4MNKA

Crystal structure of gh18 chitinase from cycas revoluta in complex with (glcnac)3
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
344
structure length
342
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGGGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYEYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDSKFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Cycas revoluta
publication title Crystal Structure of GH18 Chitinase from Cycad, Cycas revoluta
rcsb
molecule keywords Chitinase A
total genus 122
structure length 342
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4mnkA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4mnkA01
4E2OA 4FF5A 2DSKA 4H7VA 1V6XA 1LL4A 2FH8A 2Z1SA 3ZQ9A 5I23A 3WBEA 1GQKA 1KXHA 1Q6GA 5D9MA 5I3DA 4Z2KA 1WE5A 1W3LA 1CZ1A 1WZAA 1P6WA 1R86A 4ZENA 1Q6FA 4JKMA 1FFQA 4UZSA 5DFAA 3BMVA 4KMQA 1MFVA 1E6SM 1A47A 1K9TA 1YHTA 1GVIA 4UFLA 2YL5A 3UERA 1UR1A 3G6MA 4MAZA 5JUVA 5DEZA 1WPCA 3VD7A 1QHZA 3GDBA 2J79A 3PTMA 5E6ZA 4S3KA 4XV0A 3WFZA 5A6MA 1JXKA 1KCKA 3S2CA 4KRTA 3GH5A 4F9DA 1I1XA 1UWUA 3CHFA 3AHTA 1HT6A 5DT7A 3VTRA 2VT0A 2FH6A 1RP8A 1LWJA 1ITCA 1MWOA 4AD0A 3PZUA 3OGSA 3WMBA 1UH3A 5A2CA 2QV4A 3M07A 1M7XA 4PTVA 2EBNA 1HL9A 1X1NA 4BQ5A 4LQ1A 4J3TA 4UFHA 8CGTA 3GTNA 4WK9A 4W5ZA 1QNQA 2WKLA 3ALFA 1HP4A 3SCRA 4ATWA 1G01A 2DEPA 1EQCA 2W61A 4PTMA 1JYNA 1FH7A 2DSUA 3GBEA 1W32A 3GH4A 1E4MM 1C90A 1OINA 4UQAA 1E70M 4AZGA 4Z2JA 2D0GA 1J0HA 3U57A 5ABFA 2BS9A 1I75A 3VGHA 1J01A 1W2VA 3WF2A 3VOCA 3WD2A 3WUGA 1UKPA 1VFFA 5JBEA 2GK1A 1E4LA 4UFJA 4Z2HA 1TG7A 4HU8A 2XWDA 3NJ3A 4UOQA 3WDQA 1GW1A 1HVXA 1TFVA 3WKZA 2FGLA 3ZIZA 1SR0A 1W9BM 4M24A 2E4TA 4UTFA 2VX6A 4V27A 1ZBVA 3EMZA 2WC3A 1J11A 3UESA 3FW6A 2VZVA 4M56A 2VVSA 1KGWA 1HJSA 3WD3A 1QW8A 4B3LA 1UD3A 1C8XA 3ZT7A 3ZSTA 1MQQA 4W84A 3WFLA 3AS1A 4JKLA 1OGSA 2JIWA 1ISWA 1B3VA 1V02A 3TTOA 1R87A 1HXJA 2ZXAA 5A1AA 1SFSA 2BVYA 1TE1A 4J3SA 3TOPA 4JFUA 4BQ4A 2J7HA 4D1JA 2VRJA 4HA4A 1VB9A 4TOQA 4H2CA 4JZ5A 1UD6A 1W1PA 2WCAA 1FP8A 5IHSA 3IAQA 1V3KA 4NI3A 2J78A 3TTQA 3SCNA 3PTQA 1C92A 2XSBA 3JUGA 4LPCA 3MV11 3AQUA 1Y7VA 4NRRA 3CHEA 4AD2A 4PBGA 3AROA 4WSKA 2QMKA 5D9NA 3WQWA 4P7RA 3QHNA 1NM9A 1TR1A 2X09A 4XZBA 4TX8A 1ESWA 1D3CA 1UR2A 5JBDA 2WB5A 3NCOA 1UOKA 2ZUTA 2WWDA 3EDKA 1HKJA 3GYCA 1B3XA 1RH9A 3GM8A 1OBAA 2Z1KA 2A3EA 2EQDA 4M1RA 4P7QA 4JCMA 2WM0A 4IPLA 1W3KA 3PN8A 4A3YA 1KBBA 2GDUA 3RIKA 2UY4A 3WNLA 2ZUNA 2EEXA 2E8ZA 4TVDA 1JD9A 3L4UA 1HIZA 2QMJA 1K6AA 2YL9A 2YBTA 2V38A 3RM4A 3WDRA 1ITXA 5CXPA 1JIBA 3VUPA 1I1WA 1OD0A 5I79A 1TZ7A 3ARWA 2J47A 2HISA 4ZXOA 4AZIA 1R7AA 1UG6A 1BYCA 1ZJAA 2ZICA 1BF2A 2XGBA 1XH0A 1CPUA 4F79A 2CERA 3SCTA 2EXOA 4OKDA 3K4DA 4LYRA 3GNOA 3WIJA 4YPJA 5FOOA 3KZSA 2EPKX 2XWEA 1BYDA 4HPGA 1EDTA 1QNOA 4WJXA 4QCFA 1VENA 1UWTA 3VD3A 5A69A 2CBJA 1OIMA 1M04A 3I3BA 3BAIA 4AZHA 4W87A 4MAVA 1WDSA 3UEQA 1F4HA 1UKTA 1QOXA 3NIYA 1PAMA 1CNVA 3BAKA 3LPFA 1M53A 1K9EA 3BH4A 2WMJA 4W89A 4BZYA 5D9OA 5HXMA 3VX1A 4B9ZA 1KBKA 1EGZA 4WKAA 5BWFA 2WW5A 5GQBA 3AXXA 2WHKA 1OM0A 2WZIA 2WZHA 1VBUA 5BRPA 4HZ6A 4UFMA 2ZIDA 3APGA 5HPCA 3WUBA 4CN6A 2F8QA 2WYSA 3OBAA 2DT2A 1V3JA 4M29A 4LXFA 4W88A 3T0DA 2EPNA 4HU0A 2UY3A 4WIWA 4NF7A 4EE9A 1E5NA 3GBDA 2CIPA 3UG3A 1RP9A 2AMGA 3AHXA 4TTUA 1V0NA 3IJ9A 2VO5A 1CXFA 1ZS2A 2O92A 1VFOA 4HOXA 3ZT5A 4ZEPA 4N42A 3I3DA 5GNZA 4PCTA 1G0CA 2XM1A 2Q8XA 1D2KA 4R5EA 3T2OA 5A95A 3W38A 1KGXA 1LJYA 2XFFA 4BF7A 1AQ0A 3QHOA 3WNMA 3FXYA 3W27A 2F61A 4JFVA 4XX6A 4MADA 2EPMX 4P8UA 5ECUA 2DSVA 1EDGA 1GCYA 2E0PA 2J62A 1QNSA 4X0NA 4GIAA 2VOTA 3PZTA 2VQTA 1ZB5A 2ZX7A 1B9ZA 3UR8A 3RMEA 1EQPA 4OOUA 1UYQA 3CBWA 5AYBA 1GPFA 2YBUA 4BCEA 1E3XA 4PN2A 4FK9A 4CGTA 4DUWA 1EDQA 3PZQA 4XZWA 1R8LA 4OBRA 1GVYA 1QI0A 3THDA 3WDIA 3CUHA 2CYGA 1EOMA 4UQBA 1XD1A 1KXVA 1VFMA 5ABGA 5IFPA 1XGZA 4YHEA 4FLQA 1BG9A 1E3ZA 4JFTA 1FHDA 3L4ZA 5HDRA 3WL1A 5JH8A 3PZNA 3VINA 4M8UA 4PMYA 3RCNA 5ABFB 1KGUA 1V3IA 2X0HA 2V3FA 2QF8A 3AOFA 4PMNA 1W3HA 1V3MA 3DYOA 2GK1B 2V5DA 4JFWA 5FKYA 5JIPA 1MW3A 4CN1A 2DT0A 2CKRA 1MW2A 3ARPA 1ISZA 4UQDA 1JDAA 5FL1A 3WL0A 2PBGA 2VR4A 2ZXDA 2C0HA 1OT1A 1QI5A 5A8MA 2DH3A 1S46A 2EO7A 3MUAA 3W4RA 2A3AA 1BSIA 4JHZA 2CEQA 5CLWA 3WUEA 3VM7A 4CKQA 4QP0A 4A3HA 1DWIM 2WC7A 2FHCA 1E0XA 2GSJA 3N17A 1UWRA 2D24A 1XRVA 1GQJA 3W6LA 4OZOA 1LF1A 1QPKA 1KWKA 3AIVA 3RO8A 1HJVA 2BY0A 1M01A 4AD5A 2CBVA 2ZX6A 1W1TA 1Q6CA 4FMVA 4BQ2A 4DWSD 4NRSA 4QDMA 1EH9A 1EIBA 1ZBCA 1DHKA 1HN1A 5D4YA 2ZXQA 1WKYA 5CPQA 2YLAA 3AHVA 5M17A 4AD4A 1TMQA 5M5DA 1BTCA 1QI2A 3LPOA 3NSXA 3CH9A 1JZ4A 1GOKA 2UY5A 3ZJ7A 1H5VA 2Y5EA 1EHAA 3RJYA 1B3WA 2CXGA 4XB3A 4X9YA 3WH5A 3CUIA 2A3HA 4HA1A 2G3NA 4PMUA 2BHZA 4AZ7A 2D1ZA 5ABHA 4W7WA 3PZMA 1TVPA 1JDDA 3AXHA 3RM8A 2JIEA 2WHJA 4UQ9A 4PUDA 2YDQA 1OGBA 2RGMA 2D23A 2BY1A 3BAJA 5DF0A 1ODZA 3VM5A 3WMCA 2VZSA 1JDCA 1C8YA 4W8LA 3OA5A 1W9UA 5A94A 1PPIA 1CXIA 3WF3A 2BHUA 5A6LA 3WNOA 4DWSB 5A6BA 3SCWA 3CUFA 6TAAA 2VURA 3WQ4A 3MANA 2AOSA 2CHOA 3NSMA 2BVTA 5CGTA 2G3JA 1EO5A 5IXEA 5C8BB 5I24A 3POHA 1JZ2A 2CKSA 5FD0A 3QGVA 5E9AA 3PZ9A 3VMNA 2WK2A 5M3WA 5HNNA 1DWAM 4D6JA 3BAYA 3M7SA 3N13A 1BG4A 4ML4A 3MO4A 4D6GA 2VUYA 1BGAA 5E0CA 4TXEA 3LPGA 1QW9A 3VD9A 1GHSA 3ARTA 1XSJA 2DIJA 4PEEA 1XD0A 5I78A 3AJ7A 2YDSA 5AC5A 2XVNA 4CU8A 3VU2A 2ZUWA 2EPOA 4CVUA 4PMRA 3J7HA 3CGTA 3W26A 3ARUA 3W25A 2VMFA 3O9NA 1XSIA 2E8YA 4Q7NA 3AS0A 3AFBA 2YA2A 2Y24A 3WY1A 1CWYA 5I2UA 3ALGA 5D9PA 4AZBA 3D5HA 4EANA 5DO8A 1VAHA 3VIIA 1US3A 5ABEA 3VNZA 1BAGA 3DC0A 5M03A 2YOCA 3W81A 1UKOA 3W82A 4IUGA 1LL6A 4X0VA 3W24A 4CN4A 2X2YA 1ZU8A 5A8NA 2WSPA 5C71A 6A3HA 3ZOAA 4ATLA 1WZKA 4K68A 4D6IA 3THCA 3BSHA 1H2JA 4AEEA 2G3MA 1OCQA 2O9OA 1H41A 4D6HA 2YL6A 1JD7A 2XTKA 4MDPA 1HNYA 4UOZA 4P7LA 3UG4A 4J27A 2JF7A 1E0WA 1SMDA 3AS3A 5HBFA 7CGTA 1JI1A 3CIVA 4GXPA 1IT0A 1G5AA 3ARXA 1H4PA 2J77A 1DTUA 2WVSA 2JEPA 2VZOA 2BNJA 1UKSA 3BLPX 3WF1A 4PMQA 5AYIA 5CJ5A 1BHGA 1XHGA 3L2MA 3T2QA 4JL1A 3CUJA 1V0KA 2V5CA 1H09A 2ZX9A 4ACZB 1OB0A 3KWXA 4FLRA 1QNRA 3VD5A 3AS2A 3DHUA 4DUXA 3CHCA 3SUTA 1Q4NX 3ZMRA 3CMJA 4Z2GA 3B9EA 3VGDA 2J4GA 3II1A 3BAXA 1JYXA 1BYBA 2BXYA 5F7UA 3F5JA 2WLZA 1MXDA 4GO9A 4P7OA 2VC9A 3O2LA 3VDAA 4P8VA 4DM1A 4ZE5A 3WELA 1JGIA 3MSDA 3BSGA 2XIIA 5DMYA 2ZWZA 3WBAA 2WPGA 5JBFA 1CECA 2VR5A 2VX7A 2O9RA 4QLKA 1QNPA 5E09A 4H8VA 1J0YA 5BXPA 2G4FA 4WKFA 3FAWA 3U5UA 1KFWA 3U5YA 1CGVA 3WQ6A 3AISA 4UFKA 1UZ1A 5JIWA 5I6SA 1B3ZA 8A3HA 1GHRA 1VFUA 5CSYA 2VRKA 4M80A 3OG2A 1KR1A 2VX5A 2VVNA 5LA2A 1GOMA 3UG5A 1X6LA 3PZOA 4MNKA 4MB5A 2WWCA 2VCBA 3WNKA 3K8KA 2WMIA 1ZBWA 1VIWA 4AIOA 1C7SA 2QPSA 1CXLA 3A47A 3IAPA 1UQYA 3T2PA 4DWSA 3EDJA 1UD8A 2C8NA 5FIPA 2J74A 2WC4A 5A3HA 3AIUA 4YN5A 2XSAA 3W28A 3O6AA 4AZ5A 1H3GA 2A3BA 1TUXA 2UY2A 3MU7A 2BVDA 3GH7A 1E6PA 4XUYA 1H1NA 3A6OA 3WH6A 4Z2LA 4HOWA 3PZIA 1E56A 4A4AA 2J8GA 3SEPA 2VZUA 1B90A 3BXWA 1FA2A 2VL4A 4WKHA 4RE2A 1FOBA 3GNRA 1TA3A 4WSJA 1GOQA 2XIBA 4D71A 2FHFA 1NP0A 5AY7A 5TD4A 1FH9A 1V6UA 3IK2A 1C7TA 4C7FA 1R7OA 1CXEA 2DT1A 1DP0A 2WKGA 4AISA 3N15A 1VEOA 3CO4A 2ZWYA 4CCCA 2BY3A 3HJEA 3MSGA 3OIHA 2PWDA 1E6QM 2G8ZA 3WQ8A 1WDQA 1R85A 3AYSA 2GJRA 3FHAA 3E1F1 3IJ7A 1NWTA 2ESCA 2W62A 1V0LA 4GQRA 1CGYA 3QOMA 2CITA 4UOJA 1K9FA 2E9BA 3OB8A 2MANA 1EHNA 2PWHA 5LYRA 3RM9A 1B2YA 3LPPA 2OYLA 3VIFA 4NZCA 2QPUA 3AMCA 1PIGA 2WVTA 1QBAA 3B8SA 3CTTA 2CHNA 4JCLA 2Y8VA 3VILA 4OIFA 4OBSA 4GZJA 2CBIA 3DHPA 5IHRA 1U2YA 5A8OA 1UR0A 2FDMA 1AQHA 3AMGA 2YDRA 2OWWA 2B31A 4AD3A 1W3JA 4UNIA 1JNDA 3VIGA 2WBKA 1B30A 4GKLA 4F9JA 3SIMA 1GQLA 2GJXA 2PC8A 2W63A 4UQEA 3AIRA 3L4WA 1LL7A 3CZEA 2XYLA 2PB1A 4V2XA 2DQXA 1E4IA 3OGVA 4AW7A 1JF6A 1V08A 3CZJA 3CZ8A 3HU7A 1LG2A 5CQ1A 1WO2A 1CIUA 1HVQA 2DDXA 3EDFA 2VCCA 3LMYA 3VDCA 4GQQA 3VD4A 2OWCA 3BLKA 5A2AA 3SURA 1GQIA 1OD8A 1PBGA 2ZUVA 1WCGA 3N9KA 4AEFA 1C3FA 1QVBA 1E72M 2VI0A 2ZUUA 3AI0A 1KB3A 1YQ2A 4IPNB 4KH2A 1B1YA 2OYMA 1UWQA 2CPUA 3EDDA 5C70A 2JFEX 4ACZA 3NYDA 5BRQA 1SMAA 3WH8A 2EPLX 3ARVA 1U30A 1V6YA 1KWGA 5D8WA 4H41A 1PX4A 4D6FA 1WNOA 1O7AA 1FP9A 3S6TA 3SUWA 1WP6A 5EBAA 2BFGA 1PEZA 1XYFA 3U7VA 2V3DA 3VO0A 1Q6EA 3HN3A 1NARA 2FGZA 5I77A 3WN6A 1CGWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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