2YBTA

Crystal structure of human acidic chitinase in complex with bisdionin c
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
AYQLTCYFTNWAQYRPGLGRFMPDDINPCLCTHLIYAFAGMQNNEITTIEWNDVTLYQAFNGLKNKNSQLKTLLAIGGWNFGTAPFTAMVSTPENRQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFDWEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIPQLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAEKLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGWDAPQEVPYAYQGNVWVGYDNIKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQGKFPLISTLKKALGLQSASCTAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Analyzing airway inflammation with chemical biology: dissection of acidic mammalian chitinase function with a selective drug-like inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACIDIC MAMMALIAN CHITINASE
total genus 126
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2011-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 2ybtA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2ybtA01
4UOJA 4AZ6A 1BYCA 2CXGA 1UR9A 3WD4A 4K68A 1NWSA 1WZMA 3AYSA 3WDPP 1AMYA 1MQPA 1KQYA 3VIOA 3PTQA 1XH1A 2YBTA 2WLZA 3N11A 5D4YA 1W1PA 4RE2A 1E3ZA 5ABHA 4WK9A 1BGAA 1CYGA 4LYRA 4PMDA 3T0DA 1GOMA 1H4PA 3NDYA 2Y2WA 4J3UA 4QAWA 5BXRA 4H8VA 1EDQA 1H11A 5FL1A 1KR0A 1E9LA 1UOKA 3WQ8A 2BY2A 3I3DA 4ATWA 2E4TA 1KXHA 1E73M 3VIPA 3W27A 1UKQA 3S6TA 2J74A 3MUY1 1UKTA 4HU8A 4H2CA 3T2PA 3CZGA 1C8QA 1WAWA 5CSUA 1HX0A 1H2JA 6A3HA 3CZKA 5HBFA 2WVSA 1XCWA 2D0GA 4YHGA 4B15A 3A3HA 5DFAA 3AOFA 3ZM8A 1LF1A 4JFTA 3DHPA 4F9JA 2WBKA 1KCLA 2ZE0A 2BS9A 4QP0A 1J12A 2FHBA 3PZMA 4V2XA 2PBOA 2IXUA 2FH6A 2WNWA 3EMQA 2X1IA 5FL0A 4AD0A 2MANA 2XFRA 4BQ5A 1V3KA 1FH7A 4MAVA 4PMQA 1EOMA 4GQRA 4JZ5A 4M29A 4PSRA 1QNRA 2WCSA 2WK2A 1LL4A 4B9YA 1V3HA 3ZT5A 3ZMRA 1XD1A 3VMOA 2VX6A 5EB8A 2E8YA 4MTVA 2WKLA 2OSXA 3ZT6A 1GPFA 4U3CA 2J7DA 4J3SA 1EOKA 5IDIA 1E4LA 2GJXB 1KWKA 3WD2A 1HJUA 1KCKA 2WHJA 2ZUVA 2DEPA 1JI1A 5I24A 1W32A 1NP2A 4DUWA 2VX7A 1BYAA 4WKHA 2ZWZA 3CMGA 2XGIA 2BVDA 4DUVA 4J27A 2YA0A 1JYVA 3AXIA 4GINA 1ZBWA 4HP5A 3OA5A 1MYRA 1UR4A 3WKZA 1JNEA 1DHKA 2WYSA 5LA0A 1KXTA 4UFIA 1NOFA 3T0AA 1QI2A 2E8ZA 3T0BA 4DM1A 3BGAA 2C7FA 4QCFA 1UWRA 1M01A 1H0IA 3AZTA 5C71A 3HMCA 1XHGA 1HN1A 5AYBA 1W3LA 2XTKA 1CGTA 1V02A 5I79A 2CBJA 2WHLA 1E40A 2C0HA 4PN2A 3UCQA 3CPUA 4PMYA 4PCSA 3SIMA 2CHOA 2J47A 4TX8A 1MQRA 2FGLA 3S2CA 3VGFA 3VIHA 3K4DA 3L2LA 5CSYA 4H8HA 4IM4A 4JHOA 4KMQA 1RPKA 1E15A 1JFHA 2G3NA 2WMIA 5HDRA 1KGXA 3EMCA 3WH8A 2ZUMA 5M17A 4A4AA 1PIGA 3PZNA 1FHLA 4KH2A 4IUGA 4KWUA 5FCZA 2YL5A 4GIAA 2ZXDA 4PMXA 1US3A 2EBNA 2O9RA 1EA9C 1VF8A 5CPQA 4JAWA 4D6DA 1NQ6A 2BHUA 4C7GA 3O2LA 2W67A 3AIVA 5JIPA 1W9VA 4RE4A 3SCUA 1J10A 4L4OA 5A6MA 1ISXA 4EKJA 1H41A 1XH2A 1UA7A 1GNXA 2E9BA 3ECQA 3NYDA 2J7HA 1W1TA 1E6RA 1UWTA 5BXPA 3VIKA 2XYLA 2D24A 1H0GA 2YOCA 4P7OA 2VR5A 3AIRA 2BY0A 1XC6A 3EBVA 5BRQA 1CIUA 1M04A 3L4VA 1UD4A 1V3MA 1EQCA 3FXYA 1MW2A 1P6WA 4JKLA 4XZBA 1E56A 4PTVA 1B3XA 3TTOA 3T2OA 4PUEA 3K4AA 1NM9A 4WKFA 1HVXA 4H8UA 3WQWA 5IFPA 4C7DA 5HPOA 4XZWA 1CDGA 3VX1A 3KE0A 3THDA 3WUFA 4GZIA 1DWGM 1ZB5A 4P8UA 2XWEA 1CXKA 2ZX5A 1FP9A 3VD4A 4UOQA 1KQZA 2EQDA 2J7EA 1JG9A 3K8LA 3RO8A 3AQUA 5I77A 1OGBA 2X0HA 4AW7A 3SCRA 1K9EA 4PSPA 3MUZ1 1W3JA 4AYSA 4Z2LA 5GNXA 2VTFA 1HL9A 1CWYA 1B0IA 1LWJA 1K9TA 2G41A 1CGXA 1G9HA 1E1FA 1C3FA 4AZ7A 5F7UA 2JFEX 1G0CA 1R86A 3ZSSA 2CBIA 1XYZA 5DT5A 1MFVA 2VNCA 1QPKA 1V3JA 3U7BA 1UR1A 3CZEA 1KB3A 1JYXA 4MJ4A 3WY1A 2EEXA 2Y8KA 3CUHA 2EPMX 3AIWA 1XRVA 4W88A 1UR2A 4MNLA 4PMOA 4LX4A 5D8WA 2VJXA 3ARQA 2VQTA 2V3DA 1DP0A 3IANA 1SYTA 4QLLA 2VQUA 3RPMA 1E6XM 1UZ1A 2A3AA 4CUCA 2G4FA 1GHSA 2XIBA 7TAAA 1DWHM 1E1EA 1OSEA 5BYWA 3WDHA 4CD6A 3RMEA 3ZIZA 1GUVA 2D0HA 3NIYA 4CN6A 3NUKA 1GOKA 5D9OA 4M56A 1EXPA 2XUCA 3BSGA 1OCQA 4UQDA 3VVGA 1EDGA 2DSWA 1E70M 2WVUA 3IJ8A 4QLKA 4UCFA 4W7UA 1CGUA 3I3BA 1JDAA 3D5HA 5CJ5A 4ZENA 3OB8A 3N9KA 1L0PA 2OWCA 4TVUA 5LA1A 2CERA 2CBUA 4TVCA 2HISA 5HNNA 4TX6A 4JIEA 3GH5A 4KRTA 2JIWA 5ABGA 1M03A 1VEMA 2IXVA 2WAGA 3ZJKA 4JL2A 4JKKA 1J0ZA 5A2CA 1AQ0A 2BXZA 3GXIA 3TOPA 3WNKA 5A1AA 2PI6A 2WC4A 1YQ2A 3GBDA 5CLWA 4W86A 4AY1A 1PZ3A 1UKSA 1XH0A 2BFGA 2VI0A 2WB5A 4X0NA 4AZCA 1JZ8A 4PBGA 2Y8VA 3CHFA 1HJXA 3PZOA 3U57A 1R8LA 3VGGA 1CXHA 5I2UA 5CXPA 1TZ7A 3KWXA 3WIJA 5I0DA 2CKRA 1KWGA 5EMYA 1BLIA 1UKPA 5DMYA 1ISZA 3WF3A 3TONA 2YKKA 2D3LA 1C92A 3GYCA 1LJYA 3MKKA 2OLHA 1US2A 2J77A 4AIOA 1QNOA 1C7SA 2DQXA 3WUEA 4CD4A 3OG2A 5CZKA 3THCA 3K46A 2DH2A 3ZSTA 2XG9A 3EDFA 1E6QM 2VRQA 3VNZA 3MO4A 1R7OA 2YL6A 3N18A 4AD2A 2WVVA 4WLCA 3T09A 2PC8A 3PTKA 2OYMA 3IJ9A 1FH8A 1CGVA 1UHVA 4CCEA 2YDRA 4H04A 4E8DA 4MDOA 3CHCA 3NSXA 3APGA 3PZTA 2DT0A 3AS1A 5CGMA 3N17A 3ARSA 2YIHA 2DDXA 5A8OA 5A95A 1Q6EA 2J4GA 2XM1A 3WNNA 2ZX8A 3VO0A 5A8NA 1VRXA 3AS3A 1QNQA 1UG6A 4OKDA 5I78A 2VURA 4UFKA 1SMDA 2F2HA 4GKLA 4CD7A 1BPLB 4NI3A 1E43A 1LG2A 1H1NA 1C90A 2PWFA 2W91A 6CGTA 1D2KA 3EMZA 4MB4A 2WKGA 3W25A 3AXXA 4GZJA 5IFTA 1EGZA 4Q7NA 3WENA 3WEMA 4E2OA 3GXDA 1JZ6A 3CUGA 3BC9A 1QW8A 2JE8A 3ZQ9A 1B9ZA 2D3NA 1HXJA 3CO4A 4RL3A 1GOOA 5FD0A 3BXWA 2VZVA 3MSGA 5EFFA 2GK1A 1E0WA 4W84A 2ZXQA 3WD1A 3UR7A 2QV4A 4QFUA 3TTYA 3BAKA 4AIUA 1H5VA 4AXNA 1QNSA 1KBBA 1W1VA 4ZXOA 1I1XA 1GOWA 2DSKA 1GORA 3VDCA 2CYGA 2CESA 2PF0A 2YLLA 3D3AA 1NARA 1WZLA 1FA2A 2XIIA 3AI0A 1UWIA 3SUWA 1AVAA 2J62A 2XJ7A 1EHNA 4UZUA 2XVKA 4HZ8A 4AZBA 3L4TA 4YPJA 4MDPA 1EH9A 2B31A 3TA9A 1FHDA 3WF0A 4CKQA 4HA4A 2HVMA 3AHTA 4M8UA 3ZJ7A 2J78A 3PZIA 1PX4A 1TA3A 4FMVA 3QR3A 4NRRA 2E40A 4WJXA 2BHYA 3GXFA 1UA3A 4JFWA 3WF2A 4YHEA 1ZS2A 2Q8XA 1OB0A 4PTWA 2WWDA 3F5KA 1U33A 3AIEA 3RILA 4GPNA 5E09A 1C8YA 1NP0A 1UQYA 1J18A 3AMDA 4Z2JA 3FHAA 3GXMA 1B3WA 3ZO9A 5LA2A 4EANA 1KGWA 5AY7A 1BG9A 2GVYA 3GNOA 1Q6GA 1W91A 2X0YA 2OSYA 3SCOA 4A3HA 4E8CA 3FHQA 3PN8A 3CUFA 2VC9A 3SCSA 4LGXA 3UG5A 3O9NA 4DWSD 4MNKA 1E71M 1QHPA 4J28A 1WB0A 1XD0A 4UQAA 3T2QA 3AMGA 1JZ4A 2V5DA 2NT0A 1V3IA 1CNVA 3VIGA 1SMAA 3VD9A 1CGYA 4F66A 3A4WA 4M81A 2UY3A 5GNYA 1B1YA 1VFFA 4D6EA 3M46A 1JZ3A 1VFOA 2CIPA 4FLQA 5FKYA 1GW1A 1VEPA 1DWJM 5DEZA 1J01A 1H09A 5IHRA 3U5UA 4J3XA 1UZ4A 4W5UA 1BQCA 1BG4A 1V0LA 1NWUA 3AHVA 2PB1A 2WSPA 3I3EA 5A6JA 3DYPA 2UY4A 4W89A 2O9PA 3G6MA 3W6LA 5ABEA 5AYIA 3W0KA 3F5JA 1XSKA 3OLEA 1ZJBA 4OZOA 2VCAA 5CPSA 3CTTA 3VGEA 3LPPA 1BYDA 4JCLA 3NSNA 5JH8A 4PMZA 2ZX7A 5A8PA 4BS0A 1Z32X 4PCTA 3MUIA 4CU8A 5D9MA 5DT7A 3BCFA 1CZ1A 2VZUA 4Z2GA 5E0CA 4F8XA 2J7GA 1D7FA 1VFUA 3OLGA 2AMGA 1JZ7A 4TTUA 4OJYA 2XVPA 2QLYA 1W3HA 3BMVA 3VOCA 4MJ2A 1QHOA 3B9EA 4Z2IA 3A47A 2RGLA 1NWRA 4W5ZA 1S46A 1W9BM 2Z1KA 3W37A 1GQIA 2WMFA 3N13A 3RM4A 4XUYA 4XB3A 1JYNA 3WDIA 1UQZA 1E5JA 3CHDA 1UD8A 5EBAA 5A6LA 1J11A 3O6AA 2X8RA 1C7TA 5E70A 3FY1A 1E6ZA 1E0XA 3BLPX 4M24A 1CXLA 2GUYA 2IUZA 3W26A 2VUYA 4ZE4A 3K1DA 3ARYA 2Y5EA 5HXMA 1OINA 4Z2HA 3L4UA 3CH9A 1MW3A 3K8MA 1HJVA 4MNMA 5A8MA 1J0IA 3N15A 3QHOA 2ZXBA 4J3TA 5ABFB 3GNRA 1XYFA 3BLKA 3SCWA 2ZUWA 4JFVA 1HP4A 5A69A 1HKJA 2VVNA 4P8XA 2DPEA 1R87A 1GVYA 4U31A 4UFMA 2O9OA 2BVYA 3L4WA 2GJXA 4YN5A 3W82A 3ZJ8A 2BVTA 4V28A 1KBKA 4RE3A 2WVTA 3VPLA 3SEPA 1DEDA 2VOTA 2QF8A 4B3KA 4MB1A 2NW0A 3WNOA 3VIIA 1B90A 4AD3A 1E0VA 1C93A 4FK9A 2DIJA 3WDJA 2WCAA 4CVWA 2ZXAA 4LXFA 3RJYA 2YL9A 1TMQA 2A3CA 1VBRA 2WZEA 4D71A 1KXQA 3WD3A 5JIWA 3SCNA 3WMSA 3WH5A 2VZOA 4D1JA 2CNCA 3KL3A 1G1YA 3WDQA 3ZT7A 2G3MA 4PRWA 3VM5A 2FH8A 4DM2A 4AZCB 1L8NA 1X1NA 3ARWA 3VD7A 2WPGA 1NOUA 1I75A 2JF6A 1LL6A 1SFSA 1J0HA 1QI0A 1E4IA 1OT2A 4TUFA 1OWQA 3OZOA 4MAZA 4AZGA 3WFZA 3GTNA 1LG1A 1WZAA 3UERA 3AISA 4CU7A 1BYBA 2F8QA 3VIFA 4BQ2A 3AIUA 4KGJA 2DT3A 2E0PA 4NZCA 1TVPA 3IJ7A 3WMBA 3CZLA 1K6AA 3WQ5A 5C8BB 1EQPA 2NT1A 2WSKA 1PJ9A 5KEZA 1MVYA 1QNPA 1PPIA 3CZJA 3DYOA 4U3AA 2DT2A 3UG3A 1ISWA 3WH6A 1Q6CA 1TR1A 1H49A 1DWIM 3WH9A 1GQKA 2VR4A 2XSBA 2YDQA 1K9FA 2BHZA 5A3HA 3VINA 1X6LA 4PTXA 4S3KA 2ZUSA 4A3YA 2CHNA 4OBRA 1V3LA 5D8ZA 4J7RA 4HOZA 3J7HA 1FOBA 1QI3A 1HIZA 2EPOA 3VTRA 5BWFA 1ESWA 4U33A 3N04A 2VO5A 2VT0A 3VMNA 4DWSB 4EE9A 4P7QA 1MW0A 1E55A 3RDKA 2DSUA 3WD0A 1B31A 4D6CA 1NWTA 1CEOA 3WL1A 1CTNA 4QCEA 4ACYA 5CGTA 3VM7A 3AMCA 4PUDA 3WELA 4N42A 2J7BA 1UD6A 4HZ6A 5I3DA 5HPCA 3E1F1 3WL0A 3LPFA 1LLOA 3WF4A 2OWXA 1CPUA 3SCVA 4M1RA 2ESCA 5A6KA 3SUTA 3KL5A 1I1WA 4HU0A 1JXKA 2FDMA 3GNPA 4W8BA 1H3GA 2DIEA 5D9NA 4P7LA 1QBAA 5A6BA 1MQQA 1A3HA 3MANA 5I5RA 2XVGA 5A8QA 4LYPA 2XWDA 1LL7A 3U7VA 2XVLA 3HJEA 1RP9A 3W28A 1ZBKA 1W3KA 5D9PA 1WNOA 4GI9A 4HZ7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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