3QOKA

Crystal structure of putative chitinase ii from klebsiella pneumoniae
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
PLMSVGYFNGGGDVTAGPGGDIDKLDVRQITHLNYSFGLIYNDEKDETNAALKDPAHLHEIWLSPKVQADLQKLPALRKQNPDLKVLLSVGGWGARGFSGAAATAESRAVFIRSAQKIIQQYGLDGIDLDWEFPVNGAWGLVASQPADRDNFTALLKSLREAVGEQKLVTIAVGANAESPKSWVDVKAVAPVLNYINLMTYDMAYGTQYFNSNLYDSSHWPTVAAADKYSADFVVNNYLAAGLKPSQMNLGIGFYGRVPKRAVEPGIDWTKADAQNNPVTQPYFGPQQIALFASLGYDLSKDTYVKYNDIVGKLLNDPQKRFTEHWDDEAKVPWLSVQSAEGKPLFALSYENPRSVAIKADYIKAKGLAGAMFWEYGADDQNQLARQLAESLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae
publication title Crystal structure of putative chitinase II from Klebsiella pneumoniae
rcsb
molecule keywords Putative chitinase II
total genus 124
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3qokA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3qokA01
5AC4A 1FFQA 4AD5A 4LPCA 1EIBA 1KR1A 5CSYA 1UWUA 4PMUA 3BSHA 3L4ZA 1CGVA 1ISWA 1VEMA 4W85A 3TTQA 4XV0A 3OZPA 4HU8A 2CETA 1I75A 4H8VA 3W29A 2GDVA 4U2ZA 2YL6A 4AZGA 3WNKA 4HU0A 5A3HA 4WKHA 1V3KA 1L0PA 1N82A 2JEQA 3WMSA 2PWDA 4AZBA 3AISA 1JAEA 3VIJA 4P7QA 1A3HA 1J0IA 4UFKA 2ZICA 3RCNA 2DEPA 5HNNA 4F9JA 4S3KA 3PTKA 3W28A 2VZVA 2XVNA 1H0GA 5BRQA 4YHEA 1E43A 4Q22A 2GDUA 3B9EA 4FF5A 3ZR5A 3K8LA 3WSUA 2XTKA 2V5CA 4HOXA 1C8XA 1HNYA 1JXJA 2JALA 1JD9A 5IDIA 4UQDA 4FLRA 3WBAA 5A6LA 2XPKA 1W9PA 3EDKA 3WNMA 3EYPA 1JI1A 1W1VA 1AQHA 1JYVA 2J7CA 4MADA 3RPMA 4CVUA 1DHKA 3U57A 1R86A 2ZX8A 1KR0A 3GM8A 2AMGA 1KGXA 1VEOA 4AY1A 1BTCA 4Z2LA 3MV01 2QMKA 3TTSA 1LF1A 5CGMA 1G94A 3NUKA 1X6LA 3WD4A 5EB8A 1ZL1A 2VRKA 1E55A 1GOKA 3PZNA 1V6VA 2BHZA 3W53A 4D6CA 5AYBA 4PMQA 2WW5A 3MSGA 3VD9A 3F5JA 4P7RA 4JHZA 1TFVA 2DT3A 5A6AA 2BXZA 3W4RA 1HVQA 3MUIA 3MUAA 4PMVA 1W1YA 2DIEA 1OINA 5CLTA 1TVPA 1RPKA 1E5NA 3WDIA 1PBGA 1AMYA 1HN1A 1MW0A 2D1ZA 5CSUA 5A8NA 2WKLA 2WMJA 3PZMA 2A3HA 2V3GA 4D72A 2JE8A 1VRXA 2OSYA 4BA0A 3AOFA 3PBGA 4AISA 3CBWA 4H8HA 3RIKA 2ZXAA 4A4AA 1IV8A 3AYRA 4BQ2A 4DM2A 1V3LA 3N12A 4W93A 2WVSA 2WHKA 2V3EA 2G4FA 3EDJA 3FN9A 2JIWA 4JFWA 2XYLA 5GQBA 1RP8A 3GXDA 4L4OA 3OBAA 2WPGA 4LGXA 3WBEA 3VM5A 3DHUA 4M8UA 4AD2A 4D6JA 4B9ZA 1QI0A 4PSPA 4CCDA 3VDAA 3VD7A 1ISYA 3WQVA 1V6UA 3LPPA 5A6KA 1JFXA 1DEDA 3EDEA 2PB1A 1WZLA 4J3UA 1GORA 4FK9A 2J7EA 1J12A 3IK2A 3AIWA 5KZ6A 3PZOA 1TVNA 1HP4A 3AFBA 1GPFA 3AHVA 2VC9A 1UWQA 3CUIA 2VRJA 4UNIA 2FGZA 2WK2A 2WC7A 2Y5EA 1CGYA 3CHFA 3TTYA 2ZUVA 1LG2A 1UH3A 2E3ZA 3VX1A 2HISA 1VFOA 4JAWA 5EMYA 1TCMA 4QAWA 3BCDA 5EFFA 2VCCA 3AHTA 2NT0A 2JIEA 3WN6A 3WUGA 1E9LA 1XRVA 3ALGA 2DGAA 4WJXA 4NRRA 4MTVA 1UD5A 2WMKA 2XVGA 1XC6A 1ESWA 2ZUMA 2DH3A 4AZ5A 1JF5A 4AEEA 3GXIA 4B3KA 5A8PA 3THDA 4PMDA 3PTMA 1E3ZA 3UERA 4CD7A 3BCFA 4PUEA 2WCAA 1B3WA 4AWEA 1PEZA 5CXPA 1W91A 4F8XA 4JIEA 1FHDA 1B2YA 1CWYA 1EQPA 5HXMA 3PHAA 3NSXA 1V3JA 3DYOA 2DT0A 3GNPA 5CPQA 3MKKA 3FAXA 1BYDA 3WDPP 3W24A 3SURA 2D23A 1RP9A 5C71A 3PZIA 4WKFA 4MB5A 1V0LA 4D6GA 5E9AA 1E6ZA 2X09A 4GO8A 3AYSA 2WVTA 2UY2A 3ZT5A 1VAHA 4J3TA 1W1TA 5JIPA 3ARRA 1UD8A 3F4VA 3I3BA 1G1YA 3VDHA 4BF7A 5M5DA 3THCA 4XB3A 2VX5A 1DWJM 3NCOA 4CGTA 2OYMA 5LA0A 5DO8A 1RH9A 3CZ8A 3AXIA 4AZHA 2CHOA 2G3IA 4V27A 3ZSTA 4J3SA 4U33A 5FD0A 3I3EA 3TONA 4KMQA 4XX6A 3WQ8A 2IXUA 5BCAA 3ZT7A 1JFHA 5GNZA 4HZ6A 1HL8A 4YN5A 1QNPA 3RJXA 2V38A 3AIQA 2UY4A 3NDYA 1G0CA 3KL0A 4DUVA 3WF1A 2YL9A 2ZX9A 3VIGA 2E40A 3SCTA 4AIOA 1XH2A 2YJQA 4WIWA 4DWSA 4E4PA 2O9PA 1Q6DA 2CIPA 1XYFA 1PX4A 3WH9A 4C7DA 5HPOA 3T0DA 4UOQA 4ATLA 4HPGA 2GJRA 1SYTA 1JD7A 1E71M 5FIPA 4EE9A 2A3AA 4IPLA 2WLYA 3W6LA 3N04A 3L4WA 1QVBA 3SCNA 1ODUA 3NSMA 1LWHA 4KGJA 2WMHA 1U33A 1TZ7A 3WMBA 1CBGA 1MW2A 1XSKA 4H04A 1PPIA 2A3CA 3N18A 4CVWA 3VD5A 2D3LA 3QHMA 2XWDA 4UFJA 3F5LA 5HBFA 3L2MA 2YBUA 5A2AA 2WVVA 2WBKA 4J27A 1E40A 3OGRA 4JCMA 1EOMA 1JDDA 2XSAA 1CGTA 1K9EA 3T08A 3FY1A 1PIFA 3PZQA 1LL4A 2XFYA 2CBVA 8A3HA 1Z32X 2VQTA 2DQXA 2OYKA 1UWRA 3EBVA 4M56A 4V2XA 2Y4SA 4UQ9A 2EEXA 4WLCA 4CU8A 2EQDA 5FCZA 1I1WA 3VU2A 2W67A 1V03A 4NSBA 4M24A 5A8QA 3W81A 3VIFA 3PZTA 1UKQA 3GYCA 1B0IA 3EMQA 2X05A 3VO0A 3QOKA 2UY5A 4A3HA 1J9YA 5A94A 6A3HA 2VVNA 1QHPA 2PWHA 4DWSC 3WD3A 1W9BM 2GJXA 2EPLX 1ZJAA 4M80A 8CGTA 4W84A 2BY3A 3SCQA 1CGUA 4XUYA 2DT1A 2ZUWA 4EANA 4W8BA 1VB9A 1V02A 4ZE4A 2VZTA 3K1DA 2WC4A 2XVPA 2CCRA 3WEOA 4OBSA 3JUGA 3S2CA 4UR9A 1UKPA 4TTUA 2FHCA 1XD1A 4MNJA 2WANA 1Q6GA 1JYWA 2VR5A 2PBGA 3N9KA 2J7GA 3WFZA 1CDGA 1BFNA 1FHLA 1WZAA 1UKSA 3ZQ9A 1EGZA 1B90A 2NT1A 1JAKA 4F79A 1E0XA 5CPSA 1J11A 2WMIB 5BXSA 2VR4A 2F2HA 2B31A 1B9ZA 3MSDA 1QNOA 4WK9A 2CHNA 4ACZA 3NJ3A 3KWXA 3CZEA 1E6NA 3N13A 3K8MA 4P7OA 5A1AA 2D2OA 3CMGA 4JKMA 2J79A 3T2OA 2CBUA 4P8WA 3AS2A 1X6NA 2WCSA 5A6SA 1E4MM 2YA0A 1WKYA 1OWQA 2UY3A 3W6MA 1FH7A 2BNJA 4FLOA 4PMNA 3T09A 2J25A 1J0JA 3BAJA 4KGLA 4D6EA 3WL1A 4GPNA 1SFSA 2XGIA 4EAMA 4YHGA 4CUCA 3AZTA 3GXMA 2ZE0A 3L4XA 3KZSA 3UG4A 1UD2A 4P7LA 3AS3A 1EDTA 4GIAA 1B1YA 2DT2A 5KEZA 2EPKX 1E1FA 2QPUA 4UOZA 1JDAA 2Y8VA 1IZKA 4PMZA 1WDQA 4GI6A 2VT0A 2FHFA 3PTQA 1Q6CA 1NOWA 3WENA 1Q6EA 4GZEA 2D24A 1UD6A 1PAMA 1DWHM 1JF6A 1WP6A 2YL5A 2BS9A 1WO2A 1ECEA 4LQ1A 3T0AA 3K4AA 3WUBA 5GNXA 2XM2A 4K68A 1SMDA 4HOZA 3AHXA 3D5HA 2C0HA 1GHSA 4JFVA 5ABEA 1DTUA 2DDXA 2WZEA 5LA1A 1GOOA 4XZWA 1C7TA 4ZEPA 3W27A 5DEZA 1XH0A 3VNZA 3ZO9A 4PRWA 1NWSA 3KE0A 4IISA 2PF0A 5ABFB 3PZGA 2RGLA 2J7BA 2NSXA 2J8FA 4W8LA 4RL3A 3RJYA 5IHRA 2GK1B 3I3DA 3A6OA 3CTTA 4GI9A 3RO8A 4W89A 1JZ6A 1V6WA 1LLOA 4F66A 2CITA 1GNXA 3BC9A 4D1JA 1GJUA 1XYZA 3SCRA 1V3IA 3CZJA 3CHCA 3G6MA 1DWFM 3ARXA 5I23A 4M1RA 1JYXA 5A6MA 1HJVA 3TP4A 1CIUA 1Q4NX 3ZSSA 4ZENA 3WNPA 3WNLA 3EMCA 4GZJA 2WCGA 1JNEA 2EJ1A 3L4UA 3APGA 4FLQA 4P8XA 1W2PA 4GKLA 4KRUA 4X0NA 3BAIA 2WB5A 4OUEA 1CLXA 1BYAA 5CLWA 4W87A 9CGTA 1MVYA 2D3NA 1E3XA 1MQRA 4P8UA 5A8OA 1JZ5A 2PI6A 5A2BA 2VTFA 4MJ4A 2OYLA 1B31A 4UQAA 5FL1A 5JBEA 2VX6A 7CGTA 1KBBA 3FXYA 1EO7A 1TA3A 2J75A 3WD1A 4OJYA 1US2A 3ARPA 1W3HA 2OSXA 3AI0A 2DSUA 3RMEA 3AJ7A 1GONA 2CBIA 4JL1A 3AMDA 1YQ2A 3GNOA 4PCSA 4HMEA 4U5KA 2XVKA 4CD6A 1LL6A 3ARTA 1JYNA 5JBFA 3ZM8A 4Y7EA 1JZ3A 3VGBA 1PIGA 4Z2IA 3CPUA 4UQEA 4AMCA 1SMAA 1HJQA 4MJ2A 3VILA 4MAZA 4RE2A 2WVUA 1VIWA 1QNRA 3MMUA 2UWFA 1GJWA 5CPTA 3FAWA 2PBOA 4N0RA 3BAKA 1AQ0A 3AZRA 2WBGA 1KB3A 1KBKA 4NF7A 1W9DM 1JDCA 1WZKA 1UD3A 2CYGA 2Y24A 3D3AA 1FFRA 3KL5A 1BHGA 4LYQA 5M3WA 2XFRA 1WZMA 1TMQA 2VCBA 2ZXDA 1W2VA 5A2CA 3ARQA 2DSKA 1VENA 4JKLA 4TOQA 1E0VA 4CN1A 4DM1A 1CGWA 2Q8XA 3WEMA 1A47A 1XV8A 1HXJA 3BXWA 2XWEA 2ESCA 4LXFA 1DP0A 1AVAA 1UZ1A 4GINA 1ITCA 5FL0A 3W25A 4PMRA 4UOJA 2QMJA 2BY2A 4TX6A 1H2JA 3ARVA 1QI5A 3AHZA 1F4AA 1NWTA 4GQQA 2GSJA 1L8NA 2XSBA 2GJPA 4J28A 1G5AA 4M29A 1R8LA 2JEPA 3VIHA 3U7VA 2VRQA 4TX8A 2ZIDA 6TAAA 5JBDA 4ACYA 2ZX5A 1JZ2A 1HP5A 1E4NA 3GH7A 5LA2A 3BGAA 5A69A 1I1XA 3VIPA 3VGEA 2Y8KA 3NYDA 2Z1KA 3NDZA 3ZJKA 4WSJA 1NQ6A 1QNSA 2AOSA 3W0KA 2A3BA 4QLLA 2X0YA 2FH6A 1ISZA 1OSEA 1ZBCA 3CUHA 3VNYA 1WDPA 1MQPA 4D1IA 1UR0A 1LG1A 2XJ7A 1ISVA 2DSWA 1W3JA 2CKRA 3OLGA 4UFMA 3U5YA 2CBJA 5IXEA 1UG6A 4KRTA 1PX3A 1QI2A 5BXPA 3VTRA 4UFHA 3WNOA 5D8WA 3GH5A 1R7AA 1H11A 1KXTA 5FOOA 4CN6A 1R87A 5BROA 5I3DA 2VURA 4C7GA 4EK7A 1U2YA 3MU7A 4AD4A 2ZXQA 2HVMA 5E6ZA 2YKKA 5C8BB 5E0CA 3A4XA 2EBNA 4BQ5A 4JFTA 3N11A 2VMFA 4W88A 2RGMA 1LL7A 1KXQA 4TTGA 5I24A 3EDDA 3WDRA 3M7SA 2WSKA 1UA7A 2FGLA 3OLDA 4Z2HA 4IM4A 4D6DA 2YLAA 2BV9A 3UG5A 4E2OA 1UQYA 2G3MA 1E70M 1HJUA 3OLIA 3RM9A 4LYPA 1ZBWA 2QF8A 1J0KA 1GVYA 1JNDA 1VJSA 2EXOA 4U31A 1HKMA 2CKSA 1B3VA 1LJYA 1GQKA 1ISXA 3SUUA 1NOFA 1DWIM 3BAWA 1CZ1A 3DECA 1M7XA 3VKKA 3WH7A 4AZIA 2YDRA 3ARYA 3SUVA 2W5FA 4PUDA 1QW8A 3AHYA 2YIHA 4ZFMA 2BY1A 4AEFA 1HJWA 3CHEA 5A6BA 2YDQA 3PZVA 3AXXA 2E9LA 3ECQA 3SCSA 4ATDA 4MB1A 3O6AA 2YBTA 3SCUA 1MW1A 3AXHA 1M04A 2J8GA 3SUWA 3AICA 3FHQA 4U2YA 2VZUA 2XM1A 1QOXA 4U3AA 4UZSA 4IUGA 2EPOA 3J7HA 1MQQA 3SCPA 1O7AA 2W66A 4TVDA 3CZLA 3CUFA 4HZ8A 5A6BD 4WKAA 4QDMA 1X1NA 1WDRA 1UOKA 1TE1A 1V3MA 2BVYA 2E8YA 2F61A 2W61A 2XIBA 3PZ9A 2C7FA 4DWSD 3WY1A 2J62A 3CGTA 1VEPA 2CXGA 4J3WA 4YPJA 3VPLA 4HP5A 4GZIA 3WH6A 4AXNA 3AMKA 3WF2A 3EMZA 3UESA 3HU7A 2YL8A 3MANA 2FDMA 3VIKA 5ECUA 3W26A 3T2PA 1OD0A 3W37A 4C7FA 1GQIA 5D8ZA 2YOCA 2VZSA 3ZR6A 3II1A 4MDOA 4HOWA 1W32A 1MYRA 1HVXA 5CQ1A 2WWDA 3ZOAA 4MPKA 3AMLA 4PMYA 1E56A 3OIHA 3WF0A 5BRPA 3LMYA 1LQ0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2X2G A;  1EUN A;  1OIM A;  2E7F A;  1S5M A;  3MWC A;  1HIZ A;  5ABH A;  1HT6 A;  4TW6 A;  1ML1 A;  5HA7 A;  2Y7D A;  2Y2W A;  1NIU A;  1R85 A;  4M6Q A;  4MNM A;  4OZO A;  2F2K A;  2WXD M;  3STG A;  4KEZ A;  5DMY A;  3DHF A;  3EX2 A;  1GZG A;  3SFK A;  1XLF A;  4OUI A;  1GQJ A;  1EP3 A;  4W9T A;  3LPO A;  1HKI A;  1PWM A;  3AMG A;  3B03 A;  1OBA A;  3LV5 A;  4AIE A;  4ZOC A;  3FDG A;  1YHT A;  3NI6 A;  2X30 A;  1I9C B;  1LLZ A;  2ZTJ A;  4WDU A;  4OHQ A;  2OWW A;  4JFK A;  1XGZ A;  4RE3 A;  2QIW A;  4C6N A;  3VGH A;  1OGB A;  2WSQ A;  5K3V A;  4ZQR A;  5AHL A;  2XG9 A;  1F4H A;  2PWG A;  4OOU A;  1HKK A;  1W1P A;  1ENU A;  1BYC A;  1FQ0 A;  3FVD A;  4O1F A;  3I6T A;  2NW0 A;  4A8N A;  1XCX A;  2H9A A;  1UZ4 A;  3CWN A;  4YTQ A;  1LOS A;  4GG9 A;  3L65 A;  4L65 A;  4HIB A;  2ZXB A;  3L5L A;  1UB3 A;  1JEZ A;  1DWG M;  4NXK A;  2J78 A;  2C91 A;  4QLJ A;  1W6T A;  3UU0 A;  1OYC A;  4CNU A;  3V0U A;  1LBM A;  4PMX A;  3SAZ A;  3CLW A;  1J79 A;  2NUY A;  4GYJ A;  1S3T C;  2EPH A;  4EF9 A;  2J47 A;  2ZVI A;  2ZRW A;  4ZO9 A;  4TV5 A;  4HCH A;  4LAO A;  2C79 A;  2E8Z A;  5IFT A;  1VHN A;  2O92 A;  3SJ3 A;  2PGR A;  1FKG A;  2QZR A;  1RD6 A;  1AFS A;  3BH4 A;  1O5Q A;  2HK0 A;  4ONV A;  3OW1 A;  5FES A;  1KCX A;  5IRP A;  1GCY A;  3NTY A;  2V8Z A;  2B7Q A;  2YA2 A;  1BXC A;  1K9D A;  2J4G A;  3USB A;  3SGZ A;  2PA6 A;  3STF A;  3CQ0 A;  3QC3 A;  4A3Y A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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