1E6ZA

Chitinase b from serratia marcescens wildtype in complex with catalytic intermediate
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Serratia marcescens
publication title Structural Insights Into the Catalytic Mechanism of a Family 18 Exo-Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
total genus 165
structure length 497
sequence length 497
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2000-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1e6zA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1e6zA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e6zA01
1MXDA 3L4WA 1AQ0A 2EO7A 3BCFA 1VIWA 2QMJA 2ZX7A 3AMKA 4PMZA 3ZJ6A 3UG4A 2WWDA 1J12A 3VD7A 1G01A 2XVPA 3WQWA 1E5JA 4QAWA 4UOZA 3NSXA 1SYTA 3L4XA 1FP9A 1UA7A 3MMWA 1JDCA 2D22A 3PZ9A 2G3MA 1BHGA 3DYOA 1AQMA 1VEMA 1JZ2A 2EPNA 1MXGA 1KWKA 2CITA 1CGYA 4JFVA 2EQDA 1M04A 3NDYA 2V3GA 3VD4A 4UQBA 3AHYA 1QI4A 1PZ3A 4AWEA 8A3HA 1UA3A 3VX0A 4KRTA 1TA3B 1GNXA 1A47A 1FA2A 5BWFA 1I1WA 4CN1A 3MKKA 3CHEA 2VC9A 3AIQA 4GPNA 1OT2A 4K68A 4DUVA 1W9XA 4F9DA 4AZ7A 2PWEA 2CBJA 2QPUA 3NYDA 2X2YA 1BYDA 1UD5A 4PMNA 4ATLA 1V0KA 3SCTA 3AISA 1CEOA 3WQVA 4J3TA 3AHZA 4WF7A 4RE3A 2WMKA 2XWDA 4GQQA 3VO0A 2WMGA 1A3HA 1PAMA 4CU7A 1JYXA 4D1JA 4ACZB 1I1XA 4EKJA 3ZT5A 2J8GA 3BXWA 1E70M 2J47A 3SEPA 1IZKA 1W9BM 4GI6A 2G41A 3OA5A 4LGXA 3ARUA 2O92A 1QI0A 3SCPA 1CIUA 1HKIA 3WD3A 5LYRA 4RE4A 4JFTA 3L2LA 4M56A 2Y8KA 2YBTA 2EPOA 3TA9A 2NW0A 3MV11 3LMYA 4M1RA 1OM0A 1RP8A 2ZUTA 4UFJA 2VO5A 1EGZA 3W29A 1QOXA 2QLYA 4MPKA 2G3IA 1W2VA 1WKYA 4W86A 3QR3A 3O9NA 1UD6A 1EXPA 1SMAA 3FHQA 2V38A 2UY4A 3IJ8A 3VILA 3W6MA 1DHKA 2ZUNA 1X1NA 3OLGA 4QLJA 2GVYA 1CDGA 4E8DA 2ESCA 2OYKA 2DGAA 1E6SM 2GK1A 4ZFMA 3VIJA 1QBAA 1PEZA 3ALGA 3A4AA 1QNRA 3CZKA 1HJVA 5JBFA 5ECUA 1J0ZA 1W1PA 2V3FA 3NSNA 3K8LA 4HZ7A 1SFSA 3ARZA 4KRUA 3WIJA 2X8RA 2XIIA 1BF2A 3HMCA 2XG9A 3J7HA 4JCLA 4DWSD 1U30A 3OB8A 4TX6A 1OGBA 4JFWA 3EDDA 4B15A 4AYSA 1PZ2A 9CGTA 1TVNA 2FDMA 4ATDA 2C8NA 2JE8A 3O6AA 2PBGA 3SUWA 3F5KA 2DT3A 3WEMA 5GNYA 4AEEA 4P8XA 3IJ9A 3OZPA 3WQ4A 4HMDA 1E55A 2B31A 2XVGA 4PUEA 4MADA 2Y4SA 4DWSA 4M24A 1B31A 1SMDA 4HOZA 3VGBA 5BRQA 5ABHA 1UKQA 5A6SA 2OWWA 1R86A 1DWGM 5A94A 2DH3A 3O2LA 4UFHA 1ZBVA 1CPUA 3EBVA 3WMSA 5ABEA 5ABFA 3BLKA 3THCA 2OWXA 4IPNB 1PX8A 3ARQA 4D6GA 1QI5A 3VDHA 4BQ5A 1TFVA 2A3AA 1JD7A 4UTFA 2QF8A 1R87A 1VEPA 2GJRA 4ML4A 4E4PA 4WKHA 1E15A 1JZ8A 3AS3A 1E6RA 4HU8A 1ISYA 1OSEA 2GJXB 1BGGA 4LYRA 3BGAA 1AIWA 1C8XA 2J25A 1HJWA 2J7FA 4Z2KA 1OINA 2Q8XA 5AC5A 2VVNA 4F9JA 4W87A 1PX4A 2ZUWA 4PSRA 4UZSA 5E9AA 3WEZA 3G6LA 2CHNA 1B3WA 1PIFA 4W7WA 2DSWA 5E0CA 4M80A 4OBSA 4AD0A 3M6DA 4R5EA 4F79A 1EOKA 3ARWA 1E73M 3ARSA 3ZT7A 4PTWA 5C71A 3UESA 4MDPA 1JF5A 5CPTA 1G1YA 3CZEA 4P7LA 1WZAA 5A8PA 4AIUA 1Q6CA 2WLYA 4P7RA 3AMLA 5D9OA 3ARVA 3AS0A 4UFLA 1CLVA 6TAAA 1ISXA 3BAIA 2JEQA 2O9PA 4H8UA 1J18A 3CHFA 2WLZA 1H3GA 2BFGA 2JIEA 3ZR5A 3N18A 3RPMA 2DT2A 5EB8A 2FGZA 1BTCA 4HMEA 1H0IA 2E40A 3VIFA 2Y5EA 1DP0A 4F66A 2XM2A 1H09A 4OBRA 1E6NA 1HNYA 1VF8A 3EMZA 1CGTA 1OWQA 1GOIA 3MMDA 4NZCA 5GQBA 2XUCA 1V08A 3AICA 3U7BA 1XC6A 3VINA 2J74A 2ZWYA 5CGTA 4PN2A 1XD1A 5IDIA 3KE0A 3T2PA 5CSUA 2CETA 4H41A 4JFSA 1M03A 1E6ZA 1UKTA 5D9PA 1U2YA 5JIPA 2WVSA 3FNDA 4UR9A 1VAHA 2G4FA 3K46A 1Y7VA 3DHUA 2W4XA 1I75A 3HJEA 4PCSA 3L4YA 4Z2JA 5BYWA 4J3UA 4TUFA 5CJ5A 1ODUA 2WWCA 4GIAA 4KGJA 1XH0A 3PTMA 3ZQ9A 6A3HA 1C8YA 5A69A 4MNLA 3WNNA 1HT6A 1BYBA 5E09A 4B3LA 1PJ9A 3OLEA 5E6ZA 3RMEA 2XYLA 3PTKA 4Z2IA 1E1FA 3MSGA 1UR1A 4AIEA 3CMJA 3OGSA 3N13A 3IK2A 1C7TA 2PWFA 4JKKA 1OT1A 3ARPA 3GH7A 2BY2A 2DEPA 2W63A 3MUY1 1UKPA 1KGXA 5I78A 4CD5A 3KEHA 1CYGA 1XH1A 4OUEA 1G5AA 3WFLA 1H49A 1H1NA 2J7EA 1W1YA 4UQCA 1CZ1A 5AC4A 3VOCA 2EJ1A 4WSJA 5AY7A 1M01A 1VFFA 3CZGA 1JXJA 3D3AA 3AXIA 1WB0A 4GI9A 5DMYA 4PMRA 1X6LA 4V27A 1V6XA 5A6LA 3GH5A 4J3SA 1HJXA 5ABGA 4JKMA 3W26A 1HKMA 2VX4A 8CGTA 1WDRA 3WKZA 3WFZA 3KL3A 3AFBA 2DH2A 3WNKA 1C7SA 4TTUA 2OSWA 2WZHA 4GO9A 1J0JA 3W0KA 5IXEA 4J3VA 1F4HA 2WVTA 4AW7A 3DHPA 1WE5A 2UWFA 3VU2A 1EO7A 4WKFA 1FH7A 5CSYA 2Y8VA 5BXPA 1VFUA 2WK2A 3VX1A 4AZ5A 4TTGA 2VI0A 3VNYA 3PZQA 4H8HA 3OG2A 3GXIA 1B3YA 3VD5A 3U57A 3PZUA 4ATWA 1EOMA 3W37A 1H0GA 2WM0A 1TG7A 2CEQA 1EHAA 3U5YA 4W5UA 5D8ZA 3WQ6A 2VZUA 3GH4A 4PUDA 5HXMA 1GORA 4LPCA 1ZU8A 5A8OA 2E9BA 2VVSA 3OBAA 5JH8A 4MB3A 2YL8A 1Q6EA 2D0HA 2QMKA 5BROA 5IHRA 2VZSA 4W5ZA 3WL1A 2UY2A 2JIWA 4H04A 3CPUA 4Q22A 5A8NA 5A3HA 1RD6A 2VOTA 5KEZA 3AS1A 3WNMA 2CYGA 3AIUA 1MFUA 2FHBA 1M53A 4J3XA 2NT0A 4KGLA 2E3ZA 3GTNA 1KFWA 3NIYA 5I77A 3WY1A 1LG1A 1QW9A 3NJ3A 3WH8A 4JIEA 3K4AA 1UHVA 3DYMA 2WVVB 3OIHA 1N82A 2CKSA 2AAAA 3OLIA 2ZX5A 5JBDA 1UKOA 5D9MA 1K9DA 2BXZA 2VRKA 5CPSA 1HF6A 3DECA 1GHRA 2GSJA 1B30A 3VD3A 1E0VA 1QW8A 2WMHA 5C8BB 1ISVA 4UQDA 3WH9A 4TVDA 2ZXBA 1FHDA 4D72A 1E56A 1VBUA 1J10A 2GFTA 1MFVA 1VBRA 3IAQA 4E8CA 4JHZA 3ALFA 1WDSA 1GUVA 3ARRA 4FMVA 1E4NA 3RO8A 3A4WA 1L0PA 4HU0A 3N11A 4NI3A 3WD2A 5DF0A 1CGXA 3CTTA 1GQKA 1ISZA 4CU8A 4P8WA 1UD8A 1XRVA 4AIOA 3VNZA 1JZ6A 4JKLA 1UWSA 1Z32X 4BQ2A 3T2QA 3RJYA 4D6IA 2ZX6A 2ZXDA 3CZJA 5HNNA 2BY0A 4H2CA 1QI2A 3BAXA 3AI0A 3VDCA 1XYFA 4PTXA 5CG0A 1TA3A 2J62A 1CXFA 3BLPX 1SR0A 4D6DA 2F2HA 3PTQA 4PYSA 3QHOA 3VGEA 2J7BA 4DUWA 4V2XA 1BFNA 2VT0A 4ZXOA 4XB3A 3W28A 1MWOA 1H41A 1DWIM 4PMDA 4FK9A 1PBGA 3WUFA 4TXEA 3U7VA 4B16A 3NSMA 1GQLA 3GDBA 1QNQA 2VQTA 2AOSA 1UG6A 1BLIA 3N17A 3W38A 1HVQA 2E9LA 1GJWA 1C91A 4PRWA 3ZR6A 5C70A 5BRPA 3F4VA 5DT5A 4C7FA 2A3CA 2CERA 3IANA 2VMFA 2FHFA 1BVZA 3POHA 5GPRA 2FH6A 1E3ZA 2DQXA 5FL1A 4XZWA 3TTQA 2GJPA 2GUYA 1NARA 2YA1A 4H8VA 3TTOA 1ZS2A 2JALA 2WBGA 5M17A 2YA2A 4B9ZA 1JAEA 1K9FA 3AZRA 3K4DA 1WNOA 1DWFM 3GXFA 2WXDM 1EDGA 2JFEX 2BNJA 2ZIDA 3OLDA 1LWHA 4LYQA 4UFMA 5F7UA 2VRQA 3VM7A 1DTUA 4TVUA 4AZ6A 3CH9A 4Q7NA 4GQRA 3EYPA 1EHNA 4QCEA 7CGTA 3AMCA 5IFTA 1CNVA 4HOXA 1UKSA 4MAVA 2G8ZA 4YPJA 2XVLA 4AMCA 2XGBA 1GVYA 1GZJA 2AMGA 3SCOA 4M8UA 3SCSA 1Q6GA 1UOKA 1UUQA 3TTSA 1B3ZA 3KL0A 1ZJAA 1FH9A 3N12A 4GZIA 4P8UA 2VZOA 1FFQA 1HN1A 2J78A 3CUIA 3EDFA 3AHTA 4Z2GA 2MANA 2YLAA 3FW6A 1G0CA 4FF5A 4J3WA 4W8LA 1JFXA 1BQCA 2X05A 5A2CA 2XVKA 1V02E 4AZCB 3RCNA 2V5DA 4U5IA 5E70A 2XM1A 3HU7A 3TP4A 1HL8A 4UOQA 3ZIZA 2WMIA 4D6EA 3CLWA 4AZHA 1UD4A 1K9TA 3WQ5A 1EA9C 2PWDA 2GK1B 2WSKA 4D6JA 4DUXA 1KXQA 5EBAA 3U5UA 3ZSTA 2E8ZA 3MMUA 2W62A 3DC0A 4J28A 3GXMA 4FLOA 5M3WA 3FY1A 3AIBA 1CXHA 2VQUA 1IT0A 1UWQA 1VENA 5IFPA 1NOFA 2WC3A 1HKKA 1O6IA 4ZXLA 4RE2A 1WCGA 2WKGA 1E4LA 3AXHA 3VUPA 1UD3A 3BAWA 2XSAA 1JDDA 3B9EA 2NT1A 1JYVA 3MO4A 4WSKA 4D6CA 4NSBA 1HVXA 2XFFA 1CXLA 4JCMA 1HP4A 3VKKA 2G3NA 2WCGA 1TZ7A 3II1A 1NOUA 2UY3A 2Z1SA 3ZMRA 4U3AA 1GQIA 1Q6FA 2GJXA 4DWSB 2WZIA 2XVNA 4N42A 4UQEA 3GM8A 3M46A 1AQHA 2WHLA 2EPMX 2E4TA 3FAXA 4YHGA 3SCVA 3WUBA 2XHYA 4AISA 1EH9A 2EPLX 1LQ0A 2O9RA 4BZYA 2XWEA 3VGDA 3W4RA 2XPKA 1BGAA 5D9NA 5ABFB 1C8QA 3CUGA 2D3NA 4W8BA 1UWTA 5M5DA 5CXPA 1O7AA 7TAAA 3SCUA 4JL1A 3E1F1 1GOWA 1S46A 1M7XA 3KL5A 1YHTA 2ZUUA 5BXSA 1CTNA 1CXEA 2YJQA 2W67A 2CKRA 1EQPA 1KQYA 3OGRA 3WENA 3AYSA 1IV8A 1JIBA 1LL4A 1W1TA 1FH8A 2CBIA 2VURA 4Y7EA 1W1VA 1J01A 4HTYA 4JAWA 4CU6A 2YL6A 2OYMA 1GPFA 4S3KA 4AC1X 3ZOAA 5TD4A 1ECEA 1R7AA 4PCTA 4LX4A 3N15A 4OZOA 3WH5A 2PWGA 1E71M 2CCRA 1HXJA 2BHYA 2D24A 3S2CA 5A6BA 4TVCA 3UG5A 4D71A 3QOMA 3VM5A 4KWUA 3EDEA 4R27A 3MS8A 4CUCA 4UQAA 4CVUA 3SURA 3VD9A 5EFDA 1E6XM 1JAKA 4JL2A 3NUKA 1C93A 1LL6A 1ZJBA 5E0FA 1CGUA 3WNLA 4XX6A 4H7VA 4XZBA 1US2A 5A95A 4P7QA 2CBUA 2YIHA 2ZXAA 1KR1A 3I3DA 5I6SA 2EXOA 1JNDA 1CXKA 1HJQA 1V6UA 3MU7A 3BSGA 4PMUA 4HPHA 4GI8A 1NM9A 3BAJA 3CHCA 1XGZA 3NDZA 4AZBA 1UR9A 1GJUA 3SUSA 1JL8A 2WC4A 3ZSSA 1KCKA 4JZ5A 1LWJA 1MQQA 1UR8A 1HP5A 1B3XA 3M07A 3K8MA 1EDQA 3IAPA 3EDJA 1W91A 4C7GA 1E0WA 4OOZA 2A3HA 4JFUA 3THDA 3ZT6A 4S3JA 2OWCA 3FN9A 2J77A 1OB0A 2VUYA 1E4IA 2WPGA 3CHDA 1LL7A 2WSPA 2VTFA 4J27A 2J7DA 5IHSA 1HJSA 4W7VA 4AEFA 1JI2A 4WKAA 1XH2A 2VX6A 2ZX8A 2PBOA 3AJ7A 1QBBA 4FLSA 1DWHM 3WF2A 1UD2A 1RP9A 2FHCA 3CUFA 1J0KA 4HPGA 5BXRA 3LPFA 5LA0A 4Z2LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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