1W9UA

Specificity and affnity of natural product cyclopentapeptide inhibitor argadin against aspergillus fumigatus chitinase
Total Genus 145
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
145
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
ASSGYRSVVYFVNWAIYGRNHNPQDLPVERLTHVLYAFANVRPETGEVYMTDSWADIEKHYPGDSWSDTGNNVYGCIKQLYLLKKQNRNLKVLLSIGGWTYSPNFAPAASTDAGRKNFAKTAVKLLQDLGFDGLDIDWEYPENDQQANDFVLLLKEVRTALDSYSAANAGGQHFLLTVASPAGPDKIKVLHLKDMDQQLDFWNLMAYDYAGSFSSLSGHQANVYNDTSNPLSTPFNTQTALDLYRAGGVPANKIVLGMPLYGRSFANTDGPGKPYNGVGQGSWENGVWDYKALPQAGATEHVLPDIMASYSYDATNKFLISYDNPQVANLKSGYIKSLGLGGAMWWDSSSDKTGSDSLITTVVNALGGTGVFEQSQNELDYPVSQYDNLRNGMQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Aspergillus fumigatus
publication title Specificity and Affinity of Natural Product Cyclopentapeptide Inhibitors Against Aspergillus Fumigatus, Human and Bacterial Chitinases
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE
total genus 145
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1w9uA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1w9uA01
4MNJA 3O2LA 4H41A 2WBGA 7A3HA 1NM9A 1FA2A 1G94A 2OWXA 3U5YA 3T2PA 3FNDA 1OBAA 1V3HA 3RM4A 4J3UA 5M03A 3WD0A 1XCXA 1XHGA 5BROA 4ZXOA 2V3GA 1VRXA 4W87A 4JFSA 1E3ZA 1HN1A 2YLLA 3W25A 2J79A 1H49A 2BVTA 1V0LA 1VJZA 1EA9C 5AC4A 4AD0A 1K9TA 3GH7A 2VRKA 3KEHA 4PMOA 2XGBA 3NIYA 3U5UA 3VINA 1KQYA 2NW0A 3PTMA 5A2BA 1UKOA 4UQEA 1VEMA 1DWGM 3SUSA 3POCA 2VZVA 1UWTA 4NI3A 2VUYA 1E3XA 1SFSA 4C7DA 5GNZA 1V6WA 4GPNA 8CGTA 1OGBA 3BCDA 2GJRA 2C0HA 1E4IA 3CIVA 2ZX6A 2QLYA 5I23A 2XM2A 5FL0A 2WZEA 1BSIA 1H41A 2E9LA 3BSHA 4MJ2A 2XGIA 5A6SA 2D22A 3NSNA 1R7AA 4JIEA 5M5DA 4PTXA 3A4WA 2WNWA 4QLKA 1J01A 4Z2IA 3WFZA 3IJ9A 4GO8A 4XX6A 4UFMA 2OSYA 4LGXA 1LWJA 3EDDA 1FFQA 1GCYA 2YJQA 2CEQA 2WHMA 1TFVA 5M17A 3ARTA 2CKRA 2E8YA 3NCOA 3F5LA 3OLEA 3WQ5A 1VBRA 3N1AA 2VNCA 5A8NA 3DC0A 6A3HA 5KEZA 3WF1A 4XZWA 2DSUA 1BVZA 5ECUA 2YL9A 3GXDA 4HOZA 1KR0A 5CSUA 2WBKA 4W85A 1V0NA 2ZOXA 3JUGA 1XH1A 1PEZA 4UQDA 3NYDA 5HBFA 3HJEA 4IM4A 4ZENA 4JFUA 1CLVA 4AZ5A 4GO9A 3EDKA 3KL0A 4EKJA 4F79A 3PZUA 4MADA 3LPFA 3CHCA 1OD8A 1HL8A 2JE8A 2W92A 1HKMA 5AYBA 2ZUTA 1J11A 2JFEX 3MV01 2J47A 5A8PA 1TA3B 1UYQA 4PSRA 3PZGA 3VIFA 4P8UA 1TZ7A 1K9DA 5BXSA 4UQ9A 4B3KA 3QGVA 1UD4A 3GZAA 1KWKA 1E6NA 1TE1A 1C8XA 1QVBA 2QF8A 1V6UA 1OWQA 5A8OA 5A94A 1W1YA 1J10A 2J7BA 4MNLA 1Q6GA 2A3HA 5CG0A 4ATWA 1VFOA 1WCGA 3AHXA 3UR7A 4A3HA 3FAXA 4H7VA 1Q4NX 1JDCA 2WMHA 2VVSA 4W7WA 4J3XA 1H5VA 3PTQA 1VEPA 4GQRA 3WL1A 1MXDA 3AHZA 5D9OA 1CYGA 2UY2A 1ISXA 2XG9A 4JAWA 4BQ4A 3THDA 1YQ2A 1V03A 1OB0A 5I24A 2J25A 4OKDA 3AIRA 2F61A 3AROA 3PZVA 4WLCA 2WZHA 2OSXA 2J7GA 3MUY1 4UOZA 3AOFA 4Y7EA 2CBVA 1QI3A 4DUWA 4WKHA 3AIQA 1AQMA 1JZ5A 4HA1A 4W86A 1PX4A 2CETA 3PZOA 3KL5A 4UOJA 1HXJA 3IAQA 4WK9A 4YPJA 2PWDA 2ZXDA 1M53A 3BCFA 1VF8A 1CWYA 1BHGA 2VX4A 4D6IA 3WNKA 1W91A 3WSUA 2A3AA 2WB5A 1W9PA 1CGTA 3QHOA 4AZIA 1DP0A 2J75A 4NRSA 3AFBA 5A3HA 2JIWA 4A3YA 1EOMA 4P7NA 3BAYA 4UQBA 5E6YA 1JYVA 1HJWA 1B3YA 2BY0A 1MW3A 4J27A 3N18A 1R7OA 1EO7A 2DGAA 1CXLA 3WF2A 1GJUA 1P6WA 1TR1A 3L4UA 3TTOA 2A3EA 5ABHA 4LX4A 2UY5A 4AYSA 5C70A 2WAGA 1CTNA 3MSGA 1AVAA 3ARVA 2O92A 3VGEA 1OINA 3G6MA 3K1DA 5DT7A 4PMXA 1GOMA 1B31A 1JXJA 2W5FA 3CZLA 1NP0A 2D0FA 3UESA 3CPUA 5CSYA 1UR1A 3W27A 2ZXQA 5CGMA 1OGSA 2EPLX 1OSEA 3GBDA 3WUEA 4PMDA 4TXEA 5A8QA 3VGDA 1UKTA 3SCWA 4JHOA 1XC6A 3SUTA 3OZOA 1CLXA 3M6DA 2J7FA 4Q7NA 3WMSA 5JBDA 2XIIA 4KRUA 4HZ8A 1W9VA 2JF6A 3SCTA 2NT0A 4DUVA 1VJSA 3CZJA 1LL6A 2FHCA 1H4PA 3VNZA 3VD9A 1GZJA 3W37A 2ZE0A 1BYDA 2YL5A 3L4VA 1QI4A 1B3ZA 5JIWA 2D1ZA 1V3JA 2XVGA 2XFFA 2IUZA 3BXWA 2VZOA 2YDRA 5E0FA 1UR2A 3POHA 2V5CA 2WXDM 4C7FA 1BTCA 3BAIA 5HPCA 2XFYA 1W9DM 1GOQA 1XSKA 2YKKA 2W61A 5EFFA 1DWAM 3WF3A 4AEEA 1RP9A 3AISA 1QNQA 3ZQ9A 5E9AA 2J7CA 1E15A 1NP2A 5CGTA 1HP4A 3KZSA 3PZMA 3MKKA 3EMCA 3OLDA 3WH7A 1H1NA 3MUIA 4IPLA 4NSBA 3VD7A 3VGGA 1ZBCA 3VD3A 5EBAA 1IT0A 2D3LA 2XVKA 4CGTA 3AHVA 3VGBA 1GUVA 5EFDA 4XB3A 5LYRA 1XH0A 3K8KA 2XIBA 4PMZA 1UWSA 3GNOA 1RP8A 2ESCA 1QHOA 3SCUA 5CPQA 2DH3A 4WSJA 3AICA 4N0RA 5BCAA 1UD5A 3A6OA 5C71A 4IISA 3PZQA 1WPCA 4ZXLA 4U31A 4V2XA 1I1WA 4AIEA 3CHEA 1W3KA 3W6LA 4RE2A 3RM9A 3WF4A 3CO4A 1E4LA 1X6LA 3VKKA 3W0KA 4HPHA 1B0IA 2BXYA 2VVNA 3UG4A 3GNRA 1EQCA 3W4RA 2O9RA 2UY4A 1R86A 4QCFA 1W1TA 4V28A 4BZYA 3VGHA 4U2ZA 3VPLA 1RPKA 2J78A 2C7FA 6TAAA 3WEOA 1A3HA 4HOXA 4Z2JA 2WK2A 5ABGA 3VMPA 2YIHA 4WIWA 1E40A 5CPSA 3WN6A 3VDBA 4PMVA 2EPOA 1JFHA 2YL8A 3KWXA 4UFKA 4CN4A 2Q8XA 2VZTA 1XGZA 3T08A 3GBEA 2V5DA 3WQ8A 3WNLA 3VM5A 4E4PA 1OCQA 2CESA 1UR4A 1HX0A 4QFUA 3VIGA 1SMAA 1JD7A 2PBOA 3K46A 3ALFA 4UOQA 5GNXA 1HJSA 3SCPA 1WAWA 1LG1A 1BQCA 4FLQA 1BG9A 1U30A 2VOTA 5D9MA 2D24A 4DUXA 1NOFA 4MB1A 1HKKA 4URIA 1UWQA 1I75A 3NJ3A 2YLAA 3ZT6A 1UH2A 2DEPA 2JALA 3VU2A 1HKJA 4LYQA 1W3HA 3CZ8A 2XHYA 3M7SA 1W9BM 3APGA 3BC9A 5A6BA 1F4HA 1S46A 2X05A 3OLIA 1V08A 1DWHM 4P8XA 4UNIA 3UEQA 2BHYA 1J0JA 1V3KA 1TVPA 1JG9A 4N42A 3GNPA 1MWOA 1EH9A 3DYMA 4IPNB 4E2OA 2YA0A 2FHFA 2G4FA 1VFMA 3RDKA 5GQBA 4UQAA 1CIUA 4OIFA 2GJPA 4KMQA 1B3XA 2JF7A 3WY1A 1E6RA 4U5IA 4D1IA 5CLWA 3SCQA 3ZOAA 4XUYA 3WD3A 3N12A 2DSVA 1WDQA 4ZFMA 1JL8A 3U7VA 2J7DA 2WHLA 1HP5A 1KR1A 1B90A 2VQUA 3PTKA 4U2YA 4TTUA 1VFUA 1BVNP 4S3KA 2VZSA 2YA1A 5LA1A 3S2CA 1FFRA 1D3CA 3EDJA 4W5UA 1UOKA 3MANA 1C8YA 1UA3A 2EBNA 1UR9A 4F8XA 3ARXA 1VAHA 4CCDA 3PBGA 2J74A 2PC8A 3RO8A 1NOWA 4GI9A 4BCEA 3VIMA 1CPUA 1JIBA 1CBGA 4R5EA 1UWIA 2OWWA 3IK2A 2DQXA 3PHAA 2RGLA 1PIFA 3RJXA 1B3VA 2PBGA 9CGTA 4DWSB 3KL3A 3OBAA 3VVGA 2PWEA 3THCA 5IDIA 4B16A 1EXPA 1NWSA 4BS0A 4W7VA 1E6PA 2DIJA 3VO0A 4AZGA 2UY3A 4DWSA 3CZEA 2FGLA 3FAWA 1R8LA 1OIFA 3CMJA 4XZBA 2J7HA 1GJWA 4J3WA 4OOUA 3WKZA 1QOXA 4PMUA 1GW1A 2WCSA 5CLTA 2DPEA 3PZTA 1C7SA 1UQYA 2BY2A 1GHRA 1KGWA 1QW9A 1FOBA 1HVQA 2BVYA 3AIBA 4W8AA 1V0KA 1CGWA 4B15A 3WMCA 3EMQA 2WHKA 5F7UA 4QDMA 1UH4A 2ZX7A 1XSIA 2VR5A 4GZEA 1ZBWA 5E70A 3BAKA 1E55A 4B3LA 2X8RA 3GXFA 1FH7A 3AMKA 2WM0A 2X09A 1J0KA 3WQWA 1KBKA 3VDCA 3IJ7A 4TUFA 1U33A 2V3EA 1JNEA 1H2JA 1KCKA 1BFNA 1HNYA 2G3IA 2Y5EA 2WSKA 5FD0A 2Y8VA 4U3AA 1CXKA 2CBJA 4QAWA 3VD4A 3ZR5A 5IFPA 2E9MA 5IHRA 1PJ9A 1C7TA 3ARSA 2C8NA 6CGTA 1K9EA 5AC5A 3WMBA 4D6GA 2FH6A 5A95A 4FLOA 4WJXA 2GUYA 1QI5A 2ZXAA 5A6JA 1MVYA 2WC4A 3BAWA 3W82A 3WDJA 4GZIA 3WNPA 3AYSA 5D8ZA 3LPGA 2X0YA 2WW5A 3UCQA 3RMEA 4JCMA 5LA2A 5I77A 2OYKA 2WCGA 4D6JA 2EO7A 3IANA 3VMNA 4HMDA 4ZE5A 1UWRA 1TA3A 1W3LA 1UQZA 2EEXA 4OBSA 3PZIA 2CCRA 1XRVA 1BYAA 2XM1A 3K4AA 4HZ6A 1WNOA 4ACYA 1HIZA 3CUIA 4J7RA 4QCEA 3RPMA 5I3DA 1GOOA 5FKYA 1J18A 2FHBA 3NSXA 4UZUA 1ZL1A 1IZKA 1HL9A 3M46A 1ESWA 3WQ4A 1VENA 2VRQA 5I79A 1ISWA 1E73M 4PBGA 1WZLA 2W62A 1SMDA 3N04A 2QPUA 3WENA 2DSZA 2GDVA 3PZNA 3DHPA 3CZKA 4FMVA 1GVIA 2CBUA 4LXFA 4OZOA 1JDAA 3LPOA 3TONA 3OA5A 1CGYA 4JKLA 2GFTA 2GJXB 3MU7A 1FHDA 3FXYA 3ZM8A 4DM2A 3ARPA 1PBGA 3WUFA 4TVCA 8A3HA 3WD1A 3DHUA 2VO5A 2CKSA 1E1FA 1NARA 3F5KA 3A3HA 1E71M 3WFLA 3WH8A 1UKPA 2AOSA 1E43A 3T2QA 4HOWA 4P7RA 2WMGA 4PMNA 1TMQA 2BNJA 3OB8A 4MDPA 1LG2A 4GZJA 4KGJA 4JKMA 5DO8A 2DT3A 4AISA 3ARYA 1B9ZA 1E0WA 1MFUA 3WQ6A 3ZSSA 1GOKA 1LF1A 4HTYA 1DWIM 1JXKA 2VX7A 2Y2WA 1L8NA 1W9XA 1QHPA 1ZBVA 2ZICA 2VCBA 3GH4A 4AZBA 2E3ZA 2WVUA 3WDPP 1Q6DA 3ZSTA 4KGLA 5EB8A 3AZSA 4AD5A 3WQVA 5E09A 1M04A 2CHNA 1X6NA 4HU8A 2GDUA 1JGIA 5CPTA 3CUGA 1GNXA 2WZIA 1XH2A 2E0PA 4HP5A 3WNMA 1E1EA 1ZS2A 1JZ3A 3VDHA 5BXPA 1IZJA 4CKQA 5D4YA 1UUQA 3NDZA 2O9PA 1WKYA 3VM7A 3VIHA 4FLRA 2Z1SA 1JZ6A 1EOKA 1Q6EA 2V3FA 2VCAA 1WZKA 1DHKA 3MV11 4OOZA 2A3CA 1WE5A 1E6ZA 2PF0A 1Z32X 1TUXA 3T0AA 3OG2A 5FCZA 3VD5A 3AXIA 3CMGA 5A69A 3EYPA 1TCMA 3N13A 1LL7A 1NQ6A 4MB4A 2CIPA 3L4ZA 2E40A 3T0DA 2VX5A 4YN5A 3T0BA 2WC3A 2WMIB 4NRRA 1UD8A 1NWUA 3ARRA 3VIOA 1E6XM 1KXQA 1OGGA 2D20A 3II1A 1KQZA 1IV8A 1US2A 2E4TA 1UWUA 3AMDA 2J8GA 5E0CA 4M8UA 4D71A 1C93A 1E5JA 1K9FA 5CJ5A 1E6SM 2WMIA 2QMKA 3WF0A 2WPGA 3EMZA 1R87A 3OGVA 1UKSA 1VBUA 1RD6A 1PZ3A 2V38A 1QPKA 1B2YA 1EDGA 1HF6A 4M80A 3QOKA 1EGZA 4LPCA 2DSKA 3N9KA 2YBUA 1EO5A 5DFAA 1VB9A 3SURA 2VMFA 4J3VA 2VCCA 5JIPA 4U33A 4LYPA 3AHTA 4ZE4A 1C92A 4S3JA 2WANA 3VMOA 5HNNA 3S6TA 1W1PA 3CHDA 4PUDA 3VX1A 3ECQA 1N82A 1KGXA 2W66A 1MYRA 3WDQA 1CGVA 1C8QA 1C91A 1PAMA 1E9LA 2OYLA 4F66A 5BYWA 1QI2A 2PB1A 2O9OA 1CXIA 3WBEA 1G0CA 1GQLA 4HMEA 4AD2A 3BAXA 4CD7A 1HJQA 4JL2A 1KBBA 3MUAA 1JFXA 2ZUMA 1D2KA 1W2PA 3D5HA 1H11A 5JBEA 3O6AA 3UG3A 1E72M 5IXEA 4MTVA 1CDGA 5A8MA 3SUWA 3CTTA 2ZX8A 2EPMX 4HPGA 1E56A 3RM8A 3CGTA 3G6LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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