3CHEA

Crystal structure of aspergillus fumigatus chitinase b1 in complex with tripeptide
Total Genus 146
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
146
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
ASSGYRSVVYFVNWAIYGRNHNPQDLPVERLTHVLYAFANVRPETGEVYMTDSWADIEKHYPGDSWSDTGNNVYGCIKQLYLLKKQNRNLKVLLSIGGWTYSPNFAPAASTDAGRKNFAKTAVKLLQDLGFDGLDIDWEYPENDQQANDFVLLLKEVRTALDSYSAANAGGQHFLLTVASPAGPDKIKVLHLKDMDQQLDFWNLMAYDYAGSFSSLSGHQANVYNDTSNPLSTPFNTQTALDLYRAGGVPANKIVLGMPLYGRSFANTDGPGKPYNGVGQGSWENGVWDYKALPQAGATEHVLPDIMASYSYDATNKFLISYDNPQVANLKSGYIKSLGLGGAMWWDSSSDKTGSDSLITTVVNALGGTGVFEQSQNELDYPVSQYDNLRNGMQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based dissection of the natural product cyclopentapeptide chitinase inhibitor argifin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Aspergillus fumigatus
total genus 146
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2008-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3cheA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3cheA01
4AZCA 3VM5A 5LYRA 4P8UA 2ESCA 1B30A 1MQQA 2JEQA 3LPFA 3N11A 4H8UA 3WEOA 3AS0A 1OT2A 2J75A 3ZR6A 1E6XM 3WN6A 3KZSA 2XJ7A 4C7GA 1LWHA 3MUY1 4HA1A 3PZQA 4X0NA 1UKQA 4RL3A 1E6NA 4D6EA 3WQ5A 1O7AA 1JDCA 2PWGA 3ECQA 3F5JA 3WH7A 5IHRA 1EOMA 1CGYA 3ZT5A 3CHEA 5HBFA 2CKSA 1MXDA 4CCDA 1SMDA 4AEFA 2OWXA 1ISWA 3WMSA 3GH4A 1V6XA 3HMCA 3WQVA 1YHTA 2YDSA 3U57A 4FLQA 1V6VA 5GPRA 1PIFA 2Y24A 4P7NA 3VMPA 1NM9A 3SUUA 5IFTA 1VIWA 1QHOA 1GVIA 3WF1A 4UFLA 2D3LA 3UG5A 1QBBA 2VCAA 3VIIA 2VX7A 5AYBA 2XHYA 4E8DA 3ZR5A 1EHNA 5DF0A 3T08A 1QNOA 1R87A 5A1AA 1UG6A 4LGXA 4D71A 2W61A 1UD3A 4UNIA 4TX8A 1UR4A 2UY2A 1JYXA 3WELA 4AZCB 2IXUA 3WF2A 1RD6A 4M1RA 1V3KA 1B3XA 5D9NA 1EDQA 4UFMA 4ATDA 2XVNA 1WZLA 3M07A 1HKJA 3WUEA 3VMNA 3T0BA 4D6HA 1A3HA 1QHZA 1H4PA 1M01A 4JL2A 4UZSA 1JZ3A 3CTTA 1VENA 4PMOA 2J74A 3AHXA 3W27A 4H8VA 1CEOA 1G01A 3K46A 5JIPA 1GQLA 4MDOA 4ACYA 2JF6A 5I6SA 4S3KA 2ZXDA 1HJVA 3U5UA 3I3BA 4L4OA 3MV01 4Z2KA 3AMCA 3CGTA 3UERA 2BY1A 1HVQA 1X1NA 2DDXA 1W32A 3LMYA 2QPSA 1VF8A 4TTGA 4J3XA 4E4PA 2DSVA 2DH2A 4MAVA 3PN8A 4CCEA 5E6YA 1WDQA 3KL3A 4JFSA 2QLYA 3ZOAA 3FHAA 1HN1A 2YA1A 1OSEA 1C92A 1V3MA 4DWSA 4UFJA 2WK2A 1W9BM 4QFUA 3AXIA 1CXFA 5FKYA 1NP0A 2PB1A 3TA9A 1O6IA 2EXOA 3WUFA 1GPFA 1B3WA 2WANA 1I1WA 2E9LA 4XX6A 7CGTA 4TUFA 4D1JA 1PAMA 1HF6A 1WB0A 2Q8XA 1V03A 3M6DA 4UOQA 3MMWA 3ZJ8A 4OOZA 1GONA 4LPCA 5IHSA 2WBGA 4UQEA 3THCA 4C7FA 3F5LA 2XPKA 3OLIA 3B9DA 3K8LA 3WD2A 2CBJA 1KXQA 3SCQA 2FDMA 5I3DA 3L4YA 3ARYA 1HJUA 2HVMA 2Y4SA 2XG9A 1ODUA 4KRUA 1P6WA 3OGSA 4PMXA 3MO4A 4KRTA 3TTYA 1EA9C 2BS9A 5BYWA 1PJ9A 3JUGA 3WNMA 1LL4A 3AISA 6CGTA 1M7XA 4NF7A 3U7VA 1BF2A 2GDUA 2VI0A 3DYPA 3RM4A 3M7SA 4ZE5A 3NDYA 1DWIM 4CU6A 1WPCA 1VB9A 4MJ4A 4CD6A 4U5IA 2WMJA 1HL9A 4EKJA 5EBAA 3B8SA 4P7OA 2QHAA 2BY3A 3VGEA 1DWFM 3CMGA 3PZNA 5C71A 3VKKA 2J7FA 1XD0A 4CN1A 3CHDA 5A8NA 3VD4A 3KL0A 4P8WA 3QHNA 4N0RA 4W88A 3QOKA 3ARXA 4AWEA 3PZUA 3WH6A 5ABFB 4Q22A 3ARRA 1DTUA 4L4PA 5E0FA 2V3EA 3EMCA 2CBUA 2VX6A 4PUDA 4AXNA 3I3EA 5A3HA 3MU7A 1KXTA 3WQ8A 3CHCA 2QMKA 5E70A 4AD0A 3SCWA 4TX6A 4UFIA 4M82A 3W82A 1E0XA 1LJYA 2WZHA 5DT7A 3GNOA 2WMIA 3QR3A 1IT0A 3TTQA 1PEZA 1AVAA 3WQ6A 1UH4A 2O9TA 3AMDA 2BHYA 1NH6A 1W9UA 5ABHA 2DT2A 3NSNA 1UA3A 2XSAA 2EPLX 5IFPA 5E0CA 3NJ3A 3A6OA 3IAQA 3EMZA 1B0IA 1NWRA 4JZ5A 3W53A 5JBFA 1ECEA 3ZM8A 2OSXA 2MANA 4PMZA 2PBOA 1QNPA 2XVLA 1EIBA 1BGAA 4JKLA 1WZKA 1E5JA 1Q6FA 2WSPA 1ISXA 1GOKA 5CSYA 1E1EA 2V3DA 3PZMA 4U3AA 1OGGA 2DSZA 2VURA 3FHQA 1OGSA 1ISYA 2WC3A 4UTFA 3S2CA 2ZXAA 3T2PA 4CN4A 5AY7A 2V5CA 4TOQA 3WF3A 1HP5A 1E1FA 3VD3A 2FH6A 1GW1A 2WMGA 3EBVA 2YL5A 4GPNA 4OBSA 3VILA 1TG7A 2V5DA 3ZJ7A 1F4HA 2ZXQA 2Y2WA 2JFEX 3BAJA 3WD3A 3SCNA 4OJYA 2J7DA 2WMFA 3NIYA 2VVNA 2C8NA 1KGWA 4ZEPA 1KCKA 1K9TA 3PBGA 3CUHA 5C70A 4OUEA 3CO4A 1BQCA 1CZ1A 1V3JA 4V28A 5D9MA 4KGJA 1EOKA 2W92A 1E73M 1D7FA 3PZ9A 1CLVA 4PMRA 4V27A 7TAAA 3MUAA 3T2OA 1HKIA 1GQKA 2Z1SA 1LWJA 5HNNA 3LPPA 1VFMA 3VDCA 3WNPA 1HJQA 1E56A 2VNCA 1QI0A 5BXSA 3WMCA 4PUEA 2WHKA 5BRQA 2OWCA 2V38A 1KXVA 3WDHA 1CYGA 2G41A 5A6BD 4OIFA 5ABEA 1ZS2A 1HJXA 2G3MA 2DEPA 1FH7A 3GYCA 1E0VA 3I3DA 4M81A 1ZJBA 2YLAA 1BG4A 1UWUA 2YDQA 3HU7A 1JFHA 4CD7A 1BYBA 2DH3A 4K68A 3HJEA 2BXYA 1ZBCA 3N17A 4D6GA 1WP6A 3IK2A 1UQZA 4BS0A 4WKFA 4X9YA 2EBNA 3BGAA 3VUPA 1W1TA 3VM7A 3W81A 3ZT7A 5A6JA 1KXHA 5E6ZA 3N1AA 3VIHA 1LL7A 1PZ2A 1KR0A 2J25A 3A4AA 3GH7A 3PTKA 3FAXA 1ODZA 1UWIA 2GVYA 2EPOA 1VJZA 2JF7A 3POCA 3RCNA 3L4WA 3MS8A 2WYSA 3WUGA 2E8ZA 3VDAA 4BZYA 1FHDA 1WZAA 1CXIA 1MVYA 4D6IA 4QCFA 1NQ6A 3VGDA 4PSPA 4UR9A 4ZENA 1RPKA 1ISZA 4JHOA 1NOFA 1CTNA 1GNXA 4AZ5A 1W91A 3AZTA 3OB8A 1QNSA 1M03A 2D24A 2WZEA 2WMKA 3O2LA 5M03A 3MUZ1 3RJYA 3RM8A 3W38A 3E1F1 1GQIA 1LG1A 1E72M 1Q6CA 2OYLA 4Y7EA 2JE8A 2WHMA 3EMQA 1E6RA 4JHZA 4PN2A 3TTSA 3G6MA 4Z2JA 5JIWA 2BVYA 3PTMA 4MPKA 3QHOA 4ZE4A 3CZJA 5FCZA 4D6DA 2W5FA 2BHUA 1UKTA 1V6WA 4CGTA 1TR1A 2FHCA 2OLHA 2FHBA 3W26A 3BCDA 2VRKA 3DYMA 1CGUA 1J0ZA 1VEPA 1VJSA 4FLOA 1BYCA 1OT1A 3NCOA 2EQDA 5A8OA 1HP4A 3SCUA 5A6SA 1W3HA 1S46A 3BH4A 1V6UA 2W91A 1W3JA 4F8XA 5FOOA 3SIMA 4JFTA 1CBGA 5DFAA 1FFQA 3GXDA 6TAAA 3CUFA 3VIKA 2X0HA 1L0PA 1BTCA 3WDQA 1J0YA 2GUYA 3IAPA 1UWSA 2O9OA 2ZXBA 1GHSA 2GDVA 1GOMA 2CBVA 2BVDA 2QV4A 2QF8A 4HOWA 2VVSA 3GTNA 3ARWA 2YBUA 2ZX8A 2X2YA 9CGTA 4P7QA 4CU7A 3UEQA 4MNLA 1EDGA 2O9PA 1AMYA 2YL6A 4J7RA 3VIFA 3VIOA 2Y8KA 2XTKA 1CXHA 2VTFA 3PHAA 5CPTA 4HOZA 3BSHA 4HP5A 3B9AA 2VX5A 2D0FA 1E70M 3VGFA 2W4XA 3WF0A 1C91A 4WKHA 4AIEA 4DWSD 3SCRA 4DUVA 1VFUA 3W25A 5BXRA 1W9PA 2VO5A 2FH8A 5A6KA 3MMUA 4D72A 3K8KA 1HT6A 3WEMA 1UD4A 2W63A 3WQWA 3OLDA 4JFVA 1MYRA 3BAIA 1B3YA 1J12A 3GZAA 4CN6A 2B31A 3ZIZA 1VBUA 3T2QA 2A3BA 2VR4A 1UOKA 4BQ4A 5CLWA 4HMEA 4B9ZA 3D3AA 3VGBA 3UCQA 1GOOA 1G0CA 3BMWA 1E4IA 4S3JA 3AS3A 3VTRA 1UQYA 4KH2A 4U2ZA 3AYRA 1BLIA 3WDRA 4LXFA 4W84A 1HXJA 4CD4A 1BYAA 4BCEA 4TVDA 1MW3A 3ARPA 4X0VA 4IM4A 5A8QA 1JZ8A 4PTXA 1JZ6A 1HX0A 1RH9A 2BV9A 1BPLB 1EXPA 3L2MA 4J3UA 3CIVA 1BGGA 3FNDA 1E6ZA 3RPMA 4AY1A 1H09A 3WD4A 3UG4A 2DPEA 1W1VA 1QNQA 4D6FA 4BQ2A 2CPUA 2VJXA 1UD5A 3MKKA 3EDEA 4H7VA 3II1A 3ZT6A 2GK1A 1XH0A 3WEZA 4JCLA 3SUVA 2ZX5A 3DECA 2DT0A 2NW0A 3EYPA 4NZCA 1D3CA 1TUXA 2XSBA 1C8QA 1XRVA 2QPUA 5CG0A 2DSKA 1K9DA 3N18A 5HPOA 4WIWA 4DWSC 3BAXA 2BFGA 3AHVA 1JAEA 1V0KA 3GDBA 4MNJA 3GBEA 3WY1A 5I77A 2GFTA 2WNWA 4PMVA 3N12A 4UQ9A 3QGVA 2OYMA 4YN5A 5ABFA 5BWFA 3WH8A 1OB0A 4MNKA 3NSMA 4LQ1A 2ZX7A 4P7LA 2FGZA 2VZTA 2WLZA 3VVGA 3G6LA 2C7FA 4CKQA 3WENA 1QI3A 1VRXA 4MAZA 4AIOA 1H49A 5HOSA 4HMDA 4JFUA 4DUWA 3PZOA 1ESWA 4U2YA 3OGVA 5D9PA 1PBGA 1NWUA 2PC8A 5BROA 2DT1A 1EH9A 2G3JA 5HXMA 1EHAA 1X6LA 2XWDA 1V0MA 2VUYA 2CCRA 2NSXA 4MNMA 2JIEA 1QBAA 1U2YA 5AC4A 5AYIA 1DWJM 3W4RA 2RGMA 3THDA 1J0IA 4FF5A 2GJRA 2WZIA 3TP4A 2WMHA 2ZICA 1V08A 4D6JA 3RO8A 3BLKA 1X6NA 5I24A 4HU8A 4HZ7A 5C8BB 4YHGA 1NOWA 4GI6A 3WKZA 1C90A 2GK1B 3ALGA 2W62A 1V0NA 1XV8A 3VOCA 4CVUA 3OGRA 4A4AA 3J7HA 1JZ7A 1W2PA 5LA0A 1UYQA 3WBEA 3VX0A 4R27A 2WPGA 4JL1A 1OIMA 4W5UA 4LYRA 1IV8A 2QMJA 2YDRA 3KEHA 2XVGA 4PMYA 1JYVA 4XUYA 1EDTA 1JNDA 2WCSA 4XZBA 1LG2A 2NT0A 2DGAA 2PBGA 3IJ9A 1DHKA 1PZ3A 1GJWA 3RDKA 2O9RA 1C7TA 1TFVA 3AMGA 3A4WA 3AICA 2XGIA 2JEPA 3VPLA 3QOMA 3AFBA 1E4MM 3BAYA 4Z2GA 1JI1A 2YL9A 2ZUUA 4AC1X 4AZ7A 1MW1A 5GQBA 4KMQA 5A69A 4RE2A 1KWKA 3N9KA 2CITA 4F9JA 1ZBWA 1QI4A 1G94A 2CYGA 1BAGA 3O9NA 1LF1A 3WD0A 4CD5A 2DSWA 5CJ5A 1JXJA 3GNPA 4FK9A 3SUSA 3PZTA 4ZXLA 4F79A 1TZ7A 3AYSA 3OIHA 1QI2A 1JFXA 3WF4A 5I5RA 4E8CA 3NUKA 1UKPA 4W7VA 3FAWA 2RGLA 1E6SM 1W3LA 1EO5A 2YL8A 4JKKA 4Q7NA 2YOCA 1NWTA 4W93A 4XB3A 2WSKA 2ZWZA 3PTQA 1E3XA 1UD2A 4AZGA 1B9ZA 1AQ0A 1XYFA 1KB3A 1MFVA 3BMVA 4GI8A 3WQ4A 1U30A 2CNCA 3AZSA 2W66A 2GJPA 1WKYA 4M56A 1MQPA 3DHUA 3GXIA 2CKRA 2XUCA 4EK7A 2CHNA 1KFWA 5CPQA 4HZ6A 2O92A 1BG9A 4J28A 4V2XA 1I75A 3RM9A 5E09A 2BVTA 4W8LA 4WSKA 3ARQA 1CXKA 1JD7A 1XYZA 2IXVA 3IJ7A 5M3WA 3WFZA 4P7RA 3CBWA 2EJ1A 3OBAA 5E9AA 1V02A 2YKKA 2XIBA 2BY2A 1J18A 4J27A 2DIEA 1B3VA 1V3LA 1E40A 4B9YA 4B3LA 4D6CA 2DT3A 2X09A 4Z2IA 3WD1A 2D0HA 3SCVA 2ZWYA 3LPOA 3MANA 4B15A 1JAKA 1HVXA 4UCFA 4UQBA 2DSUA 5ABGA 4Z2LA 1VFFA 8CGTA 4GO8A 1E55A 5ECUA 3T09A 1TA3B 1KQYA 4MB5A 1CDGA 1UD8A 4TVCA 3AMLA 1OBAA 1OWQA 3F4VA 1E43A 3OLEA 1UWRA 5DEZA 2D0GA 3EDKA 3W0KA 4XV0A 2A3HA 4M29A 1B2YA 5EFDA 4AIUA 2EO7A 4JFWA 4J3TA 3BC9A 3PZVA 4YPJA 3U5YA 2VT0A 2ZIDA 5AC5A 4AD5A 3EDDA 3ARUA 1IZKA 1E3ZA 2F61A 4WF7A 3L4XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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