1LJYA

Crystal structure of a novel regulatory 40 kda mammary gland protein (mgp-40) secreted during involution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPKLKTLLSVGGWNFGPERFSAIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTALVKEMKAEFAREAQAGTERLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFRGNSDGSSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSFTLASSKTDGGAPISGPGIPGRFTKEKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLAEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
publication title Crystal Structure of a Novel Regulatory 40 kDa Mammary Gland Protein (MGP-40) secreted during Involution
pubmed doi rcsb
molecule keywords MGP-40
total genus 111
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1ljyA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ljyA01
1EQPA 1H0GA 3RJXA 2XFFA 4W8LA 3ARZA 3CHFA 3W28A 2CHNA 2WSPA 4QLLA 4YHGA 5C71A 1MW1A 2V38A 2WHJA 2X2YA 3NYDA 5A2CA 1I75A 1OT2A 2NT0A 2XWEA 3PZNA 2WHLA 2WB5A 3MO4A 3CUHA 1JXKA 4WIWA 1B0IA 2GDVA 3BMVA 4MJ2A 4PTMA 1WZAA 4EK7A 3G6LA 2BY1A 2YL5A 1JYXA 5BWFA 2RGMA 2G4FA 3CLWA 1GZJA 5BYWA 4DUVA 1XCXA 1WKYA 4PMZA 3VGGA 2PF0A 1E73M 1CPUA 4C7FA 2GDUA 1BVNP 3FHAA 4CUCA 2GK1B 4D1IA 1UD6A 4UQ9A 2WANA 3OG2A 3SCTA 3GDBA 1ISVA 1WCGA 1W3LA 2W61A 3L4YA 4ATLA 4MAZA 2OLHA 2YA2A 3MUIA 4PSPA 4AIOA 4FF5A 4MDOA 3SCVA 1CIUA 1XC6A 2Y24A 4HA3A 3VX1A 1LJYA 1UHVA 3VGBA 4PMRA 4CCCA 5CPSA 5I2UA 1UYQA 2WK2A 1EIBA 4AD4A 4OIFA 3RIKA 1BGGA 2D3LA 4AEFA 4UFHA 1BG9A 3ALGA 1HX0A 1LWJA 4W85A 3QOKA 4D6HA 1JYNA 3VD7A 5FD0A 1R85A 4CVWA 1E4LA 4GI6A 5JUVA 2BVTA 1TFVA 5A6BD 2W63A 4AZ5A 1V6XA 3VNZA 3K1DA 3WL0A 1CGTA 3AQUA 2E0PA 5BROA 3S2CA 2XIBA 3MUY1 1BYCA 4J3SA 1GOIA 1H0IA 1D2KA 2XM2A 2O9TA 2VZSA 1CXEA 1ITXA 3I3EA 4QCFA 3ZSTA 1TA3B 3N17A 4PCSA 2A3CA 1UWRA 2CBVA 2WCSA 2OSWA 4UQCA 5DT7A 5A8PA 4W5UA 1W2PA 3SUTA 2ZX8A 3RM4A 2BS9A 3BAIA 2Z1SA 4OBRA 1JZ5A 1HT6A 2OSYA 2VNCA 3BLPX 2V3DA 3F5KA 4WJXA 2VRJA 3VIPA 5BRPA 2Y4SA 4W8BA 4TTGA 1FHLA 1KXQA 1E43A 3WMCA 1CXKA 5D4YA 2VOTA 2VX6A 3PZUA 2EPOA 4GI9A 4HU0A 1HIZA 2BFGA 4GKLA 1C8QA 1UWQA 3O6AA 4Q7NA 3WMSA 4PUDA 1A3HA 2V3FA 4M8UA 1XYFA 1VENA 1B2YA 2V5DA 2QPUA 2DSUA 2FDMA 1VBUA 2JE8A 1JDDA 1BGAA 4AZGA 3ECQA 1GOMA 4D6JA 1VBRA 3GH5A 4U33A 4MADA 1CEOA 4P8UA 2GVYA 4QLKA 2VRQA 1VRXA 2J25A 2W62A 1HP5A 3WNLA 1ECEA 4HZ6A 1BVZA 4ML4A 3AXHA 3ZJ7A 2FHBA 1OD8A 2F8QA 1GQJA 1UH2A 1NARA 4BQ3A 3AIEA 1KBKA 4UFKA 4ACYA 3BAJA 3S6TA 4HOXA 2YOCA 2V3GA 3POHA 2BY0A 1GHRA 2ZUVA 1EHNA 1JNEA 1WZLA 3K8MA 2XIIA 5BRQA 4W5ZA 3WBEA 5JBDA 4M24A 1KBBA 3CHDA 1VFFA 1KQYA 1E4IA 4BZYA 7CGTA 3GXMA 4JZ5A 1OGGA 3WH8A 4TVUA 5FKYA 3WDIA 1GCYA 4PCTA 1YHTA 1B31A 3N1AA 4E8CA 3FW6A 2XFYA 5DO8A 1UZ1A 1HKJA 2Q8XA 1MQQA 4GZEA 5CSYA 3VGDA 1EGZA 4JFWA 3W37A 4UFJA 2WCGA 4D6GA 5EFDA 4MNLA 2XJ7A 4AD2A 1UH3A 1KWKA 2J8GA 4UQAA 4TTUA 1JZ3A 3O2LA 5HNNA 2Y5EA 1LG1A 3NIYA 4CD7A 1VEOA 4HMCA 4M80A 3M46A 1DWHM 3UETA 4UFMA 3BAKA 3NDZA 5A6LA 2A3AA 3WY1A 4CCDA 3K8LA 3MU7A 3VDCA 1C90A 1I1XA 1V02E 1W9VA 3VM7A 3QGVA 4BQ2A 2D2OA 1V3HA 1UA7A 1H5VA 3KL5A 1C91A 1V6WA 4WSJA 1KCLA 4FK9A 1TVNA 2ZXAA 3GYCA 4TVDA 1VFOA 3HU7A 2E40A 5A6KA 4WKFA 3IANA 1UR2A 3B9EA 2VX4A 1J0HA 1DHKA 2E9LA 2VR4A 1OD0A 1W32A 2WCAA 2QHAA 1E55A 1O7AA 2Z1KA 4XUYA 3EMCA 3BLKA 3PZMA 1WPCA 3A4WA 3WDPP 3B9DA 3AHXA 4PMUA 2VUYA 1GW1A 1H4PA 4NRRA 2XUCA 3T2QA 3K4AA 1MWOA 4HU8A 1M03A 5IXEA 2JALA 2VRKA 4FLOA 4ZE4A 1VEMA 2BY2A 1LL7A 4CU8A 3WH9A 1JFHA 1M53A 1IZJA 2UWFA 3UCQA 5CJ5A 3DECA 1HKIA 4LYPA 2YDRA 1MVYA 5CGTA 4Z2GA 1AQMA 3QHOA 4ZENA 4B3KA 1X6NA 3VX0A 2D22A 2DSWA 3UR8A 4MNKA 2X0YA 2PB1A 2D1ZA 3OLEA 1OBAA 1S46A 1V3IA 3ARPA 3CHCA 4M82A 3HMCA 1LQ0A 1W9XA 3TONA 1NQ6A 1J0YA 5ECUA 3NUKA 4AZIA 5IHRA 2WVSA 2OYLA 3BAXA 3QR3A 1OWQA 3WN6A 2MANA 2XGIA 1QBAA 1XSKA 4L4PA 3TTOA 3WIJA 5FL0A 4D6EA 3VKKA 1C3FA 7A3HA 2VI0A 1CGVA 4BF7A 4CVUA 5D9OA 5A1AA 2ZUSA 3AXXA 1E1EA 5CZKA 1UR9A 3W4RA 3AOFA 3KL3A 4PSRA 1OGBA 4W7WA 2XVPA 4DWSA 2NSXA 3CMGA 2J47A 3VO0A 3IAPA 3WFLA 4UFLA 1P6WA 1ESWA 4EAMA 3ARYA 1NH6A 5D9PA 3UEQA 4P8XA 2BHUA 1Z32X 2WVUA 3SUWA 3SCPA 4AWEA 1OSEA 3NSNA 1HL8A 1E5JA 1R7AA 3T09A 3W25A 3OIHA 2CBIA 2EEXA 2J7BA 4WSKA 3WF2A 1TE1A 1JD9A 3F4VA 1JIBA 1VB9A 1E3XA 2Y2WA 4ZXOA 1ZU8A 1JZ4A 3D5HA 5TD4A 5E0FA 2J4GA 1UG6A 2AOSA 1C7SA 1E4NA 4HP5A 5CPTA 1W1PA 3IAQA 1W91A 1Y7VA 3AYRA 4OUEA 4UOJA 4JL2A 2BNJA 4V28A 1GORA 1TA3A 1CWYA 1JI2A 1QNOA 4GQQA 4U5IA 1CZ1A 4ZFMA 1W1TA 1E6NA 1V3JA 2WMJA 1DWIM 4J3TA 4AZHA 4ZE5A 1XH1A 1KR0A 3RM8A 4D1JA 5IFPA 3CZ8A 1ISXA 1I1WA 3WDHA 1QI2A 3VGHA 4UTFA 1G5AA 1GOQA 3VIFA 2VX5A 2EQDA 4B9YA 2CXGA 1PAMA 3BAWA 1FH8A 3W53A 2XHYA 2ZX9A 1PZ3A 3WNOA 1BFNA 3EDKA 4UQBA 1TMQA 4GZJA 4MJ4A 3A4AA 3ARUA 1OCQA 5I77A 2VCAA 3WF1A 4AIEA 2YIHA 2FH8A 1B90A 1E15A 3WDJA 2DGAA 5DEZA 1G01A 5ABEA 1HXJA 4KGLA 2QMKA 1GOKA 2XTKA 5E6YA 2F2HA 3LPGA 4LQ1A 2WC4A 1BAGA 3MUZ1 4F9DA 1OIFA 5CGMA 1JF5A 1E40A 2ESCA 1CGXA 3VMPA 3HN3A 3ZT7A 4AEEA 4JHZA 2J7HA 4AIUA 1SMAA 3W0KA 1V6UA 2GJPA 4WF7A 4BA0A 4E4PA 2VO5A 1QW8A 5A94A 4MPKA 4PN2A 2JFEX 5A3HA 1HL9A 4H8UA 1QI5A 2F61A 1PIFA 2CCRA 1QHPA 4TX8A 3THCA 4W7VA 3WH7A 3WEMA 5LA0A 1W9BM 2DIJA 4DWSB 1TCMA 2YL6A 1UWIA 4HOWA 1WE5A 1BQCA 2CBJA 1JFXA 3W6MA 2GSJA 1HKMA 2XWDA 1W3KA 4HPHA 5IDIA 3PZQA 1J01A 2G3IA 1EHAA 4B3LA 4OKDA 3IJ8A 4EKJA 2PBGA 1FOBA 2FGZA 3UG5A 2WM0A 4W87A 2YDQA 1H3GA 2WVVA 2AMGA 4DUXA 1PX8A 1BYBA 1NP2A 2QV4A 4HTYA 2Y8VA 4PTVA 5A6SA 4M56A 2YDSA 1H11A 4ATWA 3GNOA 5CQ1A 4HMEA 2Y8KA 1B30A 3VM5A 4W84A 3K8KA 3PTKA 4PTXA 3IJ7A 3FY1A 3ZIZA 4J3VA 3T0DA 1MXGA 1UD3A 3AFBA 4AZCB 2VMFA 4DWSC 3L4ZA 3GNRA 4LGXA 5JBFA 5KEZA 2XM1A 4UR9A 3ZOAA 1GUVA 5HOSA 5BXTA 3CUFA 4C7GA 3ZSSA 1F4HA 1V0KA 4QCEA 2WLYA 1QI0A 2VQUA 3F5LA 4AY1A 1XH0A 4X0VA 1JZ2A 1V6VA 1UR4A 1WZKA 4YPJA 1E0XA 1JAKA 4H04A 2XSBA 4JFUA 2WBGA 4RE4A 5A6AA 1ZBVA 4UQDA 4UOQA 1PJ9A 2C8NA 3WL1A 1R86A 1VJZA 1CLVA 2BXZA 3SUSA 1BTCA 3FXYA 1MFVA 4IPNB 4W86A 1UWSA 1EXPA 3MS8A 4CCEA 3GZAA 2ZOXA 2JF7A 2FHCA 2DT2A 4QDMA 2WWDA 3SURA 3DYOA 3W38A 3N04A 2J74A 1UUQA 4ATDA 1SMDA 2J7EA 4FLRA 2J7CA 2YL8A 1E1FA 2RGLA 5D8WA 1MW0A 2A3BA 5D9NA 1HJSA 4MB1A 1UKTA 3SUVA 1GJUA 4XB3A 1TR1A 1CXIA 2VT0A 2HISA 2YA1A 1EH9A 2PBOA 1KWGA 2QPSA 1OINA 2OSXA 1UA3A 5I24A 3I3DA 1J11A 3RJYA 3VINA 3GXDA 1SFSA 1E70M 1B3WA 3CUJA 5M03A 3OGSA 1PBGA 1Q4NX 3QHMA 3VU2A 3T0BA 1R87A 1WDPA 3TTQA 5C70A 5E70A 3M7SA 3OBAA 2D3NA 3N15A 4P7NA 1HJQA 3WF4A 3WUGA 1CECA 2OWXA 3ZMRA 3AIUA 3NJ3A 2CETA 1GNXA 4S3JA 4HA1A 3N18A 4AYSA 1E0VA 1KGWA 1LF1A 3WNPA 5KZ6A 2PI6A 1KGXA 2WHMA 2WKGA 5A8QA 5HXMA 1ZBCA 1GVYA 1CXHA 2WBKA 5E09A 4J3XA 4ZEPA 3N9KA 4AXNA 1XYZA 1EO7A 2CERA 5A2BA 5JIWA 3LPOA 1JYVA 1UKQA 2XSAA 4PMYA 2BVYA 1E6RA 1B3ZA 5E6ZA 5EB8A 2DH2A 3BSGA 1SR0A 3PTMA 3ALFA 3VIOA 3WQ5A 4W7UA 1W9PA 5A8NA 3VIKA 2WVVB 3U5UA 2D0FA 2VJXA 2X8RA 1ISWA 1LL6A 1QHZA 2ZE0A 4P7OA 1HVXA 1EOKA 4JFVA 3DC0A 3NSMA 5A6MA 1UR0A 4D6IA 5CPQA 4CN4A 3AIVA 3SCUA 5I3DA 3M07A 5LA2A 3BSHA 1NM9A 2WXDM 1VFMA 5GNYA 1HJWA 4XZWA 4JIEA 4E2OA 3WF3A 3AIQA 4HA4A 3JUGA 1J0ZA 1GOOA 4CU6A 1E6XM 2ZXDA 4X9YA 4EE9A 3N11A 3FNDA 1FFQA 4V27A 4L4OA 1EQCA 2EPLX 1KFWA 2W66A 5BXSA 2W5FA 4J28A 4IISA 1K9TA 4CU7A 1K9EA 2J62A 2ZUUA 3BCDA 5HBFA 2VCBA 3PZ9A 3WELA 4FLSA 4GIAA 2BY3A 3CGTA 1JGIA 2WZIA 3IK2A 1ZS2A 3BAYA 2DSZA 1LG2A 3VD4A 4WK9A 2J79A 1KXVA 1HJUA 3SUUA 2CKRA 3ZM8A 1BYAA 5GQBA 3VUPA 1C93A 4GO9A 4PMXA 3RCNA 2VZUA 2QF8A 1J0KA 3AHYA 3VIIA 3OLIA 1VJSA 5I5RA 4H2CA 3RPMA 2DH3A 4QLJA 2DSKA 1QI3A 1JAEA 1PEZA 2C7FA 3T2OA 3W29A 1QHOA 5ABFA 3WNNA 3ZT5A 1EO5A 4TVCA 3UG3A 1JNDA 3MSGA 1SYTA 4M1RA 1UD5A 1WNOA 5GPRA 4Z2JA 4TX6A 5JBEA 1UR1A 5M5DA 3VOCA 4J3WA 1QNPA 4KRTA 4Z2KA 1UKOA 3GXFA 3SEPA 1W3JA 3VD3A 2YLAA 3B8SA 2D20A 4GPNA 4WLCA 3T0AA 1E3ZA 1JF6A 5DT5A 1KXHA 2CKSA 1AVAA 3OA5A 5DF0A 1MQPA 3CUGA 4X0NA 4PMQA 1M7XA 3CZEA 4UNIA 3ARVA 4AD3A 4PMNA 3U7VA 1UWUA 1CGWA 5JH8A 1CGUA 2E8YA 3OZPA 3VGEA 1JZ6A 1N82A 1LWHA 3FHQA 3AJ7A 2ZIDA 1GPFA 2E8ZA 4NF7A 2X0HA 1BPLB 3PZIA 2DSVA 2J78A 1JDAA 3BH4A 3MMDA 4M81A 3UERA 2VR5A 1OGSA 3HJEA 4FMVA 1BLIA 1B3YA 4Y7EA 2BHZA 1NOFA 3WNMA 1BG4A 3SCRA 2WC3A 1JZ8A 1BYDA 5A6BA 1CXFA 1RPKA 3CUIA 2CITA 1L8NA 3A6OA 1WP6A 2J77A 1NOUA 1V03A 2WMKA 2EO7A 4AZBA 4AZ7A 3AS1A 1BF2A 3TP4A 1KR1A 3BC9A 3KEHA 1UKSA 1C7TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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