3RMEA

Amcase in complex with compound 5
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
YQLTCYFTNWAQYRPGLGRFMPDDINPCLCTHLIYAFAGMQNNEITTIEWNDVTLYQAFNGLKNKNSQLKTLLAIGGWNFGTAPFTAMVSTPENRQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFDWEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIPQLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAEKLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGWDAPQEVPYAYQGNVWVGYDNVKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQGKFPLISTLKKALGLQSASCTAPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Identification and Characterization of Acidic Mammalian Chitinase Inhibitors
pubmed rcsb
molecule keywords Acidic mammalian chitinase
total genus 131
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2011-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3rmeA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3rmeA01
5A8NA 1TCMA 1JNEA 1KXVA 4N0RA 3WQ4A 3AIWA 1H4PA 3CUGA 4N42A 2WCSA 1KR1A 4S3JA 4W5UA 4CUCA 3LPFA 4H41A 1UH4A 2JF7A 2ZX5A 4MB4A 3OGVA 1V3IA 3SCWA 1V6VA 1LL4A 2A3HA 2CHNA 2OLHA 5M5DA 2O9PA 2WAGA 1QOXA 3DHPA 3AHTA 1FH7A 1H11A 3W53A 4D6JA 4C7DA 2OSWA 4AZIA 2BY2A 4E2OA 4DUWA 1LL6A 2YA0A 3TP4A 4AZHA 1BF2A 2XVNA 4Z2KA 3VIHA 3LPGA 3VX0A 1E70M 4DUXA 3W24A 2GUYA 3ZQ9A 1V3KA 1BAGA 3BAXA 3K4AA 4J3VA 3ZT5A 2BHUA 1V02E 1FFQA 1W1VA 2CXGA 2CHOA 4NZCA 1V6YA 2WSKA 5A94A 1V0MA 1GUVA 4WSKA 1UR1A 3NSNA 1M01A 2FGZA 3VIIA 3VD3A 4UR9A 5IDIA 4D6CA 3VDHA 3EDJA 3UG3A 5DEZA 2VZOA 4AZ6A 3QHOA 4CD7A 2X05A 2J47A 4UZUA 2UY2A 1MFVA 2VO5A 2FDMA 4ATWA 1K9FA 1OGSA 2BFGA 4B16A 4GI9A 1UG6A 1HJXA 3MANA 1KR0A 3T0BA 2JIWA 1ITCA 1MVYA 4BF7A 3WQWA 4HMEA 1WAWA 1UD8A 5CXPA 2DGAA 4PTXA 3WMCA 3F5KA 4GQRA 2J8GA 5E6ZA 4F79A 2DT0A 3N13A 5HPOA 5CSYA 2DIJA 5CGTA 2WPGA 4EANA 2WMIB 2CPUA 3A6OA 5HOSA 2D0HA 1VFOA 4S3KA 4MNJA 5DF0A 1E6QM 2VVSA 1HP5A 1HN1A 3AS1A 2XFFA 1MW2A 4B3KA 1MFUA 1OINA 1U30A 3AIBA 3O9NA 1J0YA 1KWGA 3KZSA 1K6AA 2W63A 1J11A 2W62A 1ECEA 1XSIA 1VENA 3BCDA 2QMJA 1I1XA 2VX7A 3BAYA 4B9ZA 5BXRA 1FOBA 2O9RA 1UH2A 2J7EA 2WMKA 2ZE0A 2OYLA 4AD4A 3PZ9A 4P7OA 4X0VA 1NWSA 3EDKA 2WC4A 5D9NA 1US3A 2VR4A 4CD6A 1PEZA 1E6PA 1VFUA 1C91A 1XYZA 3VIKA 3WNNA 1QI5A 3W28A 4W85A 2ZICA 4XV0A 4LYQA 2NT1A 1XRVA 2ZUNA 2J7BA 3SCRA 3AXIA 2ZX8A 1ZB5A 4FMVA 3RIKA 1UA3A 4FK9A 4W88A 3SIMA 3OGRA 5IFTA 1G01A 1DHKA 4JCLA 1R87A 1QNSA 1E55A 2XGBA 3M7SA 3VUPA 3CH9A 5LA1A 4UOZA 3WENA 1C8QA 4HP5A 4UFMA 1E9LA 5A2CA 1UD3A 5BXPA 1QPKA 3MSDA 1GPFA 1M04A 3ARYA 5JBFA 2PB1A 3WEZA 2J7HA 7A3HA 3QR3A 2FH8A 3SCSA 3TTOA 3GNRA 1W9DM 3RM4A 5JBEA 1US2A 2CKRA 1GJUA 4PTVA 4J3SA 1QI3A 4QCFA 1V3JA 2XSBA 2ZX7A 4XZWA 2BXZA 1EH9A 3AIVA 3NDZA 4WJXA 3ZJ6A 1CXHA 1YQ2A 4JZ5A 5HDRA 2D23A 4UQEA 2V5DA 3VMNA 1VIWA 5CGMA 3SUWA 4QFUA 3VD5A 2XPKA 1BQCA 2XYLA 4BCEA 3WEMA 4DWSD 1NM9A 1Q6CA 2WYSA 2V3GA 2WZHA 5JBDA 2G3IA 4UFIA 3WH7A 2CBJA 1TZ7A 3MMUA 4UFHA 1EA9C 4XX6A 1K9TA 2XJ7A 5I0DA 3I3EA 1PAMA 5BRQA 5E0FA 2EBNA 2XVGA 1E6NA 4QLKA 2D1ZA 1MW1A 1HL8A 2WHLA 3B9EA 4MJ2A 3VD4A 4XB3A 2WK2A 5CSUA 1LWJA 3WDIA 3VDBA 4ZEPA 3ARQA 3RMEA 1PJ9A 2D3NA 4F9JA 3MS8A 4PCSA 5HBFA 3FHQA 1C93A 1WZKA 1LWHA 1KXHA 3PTQA 3FXYA 4H7VA 4W7WA 3GXFA 1V0NA 1XYFA 1VFMA 1J01A 4Z2JA 2E9MA 2WHMA 3K4DA 4B3LA 2EO7A 4ATDA 4Y7EA 3IANA 2XVPA 4AD3A 3RDKA 2CKSA 2J78A 1Y7VA 1XSJA 4UQ9A 1HF6A 3GNOA 1KGUA 4MNKA 2WCGA 3BC9A 4X0NA 1Z32X 2PF0A 4MJ4A 3T0DA 5D9OA 4IPNB 1LLOA 1UA7A 4PMDA 3GBDA 1KQZA 1BGGA 5IXEA 4PSPA 1XH2A 4NSBA 2JIEA 1XH1A 1PBGA 1HJQA 1H0IA 1XD1A 4J3XA 4Q7NA 2JEPA 1KGWA 1FFRA 2ZUTA 1X6NA 4J28A 3SUTA 4H2CA 1F4HA 5M03A 3A4WA 2GVYA 4JKLA 2DSZA 1UQYA 4W7VA 4JAWA 1AQ0A 4D72A 4WKAA 5I77A 3CHCA 4U3AA 4KWUA 3PBGA 3WD3A 3GXIA 4JKMA 1D7FA 3DECA 4TVUA 3RPMA 3WDJA 6TAAA 4PMXA 2F61A 1VFFA 2GJXA 4CU6A 1BHGA 1EHNA 1J0ZA 1MQRA 3WY1A 1BFNA 2J7CA 3BMVA 2XGIA 2D0GA 1DWIM 4ACZA 3ARXA 1V6UA 2DT1A 3N15A 1LJYA 3II1A 1V3HA 5A6BD 4QLJA 3IJ9A 4R5EA 1U33A 5A2AA 1DWGM 1VB9A 3ARTA 2J74A 1V0LA 3PZIA 3WMSA 4GPNA 4ZXOA 4RE2A 4EAMA 1H09A 2DPEA 4H8VA 1WDPA 3ZJ7A 4MAZA 2CNCA 1E0WA 1E5JA 3W6LA 4AIOA 1J18A 1F4AA 2HISA 1JL8A 5M17A 4HOXA 1C3FA 1J0IA 3VGHA 1NWUA 3OGSA 3VPLA 1OIMA 5TD4A 5CLTA 1MXGA 1WZMA 2QHAA 1W9UA 3SCVA 4IM4A 1L0PA 2DDXA 3PZVA 4U33A 1ISWA 1IT0A 1ZJBA 1GNXA 2C0HA 3OLDA 1BSIA 1HL9A 3L2LA 2CYGA 2DIEA 3WEOA 3NJ3A 2C8NA 3GH5A 1E4MM 3CZGA 3SCUA 1GVIA 2XSAA 3WSUA 2YDRA 3OLEA 1B3YA 2WVTA 1KQYA 1W2VA 1QHZA 1BG9A 2Q8XA 3VD7A 3AXHA 3L4VA 4KRUA 1UR4A 3WDHA 2FHCA 4HMDA 2WKLA 1DWJM 5FOOA 1H0GA 2CEQA 4A3HA 3WDRA 3GXDA 4CN1A 1C8XA 4F8XA 1W1YA 1V3MA 1N82A 1ISVA 1CGUA 4Z2HA 1E72M 3PZNA 1KFWA 1QVBA 3W29A 1B3VA 2XG9A 4PTMA 4NF7A 1EDQA 1CPUA 4PMUA 3WFLA 4ACZB 5CPSA 5CJ5A 1UR2A 2J7GA 2EPNA 1D2KA 7CGTA 2ZWZA 1JF6A 1EQPA 3JUGA 4BQ5A 1UWSA 5D4YA 3CMGA 3WD1A 4AD1A 3K8LA 1LG1A 4CCCA 1GHSA 4AZGA 2V5CA 2XM1A 5ABHA 1GOWA 2WWCA 1GZJA 4V28A 3T2PA 3AISA 1BVNP 1RP9A 3WH5A 2WLZA 1PZ2A 4UQDA 3WQ5A 3SUSA 5A6LA 3MUAA 4E8CA 2X1IA 4JFTA 4ZENA 3MO4A 1CGTA 5EB8A 4JFWA 4P7LA 4Q22A 3AMKA 4OJYA 1EOKA 4HTYA 3KL5A 4D71A 1R7AA 4GO8A 1JGIA 1WZAA 5AC4A 2WHJA 4FLQA 3VNYA 1HVQA 2CETA 4J27A 1NWRA 1VJZA 4UOQA 2XWDA 1PPIA 1QNPA 4QP0A 1O6IA 1HJSA 1BVZA 5BXSA 1CLVA 2CBUA 2V3DA 7TAAA 5E9AA 4OKDA 4TX8A 4BZYA 2YA1A 1KGXA 1W3HA 1TG7A 5A6SA 4GI6A 4PMZA 4HA1A 4LGXA 4M29A 4W86A 4CCEA 1ODZA 1JDCA 1JDAA 1Q6DA 1B3WA 2WLYA 3BLPX 1BYCA 2YL6A 1C8YA 1TE1A 2X2YA 3UEQA 3DHUA 4PEEA 1FH9A 3CZLA 3MKKA 1VAHA 1HKKA 3ARPA 2ZXDA 1UWIA 2VX6A 3QHMA 2XUCA 2J77A 5A3HA 1TR1A 1E56A 1FP9A 2D2OA 3AHZA 1QBBA 2GJRA 2WXDM 3OG2A 4PYSA 5CLWA 4KRTA 3CUHA 3WNPA 3D5HA 1W3JA 4V27A 4HZ6A 1HKMA 1G9HA 3BAWA 2BNJA 1GOQA 2VI0A 3NUKA 1CGXA 3ARZA 5A6AA 2VURA 4OIFA 1UZ1A 3CHDA 1L8NA 4PMQA 1LQ0A 3BLKA 1YHTA 5BCAA 2VZVA 1TVNA 1EHAA 1HIZA 1ZL1A 3CBWA 2WBGA 3U5UA 1CXKA 3VNZA 1WDRA 3MUIA 3UETA 3OA5A 1WCGA 2ZUWA 3VMOA 4TUFA 3K8MA 5A95A 3SUVA 3RILA 5EMYA 1CTNA 2X0YA 3N1AA 4UTFA 4U5KA 2ESCA 3TTQA 3LMYA 3DYPA 1EDGA 1JZ8A 4MNMA 1UD2A 2PI6A 4M81A 4Z2IA 4PMVA 1SMAA 1HXJA 2NSXA 4QCEA 1MXDA 2Y8KA 2YDQA 4W8AA 3WH8A 3T0AA 4GI8A 2WVVA 2DH2A 4PSRA 3ARSA 5HNNA 1GJWA 4AWEA 4EK7A 4GQQA 4Z2LA 1FHLA 2CESA 2PC8A 2WVUA 1QNQA 2G3NA 2J75A 2OSXA 3MSGA 3RJXA 3UG5A 3ZO9A 2YDSA 5IHSA 4KH2A 4PMYA 3U57A 1LF1A 3OLGA 3ZM8A 2O9OA 3DC0A 6A3HA 2WHKA 2WMFA 2F2HA 3WMBA 4AEFA 4L4OA 4ZE4A 1V3LA 3BH4A 4JCMA 4AIUA 3ARWA 4D6IA 3AIQA 4GKLA 1WDSA 5ABGA 3WNMA 1B3XA 5FKYA 4CCDA 2VRQA 3AI0A 3VIPA 1NQ6A 4CD8A 2ZXBA 4HU0A 4HPHA 1CYGA 1OIFA 1CNVA 4J3WA 4QAWA 4UQBA 1QNRA 1W1PA 3OB8A 4TTUA 2ZWYA 5GNZA 5A6KA 2YBTA 3AXXA 3WDQA 4X9YA 2EEXA 5EBAA 1E0VA 3CUFA 3KL3A 4RE3A 1CWYA 3GH4A 1CBGA 1H1NA 3FHAA 1JXKA 4P7RA 1BYDA 2D0FA 4J3UA 1NWTA 3AJ7A 3AZRA 2D24A 3HJEA 1MW0A 1CGYA 1XV8A 2ZUVA 2XFYA 4KGJA 4QDMA 1QI2A 3AOFA 3A4XA 5A1AA 4M8UA 1OCQA 1I75A 4UQAA 1J9YA 3HU7A 5D8ZA 4XUYA 2YJQA 1MYRA 4WF7A 1VJSA 2WM0A 4AY1A 3OLIA 1B30A 4JL2A 2WVVB 3APGA 1ZBKA 4TTGA 2ZUSA 2Y5EA 2Y8VA 1J0KA 2DSVA 5E70A 3W38A 1R85A 1JAEA 3ZOAA 2XTKA 5E6YA 2JE8A 2WBKA 1WP6A 3PTKA 1JZ4A 1UKSA 3UCQA 3GDBA 1UUQA 1OGGA 1E1FA 1JYWA 1E6RA 1DP0A 1H3GA 2X8RA 3TA9A 5EFDA 1GHRA 1W1TA 4A3YA 5GNXA 1IZKA 3AICA 4C7GA 3PZMA 2GSJA 1H41A 5DT7A 3A47A 3WF2A 1E73M 1OD0A 1UOKA 1X1NA 3IK2A 5FCZA 4B9YA 5FL1A 4P8UA 2XVKA 2ZX9A 5A6JA 1XCWA 3VKKA 5GPRA 1ISZA 2E3ZA 4OBSA 3AZTA 4BA0A 2WC7A 1CENA 1XHGA 1HT6A 1E5NA 3BGAA 5KZ6A 1D3CA 3N12A 1NP0A 2VTFA 3O6AA 4JIEA 2VCBA 2ZXAA 5A69A 1SR0A 4MDPA 2W5FA 3A4AA 3F4VA 3W26A 1W3LA 5AYIA 4MPKA 2G8ZA 1V08A 1GQLA 2WVSA 2WW5A 3PN8A 3EBVA 1GCYA 4F66A 4CN4A 3G6MA 3ARUA 2JALA 1E6ZA 1E71M 1BLIA 3WF3A 4JHZA 3WUGA 3VDAA 3CO4A 4F9DA 1W91A 1PX8A 2FHBA 4CKQA 1HKJA 4AYSA 4LPCA 3PHAA 4OOUA 1R7OA 5AYBA 1B0IA 3EDDA 2OWCA 2BS9A 1K9EA 4JFVA 3W25A 3N9KA 1UKTA 1ISYA 2W61A 2DSWA 2QPSA 1AQHA 2BVYA 4AISA 3AROA 4P8WA 1MQPA 2BXYA 3UESA 2QV4A 3WQ6A 2ZUMA 3BAKA 3AYRA 5A8OA 1E15A 3WL0A 1UKQA 2O9TA 1B2YA 1JF5A 3CZ8A 3WQ8A 3EMQA 3VGDA 1ITXA 1WDQA 3CMJA 4AMCA 4EKJA 1X6LA 4JFUA 3L4ZA 1JZ7A 1Q6GA 3VO0A 4MB3A 4PBGA 5AC5A 3CZEA 3CIVA 3OBAA 1HJVA 3VVGA 1WE5A 1CEOA 1A3HA 2VRJA 4HOZA 2E0PA 3PZQA 2X09A 3WNKA 3W0KA 4LQ1A 1W9VA 5GQBA 3AS3A 1B1YA 1ISXA 4ZE5A 1JZ2A 1V6WA 2WANA 1NOWA 5DT5A 4ML4A 3GNPA 2F8QA 1Q6FA 1CGVA 1VEMA 4W7UA 4FLSA 4GO9A 3CTTA 3CZJA 3AYSA 2AAAA 4AZCA 1H2JA 5AY7A 3AMCA 2X0HA 1VEOA 4UNIA 1RD6A 5A8QA 4P7QA 4D6DA 2J7DA 3WELA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3PK7 A;  2YW4 A;  5HTG A;  2PTZ A;  4Z1D A;  2HMC A;  1PX4 A;  3FFS A;  3UQN A;  4WK9 A;  4TYO A;  1P6W A;  2OZ0 A;  2Z29 A;  1ICP A;  1JFX A;  2DSU A;  3EYP A;  2ONE A;  3L4W A;  2A2I A;  2VCC A;  4QS5 A;  4BFA A;  2FPT A;  2WB5 A;  4JS3 A;  5IHR A;  1TPW A;  1Q6O A;  1FWI C;  1GPW A;  2RDU A;  4W9Q A;  4QRO A;  3MV1 1;  2A3C A;  2VOT A;  1WBJ A;  1NP2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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