3RM8A

Amcase in complex with compound 2
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
YQLTCYFTNWAQYRPGLGRFMPDDINPCLCTHLIYAFAGMQNNEITTIEWNDVTLYQAFNGLKNKNSQLKTLLAIGGWNFGTAPFTAMVSTPENRQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFDWEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIPQLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAEKLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGWDAPQEVPYAYQGNVWVGYDNVKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQGKFPLISTLKKALGLQSASCTAPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Identification and Characterization of Acidic Mammalian Chitinase Inhibitors
pubmed rcsb
molecule keywords Acidic mammalian chitinase
total genus 133
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2011-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3rm8A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3rm8A01
3WQ5A 2VJXA 8CGTA 1V0KA 2CESA 4EANA 5LA1A 4HPGA 1OD0A 1VEPA 2O9OA 4TX8A 4W86A 5A95A 5JBEA 5BXSA 1BF2A 3B9DA 1XGZA 3WD3A 1H11A 4DUWA 2UY3A 2EEXA 1GVIA 3MUIA 3BH4A 3AXXA 1W3KA 2ZUTA 3WH8A 2GJRA 4RL3A 1MVYA 2WZHA 4PSRA 1CECA 2CKRA 1BAGA 3A3HA 1GORA 3W37A 1JYVA 1FA2A 4CUCA 3WNNA 1IT0A 1H2JA 2X0HA 1OD8A 4MB4A 1LF1A 3L4YA 3VTRA 3EBVA 1HKIA 2W62A 3OZOA 3CIVA 1JZ6A 4B9ZA 1UYQA 1BYAA 2D3LA 3O2LA 1KBBA 1Q6GA 4B16A 1JDDA 3AS2A 2J75A 4A4AA 1PZ3A 2ZUWA 1TFVA 1YHTA 5I23A 4DWSA 3OIHA 3CHFA 3DHPA 2CPUA 1SFSA 4M82A 2B31A 4MNKA 3K8MA 4D72A 4LGXA 2YL5A 1CXLA 1GQIA 4PMXA 2CYGA 4HPHA 3MV11 5CG0A 6CGTA 4OIFA 1UKTA 3BAIA 1I1XA 3VINA 4OJYA 1QHZA 3VGFA 4JAWA 4MB5A 3CPUA 2NT1A 1VB9A 4D6HA 1WO2A 1KB3A 2WZEA 3MMDA 3AIBA 3AIWA 3EMQA 4LQ1A 5FL0A 3SCOA 2XSBA 4QLKA 2CITA 2J7DA 4PMUA 4MB3A 1HKJA 1V0LA 2BV9A 4YHGA 4IPLA 1BFNA 3ZJKA 1V08A 2GFTA 1EHNA 3SURA 3UETA 3I3BA 5A6SA 2CHNA 3CMGA 2ZX8A 4GQQA 2QF8A 2NSXA 2PWGA 2BY0A 1V3LA 3WNPA 3AMGA 3ARVA 1ESWA 2WVUA 2VQTA 2RGLA 1B3XA 2BHYA 2C7FA 3PZUA 3TOPA 4D6CA 2ZX9A 4MB1A 2WHLA 1CGXA 5CGTA 1W9UA 2GJXA 4CN6A 5JIPA 3AQUA 2VX5A 1V0MA 2XVKA 1FH7A 5F7UA 4AZ6A 3RILA 1B3ZA 1HNYA 5I77A 4CVWA 3WF2A 3NJ3A 1ZBVA 1L0PA 1Q4NX 2ZX5A 2YA2A 1ZU8A 1BVZA 1QNPA 1E56A 2WK2A 3AS1A 1J9YA 3J7HA 1JZ2A 2OYLA 2DT2A 2ZX6A 4W85A 3K1DA 2XVNA 4JFUA 1DHKA 3CZLA 2HISA 1E6PA 1FFQA 4UQEA 1QI4A 4P8UA 3KZSA 1JDAA 1AMYA 4CD4A 3PHAA 1A47A 4QLJA 1QPKA 3WEZA 1GJWA 2DIJA 5DEZA 1NM9A 1O6IA 2FHFA 3FAWA 1B30A 1UR8A 3ARPA 3JUGA 4PTXA 4BF7A 4UCFA 3W81A 3THDA 1XHGA 2OSWA 1VFFA 3HJEA 1EH9A 1UR0A 4M81A 1KQYA 2ZWZA 3VMPA 1EQPA 4PUEA 5GQBA 2G3MA 1C7SA 3WKZA 1QVBA 5IXEA 1GQLA 4CKQA 1E40A 1XV8A 2E40A 3EMZA 1K9EA 3L2MA 3AS3A 4NI3A 8A3HA 4HOWA 2WHKA 1B90A 1XC6A 3BGAA 3WDPP 1D2KA 5DF0A 3GNRA 4AD5A 1F4HA 5A6LA 4M24A 5ABEA 2IUZA 2VZUA 3CTTA 3WN6A 4OOUA 1UWUA 1XD1A 2VI0A 3CO4A 5A8NA 3RCNA 3T0DA 3AZRA 3OGSA 2F2HA 3FHQA 1JYXA 3N17A 2JFEX 3MUY1 3WH5A 3UG3A 2YDSA 4AZIA 1V3IA 2ZUVA 4TX6A 1W9DM 1Q6CA 2VZOA 1OGSA 1B2YA 2G3JA 5HNNA 2YBTA 1UQZA 3ZJ7A 5CZKA 3WDQA 2E9BA 3AJ7A 2WWCA 3IJ9A 4JFTA 3BCFA 2XGIA 1C92A 1UQYA 4JIEA 1R85A 4H41A 3UR7A 4UNIA 1LL4A 2PWHA 3A4WA 4GI6A 2VTFA 3SUVA 5FL1A 3AMKA 3L4WA 3AHTA 1E3XA 3WH9A 3L2LA 2J74A 4CD7A 2YDQA 1J0JA 3EDJA 2AMGA 4UQCA 4ZEPA 2DPEA 2ZUSA 4PCSA 4J27A 2J4GA 1TCMA 5D9MA 4V27A 1KGWA 3GXMA 1XRVA 3WH7A 4AEEA 1M7XA 5BROA 1GPFA 1B31A 1J0ZA 4HA4A 1RH9A 1UZ4A 2A3BA 2ZUNA 2DEPA 1V3JA 1PIFA 4NZCA 3WL0A 2D23A 2VR5A 3U57A 5BRPA 2DSKA 3NSMA 4OKDA 2J7BA 4GO8A 3EDDA 5D9NA 2VOTA 1E6QM 3GXFA 5BYWA 4MDPA 3WD4A 4TTUA 1H5VA 1VRXA 2JIEA 4PEEA 4UQDA 3OZPA 3T0AA 1XYZA 3WDRA 1BG4A 4NF7A 4Z2JA 3WFZA 1JF6A 5D4YA 1W9PA 3AROA 1L8NA 2WBGA 1B3VA 2XTKA 5JH8A 1B0IA 1H1NA 4W7WA 5E0FA 4ML4A 4PMVA 1V6WA 2XYLA 2E8YA 5GPRA 2YA1A 4AYSA 5A2BA 2XIBA 3WH6A 3SUTA 1GHSA 3VD7A 5AC5A 2OWXA 3ZO9A 2AAAA 4J3SA 3WDIA 3AYSA 5AYIA 1E9LA 4LXFA 2D20A 5GNYA 1CPUA 4W8BA 3VM5A 3A6OA 4WSJA 3WD1A 1QI3A 4C7DA 3VIMA 1E4MM 3WY1A 3AHYA 1HIZA 9CGTA 1G0CA 3VD4A 1HVXA 4PTMA 1NWTA 1UH3A 4PMOA 3S6TA 2GDUA 2OSXA 2J77A 1GOOA 3VMNA 3N18A 3L4TA 1HL9A 3BAKA 2G3NA 1JFHA 5KZ6A 1ITCA 3PZQA 1JZ4A 2YLLA 1OGBA 3F5KA 1SYTA 3CUHA 5A6MA 3VMOA 1G5AA 2WPGA 3W53A 3CH9A 2W5FA 4U33A 5IHRA 4J28A 2J7EA 2BXZA 2VCAA 4AZHA 1HJQA 5A6BD 5BCAA 4JL2A 5JIWA 4GO9A 1UH2A 4H7VA 2EPMX 4OOZA 4Q7NA 1XD0A 3BCDA 2J7CA 3PZTA 3AIRA 1VJSA 3AHXA 4ACZB 2WANA 2MANA 2WLYA 1CWYA 3VIFA 1B3YA 2GJXB 2Y4SA 1GUVA 3RMEA 1PBGA 2VO5A 5CLTA 4J3VA 4JHZA 3PBGA 1M03A 3MMUA 3SCVA 3W6MA 2ZWYA 1CDGA 1RPKA 4WJXA 1XH1A 4H8UA 3U5UA 1ZS2A 1NWRA 4TOQA 2RGMA 4M29A 1MQQA 3VPLA 4MNMA 1FH9A 3ZSSA 4EE9A 6TAAA 3WUFA 1LG1A 4OBRA 1PX3A 2WMGA 2G8ZA 3BAYA 3WMCA 4HMDA 1W1TA 2D22A 5A3HA 3MMWA 1W1YA 5HXMA 2E4TA 4C7GA 2X2YA 3KWXA 4QCEA 2D0HA 3T2QA 5HOSA 1E4NA 5D8WA 2YOCA 3W0KA 1J12A 4W89A 2JEQA 3AZSA 4C7FA 1WE5A 1MXGA 4D1JA 4HTYA 2WCGA 1DWJM 3SCTA 3BSHA 2J7GA 2J7FA 2Y8VA 4W8LA 3U7VA 3BMVA 2UY5A 4V28A 2XGBA 1LLOA 2XWEA 3WDJA 1HKKA 3IAQA 1E6ZA 1HX0A 2VCCA 4P8WA 4P7OA 4CCDA 3KL0A 2ZICA 3L4ZA 5BRQA 5ABFA 4K68A 1E4IA 3MKKA 4QCFA 2GSJA 1TA3A 4U3CA 3U5YA 3DC0A 3LMYA 2X1IA 2XUCA 2WC3A 3KL5A 1F4AA 2JF7A 5E0CA 2V5DA 3WF4A 2ZXAA 1MQRA 2YJQA 1MW1A 3CHDA 1H0GA 3WF1A 1DTUA 1GCYA 2XVPA 4JCLA 1JI1A 4BQ2A 1VF8A 4PMQA 1AQ0A 3AHVA 3VM7A 1CBGA 5IFPA 3ZIZA 4W88A 1UR1A 5LA0A 4KRUA 3WMSA 1VFUA 2BY1A 2BVDA 3GH4A 2WMHA 1OT2A 3FN9A 2CXGA 3CBWA 1P6WA 1TMQA 2BXYA 2Z1SA 4HOXA 1ODZA 4GZEA 3W4RA 1DWHM 1JZ7A 4F9DA 5CLWA 1GNXA 1U2YA 1W32A 2YA0A 1E70M 1WDRA 3UESA 5E6YA 3DYPA 4X0NA 5E09A 3O9NA 2YLAA 2QPUA 4PUDA 3OBAA 1AQHA 4CN1A 4FMVA 1UR2A 5KEZA 3SCPA 4MTVA 1BYDA 2CBIA 3LPOA 2OYMA 2WZIA 3OA5A 4DWSC 1FH8A 2VZTA 4AWEA 1KXHA 2QMKA 4WIWA 3VX1A 5CJ5A 1DP0A 4M1RA 1H3GA 1V6YA 1MWOA 1QBBA 1OM0A 1UD8A 4F79A 1UD5A 2NW0A 1ISVA 2IXVA 4N42A 4GXPA 4MPKA 4E4PA 3OLEA 3AIVA 2PI6A 1TR1A 1QNQA 2QLYA 5C71A 3WL1A 1H0IA 2EPOA 1EQCA 2E3ZA 1EOMA 3VIHA 2C0HA 2DGAA 4D6JA 4TVDA 2Z1KA 3O6AA 3VIGA 2XPKA 1E71M 1B3WA 4B15A 2A3HA 5A8QA 4AD1A 2O9TA 3B9AA 1E6RA 4OZOA 4W7UA 4DM1A 3VDAA 2V3DA 4PN2A 3FNDA 2VZSA 2WCSA 2BFGA 2PWFA 2FHCA 2VNCA 1JZ5A 1CXKA 3PZIA 3N12A 3VU2A 4ZE5A 1DWAM 3CUJA 4XZBA 2OWCA 2ESCA 1VBUA 2FH6A 3TTOA 1G9HA 4NRRA 3CUIA 4U5KA 1XCWA 5E9AA 2IXUA 1PZ2A 3AHZA 2WNWA 2WMIB 3I3EA 2YL6A 3WENA 5A94A 4GZIA 4P7RA 4BQ4A 5IHSA 3W28A 1FHLA 3SCUA 1US2A 3AMCA 4DUVA 1LWHA 1U33A 2OLHA 1JG9A 5BXRA 3VOCA 1UD2A 3AICA 3TA9A 1H41A 3AMLA 2CBJA 4LYQA 5C70A 1Y7VA 1GOQA 3SEPA 1M04A 4L4PA 3AIEA 3EYPA 1UG6A 2W67A 3K46A 5DT7A 3VD3A 4XB3A 5DFAA 3ZT5A 2DSZA 1MFUA 4H2CA 2X0YA 1CXEA 1ITXA 4LPCA 3FAXA 4P7NA 3U7BA 3MO4A 4WF7A 4P8XA 2O92A 3WQ6A 3BAWA 2CIPA 3MUAA 1NH6A 1UA7A 1NP0A 4PMDA 1J0HA 3A47A 3ARSA 2VRKA 4UZUA 1D7FA 2QV4A 2XM1A 5A1AA 4MJ2A 3UEQA 2W66A 3EDFA 5D8ZA 3NSXA 1C8XA 4NSBA 4XZWA 3PZGA 3GM8A 2G3IA 2ZUMA 3WUGA 1V6UA 1XYFA 5A6JA 2DH2A 2WKLA 3PZNA 1JYWA 3W29A 1BQCA 3CMJA 3RDKA 2TAAA 2Y24A 3QR3A 3VILA 4XX6A 3ZT6A 3W6LA 3WBAA 1NWUA 4A3YA 2DT0A 4QP0A 1MQPA 4AD2A 3T0BA 3GXIA 4OUEA 2OWWA 4BZYA 2VVSA 1HKMA 4Z2GA 5DO8A 3AYRA 1TVPA 2BVTA 2WMFA 5FKYA 5GNZA 1TA3B 1E1FA 2YL8A 1K9DA 3VO0A 3ZJ8A 1TUXA 5CPSA 3N9KA 3FY1A 1MYRA 1FFRA 1CXIA 4W8AA 2J7HA 3HN3A 2J62A 3VDCA 5GNXA 2PBGA 4RE2A 4HZ6A 3VUPA 1PJ9A 1CIUA 3WUBA 1HN1A 5BXPA 3ARRA 1BYCA 3F5JA 3OB8A 1HJUA 4HP5A 1UHVA 4KGLA 1Q6EA 2J8FA 1W9XA 4LYPA 3APGA 4KMQA 2E0PA 2WVVA 3BSGA 3SCQA 1C7TA 1CLVA 1YQ2A 3M7SA 2PF0A 1EGZA 3OGRA 2VVNA 1RP9A 1N82A 1VIWA 4ZENA 2BY3A 1JGIA 1W91A 3LPFA 1NWSA 4GIAA 3BAXA 4UOZA 5DMYA 1E0VA 2GDVA 2W91A 1VAHA 1Q6FA 3BLPX 5A8MA 1W9VA 5M03A 4CCCA 2CBVA 6A3HA 4WSKA 4KGJA 2XJ7A 4GQRA 5HDRA 4MAVA 2C8NA 3VIOA 4B3LA 2E9MA 3G6LA 4MJ4A 2Y8KA 1JD9A 1E4LA 2WSKA 3AIUA 3N11A 4JKLA 2A3AA 1HJWA 1ISXA 3DYMA 4DWSB 4J3UA 1UWQA 3DYOA 1JYNA 3KEHA 1VENA 3THCA 1W3HA 3ALGA 2V3FA 3RM9A 1EXPA 4WKFA 4WKHA 1WP6A 1E55A 2WYSA 1NOWA 2Y2WA 1QI2A 4Z2KA 2XWDA 2QMJA 2D0FA 2FDMA 3ALFA 1ZBKA 4V2XA 2BNJA 5A2CA 3PZMA 1EDQA 1KBKA 2GVYA 4HOZA 2WXDM 1UD4A 2QPSA 4BS0A 3RJXA 1UR4A 3T08A 1X6NA 4ATWA 1DWIM 5IDIA 1KGXA 3TP4A 3NDYA 1HVQA 1C90A 2WWDA 4YN5A 4UR9A 1FOBA 2VRQA 2VX6A 4DUXA 3HU7A 1W3JA 2BS9A 1CGWA 3MS8A 3WD0A 5I79A 3GTNA 4XV0A 5CGMA 1ODUA 2WB5A 3NSNA 3S2CA 1UKPA 4CCEA 1WDPA 4Y7EA 1ISZA 2YBUA 1JF5A 2UY2A 1IZKA 4AEFA 1VJZA 2JEPA 1CENA 3K4AA 5JBDA 4J3XA 3K4DA 5I78A 1WZKA 1HF6A 3AZTA 2VX4A 1V03A 3FXYA 5M5DA 3OLDA 1SMDA 4AXNA 1CZ1A 1KXQA 5BXTA 3AXIA 2VX7A 3W82A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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