1HKMA

High resolution crystal structure of human chitinase in complex with demethylallosamidin
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEQSGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Crystal Structures of Allosamidin Derivatives in Complex with Human Macrophage Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITOTRIOSIDASE
total genus 125
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2003-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1hkmA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hkmA01
4MTVA 5EBAA 1FP8A 4MNJA 3ZT5A 3T0DA 3VDAA 2WVVB 2YL5A 4W84A 5M03A 3SCNA 4TVCA 1US3A 1H11A 1BFNA 4UQ9A 2V3GA 1UOKA 2ZXQA 3I3BA 1B0IA 4F8XA 1E70M 4P8UA 2FH8A 1ESWA 3SCVA 1XCXA 1OD0A 5TD4A 2FHCA 2YA0A 2CESA 3T2QA 4JKKA 3AHTA 4IM4A 1H0IA 1ZBCA 1UR2A 1BSIA 4AZ5A 2X05A 2JIWA 3ARWA 2VT0A 3AIUA 4KGLA 2WMGA 5D9NA 3KZSA 1GQIA 3WD2A 4UQDA 4OJYA 3K1DA 4NSBA 1UWQA 2IUZA 1LQ0A 2AAAA 2OSWA 4JCMA 3WSUA 5AYBA 1NP0A 5A6BA 4JZ5A 2DIJA 2CBIA 1GORA 2PB1A 2OSYA 3TP4A 3N9KA 4TVUA 1SFSA 3VX0A 3WIJA 2BV9A 1LJYA 1E40A 1QHZA 2WKGA 3VMNA 2YKKA 4HTYA 4WKAA 3K4DA 4D6FA 1OSEA 1EQCA 2GK1B 3IK2A 4AY1A 1Q6CA 1F4HA 3BAYA 2VX6A 3K4AA 5CGMA 1XYZA 1Z32X 3F4VA 5CLTA 2BVDA 3AMLA 3WELA 2XHYA 3MKKA 5E6ZA 4KGJA 1XH1A 2W61A 1Q4NX 2PWHA 4CD7A 3LPFA 2X0YA 3PTMA 3A4XA 1KFWA 1E43A 4MDPA 3D5HA 3UG5A 1WZLA 5BRQA 4LYRA 2WPGA 2JF7A 4X9YA 3AIBA 3CUJA 3BCDA 3T08A 2CETA 4D6EA 3ZJ8A 4MNMA 1C93A 4ZXOA 3A4AA 1XH0A 4B16A 1UD4A 1CXKA 2HISA 1XV8A 1JYNA 3WF3A 5JBFA 3W28A 4RE4A 3KWXA 2Y24A 3A3HA 1W1PA 2OWXA 4AYSA 1WE5A 4JHOA 2PC8A 4E2OA 4N0RA 4KWUA 1AVAA 1V3JA 3RJXA 1W1TA 1QI5A 1VRXA 1NM9A 1EXPA 1OT2A 3GNOA 3AMDA 1MXDA 2G4FA 4PBGA 4HZ7A 2UY4A 2YJQA 1EGZA 4HA3A 4LXFA 1QW9A 1CLVA 1JZ6A 3WN6A 1SMAA 4DUWA 1N82A 3PZIA 4UOZA 2XSAA 1G94A 1FFQA 1GZJA 1JXKA 2G3MA 4HPGA 1UA3A 3SUUA 3GH5A 1NWRA 5A6MA 1P6WA 3FHAA 1HVXA 3BLKA 1TUXA 3UG4A 4HZ8A 1PEZA 2EPMX 3CZEA 4NRSA 3W26A 3QOKA 4UQEA 2C0HA 2EQDA 2DT1A 4KMQA 1D7FA 3VGFA 4GI6A 3ZIZA 3VIFA 1W1YA 2J79A 5GQBA 3SUVA 4AIOA 5F7UA 5DFAA 4B3KA 2J8GA 4LGXA 2O9OA 2EPOA 1E55A 2DT0A 4CVUA 5GNYA 1KXTA 1V3LA 2QF8A 1PZ3A 1QI0A 1BVNP 1EH9A 2CHNA 3CTTA 3WNPA 4UQAA 3PZTA 2ZXBA 1MQPA 4IISA 8CGTA 2PF0A 4YN5A 2J78A 1W1VA 2VOTA 2XVNA 5C71A 3AFBA 2XSBA 1OWQA 1W3JA 1MW3A 2W67A 4TTGA 2ZUTA 1VFOA 2WBKA 4WKHA 5M5DA 1BPLB 1W2VA 3W37A 4M80A 3GBEA 3D3AA 4B15A 1UD8A 1WDSA 2V38A 5BROA 2YDQA 4F9JA 3DC0A 3M46A 3SIMA 5I0DA 4M56A 4MB1A 1C8QA 3WNMA 1KB3A 1V0NA 3CUHA 3NYDA 5D9OA 4EKJA 4GQRA 1NWTA 1Q6FA 4H04A 2D23A 1UH4A 3VGDA 2CXGA 3QGVA 4XB3A 1XD1A 1UH2A 5IHRA 4LYQA 3MMUA 5CPQA 1R7AA 1V03A 3VMPA 1W9UA 2WNWA 3THCA 2BXZA 3AS1A 2O9TA 2WKLA 1E6QM 1DP0A 1S46A 1B30A 2CHOA 1I1XA 3BC9A 3AIVA 2XVGA 3DHUA 3OZPA 3WDIA 1UD5A 3TTOA 4Z2HA 4PSPA 2DQXA 1W32A 4C7GA 3WFLA 5FKYA 4D6DA 3N04A 4MAVA 3T0AA 2BVTA 5I23A 2GFTA 1V3MA 2DSZA 1W3HA 2WYSA 3A6OA 2ZE0A 2QPSA 1J10A 4KRTA 1UD3A 4PMYA 4OZOA 1X1NA 4HMCA 2J4GA 1XH2A 4J3WA 5HNNA 3GNPA 4ML4A 4AIEA 4PTWA 1V02E 4AZGA 2VX4A 5I2UA 5DT5A 1L8NA 1WPCA 2YA1A 2VO5A 1CGXA 5D9MA 1W9XA 4HU8A 3PZNA 1CXHA 1HL8A 1HN1A 5BXPA 2XWEA 1BG4A 4MNKA 1J0KA 2DH3A 1E4IA 3POHA 1CECA 1KWKA 1CGUA 3WH6A 4J3XA 4ZE4A 1GPFA 2YIHA 3MSGA 2XFRA 1YHTA 1TVPA 4CD5A 3PTKA 1HVQA 1EHNA 1WO2A 4BQ3A 1WCGA 4H41A 1X6NA 2VUYA 3SUTA 1V08A 4LYPA 1MQQA 2GUYA 3CH9A 3T2OA 3QR3A 1R85A 2GJXB 4NRRA 3OLEA 4PMRA 4ACYA 1NOFA 1WP6A 1JZ4A 1NWSA 1LG2A 2E40A 1JFHA 4MADA 1HF6A 1BG9A 3PZOA 3K8MA 1OIMA 2XIBA 3VDHA 1K9EA 1F4AA 1US2A 3CUFA 1GQJA 4PMOA 3DHPA 3W6LA 3MMWA 2VC9A 1JG9A 1W9DM 2ZICA 1HL9A 5E6YA 5AY7A 4WKFA 3THDA 3VKKA 2ZUMA 3AIWA 2WC3A 1HKJA 1HJXA 1J18A 4UZSA 3IJ7A 1KBBA 5KEZA 1MW1A 1JFXA 3WDRA 1HKMA 1XSIA 1B9ZA 4IPLA 4W89A 1E4LA 3SCTA 1UWSA 2DT3A 3CIVA 1QI2A 4ATLA 1FOBA 3CPUA 5JIPA 2D3NA 4MPKA 4E8DA 2VZVA 3WNNA 5ABFB 4KRUA 3DYMA 2J7FA 1JF5A 2BY1A 2ESCA 1KCLA 5ABEA 3ARXA 4ACZB 2OSXA 1PPIA 4V28A 4CD4A 3KE0A 1ZJAA 2UY3A 4W8LA 4AC1X 2VI0A 1VBUA 1OINA 5CZKA 1WDRA 3VMOA 3VILA 3VNZA 1KQYA 3WKZA 4J28A 4W5ZA 3WMCA 1J0IA 3BAJA 4AZ7A 1QI3A 1KXVA 2ZUSA 2VRQA 1MW2A 2FGZA 3G6MA 3MS8A 4DWSA 1J11A 5LA2A 1PAMA 2YDRA 1U30A 1GOOA 1E4MM 2WMFA 1CGVA 1JNDA 4FK9A 5HPOA 2J47A 2ZX9A 2C8NA 4Z2GA 2GDVA 3WQ8A 1PX3A 1DTUA 4ZEPA 5HPCA 5FCZA 4PMUA 4GI9A 1E6SM 2DPEA 2XGBA 3S6TA 3WENA 1EDGA 5GNZA 3WEOA 4PMVA 3GNRA 1UR4A 1C92A 3M6DA 4XZBA 4BQ2A 2E0PA 2DSWA 1M01A 1CGYA 1QNPA 4E4PA 2OWWA 2O9RA 2ZX8A 4S3KA 4WK9A 4W7VA 3L4UA 2J7DA 3MO4A 4PTMA 2CITA 3CZKA 1U2YA 3DECA 4RL3A 4TX6A 4GZIA 5JH8A 1HJQA 3ARQA 5E09A 4BZYA 4HA1A 1QNOA 3VIMA 1E73M 1G5AA 2WZEA 1VENA 4OBRA 4PN2A 3N11A 2D2OA 3OLGA 1G0CA 3KL5A 1JGIA 3AHVA 3NCOA 1V0LA 3OIHA 3CZGA 1O7AA 1HJWA 1HIZA 3RMEA 2PWDA 4AWEA 3GH7A 3MU7A 1R8LA 1E5JA 1ZJBA 2VCCA 2QMKA 2ZX5A 2W5FA 3MUZ1 1TG7A 2VURA 1BYAA 4UFHA 4DM1A 1ECEA 3WEZA 1KXHA 4URIA 1EHAA 1E6ZA 1MYRA 4UQCA 1PX4A 1B31A 4MNLA 2ZXAA 4QAWA 4Z2KA 2W4XA 3GXIA 3SCUA 1JZ7A 5IXEA 1UQYA 1GVYA 4LQ1A 4TUFA 4KH2A 1IT0A 3NDZA 1MFVA 5CXPA 3UG3A 4QDMA 3WFZA 1HXJA 2OWCA 3L4WA 3W38A 1UH3A 3WH5A 1JXJA 4JFUA 4JAWA 5DO8A 2J7BA 1ZS2A 2QHAA 5JUVA 5IHSA 4P7LA 5BXTA 1FFRA 2XVPA 5A2BA 4W87A 4XX6A 2VNCA 3I3EA 3VTRA 3UERA 4FF5A 3WMSA 2XVLA 4RE3A 1GONA 2BHUA 1H49A 1Q6DA 3ARTA 1HKIA 3SCPA 1C91A 2G3NA 3CHEA 2VQTA 1EA9C 5A6BD 1KWGA 3GM8A 1CIUA 4AZCA 3AZRA 2VZTA 2J25A 1TZ7A 1FHDA 3WNOA 4CCDA 1GOQA 2WMIB 2PBGA 2XM2A 1BAGA 4EAMA 2YL8A 2WCSA 1G01A 1QNSA 2QLYA 2X0HA 1C8YA 4JFTA 2DDXA 5EMYA 4PCTA 3OZOA 3AZTA 2Z1KA 1B3XA 2DSUA 1E1FA 3EBVA 5I77A 5EFFA 4QFUA 4NI3A 3WBAA 4X0NA 2Y5EA 1XSJA 1M53A 1TR1A 3VPLA 1GCYA 1VBRA 2WC4A 2XUCA 1JDAA 4J3SA 3BAXA 1XD0A 3SCWA 5ABFA 4GINA 3L4VA 4PMQA 5BXRA 2DEPA 3BMWA 2A3EA 3EMQA 4AIUA 3AMKA 2D3LA 1NOWA 4CKQA 3ZJ7A 5A95A 2IXUA 1GJUA 5I3DA 1QHOA 5HBFA 1H41A 3VIOA 1GOWA 1TA3B 2ZOXA 1QPKA 4BCEA 1V6VA 4E8CA 3RCNA 4CUCA 3L2MA 5M17A 3OLIA 1KXQA 1EO5A 5A6AA 4JFVA 3OGVA 1K9FA 4P7NA 4PSRA 3WQWA 1B90A 5CGTA 2XGIA 5D9PA 3WDPP 3CMJA 3L4ZA 2XG9A 3VGGA 2VZUA 2WZHA 2VJXA 4AD0A 3UCQA 4U33A 4UZUA 1JD7A 4WSJA 2YDSA 1QBAA 4AZ6A 4DUVA 4HOXA 1H0GA 2WB5A 3LMYA 4V27A 3VD5A 1GQKA 5A8OA 5IFTA 1KGWA 2PWGA 1E3XA 1OBAA 2WXDM 4MJ2A 3B8SA 3GZAA 3ZR6A 3FW6A 1E6PA 2CKRA 1IV8A 3PZUA 3S2CA 4CU7A 2YL6A 5BXSA 3WQVA 1W9BM 4HMEA 1C90A 3WNKA 3NSNA 4D1JA 1KGXA 2EO7A 2CEQA 3ZJ6A 1CENA 4W88A 3APGA 1KBKA 1HJSA 1V3KA 1JDCA 2DSKA 5LYRA 5AC4A 1HKKA 1WKYA 1OGSA 2WVVA 1HP5A 2BS9A 4WJXA 4GQQA 1I75A 4M1RA 5EFDA 1GUVA 2OLHA 1Y7VA 4AW7A 4F9DA 3POCA 4J27A 4MDOA 1LL7A 4PMDA 3ZR5A 1CTNA 4QLJA 1OD8A 4OOZA 1E6NA 4PYSA 3AYRA 4UFJA 1H4PA 3AROA 3BAKA 5ABHA 3AMGA 1JI1A 4EANA 4D6IA 4W5UA 2ZIDA 2ZWYA 3PZQA 1NOUA 2E8YA 2Y4SA 4C7DA 1CEOA 4FLOA 4M24A 3WY1A 2CNCA 4FMVA 2WCGA 1XYFA 2AOSA 3SCRA 1E6RA 3FY1A 3DYOA 4FLRA 3N13A 3OGRA 1OT1A 3WQ6A 4JFWA 4QCFA 2WHKA 2BFGA 5CJ5A 4L4PA 4Q22A 3WF0A 4GZJA 4JKMA 2WHLA 2NT0A 4QP0A 1VEMA 3CMGA 1JF6A 2BY3A 5A1AA 2D22A 4W7WA 4EK7A 3AIEA 1ITCA 2W66A 2W62A 1C7TA 5C70A 3U57A 4ZE5A 4JFSA 2GDUA 1V6XA 1V0MA 3WF1A 1FA2A 1VIWA 1GW1A 2WCAA 4B9ZA 1CYGA 5LA1A 1D3CA 3HMCA 2PBOA 4ZENA 4C7FA 1GHRA 4AEEA 5BRPA 2V3FA 1DWGM 3HU7A 3U7BA 2GK1A 3SURA 2WBGA 1EOMA 5A6LA 2VTFA 1V3HA 1E1EA 5A2CA 4MB5A 3UR8A 5GPRA 3KL0A 2UWFA 1NWUA 4TVDA 3MMDA 2B31A 3BCFA 3N1AA 4WIWA 5DMYA 4H8HA 1UWIA 3MV11 2VVSA 4UFIA 3B9EA 2GVYA 4R5EA 4M8UA 1SYTA 3AXIA 2CPUA 2X1IA 1UUQA 3N17A 4UFMA 3SCSA 3BGAA 1CXEA 3OBAA 3SCQA 4EE9A 1NP2A 3ZOAA 1FHLA 4PTXA 2E9MA 1K9TA 3WH7A 1M03A 3AHYA 1FH7A 1PBGA 3F5LA 5DEZA 2BNJA 1ISVA 4CCEA 3VD4A 1BF2A 4IUGA 3AHXA 3CHCA 4JCLA 1J01A 1UR1A 3I3DA 3ARYA 1Q6EA 3CHFA 1UKSA 1JNEA 1UZ1A 4W86A 5E0CA 3B9DA 3WD0A 2FGLA 2WW5A 3ARUA 3U7VA 2J7CA 3PZ9A 3EDFA 3UEQA 5C8BB 3PHAA 2BXYA 5JIWA 4W8AA 2VRKA 7TAAA 1CGTA 4Z2IA 1HT6A 3BAWA 4D72A 4U5IA 3W81A 2VCBA 7A3HA 4J3UA 1RH9A 5IFPA 4ATWA 1QHPA 3ALGA 3W4RA 1BYCA 4UQBA 1R7OA 3O9NA 4PEEA 1VF8A 1GOKA 3FAWA 4BF7A 3VGBA 5D4YA 3WUBA 3AICA 3WQ5A 2GJRA 3CUGA 3WUFA 3T2PA 1NQ6A 1C3FA 3VIHA 1TCMA 2ZXDA 2VZSA 2EJ1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1MQR A;  2V5D A;  1WNO A;  1XHG A;  1K9D A;  4U5K A;  5HXM A;  2EBN A;  4CVW A;  2DSV A;  2VL4 A;  4TXE A;  4GI8 A;  1V0K A;  3FAX A;  1QOX A;  3NDY A;  1XGZ A;  2JF6 A;  3CZL A;  1RPK A;  5KZ6 A;  7CGT A;  5BYW A;  3NUK A;  4D6J A;  5ABG A;  1WAW A;  4JL1 A;  1EO7 A;  3RM4 A;  2C7F A;  5IDI A;  2J7G A;  1PIG A;  1XSK A;  2WLZ A;  2CCR A;  3WD4 A;  1R87 A;  1TFV A;  1UQZ A;  3VM7 A;  1M7X A;  1JAE A;  3NIY A;  1PX8 A;  3WF2 A;  1UWU A;  1WZM A;  2D0G A;  2V5C A;  1HP4 A;  1CWY A;  1ODZ A;  4HOZ A;  1RP8 A;  4RE2 A;  1TVN A;  2EPN A;  1JZ2 A;  1HX0 A;  3J7H A;  3ZST A;  2A3A A;  1BGA A;  4X0V A;  3AIS A;  5I78 A;  4CN1 A;  1W3L A;  1VEP A;  5A3H A;  4UFK A;  4NZC A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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