3WD1A

Serratia marcescens chitinase b complexed with syn-triazole inhibitor
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
total genus 162
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd1A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd1A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd1A01
1RH9A 3GNRA 4AWEA 2V5DA 3OG2A 4RE2A 2J7DA 4D6HA 1JZ7A 1AQMA 4RE3A 1KGWA 1UZ4A 4AD4A 1V0LA 4UQAA 3SUUA 1SMDA 3BCFA 1UD8A 3L4UA 1NWRA 1PX4A 2ZX8A 2CPUA 3RM9A 3GBDA 4ACYA 4CCEA 1DEDA 1UA3A 4P8UA 1E6RA 4HPGA 4MB3A 4M24A 3L4WA 3WDIA 4HOZA 2AMGA 5I78A 3VIIA 3OGVA 4PEEA 5I24A 3NSMA 1R7AA 5EFFA 2EJ1A 1RPKA 4TVCA 1EDGA 3OGRA 2Y2WA 4RL3A 3RIKA 4UZSA 1C7TA 3UR7A 1PZ2A 1E71M 4OZOA 3PZVA 4JKKA 2FGZA 1UH4A 3RJXA 2WHMA 1ODZA 2DDXA 3RPMA 1I1WA 3WEOA 1E0WA 2DT0A 4OKDA 3WH6A 4AISA 1B31A 2CESA 4OUEA 9CGTA 3A4AA 3AMKA 1KFWA 3UERA 1UA7A 2IXVA 3SIMA 1QI5A 4S3JA 1OT2A 5IFTA 3WELA 4PCSA 1MFVA 3IJ7A 1GQJA 2YA0A 2VRJA 1IZKA 4UNIA 3BAXA 3POHA 3OA5A 2VC9A 3NYDA 1AVAA 4GPNA 2GUYA 3W81A 1TUXA 3B9AA 2V3DA 1J9YA 4HMEA 1ISZA 1MW3A 4GQQA 1C91A 1JNDA 1V3MA 1OWQA 1VEMA 3VVGA 4E2OA 3WF2A 3NCOA 1BTCA 2GDUA 2GJRA 3FHQA 4JHOA 1PAMA 3PTQA 2CHOA 4W7VA 2YA1A 3L4VA 3PZNA 5HPOA 3W29A 4CGTA 3ZJ8A 3CHEA 1W9BM 2D3LA 2DSUA 4JKMA 1ISXA 1SMAA 1G0CA 4CCCA 4QAWA 3GH4A 3VUPA 2DIJA 2PWFA 3PZQA 2VRQA 4C7GA 3MS8A 3W24A 1NP2A 5JUVA 1JZ8A 3PTMA 2VZSA 1FP8A 1H11A 4HZ7A 1US3A 2VZOA 5LYRA 1WB0A 3MV11 1J0YA 4UTFA 1GQKA 1DWHM 4IPLA 1JZ3A 2WB5A 4X9YA 3WH9A 1HP4A 3T0DA 1MQRA 2UY4A 1N82A 5DFAA 2ZUTA 1X6LA 3T0BA 1E1FA 4Z2HA 1V3KA 2XIBA 2TAAA 5FL1A 1HIZA 2CCRA 3DECA 1NWTA 3F5KA 4PMZA 1V6VA 2XGBA 2EEXA 1UUQA 4WSKA 1FH9A 1H2JA 5HNNA 5JBDA 4GKLA 1OBAA 2VX5A 3RCNA 2X09A 2XGIA 5DF0A 1GOWA 4HZ6A 1D7FA 4TVDA 1WPCA 1PJ9A 5CGTA 1BAGA 3WNLA 4AD2A 1VB9A 3CZLA 3LPOA 1BYAA 1E6ZA 2ZX6A 2WW5A 3WEZA 3AYRA 1M03A 1BYCA 3ZO9A 4FLSA 4PMYA 4LYRA 3ZSSA 1KQZA 3VGDA 4J27A 4UOZA 3KWXA 4KH2A 6TAAA 4U3CA 1EO7A 1UWIA 3F5LA 3WDPP 1MW0A 1UH2A 2CBJA 2QMKA 2XFYA 3U7BA 2WVSA 2ZICA 1HKMA 2WYSA 2OWXA 1EXPA 4OOUA 3OLGA 3APGA 1JFXA 2J7CA 3N13A 1US2A 3WUGA 5M17A 3N12A 1DWGM 4JL1A 1BG9A 5C71A 2E8YA 3B9DA 2VMFA 4P8WA 3CPUA 4H8VA 3ZR5A 5A6JA 3HU7A 1CZ1A 1ZBWA 3BAIA 4R27A 3WNPA 1K9FA 1KWGA 4DWSB 5ABFB 4AD3A 5ABFA 2O92A 3FNDA 2XTKA 1SFSA 3W6LA 4MDOA 4B15A 1NOUA 4H7VA 2G41A 3OB8A 3CBWA 1G9HA 4M81A 2J7EA 4UQEA 3RM4A 1J12A 3WFLA 2VUYA 1UH3A 2G3JA 4N0RA 1W2PA 1HJXA 3U57A 3THCA 4AEEA 1VRXA 2J47A 4UQ9A 2VQUA 2GSJA 1WAWA 1E4LA 3SURA 4DM1A 3LPFA 3N17A 3WDJA 4GZJA 4PTWA 4U3AA 5AC4A 2WM0A 4W89A 5GNYA 3IJ9A 3W38A 4BA0A 2DQXA 4PBGA 4U5KA 4ACZB 4ACZA 5IXEA 3UG3A 3ZT5A 2D2OA 3VIJA 4ATWA 1BLIA 1EQPA 3F5JA 1H4PA 5A6LA 3ZJKA 1JAKA 2WMJA 1WZLA 4MDPA 4D1JA 3I3EA 4URIA 3AZSA 2PC8A 2E0PA 2W4XA 1O6IA 1CNVA 2OSYA 4LGXA 1L0PA 4MNMA 1Z32X 3WD3A 5HXMA 2VURA 4MNJA 4W84A 1V3JA 4PMVA 1OGSA 4MB4A 2WLYA 2CIPA 4HA3A 2WVUA 3WNKA 1SR0A 2WC7A 3BAJA 2XSBA 1FA2A 2WMFA 1KBBA 3GXFA 4MB1A 1W91A 1J01A 2XJ7A 3TTYA 4W5ZA 1CXLA 4FF5A 3J7HA 1JNEA 3UESA 1M53A 5F7UA 1NM9A 4MNLA 4AZCB 2V3EA 1BQCA 5D8ZA 2O9RA 4HOWA 1UQZA 1HT6A 1VJSA 3QGVA 2CKSA 1XCWA 2BNJA 2JF7A 1LF1A 3BLPX 1ISYA 1JD9A 4QCEA 1JFHA 1HKJA 1K9DA 5LA0A 7A3HA 1CPUA 2YJQA 3I3BA 5M03A 3M6DA 2VJXA 1J0JA 3M07A 5A94A 1V6YA 1W3KA 3SCSA 1W3HA 2WKLA 1CGYA 4TVUA 1XH0A 2DEPA 2QHAA 4AZ5A 4AIOA 5JIWA 2WZHA 3GYCA 2WVTA 3WQVA 4MNKA 2BXZA 4ZE5A 3WMCA 3ARZA 4CD6A 1DWIM 1FFQA 3WQ8A 4ATDA 1H1NA 1V0NA 4X0VA 3VX1A 4NSBA 1EOMA 2W5FA 4CU6A 1W9VA 1B3XA 4JFSA 4RE4A 1DWFM 4H8HA 3CUGA 1CWYA 3AIEA 3FAXA 2OYKA 2YL8A 4M1RA 1KR1A 3WENA 4J28A 5DO8A 2X05A 2UWFA 3QOMA 4UOQA 3GH7A 2EPOA 4AW7A 3DHUA 2YL6A 3PZOA 1L8NA 1UR9A 1JD7A 3CHFA 3BAWA 2BVYA 4J3TA 1WZKA 1V02E 1OGBA 1GOIA 1CGXA 3EBVA 3W53A 3AYSA 1MFUA 2GVYA 3DYOA 1E6SM 1PIFA 2VCAA 3HJEA 4ZENA 3VMNA 4L4OA 3VM7A 1M04A 1XGZA 3L4YA 2EPLX 3MMWA 1VENA 2DT3A 3AJ7A 3VGBA 4AIEA 2Z1KA 5GNZA 1CDGA 3GXDA 4KWUA 1XC6A 4H04A 5CQ1A 1XRVA 2YL9A 3VIFA 4JFTA 3ARYA 1DP0A 4HMDA 1FFRA 2DPEA 3FN9A 1KGXA 4JHZA 1E56A 4PMQA 3VO0A 3NDZA 1WDSA 3KL0A 5E9AA 1UR4A 3EDEA 4AIUA 3AMDA 4FLRA 1JZ4A 4BQ2A 4M56A 1VBUA 1MXDA 3G6MA 2YOCA 4R5EA 3VIPA 4E8CA 1W1PA 1OCQA 4QLKA 3FW6A 1UR8A 4HP5A 2J7BA 3II1A 3MMUA 1D2KA 5AC5A 3OZOA 3NJ3A 1CLVA 1EA9C 1J0KA 2X0HA 1UD2A 4IPNB 4H8UA 3L2MA 2VQTA 3IANA 3WD0A 3PZUA 6CGTA 2PWDA 4HA1A 5CSUA 3VOCA 1ZBVA 3SCTA 4J3XA 4HA4A 4AXNA 1FOBA 1JZ2A 3EMQA 4KRTA 3AS3A 3WN6A 3AHZA 4GIAA 2E8ZA 4CN1A 1NARA 3ZOAA 2DT1A 3NDYA 1C93A 4MTVA 1HL9A 1W9XA 2CEQA 1JYXA 4KMQA 3RILA 3GDBA 1XSIA 3AIWA 1VJZA 1FH7A 3DYPA 2XVLA 2ZIDA 1GHSA 5FKYA 2GJXA 2WZEA 4W93A 4C7FA 4P7LA 3U7VA 5EBAA 2Y24A 3CZGA 5FOOA 3MV01 2G4FA 4W7UA 4C7DA 3VD7A 4AZBA 2CERA 4PTVA 3L4XA 4AMCA 1TMQA 4WKHA 1VEOA 2D22A 3LPPA 1WKYA 2WMHA 4FMVA 3MSDA 5CPSA 1V6UA 3VILA 4TX6A 4AZGA 4PUEA 2BS9A 4K68A 2O9PA 4M8UA 1FH8A 1CEOA 5I2UA 1TZ7A 3WH5A 2YBTA 4H41A 3CZJA 1LG1A 5DT7A 1XSJA 2WC4A 5CPQA 2XVKA 4D6GA 2XPKA 5FD0A 3WL0A 4F79A 2ZX9A 1CXFA 1KXTA 4ZE4A 2IXUA 4PSPA 1ESWA 2FGLA 2PWEA 1KXQA 3BMVA 2BHUA 1X1NA 4TUFA 1UD4A 1BVNP 1UKOA 2FHBA 2AOSA 2ZUUA 4D72A 1GOQA 3K8KA 1NWSA 1E4IA 4TXEA 1QNQA 5LA1A 4J3WA 7TAAA 4PTMA 4UFIA 4V2XA 1E4NA 1UR1A 1V02A 3K4AA 1UQYA 1M01A 1ZJBA 3A4XA 1XCXA 3VIGA 2GFTA 1HJQA 3CMJA 4MAVA 1S46A 2VCCA 2EXOA 2QPSA 1BSIA 1U2YA 3T2QA 1E72M 2WNWA 2WVVB 2WVVA 5I5RA 1F4HA 2VZTA 5LA2A 1KR0A 3BLKA 3QHOA 5D9OA 3BC9A 1R86A 3ZT7A 4UQBA 1UKSA 1BGGA 1VFMA 3WD1A 3ARTA 2WZIA 3IK2A 2J7HA 2VX4A 5DEZA 1QHPA 2ZUVA 4AZ7A 1W9PA 1ED7A 4H2CA 1XV8A 2PF0A 3W25A 4W88A 3CZKA 3VINA 3AS0A 2WBKA 2VX6A 4IM4A 4AYSA 1EIBA 4U2ZA 3QHNA 1WZMA 3DYMA 3T2PA 1GJWA 1G94A 4KGJA 2VVNA 2WWDA 1NP0A 1VIWA 2XSAA 2DSWA 3SCWA 1GUVA 2A3BA 1GQIA 1K6AA 1XD0A 1YHTA 1G01A 4GI9A 1RP9A 1V03A 2WMIA 2FH6A 1UWRA 2YBUA 1WDQA 1Q6GA 4WSJA 1KXVA 3W27A 1R7OA 5A8QA 3VU2A 3POCA 4ZXOA 2DH2A 2BV9A 2XM1A 1ZBKA 4WK9A 1B90A 3AISA 1KGUA 5I23A 1E6QM 4WKAA 4UFLA 3WBAA 3W82A 4GQRA 2Q8XA 8CGTA 3AS1A 2ZX7A 2WCAA 1ECEA 1R87A 1JF6A 5CGMA 4FK9A 4ML4A 4HTYA 3TTOA 1V0KA 1W2VA 3NUKA 4U31A 3SCRA 2BY0A 2V3FA 1CENA 1ZJAA 3KZSA 3N9KA 3VDHA 1BYBA 1QHZA 3CH9A 3VDBA 5D9NA 1QBAA 1B3WA 1HP5A 1I75A 2RGLA 1VF8A 1HJSA 4PUDA 4ZXLA 2EBNA 2W67A 1MW1A 3T08A 4CVWA 2A3EA 1E3XA 4JCMA 5A95A 2XIIA 3TOPA 2PWGA 3MANA 4HU8A 5CXPA 5I3DA 3VMOA 1E70M 1C3FA 3T0AA 5AYIA 1QNOA 1GONA 4WF7A 2ZUMA 1HKIA 1JZ5A 2J8GA 2WK2A 1ITXA 4YHGA 4XUYA 2V38A 4HPHA 1UR0A 3OGSA 4UFMA 1EDQA 1AMYA 4MJ4A 5E70A 1JZ6A 2WPGA 4J3UA 3HMCA 5HDRA 5A8NA 4D6DA 4D6FA 3T2OA 1C7SA 4PN2A 1QNSA 1CGWA 3AS2A 4V27A 4W85A 4BS0A 3CMGA 4W5UA 4QCFA 2OSWA 3GXIA 4U33A 3PTKA 5A6BD 4B3KA 5CSYA 4LXFA 4D1IA 3ZJ6A 1WO2A 3SUSA 3AFBA 1MW2A 3F4VA 1Q6DA 1OINA 3LMYA 2W66A 3WF3A 4NF7A 1B3ZA 1EH9A 4TTGA 2ZXBA 1HVQA 3PBGA 3AHTA 3CIVA 3K8LA 3OLEA 3MMDA 2YLAA 3WIJA 5BXPA 3BH4A 1IV8A 4ZEPA 4D71A 3SCOA 1V3IA 2NW0A 1IT0A 5E0CA 1MQQA 3CUJA 1DHKA 3ARSA 1CECA 6A3HA 3TP4A 1QNPA 2QPUA 5A2CA 4JL2A 4ZFMA 1XYZA 2UY3A 2D0HA 4QDMA 4CU7A 2E9BA 4W87A 2J25A 1WE5A 1EDTA 5BYWA 3FAWA 2XVPA 1OM0A 1FHDA 4P8VA 3WUEA 3AHXA 3N04A 4UQDA 4M29A 4DUVA 3AIQA 1QI2A 2VCBA 2RGMA 5JIPA 2FH8A 2CITA 1Y7VA 4GXPA 1ITCA 1TA3A 3KE0A 4B16A 3VGFA 4F66A 3WUFA 1NOWA 3KEHA 1UOKA 4BZYA 3AOFA 5DT5A 4J7RA 3SEPA 4J3VA 1HNYA 3EMCA 2XVNA 2OYMA 4JFVA 1BVZA 1YQ2A 2J75A 5CLWA 3BAYA 2J78A 4WKFA 2JIWA 5IHRA 3VTRA 3IJ8A 5I0DA 1MWOA 1JDDA 2C8NA 3FHAA 4UQCA 5KZ6A 3NSNA 2VZUA 1J0ZA 3B8SA 3UEQA 1WZAA 1G5AA 4GI6A 1E55A 1UWTA 1W1YA 4U5IA 3W26A 3UG4A 2G8ZA 2ZXAA 3ZM8A 2O9TA 4JFUA 1EGZA 2XFRA 1OD8A 4CUCA 3ARVA 1QNRA 1RD6A 2YKKA 4BQ5A 3VIKA 1U33A 3WD2A 5FCZA 2D23A 1V0MA 1BGAA 2YIHA 3S2CA 2J4GA 2CBUA 4XZBA 5E0FA 2VL4A 2Y5EA 4W7WA 2C0HA 3O6AA 3I3DA 1K9TA 3SUWA 3GXMA 1V3LA 5CPTA 2E3ZA 2PBGA 1UWUA 1KCKA 2E40A 1E1EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1VEP A;  3VIM A;  3AQU A;  3L4T A;  2WHL A;  1E6P A;  1H41 A;  3AIR A;  3UET A;  2EQD A;  5TD4 A;  4D6I A;  1Q4N X;  3OZP A;  4MPK A;  4XZW A;  2XUC A;  2Y8V A;  3AHY A;  3OIH A;  1TFV A;  3NSX A;  2VX7 A;  4PMR A;  1TVN A;  1QVB A;  2E9M A;  1WDR A;  3MO4 A;  1GPF A;  2ZUN A;  1E15 A;  2ESC A;  5A8P A;  1Q6C A;  3AZT A;  3DHP A;  2D49 A;  4KRU A;  3WSU A;  2RTS A;  4EE9 A;  1OGG A;  5I6S A;  4HMC A;  1V6X A;  1U30 A;  2D20 A;  1XH2 A;  4MAZ A;  3SCU A;  2WAN A;  3AMG A;  2AAA A;  2BFG A;  1JI1 A;  1EQC A;  1GVI A;  1C8Y A;  1EHA A;  4B9Z A;  5JBF A;  4W8L A;  1B9Z A;  3UCQ A;  1WP6 A;  1GCY A;  1BHG A;  1CIU A;  2E4T A;  3RJY A;  4XB3 A;  5D9P A;  1MQP A;  2VR5 A;  4XV0 A;  3OLD A;  3VGG A;  1VAH A;  4A4A A;  2B31 A;  3HN3 A;  4WJX A;  1I1X A;  4PMU A;  3ECQ A;  5A6M A;  1DWJ M;  1WCG A;  1HJU A;  4BF7 A;  4GO8 A;  4IUG A;  1H0G A;  5BCA A;  1TG7 A;  3VNZ A;  3WQ5 A;  1J18 A;  4AD0 A;  2YDR A;  1VFO A;  1DTU A;  1TE1 A;  1JYN A;  1KQY A;  3GH5 A;  3CTT A;  3WDH A;  1HJV A;  4P7N A;  3EDK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5KIT A;  3SRF A;  3UQN A;  2Y1H A;  4U2Y A;  4H00 A;  2DZV A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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