4W5UA

Crystal structure of chitinase 40 from thermophilic bacteria streptomyces thermoviolaceus.
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
GTVKLGYFTEWGTYDRNFNVKNLDTSGTAAKITHINYAFGNVTGGKCAIGDSYADYDKAFTADQSVSGQADTWDQPLRGNFNQLRQLKAKYPHIKVLWSFGGWTWSGGFADAAKDPQGFAQSCYNLVHDPRWDGVFDGIDIDWEYPNACGLTCDSSGPDAFRNLMAALRSTFGDELVTAAVTADGTPGGKIEATDYAGAAQYVDWYNVMTYDFFGAWDAQGPTAPHSPLTSYDGIPKQGFTSADAIAAFKAQGVPADKLLLGIGFYGRGWTGVTQDAPGGTATGPAAGTWEQGIEDYKVLKNTCPVTGTVAGTAYAHCGSNLWSYDTPDTIASKMAWANDQGLRGAFAWDFSGDTADGELIAALSNGLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of chitinase 40 from thermothermophilic bacteria Streptomyces violaceus.
rcsb
molecule keywords Chitinase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces thermoviolaceus
total genus 130
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4w5uA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w5uA01
2XGIA 2WLZA 1ZBCA 3N9KA 2WMJA 4AXNA 3RM9A 1E3XA 1NWRA 2J7EA 1CEOA 4ZEPA 2PC8A 1XD1A 1H3GA 2WM0A 1ZBWA 2WMIB 5E0CA 4W7WA 2BFGA 1C92A 1M04A 2XSAA 3WDHA 1UWRA 3CZEA 3CZ8A 3F4VA 2DIJA 4J7RA 2YA1A 4M56A 1GCYA 4C7FA 5IHRA 1WDQA 1V03A 3ARQA 5DEZA 2CHOA 1UR4A 4X9YA 2WZHA 3WNLA 1B9ZA 2XVGA 3AI0A 1EDGA 1B1YA 5HPCA 1GOMA 3ECQA 5A8NA 4AYSA 2DDXA 4B3LA 2WBKA 5EFDA 4GI9A 5GNZA 2G3IA 1LF1A 4NRRA 2OSWA 1GONA 1H09A 4H8HA 1FHLA 4TXEA 1NOWA 4BS0A 4AC1X 5IFPA 1TE1A 3K8LA 1UKOA 3RCNA 4Y7EA 3WUGA 1E5JA 2JF6A 4AD0A 2Y2WA 4HU8A 1QI2A 1ODZA 1SMDA 5I23A 1CXLA 3GZAA 1GOIA 2J62A 2VZSA 2ZE0A 4W7VA 1E6SM 2VNCA 2B31A 1UH4A 4Z2LA 4UQEA 4UQDA 4CGTA 4NF7A 2PI6A 1OD0A 1M01A 2BY2A 2J7DA 2W63A 3PZVA 3NUKA 2F8QA 2G3MA 1HJUA 1E0WA 1B0IA 4AMCA 5FL1A 1WZKA 2XUCA 1UA7A 3AHYA 2V5DA 1ISVA 1TA3B 3PZ9A 3NSXA 4YHGA 1KXQA 4MB1A 1A3HA 4GQQA 2QPSA 1K9DA 3UR7A 1JF5A 1J10A 2WK2A 3VM7A 2VZTA 2ZUNA 1JYVA 2WHKA 1R8LA 4AZ7A 4CN1A 1G01A 3VIHA 1XH0A 3AMKA 2D1ZA 2TAAA 4HA1A 8CGTA 4FLSA 2JEPA 4DUXA 1DTUA 3CZLA 1PX4A 3D5HA 1JI2A 1VF8A 3SEPA 1J12A 1TCMA 1JI1A 1GVYA 2DGAA 1B3WA 1QNSA 1DWGM 4NZCA 4HZ6A 4PMQA 4FMVA 2VRJA 1D2KA 1W91A 4X0VA 4QCEA 3DECA 2D23A 2ZICA 3CLWA 4L4OA 2QLYA 2J75A 1KGWA 1E4IA 3WH7A 1C93A 2YDQA 2OWWA 4HMCA 3VD5A 3MUZ1 1QI5A 4BCEA 2XIIA 2WXDM 4CCCA 2WWCA 1QI0A 3WBAA 2BHUA 3QR3A 4CD5A 4QLJA 4UQBA 2BNJA 3KWXA 3DYPA 2WCAA 1KGUA 1OM0A 3II1A 3WN6A 4CD7A 3FW6A 5E6YA 2VMFA 4MJ4A 2BY3A 2RGLA 4B15A 4MNMA 2QHAA 1WZAA 4MDPA 3ZT5A 1EDQA 1HL8A 3APGA 3HN3A 2VX5A 1QI4A 4DWSC 3IK2A 4RE2A 4TOQA 2J79A 2UY2A 3CUJA 5CGTA 3WD1A 2EQDA 4ACYA 4TX8A 1C7SA 4E2OA 2CKRA 3GDBA 4P8UA 2QV4A 2WMGA 3AOFA 4RE3A 1PZ2A 5DFAA 5ECUA 2OYLA 2F2HA 3VIJA 1KQZA 1W1YA 2ZUMA 1EDTA 1M03A 3VIIA 3N17A 2ESCA 4XV0A 2C0HA 3CHCA 3RO8A 2WANA 1FFRA 3GBEA 1E6PA 1KGXA 5M17A 2WVVB 4B16A 3WL1A 1VFUA 3PZOA 1NH6A 4F79A 3I3DA 4OJYA 1GQJA 4ZE5A 1GUVA 2GJRA 9CGTA 1W9DM 3WIJA 2YDSA 2W66A 1G94A 4PSPA 4MNLA 1E0VA 3WDJA 2PBOA 2X2YA 3S2CA 5HXMA 2CETA 3OLEA 2XSBA 1CXIA 3OLGA 4R27A 3O9NA 2VC9A 4U31A 3MV01 2BVTA 3HJEA 3QGVA 4W5UA 3CUIA 1CNVA 3VD4A 4FK9A 1KXVA 1J18A 1D3CA 1LLOA 4Z2KA 1XRVA 5FOOA 5E6ZA 4CCEA 4ACZA 3AXIA 2EEXA 1W9UA 1EOKA 3WF4A 4H7VA 1R7AA 2GK1B 4UFKA 1W9XA 2XVPA 1CGVA 2XYLA 1EQPA 1FHDA 4W8AA 4OOUA 1GZJA 4P7NA 4XZBA 1N82A 1VFOA 3W6MA 1R86A 3VIOA 3WELA 1UD3A 1OWQA 1GOOA 4PSRA 1LG2A 1SR0A 2X8RA 2A3EA 1BGGA 1JZ6A 2VL4A 2YOCA 3EDJA 1AQ0A 1H41A 1UWTA 5ABGA 1MYRA 2D2OA 4AD2A 4M80A 3T0AA 4UQ9A 2X0HA 1W32A 3K4DA 1UD4A 4P7OA 3MMUA 4U5IA 1PJ9A 5EB8A 7CGTA 3VOCA 1TG7A 4W8LA 1ZS2A 2A3BA 3CZKA 3W81A 1US2A 4TX6A 1DWFM 3MUIA 1W1PA 4TVCA 3POCA 1TMQA 5BRQA 2CEQA 2ZXBA 4GKLA 3WDPP 4AZ6A 3U5UA 3ZJ8A 4IPLA 2OSXA 3BMWA 3L2MA 2XGBA 3A4WA 1JZ7A 1UQYA 3AMGA 1E5NA 1UH3A 4UNIA 2W5FA 4BQ3A 4D6GA 1Q4NX 1CLXA 3AYSA 1WB0A 1X6NA 3BAJA 1V0NA 2X09A 1WNOA 4TTGA 2CITA 3W26A 1CXFA 1JZ4A 4QP0A 3SCPA 1QNPA 4F8XA 2ZUTA 1HVXA 4P7RA 1MW0A 2ZWZA 1J0IA 2VCAA 5JIWA 3TTQA 1C3FA 3RPMA 1W1TA 3N15A 4WKAA 1CGWA 3SCNA 4UOJA 5CPSA 2BXYA 5BXSA 4EE9A 4W8BA 1MXDA 4XZWA 1BHGA 1RPKA 3OBAA 3UEQA 3WBEA 5I78A 4CN6A 1JNEA 1VEMA 3W27A 1DEDA 5E09A 3VX1A 3DYOA 2VUYA 1NM9A 2Z1SA 1ZB5A 3LPOA 3VD3A 4DM2A 4DWSA 3CBWA 2J25A 3ZO9A 4D6DA 4DWSD 1UWSA 1GHSA 2VR4A 3BSHA 2YL9A 2Y24A 2VJXA 1RD6A 3W4RA 3WD4A 3W38A 3WH8A 1KBKA 2WZEA 4ZENA 1JDAA 3CO4A 3ARWA 1VENA 2CERA 1RP9A 1LG1A 2WYSA 3M6DA 4D6FA 4PRWA 1UZ4A 4PMVA 2VOTA 1VBUA 3RM8A 1E1FA 3CGTA 4TUFA 4D6HA 1JZ2A 1HKJA 2DSWA 2WVSA 2YA0A 1GPFA 5A2AA 3F5LA 4GXPA 1QBAA 2J77A 1ESWA 5D9PA 1JZ5A 5EBAA 2WC7A 2E9MA 2JEQA 3W82A 3ARTA 1Q6DA 3A3HA 4HZ7A 1CZ1A 4DUVA 1OSEA 5A8MA 2E4TA 1EA9C 3FXYA 1W2PA 5EFFA 1QHPA 5BXTA 4E8CA 3GNOA 2V38A 4KRUA 4PMOA 4D1IA 3VGFA 2ZX5A 4FLOA 3VILA 2J4GA 4HPGA 4W84A 3I3BA 3WY1A 1WDPA 3RJXA 4LGXA 1WE5A 3WNPA 4DM1A 3W6LA 1AQHA 5A95A 5I3DA 3CMGA 1AMYA 2EPOA 2WAGA 3B9EA 2DPEA 1CLVA 5D8WA 2EJ1A 1BG4A 3HU7A 4D6EA 3TOPA 3WDRA 1HL9A 4H8UA 5BXRA 4MJ2A 3AS2A 4PMXA 5E70A 1GQKA 1W3JA 3B9DA 2UWFA 2WPGA 3M07A 2CCRA 3VMNA 5A6BA 1XH2A 4C7GA 3ZR6A 1GQLA 2OWCA 3WUEA 2DSKA 2W62A 1V6YA 3MANA 5A6BD 3MO4A 4J3UA 1QHZA 2UY4A 1US3A 3N12A 4RL3A 5FL0A 5GPRA 3B9AA 4PMUA 1B3YA 4J27A 4WSJA 3NDZA 4PYSA 3AROA 1X1NA 1TVPA 3AHZA 4WKFA 1CWYA 2GJXA 1Q6CA 4W87A 1KR1A 3BAXA 3AMLA 4C7DA 1KXHA 2XM2A 5HDRA 3UG4A 4KMQA 1JGIA 4ATWA 1UR0A 3WEZA 4MAVA 5CXPA 2O92A 2WCSA 3UR8A 1UWIA 2CYGA 1WP6A 2J7HA 1VEPA 5CSUA 5HNNA 2WZIA 1ITXA 2DT2A 1CYGA 3PZQA 2BHZA 1E6XM 4J3TA 4HTYA 4UFIA 1H1NA 1SMAA 1BPLB 1UR2A 1XHGA 3WMCA 2FHCA 1QNQA 4W7UA 1KR0A 3W29A 2DT0A 2FGLA 1C8QA 3L4UA 1XSIA 1GVIA 3WNKA 1V3IA 3FAWA 2Y8KA 5I2UA 3K46A 4UFMA 2XVNA 1TVNA 3OLDA 4PMRA 3SCOA 3VTRA 1ODUA 4AD3A 3N04A 1EQCA 3GM8A 4EANA 2QF8A 2VRQA 3T0DA 1E70M 3BCDA 1I1XA 3G6LA 2V3GA 1V02E 3ZIZA 2ZIDA 5D9NA 1CXKA 3L4XA 3OA5A 4H2CA 4UFJA 4P7LA 2NT1A 4JKMA 4TTUA 3RILA 1W3HA 4URIA 2VQTA 1QNRA 4CD4A 2PWEA 1ISZA 3GXFA 3A4AA 1NP2A 4BZYA 1H0IA 4U5KA 1V3HA 1QBBA 4U2ZA 3FAXA 3SCTA 2CBJA 4UQAA 3WUBA 1UYQA 2YDRA 1R85A 5A6JA 2VR5A 2XHYA 2VURA 4FLRA 4UOQA 4OKDA 3WF0A 4UCFA 2VZOA 1ZBVA 5FKYA 1KCKA 4BA0A 5EMYA 4Z2GA 1P6WA 5I5RA 4PMZA 5C8BB 3BLPX 4ZXLA 2A3AA 2WMIA 3TTYA 4HA4A 1V6XA 1FH8A 2NSXA 1HKKA 4ML4A 1BGAA 1CPUA 1J0YA 4MNJA 3MSGA 1S46A 3F5JA 1GOKA 4CD8A 3WF2A 2CBVA 2FH6A 2BVYA 1EO5A 5I6SA 3VM5A 2G41A 3CUHA 1UKTA 5LA1A 1GHRA 2D3NA 3VIMA 5AYBA 5D8ZA 1B31A 1JG9A 1BYCA 2FGZA 4AZ5A 5E9AA 1JAEA 1XD0A 1FH9A 3HMCA 4GZIA 2DT1A 1VBRA 2IUZA 3NYDA 3PZNA 4MNKA 4MAZA 1E15A 1J11A 3MS8A 2CESA 3N18A 1M7XA 1E1EA 3A4XA 1E6NA 3NSNA 3AIWA 1V6VA 5A6KA 1O7AA 1QVBA 1OB0A 2J7CA 1UR1A 3WENA 2YLAA 2EPKX 4LQ1A 1BSIA 1CGYA 1XSJA 2PBGA 4V2XA 4AD4A 4PN2A 3OGSA 5A2CA 4M81A 1E6RA 1W3LA 1I75A 2A3HA 5A3HA 2VO5A 3S6TA 2W92A 2ZOXA 4W88A 1EHAA 3LMYA 4PCTA 1AQMA 4KGLA 4F9DA 4W5ZA 1QOXA 1OGSA 1UHVA 1EHNA 4D6CA 3WFLA 3BLKA 1E71M 4YN5A 4AEFA 1C90A 4UFLA 1TA3A 4QFUA 3FHQA 2YL5A 3EDDA 3IANA 3GXDA 4JHOA 2JE8A 2BVDA 2PB1A 4MB4A 2DIEA 2QMKA 4UQCA 3RJYA 4M8UA 1J01A 1LL7A 3GH7A 3WH9A 4YPJA 3GXIA 1V3MA 1WKYA 4M1RA 3T2PA 3VMOA 3VGBA 2VX4A 1J9YA 1LWJA 4AWEA 3OIHA 5D9MA 5KEZA 1TZ7A 2WSKA 2CBIA 4FF5A 1G1YA 1DWIM 1KQYA 4D6IA 3NJ3A 1HKIA 3VNZA 3T2OA 4L4PA 1GJWA 4P8VA 1BVZA 1XSKA 1JF6A 3CH9A 2IXUA 3VGDA 1Y7VA 4B9YA 4LYRA 2EBNA 2XVKA 2XM1A 1CBGA 4OIFA 1UD5A 5CGMA 3CZJA 1BYBA 3OGRA 4AD1A 1W1VA 4QCFA 2EPMX 1UWUA 2WC4A 4JKLA 4QDMA 1NOFA 3VDCA 3CHFA 3CHEA 3MU7A 4AIUA 1XCWA 3CPUA 3WFZA 2OWXA 4XB3A 2WMHA 2PWGA 1W2VA 4GO9A 3VO0A 2WVTA 4BQ4A 2XG9A 3PBGA 1CGXA 1TUXA 2WHJA 4GPNA 5I24A 4UZUA 5ABFB 1PEZA 1PIFA 1E6ZA 3AXXA 4EKJA 4J3SA 4WJXA 2D0HA 1HP5A 3ZT6A 4AIEA 4CVUA 5CJ5A 1XYZA 2YA2A 1PX8A 3SCUA 1IZKA 2A3CA 2XFRA 1WZLA 4XUYA 3L2LA 4A4AA 4JFTA 4U2YA 1ZJBA 3AHVA 2E0PA 4AZCB 4F66A 3IJ9A 3WQWA 5DO8A 1XGZA 5JBDA 2E8YA 3QHNA 4K68A 3O6AA 3PTMA 3UG5A 1UR8A 2WVVA 4F9JA 3RIKA 2ZXDA 4Z2HA 4PMYA 3LPFA 1UA3A 2NW0A 1U2YA 3KE0A 1LJYA 3W37A 3AIVA 2EPLX 5BWFA 4Z2IA 2YBUA 3DC0A 4PTVA 3EDFA 1JFHA 4M24A 3E1F1 4J3WA 1OINA 2YJQA 3THCA 3IAQA 1UD6A 5BXPA 4WF7A 2Y8VA 1ITCA 1UKQA 1NWSA 1E3ZA 1CXEA 1UZ1A 2ZUSA 2E40A 1OGGA 4HOWA 3AFBA 4V28A 3FNDA 3CUGA 2WHLA 4CKQA 1DWAM 2GK1A 2GJPA 1HJVA 3ZM8A 3A47A 4D72A 4BQ5A 1TFVA 3UETA 2YBTA 1UWQA 3AIBA 5M03A 4PCSA 3D3AA 1MQPA 4JHZA 4ZE4A 1V08A 5IXEA 2UY3A 1VJSA 2XVLA 2VZUA 4JKKA 3BAWA 3DHPA 3AZRA 1BF2A 4CVWA 3VDHA 4Z2JA 2XJ7A 2GFTA 2FH8A 5A8OA 3AMDA 1G0CA 3WNOA 3CHDA 1GOQA 4JIEA 5AC5A 3BGAA 2ZX8A 3KL3A 1HF6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2X0Y A;  4LPC A;  5AY7 A;  5A94 A;  1TR1 A;  3GH4 A;  2CBU A;  5CZK A;  4CCD A;  4FLQ A;  3WMB A;  3AZS A;  4JCM A;  1B3Z A;  1U30 A;  3DHU A;  3L4Z A;  3VDA A;  1VAH A;  5ABF A;  1ECE A;  2VT0 A;  3OZO A;  2XWE A;  2NT0 A;  1CGT A;  5JIP A;  3U7B A;  2AOS A;  3AIC A;  1FP9 A;  1E40 A;  1UQZ A;  2D22 A;  1X6L A;  1ZBK A;  5FIP A;  1J0Z A;  1OD8 A;  2GJX B;  2XIB A;  4P7Q A;  2WMF A;  1JD9 A;  3SIM A;  5DT7 A;  3VD7 A;  1AVA A;  1DWJ M;  3WQ4 A;  3CZG A;  4S3J A;  4H8V A;  5E0F A;  1WO2 A;  3K8M A;  3VX0 A;  2VCC A;  3TTO A;  1NWT A;  1BYA A;  1G9H A;  1PX3 A;  3ZST A;  4JCL A;  1KWK A;  3GYC A;  2D20 A;  1PBG A;  1JIB A;  1ZL1 A;  1DP0 A;  2J7F A;  3L4W A;  3QOM A;  4AZC A;  3MMD A;  4WK9 A;  3VMP A;  3MUA A;  4PUD A;  4W86 A;  2QPU A;  3KEH A;  1BLI A;  4IIS A;  3PZM A;  2Y5E A;  3F5K A;  4ATL A;  4PTM A;  1QNO A;  3WH6 A;  4OZO A;  4UFH A;  2DEP A;  2WNW A;  2WKG A;  1E9L A;  3EMC A;  1I1W A;  2DQX A;  1R87 A;  4GI6 A;  2CHN A;  4TVU A;  4LYP A;  1V6W A;  1DWH M;  3AHX A;  1KBB A;  1XV8 A;  1HN1 A;  4WKH A;  4H41 A;  2OYK A;  5LYR A;  5HBF A;  3VKK A;  3ALF A;  3VNY A;  5CSY A;  2AMG A;  3FHA A;  3VGE A;  3N11 A;  1F4H A;  2BV9 A;  2GDV A;  5FD0 A;  3L4T A;  4JL2 A;  1RH9 A;  3VDB A;  4KH2 A;  3VPL A;  2W91 A;  4ATD A;  3GBD A;  3VIF A;  2PWH A;  4N42 A;  2W61 A;  6TAA A;  2RGM A;  2Q8X A;  4IPN B;  3WUF A;  2QMJ A;  1KB3 A;  1V3L A;  4GIA A;  1WDS A;  5M3W A;  3SUV A;  2D0G A;  4A3H A;  3TA9 A;  1NOU A;  3AQU A;  4Q22 A;  5GQB A;  2WLY A;  1VRX A;  2XWD A;  3ZMR A;  2VRK A;  2O9P A;  1SFS A;  1EIB A;  1V0M A;  2VX6 A;  1EO7 A;  2WCG A;  1UKP A;  1IV8 A;  1MFU A;  5A6S A;  1J0K A;  3ZR5 A;  4TVD A;  1NQ6 A;  4RE4 A;  3WDQ A;  1XH1 A;  2OLH A;  4AZG A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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