1H0GA

Complex of a chitinase with the natural product cyclopentapeptide argadin from clonostachys
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title High Resolution Inhibited Complexes of a Chitinase with Natural Product Cyclopentapeptides - Peptide Mimicry of a Carbohydrate Substrate
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 170
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1h0gA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1h0gA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h0gA01
3WQ8A 1B3ZA 2WCAA 1BGGA 1LF1A 4AIEA 3AIQA 3U7VA 1EOKA 1HF6A 3VILA 1E15A 4AZIA 1ESWA 1DHKA 4P8UA 3RJYA 3APGA 4E2OA 3ARUA 1JZ8A 4MB3A 2WSPA 4D6CA 2IUZA 2VRJA 1WKYA 7A3HA 1FOBA 1O6IA 1K9EA 1JD7A 3WMSA 3OZPA 4B16A 1CECA 3AIBA 1QBBA 3N13A 1D7FA 4XUYA 1H49A 4EAMA 5I79A 1VEPA 2XSBA 2DQXA 1CXIA 5HXMA 1NQ6A 4C7DA 3VDHA 3SCSA 3ZT6A 1H2JA 1B2YA 3PTQA 2QHAA 4D6GA 1UKQA 3BAWA 1NWSA 1E0XA 1JNEA 1V6WA 2VR4A 4W7VA 3T0BA 5I23A 3CPUA 3VGEA 4WKFA 2WVTA 1WZKA 3ARYA 3AMLA 2VZTA 1XSJA 4IISA 1AQMA 2YIHA 3S6TA 3T2PA 3VD9A 3FY1A 2XWDA 2DSWA 4LYPA 4CD5A 4PYSA 4UQEA 1DP0A 3WEOA 2W4XA 2V3FA 3CZJA 1BGAA 1KWKA 1E1EA 1W1VA 3WBAA 5IXEA 3AMKA 4ZE5A 3T09A 4JAWA 2VX4A 4PMDA 2XJ7A 3DYOA 4YN5A 4CCCA 1KXVA 1JZ4A 1OGSA 3WIJA 1MQPA 3ECQA 3PZMA 1KCKA 1WZAA 5CZKA 2WHJA 2G3JA 4PSPA 2CERA 1KR0A 1J0JA 1W9PA 2ZUSA 1MW2A 4UFJA 3W25A 2X0HA 1XRVA 4B15A 3WSUA 4E8DA 5A95A 1LWHA 3DECA 4LXFA 3W81A 3WBEA 2A3HA 3DC0A 3AQUA 1EIBA 1JI2A 4AZ7A 3WMCA 1K6AA 1KFWA 2FHFA 1GOOA 3W26A 2WW5A 1HKIA 1HJSA 3TTQA 3FN9A 4CD4A 2JF6A 6A3HA 2WZEA 3AIWA 3HU7A 1VJSA 2WSKA 1W32A 2WYSA 3UR8A 4MDPA 1UKOA 4D6HA 1JYXA 3ZJ6A 4B3KA 2VRQA 2J62A 2RGLA 2WXDM 2O9TA 3AYSA 4NRSA 1H11A 4GO8A 4E4PA 4M8UA 3SCWA 3PZOA 4H8VA 4W5UA 4UOQA 3WL0A 5I5RA 5GNZA 4NI3A 4QLLA 3RM4A 4W89A 3EDJA 5GQBA 1LL4A 1MFUA 2ZX9A 2ZUTA 4GQQA 1JL8A 3MUIA 2A3CA 3N17A 4ZEPA 3NIYA 3WEZA 1JZ7A 1OGGA 3K1DA 3BMVA 1UYQA 4BQ3A 1WB0A 1IZKA 3WDJA 2FDMA 1EH9A 3VUPA 1J0KA 1VBUA 1JF5A 1R87A 3MUZ1 4MB1A 2DSZA 2VX6A 4LGXA 1J9YA 2VI0A 4WSJA 1W9BM 1RP9A 1W91A 1BF2A 3WF3A 2QV4A 6CGTA 1E43A 5CQ1A 3F5LA 3WNOA 2C7FA 3VDBA 3RPMA 1CGYA 1QNQA 1M7XA 1J0HA 1TA3A 3WD1A 5HDRA 2W61A 1UWSA 1CBGA 3T08A 4J7RA 3A4AA 4JIEA 3BH4A 1GJWA 4PSRA 5I3DA 2CCRA 2PWEA 3T0DA 1NARA 3RILA 2PWHA 1W1YA 5BXRA 1UQYA 2XPKA 1HXJA 4P8VA 2V3DA 4D6EA 1QNSA 2W62A 5ABGA 1B31A 1V02E 2G41A 4BCEA 1BG4A 4OOUA 3W24A 5HPOA 1H1NA 3WD0A 3N9KA 1ZS2A 4AZ5A 1JZ3A 3MMUA 3SUTA 4YHEA 3WMBA 2BFGA 3AXHA 4AD5A 4CVWA 1X1NA 5IHSA 2J25A 2XGBA 1H4PA 4TTGA 1SFSA 1V3HA 1GOMA 1UD2A 4KGJA 2YA2A 4XB3A 1A47A 1XCXA 3AS1A 2ZX6A 3FHAA 1ZL1A 4V28A 4C7FA 1B0IA 4TVCA 1LG2A 1AQHA 3PBGA 3AISA 3OLEA 3WF2A 3SUUA 1UR0A 4Z2LA 4NSBA 5C8BB 5LA2A 5JIPA 3AICA 1RD6A 4M29A 2V3GA 2A3EA 2F2HA 5HNNA 1ODUA 2OYLA 1JFXA 4GXPA 4CD6A 4M24A 3HMCA 1U33A 4HTYA 3NDYA 3UEQA 1Q6FA 1PPIA 3CHDA 2Y8VA 1NH6A 1DWGM 2E8YA 4NZCA 1UD5A 1EXPA 4IPNB 2WKGA 2V5DA 5DT7A 1GJUA 1G0CA 3ZR6A 1QNRA 2JFEX 2E40A 4HZ7A 4W8AA 3WUEA 2DT2A 1LL7A 2IXVA 5D9MA 2VURA 3ARXA 4HOZA 2XHYA 5A8MA 1CENA 4PMYA 1FFRA 3VU2A 5BRQA 1BSIA 2W67A 3UG4A 1QI3A 3G6MA 3A6OA 3UG5A 1ISZA 1PJ9A 1E4LA 4UOJA 2OWXA 2W91A 1W3JA 3PZUA 4QAWA 2Y2WA 4XZBA 2EQDA 2HISA 3N11A 4X0NA 3CTTA 1NWUA 2E4TA 3L4XA 1CLVA 2O92A 3I3EA 3WH8A 4JFTA 4EK7A 3UERA 3W6MA 2EO7A 2XG9A 3QOKA 2DH2A 4MDOA 1NOWA 3AHZA 3GM8A 1CIUA 4HOWA 4BQ5A 2G4FA 2ZUWA 5LA1A 4J27A 1JXJA 3BAXA 2DGAA 2WC3A 4URIA 1VB9A 3L4WA 2FGLA 1D2KA 5E0FA 2VJXA 3U57A 8A3HA 2X0YA 1K9TA 4J3WA 2DSKA 1GVIA 1PIFA 3AZSA 4MB5A 1UA3A 4HPGA 4CD7A 1HL8A 1ZU8A 4GKLA 2D22A 1V3MA 4GI6A 1CZ1A 2VVSA 2ESCA 4CN6A 3WH9A 1C3FA 1E6XM 4PUDA 5CSYA 3L4TA 4WF7A 1TG7A 1MXGA 1BVNP 1TUXA 2J79A 2RGMA 2WVUA 2CHNA 4B9ZA 3WL1A 1E0WA 1OB0A 2V3EA 1CXEA 2X09A 4GI9A 1QHOA 1VBRA 4BA0A 1A3HA 2PB1A 2VUYA 3ZQ9A 3NCOA 3CO4A 1JXKA 1FH7A 2J7EA 2OSXA 2ZOXA 3K4DA 1XH1A 5A2BA 3QHMA 3I3BA 1AMYA 2D3NA 3MUY1 1V3LA 3NJ3A 4LQ1A 3TTSA 1M01A 3WEMA 3VGBA 1I1XA 1XSIA 2MANA 3AFBA 3CUIA 1NWTA 1TMQA 5E09A 3VM7A 1BFNA 1E3ZA 3AXXA 3KL5A 2XM1A 4BQ4A 4MNJA 1L8NA 3A47A 1QI5A 3VD3A 1GOQA 1K9DA 3GXDA 5GNYA 4W93A 4AZ6A 3ZJ8A 1E4MM 5A8OA 1R8LA 4GIAA 5CPTA 9CGTA 4W86A 3CMGA 1VEOA 1WDPA 1E56A 4KMQA 1QI0A 2J7DA 1VENA 4BQ2A 3U7BA 2QLYA 3SCVA 1PAMA 4UQDA 2D2OA 3WENA 1W2PA 1CGWA 3WNMA 5M5DA 2GDVA 5I77A 1GQIA 1KBKA 4JCMA 5I0DA 2GJPA 3WD3A 1WPCA 5DEZA 1UZ4A 3PZTA 1TA3B 1WE5A 1GHRA 2O9PA 1FFQA 4MNKA 3AMGA 4ZXOA 3ARQA 5M03A 4F9DA 1ITXA 4F8XA 1V6UA 3VIOA 1CXFA 1J0YA 2CIPA 1KGUA 4M81A 3WH5A 3WKZA 4L4OA 1EGZA 4MNMA 3BCDA 3ALFA 1OIFA 1JDDA 4ATDA 1E6NA 2E8ZA 3EMZA 3RCNA 4QFUA 4JCLA 2WAGA 2WMKA 2XGIA 4AEEA 4W87A 1ODZA 1QNPA 1KXTA 2C8NA 1UZ1A 1UD4A 4FMVA 1WZMA 2O9OA 3TA9A 1M03A 1JI1A 2PC8A 1E4NA 1Y7VA 5EBAA 2TAAA 5FL1A 1OD8A 1UG6A 3WD2A 5A6JA 3MV01 1VFOA 1U30A 2XFFA 4FLSA 1PIGA 1JIBA 4DM1A 2CEQA 1OD0A 4GINA 4P7OA 2X1IA 4AZBA 1KGXA 2D49A 1U2YA 1FH8A 1GONA 2D23A 1OSEA 3QOMA 3QHOA 2F8QA 5A8QA 1EHNA 4UQ9A 4PTXA 2VTFA 1WDRA 2D0HA 1QHZA 5A2CA 1KR1A 2DIJA 1TVNA 3VIIA 3JUGA 2ZUMA 4V27A 4D71A 4Z2IA 2ZWZA 4U31A 3WDHA 2J4GA 2NT1A 1TFVA 2OYMA 2ZXQA 3CMJA 4P7NA 4DUWA 2J7CA 3AS2A 2J7GA 1WP6A 3AZRA 4MAZA 4PMVA 3BMWA 3GTNA 1HN1A 4HP5A 1UWUA 2GJRA 3CZGA 3VX1A 1UWIA 2VZOA 3DYPA 3PN8A 4U33A 3AI0A 3AS0A 4J3TA 3CUGA 2VX5A 3WQ6A 1V0LA 2VNCA 4W7UA 4AZCA 4JHOA 4HA4A 4JHZA 1ITCA 2QPUA 1NP0A 1BG9A 2D24A 4W84A 1W9VA 2JALA 1KBBA 1UWQA 3GBEA 3MUAA 2VQUA 3HJEA 3VX0A 3OLDA 3PHAA 2W5FA 1EQPA 5EMYA 4YPJA 1SYTA 5E9AA 2BY0A 3TP4A 1XV8A 5HBFA 4UFMA 2XSAA 1DTUA 2BXZA 2X2YA 3O6AA 1PX3A 2ZXDA 5BROA 1QNOA 1MXDA 1W9XA 1HJQA 2UY4A 2VRKA 4B3LA 1J12A 3VINA 3GH5A 2X8RA 5BXPA 1E5JA 1JNDA 1B3VA 1E71M 3EDDA 3PZQA 2WBKA 2XM2A 5JBFA 2Z1KA 1B30A 4E8CA 1SMAA 4CU8A 4AD3A 1BQCA 3L2MA 3NSXA 5A3HA 1EDTA 1OT2A 4KRTA 1J01A 3WUFA 5M3WA 1XH2A 1E6QM 2PWDA 1EQCA 3OG2A 1NWRA 3KL0A 2VZSA 4LYQA 1P6WA 2W92A 4DWSC 1R85A 3E1F1 1KXQA 3RM9A 1B3YA 4JL1A 3DHUA 4HU8A 1W9DM 4N0RA 3OLGA 4HA3A 5AYBA 3N12A 4D6DA 4KWUA 3ARWA 5D8WA 1W9UA 1V3JA 1HVQA 4U5IA 1E6ZA 1F4HA 1UR4A 2XVPA 1C92A 3VD4A 5EFFA 2GDUA 4OJYA 2WZIA 3W82A 3F5KA 1PZ3A 3BXWA 4Z2GA 4PMUA 1XC6A 1RH9A 1I75A 2WHKA 2VX7A 4JL2A 3ARZA 1O7AA 4AD2A 1CYGA 3KEHA 2NSXA 4A3HA 1JG9A 3ARTA 2OWCA 4EKJA 2BY3A 4ATLA 1WNOA 1KXHA 4AD0A 5HPCA 4CVUA 5DF0A 3GXFA 1JGIA 1BLIA 4GPNA 2JF7A 2DSVA 5CPQA 4Z2HA 3IJ7A 2DEPA 4FF5A 3VNZA 3II1A 1UR2A 1XGZA 3UETA 1EO5A 2YLLA 1E4IA 3KL3A 4H04A 5FCZA 1V0NA 3VPLA 1GOIA 1J0IA 3VM5A 2XVNA 2YOCA 2NT0A 2V5CA 5AC4A 4JFWA 5A6LA 1C8YA 4P7QA 1V3IA 3ZSTA 4H8HA 4UQAA 3VIHA 3ARSA 2IXUA 1OT1A 3B8SA 4UFKA 4JKMA 2E0PA 3IANA 3QR3A 4F9JA 1TR1A 4XV0A 4EE9A 4D6JA 2A3AA 4MPKA 3SUWA 1CXLA 1OINA 3HN3A 2Y4SA 1NOUA 1EOMA 4D6FA 3POHA 3A4WA 1HKJA 2GFTA 3L2LA 1BTCA 2EEXA 1B1YA 1BYDA 2YDSA 2NW0A 1CGXA 4UCFA 3ZT5A 3B9EA 5I78A 2ZUVA 3MMDA 3K8MA 1UH3A 3SCRA 5KEZA 5CJ5A 3N1AA 2OYKA 5A6SA 3VIMA 3CGTA 1H5VA 2B31A 1E6RA 3CIVA 1SMDA 4YHGA 1GNXA 4GZEA 4H8UA 3VIKA 5BXSA 4DUXA 3MU7A 1HJWA 3IJ8A 1W3HA 3WDIA 5CXPA 4JKLA 1ISYA 1UKSA 1J10A 2XIBA 3GH4A 1W3KA 1J0ZA 4BZYA 1KCLA 3GH7A 4JFUA 5JBEA 4MJ4A 4C7GA 1C93A 3SCUA 4AC1X 3SCTA 4PTMA 2BHUA 4RL3A 1RPKA 1J11A 4D1IA 4X9YA 5IFPA 3CLWA 4W8LA 3L4ZA 3AJ7A 4OOZA 2VCCA 3AOFA 4PCSA 1E73M 2CBVA 1ED7A 4N42A 1JZ5A 1QW9A 2WVVA 4Y7EA 5A2AA 5BYWA 4ZENA 1UKPA 1V3KA 5GNXA 5ABFB 2WBGA 4WJXA 4AEFA 1WZLA 3BAYA 2OWWA 1E6PA 1QOXA 3MSDA 2CKRA 5E0CA 5E6YA 5ECUA 2CESA 3UESA 4CGTA 3IAPA 1B90A 2EXOA 3N18A 2ZIDA 4A3YA 2XUCA 1HVXA 2FGZA 3CHCA 1C91A 3AHXA 2WC4A 3AIEA 4J28A 2G3NA 4PMNA 3M7SA 1RP8A 4AZHA 4AZCB 5A69A 3WQ4A 5I24A 4H2CA 1CEOA 4J3XA 3F5JA 5IDIA 3ZSSA 2WMFA 3VTRA 2Y24A 5LA0A 1HIZA 4UR9A 5GPRA 3PZGA 1QW8A 2WMHA 1XSKA 1G5AA 3FHQA 1CXKA 1E5NA 4UFHA 1C8XA 4B9YA 4HPHA 4ACYA 4IPLA 3SCNA 4WKHA 3S2CA 1UUQA 2WCGA 4Q7NA 3WH7A 4TX8A 5CLTA 3K46A 3MS8A 5EFDA 2C0HA 3CHEA 2YL6A 4J3UA 3UCQA 3EMCA 1CTNA 1DWHM 4ZFMA 1Q4NX 1K9FA 1E0VA 1XH0A 2CITA 4QCEA 3DYMA 5M17A 1GOWA 1YQ2A 3GYCA 4U2ZA 2GK1A 3VGHA 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 2CPU A;  4GZI A;  3ZM8 A;  4EAN A;  1CWY A;  3RDK A;  1UD6 A;  4L4P A;  3IAQ A;  4PMO A;  3GBD A;  1GQK A;  1HX0 A;  5D4Y A;  1WDQ A;  2YKK A;  1UH4 A;  4J3V A;  3VD5 A;  3VIP A;  1SR0 A;  2ZX8 A;  2BXY A;  3BGA A;  4AWE A;  5FIP A;  2CET A;  2DSU A;  1UHV A;  1CDG A;  4S3J A;  1G9H A;  2BVY A;  3ZT7 A;  4ATW A;  2FHB A;  2XFR A;  3AHY A;  5A6B D;  1R86 A;  4KGL A;  2WK2 A;  3G6L A;  1WAW A;  3VVG A;  2ZXA A;  2ZXB A;  1PBG A;  5FD0 A;  1IV8 A;  1UR1 A;  1R7A A;  3W6L A;  7CGT A;  2QF8 A;  3W29 A;  7TAA A;  1GZJ A;  4Z2J A;  4UZS A;  2UY5 A;  1XCW A;  1JZ2 A;  1JAE A;  3RJX A;  2WNW A;  4AY1 A;  2G3M A;  4X0V A;  2VC9 A;  4HZ8 A;  4GI8 A;  1Z32 X;  1QI4 A;  2GJX B;  3WDQ A;  5JIW A;  2CYG A;  3PZV A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3BQ5 A;  1POJ A;  4JTA A;  3GR4 A;  2PE4 A;  3OEX A;  4JIR A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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