1H0GA

Complex of a chitinase with the natural product cyclopentapeptide argadin from clonostachys
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
publication title High Resolution Inhibited Complexes of a Chitinase with Natural Product Cyclopentapeptides - Peptide Mimicry of a Carbohydrate Substrate
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
total genus 170
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1h0gA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1h0gA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h0gA01
3VILA 1MXDA 5HXMA 1GVIA 4D6JA 2Q8XA 1XCWA 1QNOA 4UCFA 1D2KA 3OZOA 3OGRA 2WZIA 4AZ5A 4YHEA 1MWOA 1E4NA 3WD0A 3AIUA 5HPCA 5DEZA 1CPUA 2VVNA 3LPOA 1GOKA 2G3IA 3N12A 2XYLA 1HP4A 3VGBA 3W0KA 1GOIA 4YPJA 3ARVA 1LJYA 1J9YA 4JIEA 4WIWA 3ARZA 5A6SA 5A6BA 1KQYA 2OWXA 4AZBA 3WF0A 2A3EA 3WH9A 4RL3A 9CGTA 2DH3A 1WDPA 2CYGA 3SUWA 3NDYA 1E70M 2VRQA 1UA3A 3BAYA 1IZKA 1GHRA 4LPCA 2J7CA 3J7HA 1ISVA 4AZ7A 3WF2A 2JIWA 1EO5A 1WPCA 2ZICA 5KEZA 3W4RA 3VIOA 4F66A 2WMIB 4X0NA 4PUDA 3SEPA 3ZT5A 2CBJA 4BS0A 1M53A 2VTFA 1GW1A 4JFUA 5A8PA 3PZNA 2VURA 1GQIA 2D0FA 4P8WA 1UKQA 4ATWA 3DYMA 3AZSA 3VKKA 1K9EA 4PSPA 2ZWYA 4AZ6A 4QAWA 3KL5A 3NSNA 4U33A 1HXJA 4J3UA 4QFUA 1WZAA 2TAAA 2DSWA 3M46A 4CU6A 4AXNA 1WDQA 5GQBA 1HJWA 1XYFA 3SCNA 1EQPA 1E4LA 4AMCA 1FHLA 4TTGA 1AQ0A 2EQDA 3KL0A 2ZUUA 3A6OA 2O92A 4D6CA 3AS3A 3CZLA 2FHFA 3WQ4A 1ISZA 2ZUTA 5I6SA 2W91A 1FH7A 1GONA 2ZUWA 3WUGA 4L4PA 3SCRA 5LYRA 1KBBA 1ECEA 3CZGA 1B3VA 1NP0A 5E6ZA 1MVYA 2ZX9A 3VD4A 4M82A 5BROA 3VD9A 4P8XA 4CCDA 5CSYA 1UR4A 4V28A 4XZWA 5HBFA 1FA2A 1FP8A 2XWEA 3WEZA 3PBGA 2PB1A 3AXXA 4DWSC 1E72M 3VDAA 1FFQA 4AZHA 2X1IA 3WNMA 3BCFA 4ATDA 3VNYA 2V5CA 1QNPA 3GDBA 2PF0A 3A4XA 8CGTA 3VVGA 3BAWA 6CGTA 5I24A 1LG1A 1UWIA 3L4YA 4BQ3A 3RPMA 4UQDA 5JH8A 2XSAA 3IAPA 2WVVB 3SCWA 1ODUA 1UUQA 4OBSA 3WQ6A 3W6LA 1QHZA 1E9LA 5EB8A 2QV4A 3AYRA 4X0VA 2XHYA 1J18A 1XV8A 5ABFA 2XM1A 4AD1A 2DT1A 3T08A 3FHAA 3UEQA 1TVNA 3AMGA 1AQMA 2CERA 5JBFA 1OGGA 4DWSA 1N82A 1UD4A 4LYRA 4XUYA 2OWWA 3ZJ6A 1SMDA 2CHOA 3QHOA 3POHA 2E8ZA 2OYLA 4H41A 1QHOA 1VJSA 5IXEA 3VD3A 3RDKA 1ZJBA 2VZSA 3N17A 1IV8A 7TAAA 3GYCA 1CBGA 2WYSA 3N9KA 4M8UA 1QW9A 3CUIA 3AJ7A 2O9TA 3VGFA 3ZT6A 1UR8A 2ZOXA 1HKJA 1BTCA 5M3WA 1FHDA 2J77A 1WB0A 2BVYA 3AMLA 3ARPA 1I1XA 4URIA 2WVTA 3VO0A 3MSGA 5LA1A 4WKHA 1IT0A 3PZTA 1NQ6A 3GM8A 3TTYA 2DT0A 4CUCA 3GH7A 1BVZA 3MU7A 3APGA 3RM4A 2JF6A 1EA9C 3K8KA 3WL0A 2WW5A 2C0HA 1J12A 4M81A 4GI9A 3HU7A 1DHKA 3VUPA 2YL5A 5DFAA 3W26A 1A3HA 4DM2A 1W9VA 4JKMA 4NRRA 5DO8A 1G9HA 1CZ1A 4BCEA 2G3NA 1GPFA 3WH7A 4JHZA 4AZGA 1E40A 4HA4A 5A8QA 1MYRA 4FLSA 1BYDA 2AAAA 4U5IA 4UFIA 4CGTA 2J74A 1IZJA 1C92A 2WC3A 1VBUA 3WH8A 1V0NA 3MV01 4KWUA 4CKQA 3I3BA 3MMDA 2NT1A 1W1VA 2GVYA 4CU7A 3DHPA 1E3XA 5A8OA 5A8MA 3LPFA 3TONA 4AEFA 1HT6A 1PJ9A 4DM1A 3K4AA 4UQAA 3SCSA 2VCAA 5A6AA 7CGTA 1JD7A 1PX4A 1CGUA 4ACZB 2JEPA 4GZEA 4AD3A 5GPRA 1EDQA 2VJXA 2DDXA 1ITXA 1BYCA 7A3HA 1CXFA 1H41A 2CEQA 2EJ1A 5HOSA 2D2OA 1VEPA 4D6EA 1G01A 4FLQA 2W66A 1L0PA 1OD0A 1PX8A 3IAQA 4MADA 1ZBCA 1F4AA 3MUY1 3DHUA 2WCGA 2BY2A 3A3HA 1JGIA 4DUWA 2X8RA 4PMXA 2GJXB 1LQ0A 3U7BA 4PMZA 2DSKA 1NWSA 1B1YA 4PN2A 2UY5A 3VX1A 1CLXA 1JZ5A 5BWFA 1MQPA 3BSHA 2J47A 1HJQA 2WXDM 2YIHA 1V3IA 3RCNA 2XIBA 4JCMA 3AHZA 3MSDA 1GVYA 4JZ5A 1WZMA 2J62A 4UOJA 3MUAA 2VO5A 1EDGA 3LMYA 2X0YA 2X09A 4WJXA 2D49A 2EEXA 2PWHA 3PTQA 1C90A 3WBEA 3VGDA 1E43A 2RGMA 1EHAA 2DGAA 1J0JA 5HNNA 3T2OA 1UR0A 3FAWA 2YBTA 1WDRA 1UZ4A 4LXFA 1B3WA 2J8GA 2WC4A 1J0HA 3NSXA 4FMVA 2QHAA 5E0FA 1UR9A 3MKKA 1TFVA 2WMJA 3CUHA 3WD1A 1RD6A 4XZBA 1ISWA 4LX4A 3AMDA 3KL3A 2V3FA 3TA9A 1OB0A 4XB3A 3EBVA 4FLOA 1V0KA 3UG4A 2WC7A 4FLRA 1KGXA 1BYAA 2ZUMA 3ZSTA 1LL7A 3RM9A 3W53A 4TVUA 1UD6A 3CGTA 2PWGA 4FF5A 3CUFA 2CXGA 1JF5A 1JNDA 1VAHA 2E4TA 3AXIA 1WZKA 5CLTA 1ZJAA 4D1JA 1D3CA 1V0LA 5FCZA 5DT5A 1UWQA 1QPKA 4HZ8A 1EIBA 3GNRA 4U2ZA 5CLWA 1NARA 2XSBA 2DT2A 3CZKA 3OZPA 4RE2A 3WMSA 3GH4A 5C71A 2WKLA 4PMOA 1HJVA 1UR1A 3AS1A 1ZBKA 4MB4A 3AIRA 5A6KA 1PX3A 2X0HA 2QMKA 1E73M 3BGAA 2XG9A 2VX7A 3WNLA 2YDSA 4UZSA 3VX0A 3HJEA 4KH2A 3ZQ9A 1D7FA 3WFLA 3VMOA 1LLOA 1KR1A 4JCLA 1UWUA 1H3GA 2YA2A 2YA0A 3OLGA 2FH6A 1KXQA 3CO4A 1PAMA 4FK9A 3VPLA 2D24A 5CSUA 2RTSA 5E0CA 1JIBA 5CG0A 3CZEA 3BMVA 1R7AA 3EMQA 2JF7A 1TUXA 2PWEA 3FW6A 2CBVA 1DWAM 2Y2WA 3QR3A 1V3JA 4MB1A 3DYPA 1MW2A 3CPUA 4M80A 1JYXA 4IPNB 4AIEA 4RE4A 1KBKA 2UWFA 1TZ7A 3L4WA 1QBBA 4AISA 2O9PA 4AW7A 4B15A 1W1PA 4AIUA 4Z2LA 2VCCA 1V3KA 4Y7EA 3VIIA 3AFBA 2YOCA 4JHOA 2A3AA 1UD2A 4HA3A 1KR0A 3PTKA 3WD2A 3RILA 1UA7A 4IPLA 3GNPA 2W5FA 2EXOA 2CESA 4UFLA 3T0DA 1HIZA 3L2MA 2WKGA 2PWDA 3BSGA 4WK9A 2Z1KA 1PBGA 3WENA 1NWUA 1K9DA 1XGZA 2W61A 1E56A 4HA1A 1LG2A 3S2CA 1VIWA 4QLKA 3VIFA 2VZOA 4N42A 4TTUA 4NI3A 3A4AA 4QLJA 3W38A 1M7XA 3N18A 3U57A 5FKYA 4GKLA 3WL1A 4H2CA 3FHQA 1G0CA 2VQTA 4P7OA 4PMNA 3QHNA 1HKMA 1Q6CA 5I78A 5CGMA 3BAIA 1MFUA 2NT0A 2G3JA 1WAWA 2WNWA 2FHCA 3ARUA 2FGLA 4HMEA 1HJSA 2IUZA 1UWTA 5A3HA 5FOOA 2ZX5A 3D3AA 3DYOA 1PZ2A 3WDRA 3AS2A 3TTQA 3OGSA 4M1RA 1R85A 1C8XA 1VFUA 4EAMA 3VIJA 2X05A 1FP9A 5A69A 3SCPA 1E0XA 4HTYA 3EDFA 1OT2A 3VNZA 1OWQA 1UH3A 4S3KA 2BY3A 1Q6EA 5M03A 4AEEA 1DWIM 1CXEA 2D1ZA 3SCQA 2JE8A 4YHGA 1HF6A 2E40A 4J3TA 3T0BA 2CCRA 1V6UA 1V6XA 4W7VA 4PTXA 1RH9A 3CLWA 4X9YA 5AYBA 1QI5A 2ZX7A 3PZOA 4NZCA 2VL4A 3WQWA 2XGIA 1W9PA 3LPPA 2VX6A 4P8UA 1H49A 3KWXA 1EQCA 3MMWA 4AY1A 5JIPA 4HMCA 1AIWA 4CD6A 5A94A 1BG4A 5D9OA 1QI2A 1TG7A 4CCEA 2J7EA 1PPIA 2PBGA 2QMJA 1KGWA 4LQ1A 4HOWA 1C93A 1HL8A 5BXSA 1MXGA 2Y8VA 1ZS2A 2IXVA 1BG9A 1CYGA 4MB5A 1JZ4A 3L4VA 1WNOA 4AD4A 1UWSA 3AHYA 2BHZA 3PHAA 1KCLA 5GNZA 2E9LA 4PCSA 4E2OA 4PTWA 3K1DA 4CN1A 4WKFA 2Y5EA 2JALA 1K6AA 4XX6A 2WHJA 4WLCA 5I79A 1V3HA 2GK1A 2V3DA 4UFKA 4U2YA 4TX8A 4KGJA 3WH6A 1UHVA 3GXFA 1UD3A 3ARXA 3ARRA 5I2UA 2J78A 1KXHA 2Z1SA 3PZQA 5FIPA 4TOQA 5C70A 3NDZA 1GQJA 1V3MA 4HMDA 2BY0A 4OJYA 4DWSD 1B30A 2DH2A 3DECA 3VIGA 2BHUA 4CN4A 3F4VA 3SCOA 5A6MA 5CQ1A 5A6JA 4NF7A 3U5YA 4ACYA 4KRUA 3WDPP 1AQHA 5A8NA 4MB3A 4PMRA 3VDHA 4AZCA 1E4MM 4PBGA 3U7VA 1W9UA 2D3NA 1HX0A 3QHMA 4OBRA 1QOXA 2WHKA 1K9FA 2XM2A 2QF8A 1M04A 2J7BA 1TMQA 5CZKA 1J0KA 2MANA 4W86A 2E3ZA 1HP5A 2BV9A 4CN6A 1OT1A 3WH5A 5BXRA 1CIUA 3NJ3A 4MPKA 3BC9A 5I0DA 1X6NA 2CPUA 1TA3B 3AXHA 1HNYA 2ZX6A 1SMAA 4GO9A 4MNKA 1H5VA 2GUYA 1PIGA 1JZ8A 4H04A 1JYWA 2WK2A 4QCEA 3MO4A 3CIVA 1QBAA 1HL9A 1OIFA 1C7SA 4CD7A 3MMUA 5DMYA 5ABGA 4WSKA 3THDA 3CUGA 2DSUA 1BVNP 1XH0A 1B3XA 4J3SA 4W5ZA 4CVWA 1CTNA 4D6DA 1JNEA 3NYDA 2WHMA 2XGBA 2XVLA 3W24A 1CGXA 1E5NA 1S46A 1EGZA 1J01A 2G4FA 1O7AA 3VIPA 1UQYA 4MAZA 1TCMA 4HU8A 2QLYA 4U3AA 3ARSA 4HPHA 1Q6FA 1V6WA 3FY1A 2EO7A 3AYSA 3CH9A 3OLIA 4JFVA 2WBGA 1OD8A 1V08A 1BSIA 2XVPA 4UZUA 1VRXA 3T2QA 1SFSA 2DIEA 4PUEA 1VFMA 4ZXLA 2WMGA 2BVTA 1UD5A 3K4DA 3BAXA 1Q6GA 1UH4A 3BLKA 3CTTA 1ZBWA 3BXWA 4W89A 3VINA 3PZIA 1QI4A 3MUZ1 4NSBA 1CXHA 3ZJ8A 3VD7A 2J7HA 4AD2A 1XSKA 4S3JA 5BXPA 3OLEA 3WF4A 3M7SA 1KXTA 3NCOA 1C91A 2GFTA 4QP0A 1MW1A 2XJ7A 1XHGA 3BLPX 2WLZA 1OM0A 2VNCA 4JL2A 1YQ2A 1ZB5A 2WVSA 3RO8A 2WB5A 3WMCA 4F8XA 5IFPA 1W3KA 3WQ5A 1BLIA 1VENA 4AD0A 5IFTA 5BXTA 1WDSA 3RM8A 1U30A 2CETA 5BYWA 3F5JA 2PBOA 1J0ZA 1CWYA 4JFWA 3EDJA 4NRSA 3AMCA 1KQZA 1XH1A 3B9DA 5I77A 1FFRA 4UFHA 5EFDA 1E6RA 4W8BA 4W85A 3SCTA 2O9OA 1OBAA 4EKJA 2PC8A 4H8HA 3PTMA 1PEZA 1XC6A 3MV11 2DSZA 2ZIDA 3W29A 5AC5A 2W63A 1L8NA 2XVGA 1R8LA 2VRJA 4UOQA 2WBKA 3W28A 2X2YA 3DC0A 2F61A 3PN8A 4ZFMA 4UFJA 3WEOA 1C7TA 1G94A 1CGWA 2F2HA 1E6XM 1NOWA 2ZE0A 2WMIA 1BF2A 2J8FA 2WCSA 3ZJ7A 5IDIA 4Q22A 2J7FA 3OBAA 4GPNA 1J11A 2W62A 2BY1A 2VR4A 1V6VA 3EDEA 3WNNA 1CGTA 1ESWA 1JF6A 3GXIA 4OOZA 3WD4A 2IXUA 4KRTA 3HMCA 5DT7A 2JEQA 1KWKA 1NH6A 1XRVA 2XWDA 2ESCA 3CZ8A 1JI1A 1OGSA 1E6NA 1UKOA 2XPKA 3GBEA 4P7LA 1HJUA 5HPOA 1U33A 4MNMA 1C8QA 3VIKA 1ED7A 3MANA 2GDUA 4IUGA 2VZTA 2G41A 3RMEA 3AHVA 5ABFB 1BQCA 1UR2A 2V3GA 3N13A 4EK7A 4D71A 2BFGA 1US3A 1AMYA 1ZBVA 2A3BA 2OLHA 3QOKA 3SURA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4GHA A;  1PWM A;  2FMO A;  4FS9 A;  1C8Y A;  1LL4 A;  2FTW A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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