1LL6A

Structure of the d169n mutant of c. immitis chitinase 1
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
392
structure length
392
Chain Sequence
GGFRSVVYFVNWAIYGRGHNPQDLKADQFTHILYAFANIRPSGEVYLSDTWADTDKHYPGDKWDEPGNNVYGCIKQMYLLKKNNRNLKTLLSIGGWTYSPNFKTPASTEEGRKKFADTSLKLMKDLGFDGIDINWEYPEDEKQANDFVLLLKACREALDAYSAKHPNGKKFLLTIASPAGPQNYNKLKLAEMDKYLDFWNLMAYDFSGSWDKVSGHMSNVFPSTTKPESTPFSSDKAVKDYIKAGVPANKIVLGMPLYGRAFASTDGIGTSFNGVGGGSWENGVWDYKDMPQQGAQVTELEDIAASYSYDKNKRYLISYDTVKIAGKKAEYITKNGMGGGMWWESSSDKTGNESLVGTVVNGLGGTGKLEQRENELSYPESVYDNLKNGMPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title THE STRUCTURE OF AN ALLOSAMIDIN COMPLEX WITH THE COCCIDIOIDES IMMITIS CHITINASE DEFINES A ROLE FOR A SECOND ACID RESIDUE IN SUBSTRATE-ASSISTED MECHANISM
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE 1
molecule tags Hydrolase
source organism Coccidioides immitis
total genus 153
structure length 392
sequence length 392
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-04-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1ll6A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ll6A01
2GJXB 5BRPA 1KXQA 3TOPA 2YIHA 3WEMA 1WZLA 3UR8A 3AICA 3VKKA 2E3ZA 3ARVA 1GZJA 3ZJKA 3IK2A 1GPFA 1F4HA 3G6MA 2XIBA 3THCA 1H5VA 3W0KA 1I1WA 4M56A 3OG2A 3M6DA 4PMZA 2EPOA 1S46A 2QPUA 2WHKA 4Z2HA 4LGXA 3FAWA 2V5DA 2VVSA 2O9PA 3GH7A 3FXYA 1TCMA 3GZAA 3W4RA 5ABFA 3VNZA 2YDSA 3N04A 2VT0A 1V6VA 4MJ2A 1JZ5A 3APGA 3BSHA 1NP2A 1QI0A 2J75A 2V38A 1QOXA 1WP6A 5HNNA 2W5FA 2XVGA 1H11A 2QHAA 2J7HA 1MW3A 4DWSB 4U31A 4GINA 2D2OA 4LYPA 1LWHA 4GZEA 5DT5A 4D6GA 2CHNA 4LPCA 1W1PA 1GQJA 1H0GA 1VFUA 9CGTA 1J0KA 1CGTA 3T0AA 1QVBA 3VDBA 3ALFA 2DSKA 4E8DA 1WE5A 5IFTA 3SCWA 2G41A 2NT0A 3VIMA 3VTRA 2UY2A 3WMCA 1V02A 3VMPA 1TVPA 1UWSA 3WMBA 5CGTA 1BYBA 3W29A 4TVCA 1C7SA 3VDAA 3EYPA 1BPLB 3U7VA 4DUWA 4P8XA 5CJ5A 2BY1A 5ABFB 1GOOA 3CHFA 4HZ6A 3VU2A 3O6AA 1UQYA 4OUEA 4JL2A 1TE1A 4LXFA 4D71A 6A3HA 2JEPA 3LPPA 2YJQA 2X2YA 1W1TA 6TAAA 3EBVA 2Y4SA 3KL5A 2WBGA 4GO8A 5BYWA 3S2CA 2XVLA 3A4AA 2WNWA 3MUZ1 1J0YA 1HX0A 1QW9A 1KBKA 4PMNA 2OWWA 4TTUA 4CU7A 3AHZA 3ARZA 5HBFA 4CD4A 4GI9A 2D24A 1GOKA 4CN6A 3W6MA 1V3IA 3A6OA 3WUBA 4AIUA 1CLVA 2BY0A 4M80A 3ZJ8A 1JAKA 2EJ1A 1TA3A 3NJ3A 2XVPA 4AD0A 2IXUA 4D6IA 4TOQA 4TVUA 2JALA 2W62A 3K8MA 1E6RA 2EPLX 1NOWA 2XM1A 4FMVA 5IFPA 3MKKA 1V3JA 2F61A 2W63A 4UFMA 3GXFA 1HJXA 1JZ2A 4KRUA 4ZXLA 3QR3A 1W32A 5CXPA 1EA9C 5CLTA 1E3XA 2GFTA 3W28A 4WK9A 4BZYA 3K8KA 4WKFA 1LL6A 2JFEX 1W3HA 3DYOA 4B16A 3WQ6A 4UFIA 2Z1KA 4PMUA 4CD7A 2WC3A 2PWGA 4PUEA 4AZ5A 4AZHA 1YHTA 5A3HA 3WFZA 1E0WA 3A4WA 4MDPA 3SEPA 1ISYA 4U5IA 2XGIA 4LYRA 4JKMA 1V3HA 4IM4A 3WH6A 4CU6A 2OWXA 4AZGA 3D5HA 1E6ZA 2WWDA 1QNPA 1PIGA 5KZ6A 4W7VA 1K9FA 1H1NA 3WD3A 2EXOA 3WY1A 2A3EA 1V0LA 5CPSA 4HOWA 3K4AA 4AZBA 1V0NA 1CTNA 5E70A 5M3WA 1OSEA 3IANA 2QPSA 3M07A 4HZ7A 3VGGA 5DT7A 5E6ZA 3PHAA 5DF0A 1JFHA 3OB8A 4ZENA 3VM7A 2DIJA 1PX4A 1WNOA 3VIKA 1E6QM 1YQ2A 3MSDA 2ZX6A 3VD5A 1O6IA 3CZKA 3LMYA 1C8XA 4W8BA 5BCAA 2OYMA 2FHCA 1RPKA 1J0JA 1XH0A 3VD3A 3MSGA 1HJVA 1ZBCA 1UQZA 1UR2A 3T09A 2XFYA 3MANA 3ARPA 4HMDA 3WF1A 2W61A 3IJ7A 1UHVA 4DM2A 2HVMA 1OCQA 1JZ4A 3AS1A 2FGZA 3MMDA 4GIAA 3ZSTA 1AQ0A 1B3XA 4N42A 3MV01 3JUGA 4HTYA 4JCLA 1H49A 4U5KA 3ARWA 2PB1A 3SUVA 4R5EA 2WWCA 1VFOA 4MADA 2BHYA 1LL7A 4P8WA 2WBKA 5ABEA 3PZNA 1QBBA 1W3JA 1HJQA 4FLOA 1R86A 1JDCA 2CBUA 3RPMA 1DTUA 2CETA 2ZXAA 4XX6A 2AOSA 3MV11 3ECQA 2V3GA 4MNMA 2NW0A 1MQQA 1B3ZA 3NSXA 2O9RA 2CPUA 1UR9A 1UH4A 2FH6A 4GO9A 4EANA 3WQWA 1ZS2A 4UR9A 5BWFA 1E4NA 3AHYA 1OM0A 3ZQ9A 2J47A 3POHA 4MB5A 2BNJA 3GBEA 4PBGA 4F9DA 4ATDA 1ITCA 3AXXA 5IDIA 4M24A 4WF7A 1O7AA 1N82A 2DT3A 1ITXA 5EB8A 1E70M 1E1EA 4JZ5A 3WUGA 3KE0A 2UY4A 1GQLA 4PMDA 5A95A 2EEXA 5ABHA 2VNCA 3PN8A 3SIMA 2GDUA 3AHXA 5JUVA 3SCQA 1XH1A 3AIWA 3WL1A 3T2QA 2E0PA 3CGTA 4J3UA 1JI1A 1XSIA 4PYSA 1E56A 4FK9A 1EDTA 2VMFA 2W67A 2BV9A 4KMQA 2C8NA 1J9YA 1FH9A 2XVNA 3BAKA 4PTVA 3VIHA 3TTOA 1C93A 5A8NA 1XCXA 4JFSA 1KWKA 5LA0A 4AD5A 4AWEA 3IAQA 4C7GA 2G4FA 1JYWA 1VJSA 1JZ3A 2CESA 2FGLA 3TTQA 4BS0A 2CNCA 1PIFA 5M5DA 1B3VA 1M01A 3CH9A 1E5NA 3OLGA 2WPGA 1XD0A 3E1F1 2DT0A 1XRVA 1RP9A 1TMQA 4JCMA 1V6YA 2VJXA 5CLWA 1A47A 2CBIA 2X8RA 2XUCA 3UR7A 2NT1A 1XSJA 1QHPA 1IZJA 3AXHA 4ACYA 1CGVA 1OBAA 1OT1A 4HA3A 3VIOA 1JL8A 1QW8A 1JIBA 2DSVA 3PZUA 4HA4A 3CMGA 1CEOA 4P8VA 1ODZA 3F5LA 1KGWA 1CXIA 1NOUA 1VBUA 2DIEA 1G5AA 1UG6A 5EFFA 3I3EA 3ARYA 3VD4A 1W1YA 1NOFA 3AS0A 2BS9A 2WW5A 3AHTA 3WNOA 4WSJA 3N17A 4W8AA 4K68A 1WPCA 3SCNA 5CG0A 5EFDA 1G1YA 2D23A 3A4XA 4IISA 5A8PA 4YN5A 2GK1B 1MW0A 1ECEA 3FNDA 4W88A 1WB0A 5CGMA 6CGTA 2CERA 3W26A 1HKIA 4FLSA 4CKQA 1B30A 3CZLA 4JIEA 1J11A 4W7WA 2X0YA 1Q6GA 1RP8A 3EMQA 2WVVB 4UOJA 3WDQA 3EMCA 3BMWA 5D8ZA 2XG9A 3RIKA 2ZWYA 2WSKA 3MUAA 3POCA 4MAVA 1UD8A 2WSPA 1M03A 2YA2A 3W24A 2YL6A 3GYCA 4UOQA 1XC6A 5DMYA 3NSNA 3PTMA 3UERA 1H09A 4YPJA 4R27A 3PZVA 1MYRA 2VX6A 3QHMA 2YA0A 3KZSA 2X05A 3ZSSA 4LQ1A 1W9UA 2NSXA 4WKHA 2E4TA 2CCRA 5GNXA 1U2YA 1XD1A 5A2BA 2OLHA 3OBAA 1EO5A 3WN6A 3PTKA 4NI3A 4H04A 4KWUA 3ZT5A 4GI8A 5HXMA 3B9DA 1W9XA 4KH2A 2GDVA 1MQRA 3CBWA 3HJEA 5FCZA 1E55A 2WZEA 1CBGA 1U30A 1E15A 3MU7A 3VDHA 1AQMA 1WDPA 3EMZA 2DT2A 1B0IA 3N12A 3GTNA 1UD2A 4AYSA 1OT2A 2Y24A 1H4PA 2EPNA 2Y5EA 3NSMA 3NIYA 5E0FA 1GJUA 1D7FA 1KR1A 1W91A 1QNRA 7TAAA 1BGAA 3EDEA 5A6MA 3WBAA 5JBEA 4DUXA 4AMCA 3GDBA 4F8XA 4BQ5A 2YA1A 5I6SA 1UD3A 1C90A 4JAWA 2ZWZA 4PTMA 4J3TA 1J0IA 1NWTA 1GOMA 4E8CA 2YL9A 1VFMA 4U3CA 1OGGA 1G01A 3WMSA 4W84A 3O2LA 1WDQA 1PZ3A 5CQ1A 2E9BA 3WKZA 1VB9A 1E72M 1BYAA 1GOWA 2DH3A 2EPKX 5A6JA 1HF6A 1CPUA 3WQVA 3RJXA 3KL0A 1NP0A 2XWEA 2WMHA 1QI5A 2D0GA 1GOQA 4TX6A 4Z2GA 4CUCA 4YHEA 1D3CA 2DSWA 1B90A 2DEPA 1V3KA 4QCEA 4M8UA 3ZT7A 4W89A 5HPOA 2W66A 4H8HA 1GONA 3CZEA 3BXWA 1HJWA 1XSKA 1GHRA 2PWDA 3ARTA 4HU8A 5I5RA 1NM9A 1W9DM 2UY5A 1HL8A 1QNQA 4PTWA 1W9PA 5A2CA 4ZE5A 1CGXA 4U33A 4AEFA 1KCLA 4D6DA 1V0KA 1M04A 1FHLA 4DWSC 4PCSA 5JH8A 3GH4A 1DHKA 5C71A 1SMDA 2D1ZA 1D2KA 1XV8A 1LLOA 4X9YA 1JYVA 1C3FA 3WDIA 1GVYA 4PEEA 1W9VA 1BF2A 4B3KA 5D9PA 3L2MA 1LG2A 3AS2A 5AYIA 2DPEA 5A1AA 1FP9A 3LPFA 4NRSA 3ARXA 2WVTA 5A6SA 4MNKA 1JF5A 3VO0A 1JZ7A 1JZ6A 1SFSA 5A2AA 1EO7A 3WNNA 4UQ9A 1E3ZA 3VPLA 5C70A 2ZIDA 2ZUWA 5A69A 4AISA 4J3WA 1BG4A 3BMVA 4MB4A 2VC9A 1QHOA 5D4YA 4UQCA 3QHNA 3FHAA 3AFBA 1VENA 4PMXA 3FN9A 1W2VA 1KXVA 2JEQA 1Q6EA 2PBOA 1KGXA 4XUYA 4PTXA 3WD2A 2D20A 5DFAA 2ZUVA 3QOMA 3W82A 1LL4A 2D0HA 2BHZA 2YDQA 4GZIA 3MUY1 5HPCA 1EIBA 5HOSA 3LPOA 3N13A 4B9YA 1JNEA 3U7BA 2O9TA 8A3HA 3AMDA 3SCRA 1UA7A 4QLLA 3CPUA 2VZSA 2WAGA 2ZUTA 2CYGA 3CUGA 3O9NA 1F4AA 4AW7A 1HNYA 1VEPA 5BXSA 1DWIM 1W3LA 2FDMA 3MUIA 3AHVA 2Y2WA 1PBGA 4CN4A 2VX4A 2Q8XA 2OSXA 4JFTA 4NRRA 4RE3A 5JBFA 1E0XA 4CVUA 4JKLA 2WMKA 2J8FA 4XZWA 4YHGA 2WHLA 3FW6A 4X0NA 1B31A 3CZJA 1DP0A 2RGMA 1R7AA 5A6AA 1VRXA 1CXFA 4BCEA 2PI6A 1AVAA 5A8OA 3WH7A 2PWEA 2XJ7A 1KQYA 4AC1X 3L4TA 2VO5A 2W4XA 3ARUA 1KXTA 4LX4A 4PMVA 1J0HA 3L2LA 4QFUA 4MNLA 3TTYA 1C7TA 3DYPA 3B9AA 2Z1SA 1UKSA 5M03A 3UG3A 3TONA 3QGVA 2WVSA 4OIFA 3PBGA 4UTFA 1V03A 3A47A 4ATLA 5JIWA 3OZOA 3WEZA 2XWDA 1UR0A 2E9LA 4KGJA 3PTQA 1FFQA 1ODUA 1K9EA 2VOTA 1OGBA 1H41A 1CIUA 2XIIA 1BYDA 3UETA 1HVQA 4E4PA 2ESCA 5I24A 2WANA 3VX0A 3VM5A 5LA2A 1MFVA 1JDAA 3VOCA 2GJRA 4GZJA 4GQQA 3U57A 4P7OA 5D9OA 3L4XA 1OWQA 4J28A 5E9AA 4W8LA 2XM2A 1ZBVA 3FHQA 2WZHA 1HVXA 2BXYA 3AIRA 3W25A 1JZ8A 1NWRA 4HPGA 3WL0A 3EDJA 3HU7A 4M81A 2VL4A 4AD2A 2BFGA 3U5YA 3VDCA 1FOBA 4BQ4A 1OD8A 4D72A 4L4PA 1UD4A 1Q6DA 1HJUA 5I2UA 3AMLA 3GNRA 3F5KA 4W7UA 4F66A 3SUUA 1W1VA 2YBUA 1JNDA 2VVNA 4GQRA 4TUFA 3PZ9A 3VGEA 4MPKA 5I23A 3PZIA 1V6XA 4UFJA 3OLIA 3ZIZA 3NCOA 3RCNA 3WENA 5DO8A 2ZE0A 4U2YA 4C7DA 2AAAA 1GHSA 1WZAA 3WDJA 4HOXA 1CECA 3B9EA 1X1NA 4OJYA 3WH8A 1H3GA 2FHBA 4D6JA 1HN1A 1J0ZA 4MB1A 1PAMA 1PEZA 2J79A 3AYSA 3N15A 1OD0A 1DWGM 4AD4A 5I79A 4BA0A 1UKOA 3UESA 1VEMA 3B8SA 4ATWA 3EDKA 3DYMA 3L4UA 3RM9A 1OINA 1OIFA 3RM8A 1V0MA 5BXRA 1ZU8A 1V08A 1UD6A 3GNOA 4RE2A 1CLXA 2IXVA 1ISWA 4WLCA 4QLKA 2BVDA 4PMOA 1UH3A 5IHSA 1R87A 3WD1A 2WMFA 2VQTA 4FLRA 2WCAA 4AZ6A 4HA1A 1WZMA 3WUEA 4CU8A 1V6WA 2X1IA 4PRWA 1DWHM 1WCGA 1JD7A 3THDA 1TZ7A 1EHAA 3GXIA 3QHOA 4RL3A 2GK1A 1BFNA 2VI0A 4ZEPA 1US2A 3CHDA 2FH8A 1RD6A 3WELA 3IAPA 3PZQA 4UQDA 3T2PA 1B3YA 1B9ZA 1BHGA 4A4AA 1ZBKA 2X0HA 3IJ8A 1E6XM 3KEHA 2WVVA 5BXPA 1UR4A 2RGLA 4UOZA 1Q4NX 4TTGA 3HMCA 1C8YA 5AY7A 1EQCA 1EOMA 4TX8A 4AZCA 2J4GA 3WQ4A 3BSGA 4N0RA 3PZMA 1BTCA 2CITA 4H7VA 4MTVA 1FHDA 4UFLA 1UWQA 3UG5A 3CUFA 4RE4A 1GNXA 4IUGA 2XFRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2B5U B;  3VE9 A;  1VCV A;  4L4O A;  4KFO A;  1EUA A;  1XH2 A;  4TXE A;  3TA9 A;  1H50 A;  1BXB A;  5AYZ A;  4PN2 A;  1F73 A;  4Q22 A;  2VOM A;  3W7I A;  5RUB A;  4Q6X A;  2E09 A;  3SBF A;  3D46 A;  3ZZ1 A;  3BH4 A;  5EBA A;  2ZUS A;  5CJM A;  2PDM A;  2A7N A;  2F2D A;  4JFI A;  4IPI A;  3P84 A;  3PBU A;  2PD5 A;  5KZE A;  2TAA A;  3H4W A;  2BXZ A;  1K4G A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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