4WJXA

Crystal structure of human chitotriosidase-1 catalytic domain at 1.0 a resolution
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title New insights into the enzymatic mechanism of human chitotriosidase (CHIT1) catalytic domain by atomic resolution X-ray diffraction and hybrid QM/MM
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Chitotriosidase-1
total genus 137
structure length 369
sequence length 369
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4wjxA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4wjxA01
1QHOA 2CERA 5CPQA 5BXTA 3RO8A 1E4MM 2FGZA 5CPTA 2FHBA 4U2YA 2RGMA 3ARYA 3OLGA 5E9AA 1BG4A 5A6MA 1UD8A 4PMUA 3VNZA 1UH2A 3TP4A 4GINA 4CGTA 1TE1A 2QMKA 1HL8A 4B9ZA 5BCAA 2VVNA 4Y7EA 1QNOA 1E0WA 5D9MA 4Q22A 4CU8A 1ZL1A 4EE9A 5GNYA 2UY3A 4ML4A 4Z2HA 5EFDA 1HVQA 2DDXA 1EOKA 1GZJA 1G0CA 1VFUA 1WCGA 2G3NA 1KR0A 2BXYA 3T0AA 3BMWA 3ZSSA 2Y8VA 3WUGA 1GVYA 3O9NA 1J18A 4N0RA 5HNNA 3VD7A 3WF4A 1FHLA 2ZUTA 4ACZB 1B9ZA 1W9PA 5CGTA 3WD2A 2BNJA 1MW3A 2ZWZA 3RCNA 1WE5A 1CLVA 4OIFA 3VD4A 3RILA 3N12A 2G3JA 1CXIA 1XCXA 3AS1A 2WMJA 3G6LA 2WVVA 1WDSA 1CWYA 2X05A 1J0JA 1LWHA 1W3HA 3PHAA 1E1EA 5A1AA 4V28A 3W38A 1E6ZA 3WD4A 1PX4A 2WZIA 4H8UA 5HXMA 4OBSA 1NWTA 2QF8A 4P8WA 2GJPA 1ECEA 1MW2A 5FL0A 3UR8A 4MPKA 1I1WA 1V02A 1X6LA 5EB8A 2G4FA 1ISVA 1FA2A 2VRQA 3PTQA 1VJSA 4FF5A 3PZIA 2EXOA 3NCOA 3WDJA 1HF6A 2D24A 5IFTA 4CVWA 2DT2A 4AZCB 3SUVA 3WNOA 4M8UA 1C7TA 3CUIA 4UTFA 5D9NA 1E71M 1VEOA 4MTVA 3CZGA 4JZ5A 3VDBA 2AMGA 3U5YA 2QV4A 1US2A 5CSUA 1PX3A 2GFTA 3W4RA 3PTMA 3CHCA 1UKTA 4OJYA 3SCVA 2G3MA 1BVNP 3TONA 2WHMA 3VIFA 1E5JA 3GNOA 2QPSA 2XGIA 3M6DA 3W28A 4D6IA 1HJUA 1DWAM 4QAWA 4UCFA 2E9BA 1QBBA 1RH9A 5E09A 3WNLA 5HPOA 1W91A 1NQ6A 1JI1A 1EO5A 5ECUA 1FP9A 2EBNA 1TFVA 1UWQA 2W92A 5M17A 1KB3A 4C7DA 5JBDA 5JIPA 1XCWA 4HOWA 3K8LA 4HZ8A 2Y24A 4UQAA 3AZSA 5A3HA 3AHVA 4KGLA 1GJWA 1TVPA 3SURA 1GOKA 4AWEA 3CUGA 1NOUA 4ZEPA 2WBGA 5DF0A 1VB9A 3AYRA 1WAWA 2J7FA 4BZYA 1GOOA 3ZOAA 1E6SM 1DWGM 1JL8A 3UEQA 1G9HA 2E4TA 4F8XA 3CHDA 1E0XA 3A4XA 3SCNA 1UD2A 3S2CA 3WBEA 4JHOA 2WMKA 4MDPA 3VINA 3VO0A 3W81A 1M7XA 2CBIA 3GBEA 5DO8A 3RPMA 3ALGA 1TVNA 1WZKA 4CU7A 2J62A 2ZX7A 4M80A 2YDQA 4ATDA 4M29A 2XWDA 1V6VA 4W86A 2ZXDA 1HT6A 2J77A 1EQPA 1J12A 4WKAA 3VU2A 5E70A 1B3VA 3JUGA 1G94A 1QHZA 3WD1A 2WB5A 1UR1A 3WUEA 3VIMA 1K9EA 4EKJA 2V3DA 2GJXA 1H41A 1C8QA 2GVYA 4UZSA 1YHTA 2OWXA 2WNWA 3UR7A 2Y8KA 4S3KA 1VEMA 5A94A 4MJ4A 2E8YA 2XUCA 4RE2A 2IXVA 3DECA 4MB1A 5AC5A 1H1NA 1BYDA 1JAEA 1UR4A 5FIPA 4UR9A 4WJXA 1SYTA 4GKLA 5DEZA 2J4GA 5BXSA 1V6WA 3BAWA 3ZJ7A 4D6GA 3AMDA 4F9DA 4KRUA 3GH4A 3AHTA 1MXGA 4RE4A 4D1IA 3THDA 4JFUA 1WB0A 4KH2A 2OWWA 1OBAA 4CCEA 2OYLA 2WC3A 3PZTA 4R27A 3MU7A 2ZUUA 3K8KA 5I0DA 1MYRA 3VNYA 4MNKA 3AIUA 1BSIA 3W53A 1XYZA 3IAQA 1UG6A 1W1VA 3UERA 1EQCA 3W24A 2G41A 5C8BB 4JKKA 3BH4A 7TAAA 2BHUA 2VRJA 1UWTA 1BQCA 2O9RA 3A4WA 2X2YA 1LQ0A 2GK1B 2VR4A 5CG0A 1OCQA 1CXHA 5A6BD 4EANA 2DIEA 3ARWA 1J0ZA 1GCYA 2XYLA 4WKFA 3PZVA 5C70A 3ARSA 3BSHA 4PMQA 3T0BA 3RMEA 1L0PA 4AZBA 1UR2A 1XSKA 5CJ5A 1GPFA 3WSUA 1BAGA 4UQBA 2UY5A 1DWFM 4MNLA 4HMDA 1Q6EA 2X1IA 2YA0A 1J0YA 2UWFA 1CGVA 4D6DA 2DT3A 5E6ZA 1E15A 1TG7A 3WFLA 4XZBA 3T0DA 1MXDA 2VCCA 2VNCA 1CTNA 1XH1A 5IHRA 4HU8A 1CGXA 4TTUA 3WH6A 1E55A 2WHLA 5GNXA 4LGXA 2VZSA 4M56A 5GPRA 3MS8A 2WVTA 4AZ5A 2WLYA 3OLDA 2VZOA 3A3HA 1TCMA 5TD4A 1FFRA 4B3LA 3RIKA 5I77A 2EPMX 4P7LA 3VIOA 5ABFA 4W87A 1HJXA 3EDDA 3ZJKA 5AY7A 4D6HA 2WZHA 4EAMA 1EIBA 5ABEA 4AZ6A 2XSAA 4LXFA 1E1FA 1SR0A 1QW8A 4J3UA 4AY1A 1M01A 4PN2A 4GZIA 4H04A 4PEEA 5KZ6A 1C8XA 2EPOA 1CGYA 4TTGA 2WCAA 3MUIA 1WZAA 1E43A 3AIQA 5LA1A 3OGRA 4HU0A 1IV8A 2JEPA 4BQ5A 4BA0A 4DM2A 3CUHA 1UD5A 2D3LA 1J01A 4CD5A 4HPHA 2X09A 1B30A 4JL2A 3W6MA 4AD3A 1V3KA 4D1JA 1JNEA 1DP0A 1W2PA 4GQRA 1VIWA 1E9LA 1C3FA 4JIEA 3CTTA 4OUEA 2HISA 2ZX5A 2O9OA 5LA2A 4AEFA 4UOJA 3K4DA 3E1F1 2WW5A 2J79A 1J11A 2D0HA 3KL5A 1UR8A 3MANA 1UH3A 3AIBA 3PTKA 5CPSA 1JZ7A 1FH9A 2PWDA 4DM1A 4CKQA 2JIEA 3OG2A 3EDJA 5C71A 2G3IA 4XZWA 2WZEA 4LQ1A 3AROA 3EMZA 1C93A 1IZKA 1CBGA 2J7DA 1BGAA 1V02E 1U2YA 3VTRA 3VKKA 3M7SA 1GORA 2VQUA 1RP8A 4P7QA 1BF2A 1FFQA 1Q6GA 3MSDA 1R8LA 3BLKA 3DYMA 4P7OA 4QLJA 3WD3A 4PUEA 2ZX8A 1UWSA 1WZLA 2UY4A 5E0CA 4ACZA 1PPIA 2JF7A 4RE3A 3VX1A 2AOSA 4GQQA 4U31A 4AZHA 3BLPX 2DSWA 1K9FA 5A8MA 2BS9A 3AIVA 2GDVA 1OWQA 4MNMA 2YBTA 4D71A 4AD4A 4LX4A 3A4AA 4CN6A 1E4LA 4H2CA 4FK9A 3RM4A 4FLRA 1FH8A 2J7BA 3QHOA 4AISA 3U7VA 1NM9A 3PZMA 4L4OA 2FH6A 2O9PA 1V3IA 3SCOA 1W3KA 3OGSA 1E72M 2A3AA 2XVPA 5JIWA 2WLZA 2W91A 1NP0A 4U2ZA 4ZENA 3CZJA 1R85A 3TTSA 3VMPA 1W9DM 2W4XA 4DUWA 2O92A 3N15A 3AHYA 1ESWA 7CGTA 1V03A 1EO7A 4IPNB 1SMAA 4M1RA 4PTMA 1PJ9A 1JZ8A 4DWSB 1KXHA 1EH9A 1V6XA 3VPLA 3WL1A 2YLLA 2D3NA 1VFFA 3BGAA 2FDMA 1PEZA 4PBGA 5CXPA 3ZT5A 3NSMA 5M5DA 5A95A 3CZKA 3L2LA 2D2OA 3NYDA 3DHPA 3AMKA 4BQ4A 4BF7A 3O6AA 3VM5A 2WCSA 3OIHA 2F2HA 2ZE0A 3BAXA 1VENA 4UQEA 2YDRA 1WO2A 4GI9A 3B8SA 3RM9A 3I3DA 3F4VA 4MADA 3HN3A 2DSZA 4PMXA 2VCAA 3CUFA 1G5AA 4WK9A 1UYQA 2D22A 3WELA 1QI2A 3FAWA 4MAZA 2YA2A 1CGUA 5LYRA 4QCFA 1Q6DA 4NZCA 3N11A 1MVYA 3OLEA 3SUSA 2VZTA 4PTWA 1UOKA 1ZU8A 1MQRA 1VBRA 4S3JA 1K9TA 1HVXA 4AW7A 2VR5A 1E40A 2CHNA 2CKSA 2UY2A 2DQXA 3CIVA 3CZLA 2PWGA 4AMCA 2WMIA 4AZ7A 2OLHA 4UFIA 3WL0A 3MO4A 4JL1A 1UH4A 3WNKA 5FOOA 4AIEA 2NW0A 4BQ2A 4H8VA 1UR9A 5BRQA 4MAVA 4CCDA 4WIWA 4WF7A 2DH3A 2XM2A 1HJWA 1WNOA 3EYPA 2XVGA 5DFAA 4CD4A 4M81A 2F8QA 4MDOA 1UA7A 5A2CA 1VJZA 4JFWA 3N1AA 1VAHA 2FGLA 5D9OA 1OT2A 4DUXA 2VT0A 4Z2LA 3IJ9A 3VDAA 3L4YA 1E6QM 3VIPA 1EOMA 3WENA 1LJYA 1M03A 1UD6A 4WKHA 5FL1A 2VZVA 1W3LA 1KQYA 3AYSA 1WDQA 2NT1A 1WDRA 4W8LA 3FY1A 1LLOA 3ARZA 2WWDA 3BCFA 1BLIA 3L4UA 2OSYA 3MUAA 1B3ZA 3VDCA 5DMYA 2WMFA 2Z1SA 3T2QA 3WDPP 4DUVA 1QHPA 8A3HA 1OINA 2VMFA 5E6YA 2DT0A 5I6SA 4UFJA 1HKJA 2DGAA 1H5VA 3LPOA 3SUUA 3HJEA 5FKYA 4UFMA 1HP4A 1OIMA 1OGGA 3N04A 1XHGA 1QVBA 3DYOA 4AIUA 3AICA 3K8MA 2Y4SA 3W82A 5CGMA 5D8ZA 3LPPA 4FLQA 1UWRA 3WEOA 5IHSA 3TTYA 4QCEA 1GONA 4UNIA 4BCEA 1WZMA 5GNZA 1HJSA 3KZSA 4KMQA 3CBWA 2D20A 4W93A 3MSGA 3PBGA 1OD0A 3NIYA 1E3ZA 3PN8A 2W62A 3W27A 3WDHA 1KGXA 3WEZA 1KCLA 1MFVA 2YIHA 3FNDA 3WD0A 1E6PA 1HJQA 3IK2A 1W9BM 1JG9A 3CLWA 2GDUA 1VF8A 1H0IA 2O9TA 3WQ5A 3B9DA 1JXJA 1I75A 5AYBA 5BXRA 3HMCA 4PCSA 4V27A 5HBFA 3AZTA 2JALA 5HPCA 5LA0A 4HA3A 3GXFA 2ZIDA 3VM7A 3L4TA 3WQVA 3WF0A 2WVVB 2OYMA 2J7EA 4DWSD 2FHCA 1GNXA 2YA1A 4IISA 1MQPA 4HZ6A 1RP9A 3ARVA 3WNPA 1CDGA 4GI8A 3KL0A 1D7FA 4NRSA 3WQWA 3AQUA 3AS0A 1I1XA 3TTOA 2DSUA 1H3GA 1ISYA 3ZSTA 4X0VA 2EQDA 3MMDA 2VCBA 4H8HA 3L4XA 1BPLB 2YKKA 5JUVA 2WCGA 2WHKA 3BC9A 4PMDA 1NOFA 3WF2A 5A8QA 2VI0A 1HKMA 1QI4A 1U33A 5A69A 1WDPA 4W89A 2PWHA 2CXGA 3DC0A 1UWUA 3NUKA 4WSKA 1H09A 2J7CA 1E0VA 2XVKA 3WMCA 3GH7A 1U30A 1M04A 3L2MA 3VIJA 1UUQA 4OOZA 1S46A 3QOMA 5D4YA 4AD0A 5I78A 1TUXA 1GOMA 1A3HA 1C7SA 3ZQ9A 2WHJA 3WMSA 1UZ4A 2HVMA 3NSNA 3UESA 5ABHA 3CZ8A 2XM1A 3RJXA 5A6KA 3WN6A 4B3KA 5M3WA 1CXEA 1AMYA 2VC9A 1X6NA 2Y5EA 1V0KA 2CCRA 1UKOA 3AI0A 3IJ7A 4OBRA 4XX6A 3SCRA 1PAMA 3GZAA 3AIWA 4Z2JA 3T08A 1QNQA 3ZMRA 1OT1A 4PSPA 1OM0A 1H49A 2A3EA 2ZOXA 4P8VA 5I79A 3VD3A 1A47A 2QMJA 4HMEA 4CN1A 3ARTA 3WBAA 4HOXA 4CCCA 1J0IA 4AEEA 2YBUA 3N13A 3AHZA 1FH7A 2CBUA 1VFOA 2VQTA 3TTQA 5D9PA 1GHRA 5CQ1A 2AAAA 4PMVA 4MB3A 2BY3A 4IM4A 4JFVA 5ABGA 1JF6A 2J7GA 3B9EA 2W66A 4YPJA 1ZBWA 1F4AA 1MFUA 2D1ZA 4U3AA 1CENA 3ARPA 2E8ZA 2J78A 2V38A 3QR3A 3UETA 1JYVA 2A3CA 1TR1A 4AD1A 1PX8A 1V3JA 2CIPA 3PZUA 2ZUMA 4QLLA 1KXVA 4OOUA 2XFFA 2CETA 2C7FA 2J8FA 2WC7A 4PCTA 3OBAA 2EEXA 4X0NA 4XB3A 4PRWA 1XSJA 1UQYA 1UR0A 3WDQA 1JNDA 3VMOA 4ZXLA 1OB0A 1OIFA 4D6JA 5HDRA 3ARXA 3M46A 4TUFA 4J27A 1V3LA 1US3A 3GXMA 4P8XA 1HX0A 1HJVA 2BHZA 4CD6A 4J28A 3W37A 4PTVA 1JFXA 2XFRA 3VD5A 3VIKA 1JZ5A 1ISZA 3A47A 1B90A 3ZM8A 1KGUA 1KFWA 2XWEA 1XGZA 4ZXOA 3ALFA 1AQ0A 1E6NA 2A3BA 2G8ZA 3AXHA 4NSBA 1ITCA 3FW6A 5JBEA 3G6MA 1CXFA 1OSEA 2VUYA 3WKZA 2OSXA 3RJYA 2CKRA 2OYKA 2XIBA 2BVTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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