The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
110
|
structure length |
110
|
Chain Sequence |
EPIPICSFCLGTKEQNREKKPEELISCADCGNSGHPSCLKFSPELTVRVKALRWQCIECKTCSSCRDQGKNADNMLFCDSCDRGFHMECCDPPLTRMPKGMWICQICRPR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Combinatorial readout of unmodified H3R2 and acetylated H3K14 by the tandem PHD finger of MOZ reveals a regulatory mechanism for HOXA9 transcription.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Histone acetyltransferase KAT6A
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
13
|
| structure length |
110
|
| sequence length |
110
|
| ec nomenclature |
ec
2.3.1.48: Histone acetyltransferase. |
| pdb deposition date | 2011-12-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00628 | PHD | PHD-finger |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Herpes Virus-1 | Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2VJF B; 2K1J A; 2G45 A; 1MM3 A; 2JMJ A; 3M62 A; 2K16 A; 2ECN A; 2YRE A; 2YQM A; 3HCT A; 2MUM A; 2VJE B; 4L58 A; 2ECI A; 4I7D A; 3PUR A; 2YT5 A; 5AIT A; 1FBV A; 2K17 A; 2LRI C; 5H9M A; 3HTK C; 2VPE A; 2C2L A; 3KV6 A; 1WEO A; 4R8P K; 2F6N A; 2EGP A; 4N4F A; 2M85 A; 3RTR B; 1WIL A; 3C5K A; 3ZVZ B; 2M6M A; 5C13 A; 4O64 A; 3SHB A; 1WEP A; 1VFY A; 4UP0 A; 5FB1 A; 5D1K B; 2F42 A; 2ECT A; 1X4U A; 4L7X A; 2KWN A; 5FER A; 2M3H A; 3V43 A; 2LDR A; 2VJE A; 3QZV A; 4NN2 A; 2CKL B; 4F52 B; 4B86 C; 4FO9 A; 2MD7 B; 4A0C D; 2RI7 A; 4AVX A; 4S3O B; 5FEY A; 2DX8 A; 1JOC A; 2YSJ A; 3N9M A; 1G25 A; 3PHD A; 1F62 A; 4ZDT A; 4WA6 A; 1WEN A; 2IDA A; 3EB6 A; 3O70 A; 1HYJ A; 2NAA A; 4LKA A; 2Y1M A; 2YW8 A; 3EB5 A; 2YUC A; 4CA1 A; 3N9N A; 4GNE A; 2CSZ A; 3U5N A; 3GV4 A; 2ECG A; 2MA6 A; 1Z60 A; 5JG6 A; 1BOR A; 3KNV A; 5DIN A; 2CKL A; 3NG2 A; 2YUR A; 5FB0 A; 2I50 A; 3HCS A; 4YAT A; 5LKU A; 5G04 B; 2L75 A; 4QF3 A; 2UZG A; 2KU3 A; 2OXQ C; 4PPE A; 3RPG C; 3SOU A; 4YBM A; 2YQL A; 2HDP A; 3PUQ A; 4FJC A; 1E4U A; 2HYE D; 4X3G A; 3SOX A; 1WEW A; 3N9Q A; 1WIM A; 4BHW A; 2VPB A; 5G05 B; 4I7C A; 1HYI A; 3DQV R; 4V3L C; 2D8S A; 3M99 A; 5B75 A; 2E6S A; 2L43 A; 2FUU A; 5B8D A; 4N3W A; 2G6Q A; 3O33 A; 2LXP C; 2MNZ A; 5LKX A; 1VYX A; 4GND A; 4R7E A; 5LCW B; 1WEE A; 2XB1 A; 4YAD A; 3O7A A; 1JM7 B; 1T1H A; 1WFK A; 2G43 A; 4AP4 A; 5TBN A; 2KYU A; 2YSM A; 3LQH A; 5H1V A; 4B7Y C; 2AN6 A; 2LXH C; 2JRJ A; 2LGK A; 1Z2Q A; 2BAY A; 2JMD A; 3GL6 A; 3ZTG A; 2KWO A; 2QJ0 A; 1FP0 A; 1X4J A; 2Y1N A; 3U5M A; 4A4C A; 1LDK C; 2QIZ A; 2JMI A; 4FK5 A; 5DKA A; 1WEU A; 4LK9 A; 2KR4 A; 3T7L A; 4TKP B; 4I7B A; 3RPG B; 5AIU A; 2L5U A; 1JM7 A; 2KIZ A; 4IC2 A; 2RSD A; 5KH9 A; 4WZ3 B; 4ZQL A; 2LN0 A; 3N9P A; 4P5O B; 1V87 A; 4BBQ A; 1WEV A; 3IHP A; 1DVP A; 3I2D A; 2YHO A; 2QIC A; 2MA5 A; 4AYC B; 4LLB A; 2PUY A; 2LGV A; 4YBT A; 1MM2 A; 1XWH A; 2FSA A; 2CT2 A; 2F6J A; 1WEM A; 2VPG A; 4GNG A; 4PTB A; 4LJN A; 4LAD B; 3O36 A; 3LRQ A; 2L80 A; 5TAB A; 4GNF A; 3T6R A; 2MNY A; 2MT5 A; 2KWJ A; 2YHN A; 4YAB A; 2KGG A; 2KWK A; 4ZUX U; 2LQ6 A; 2H0D A; 3C6W A; 3LQI A; 4W4U A; 5D1L B; 3HCU A; 3VK6 A; 2YYR A; 2L0B A; 4GB0 A; 4AUQ B; 5B79 A; 4MVT A; 4AYC A; 3SOW A; 5LKT A; 4A49 A; 5H1U A; 3L1Z B; 3L11 A; 3ZPV E; 4WZ2 A; 3DPL R; 2ECJ A; 2XEU A; 3O34 A; 4WZ0 A; 1IYM A; 5LKZ A; 5D1M B; 4XI1 A; 2KGI A; 4V3K C; 5TDR A; 1ZBD B; 4IC3 A; 3LQJ A; 3N9L A; 3U5O A; 4CCG X; 5EYA F; 2KE1 A; 3ASL A; 5KH3 A; 2VJF A; 3ZYQ A; 3M63 A; 3N9O A; 1LDJ B; 3L1X A; 3ZPV 1; 1U6G B; 3O35 A; 5B76 A; 4Q6F A; 1CHC A; 5H1T A; 1WGM A; 2C2V S; 3MHH A; 2EA6 A; 2MIQ A; 5I3L A; 3MHS A; 3ZVY A; 5TRB A; 4QF2 A; 5G0F A; 2E6R A; 2H0D B; 1Z6U A; 3FL2 A; 1VD4 A; 4A4B A; 1RMD A; 4YAX A; 5B78 A; 1K2F A; 1WE9 A; 2KRE A; 5B77 A; 1WEQ A; 5KH7 A; 4YBS A; 2ZET C; 2CSY A; 2LGL A; 1X4I A; 2LV9 A; 4C9Z A; 2LGG A; 3O37 A; 5J3X A; 4R2Y A; 2VP7 A; 2ECV A; 2M1R A; 3KQI A; 4UP5 A; 2KFT A; 5TDW A; 5C11 A; 2PNX A; 3U5P A; 1N87 A; 3KV5 A; 3ZNI A; 4UI9 B; 2FUI A; 2VPD A; 4MSX A; 2EOD A; 2MD8 C; 1WES A; 4FIP A; 2K4D A; 4S3O C; 2VNF A; 2Y43 A; 2ECW A; 2YU4 A; 4YC9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2M13 A; 2VJF B; 2JUN A; 2K1J A; 2G45 A; 1MM3 A; 2JMJ A; 3M62 A; 2K16 A; 2ECN A; 2LAU A; 2YRE A; 2YQM A; 4H9D A; 3HCT A; 2MUM A; 2VJE B; 3LVQ E; 4L58 A; 2ECI A; 4I7D A; 5SVI B; 3PUR A; 2KKY A; 2YT5 A; 5AIT A; 1FBV A; 2K17 A; 2LRI C; 3FM8 C; 5H9M A; 3HTK C; 3O47 A; 2VPE A; 2C2L A; 3KV6 A; 1WEO A; 4R8P K; 2F6N A; 2EGP A; 4N4F A; 2M85 A; 3RTR B; 1WIL A; 3C5K A; 3FAN A; 3ZVZ B; 2M6M A; 5C13 A; 4O64 A; 3SHB A; 1WEP A; 2DJA A; 4Z0R A; 1VFY A; 4UP0 A; 5FB1 A; 1MBM A; 5D1K B; 2F42 A; 2ECT A; 1X4U A; 4L7X A; 2KWN A; 5FER A; 2M3H A; 4Z0O A; 3V43 A; 2LDR A; 2VJE A; 3QZV A; 5SVI A; 4NN2 A; 2CKL B; 4F52 B; 4B86 C; 4FO9 A; 2RR4 A; 2MD7 B; 2OWA A; 4A0C D; 2RI7 A; 4AVX A; 4S3O B; 5FEY A; 2DX8 A; 1JOC A; 2YSJ A; 3N9M A; 1G25 A; 3PHD A; 5K3Q A; 1F62 A; 4ZDT A; 3LDY A; 2CRW A; 4WA6 A; 1WEN A; 2IDA A; 3EB6 A; 3O70 A; 2DSM A; 1HYJ A; 2NAA A; 4LKA A; 2Y1M A; 2YW8 A; 3EB5 A; 2YUC A; 4CA1 A; 3N9N A; 2P57 A; 3PLW A; 4GNE A; 2IQJ A; 2CSV A; 2CSZ A; 3U5N A; 4F1P A; 3GV4 A; 2ECG A; 2MA6 A; 1Z60 A; 5JG6 A; 1BOR A; 3KNV A; 5DIN A; 2CKL A; 3FAO A; 3NG2 A; 2YUR A; 3T9K A; 5FB0 A; 2I50 A; 3HCS A; 2YVR A; 3SUB A; 4YAT A; 5LKU A; 5G04 B; 2L75 A; 4QF3 A; 2UZG A; 2KU3 A; 2OXQ C; 4PPE A; 3RPG C; 3SOU A; 2XOC A; 4YBM A; 2YQL A; 2HDP A; 3PUQ A; 4FJC A; 1E4U A; 2HYE D; 4X3G A; 3SOX A; 1WEW A; 3N9Q A; 1WIM A; 4BHW A; 2VPB A; 5G05 B; 3MDB C; 4I7C A; 1HYI A; 3DQV R; 3DDT A; 4V3L C; 2D8S A; 3M99 A; 2JM3 A; 5B75 A; 2E6S A; 2L43 A; 2EGM A; 2FUU A; 5B8D A; 4N3W A; 2G6Q A; 3O33 A; 2LXP C; 2MNZ A; 5LKX A; 1VYX A; 4GND A; 4R7E A; 5LCW B; 1WEE A; 2XB1 A; 4YAD A; 3O7A A; 1JM7 B; 1T1H A; 1WFK A; 2G43 A; 4AP4 A; 5TBN A; 2KYU A; 2YSM A; 3LQH A; 5H1V A; 2MKE A; 4B7Y C; 2AN6 A; 2FD4 A; 2LXH C; 2JRJ A; 2LGK A; 1DCQ A; 1Z2Q A; 2BAY A; 2JMD A; 3GL6 A; 4OGE A; 3ZTG A; 4OGC A; 2KWO A; 2QJ0 A; 1FP0 A; 1X4J A; 2Y1N A; 3U5M A; 4A4C A; 1LDK C; 3H7H A; 2QIZ A; 2JMI A; 4FK5 A; 5DKA A; 1WEU A; 4LK9 A; 2KR4 A; 3T7L A; 4TKP B; 4I7B A; 3RPG B; 5AIU A; 2L5U A; 1JM7 A; 2KIZ A; 4IC2 A; 5SVX A; 2RSD A; 5KH9 A; 2CRR A; 4WZ3 B; 4ZQL A; 2LN0 A; 3N9P A; 4P5O B; 1V87 A; 3JUE A; 2XOY A; 4BBQ A; 2XP0 A; 1WEV A; 3IHP A; 1DVP A; 3I2D A; 2YHO A; 2QIC A; 2MA5 A; 4AYC B; 4LLB A; 2PUY A; 2LGV A; 4YBT A; 1MM2 A; 1XWH A; 2FSA A; 3FJU B; 2CT2 A; 2F6J A; 1WEM A; 2VPG A; 4GNG A; 4PTB A; 4LJN A; 4LAD B; 2KKX A; 3O36 A; 3LRQ A; 2L80 A; 5TAB A; 2CON A; 4GNF A; 3T6R A; 3E2D A; 4O62 A; 2MNY A; 2MT5 A; 2KWJ A; 2YHN A; 4YAB A; 3M7K A; 2KGG A; 2FFW A; 2EXU A; 2KWK A; 4ZUX U; 2D8U A; 3LJU X; 2LQ6 A; 2H0D A; 3C6W A; 3LQI A; 2XOZ A; 4W4U A; 5D1L B; 3HCU A; 3FEH A; 3VK6 A; 2YYR A; 2L0B A; 4GB0 A; 4AUQ B; 5B79 A; 4MVT A; 4AYC A; 3SOW A; 5LKT A; 4A49 A; 5H1U A; 3L1Z B; 3L11 A; 3ZPV E; 4WZ2 A; 3DPL R; 2ECJ A; 2L7P A; 2XEU A; 3O34 A; 4WZ0 A; 1IYM A; 5LKZ A; 5D1M B; 4XI1 A; 2KGI A; 4V3K C; 5TDR A; 1ZBD B; 4IC3 A; 3LVR E; 3LQJ A; 3N9L A; 3U5O A; 4CCG X; 5EYA F; 2KE1 A; 3ASL A; 5KH3 A; 2VJF A; 3ZYQ A; 3Q1D A; 3M63 A; 3N9O A; 1LDJ B; 3L1X A; 3ZPV 1; 1U6G B; 3O35 A; 5B76 A; 4Q6F A; 1CHC A; 5H1T A; 1WGM A; 2C2V S; 3MHH A; 2EA6 A; 2MIQ A; 5I3L A; 3MHS A; 3ZVY A; 5TRB A; 4QF2 A; 5G0F A; 2E6R A; 2H0D B; 1Z6U A; 3FL2 A; 1VD4 A; 5SVY A; 4A4B A; 1RMD A; 4YAX A; 5B78 A; 1K2F A; 1WE9 A; 2E61 A; 2KRE A; 2B0O E; 5B77 A; 1WEQ A; 5KH7 A; 4YBS A; 2ZET C; 2CSY A; 2LGL A; 1X4I A; 4QQ4 A; 2LV9 A; 4C9Z A; 2LGG A; 3O37 A; 5J3X A; 4R2Y A; 2VP7 A; 2ECV A; 2M1R A; 3KQI A; 4UP5 A; 2KFT A; 5TDW A; 5C11 A; 2PNX A; 3KDE C; 3U5P A; 1N87 A; 3KV5 A; 3ZNI A; 4UI9 B; 2FUI A; 2VPD A; 4MSX A; 2EOD A; 2MD8 C; 1WES A; 4FIP A; 2K4D A; 4S3O C; 2VNF A; 2Y43 A; 2ECW A; 2YU4 A; 3DWD A; 4YC9 A; #chains in the Genus database with same CATH homology 2VJF B; 2K1J A; 2G45 A; 1MM3 A; 2JMJ A; 3M62 A; 2K16 A; 2ECN A; 2YRE A; 2YQM A; 3HCT A; 2MUM A; 2VJE B; 4L58 A; 2ECI A; 4I7D A; 3PUR A; 2YT5 A; 5AIT A; 1FBV A; 2K17 A; 2LRI C; 5H9M A; 3HTK C; 2VPE A; 2C2L A; 3KV6 A; 1WEO A; 4R8P K; 2F6N A; 2EGP A; 4N4F A; 2M85 A; 3RTR B; 1WIL A; 3C5K A; 3ZVZ B; 2M6M A; 5C13 A; 4O64 A; 3SHB A; 1WEP A; 1VFY A; 4UP0 A; 5FB1 A; 5D1K B; 2F42 A; 2ECT A; 1X4U A; 4L7X A; 2KWN A; 5FER A; 2M3H A; 3V43 A; 2LDR A; 2VJE A; 3QZV A; 4NN2 A; 2CKL B; 4F52 B; 4B86 C; 4FO9 A; 2MD7 B; 4A0C D; 2RI7 A; 4AVX A; 4S3O B; 5FEY A; 2DX8 A; 1JOC A; 2YSJ A; 3N9M A; 1G25 A; 3PHD A; 1F62 A; 4ZDT A; 4WA6 A; 1WEN A; 2IDA A; 3EB6 A; 3O70 A; 1HYJ A; 2NAA A; 4LKA A; 2Y1M A; 2YW8 A; 3EB5 A; 2YUC A; 4CA1 A; 3N9N A; 4GNE A; 2CSZ A; 3U5N A; 3GV4 A; 2ECG A; 2MA6 A; 1Z60 A; 5JG6 A; 1BOR A; 3KNV A; 5DIN A; 2CKL A; 3NG2 A; 2YUR A; 5FB0 A; 2I50 A; 3HCS A; 4YAT A; 5LKU A; 5G04 B; 2L75 A; 4QF3 A; 2UZG A; 2KU3 A; 2OXQ C; 4PPE A; 3RPG C; 3SOU A; 4YBM A; 2YQL A; 2HDP A; 3PUQ A; 4FJC A; 1E4U A; 2HYE D; 4X3G A; 3SOX A; 1WEW A; 3N9Q A; 1WIM A; 4BHW A; 2VPB A; 5G05 B; 4I7C A; 1HYI A; 3DQV R; 4V3L C; 2D8S A; 3M99 A; 5B75 A; 2E6S A; 2L43 A; 2FUU A; 5B8D A; 4N3W A; 2G6Q A; 3O33 A; 2LXP C; 2MNZ A; 5LKX A; 1VYX A; 4GND A; 4R7E A; 5LCW B; 1WEE A; 2XB1 A; 4YAD A; 3O7A A; 1JM7 B; 1T1H A; 1WFK A; 2G43 A; 4AP4 A; 5TBN A; 2KYU A; 2YSM A; 3LQH A; 5H1V A; 4B7Y C; 2AN6 A; 2LXH C; 2JRJ A; 2LGK A; 1Z2Q A; 2BAY A; 2JMD A; 3GL6 A; 3ZTG A; 2KWO A; 2QJ0 A; 1FP0 A; 1X4J A; 2Y1N A; 3U5M A; 4A4C A; 1LDK C; 2QIZ A; 2JMI A; 4FK5 A; 5DKA A; 1WEU A; 4LK9 A; 2KR4 A; 3T7L A; 4TKP B; 4I7B A; 3RPG B; 5AIU A; 2L5U A; 1JM7 A; 2KIZ A; 4IC2 A; 2RSD A; 5KH9 A; 4WZ3 B; 4ZQL A; 2LN0 A; 3N9P A; 4P5O B; 1V87 A; 4BBQ A; 1WEV A; 3IHP A; 1DVP A; 3I2D A; 2YHO A; 2QIC A; 2MA5 A; 4AYC B; 4LLB A; 2PUY A; 2LGV A; 4YBT A; 1MM2 A; 1XWH A; 2FSA A; 2CT2 A; 2F6J A; 1WEM A; 2VPG A; 4GNG A; 4PTB A; 4LJN A; 4LAD B; 3O36 A; 3LRQ A; 2L80 A; 5TAB A; 4GNF A; 3T6R A; 2MNY A; 2MT5 A; 2KWJ A; 2YHN A; 4YAB A; 2KGG A; 2KWK A; 4ZUX U; 2LQ6 A; 2H0D A; 3C6W A; 3LQI A; 4W4U A; 5D1L B; 3HCU A; 3VK6 A; 2YYR A; 2L0B A; 4GB0 A; 4AUQ B; 5B79 A; 4MVT A; 4AYC A; 3SOW A; 5LKT A; 4A49 A; 5H1U A; 3L1Z B; 3L11 A; 3ZPV E; 4WZ2 A; 3DPL R; 2ECJ A; 2XEU A; 3O34 A; 4WZ0 A; 1IYM A; 5LKZ A; 5D1M B; 4XI1 A; 2KGI A; 4V3K C; 5TDR A; 1ZBD B; 4IC3 A; 3LQJ A; 3N9L A; 3U5O A; 4CCG X; 5EYA F; 2KE1 A; 3ASL A; 5KH3 A; 2VJF A; 3ZYQ A; 3M63 A; 3N9O A; 1LDJ B; 3L1X A; 3ZPV 1; 1U6G B; 3O35 A; 5B76 A; 4Q6F A; 1CHC A; 5H1T A; 1WGM A; 2C2V S; 3MHH A; 2EA6 A; 2MIQ A; 5I3L A; 3MHS A; 3ZVY A; 5TRB A; 4QF2 A; 5G0F A; 2E6R A; 2H0D B; 1Z6U A; 3FL2 A; 1VD4 A; 4A4B A; 1RMD A; 4YAX A; 5B78 A; 1K2F A; 1WE9 A; 2KRE A; 5B77 A; 1WEQ A; 5KH7 A; 4YBS A; 2ZET C; 2CSY A; 2LGL A; 1X4I A; 2LV9 A; 4C9Z A; 2LGG A; 3O37 A; 5J3X A; 4R2Y A; 2VP7 A; 2ECV A; 2M1R A; 3KQI A; 4UP5 A; 2KFT A; 5TDW A; 5C11 A; 2PNX A; 3U5P A; 1N87 A; 3KV5 A; 3ZNI A; 4UI9 B; 2FUI A; 2VPD A; 4MSX A; 2EOD A; 2MD8 C; 1WES A; 4FIP A; 2K4D A; 4S3O C; 2VNF A; 2Y43 A; 2ECW A; 2YU4 A; 4YC9 A;
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