The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
192
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sequence length |
735
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structure length |
735
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Chain Sequence |
NNLVKTEFTNETLDKIQQTQDLLKKIPKDVLEIYSELGGEIYFTDIDLVEHKELQDLSEEEKNSMNSRGEKVPFASRFVFEKKRETPKLIINIKDYAINSEQSKEVYYEIGKGISLDIISKDKSLDPEFLNLIKSLSDDSDSSDLLFSQKFKEKLELNNKSIDINFIKENLTEFQHAFSLAFSYYFAPDHRTVLELYAPDMFEYMNKLEKGGFEKISESLKKEGVEKDRIDVLKGEKALKASGLVPEHADAFKKIARELNTYILFRPVNKLATNLIKSGVATKGLNVHGKSSDWGPVAGYIPFDQDLSKKHGQQLAVEKGNLENKKSITEHEGEIGKIPLKLDHLRIEELKENGIILKGKKEIDNGKKYYLLESNNQVYEFRISDENNEVQYKTKEGKITVLGEKFNWRNIEVMAKNVEGVLKPLTADYDLFALAPSLTEIKKQIPQKEWDKVVNTPNSLEKQKGVTNLLIKYGIERKPDSTKGTLSNWQKQMLDRLNEAVKYTGYTGGDVVNHGTEQDNEEFPEKDNEIFIINPEGEFILTKNWEMTGRFIEKNITGKDYLYYFNRSYNKIAPGNKAYIEWTDPITKAKINTIPTSAEFIKNLSSIRRSSNVGVYKDSGDKDEFAKKESVKKIAGYLSDYYNSANHIFSQEKKRKISIFRGIQAYNEIENVLKSKQIAPEYKNYFQYLKERITNQVQLLLTHQKSNIEFKLLYKQLNFTENETDNFEVFQKIID
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Lyase/metal binding protein
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| molecule keywords |
Calmodulin-sensitive adenylate cyclase
|
| publication title |
Calcium-independent calmodulin binding and two-metal-ion catalytic mechanism of anthrax edema factor.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bacillus anthracis
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| total genus |
192
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| structure length |
735
|
| sequence length |
735
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature |
ec
4.6.1.1: Adenylate cyclase. |
| pdb deposition date | 2004-09-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF03497 | Anthrax_toxA | Anthrax toxin LF subunit |
| A | PF07737 | ATLF | Anthrax toxin lethal factor, N- and C-terminal domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3 | Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3 | ||
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Collagenase (Catalytic Domain) | Collagenase (Catalytic Domain) | ||
| Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | Adenylylcyclase toxin fold | Anthrax toxin, edema factor, central domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2O36 A; 1K8T A; 3Q2H A; 2OW1 A; 4XCT A; 3Q2G A; 1S26 A; 2ERQ A; 1HY7 A; 2CLT A; 2RJQ A; 2AYK A; 3P24 A; 1PWP A; 2WOA A; 3OHL A; 1GKC A; 1XFV A; 2AIG P; 1HFC A; 1WNI A; 3B8Z A; 1KUF A; 5L7F A; 1SU3 A; 1S4B P; 1Y0V A; 3AYU A; 5I2Z A; 1YRU A; 2OW9 A; 5D7W A; 1JAN A; 1JK3 A; 3F15 A; 3GBO A; 1QUA A; 1Z3J A; 1IAG A; 4L6T A; 966C A; 3KME A; 3E8R A; 3O64 A; 4FXQ A; 4GR0 A; 3LIL A; 5I43 A; 1KUH A; 2HU6 A; 2OVZ A; 1JAQ A; 1G12 A; 5BOT A; 3F18 A; 2DDY A; 3LQ0 A; 5L79 A; 2YB9 A; 2W0D A; 5I12 A; 1ZVX A; 1JIZ A; 3LJZ A; 4DPE A; 3K7L A; 3ZXH A; 5BOY A; 3LE9 A; 3LJG A; 3LUM A; 5BPA A; 1Y93 A; 1QIB A; 1GE5 A; 4PKR A; 4PKQ A; 1IAB A; 2DW0 A; 1JAP A; 3TT4 A; 3O2X A; 3LK8 A; 3OHO A; 4ILW D; 2W12 A; 1QJJ A; 1FM1 A; 1O0T A; 5I0L A; 3HB2 P; 1Y8J A; 3HBV P; 3RTS A; 3UVC A; 4H2E A; 1UTT A; 1XUC A; 3BA0 A; 1ZXC A; 1RM8 A; 4H3X A; 4HMA A; 3LGP A; 1DTH A; 1ZOT A; 1R1I A; 2JSD A; 2OXU A; 4GUY A; 1BZS A; 1B8Y A; 3F19 A; 2MZH A; 1BSW A; 3EHY A; 3KRY A; 2RJP A; 4JQG A; 1CXV A; 4JP4 A; 4PKV A; 1XUD A; 1IAC A; 2OZR A; 1BKC A; 2QPJ A; 4WF6 A; 1IAA A; 4PKS A; 2K2G A; 3NX7 A; 1FBL A; 1PWW A; 3WV3 A; 3LIK A; 3DSL A; 1GO8 P; 5I3M A; 1YRT A; 1IAD A; 1LVC A; 1KUK A; 4XM6 A; 3LUN A; 1XFZ A; 1K90 A; 3AIG A; 1DMT A; 3U1R A; 2OXW A; 1OS9 A; 1K7G A; 2XS3 A; 2ERO A; 4XM8 A; 4JIJ A; 2DW2 A; 2MLS A; 3F17 A; 2JT6 A; 1AKL A; 1AF0 A; 2W14 A; 4H76 A; 1C3I A; 456C A; 1J7N A; 1MMR A; 4FVL A; 4QKZ A; 1HTD A; 1D8M A; 2L0R A; 1HOV A; 1PWV A; 3DWB A; 1ND1 A; 3EDZ A; 1C7K A; 1OM8 A; 4ON1 A; 3ZVS A; 2WO9 A; 1ATL A; 1I73 A; 3LEA A; 1QIA A; 3KEC A; 3DNG A; 3HY7 A; 1CGF A; 1KBC A; 4GWM A; 1CQR A; 1YQY A; 4GQL A; 3L0T A; 4IN9 A; 3TSK A; 1R1J A; 5CUH A; 3DL1 A; 5I4O A; 3DPF A; 1B3D A; 1MNC A; 1PWU A; 1GKD A; 1PK0 A; 2O3E A; 1O0Q A; 830C A; 1JIW P; 2X3B A; 3I7G A; 3WV2 A; 2K9C A; 4XM7 A; 4XBH A; 1BUD A; 3EDG A; 2DW1 A; 2D1N A; 1MMB A; 1SMP A; 1ZXV A; 1ZS0 A; 1UTZ A; 1Q3A A; 4FU4 A; 2COL A; 1ZP5 A; 2USN A; 4H82 A; 2ERP A; 1BKC I; 3AYK A; 1MMQ A; 4R3V A; 4AXQ A; 1G05 A; 5D3C A; 4GWN A; 3LIR A; 1UMT A; 1OO9 A; 4AYK A; 3KHI A; 1K7Q A; 4DF9 A; 1JKY A; 1ROS A; 4ZR5 A; 1CAQ A; 2KRJ A; 3HYG A; 4H84 A; 1RMZ A; 1EUB A; 1SK6 A; 4GF1 A; 4CTH A; 2SRT A; 2W15 A; 2TCL A; 4L63 A; 1I76 A; 3P1V A; 3SHI A; 4A7B A; 2FV9 A; 1OM6 A; 1YOU A; 3LQB A; 3B92 A; 1MMP A; 5D1T A; 3CKI A; 3G5C A; 4JPA A; 1K93 A; 1JH1 A; 1G9K A; 3USN A; 1HV5 A; 3MA2 A; 4H49 A; 1XUR A; 1BUV M; 1KUG A; 1R54 A; 1USN A; 5D1U A; 1K7I A; 3L0V A; 2CKI A; 1D8F A; 1SAT A; 2JIH A; 2JNP A; 3LMC A; 1IAE A; 5D1S A; 1CK7 A; 4I35 A; 4A3W A; 2Y6C A; 3G42 A; 5B5O A; 2Y6D A; 3TS4 A; 1FLS A; 1YCM A; 4PKU A; 4IUW A; 1D5J A; 3DPE A; 3VTG A; 1AST A; 2XS4 A; 4G0D A; 5CZM A; 3WV1 A; 1BKC E; 4AIG A; 3KEJ A; 2OXZ A; 3K7N A; 4EFS A; 2DDF A; 1EB6 A; 1XFW A; 1OS2 A; 1QJI A; 2E2D A; 1CGL A; 1KUI A; 4PKT A; 2OY4 A; 3F1A A; 4WKI A; 1OM7 A; 4G9L A; 1GE6 A; 3EHX A; 1PWQ A; 1XFU A; 1ZTQ A; 5LAB A; 1A85 A; 3KMC A; 4WKE A; 2POJ A; 4AUO A; 3VI1 A; 4GR3 A; 1JAO A; 1BQO A; 2PJT A; 1BIW A; 3HDA P; 1CGE A; 3HY9 A; 4IJO A; 5CXA A; 2I47 A; 1UEA A; 3V96 B; 3HDB A; 5H8X A; 1CIZ A; 2OW0 A; 1AYK A; 3N2V A; 4JA1 A; 4GR8 A; 2E3X A; 2YIG A; 1G49 A; 5D2B A; 2J0T A; 3KEK A; 2FV5 A; 2WO8 A; 1XFY A; 2W13 A; 1SRP A; 1GXD A; 1YP1 A; 3LKA A; 2OI0 A; 1QIC A; 4WZV A; 2JT5 A; 1XFX A; 1OMJ A; 3RTT A; 4WK7 A; 1C8T A; 1R55 A; 3EWJ A; 2D1O A; 1L6J A; 3N2U A; 3I7I A; 4Q1L A; 4H1Q A; 1BM6 A; 2V4B A; 4HX3 A; 3KWV C; 2X3C A; 2OVX A; 1KAP P; 4H30 A; 1BQQ M; 1A86 A; 2N8R A; 1H71 P; 2J83 A; 4PKW A; 2OW2 A; 4DD8 A; 5B5P A; 1SLM A; 1HFS A; 2MZE A; 2Z2D A; 3TVC A; 4L19 A; 2MLR A; 2A8H A; 1UMS A; 2OY2 A; 1JJ9 A; 1GO7 P; 3ELM A; 3F16 A; 3EDI A; 3HBU P; 4DV8 A; 1GE7 A; 3ZUK A; 2X7M A; 3EDH A; 1SLN A; 1D7X A; 1R1H A; 3B2Z A; 4FXY P; 2X3A A; 4J4M A; 1G4K A; 3LJT A; 4I03 A; 5JMY A; 1I1I P; 2MZI A; 1EAK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2R05 A; 2O36 A; 1K8T A; 3Q2H A; 3FCJ A; 2OW1 A; 3UU9 A; 3Q2G A; 4XCT A; 5BRK A; 1S26 A; 2ERQ A; 1HY7 A; 2CLT A; 2RJQ A; 2AYK A; 2PO4 A; 3P24 A; 1PWP A; 4L7A A; 1UDY A; 2WOA A; 3VAD A; 4L38 A; 2Q8I A; 1RP3 A; 2Z1Q A; 3OHL A; 1GKC A; 1EGE A; 2DDH A; 1XFV A; 5J6A A; 2AIG P; 1HFC A; 2CJ5 A; 3NF4 A; 1WNI A; 3B8Z A; 1KUF A; 5L7F A; 1SU3 A; 2AO2 A; 3F29 A; 3AFF A; 3HWC A; 1S4B P; 1Y0V A; 3AYU A; 5I2Z A; 4MP2 A; 5B5W A; 1YRU A; 2OW9 A; 3C46 A; 5D7W A; 1JAN A; 4L3Y A; 1JK3 A; 2FP2 A; 3F15 A; 3GBO A; 4XVX A; 1W07 A; 1QUA A; 1Z3J A; 5J71 A; 2E80 A; 4KSA A; 1IAG A; 2ZDX A; 4MPC A; 4V26 A; 3X29 A; 4L6T A; 966C A; 3KME A; 2RFQ A; 3E8R A; 3O64 A; 2JBR A; 4Q5C A; 4FXQ A; 2RF7 A; 4AKI A; 4GR0 A; 3LIL A; 5I43 A; 1KUH A; 2HU6 A; 2OVZ A; 1JAQ A; 1G12 A; 2Q8H A; 3RKH A; 1X90 A; 5BOT A; 5K3I A; 3F18 A; 2DDY A; 3LQ0 A; 5L79 A; 2YB9 A; 3DTK A; 1JM6 A; 3BNF A; 2W0D A; 5I12 A; 4ZXV A; 4QIC A; 4H7Q A; 1ZVX A; 1GKX A; 1Y8P A; 1JIZ A; 3BNJ A; 4FF3 A; 2C12 A; 3LJZ A; 4G97 A; 4KCF A; 4Q5B A; 4DPE A; 3Q24 A; 2VIG A; 3K7L A; 3ZXH A; 5BOY A; 3LE9 A; 2R02 A; 3LJG A; 4LQQ B; 4H81 A; 3LUM A; 5BPA A; 1Y93 A; 1QIB A; 2J7A A; 1GE5 A; 4PKR A; 4DOY A; 2JIF A; 4PKQ A; 2PG0 A; 4NXL A; 4E02 A; 2D29 A; 1IAB A; 2DW0 A; 1JAP A; 3TT4 A; 1SIQ A; 4F0X A; 3O2X A; 2CJ8 A; 3LK8 A; 3OHO A; 4ILW D; 2ZAF A; 2W12 A; 1QJJ A; 1FM1 A; 1O0T A; 5I0L A; 3HB2 P; 1OAH A; 1Y8J A; 3HBV P; 4N5F A; 3RTS A; 1FS9 A; 1RJ4 A; 3UVC A; 4H2E A; 1UTT A; 1XUC A; 3UBR A; 2PNR A; 2UXW A; 3BA0 A; 4MPE A; 1ZXC A; 1RM8 A; 4H3X A; 4HMA A; 3EOM A; 3LGP A; 1DTH A; 1ZOT A; 2BU8 A; 1R1I A; 2XS1 A; 3BNG A; 1QDB A; 2JSD A; 1R3B A; 2OXU A; 4GUY A; 1BZS A; 1B8Y A; 3F19 A; 3DTI A; 4FF4 A; 4OO2 A; 2MZH A; 1BUC A; 2AZE A; 1BSW A; 3EHY A; 4IV6 A; 3KRY A; 2RJP A; 1U8V A; 4MPN A; 4JQG A; 5K3H A; 1CXV A; 2E81 A; 4JP4 A; 4PKV A; 3AFE A; 1XUD A; 1IAC A; 4LQS B; 2OZR A; 2JBT A; 3LGQ A; 1BKC A; 5M4K A; 2QPJ A; 1IAA A; 4WF6 A; 4PKS A; 2K2G A; 3NX7 A; 1FBL A; 1OZ9 A; 1PWW A; 3WV3 A; 3LIK A; 3DSL A; 1GO8 P; 5I3M A; 1YRT A; 1IAD A; 1LVC A; 1KUK A; 4XM6 A; 2YYG A; 3LUN A; 1XFZ A; 1K90 A; 3D9D A; 3AIG A; 1DMT A; 3U1R A; 2CJ7 A; 3SF6 A; 2OXW A; 1XM5 A; 1OS9 A; 1K7G A; 1WS9 A; 2XS3 A; 2ERO A; 4XM8 A; 3SCE A; 4JIJ A; 2DW2 A; 2MLS A; 4FF1 A; 3F17 A; 2JT6 A; 3D9G A; 1AKL A; 1AF0 A; 2W14 A; 2BTZ A; 4H76 A; 5B5V A; 1C3I A; 456C A; 1J7N A; 4Q1O A; 3PFD A; 4E00 A; 1MMR A; 4FVL A; 4QKZ A; 1HTD A; 1D8M A; 2L0R A; 1HOV A; 1PWV A; 3DWB A; 1XAX A; 1ND1 A; 3MKH A; 3EDZ A; 3MMO A; 1C7K A; 1OM8 A; 4ON1 A; 3ZVS A; 2WO9 A; 4AI6 A; 1ATL A; 1I73 A; 3LEA A; 2HJN A; 1QIA A; 3KEC A; 3X0X A; 3DNG A; 3D1I A; 3HY7 A; 1CGF A; 4P79 A; 1KBC A; 3C2P A; 1CQR A; 1YQY A; 4GQL A; 4GWM A; 1PI1 A; 3VKG A; 2BU6 A; 1FS7 A; 3L0T A; 4IN9 A; 3TSK A; 1R1J A; 5CUH A; 3DL1 A; 4ZYJ A; 5I4O A; 3DPF A; 5GJW E; 1B3D A; 1MNC A; 1PWU A; 1GKD A; 1PK0 A; 2ZDY A; 2O3E A; 1O0Q A; 3N0R A; 830C A; 4AKG A; 1JIW P; 2X3B A; 3I7G A; 3WV2 A; 2K9C A; 4XM7 A; 4XBH A; 1BUD A; 2YYL A; 3P4T A; 3EDG A; 4Q0T A; 2DW1 A; 2D1N A; 3EON A; 3FO3 A; 1MMB A; 3M9V A; 1SMP A; 1ZXV A; 1ZS0 A; 1UTZ A; 1Q3A A; 4FU4 A; 5M4P A; 2COL A; 1ZP5 A; 1GKZ A; 2USN A; 4H82 A; 2ERP A; 2DVL A; 3Q22 A; 1BKC I; 4MP7 A; 3GNC A; 3AYK A; 1MMQ A; 5GJV E; 3SWO A; 4L3X A; 3CE2 A; 4R3V A; 2XQR B; 4AXQ A; 1G05 A; 2YGW A; 5D3C A; 4GWN A; 3LIR A; 5BRM A; 1UMT A; 1OO9 A; 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