The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
108
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structure length |
108
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Chain Sequence |
GSHMATVSVFPGARLLTIGDANGEIQRHAEQQALRLEVRAGPDAAGIALYSHEDVCVFKCSVSRETECSRVGRQSFIITLGCNSVLIQFATPHDFCSFYNILKTCRGH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase,gene regulation
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| source organism |
Rattus norvegicus
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| publication title |
Functional insights from structures of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 domains.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Histone-arginine methyltransferase CARM1
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| total genus |
22
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| structure length |
108
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| sequence length |
108
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
2.1.1.319: Type I protein arginine methyltransferase. |
| pdb deposition date | 2007-01-31 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF11531 | CARM1 | Coactivator-associated arginine methyltransferase 1 N terminal |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | PH-domain like | Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1H10 A; 1WI1 A; 4YL8 A; 1ISN A; 3DXC A; 5EFX A; 3V5W A; 1XX0 A; 1U5F A; 1BWN A; 4Y94 A; 2D9W A; 5JHH A; 3QWM A; 3D8F A; 1UNR A; 1U2B A; 2RGN B; 5J3Q A; 3ULC A; 3GYO A; 2D11 A; 1EGX A; 1OY2 A; 1M7E A; 4K2P A; 5LOP B; 3U7D A; 1DDW A; 1EAZ A; 2MFQ A; 4HHV A; 3KSY A; 4A6F B; 2DX1 A; 2N0Y A; 1LW3 A; 2CAY A; 4WVF B; 4A6H A; 4GXB A; 2KUP A; 2Y8G A; 2AL6 A; 1WJ1 A; 1XCG A; 3KY9 A; 2D9Z A; 4PQ0 A; 1QQG A; 5C6R A; 3TFM A; 4DX9 0; 1K5D B; 5J3Y A; 4GZU A; 5DIF B; 4HB2 B; 3SO6 A; 3A8Q A; 3HQC A; 4YON A; 2UZS A; 2OTX A; 4GPT B; 1V89 A; 1PMS A; 2JP2 A; 3MDB C; 1FB8 A; 2RVB B; 4ZRK A; 5C16 A; 4KHA A; 1X86 A; 1V5M A; 4F7G A; 3PSC A; 3GYP A; 1KZ7 A; 1UNQ A; 5KQ4 A; 2YT0 A; 1M7R A; 2Z0O A; 1BTN A; 4GMV A; 5D27 A; 2L1C A; 4ZRI A; 5D3W A; 1ZC3 B; 3PZD A; 1KI1 B; 3F5R A; 5DH9 B; 2LUL A; 2MKR A; 3TW1 A; 3ULB A; 3AJ4 A; 2RUK B; 4PNK A; 3ZVR A; 1DDV A; 5C79 A; 2P8V A; 3BIN A; 4EJN A; 1N3H A; 4HAV B; 1OMW A; 2R0D A; 4P7I A; 2GJY A; 1J0W A; 4TKN A; 1AQC A; 5DHF B; 3A98 B; 1UPQ A; 2QKL A; 2EC1 A; 4DX8 A; 3MPX A; 2HE7 A; 2LOX A; 1E5W A; 1AWE A; 2DA0 A; 1ZVR A; 2L2I A; 1GG3 A; 1W1H A; 3PVU A; 2V76 A; 1DBH A; 1OQN A; 5FI0 A; 3PP2 A; 1XD4 A; 3KZ1 A; 5KQ1 A; 1RJ2 A; 3A8P A; 2COD A; 3SUZ A; 2QKM A; 3OAN A; 2D4Q A; 2P0H A; 2ZPY A; 3O96 A; 4K2O A; 1MAI A; 1Q67 A; 3IVF A; 2DX5 A; 2DN6 A; 4HAT B; 2COF A; 1P3R A; 5D3V A; 3FEH A; 5DHA B; 1B55 A; 4KHO A; 3SNH A; 3NSU A; 3SV1 A; 2DKQ A; 2J0K A; 2COA A; 2KCJ A; 1XOD A; 3AU4 A; 2MWN B; 4HB4 B; 4A5K A; 3P7Z A; 1H4R A; 5L81 A; 1ZM0 A; 1XKE A; 1PLS A; 2DTC A; 4HDO A; 3G9W A; 2DYN A; 5D3Y A; 3CIK A; 2DHI A; 5GOW B; 2ROV A; 3ODO A; 3WA0 A; 3TO1 A; 2W2X D; 1V5P A; 1WGQ A; 5D3X A; 2W2X C; 3FM8 C; 2Z0Q A; 2MDX A; 3BJI A; 2YS1 A; 3VIA A; 1V88 A; 4KVG B; 1XR0 B; 2NMB A; 3UZT A; 2VRW B; 2CY5 A; 4MT7 A; 1UNP A; 3AU5 A; 2GCJ A; 2RSG A; 1LB1 A; 3DXE A; 4NY0 A; 3PVL A; 4MK0 A; 4WJ7 A; 5HE2 A; 4HB0 B; 4CHM A; 1FGZ A; 2D9Y A; 2IYB A; 2OQB A; 1BAK A; 2D9X A; 4F7U P; 3HK0 A; 3RCP A; 1TQZ A; 4A6K A; 2VKI A; 1NTY A; 4HAY B; 1KZG A; 2IFS A; 4Z2M B; 1P6S A; 5JP4 A; 1NU2 A; 2LKO A; 4IOY X; 1BTK A; 1ZC4 B; 3PVW A; 4A6F A; 2FJL A; 1NTV A; 5LON B; 1MKE A; 2KGX B; 1I7A A; 2GCL A; 2K2J A; 2LG1 A; 3DXD A; 2K00 A; 2YVC A; 4ZRJ A; 1UPR A; 4DBB A; 1FHO A; 2H7E A; 4KHB B; 3ODW A; 2D10 A; 2E2X A; 3X23 A; 1DRO A; 1FOE A; 1I2H A; 1DDM A; 2EMS A; 4TYZ A; 1K5G B; 2DKP A; 1DYN A; 2M14 A; 5DI9 B; 2LYD A; 4L6E A; 1WJM A; 2XQN M; 3ML4 A; 1U27 A; 1UEF A; 4F7H A; 1FHX A; 4GMX B; 1EVH A; 2I1J A; 3TCA A; 4EKU A; 5JHG A; 4HAX B; 1Y19 B; 1Z87 A; 4XWX A; 2YT1 A; 4EMO A; 2GS0 A; 1FHW A; 2ELB A; 2UVM A; 3M1I B; 2COC A; 2D9V A; 4D0N B; 3CXB B; 4GN1 A; 2ROZ B; 4IFS A; 2HTH B; 5C5B A; 3FSS A; 1MPH A; 2LOZ A; 4HB3 B; 1U5D A; 2P0D A; 1FGY A; 4HAU B; 3SYX A; 2D2Q A; 1X1G A; 2UZR A; 2YRY A; 1ZSQ A; 1V61 A; 5KCV A; 2VSZ A; 1X11 A; 4B6H A; 2CRF A; 1GC7 A; 2DHK A; 2DHJ A; 1WVH A; 2W2W A; 4H8S A; 4DXA B; 1MIX A; 5CLL B; 3U8Z A; 2I1K A; 1W1G A; 3TVV A; 3D8E A; 2M38 A; 1PFJ A; 4IAP A; 4Z2N A; 2N23 A; 2BCJ A; 2J59 M; 1MK9 B; 1RRP B; 3LJU X; 4KAX B; 2X18 A; 3F0W A; 1FAO A; 2Y8F A; 3PG7 A; 3P6A A; 1V5U A; 1WGU A; 3VOQ A; 1U29 A; 1EF1 A; 3WYF B; 2P0F A; 1U5G A; 4HAZ B; 5HE0 A; 5HE1 A; 4HDQ A; 5HE3 A; 4K81 A; 1U5E A; 1X1F A; 2I5F A; 4NSW A; 4MY6 A; 4HAW B; 2K2U A; 1MK7 B; 1SGH A; 2ELA A; 4WSF A; 2H7D A; 1QC6 A; 1TXD A; 2Q13 A; 2J0M A; 2YS3 A; 3ODX A; 2J0J A; 2DYQ A; 2I5C A; 3PEG A; 3KRW A; 2AEH A; 2RNR B; 1NI2 A; 2ADZ A; 5FI1 A; 2YF0 A; 5J3T A; 5C5B B; 4C0A A; 3D8D A; 1GC6 A; 4CYE A; 2YSZ A; 2DFK A; 3QIJ A; 2G35 A; 2PZ1 A; 1WG7 A; 5JLJ B; 1TJ6 A; 3N7C A; 1W1D A; 1P5T A; 2DLW A; 2CY4 A; 4CHJ A; 2Z0P A; 3T06 A; 2YS5 A; 2EJ8 A; 2NZ8 B; 1IRS A; 1Y5O A; 4K17 A; 1X05 A; 2R09 A; 3HW2 B; 1J19 A; 3KRX A; 3QBV B; 4BBK A; 2Y7B A; 2EMT A; 3ZDT A; 1MIZ B; 2RLO A; 5CLQ B; 1SHC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1H10 A; 1WI1 A; 4YL8 A; 1ISN A; 3DXC A; 5EFX A; 3V5W A; 1XX0 A; 1U5F A; 1BWN A; 4GOU A; 4KHB A; 5I2M A; 4Y94 A; 2D9W A; 5JHH A; 3QWM A; 3D8F A; 1UNR A; 1U2B A; 3NW8 A; 2RGN B; 5J3Q A; 3ULC A; 3GYO A; 2D11 A; 1EGX A; 1OY2 A; 1M7E A; 4K2P A; 5IRS A; 5LOP B; 3U7D A; 4QJ3 B; 4GNK B; 1DDW A; 1EAZ A; 2MFQ A; 4HHV A; 3KSY A; 4A6F B; 2DX1 A; 2KUQ A; 2N0Y A; 1LW3 A; 2CAY A; 4WVF B; 4A6H A; 3A58 A; 4GXB A; 2KUP A; 2Y8G A; 2AL6 A; 1ZYI A; 1WJ1 A; 1XCG A; 3KY9 A; 2D9Z A; 4PQ0 A; 1QQG A; 5C6R A; 3TFM A; 4DX9 0; 1K5D B; 5J3Y A; 2FJU B; 4GZU A; 5DIF B; 4HB2 B; 3SO6 A; 3A8Q A; 3HQC A; 4YON A; 2UZS A; 2OTX A; 4GPT B; 1V89 A; 1PMS A; 4CSQ A; 2Z59 A; 2JP2 A; 3MDB C; 1FB8 A; 2RVB B; 4ZRK A; 5M4Y B; 5C16 A; 4KHA A; 1X86 A; 1V5M A; 4F7G A; 3PSC A; 3GYP A; 1KZ7 A; 1UNQ A; 5KQ4 A; 2YT0 A; 1M7R A; 2Z0O A; 1BTN A; 4GMV A; 5D27 A; 2L1C A; 4ZRI A; 5D3W A; 1ZC3 B; 3PZD A; 1KI1 B; 3F5R A; 5DH9 B; 2LUL A; 2MKR A; 3TW1 A; 3ULB A; 3AJ4 A; 1MI1 A; 2RUK B; 4PNK A; 3ZVR A; 2KIE A; 1DDV A; 5C79 A; 2P8V A; 3BIN A; 4EJN A; 1N3H A; 4HAV B; 1OMW A; 2R0D A; 4P7I A; 5I2S A; 2GJY A; 1J0W A; 4TKN A; 2Z14 A; 1AQC A; 3U12 A; 5DHF B; 3A98 B; 1UPQ A; 4OT1 A; 2QKL A; 2EC1 A; 4DX8 A; 3MPX A; 2HE7 A; 2LOX A; 1E5W A; 1AWE A; 2DA0 A; 1ZVR A; 2L2I A; 1GG3 A; 1W1H A; 3PVU A; 2V76 A; 1DBH A; 1OQN A; 5FI0 A; 3PP2 A; 1XD4 A; 3KZ1 A; 4DIX A; 5KQ1 A; 1RJ2 A; 3A8P A; 2COD A; 3SUZ A; 2QKM A; 3OAN A; 2D4Q A; 2P0H A; 2ZPY A; 3O96 A; 4K2O A; 1MAI A; 1Q67 A; 3IVF A; 2DX5 A; 2DN6 A; 4HAT B; 2COF A; 1P3R A; 5D3V A; 2K49 A; 3FEH A; 5DHA B; 1B55 A; 4KHO A; 3SNH A; 2RRF A; 3NSU A; 3SV1 A; 2DKQ A; 2J0K A; 2COA A; 2KCJ A; 1XOD A; 3AU4 A; 2MWN B; 4QJ5 B; 4HB4 B; 4A5K A; 2GUM A; 3P7Z A; 1H4R A; 5L81 A; 1ZM0 A; 4HSI A; 1XKE A; 1PLS A; 3HIE A; 2DTC A; 4HDO A; 3G9W A; 2DYN A; 5D3Y A; 3CIK A; 2DHI A; 5GOW B; 2ROV A; 3ODO A; 3WA0 A; 3TO1 A; 2W2X D; 1V5P A; 1WGQ A; 5D3X A; 2W2X C; 3FM8 C; 2Z0Q A; 3DCX A; 2MDX A; 3BJI A; 2YS1 A; 3VIA A; 1V88 A; 3NWD A; 4KVG B; 1XR0 B; 2Z13 A; 2NMB A; 2R2Y A; 3UZT A; 2VRW B; 2CY5 A; 4MT7 A; 1UNP A; 3AU5 A; 2GCJ A; 2RSG A; 1LB1 A; 3DXE A; 4NY0 A; 3PVL A; 4MK0 A; 4WJ7 A; 5HE2 A; 4HB0 B; 4CHM A; 1FGZ A; 2D9Y A; 2IYB A; 2OQB A; 1BAK A; 2D9X A; 3NWA A; 4F7U P; 3HK0 A; 3RCP A; 1TQZ A; 4A6K A; 2VKI A; 1NTY A; 4HAY B; 4QXA B; 1KZG A; 2IFS A; 4Z2M B; 1P6S A; 5JP4 A; 1NU2 A; 2LKO A; 4IOY X; 1BTK A; 1ZC4 B; 3PVW A; 4A6F A; 2FJL A; 1NTV A; 5LON B; 1MKE A; 2KGX B; 1I7A A; 2GCL A; 2K2J A; 2LG1 A; 3DXD A; 2K00 A; 2YVC A; 4ZRJ A; 1UPR A; 4DBB A; 1FHO A; 5LG4 B; 2H7E A; 4KHB B; 3ODW A; 2D10 A; 2E2X A; 3X23 A; 1DRO A; 1FOE A; 2KR0 A; 1I2H A; 1DDM A; 2EMS A; 2KIG A; 4TYZ A; 4D6W A; 1K5G B; 2DKP A; 1DYN A; 2M14 A; 2NBV A; 5DI9 B; 2LYD A; 4L6E A; 1WJM A; 2XQN M; 3ML4 A; 1U27 A; 1UEF A; 4F7H A; 1FHX A; 4GMX B; 1EVH A; 2I1J A; 3TCA A; 4EKU A; 5JHG A; 4HAX B; 1Y19 B; 1Z87 A; 4QJ4 B; 4XWX A; 2YT1 A; 4EMO A; 2GS0 A; 1FHW A; 2ELB A; 2UVM A; 3M1I B; 2COC A; 2D9V A; 4D0N B; 3CXB B; 4GN1 A; 2ROZ B; 4IFS A; 2HTH B; 5C5B A; 3FSS A; 1MPH A; 2LOZ A; 4HB3 B; 1U5D A; 2P0D A; 1FGY A; 4HAU B; 3SYX A; 2D2Q A; 1X1G A; 2K8E A; 2UZR A; 2YRY A; 1ZSQ A; 1V61 A; 5KCV A; 2VSZ A; 1X11 A; 4B6H A; 2CRF A; 1GC7 A; 2DHK A; 3FVC A; 2DHJ A; 1WVH A; 3NWF A; 2W2W A; 4H8S A; 4DXA B; 1MIX A; 5CLL B; 3U8Z A; 2I1K A; 1W1G A; 3TVV A; 3D8E A; 2M38 A; 1PFJ A; 4IAP A; 4Z2N A; 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