2KR0A

Solution structure of the proteasome ubiquitin receptor rpn13
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
407
structure length
407
Chain Sequence
MTTSGALFPSLVPGSRGASNKYLVEFRAGKMSLKGTTVTPDKRKGLVYIQQTDDSLIHFCWKDRTSGNVEDDLIIFPDDCEFKRVPQCPSGRVYVLKFKAGSKRLFFWMQEPKTDQDEEHCRKVNEYLNNPPMPGALGASGSSGHELSALGGEGGLQSLLGNMSHSQLMQLIGPAGLGGLGGLGALTGPGLASLLGSSGPPGSSSSSSSRSQSAAVTPSSTTSSTRATPAPSAPAAASATSPSPAPSSGNGASTAASPTQPIQLSDLQSILATMNVPAGPAGGQQVDLASVLTPEIMAPILANADVQERLLPYLPSGESLPQTADEIQNTLTSPQFQQALGMFSAALASGQLGPLMCQFGLPAEAVEAANKGDVEAFAKAMQNNAKPEQKEGDTKDKKDEEEDMSLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1
publication title Structure of Proteasome Ubiquitin Receptor hRpn13 and Its Activation by the Scaffolding Protein hRpn2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding
total genus 63
structure length 407
sequence length 407
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04683 Proteasom_Rpn13 Proteasome complex subunit Rpn13 ubiquitin receptor
A PF16550 RPN13_C UCH-binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.29.70 Mainly Beta Roll PH-domain like PH-domain like 2kr0A01
3.40.190.140 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2kr0A02
2Z4DA 2NBVA 5IRSA 2R2YA 2L5VA 2KQZA 2MKZA 2Z59A 2KR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DWAA 1XODA 2RKMA 3LSXA 2X18A 2XXUA 1LCTA 4OXVA 3QMFA 4U21A 2K8EA 3LV0A 3DLNA 2NWJA 4IY6A 4FORA 1NV5A 1MQDA 1JVYA 1UNPA 2VPNA 4O3CA 1Y5OA 2K2JA 1DK4A 4GMXB 1NV2A 1UTHA 5IZ3B 2HE7A 2XWIA 1R9QA 5IZ1A 1MQGA 4CSQA 3QYTA 1LLSA 4NF0A 4NX1A 5EFXA 2HFBA 4NHBA 4CHMA 4GMVA 3FVGA 1OVBA 3U1OA 2W2XC 4P3LA 3OSRA 3K00A 2Z13A 2I1KA 5CLLB 2Z23A 1NKXA 3O97A 3TCHA 2P0DA 3K6WA 3KSXA 4EQ9A 5B70A 4P0GA 1AWBA 2UYEA 2PX1A 4HE0A 1PC3A 5D3WA 4KQPA 3LUZA 3WAFA 1N7WA 3FXUA 3RQTA 2Q2AA 4RA1A 1SW5A 3P7IA 4G61A 3B6QA 4GXAA 1M5FA 4KCCA 2XXRA 2L1CA 1MQHA 2D4QA 5KCVA 5DVIA 2P0FA 1Y1ZA 2UYFA 5I2NA 4P47A 1IMAA 1B40A 2KLFA 2HPGA 3IFCA 2NZ8B 5JHGA 3CR9A 3V8XB 4DX90 3U7DA 2YF0A 4GX6A 3PUWE 1FBCA 1GR2A 2F36A 4R6KA 2CAYA 4NF6B 2A5TB 2L5VA 3M1IB 1U5DA 2W2WA 3RGYA 2CRFA 3X23A 4GWWA 4IOYX 1JETA 3QAXA 3MPXA 1I6QA 3CFXA 1KZGA 5DI9B 2NUVA 3DXDA 4PF6A 1FQCA 1Y3PA 2CY4A 1UEFA 3V83A 2IA4A 1OQGA 4MLVA 4NWDA 3ZSFA 4P9KA 4MCOA 4OMBA 3IB1A 4G8NA 1Y9UA 4JB7A 4TLMB 3O66A 1V5UA 1JW4A 2YLNA 3OOAA 1WJMA 1R6ZA 4NF8B 1B58A 2QKMA 2XXIA 2H5YA 3TPAA 1M5EA 4NY0A 2YVCA 4ZEIA 1Y4CA 1QULA 4OVJA 2BCJA 4JWXA 5CI5A 4YMBA 2CZIA 2Y8GA 4YZZA 2V3UA 3HSTA 3MPKA 3CFZA 1PBPA 1LBXA 1B32A 3KC0A 2RUKB 3M3FA 4XKNA 2HXRA 4MMPA 1A99A 4OVQA 3FVOA 4PE5B 2Y7PA 5ITOA 3KZGA 3PPQA 4KHZE 4KPTA 1PMSA 3G9WA 4P1EA 4X1BA 1CE2A 2M38A 2V4CA 5H8NB 1MXVA 1FPDA 4N07A 4HAWB 1FPEA 1MXUA 2DE4A 4ESXA 3DXEA 1IXCA 4G68A 2PMSA 2F34A 1NNKA 3A29A 3KEIA 4I3YA 3RUMA 1SYIA 4KD5A 3PUZE 4E0WA 4R6YA 3PUVE 5J3YA 2DKPA 3QUFA 2OZZA 4QSEA 3GBAA 2N23A 4A6FA 3O29A 1JVXA 4PQ0A 3FM8C 4THIA 2UVHA 3FJ7A 5DTBA 3TTMA 2Y7KA 5I5PA 2B4LA 2QVVA 1URSA 5TPAA 4PC9A 5H8HB 1X1FA 1WDNA 2RC7A 4OHNA 2AL6A 1FB8A 1VDWA 4RY1A 4AQ4A 3GZGA 4HHVA 4BDQA 4R75A 4I9DA 3PZDA 4WEDA 3M3KA 5H8QA 1FJ9A 5ET6A 1UPRA 2HXWA 4OVRA 4MFIA 4H46A 2ELBA 1UQWA 1NNPA 3HPIA 4WXJA 2CZHA 3L6GA 2R9JA 2RC8A 3TO1A 3E13X 4L1RA 4F2OA 4LN5A 3PEGA 4HE2A 4IY5A 2BJJX 4FIMA 3MPLA 2VT5A 4ZRIA 4PAFA 1D3KA 1S7YA 3FASA 2ZYNA 3SYXA 2WYKA 4QFKA 1YAEA 1WI1A 3BINA 1D4NA 3TEPA 3B6WA 3DM0A 2F97A 1MDP1 5I56A 1B55A 4PBHA 2HQ0A 4PAKA 2Z0OA 2EMTA 4RJZA 4PTKA 1USYH 2J0KA 2Q74A 3I5OA 3CXBB 2N0YA 1Z7ME 1POY1 2RRFA 3IR1A 5AE4A 1LFHA 3ODBA 5J16A 2QS4A 4KR5A 1MAIA 4C0RA 5AA3A 1EYKA 2HHMA 3KOTA 2DE3A 2DXYA 2IEEA 4DI4B 2DWJA 4Z7EA 3FVNA 4QRZA 2MDXA 5EQ9A 4F2QA 2KQZA 4F1UA 3HQCA 4Q8RA 3QWMA 3CSGA 4RK9A 1X11A 5EQ8A 2CY5A 3TTKA 2X26A 1J19A 3AU4A 3I6VA 1PFJA 4BDMA 4F1VA 2O1MA 1IEJA 4OVPA 2AL5A 1PB9A 2VPOA 5IZZA 5KZTA 2I5CA 2V3TA 3F5RA 1A7LA 3GYYA 1BIYA 4RNSA 1N0TA 3MVWA 1XVXA 1NFTA 3K6VA 4JSDA 4PP0A 1M5CA 1YPNA 4IB2A 2RCAA 1LCFA 4PBQA 1DBHA 1NH7A 1A40A 1G0IA 2XWOA 4PQJA 3G3KA 4GZUA 5M2VA 3O9PA 1OMWA 4KXPA 1OMPA 4HAXB 2REGA 4F18A 1LBZA 3FXQA 4GFRA 4NSWA 5FTIA 1RYXA 2DHJA 4A6KA 4ZEBA 4ELRA 4N91A 1MXZA 2PFYA 2IFSA 3GXAA 1GVCA 5CMKA 1P1OA 4N8YA 1K5GB 3B8BA 5JTYB 1N3XA 2G29A 1MKEA 2ZZVA 3B7DA 4DIGA 1I6AA 4IAPA 2NMBA 3TTNA 1LB1A 1MY2A 3TCAA 3A8PA 5ICQA 1A55A 5CMBA 2PVUA 4OTEA 2WBBA 2F7AA 1KZ8A 3TYHA 3T0JA 1V5PA 2PCRA 2DOJA 1B0HA 4ZECA 1NTYA 2YSZA 3FATA 5AA4B 3MP1A 3RN8A 2BJIA 4O3AA 4F7UP 1QUKA 5I7IA 4OESA 4HATB 3IAZA 1UPQA 5ET7A 5T3JA 5FBPA 4GNKB 3OO9A 4U4XA 2YS1A 4MJOA 3D8FA 4PFYA 1LBWA 1LB8A 1P3RA 4IO6A 3KRXA 2KIEA 3D4GA 2GHBA 2AL4A 3H6UA 3N5LA 2O6AA 3MP6A 1ZLQA 2YS5A 2ZZWA 5CBSA 1M7RA 4OQOA 3RNNA 3VVEA 5DHAB 2I4BA 4LQ2A 3V5WA 1DCUA 1FBPA 1ATGA 3W9VA 1PB8A 1TQZA 5I57A 1JNFA 1XKEA 4MEVA 2UVMA 2PBWA 3FVKA 3CHGA 3PVWA 4GOTA 1EVHA 3KSJA 5FHMA 1NUZA 1QC6A 4QSCA 1X86A 5FHNA 3PVUA 2XHDA 1A54A 3SESA 3EHSA 3JZJA 2CEYA 1MK9B 2K49A 1KA0A 5C5BA 4XKPA 1MY1A 3FV1A 4HE1A 3VIAA 3ZKKA 1QJMA 4F1YA 3N7CA 1QKAA 1GC6A 2W7YA 4HTGA 1FBFA 1LGBC 3IOUA 4OANA 5TP9B 3PP2A 2D9ZA 4N8GA 4U1ZA 4JWOA 4DE8A 4Q0CA 4FE8A 4NF4B 5KDTA 1NV1A 4GN1A 2LOXA 1BWNA 2I6EA 4OEUA 5CM6A 3RT6B 3GYPA 1DBZA 1R1NA 1TXFA 4P8BA 1DDVA 2FHYA 5C79A 1J0WA 1NI2A 4OSNA 1EZOA 4MBPA 2DE2A 3UP9A 1AL3A 3MYUA 4MLQA 4ND9A 1NUYA 1TJ6A 5ITPA 2Z0PA 2QL3A 4DIXA 4Z2NA 1QGXA 3TAJA 4OVSA 1BTNA 4CHJA 1ANFA 2IYBA 4R6HA 4QBAA 5IZ3A 3T66A 5CC2A 4MIJA 4POWA 1P1NA 2OK2A 4LQ5A 4ESWA 1RYOA 4JVCA 1BK4A 2FIEA 3KBZA 1DDMA 2VGQA 5IKBA 4TOZA 3UN6A 4WEPA 3KN3A 2ZYOA 3UGWA 1M7EA 2WKYA 2D10A 1I7AA 5DIFB 2NVUB 2J59M 2Y5KA 3PTYA 4OA4A 3PMVA 4H6DA 2FA7A 1U5GA 1IXGA 3ULBA 4G2ZA 2Z59A 3OSQA 5ET5A 3G3HA 4F39A 5LONB 1FPLA 3S9EA 3UK4A 3D8DA 1JQFA 4GBVA 4O7MA 4PFRA 1B52A 3RCPA 2ELAA 1MS7A 1MQJA 4GWZA 1P1WA 3EQ1A 1DTZA 3PGFA 4HDQA 3F11A 2P3VA 2THIA 1X1GA 2HEUA 4ISUA 4N81A 4JXIA 3DP4A 1NV3A 1FTLA 4JVIA 3LBSA 1ZMGA 1MK7B 1MI1A 5L9OA 3FVCA 1UTBB 2DVCA 4EF1A 2XXPA 3SEVA 3H6TA 2DX1A 1FJ6A 4BDRA 1FBGA 1MXYA 1Q1KA 2COCA 3PUXE 2CZKA 3ZDTA 4JVDA 4OEVA 3P6AA 4I1DA 1SVXB 5CRYA 3SKPA 5EYHA 2R8TA 5H8FB 4GLIA 1B7UA 4PCDA 4H65A 1Y1MA 4POXA 3IOVA 2ONRA 1USYE 3FUZA 4NF6A 2A5TA 2ROZB 4LA9A 3RLFE 5B7DA 1B3GA 4CYEA 3BFTA 4EKUA 3FIRA 3KOSA 2RNRB 5F1QA 4BLAA 4XFEA 2D21A 3A8QA 2DS9A 4N6PA 1AMFA 1TFDA 4X04A 2XXKA 1ZYIA 3WAEA 4C0AA 2CZLA 3JYRA 1VFDA 1Q35A 2ANJA 3U72A 3W15C 4K3FA 3KZ1A 1T77A 1QKBA 3H7MA 1GTKA 4GWUA 2GRVA 4X48A 1Z87A 4NF8A 2YT2A 2NBVA 4Z2MB 1FPBA 3K02A 4DCXA 1FW0A 2ONSA 2I1JA 3M3LA 1FQBA 4X1DA 2XD2A 2D9VA 1FBEA 4M4GA 3TTLA 4D0NB 1L5TA 1RDYA 4YB7A 4F31B 2DKQA 2KUQA 5KQ1A 2I4CA 4RYAA 4DX8A 3G3IA 5D3VA 3NOHA 1MRPA 3O6IA 4H1XA 5I3SA 2FJLA 4YONA 3BJIA 1YZ0A 3KJ7A 5FTHA 2ZXTA 1JEUA 3MVZA 1H4RA 5I2MA 4OFOA 1N76A 3MP8A 4IGTA 1EU8A 5H8NA 5AA2B 1N7XA 2QS2A 1B0LA 1DSNA 1RDZA 1ZU0A 2FIXA 1ZC4B 1S50A 4ELOA 4EUOA 1US4A 5JP4A 4DDDA 3MJNA 3R6UA 3MZBA 2M14A 3C32A 1GG3A 4C1TA 1SW2A 3ILTB 1Y20A 4ZDMA 3MUQA 4F3SA 3FXRA 3C36A 2OCUA 1I6BA 4R73A 2E2XA 5I2KB 1SI1A 4F19A 3N6TA 1KA1A 4ZS9A 2AYSA 4DCYA 2GS0A 3AU5A 1SHCA 3A09A 2ESNA 3SEWA 3QUJA 2R09A 5H8HA 3KJTA 4PDDA 1DMBA 1EZ9A 3E4RA 4P7IA 5I59B 4F7HA 1NH8A 3DCXA 2OTXA 4P56A 2HZLA 1MH4A 4LONB 3K2DA 4YICA 3KGCA 4H67A 4ZRKA 1NMUA 4DXCA 5KCJB 1DYNA 4HW8A 3QIJA 1WGQA 5HE2A 4LP2B 1MDQA 4C1UA 3JV9A 3BFUA 2DN6A 3LR1A 2K00A 1D9YA 2XXVA 2QFLA 1I2HA 1FQFA 1DOTA 4KFQA 3WYFB 2XD3A 2MKRA 3TKDA 4X8RA 4NAPA 2KIGA 2F5XA 4GF8A 4ONYA 4KCDA 3PSCA 2P2AA 3VVFA 4O94A 5I84A 3NWDA 2PFZA 2PZ1A 3SUZA 3EPEA 4OENA 5JEIA 5D3YA 1B05A 1FTOA 1EH3A 2E1SA 1P5TA 1DTGA 4GPTB 1NL5A 3B50A 1OY2A 1PB7A 4MK0A 1YCJA 4RPOA 3MDBC 3KN7A 2HTHB 3F0WA 4EXKA 4NTLA 2ALUA 2XX7A 1AIVA 3MBPA 4YL8A 1YTVA 1PBQA 4A6HA 3RTFB 2Y7RA 1LAGE 4ZE8A 1MY3A 2UVGA 1B51A 4EJNA 1MM7A 4QJ4B 4R2BA 1OQHA 5CMMA 3KSYA 1WVHA 1SGHA 3FBPA 2H9BA 1B7HA 3M8UA 4NN3A 4OFLA 2XXWA 1D9QA 2VD2A 4GL0A 4OZ9A 3D4CA 4E0XA 1P1QA 3MVYA 3EN3A 5IGAA 4XKRA 2XXYA 3SV1A 4PAIA 4BDOA 3H03A 1NV6A 1B4HA 4O3BA 2B3BA 4IO3A 2OQBA 4IO5A 3SEYA 2DXRA 3V5AA 5TPAB 4KYEA 2O7IA 2F3DA 4H0WA 4BBKA 3ODOA 2KGXB 1MH3A 4EF2A 3W9WA 5EQAA 1TT1A 2DFKA 4ZZAA 2OJTA 4P11A 1DPEA 1TWYA 4HDOA 1ZM0A 4ECFA 3OO7A 4Y94A 3N94A 3OO8A 4HB0B 3OANA 3T22A 1WG7A 1IXHA 2EJ8A 5IAIA 1IIWA 1B2HA 1N3WA 4LZ5A 1WGUA 1ELJA 4G4PA 4MNPA 4BDNA 1LBBA 2V76A 2RVBB 1P1UA 3PMWA 3RTWB 5AA4A 3VLUA 1VR5A 1I69A 2YPNA 1V5MA 5EHMA 2RC9A 1WVJA 4ZE9A 2Q13A 1B3EA 2Z0QA 1FQDA 4Q30B 1NV7A 3Q27A 1FPKA 2ADZA 3OD7A 4JBZA 3KY9A 5EYGA 3TQWA 4M1VA 4G8MA 5ET8A 5I2SA 1O7TA 2H25A 1FGYA 3IOTA 3ODWA 3O96A 3AJ4A 1VSOA 1H10A 3FV2A 5HM4B 2RLOA 5D27A 4GWSA 3O28A 3BBRA 3PVLA 4ZRJA 1OLCA 4N15A 3RPLB 3MC2A 2I0CA 1W1GA 4FEBA 4D6WA 2XXTA 3SEXA 1QQGA 3SO6A 1N04A 1GC7A 3K6UA 2GHAA 4OFJA 3HN0A 2WYPA 1IXIA 1SI0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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