2KR0A

Solution structure of the proteasome ubiquitin receptor rpn13
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
407
structure length
407
Chain Sequence
MTTSGALFPSLVPGSRGASNKYLVEFRAGKMSLKGTTVTPDKRKGLVYIQQTDDSLIHFCWKDRTSGNVEDDLIIFPDDCEFKRVPQCPSGRVYVLKFKAGSKRLFFWMQEPKTDQDEEHCRKVNEYLNNPPMPGALGASGSSGHELSALGGEGGLQSLLGNMSHSQLMQLIGPAGLGGLGGLGALTGPGLASLLGSSGPPGSSSSSSSRSQSAAVTPSSTTSSTRATPAPSAPAAASATSPSPAPSSGNGASTAASPTQPIQLSDLQSILATMNVPAGPAGGQQVDLASVLTPEIMAPILANADVQERLLPYLPSGESLPQTADEIQNTLTSPQFQQALGMFSAALASGQLGPLMCQFGLPAEAVEAANKGDVEAFAKAMQNNAKPEQKEGDTKDKKDEEEDMSLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein binding
molecule keywords Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1
publication title Structure of Proteasome Ubiquitin Receptor hRpn13 and Its Activation by the Scaffolding Protein hRpn2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 63
structure length 407
sequence length 407
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04683 Proteasom_Rpn13 Proteasome complex subunit Rpn13 ubiquitin receptor
A PF16550 RPN13_C UCH-binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.29.70 Mainly Beta Roll PH-domain like PH-domain like 2kr0A01
3.40.190.140 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2kr0A02
2R2YA 2NBVA 2Z4DA 5IRSA 2Z59A 2KQZA 2L5VA 2MKZA 2KR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RT8A 3RPWA 4IAPA 4PGPA 2P3NA 2Y7RA 3EQ1A 4GBWA 2X7QA 2P0HA 2LAOA 5IRSA 1SD3A 3MW0A 2ZYKA 1IXIA 4XEQA 5HBCA 2CODA 3SESA 2CMOA 1UNPA 4OWDA 2DN6A 1OMWA 1FTKA 2AYSA 5EHMA 5L9MA 3UIFA 4KPTA 4MJOA 2GCJA 1ZVRA 2H98A 3LSFB 3A8PA 2DXYA 1P5TA 2NBVA 2Q2AA 5CLLB 4OT1A 4QJ5B 1A54A 1NV7A 1ELJA 1B3EA 4RPOA 2RF1A 1IMDA 4R2BA 4H8IA 3A29A 4HXVA 2REGA 2ZKMX 4ZS9A 2YS1A 4GFRA 3G3FA 4N6DA 5ITPA 3NW8A 1I2HA 1LLSA 1B1XA 1FHWA 2CZHA 1MPCA 2FIXA 4MNIA 4ELQA 4H5FA 1DDMA 4JBZA 2ONKE 3PPNA 1P3RA 5I59A 2THIA 4XTCQ 3HK0A 4OVQA 4ZE8A 1MM6A 3GZGA 4QFKA 4QFNA 3MP1A 1MK7B 5DTBA 2ADZA 2R0DA 4AS5A 2UVIA 3CXBB 1ISNA 3ZKKA 2WX9A 3I3VA 1SDXA 5FTIA 3AJ4A 2B3BA 1RDXA 5KQ1A 3B6QA 3S2VA 3T9UA 3G9WA 1QQGA 4O3AA 2DLWA 3D1RA 4ZZEA 1KZGA 4JVDA 2IYBA 2KUQA 1B5JA 2V93A 3RTWB 1OQHA 3SEUA 2QS3A 4RJZA 4F7GA 2ZPYA 2L5VA 4EQBA 1FBDA 3AU5A 1LAFE 4N6KA 4YMBA 3TELA 5HE1A 2F8DA 3KN3A 3RT6B 2R8TA 5ET7A 4Z7EA 4HCWA 5DVIA 2E2XA 2E1SA 2KIEA 2QJEA 3LSWA 4A6FB 4ELRA 3PVWA 3D8FA 1QGXA 3OOAA 4H8JA 3F5RA 2XHDA 4ZRJA 3WAFA 2XXRA 1ZC3B 2H7DA 5A5XA 1USYH 2DWIA 5TPAA 4ZDMA 5H8FB 3RNNA 4U4XA 3VXCA 4G68B 4X8RA 2QVUA 2PVUA 3QAXA 2F6GA 5H8QB 5AA4B 3TTMA 2XWIA 2PMSA 2H7EA 4IR8A 3TFLA 2YS3A 5I58B 5EQ9A 3PVUA 4K81A 2Z8DA 4JVIA 1P1NA 5DVFA 1H3DA 3R26A 4NAPA 3NWDA 2V3UA 1UTHB 2YT0A 3IB1A 3KN8A 4AQ4A 1Z87A 2J0MA 4R75A 3SKPA 4F31B 4XF5A 1XCGA 4N8GA 1WDNA 4UABA 4KHOA 2H4IA 4LATA 4H1XA 5T3JA 2P2AA 3HCQA 1VDWA 2P8VA 4YKKA 1JVYA 3TTLA 2I49A 3MSTA 3M3FA 1LBBA 2RSGA 2QFLA 4NF4A 1EZPA 5AA2D 4KVGB 5DHAB 1YYZA 2Q74A 3PUYE 2VPNA 3QUFA 1WJ1A 2F97A 2D9WA 4G8MA 4L17A 2P0FA 3IL1B 3U65A 4N6PA 4OMBA 5FHNA 3QUJA 2R09A 1JW4A 1YAEA 1W1HA 1B4ZA 3OD7A 2I4BA 3ILUB 3IFAA 3H7MA 2VD2A 1MXXA 2CAYA 2QPQA 3EHTA 3MZ9A 4H46A 3K2DA 2OQBA 3OHMB 3ILTB 1PLSA 2FA7A 4EF2A 1ZM0A 1N84A 4X1BA 1LBWA 3MVZA 5FHMA 2XX9A 3RN8A 2CZLA 2V84A 3MBPA 4EQ9A 5GOWB 2DHKA 3DLNA 1XKEA 5CBSA 3TCGA 1OY2A 1K9YA 1AIVA 1P1QA 5EQ8A 3EHSA 4NF8A 4OXVA 1GGGA 3AXFA 4GVOA 1ZSQA 3MVYA 3U92A 5I2MA 4CHMA 5CMKA 4KYDA 3BJIA 3KSXA 2MKRA 4U4SA 4O3BA 1X86A 3B6WA 2Y7BA 2ZZXA 1FBPA 4F18A 3U93A 2F34A 1LEVA 1BAKA 2XQNM 1FPIA 1D9YA 3KN7A 1ZC4B 1B5HA 3MAMA 3MUQA 1SQYA 3VIAA 4IO5A 4IO4A 1FJ6A 4MHFA 4GMXB 2XXPA 4KHAA 3VDFA 1LW3A 3VE1B 4OA4A 5EFXA 2I5FA 2UVJA 4K3FA 4PCDA 4EMOA 1FSAA 3Q28A 5JEIA 4ZE9A 5JLJB 1INPA 3O6HA 3VVEA 3RLFE 3PU5A 4DIXA 2RKMA 2WYPA 2UVGA 4GX4A 4R6YA 1FPLA 4I1DA 3KGCA 1K9ZA 3FUZA 3PV0E 2LG1A 4HDOA 4MY6A 4YB7A 2OWZA 1NV1A 3NOHA 2HXRA 3C35A 5HE3A 1XVXA 2RC7A 4HB4B 2AL6A 1EYKA 2YF0A 3CIKA 3VLUA 3R7XA 5AA1A 2WKYA 4PGNA 3TYHA 3T1BA 2HXWA 3UA8A 3PUVE 4QFOA 2DE4A 3PUXE 1Y9UA 5DH9B 2NOOA 3MPXA 1MY3A 4F3GA 2XXYA 3KG2A 4TOZA 3OO7A 3BFTA 5LONB 2CY4A 2Z22A 3VVFA 1P1WA 4IO2A 2DDKA 2R2YA 1MQGA 2UVHA 2V76A 5I2SA 3GYYA 4Y94A 1K5GB 4YICA 2Z4DA 1T0KA 1MXZA 4PFYA 3VOQA 3CFZA 1MXYA 2FYIA 1FOEA 3E13X 1FQFA 3KRXA 2PFYA 4QBAA 5I5PA 2ELAA 2Q13A 1FTLA 1RYOA 4YAHX 5DT6A 2YRYA 3O66A 3N26A 1NH7A 1I6QA 5L8DA 4QSDA 3ML4A 4PNKA 1A8FA 3G3HA 4OETA 4XKQA 4PQJA 1N7WA 5DEXB 3G3GA 1BLFA 1U5EA 1NV2A 3DXDA 2BJJX 3GBAA 1U5DA 2D21A 3IOTA 2ROZB 1II5A 2COFA 3MZBA 3TEPA 1WVJA 2Y5LA 1US5A 1Q9DA 3M3LA 5IKBA 3D4GA 3EN3A 2YT1A 1DSNA 4PTKA 1NUYA 3E9XA 2D9VA 2ONSA 1NV5A 1IITA 3T96B 3RY3A 4NF6B 1H45A 4NG7A 3KJ7A 4QFPA 2CZIA 4A6FA 4P1LA 2K2UA 3PP2A 4R6HA 2F7CA 4PDDA 4GWOA 4BDQA 3B7DA 4YU0A 4PP0A 2XX8A 4O8MA 5K2YA 4EDPA 2PFZA 1MQIA 3PPOA 3PSCA 2I6EA 2VP1A 4GWZA 3V89B 2M8CA 2XXQA 4OANA 5H8SA 2GH9A 1DMBA 1OVBA 4BDLA 2BCJA 3O2AA 2O1LA 5H8FA 3FVCA 3FV2A 4JWOA 5AA2B 2F78A 4U1ZA 2D2QA 2RVBB 4G68A 4NMYA 3EPEA 1JEUA 4IB2A 5H8QA 1HSJA 3CG1A 5AA4A 4YONA 2MFQA 3PTYA 3OSRA 2ZNTA 2PCRA 1LBXA 2XXKA 4IY5A 2UZSA 4BDOA 3SEXA 2OWSA 3QIJA 5D3XA 2J0JA 4PBHA 5J1DA 1Q1KA 3FSSA 1A99A 1DBZA 4THIA 1DBHA 3RYDA 1MY0A 2B65A 1H10A 1EYJA 5H8NA 2Y5KA 4C1TA 4MT7A 5BUUA 4P11A 3QK6A 4BBKA 2WEFA 3RTFB 1MH3A 1B51A 3QSLA 2DKQA 3IK6B 2Z14A 2VKIA 2NVUB 4POWA 1YZ0A 1LFHA 3O6GA 1IXHA 1VR5A 1B40A 2Z23A 4CHJA 4OTEA 1TJ6A 4GWSA 1B55A 1LCTA 4BDNA 3KC1A 2N0YA 2FVZA 1WI1A 4ZEKA 5D27A 1KZ8A 3ZVRA 5D3YA 1U2BA 2D3IA 2AIXA 1G0HA 2P0SA 1PBPA 1ZMGA 5DYHA 3USDA 4OZ9A 1XI6A 2OX3A 2B3FA 1D3KA 4GOTA 4PFRA 1IMCA 4ONYA 4C0RA 1MXWA 5EQ7A 4MMPA 4PDHA 5KZTA 3X23A 3C4MA 2KCJA 4Z0IA 1SW1A 1JP4A 5ET8A 4GXSB 4HAWB 4FEBA 1Q67A 1SBPA 2OCUA 1ZBMA 4NF0A 3SEVA 4GL0A 3BIGA 4GLIA 4MK0A 3U7DA 3TO1A 3E3KA 3SETA 1VE4A 4TQUQ 1WGUA 1FPFA 4HE2A 5ICTA 3K0VA 3KZ1A 3CFLA 2CRFA 4P1EA 2LYDA 1B4HA 5KCVA 1QUKA 3TAJA 1NNKA 1LBYA 4I40A 1NV3A 1B58A 3HFUA 3K1PA 4Z2MB 4KFQA 1LB9A 4U21A 4D0NB 2XXWA 2MDXA 3WAEA 1MAIA 4YKIA 1EH3A 2EC1A 4KQPA 4QF9A 3H06B 3RUMA 4DDDA 3L6GA 1MRPA 5IZ1A 4ECFA 5JHHA 3VV5A 4MF3A 2AEHA 1MS7A 1NUZA 4XKNA 3MPLA 2YPNA 3FVNA 4CYEA 1FTMA 4ZRKA 4RY1A 1A7LA 3PGFA 3NWAA 1BKAA 3TPAA 4E0WA 3SYXA 4WEPA 3IJOB 3A8QA 1FBHA 1LFGA 1AOVA 4NEDA 2J0KA 2NMBA 3PPPA 4XIGQ 1H76A 1XC1A 1XHYA 3H6TA 3ISPA 4PFBA 3H4ZA 1WJMA 2DKPA 1PB7A 4ND9A 4PC9A 4U23A 2COCA 5JHGA 3WA0A 1PDAA 4G8NA 1H43A 4I3YA 4MX6A 1DDVA 3E4RA 2NUVA 3H6VA 2DE3A 3PPRA 2D9YA 1URDA 4H67A 1PBQA 4GWWA 4KCCA 2QS1A 2D9ZA 2GUMA 1XS5A 2ZNUA 3K1NA 4DI3D 1FGYA 3SDFA 3S9LC 4X1DA 3TKDA 5D3WA 1Z7NE 4DZ1A 3JYRA 3N6UA 1B0LA 2DX1A 2V3QA 2XA5A 1NFTA 3K1MA 1B3FA 4IFSA 4DCYA 4HB3B 2XXUA 5IGAA 4GL8A 3DELB 2XWVA 5D3VA 3OENA 4TYZA 5A5LA 3SNHA 1TQZA 1IMFA 1VSOA 3EKIA 4PF6A 1WVHA 1IRSA 2Z8EA 2HQ0A 3KY9A 4GX3A 3UP9A 1SGHA 1MH4A 1B32A 3B6TA 3PZDA 3HHGA 1QW0A 2ZNSA 2DFKA 5CBRA 3LC8A 1B46A 3H6UA 2VHAA 4XKPA 1DOTA 3I5OA 4Q30B 2YVCA 2KQZA 1P6SA 1MY1A 4P56A 5I57B 3FEHA 4EJNA 4OVTA 1SI1A 4FE8A 4O94A 2OBGA 3FZVA 1AL3A 1Y3NA 1D9VA 2EMTA 4TLLB 4FAJA 5ICQA 2VRWB 3ODWA 1LAHE 2O84X 3JV9A 1V5PA 4TKNA 4OQOA 3W15C 4H8SA 1RDYA 3MQ9A 5CI5A 2DWJA 2EJ8A 1N3HA 5DEXA 3OO9A 2RGNB 5AE4A 3FXRA 1KA0A 4DXAB 2ESNA 1XT8A 3IB0A 1MPBA 1U5FA 5KQ4A 4OVSA 2HAUA 4HE0A 1N04A 1V88A 4KI0E 2XWKA 5C6RA 1NL5A 3CRBA 3H6WA 4NF6A 4X04A 4KYEA 4N07A 2KIGA 3B8BA 3JZJA 2WYKA 1B52A 5EQAA 4BLAA 1Y1MA 3MVWA 1J19A 4LUBA 1URSA 1SVXB 1TXFA 2JJKA 2I48A 4MAGA 2RINA 4F29A 4D6WA 4RPNA 1ZU0A 5I2NB 4L6EA 4FECA 1POY1 5H8NB 3PMXA 5H8HB 2XD3A 2RC9A 4O7IA 3IO6A 5I2KB 1FBEA 2EMSA 5AA2A 1X11A 1TFDA 1EF1A 4OENA 2I0CA 1X1FA 3KBZA 3V5AA 4GOUA 1P1OA 3O28A 1J1NA 3TTRA 2NXOA 2UZRA 3OEMA 3LSXA 4JWYA 3SUZA 1CE2A 2ZXTA 2Y8FA 1IEJA 1AMFA 2PT1A 4KD5A 2D10A 3THIA 1NV4A 5CM6A 4QRZA 2DHIA 5TU0A 3QMFA 2N23A 2DOJA 2IEEA 2RCAA 3W9VA 3BFUA 3KOTA 3K00A 1QJMA 1TT1A 1YCJA 4WKMA 2ELBA 3A3CA 4IGRA 3ODOA 2R71A 5DW8A 1ZYIA 1LAGE 3IORA 3CI8A 3S4UA 5KCJB 4I9DA 5J3YA 3MYUA 4MH5A 4A5KA 3PG7A 3QWMA 4YKJA 2F36A 4HB2B 1M5BA 3SEYA 2IA4A 4KR5A 3ZSFA 4MBPA 1HSEA 1R1NA 3UZTA 1MPDA 4HDQA 4U1OA 4R73A 1U29A 5B7DA 2ZMBA 3LV0A 2W2XD 1NKXA 3NSUA 2Z59A 3SEWA 3EF7A 2E0SA 3QIMA 1IUDA 3PD8A 3UGWA 1OLAA 1H4RA 4NTLA 2QS2A 3KOSA 4DXCA 3DXEA 2NZ8B 3MP6A 1TXDA 4ESXA 2GHAA 1A8EA 1Y3QA 4OVJA 4PFTA 4BDMA 3CFXA 2PT2A 3Q26A 4NX1A 2I5CA 1L5TA 4F7UP 4HSIA 3HPIA 4H5GA 3ECRA 2M14A 3RPLB 2F3BA 4WEDA 1AWBA 1B05A 4DXBA 4GNKB 2FJUB 1I6AA 1S9TA 4I62A 5KDTB 1M5DA 2DVCA 1NI2A 4EXKA 3GYOA 4I8CA 1LBVA 4IGTA 4POXA 2X18A 3CIJA 4MIJA 1BTKA 1QUIA 3IOUA 4F1VA 2ABHA 4DX8A 5I84A 3IAZA 5HE0A 3U94A 4KHBB 4ZEIA 5CRYA 3N94A 2XXIA 4MNPA 2GS0A 4B6HA 2F3DA 4F2OA 3U72A 4ZRIA 4GPTB 1NTVA 2W2XC 4XWXA 4H65A 2K2JA 3UN6A 1UQWA 3VLWA 2Z0PA 1LB8A 2L2IA 1AWEA 4KCDA 1HSLA 4PF8A 4GWUA 1RJ2A 1FBFA 4ZECA 2CZKA 1FQEA 3W9WA 4F3PA 4GRKA 4RXLA 3IR1A 4EUOA 3DP4A 4R6KA 1Y4TA 3MPKA 5CMMA 3TCHA 1B6HA 3KEIA 1J0WA 1FPBA 2Y7KA 1A40A 3CVGA 1RDZA 1PB9A 4P0IA 1QUJA 2HAVA 5EYGA 4ZEFA 2YLNA 3KC0A 3G3JA 2GJYA 1LAXA 4ISUA 3BIHA 3IFCA 1DK4A 2ALUA 4M4GA 1O64A 2GFEA 5M4YB 2J59M 1ZJLA 4OEUA 4YMAA 4X48A 4AS4A 4F3SA 2W2WA 4QHQA 1OQNA 5FTHA 2PBWA 2QVRA 1UEFA 5LTCA 3CSGA 3MVXA 4G2ZA 1MQDA 4TLMB 3A98B 4OVPA 4LVQA 3BINA 2UYEA 1LBCA 3P7IA 4LONB 5M2VA 3MZ1A 5IM2A 1DTZA 3S9MC 1BTNA 5FI0A 2DS9A 3TFMA 4Q8RA 1H44A 3C33A 2DP8A 1IXGA 4LZ8A 4P0GA 2Q2CA 5K2XA 2FJLA 5I57A 5JTYB 4QJ4B 5HM4B 3C34A 4C1UA 3CG3A 3OMBA 3HSAA 4N81A 4P9KA 3TTNA 3K6XA 3IB2A 2R9JA 3BBRA 1RKMA 4ESWA 4ELOA 3S9EA 4P7IA 3RCPA 4MEVA 4PE3A 1NH8A 1V89A 1PMSA 4QXAB 1Y1ZA 2Z0OA 4JXIA 1POTA 5F1QA 2HEUA 3T0JA 1MQHA 4GWYA 4RK9A 2QL3A 5JK4A 5L9SA 4PAIA 4PFUA 3Q25A 5ELVA 4OHNA 2YJPA 1N7XA 5L9OA 3ROJA 4R9GA 5ISUA 3FXUA 1W1GA 1NNFA 2Y8GA 1UIUA 2B4MA 1MPHA 1DROA 1B3GA 3IVFA 4WSFA 3G7WA 4LQ2A 1FPJA 1Y19B 2V4CA 1MDP1 1UPQA 1URGA 3LUYA 1FPGA 3C31A 1NMUA 5I2NA 1GC7A 1NI9A 2QVVA 3SERA 1TFAA 3OSQA 1IMBA 1QULA 2D4QA 2M38A 2I4CA 5H8HA 3EHUA 5I2KA 4F39A 4G8HA 1PB8A 5DIFB 1R9LA 4A6HA 5I56A 1MIZB 3HO7A 4F1YA 4GXBA 1G0IA 2VT5A 3TODA 3K6WA 4R72A 4HAUB 1XD4A 1GC6A 2F7BA 1MY2A 1B7HA 2DTCA 1BK4A 4HHVA 1NUXA 1M5CA 2IFSA 3T06A 2L1CA 5DVJA 1BP5A 4PFIA 2HCAA 1LFIA 1YXIA 4G61A 2OLBA 4OVRA 5IZZA 4LP2B 2QMXA 2OTXA 1CB6A 5FI1A 1ZIUA 1FHXA 2QS4A 2JP2A 3PPQA 4DX90 3PMWA 1FTAA 3WYFB 3ONMA 4PAKA 4QSEA 3O6IA 1Y20A 3QXMA 1DYNA 4EF1A 5KCJA 4DLDA 4KAXB 1QC6A 1R6ZA 2H99A 1LGBC 1BTJA 2OWTA 2DYXA 1MDQA 5ET5A 4GXAA 2V3TA 3KFMA 3FASA 2O6AA 1BIYA 2O7IA 2A5TA 2HZLA 1B2HA 2RNRB 1ATGA 4GX6A 2ROVA 2A5SA 4HS7A 3C32A 4GN1A 5TP9B 3B50A 4G68C 4HAVB 3TUSA 3I6VA 4OYVA 1SW5A 4HB0B 2LOXA 4MCOA 3D8DA 2X26A 3QYTA 2YT2A 1LSTA 2ANJA 4R9FA 2GQ1A 2VD3A 3R6UA 3T9XB 1VFDA 1FBGA 1M5FA 4PAFA 2MWNB 3TVVA 1U27A 2ZYNA 4P8BA 1KZ7A 2R6GE 4PE5B 4HATB 5CMCA 4NF5B 1FQDA 2HZKA 1KA1A 4K17A 2PYYA 2F7AA 3RPLA 2YS5A 2G93A 1DCUA 4C0AA 2GCLA 2H5YA 4P3LA 4PBQA 1ZLQA 5KDTA 3ULBA 2RUKB 4OERA 1LB1A 3LJUX 4OFJA 1MXUA 2Q8MA 5I3SA 3FJGA 4DCXA 5I7IA 1FAOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2R2Y A;  2NBV A;  2Z4D A;  5IRS A;  2Z59 A;  2KQZ A;  2L5V A;  2MKZ A;  2KR0 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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