2KR0A

Solution structure of the proteasome ubiquitin receptor rpn13
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
407
structure length
407
Chain Sequence
MTTSGALFPSLVPGSRGASNKYLVEFRAGKMSLKGTTVTPDKRKGLVYIQQTDDSLIHFCWKDRTSGNVEDDLIIFPDDCEFKRVPQCPSGRVYVLKFKAGSKRLFFWMQEPKTDQDEEHCRKVNEYLNNPPMPGALGASGSSGHELSALGGEGGLQSLLGNMSHSQLMQLIGPAGLGGLGGLGALTGPGLASLLGSSGPPGSSSSSSSRSQSAAVTPSSTTSSTRATPAPSAPAAASATSPSPAPSSGNGASTAASPTQPIQLSDLQSILATMNVPAGPAGGQQVDLASVLTPEIMAPILANADVQERLLPYLPSGESLPQTADEIQNTLTSPQFQQALGMFSAALASGQLGPLMCQFGLPAEAVEAANKGDVEAFAKAMQNNAKPEQKEGDTKDKKDEEEDMSLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein binding
molecule keywords Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1
publication title Structure of Proteasome Ubiquitin Receptor hRpn13 and Its Activation by the Scaffolding Protein hRpn2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 63
structure length 407
sequence length 407
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04683 Proteasom_Rpn13 Proteasome complex subunit Rpn13 ubiquitin receptor
A PF16550 RPN13_C UCH-binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.29.70 Mainly Beta Roll PH-domain like PH-domain like 2kr0A01
3.40.190.140 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2kr0A02
2L5VA 2Z59A 2NBVA 2R2YA 2KR0A 2Z4DA 2MKZA 2KQZA 5IRSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HSJA 2Q88A 4GL8A 1PMSA 2QS2A 5IZ3B 1FPDA 4PF6A 4PQ0A 4HDQA 4GWUA 2RF1A 1IMDA 4YB6A 2JP2A 2DKQA 1D4NA 1ZSQA 1NKXA 3C35A 4ZZAA 3T93B 3FJ7A 2O84X 2NBVA 3H6WA 4BDOA 4DBBA 4ZEBA 3RT6B 3IB2A 4BLAA 4O7IA 4RYAA 1FSAA 4PGPA 2DLWA 1I7AA 3FZVA 4GPTB 3OO6A 4YKKA 3U8QA 1FPIA 4X04A 1Y4CA 4IY5A 1B05A 1KA1A 1Z87A 2N0YA 1AWEA 2DVCA 1OQNA 2CY4A 5M2VA 2Z22A 3C31A 2UZRA 4BDNA 5TPAB 3RQTA 5JHGA 3OO9A 4K2PA 1TXFA 2CMOA 1LAGE 2DFKA 2MFQA 3HK0A 2P2AA 1EYIA 1N76A 4R73A 5EQ8A 5I2NA 2PFZA 3PPPA 4I8CA 3P7ZA 4I3EA 1BK4A 1WGUA 2F3DA 3RTFB 3QSLA 1AIVA 3LR1A 1Y4TA 3SEVA 2L2IA 4N15A 4YKPA 1K5DB 4UABA 1RRPB 3LUZA 3GYOA 1FHOA 4HS7A 1B4HA 1NV4A 3DP6A 2ABHA 2RSGA 4MY6A 3TO1A 4KCCA 3DXDA 2GHBA 1MQDA 1BTKA 1FPJA 2DWHA 1JNFA 1TFDA 5KDTA 2P0FA 2ZNUA 2LOXA 3UP9A 5A5XA 3BIGA 1QUIA 1MQHA 2D10A 1YZ0A 3LSFB 4JXIA 3T9VA 1POTA 4OQOA 1K5GB 4QJ3B 1MY0A 4JBZA 5L9OA 4QF9A 3TTMA 1N7WA 2WBDA 5B70A 4RK2A 4R6KA 3A8PA 3PGFA 2XXVA 1JW1A 1B3FA 4X48A 4XKNA 3D4CA 2QKLA 5I2MA 2ZYKA 4H6DA 4QFOA 5ICQA 4R6HA 1IXIA 4AS4A 5IGAA 3M3LA 4UACA 4F3SA 2KUPA 2QJEA 2I5CA 3H6VA 5D27A 3K6WA 3S9NC 2QPQA 1J1NA 4HHVA 1H76A 5CMKA 2A5TA 2ROZB 1Y9UA 1BTJA 3Q27A 2DE4A 1JQFA 5I56A 4NG7A 1L5TA 3FEHA 2HTHB 1Z7ME 5ET5A 1OQHA 3T1BA 1GR2A 3DP4A 4BDMA 2XWIA 4NY0A 1FTLA 3A3UA 1NNFA 1B3EA 3ECRA 1FGYA 3AJ4A 2I1JA 4F2QA 4N81A 2NMBA 1U5GA 5KCJA 2REJA 4O3BA 4O3CA 3V83A 5JK4A 1QULA 4QFNA 4KHOA 1IZ1A 2Y84A 1DBZA 3Q29A 5DEXA 2AL4A 1MY4A 4GMXB 1QKAA 2F78A 4NQ8A 4OEUA 5JHHA 4DXBA 1EYKA 4K3FA 2Q2AA 4MNIA 4ZEFA 2W7YA 4F3GA 3VLWA 2ELBA 4U1ZA 1DCUA 4CHJA 1VDWA 2CZHA 4JB7A 1Q67A 1SW4A 1VFDA 3EF7A 4D0NB 5HE0A 2ADZA 3KC1A 4GXAA 1GV8A 3TVVA 2ZZWA 5HPQA 4OVPA 1FQDA 4H1XA 1B46A 3TYHA 3CFLA 3DP8A 1MQJA 1NV2A 1H43A 1S7YA 2KR0A 3MUQA 5L9MA 1INPA 3VV5A 2ESNA 2XXHA 4MFIA 2D11A 4UA8A 2DE2A 2RCAA 3TPAA 1YCJA 4G68B 1LBBA 4DZ1A 1FCKA 2IYBA 1G0IA 2OK2A 1NV6A 3OSRA 3MVWA 5J3TA 1S9TA 2F8DA 2RCBA 4HCYA 1DSNA 2XXQA 1LW3A 1GG3A 4HTGA 3CXBB 4E0XA 3CRBA 2CY5A 2VOZA 3PV0E 1US4A 2OTXA 1XHYA 4OETA 5C5BA 1B7ZA 4JWYA 5ISUA 3UZTA 3ODOA 1POY1 1U2BA 1Q35A 3E4RA 3G3HA 3EHTA 2VPNA 2VSZA 2VPOA 4YMBA 1K9ZA 4TLMB 2YF0A 2XWKA 3VVEA 2Z13A 2DOJA 5JLJB 3FM8C 2WBBA 3PPNA 1B5HA 1MXYA 4F3BA 1FPEA 2DX5A 4EQ7A 5DVIA 4E0WA 2M38A 1B55A 1FPGA 1SYHA 1CB6A 1UPRA 2QMWA 2LAOA 3P6AA 4HSIA 4GBVA 4G61A 4KQPA 2RC9A 2IFSA 3X23A 3O6GA 3L6GA 4OERA 5F24A 1A54A 3IFAA 2DA0A 3FD3A 4F31B 2UVJA 4HDOA 4DI3D 2Z14A 2VHAA 5L9SA 1ISNA 2DSFA 3HFUA 3D1RA 1OVTA 1ZLQA 3KFMA 1P1WA 1NUWA 1YXIA 3H6TA 1MY3A 4LN5A 4GXBA 2EMSA 4YKIA 3CFZA 2Y7PA 1YTVA 4GOUA 2DHJA 3DXEA 1NFTA 2CZIA 1SD3A 3PUZE 3T9XB 3HPIA 4MT7A 4DCYA 1SYIA 2OZZA 2D9VA 5DIFB 2GHAA 1JEVA 1OMWA 4Z2MB 4A6HA 4C0AA 4ZS9A 3FVKA 3FJGA 4P3LA 1FPKA 4OVJA 4A5KA 3SV1A 2RINA 3DCXA 4KVGB 4HB0B 3FVCA 4NF8A 2VT5A 3MSTA 5AA4B 4KHBA 2F5XA 4RY1A 3LJUX 2OX3A 3RPWA 1QC6A 4GFRA 3G9WA 2I58A 2R0DA 2DHKA 4ZRIA 1V5MA 3TCGA 2WX9A 2P0HA 5ITPA 2D3IA 5H8QB 2OWTA 2K00A 5IZ3A 5CMBA 3RPLA 1NV5A 3AU4A 2HAUA 3RN8A 1X11A 1V88A 4U21A 2E0SA 1DDWA 1II5A 2FIEA 2IEEA 4PP0A 2X18A 1K9YA 4YMAA 4C0RA 4LP2B 4Z7EA 4A6FA 2FJLA 2A5SA 2MKZA 2O6AA 4EF1A 4ONYA 1NUZA 3MAMA 1FGZA 3LUYA 3IB1A 3U72A 4AQ4A 1H4RA 4HAYB 4P0GA 4EXLA 3ONMA 2PX1A 1A8EA 3A58A 1P1OA 2FNCA 2D21A 4WVFB 3CFXA 3QYTA 1SVXB 2B3FA 3TCAA 1SPIA 2XXPA 4P0IA 3F5RA 5CM6A 3BBRA 2WEFA 4PFYA 4ZE9A 2F3BA 3HHFA 5DVFA 2HFBA 3D8FA 1R9QA 4IGRA 3ULCA 5ELVA 1AOVA 3K00A 3B50A 3SEWA 3TQLA 1MPBA 4ELOA 1KI1B 1NTYA 4KYDA 3SYXA 3PUVE 2GFEA 1WG7A 4MH5A 5TP9A 2N23A 2YJPA 1YPNA 2H99A 1FTMA 1MG1A 1BWNA 3D8EA 3I6VA 3PMVA 2RNRB 1AL3A 3LSWA 3Q25A 4CSQA 1SW2A 5I84A 4N17A 5D3VA 4OSNA 3MW0A 1QUJA 3BINA 4KYSA 3VLVA 4NF6A 1WGQA 3TTNA 3MVZA 2CZKA 3C9HA 3W15C 3AU5A 3AXFA 2J0JA 1QJMA 1P3RA 3R6UA 2YPNA 1M5BA 2OCUA 1V5UA 2F97A 2G93A 5I58B 3DXCA 1B32A 3PVUA 4IO7A 3TMGA 3UK4A 1MQIA 2H98A 3MJNA 1B3LA 2Q13A 4MHFA 5EHMA 1LAFE 4PQJA 4NF5B 5JEIA 3G3IA 3GXAA 4N8YA 3WAFA 4ZECA 3GYPA 4F22A 2YT1A 2KUQA 5I2KA 4NN3A 4F7UP 3QK6A 4LQ5A 3IOTA 2R8TA 2DVZA 2PT1A 3RT8A 3JZJA 2D9XA 3TW1A 1H3DA 2IA4A 1FBEA 3FXBA 2GQ1A 1EVHA 4DXAB 3PMWA 4ISUA 3EKIA 1H45A 3OELA 3IOVA 2Y8FA 4O8MA 4TLLB 4IGTA 4TQUQ 4FEBA 3IX1A 4GD5A 2DYNA 3THIA 3O2AA 5CRYA 3LV0A 3S2VA 3R7XA 3T66A 3K2DA 1HSEA 2O1LA 3HCQA 1KWHA 4IO6A 1FB8A 3U7DA 1ZM0A 4FECA 1TJ6A 4MLVA 1RDXA 3SESA 4N4UA 1AH5A 2XXRA 2I5FA 5KQ1A 4KHAA 2X26A 2XXKA 1MDP1 2I3WA 2Z8EA 4JDFA 4NMYA 2Q74A 4H5GA 5I57B 2YS5A 2FVZA 3G7WA 4IOYX 2I4BA 5CMCA 1GC7A 1ATGA 2VD3A 2HZKA 2YS3A 4EF2A 4C1UA 2QS4A 3B8BA 4GLIA 4PFIA 2P0DA 1I6BA 1RDZA 3FBPA 1T0KA 3TODA 4LONB 1DOTA 2R71A 3ODWA 4NEDA 3VDFA 3IJOB 4JSDA 3VXCA 1WODA 2HZLA 3OXNA 4TKNA 4I1DA 3O29A 2HQ0A 1D9QA 2B4MA 4LVQA 1CNQA 3HN0A 2KGXB 1B40A 2EC1A 1FBCA 4BDRA 2I6EA 4MF3A 3ISPA 1FOEA 2KCJA 1XS5A 2V76A 3H6UA 5DTBA 4H46A 2Z8DA 3S9EA 1LBVA 5J3QA 4X1BA 2R6GE 5BUUA 2V93A 3QWMA 2V25A 2ZYMA 4RJZA 1JVYA 4GF8A 4R75A 4LATA 4WEPA 1LFGA 3K1PA 1ZU0A 1LBWA 3M3KA 4POXA 4YICA 5HE3A 4QFLA 1KZGA 3OOAA 4RA1A 4DI4B 3NWDA 1XVXA 1TFAA 5JTYB 5IKBA 1NV7A 1UTHA 4MBPA 1SHCA 1RYXA 1M7RA 3C34A 1FBFA 3VVFA 4R2BA 4WXJA 1IITA 3S4UA 1PB9A 4AB6A 4KFQA 4HCWA 3B6WA 3HV1A 1IEJA 3E78A 2ROVA 4EMOA 3RCPA 1MH4A 1D3KA 4U4XA 1X05A 3MVYA 4B6HA 2CRFA 3MP8A 4P1LA 1EZOA 1IXHA 3TUSA 2I0CA 3EHSA 2CEYA 4NSWA 2PCRA 3CG1A 4ZEIA 4WJ7A 4IR8A 3T22A 2ZZXA 2THIA 2DXYA 4H8JA 2H25A 5H8HA 3MBPA 3N26A 1FTAA 3QIJA 2V3QA 3G3FA 1OY2A 4HAXB 3KC0A 2DQVA 1JEUA 2XA5A 1M7EA 4RPNA 1FHWA 1QW0A 1IXGA 4P7IA 1U5FA 3K1MA 5FBPA 1MQGA 3FVGA 4GWSA 5LDZA 5CBSA 3FIRA 3EPEA 4U2RA 2Z0QA 4FATA 2J59M 4L1RA 2FBPA 2WYPA 4EUOA 3PEGA 1FHXA 5HE2A 2F34A 2E2XA 4PE5B 4ELPA 3PUYE 3BFTA 4F1VA 5K2XA 1A7LA 1DDMA 2PYYA 3QAXA 4I3YA 1A40A 2P1SA 3I5OA 1AWBA 2HE7A 3FV1A 3DLNA 3RNNA 1URDA 3OEKA 5AA4A 2Q9TA 4F1YA 1LFIA 1FTKA 4PAFA 5H8NA 4GNKB 3SETA 5L8DA 3U94A 1FAOA 3TCFA 5J16A 1QKBA 2GCJA 1FQFA 4MIJA 1FQCA 2ANJA 1PDAA 4L17A 5BWJA 2COAA 2H5YA 3FXRA 2XX8A 4YL8A 1IMEA 1XI6A 3TKDA 1DK4A 1USYH 2XXXA 1PC3A 3IJXB 2AL6A 2LOZA 4Q30B 4DXUA 3KN7A 4RXLA 3ZDTA 1WVJA 1B2HA 5EQ9A 3E3KA 4PFTA 2VD2A 5FTIA 3KOSA 4YB7A 3HO7A 4R9FA 3CVGA 2XD3A 1Y1MA 4JSOA 1IMFA 2O68A 5H8FA 1KA0A 3G3KA 4NWCA 3RUMA 1LBZA 1VE4A 4ND9A 4XTCQ 4XIGQ 5J3YA 3RYDA 1DMBA 1EGXA 1ANFA 2D9YA 1BLFA 3D8DA 4DIXA 3MWBA 2I3VA 3OENA 3KRWA 2F36A 4ZEDA 1ZVRA 4GN1A 4XF5A 5EYHA 2F7CA 4GIZA 2XXYA 4PC9A 2QL3A 4GBWA 2RUKB 3MVXA 3IOUA 1NTVA 4EQ9A 4R6YA 2X7QA 4O3AA 2F35A 4WKMA 2K2UA 4KAXB 1J19A 1ZC3B 3NSUA 4HB3B 4PAIA 2GS0A 4GX6A 2GRVA 2OWZA 1N0TA 1NU2A 5I2NB 3ZVRA 1LB8A 4NF4A 2LG1A 1JW5A 1Y3PA 2F7AA 4KHZE 4OHNA 2NXOA 4DE8A 2D9ZA 4FIMA 4N91A 1FPLA 2Z59A 4OANA 5D3YA 3SZPA 1LCTA 1FTJA 2HHMA 2P0SA 4XKQA 3QMFA 1M5FA 2Z0PA 1WVHA 2M8CA 2OBGA 4F2OA 1LFHA 2NWJA 1IRSA 4WEDA 2GCLA 4WSFA 5GOWB 2ZNSA 3IO4A 5ET7A 3B7DA 5FTHA 1NH7A 4DCXA 4GMVA 1I69A 5CLQB 3KN3A 1AQCA 1UEFA 4EJNA 1ZTYA 1NI9A 2Y5LA 3M1IB 5AA1A 4PFBA 4GX4A 5KDTB 5C79A 2I0BA 5A5XB 1A8FA 2Z23A 2Z0OA 1MRPA 1O7TA 3S9MC 4TYZA 4OFLA 2RRFA 1Y5OA 3C33A 3L6HA 5HM4B 4MMPA 3BKIB 3RY3A 2O1MA 3PPOA 2XWVA 1B51A 2OQBA 1MS7A 4U22A 2W2XD 4JVCA 4XFEA 3JYRA 4PDHA 3EHUA 1XCGA 5I7IA 4POWA 4QSDA 3C32A 3E9XA 4HE0A 2J0MA 4CYEA 2RC8A 1D9YA 4GWWA 5IRSA 1PB7A 4GXSB 1P1UA 4GWOA 2A5TB 2UVIA 3HSAA 1B3GA 4HB4B 5I56B 5ET6A 4KD5A 1DBHA 2YRYA 4OTEA 4F39A 4ECFA 2QKMA 2DX1A 1XX0A 2DTCA 2PFYA 5EHSA 4NX1A 3OD7A 2ZNTA 2QS1A 1FPBA 5LOMA 3O9PA 4MLQA 2RC7A 4GQOA 2GH9A 2UVMA 1N3XA 2WKYA 5EQAA 3PUXE 4CHMA 2QVUA 2EMTA 4K2OA 2B4LA 2K2JA 3ULBA 3KN8A 1FQAA 1PFJA 4OVQA 4HAZB 3A29A 3NWFA 2B3BA 2KQZA 4GWZA 5EQ7A 3W9WA 1NI2A 1N3WA 4KPTA 4O94A 3KJ7A 2KIGA 5DEXB 4ZZEA 2LULA 1IQ7A 2AL5A 4OENA 5T3JA 2HXWA 1T77A 3KOTA 1LEVA 3OO8A 4BBKA 1NV1A 5J1DA 2GUMA 4ZE8A 4OVTA 1MK7B 4O7MA 2H7EA 1B58A 4PFWA 4L6EA 2MWNB 2VGQA 5AE4A 3H3GA 3B6QA 3KZ1A 1QGXA 4HAUB 1RYOA 4IO2A 4OFOA 2RKMA 4BDQA 2ZYOA 4YKJA 4PNKA 2FJUB 2QFLA 2Q8MA 3WAEA 1H44A 5CC2A 5TPAA 3N94A 4MX6A 1TT1A 2O7IA 2XD2A 3T9UA 3SDFA 2I49A 1QQGA 1VR5A 2DP8A 2W2WA 2I48A 4F19A 4OXVA 1R1NA 1KZ7A 2YT2A 2Y7BA 1IUDA 3I3VA 4OA4A 5DT6A 3T96B 2Q8JA 3F11A 4X9TA 2X7PA 1XT8A 1QUKA 3UN6A 5AA3A 4ZRKA 4OWDA 2KIEA 2XXTA 3PPQA 3PVWA 1W1HA 2ZPYA 5C5BB 2O7UA 1LBCA 1DTZA 2Y7KA 1V61A 3H4ZA 1NL5A 1BP5A 1DDVA 3RLFE 2L1CA 3G3JA 3SEYA 2UZSA 3KY9A 1NUXA 3EQ1A 3C4MA 5DI9B 1YYZA 4QHQA 1OIBA 2K8EA 1SDXA 4I9DA 3QXMA 3ZSFA 1EH3A 3R26A 4NHBA 4HATB 1U5EA 4PBQA 3ML4A 1S50A 5I59B 1D9VA 5FHOA 5I3SA 4PDDA 1XD4A 1B7HA 2D9WA 5EFXA 2YT0A 4GWXA 3PU5A 3VE1B 1MAIA 2CEXA 1XKEA 1P5TA 1J0WA 3FSSA 2FA7A 2V84A 4N6PA 4QXAB 3WYFB 4GVOA 5LONB 1B5IA 1FJ6A 3ZS6A 1ZC4B 3TZAA 1KZ8A 4YAHX 1F9BA 1MPHA 4ELQA 5D3XA 1ELJA 4HAVB 2UYFA 4FEDA 3H03A 4P8BA 4MNPA 4LA9A 3BIHA 1RDYA 3FXQA 1MIXA 4KR5A 4NAPA 3MPXA 1DROA 4AB5A 5DVJA 1OQGA 3ODBA 2RVBB 2Y7RA 3Q26A 4G68C 2DHIA 2G29A 3VFJA 3KG2A 3U12A 4XXUA 3HSTA 3K1NA 4F18A 4OVRA 1XR0B 4NE4A 3TTRA 4P9KA 4G8HA 1PB8A 1OMPA 3O96A 3TTKA 4NF8B 3GYYA 1USYE 4KHBB 2Q2CA 1SGHA 4GZUA 1RJ2A 2HEUA 4NWDA 4YONA 4LZ8A 1B0HA 3VOQA 1OLCA 4R72A 2HCAA 1FBDA 1NMUA 1FBPA 3OHMB 2ZMBA 4DXCA 4YZZA 3UIFA 2CODA 1LLSA 4IO4A 4G8MA 4G4PA 4KI0E 4OESA 1M5EA 4D6WA 1HSLA 2H7DA 2Y7IA 1PBPA 4HXVA 4F29A 5ICTA 4BDLA 3FGSA 4YB5A 4XKRA 4PCDA 1U5DA 2OLBA 3RPLB 2DXRA 3DELB 3A09A 5D3WA 3HW2B 5DHAB 4F7GA 3KRXA 1IMBA 2Z4DA 2PBWA 4QSEA 1FRPA 3NW8A 3W9VA 3QUJA 1X86A 5LTCA 3IOWA 4OEVA 2OWSA 4G68A 3K02A 1Q1KA 2DWIA 4PF8A 5HE1A 4A6FB 1E5WA 1UPQA 2PZ1A 4XWXA 1MXXA 2D5WA 3ZKLA 4DDDA 1GGGA 2COCA 2R09A 5IM2A 5FHNA 3CI8A 4R2FA 4M1VA 4MNCA 3SUZA 3FV2A 2YVCA 3CHGA 3OSQA 5AA2B 1NUYA 2YS1A 3OO7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2L5V A;  2Z59 A;  2NBV A;  2R2Y A;  2KR0 A;  2Z4D A;  2MKZ A;  2KQZ A;  5IRS A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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