The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
64
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sequence length |
216
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structure length |
204
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Chain Sequence |
ALDLNSVLGKDYGALKDIVINANPASPPLSLLVLHRLLCEHFRVLSTVHTHDSVKSVPENLLKCFDYQLGFTLIWKNVPKTQMKFSIQTMCPIEGEGNIARFLFSLFGQKHNAVNATLIDSWVDIAIFQLKEGSSKEKAAVFRSMNSALGKSPWLAGNELTVADVVLWSVLQQIGSVTVPANVQRWMRSCENLAPFNTALKLLK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
BIFUNCTIONAL GLUTAMATE/PROLINE--TRNA LIGASE
|
| publication title |
The Crystal Structure of the Gst-Like Domains Complex of Eprs-Aimp2 Mutant S156D
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Ligase
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| total genus |
64
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| structure length |
204
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| sequence length |
216
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00043 | GST_C | Glutathione S-transferase, C-terminal domain |
| B | PF18569 | Thioredoxin_16 | Thioredoxin-like domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 | Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AKG A; 4AKH A; 5A1N A; 5A5H A; 4W66 A; 5A1N B; 5A34 A; 4AKI A; 4AI6 A; 5A5H B; 5A34 B; 4ZB7 A; 5BMU B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1A0F A; 2YV7 A; 5F07 A; 1ML6 A; 5J4U A; 4FXY P; 5ECS A; 5AIV A; 4MZW A; 4YH2 A; 4AKH A; 1M99 A; 4MPF A; 1GSU A; 5ECO B; 3CBU A; 3VPQ A; 3UAR A; 3CSJ A; 4LMV A; 3IC8 A; 1VF1 A; 4GTU A; 3TOT A; 3BBY A; 4JED A; 1K0D A; 4PNF A; 1HNA A; 4F0B A; 3D0Z A; 4G01 A; 4E8H A; 1S4B P; 2DC5 A; 1PX6 A; 3CRT A; 3HJM A; 2IMK A; 1V2A A; 5GSS A; 3QAG A; 5DAL B; 4BL7 B; 3ERG A; 5A34 A; 2HSM B; 2GSR A; 2GTU A; 1M9B A; 2EFH A; 1BYE A; 1RK4 A; 1SVO A; 2VCW A; 3GST A; 2R6K A; 1YDK A; 2A2R A; 3LG6 A; 3IK9 A; 1K3Y A; 1E6B A; 4J2F A; 1AXD A; 1IYI A; 5J4Y A; 5KEJ A; 5J4V A; 1G7O A; 1GTI A; 4USS A; 1PL2 A; 5F06 A; 1OE7 A; 3ERF A; 2VD1 A; 3DGQ A; 1BF5 A; 3CRU A; 1TU8 A; 1GSF A; 1EV9 A; 4FQU A; 2PER A; 2YCD A; 4HOJ A; 4IS0 A; 4GSS A; 1YEW C; 3R3E A; 3VUR A; 2O5V A; 5DAL A; 4TOP A; 2HSM A; 1VF2 A; 1K3O A; 4GST A; 3Q74 A; 2EFE A; 3PGT A; 1HNC A; 1PN9 A; 4PUR A; 3SWL A; 3IBH A; 4G10 A; 5DJL A; 1GSE A; 4GF0 A; 2R5G A; 1UA5 A; 3IK7 A; 1F3A A; 2WDU A; 4GSN A; 1GUK A; 4Q5R A; 2IL3 A; 4N3Z A; 1F2E A; 1TDI A; 2WVY A; 3CHX C; 3IR4 A; 2WW1 A; 1B4P A; 5ECM B; 1V40 A; 3RGB C; 1K0C A; 4OFN A; 4ZB6 A; 4ECB A; 6GSX A; 5BMU A; 4PHZ C; 5ECN B; 9GSS A; 3Q18 A; 3FYG A; 3MDK A; 2AAW A; 4IGJ A; 1N2A A; 2WVX A; 5A5H A; 1G6W A; 1PKZ A; 2CZ2 A; 6GSU A; 5DQS A; 1K0B A; 4OMV A; 4IQA A; 1YJ6 A; 17GS A; 1N25 A; 3C8E A; 4JZQ A; 4F0C A; 5A34 B; 4YQU A; 5G5E A; 4KE3 A; 3LYP A; 14GS A; 3F6D A; 3UVH A; 4RI7 A; 5A4W A; 1ZL9 A; 4NAX A; 5ECR B; 2ON5 A; 4PTS A; 2CAQ A; 5DCG A; 5A4U A; 1M0U A; 1KBN A; 3UBL A; 4ZB9 A; 5ECK B; 2WZS A; 3QR6 A; 5J41 A; 4EE0 A; 2WW0 A; 1GTB A; 1GTA A; 1OYJ A; 2LJR A; 6GSS A; 2VCV A; 1EOG A; 2OAD A; 2WW2 A; 4IEL A; 5DAK A; 3O3T A; 3LQ7 A; 4ECI A; 4AGS A; 4PQH A; 2CAI A; 4AKG A; 4KDU A; 4WR4 A; 1GUM A; 3VWX A; 1YY7 A; 2OAC A; 3ZMK A; 5G5F A; 2UV8 G; 3I69 A; 2D2Z A; 5D9T A; 11GS A; 3I6A A; 2N5F A; 1GSQ A; 3L0H A; 5EY6 A; 2NTO A; 3W8S A; 1BG5 A; 4ECJ A; 5HFK A; 1K3L A; 4G0I A; 1B8X A; 5FHI A; 1GSD A; 3LXZ A; 4IW9 A; 3LFL A; 4PX1 A; 5ELA A; 4HJ2 A; 2F8F A; 4MF6 A; 1Z9H A; 3UBK A; 2C4J A; 2VKZ G; 2O36 A; 3FRC A; 3FY7 A; 1AW9 A; 1XWK A; 4IQ1 A; 3RBT A; 2ON7 A; 18GS A; 2CVD A; 1U88 A; 2GST A; 6GST A; 4I97 A; 2C3N A; 2A2S A; 4ZBA A; 5EL8 A; 4HZ4 A; 5BMU B; 1SVL A; 4W66 A; 2HRA A; 3ZML A; 1K0O A; 2AB6 A; 5EVO A; 3CSI A; 1PX7 A; 4OFM A; 3GUS A; 4E68 A; 2GSQ A; 4ISD A; 2HSN A; 4BVY B; 5A5K A; 2WVX B; 4LMW A; 5A5H B; 4BVX B; 4ACS A; 3HMJ G; 1MD4 A; 5D9W A; 4CHS A; 2HQT A; 3VI7 A; 2HNL A; 1GUL A; 1HQO A; 3VK9 A; 2GDR A; 3AY8 A; 4IJI A; 3GUR A; 3LSZ A; 5AIS A; 2FNO A; 1XW5 A; 1B48 A; 8GSS A; 4WR5 A; 4EXJ A; 4HI7 A; 4KDY A; 6GSY A; 3F63 A; 2WB9 A; 3M3M A; 3KM6 A; 4Q5F A; 5D9X A; 3LJR A; 5F0G A; 5D9V A; 5ECL B; 3GSS A; 4MPG A; 4QQ7 A; 2VCX A; 1Q4J A; 2WJU A; 5DAK B; 3P8W A; 4EDY A; 1PKW A; 3VI5 A; 3CWG A; 16GS A; 3VPT A; 4BVY A; 1MTC A; 2UZ8 A; 4KF9 A; 5DJM A; 4BVX A; 3M1G A; 1EV4 A; 4PI2 C; 1K0N A; 5JCU A; 4KX4 A; 1G6Y A; 4ZB8 A; 2GSS A; 1AQX A; 1XW6 A; 3N9J A; 5GZZ B; 4PI0 C; 1JZR A; 1GLQ A; 2VO4 A; 3GTU B; 5DDL A; 4L8E A; 5ECH B; 4EC0 A; 3KTL A; 1YQ1 A; 4N0V A; 2H1L A; 4ZB7 A; 3FR6 A; 1K0M A; 3KJY A; 4K0N A; 1OE8 A; 5F8B A; 5A1N B; 3G7J A; 1EOH A; 5FT3 A; 5JCW A; 2JL4 A; 3ISO A; 5AIX A; 4MK3 A; 1PGT A; 12GS A; 1PL1 A; 5AN1 A; 4EDZ A; 4GLT A; 1PA3 A; 2CZ3 A; 4ECC A; 1IYH A; 1BX9 A; 4L5L A; 4PQI A; 1TXU A; 1GSY A; 3LYK A; 4K0G A; 4KGI A; 2EFC A; 4L5O A; 3ZFB A; 1OKT A; 4O92 A; 4MF7 A; 4HZ2 A; 3TOU A; 3Q19 A; 2PBJ A; 1YKC A; 2X64 A; 3GTU A; 4MP4 A; 3N5O A; 3TU3 B; 3HKR A; 3MAK A; 2HSN B; 1GWC A; 4RI6 A; 3LXT A; 1PMT A; 3KMN A; 13GS A; 1XWG A; 3U6V A; 2GLR A; 1NHY A; 2EFD A; 3H1N A; 5A1N A; 4G19 A; 1JLV A; 2C8U A; 3G7I A; 2AHE A; 1U3I A; 4ZBB A; 3IE3 A; 5FWG A; 22GS A; 3GX0 A; 2DSA A; 5F05 A; 1LJR A; 1TU7 A; 1GNW A; 3NIV A; 3ZFL A; 3HJO A; 4G0K A; 5D73 A; 4G0L A; 2C3Q A; 1AQV A; 4GCI A; 2OT3 A; 4GDF A; 4O7H A; 5IQY A; 1JLW A; 1BG1 A; 2WW3 A; 4NHZ A; 4OFT A; 1M9A A; 1R5A A; 4G9H A; 1GLP A; 4QMK A; 20GS A; 7GSS A; 1Y1U A; 1Y6E A; 3WD6 A; 6GSV A; 2V6K A; 1VF4 A; 5ECP B; 4KDX A; 4PUA A; 2FHE A; 5AGY A; 3PPU A; 5A4V A; 2F3M A; 2VCQ A; 4YQM A; 3FR9 A; 2VCT A; 2WVZ A; 1C72 A; 2O3E A; 5J47 A; 5ECQ B; 4DEJ A; 19GS A; 1TW9 A; 3F6F A; 4BL7 A; 4IKH A; 2HRK B; 4ID0 A; 6GSW A; 1USB A; 2IMI A; 4Q5N A; 5ECI B; 1BAY A; 4E8E A; 2CA8 A; 1GNE A; 3VLN A; 3QAV A; 3EE2 A; 4KH7 A; 2VD0 A; 2VCZ A; 4MF5 A; 5GST A; 4YAV A; 3RFR C; 1DUG A; 5LCZ A; 1U87 A; 4PXO A; 2PMT A; 2PGT A; 4KSM A; 3M8N A; 1GTU A; 2OA7 A; 3CSH A; 1GSS A; 3KMO A; 3O76 A; 4Q5Q A; 1F3B A; 1VF3 A; 4IBP A; 5ELG A; 1PD2 1; 2R4V A; 2WS2 A; 4AI6 A; 3FR3 A; 3M0F A; 1ZGN A; 2HRK A; 4MDC A; 3QAW A; 4AKX B; 5LD0 A; 4F03 A; 4PGT A; 1EEM A; 3R2Q A; 4ZBD A; 4YQV A; 1GUH A; 1HNB A; 2J9H A; 2R3X A; 4IVF A; 4JBB A; 1K0A A; 3GH6 A; 1I1I P; 4YAP A; 3WYW A; 5J5N A; 1FW1 A; 4KAE A; 2C3T A; 4NHW A; 1LBK A; 2YV9 A; 3KXO A; 5B7C A; 2PVQ A; 10GS A; 2WRT A; 3DD3 A; 4PNG A; 3TGZ A; 1SVM A; 3UAP A; 3EIN A; 4AKI A; 3P90 A; 3PR8 A; 1YVL A; 2C80 A; 5J40 A; 1MD3 A; 4ZXG A; 1FHE A; 1AQW A; #chains in the Genus database with same CATH homology 1A0F A; 2YV7 A; 5F07 A; 1ML6 A; 5J4U A; 5ECS A; 5AIV A; 4MZW A; 4YH2 A; 4AKH A; 1M99 A; 4MPF A; 1GSU A; 5ECO B; 3CBU A; 3VPQ A; 3UAR A; 3CSJ A; 4LMV A; 3IC8 A; 1VF1 A; 4GTU A; 3TOT A; 3BBY A; 4JED A; 1K0D A; 4PNF A; 1HNA A; 4F0B A; 3D0Z A; 4G01 A; 4E8H A; 2DC5 A; 1PX6 A; 3CRT A; 3HJM A; 2IMK A; 1V2A A; 5GSS A; 3QAG A; 5DAL B; 4BL7 B; 3ERG A; 5A34 A; 2HSM B; 2GSR A; 2GTU A; 1M9B A; 2EFH A; 1BYE A; 1RK4 A; 1SVO A; 2VCW A; 3GST A; 2R6K A; 1YDK A; 2A2R A; 3LG6 A; 3IK9 A; 1K3Y A; 1E6B A; 4J2F A; 1AXD A; 1IYI A; 5J4Y A; 5KEJ A; 5J4V A; 1G7O A; 1GTI A; 4USS A; 1PL2 A; 5F06 A; 1OE7 A; 3ERF A; 2VD1 A; 3DGQ A; 1BF5 A; 3CRU A; 1TU8 A; 1GSF A; 1EV9 A; 4FQU A; 2PER A; 2YCD A; 4HOJ A; 4IS0 A; 4GSS A; 3R3E A; 3VUR A; 2O5V A; 5DAL A; 4TOP A; 2HSM A; 1VF2 A; 1K3O A; 4GST A; 3Q74 A; 2EFE A; 3PGT A; 1HNC A; 1PN9 A; 4PUR A; 3SWL A; 3IBH A; 4G10 A; 5DJL A; 1GSE A; 4GF0 A; 2R5G A; 1UA5 A; 3IK7 A; 1F3A A; 2WDU A; 4GSN A; 1GUK A; 4Q5R A; 2IL3 A; 4N3Z A; 1F2E A; 1TDI A; 3IR4 A; 1B4P A; 5ECM B; 1V40 A; 1K0C A; 4OFN A; 4ZB6 A; 4ECB A; 6GSX A; 5BMU A; 5ECN B; 9GSS A; 3Q18 A; 3FYG A; 3MDK A; 2AAW A; 4IGJ A; 1N2A A; 5A5H A; 1G6W A; 1PKZ A; 2CZ2 A; 6GSU A; 5DQS A; 1K0B A; 4OMV A; 4IQA A; 1YJ6 A; 17GS A; 1N25 A; 3C8E A; 4JZQ A; 4F0C A; 5A34 B; 4YQU A; 5G5E A; 4KE3 A; 3LYP A; 14GS A; 3F6D A; 3UVH A; 4RI7 A; 5A4W A; 1ZL9 A; 4NAX A; 5ECR B; 2ON5 A; 4PTS A; 2CAQ A; 5DCG A; 5A4U A; 1M0U A; 1KBN A; 3UBL A; 4ZB9 A; 5ECK B; 3QR6 A; 5J41 A; 4EE0 A; 1GTB A; 1GTA A; 1OYJ A; 2LJR A; 6GSS A; 2VCV A; 1EOG A; 2OAD A; 4IEL A; 5DAK A; 3O3T A; 3LQ7 A; 4ECI A; 4AGS A; 4PQH A; 2CAI A; 4AKG A; 4KDU A; 4WR4 A; 1GUM A; 3VWX A; 1YY7 A; 2OAC A; 3ZMK A; 5G5F A; 2UV8 G; 3I69 A; 2D2Z A; 5D9T A; 11GS A; 3I6A A; 2N5F A; 1GSQ A; 3L0H A; 5EY6 A; 2NTO A; 3W8S A; 1BG5 A; 4ECJ A; 5HFK A; 1K3L A; 4G0I A; 1B8X A; 5FHI A; 1GSD A; 3LXZ A; 4IW9 A; 3LFL A; 4PX1 A; 5ELA A; 4HJ2 A; 2F8F A; 4MF6 A; 1Z9H A; 3UBK A; 2C4J A; 2VKZ G; 3FRC A; 3FY7 A; 1AW9 A; 1XWK A; 4IQ1 A; 3RBT A; 2ON7 A; 18GS A; 2CVD A; 1U88 A; 2GST A; 6GST A; 4I97 A; 2C3N A; 2A2S A; 4ZBA A; 5EL8 A; 4HZ4 A; 5BMU B; 1SVL A; 4W66 A; 2HRA A; 3ZML A; 1K0O A; 2AB6 A; 5EVO A; 3CSI A; 1PX7 A; 4OFM A; 3GUS A; 4E68 A; 2GSQ A; 4ISD A; 2HSN A; 4BVY B; 5A5K A; 4LMW A; 4BVX B; 5A5H B; 4ACS A; 3HMJ G; 1MD4 A; 5D9W A; 4CHS A; 2HQT A; 3VI7 A; 2HNL A; 1GUL A; 1HQO A; 3VK9 A; 2GDR A; 3AY8 A; 4IJI A; 3GUR A; 3LSZ A; 5AIS A; 2FNO A; 1XW5 A; 1B48 A; 8GSS A; 4WR5 A; 4EXJ A; 4HI7 A; 4KDY A; 6GSY A; 3F63 A; 2WB9 A; 3M3M A; 3KM6 A; 4Q5F A; 5D9X A; 3LJR A; 5F0G A; 5D9V A; 5ECL B; 3GSS A; 4MPG A; 4QQ7 A; 2VCX A; 1Q4J A; 2WJU A; 5DAK B; 3P8W A; 4EDY A; 1PKW A; 3VI5 A; 3CWG A; 16GS A; 3VPT A; 4BVY A; 1MTC A; 2UZ8 A; 4KF9 A; 5DJM A; 4BVX A; 3M1G A; 1EV4 A; 1K0N A; 5JCU A; 4KX4 A; 1G6Y A; 4ZB8 A; 2GSS A; 1AQX A; 1XW6 A; 3N9J A; 5GZZ B; 1JZR A; 1GLQ A; 2VO4 A; 3GTU B; 5DDL A; 4L8E A; 5ECH B; 4EC0 A; 3KTL A; 1YQ1 A; 4N0V A; 2H1L A; 4ZB7 A; 3FR6 A; 1K0M A; 3KJY A; 4K0N A; 1OE8 A; 5F8B A; 5A1N B; 3G7J A; 1EOH A; 5FT3 A; 5JCW A; 2JL4 A; 3ISO A; 5AIX A; 4MK3 A; 1PGT A; 12GS A; 1PL1 A; 5AN1 A; 4EDZ A; 4GLT A; 1PA3 A; 2CZ3 A; 4ECC A; 1IYH A; 1BX9 A; 4L5L A; 4PQI A; 1TXU A; 1GSY A; 3LYK A; 4K0G A; 4KGI A; 2EFC A; 4L5O A; 3ZFB A; 1OKT A; 4O92 A; 4MF7 A; 4HZ2 A; 3TOU A; 3Q19 A; 2PBJ A; 1YKC A; 2X64 A; 3GTU A; 4MP4 A; 3N5O A; 3TU3 B; 3HKR A; 3MAK A; 2HSN B; 1GWC A; 4RI6 A; 3LXT A; 1PMT A; 3KMN A; 13GS A; 1XWG A; 3U6V A; 2GLR A; 1NHY A; 2EFD A; 3H1N A; 5A1N A; 4G19 A; 1JLV A; 2C8U A; 3G7I A; 2AHE A; 1U3I A; 4ZBB A; 3IE3 A; 5FWG A; 22GS A; 3GX0 A; 2DSA A; 5F05 A; 1LJR A; 1TU7 A; 1GNW A; 3NIV A; 3ZFL A; 3HJO A; 4G0K A; 5D73 A; 4G0L A; 2C3Q A; 1AQV A; 4GCI A; 2OT3 A; 4GDF A; 4O7H A; 5IQY A; 1JLW A; 1BG1 A; 4NHZ A; 4OFT A; 1M9A A; 1R5A A; 4G9H A; 1GLP A; 4QMK A; 20GS A; 7GSS A; 1Y1U A; 1Y6E A; 3WD6 A; 6GSV A; 2V6K A; 1VF4 A; 5ECP B; 4KDX A; 4PUA A; 2FHE A; 5AGY A; 3PPU A; 5A4V A; 2F3M A; 2VCQ A; 4YQM A; 3FR9 A; 2VCT A; 1C72 A; 5J47 A; 5ECQ B; 4DEJ A; 19GS A; 1TW9 A; 3F6F A; 4BL7 A; 4IKH A; 2HRK B; 4ID0 A; 6GSW A; 1USB A; 2IMI A; 4Q5N A; 5ECI B; 1BAY A; 4E8E A; 2CA8 A; 1GNE A; 3VLN A; 3QAV A; 3EE2 A; 4KH7 A; 2VD0 A; 2VCZ A; 4MF5 A; 5GST A; 4YAV A; 1DUG A; 5LCZ A; 1U87 A; 4PXO A; 2PMT A; 2PGT A; 4KSM A; 3M8N A; 1GTU A; 2OA7 A; 3CSH A; 1GSS A; 3KMO A; 3O76 A; 4Q5Q A; 1F3B A; 1VF3 A; 4IBP A; 5ELG A; 1PD2 1; 2R4V A; 2WS2 A; 4AI6 A; 3FR3 A; 3M0F A; 1ZGN A; 2HRK A; 4MDC A; 3QAW A; 4AKX B; 5LD0 A; 4F03 A; 4PGT A; 1EEM A; 3R2Q A; 4ZBD A; 4YQV A; 1GUH A; 1HNB A; 2J9H A; 2R3X A; 4IVF A; 4JBB A; 1K0A A; 3GH6 A; 4YAP A; 3WYW A; 5J5N A; 1FW1 A; 4KAE A; 2C3T A; 4NHW A; 1LBK A; 2YV9 A; 3KXO A; 5B7C A; 2PVQ A; 10GS A; 2WRT A; 3DD3 A; 4PNG A; 3TGZ A; 1SVM A; 3UAP A; 3EIN A; 4AKI A; 3P90 A; 3PR8 A; 1YVL A; 2C80 A; 5J40 A; 1MD3 A; 4ZXG A; 1FHE A; 1AQW A;
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