1PKWA

Crystal structure of human glutathione transferase (gst) a1-1 in complex with glutathione
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
221
structure length
220
Chain Sequence
AEKPKLHYFNARGRMESTRWLLAAAGVEFEEKFIKSAEDLDKLRNDGYLMFQQVPMVEIDGMKLVQTRAILNYIASKYNLYGKDIKERALIDMYIEGIADLGEMILLLPVPPEEKDAKLALIKEKIKNRYFPAFEKVLKSHGQDYLVGNKLSRADIHLVELLYYVEELDSSLISSFPLLKALKTRISNLPTVKKFLQPGSPRKPPMDEKSLEEARKIFRF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glutathione S-transferase A1
publication title New crystal structures of human glutathione transferase A1-1 shed light on glutathione binding and the conformation of the C-terminal helix.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 84
structure length 220
sequence length 221
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2003-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1pkwA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1pkwA01
1FOVA 2RIIA 4MF6A 1YQ1A 3GYKA 11GSA 1OYJA 2CVDA 3UVTA 3GHAA 4EO3A 3EYTA 4NPBA 3FK8A 2R37A 1QUWA 3CMIA 1AIUA 1QFNA 4FYUA 2H66A 4NWYA 1V40A 2H1AA 4PX1A 2YWIA 3A3TA 1S3AA 4POLA 4HS1A 3LYPA 2Z9SA 2RLIA 4H86A 1LJRA 4HOJA 2JACA 3WT2A 2CZ3A 1YF0A 1OVNA 2RUEA 2FWEA 4PGTA 3M0FA 1EWXA 2E7PA 1GUKA 1TU7A 2KOKA 4ML6A 3KEBA 2E2GA 1XZOA 4GWRA 3L78A 4YQMA 4I6XA 2LV3A 2DC5A 2MMAA 3IA1A 5A4VA 4ECIA 1Z7RA 1UN2A 4KW6A 4IS0A 1T4YA 2WGRA 1JZOA 3EC3A 3LG6A 8GSSA 1QK8A 2C0DA 3ZREA 1BEDA 1ERWA 3EURA 1X9MB 2FWHA 4L8EA 4IN0A 3WD6A 1ERVA 1ZL9A 1W89A 4V2MA 3APOA 4JE1A 2L5LA 1ACVA 1WRYA 1X5CA 4AF2A 3M1GA 2H74A 1K0OA 4WETA 4F0BA 3MSZA 4V1Ap 1ERUA 2VD1A 3VPQA 2JZSA 2M46A 5CP1A 1GTIA 4BVYA 3GH9A 4KCAA 1MTCA 3QAVA 3HZ8A 3BOAA 1SD8A 4WR5A 4ULXA 3GTUB 3UAPA 2A2SA 2LRTA 1V9WA 2PPTA 5ID2A 4ZB9A 5ECQB 2GSRA 1GTAA 2LRNA 4LA1A 4NMUA 3TOTA 2H72A 1YJ6A 2WULA 4TR4A 4KCEA 4LMVA 1GSSA 2CAQA 2B7JA 2VLVA 2ALBA 9GSSA 1GWCA 4NV5A 2L4QA 5GSTA 5INYA 1B48A 1I9DA 4PTSA 3WGEA 3QOUA 2LJAA 3R2QA 3DEXA 3HD5A 4MLYA 4EL1A 2OACA 4O32A 1U6TA 4Q5QA 2HQTA 2CX4A 1QGVA 1YEXA 4EKZA 5DQYA 2XHFA 1FW1A 4HU7A 4KDUA 2A4VA 4KX4A 3C1RA 3F3RA 4HDEA 4AGSA 4OO4A 1A8LA 3QAWA 1TI3A 2H1GA 1OKTA 3IE3A 4KAEA 1ZOFA 2V41A 4GSNA 2GTUA 1YF1A 4MMMA 2YN1A 3HJMA 4TW5A 4MZCA 4V2LA 3VWXA 1DE2A 2JSYA 3C71A 4IP6A 2GQKA 2P31A 1YY7A 3GMFA 1XXUA 1TTZA 2H6XA 3QCPA 1J0FA 2YWOA 4TN8A 5ENUA 3J7Yk 4D73B 1U87A 4Q5RA 3CTFA 3VPTA 2REMA 5G31A 4O7HA 4K0GA 4XS6A 2BJXA 2OBIA 5J41A 5IMVA 4ZBBA 2VIMA 3ZYWA 2VCZA 1Z3EA 4BL7B 5IMZA 2C3QA 4X0XA 2O7KA 4ECBA 1O81A 4X43A 2WDUA 1FVKA 3TCOA 1K0CA 5J4UA 3ZLPA 7GSSA 3H4KA 3ZVJD 4ECJA 5H5QA 3V1WA 3WYWA 2ES7A 2DJ0A 5HR0A 1K0NA 2CVKA 2JZTA 4XIHA 3F63A 3GN3A 4YAVA 1Y25A 1QMVA 2ON5A 3QFAC 2YJHA 2AB6A 1TI1A 5EY6A 4JU5A 4DSSA 3RHCA 1YZXA 3N9JA 4CW9A 2I1UA 4QL9A 1MDKA 4RUVA 3IC4A 1OKDA 5B7CA 1UA5A 3IPZA 3ED3A 19GSA 1EOGA 1UVZA 2QSIA 3IXRA 4GSTA 5IO2A 1T7PB 3O76A 5D9VA 2DMMA 4ZB8A 2VCQA 5DCHA 5F0GA 4OFMA 1H4OA 1XW9A 3F0IA 3RDWA 3DVWA 2V6OA 1IYIA 4BVXB 3A2VA 3FW2A 4PUFC 5D93A 1MD4A 3IRAA 5LD0A 4TR0A 1IYHA 1AXDA 1OAZA 2O85A 3P8WA 3HA9A 1WE0A 2PU9C 3IBHA 3R3EA 4FQUA 1ST9A 6GSSA 1ZYEA 5ECLB 3D6IA 5L71A 2LQOA 4HEA2 2FNOA 1GUHA 2GSTA 5IOWA 3FYGA 3KJYA 20GSA 1X9SB 2HYXA 2WJUA 2JADA 3O3TA 4TOPA 3W8JA 2BMXA 4KGIA 2B7KA 3GL3A 3F4TA 3GL5A 1XIYA 2H30A 1TKDB 4IJ3A 2CX3A 4K9ZA 3FRCA 1EV4A 1J9BA 2VL2C 3LYKA 5HR3A 1GNEA 2LJKA 2LJRA 4ID0A 2M80A 2IIYA 3TJBA 4IBPA 4Q5FA 2PUKC 4LLRA 4J2FA 5DJMA 4L0WA 4TKYA 4ILFA 4HZ2A 3DD3A 2FHEA 5CRGA 4K8MA 3QD9A 4ZBDA 4K6XA 1R4WA 2GSSA 3QAGA 2H76A 4IGJA 1YDKA 2VCTA 4HUAA 2AJQB 3TKQA 1ABAA 4YAPA 1XWBA 2F3MA 5AIVA 3PINA 3US3A 2J9HA 4KE3A 1Z6NA 2X8CA 3QDNA 4MPFA 2M72A 3GIXA 2YV7A 4BWSA 1URMA 1GSDA 4V1Ag 3KTBA 3L9SA 4MJBA 6GSVA 1XOBA 2KUCA 2FLSA 2PWJA 3HYPA 5E59A 4MH2A 4OMVA 5B8AA 4TVEA 4FYCA 1A0FA 4O5RA 5GSSA 1PD21 2LS5A 3KD0A 3GV1A 1O8WA 3DVXA 3PPUA 1BAYA 1T4ZA 3ERWA 1WWJA 3HVXA 1ZZYA 5J9BA 3FR3A 2HSMB 4XS4B 1K0MA 2OBKA 1TRWA 2ZUPA 5IOXA 2GSQA 5ECKB 2GQMA 1XPVA 4GXZA 3GTUA 3QR6A 2IN3A 3CYNA 2LTKA 1K3YA 2LEGA 4TR3A 3H8QA 1XW6A 3KM6A 1EP8A 1V58A 3A5WA 3C73A 1RW1A 2JSZA 2C8UA 4IHUA 4BA7A 1I5GA 1A23A 2PVOC 2L5OA 3MDKA 3JCML 3CTGA 22GSA 1SU9A 3KTLA 2QGVA 2YP6A 4G19A 2B3SA 3VI7A 3F6FA 4K2DA 1SKWB 1TJDA 2CAIA 1AQVA 2YANA 1X0RA 1SL1B 4ZL7A 5HR1A 3C7MA 4IKHA 3KP9A 3IK7A 5F05A 1T3BA 4I5QA 1FAAA 4ZL9A 1ERTA 1G7OA 5KN0A 1W4VA 2IMDA 5E4WA 3ZFBA 1GTBA 3DKSA 4TXOB 3ERGA 1XWCA 3IOSA 2H8LA 4OCFA 1KNGA 2OKAA 4IP1A 2H01A 4POKA 4I97A 4EDYA 2FD3A 1M7TA 2XBQA 1LBKA 4XRAA 2L6DA 3LXZA 1SL2B 3I69A 2VM1A 2KLXA 1TK5B 1XVWA 2IJYA 2NDOA 5ELGA 1R26A 1M9AA 1CQHA 3QFBC 3EWLA 1TK8B 3C8EA 4MCUA 4KH7A 3HY2A 2P5QA 2H0GA 1TOFA 1HYUA 1SJIA 2H1BA 4JR6A 1XW5A 2OE0A 4XS1A 5D8IA 2DJJA 1VF4A 1KBNA 2V1MA 3ZZXA 2OE3A 3KCMA 2C0EA 2IWTA 2GZPA 3TJGA 2CT6A 4L0UA 1WOUA 4D73A 1HNAA 1SENA 2HRAA 2WS2A 1YEPA 5CNWA 5ECOB 2YJ7A 3WT1A 1GSFA 2C3TA 1SK2A 3TKPA 4EUYA 4ISDA 5EVOA 2H70A 4WXTA 2HRKB 1TRVA 4BL7A 3IR4A 3FZAA 3GKXA 4P3YB 2OJLA 5JWQB 3KH9A 2MYGA 3HJPA 4RQRA 10GSA 2AV4A 1PN9A 1GNWA 3DYRA 5AISA 2FY6A 5JCGA 1PKZA 4ZIJA 2GQLA 2YV9A 1TXXA 4F82A 4ZBAA 2H6YA 2C4JA 4USSA 3Q19A 2C1YA 4ACSA 3E0UA 4EXJA 3TKSE 4Q5NA 1JLWA 5IPHA 4QL7A 1M0UA 2GS3A 5BMUA 2GT5A 3G7IA 3L0HA 2XC2A 3GX0A 1JZRA 1J08A 2MMZA 2WZ9A 4E8HA 2GZYA 4HI7A 2OA7A 2VCVA 1AQWA 3GA4A 3VLNA 1XFLA 3TDGA 5ELAA 5DALB 1TRSA 2KP2A 2OE1A 5B8BA 2DJKA 1PQNA 4BVXA 2X99A 2I81A 3ZRDA 3CSJA 4MK3A 3CSIA 2VL2A 5J9CA 4YH2A 4GRFA 3Q18A 3HVVA 2VL3A 4EE0A 2VL9A 5H5SA 1K0BA 1WP0A 1THXA 3RPNA 1G6WA 3LORA 3BBYA 4HQZA 5DDLA 5AIXA 1Q4JA 4O92A 2L6CA 3VWWA 3TKSC 3UJ1A 3F3QA 3VWVA 1A8YA 4WKWA 3GRXA 2FWFA 2H75A 5CAXA 1SK1A 4POBA 1KTEA 4KDYA 2YOIA 3DRNA 4N30A 1PL1A 4G0IA 4V2NA 5CO3A 3UOMA 2LKUA 5HFIA 2O89A 5A4WA 2MBSA 3HKRA 2VM2A 4IQAA 3D5JA 1K3LA 1QXHA 1EEMA 5CRWA 2PGTA 3OR5A 2AUVA 1Q98A 6GSTA 2N5FA 2KP1A 3G7YA 1MEKA 3GURA 2ZCTA 2DJ2A 3G9BA 5A4UA 4BPYA 1GRXA 3APSA 4GTUA 1X9WB 2VCXA 6GSWA 3ZIJA 1WPIA 4FIWA 4WBRD 3F8UA 2TIRA 2J23A 2YPMA 2N5BA 1NHYA 1GH2A 2MMNA 2VOCA 4MJAA 1DSBA 1R7HA 5G2ZA 3CBUA 2H71A 4MABA 2IPAA 4F9ZA 2B5EA 3EVIA 1MD3A 1YKCA 2B6MA 4HJMA 3CSHA 1A24A 2HI7A 2F8FA 4OCEA 1AUCA 4AJ7A 2YWMA 3TRQA 1Z5YE 4F03A 4MJEA 4KA0A 3TJJA 4NHZA 5JWRB 3BJ5A 1NSWA 2HSMA 4LL4B 2P0GA 3LSZA 1K0AA 4XRDA 4XS4A 4PNFA 1BJXA 5GAPD 1F2EA 1JHBA 1Y6EA 2DJ3A 2I9HA 1PKWA 1GSUA 2EIQA 3VK9A 5DAKB 1AQXA 3HVSA 2MMOA 2LSTA 2H1DA 1OC8A 1RQMA 4QQ7A 1USBA 2O8VB 1O8XA 2L57A 4XCSA 2XPDA 5ECIB 6GSUA 1RK4A 3GFKA 3KZQA 4DSRA 1HNCA 2V6KA 4DVCA 3PGTA 1E2YA 5D9XA 5IMFA 5HFKA 1BYEA 1PX6A 1ON4A 2B5YA 4YQUA 4E8EA 2PMTA 1PX7A 1VGLA 4DSQA 1JZDA 4G0KA 2EIOA 1ZMAA 1EOHA 4JEDA 3HHVA 3ZL5A 5AN1A 3A2WA 2WCIA 4TXOA 2NPBA 4XTSA 2HSYA 4K7NA 1ZCPA 3LFLA 1M2BA 2H6ZA 4N0ZA 4PQ1A 1HNBA 3M3MA 1EV9A 2AHEA 3ME8A 3IAS2 5ECSA 2UZ8A 2IMKA 5DJLA 5DVBA 3P7XA 2YZHA 2DSAA 4MF5A 4EDZA 1R5PA 5D73A 4KB3A 3UMAA 5IMDA 1F6MC 3WGXA 2HSNB 3G7JA 2HXKA 4WEYA 1U3IA 3HJOA 3P2AA 2GZZA 1XBSA 1PA3A 4J56E 5HFGA 1Z7PA 3KXOA 4CHSA 1U3AA 1B9XC 4ECCA 2I3YA 2LRCA 2HRNA 3D0ZA 4K1FA 3RPPA 2RUFA 2O87A 3CXGA 3GH6A 2VUPA 3ISOA 2EIRA 3KIJA 2LUSA 3NOFA 1FO5A 3ZITA 4GQFA 3IV4A 4K7OA 5EPFA 3H1NA 2N5AA 2HRKA 3ZMLA 1XOAA 2PERA 2OADA 3FZ5A 2HZEB 2HNLA 2HZFA 4IW9A 4GF0A 1WIKA 1AAZA 4I2UA 3NIVA 1FVJA 3WGDA 3FR9A 4OO5A 3BD2A 4WBJA 1TDIA 4JR4A 2H0HA 1A2LA 5IPGA 4FH8A 4CDOA 2H19A 1A0RP 3EU4A 5D9TA 2X8HA 3SBCA 3EMPA 4ZILA 4KSMA 2R6KA 2GGTA 3IDVA 1XVQA 2AYTA 2IFQB 1B4PA 2R2JA 1ILOA 4I8BA 3TUEA 3DWVA 2CV4A 5H5RA 3S9FA 3LGCA 3EE2A 2NVLA 4JBBA 1EP7A 3W8SA 5DALA 2DBCA 5JWOB 2C3NA 4TR1B 3TRPA 5KN3A 2BTOT 3PH9A 4EC0A 4ZL8A 3TKSA 4N0VA 3D21A 1PGTA 4RI6A 4PUAA 3GNJA 1G7EA 5D9WA 4JRRA 1VRSD 4TRXA 4RI7A 1O6JA 1GSEA 2DIZA 1GSQA 1B4QA 1X5DA 1EZKA 1M9BA 2PBJA 3KMNA 4F2IA 3HXSA 2LNTA 3APQA 3LXTA 5ECHB 5CRHA 3TOUA 1EEJA 1M99A 5FHIA 2IL3A 1F3AA 3MWHA 5G5EA 1C72A 5F06A 5FWGA 2VO4A 3H93A 3LWAA 1K3OA 4JZQA 4YQVA 4WF4A 4AJ8A 3IK9A 3RBTA 1TU8A 5ABRA 3ERFA 1GUMA 1OC9B 4MA9A 5F07A 2QC7A 1FB0A 3FR6A 3TJFA 3M8NA 2R3XA 2NTOA 2V32A 5J5NA 4N11A 4EVMA 3LQ7A 1F37A 5ECPB 5FT3A 4MDCA 4AJ6A 4OD7A 2R4VA 2DJ1A 4KSOA 1Z6MA 1OE7A 5DCGA 3FEUA 3GKMA 4PQHA 3DGQA 1ML6A 1TW9A 2K18A 3GKNA 3I43A 3Q6OA 3KMOA 3ZVJA 2B1LA 3CRTA 2ZNMA 4OWYA 5IIZA 3E3EA 4ML1A 1A2MA 3TB2A 2YCDA 1TK0B 2A2RA 4HU9A 2VD0A 2H73A 2FUG2 1B8XA 2LNSA 2VAFA 3ME7A 1SKSB 4MH3A 2KHPA 2F8AA 3GKKA 2WB9A 3MAKA 1S3CA 5IMAA 2YWNA 1FHEA 2L4CA 1XCCA 5JCWA 5LNKe 2RM6A 1TP9A 2FWGA 3IC8A 3Q74A 3QPMA 5F8BA 4MJCA 4MZBA 4X1UA 2IMEA 4PXOA 1PRXA 2D2ZA 1NM3A 2G0FA 3LJRA 2YNXA 1JLVA 1N2AA 3M9KA 2AAWA 4OFNA 3M9JA 2MBTA 2WFCA 4HQSA 3IAM2 1A2JA 4N10A 4HZ4A 3HDCA 2L59A 3FZ9A 3FY7A 3D22A 1ZYQB 3I9V2 1XWKA 2CVBA 1U88A 2WRTA 1SD9A 1THOA 2YZUA 3ZIVA 2F9SA 1PMTA 1XWAA 2XPEA 2B1KA 1V2AA 5KEJA 2FA4A 2H0IA 1GSYA 3L9VA 5CYYA 5B6MA 1GP1A 3EMXA 1OC3A 4BWQA 4Z7XA 1SJ6A 5DAKA 5CRDA 2HT9A 5D96A 4FYBA 4KNDA 3MNGA 1UC7A 1B9YC 5ECMB 18GSA 5AGYA 2K8VA 1GULA 3GSSA 4BVYB 3LEFA 3GUSA 4L5OA 3D4MA 3W6GA 4NXIA 2ON7A 2LQQA 5IO0A 2C80A 5ID2B 2JL4A 2MZCA 3UARA 3UVHA 3D4TA 6GSXA 5A5KA 6GSYA 1M2DA 1M2AA 4ZXGA 3F9UA 3VWUA 2TRCP 2K8SA 4FO5A 2G2QA 1GLPA 3DXBA 4J57E 1K0DA 3CRUA 5IM9A 4IVFA 3KP8A 1BQ7A 1JFUA 4GQCA 1MDIA 3TRXA 4MF7A 3PR8A 3FHKA 3FZ4A 4PURA 2DLXA 1V98A 4IQ1A 3NZNA 2FA8A 1AC1A 1H75A 4F0CA 1E6BA 1F3BA 3HCZA 3P90A 3IHQA 2TRXA 3AY8A 3HZ4A 4K0NA 1JZWA 1GL8A 5C00A 1MDJA 1FG4A 5G1KA 1KEBA 5HQPA 1PSQA 1YKAA 17GSA 3KGKA 2K6VA 1R5AA 3A2XA 4TXVA 5J3RA 3TKRA 4ZB6A 2I4AA 4NHWA 2EC4A 4GLTA 1F9MA 3N5OA 16GSA 4IJIA 5GAND 4PQIA 2V2GA 4RQXA 5IMCA 1NW2A 3ZFLA 5B6NA 4WF5A 4HJ2A 5KN1A 2RM5A 1GLQA 14GSA 2VCWA 5G1LA 1VF3A 4MP4A 4KDXA 1DBYA 1OE8A 4G2EA 1X5EA 1SYRA 2DMLA 3L4NA 1WJKA 1G0TA 1O73A 1HD2A 5DBQA 1T1VA 2FGXA 4LMWA 2HZEA 1LU4A 2E0QA 2E2MA 3TJKA 5LCZA 3DIEA 4GCIA 4G0LA 5COHA 3KH7A 3UL3A 4EF0A 2JU5A 1N8JA 3ZTLA 4LL1B 3RHBA 2GDRA 3E9JB 12GSA 2QKEA 3VURA 1T8EB 3GSTA 2PN8A 2CZ2A 3RAZA 1NHOA 2GLRA 3EINA 2C0GA 1O85A 1SYXA 1WMJA 5HR2A 3VFIA 4G10A 4MZWA 4POMA 5GZZB 5C04A 1XWGA 1O7UA 2X64A 3TGZA 1V57A 2IFQA 5CREA 4WR4A 4MPGA 4NV2A 4GSSA 2VLUA 1BG5A 3GX8A 4K7IA 5KN2A 1SL0B 3F4SA 1ZGNA 1SKRB 3C1SA 2X8GA 2CQ9A 2F51A 1FB6A 1SJZA 1QQ2A 3U6VA 1Z9HA 2HRFA 4KF9A 5DQSA 2NBSA 3DMLA 2B5XA 3K8NA 4DSSB 1VF2A 2FCHA 4TR1A 2VLTA 2HLSA 3VI5A 3UBLA 1SK0A 5G5FA 3F6DA 4XHMA 13GSA 2K9FA 3QMXA 3O6TA 3UEMA 5ECNB 1DUGA 3J7Yb 1HQOA 3FKFA 2DIYA 3F4RA 4PNGA 1GTUA 2P5RA 4KUNA 1DE1A 2IMIA 2R5GA 2PVQA 3EU3A 3BCIA 2XBIA 4DEJA 2CA8A 1CQGA 1T00A 2HSHA 4OFTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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