1PKWA

Crystal structure of human glutathione transferase (gst) a1-1 in complex with glutathione
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
221
structure length
220
Chain Sequence
AEKPKLHYFNARGRMESTRWLLAAAGVEFEEKFIKSAEDLDKLRNDGYLMFQQVPMVEIDGMKLVQTRAILNYIASKYNLYGKDIKERALIDMYIEGIADLGEMILLLPVPPEEKDAKLALIKEKIKNRYFPAFEKVLKSHGQDYLVGNKLSRADIHLVELLYYVEELDSSLISSFPLLKALKTRISNLPTVKKFLQPGSPRKPPMDEKSLEEARKIFRF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glutathione S-transferase A1
publication title New crystal structures of human glutathione transferase A1-1 shed light on glutathione binding and the conformation of the C-terminal helix.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 220
sequence length 221
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2003-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1pkwA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1pkwA01
5GAND 4DVCA 1JZDA 2FGXA 2IMKA 3EINA 3GX0A 2GQMA 3TJBA 2R37A 1U88A 4ML6A 4PURA 2M72A 1HNAA 1O8XA 5AGYA 4K7IA 1SD9A 3UIWA 5H5RA 1IYIA 3ME7A 2YWMA 2H74A 3KZQA 2ZCTA 1YY7A 2L59A 2ON5A 4O32A 4KF9A 1FB0A 3BCIA 3PR8A 2KHPA 5DALA 4CW9A 5EL8A 2HZEB 4D73A 2GT6A 3VWXA 1PKZA 3GKMA 4XS4A 4EF0A 3IRAA 2X64A 2N5BA 5JCUA 1B48A 1R5AA 3Q74A 1K3YA 1ERVA 5HR2A 4OMVA 2HSHA 5CP1A 4V2LA 3GTUA 2DMMA 4POKA 2WDUA 1UVZA 2C0DA 1PGTA 3QFAC 4K8MA 1R4WA 3H79A 3PPUA 1K3OA 4HQZA 3EMXA 3QAVA 5D93A 2ZNMA 1K0CA 2R5GA 5ECOB 3NZNA 4MJCA 2VL3A 3FRCA 1XOAA 2J9HA 5A4WA 3ED3A 1T00A 3TRQA 4KW6A 1A8LA 1YDKA 2DJ3A 4K0NA 1EV4A 3TGZA 4TR0A 2GSSA 5IO0A 4I6XA 2CT6A 3KTLA 1SKRB 4AF2A 1MDJA 1Q4JA 2HRAA 1VGLA 3HJMA 4KSOA 1SD8A 4IELA 16GSA 4EUYA 1EOGA 2VL2C 2DJ0A 3TCOA 1Z6NA 3UEMA 1R26A 4K2DA 4DSQA 1EP8A 1A2LA 3NOFA 4ML1A 2H8LA 3MWHA 3ZRDA 1PRXA 5ECSA 5A4UA 4FH8A 1I5GA 5J4UA 5JWQB 4RQRA 5ABRA 3RDWA 2GDRA 2B5XA 1PX6A 1BYEA 3GUSA 1U87A 3P7XA 1KTEA 3M1GA 4J57E 4WETA 1DE2A 1T4YA 2H1AA 2C1YA 2AUVA 4ZXGA 2H30A 3C8EA 5D8IA 4G0IA 1S3DA 3GKKA 2O89A 5G1LA 3FZAA 3I69A 1V98A 3R3EA 5D9WA 3LJRA 4MA9A 2UZ8A 4ILFA 2I1UA 3HKRA 2IFQB 2LRCA 1TRUA 4POBA 4WEYA 2JZSA 3G9BA 2VO4A 1NHYA 3K8NA 3M9JA 2FHEA 4JBBA 1JZOA 4XTSA 4QL9A 2YZHA 2RUEA 3FZ4A 3UL3A 1TRSA 2HSNB 3O3TA 4MJAA 4JE1A 5F0GA 2OE3A 4MZCA 1GUMA 5LD0A 4IW9A 4XRAA 1K0MA 4IGJA 3L9SA 2FCHA 2VD1A 3F0IA 2QC7A 4PNFA 4TW5A 4OCFA 1AUCA 1FO5A 4MABA 3GIXA 4WKWA 3WGEA 2RLIA 2QKEA 6GSTA 2DJ2A 1ZGNA 5EY6A 4NXIA 4GCIA 2WGRA 2H71A 2D2ZA 1OVNA 2FWFA 3A2VA 3EURA 4K9ZA 3BOAA 5AN1A 5F05A 4ZB8A 4OFMA 3CSJA 3J7Yk 3WGDA 1OE8A 1BG5A 4LL4B 3KP8A 1OC3A 3KXOA 4ZBDA 3IK9A 2V6KA 3G7JA 2EC4A 1MD3A 3HJOA 2XBIA 5DCHA 5ECLB 1K0NA 5CRWA 1M2AA 1O6JA 4FYCA 2GQKA 4IN0A 6GSWA 3KGKA 2PN8A 4PQIA 2OACA 3I43A 3EMPA 1JZWA 2RM6A 1GTIA 5FHIA 1X5EA 3Q18A 3FZ5A 2FWGA 4TR1A 5J41A 1E6BA 4XS4B 1Z6MA 1TK8B 4LA1A 5G30A 3E0UA 5AISA 2HFDA 4O5RA 3KEBA 5LCZA 3GTUB 5D9XA 1K0DA 1TP9A 1QUWA 2HZEA 1SU9A 4ZL8A 4F2IA 2X8CA 2B6MA 4NAXA 5ECIB 3GURA 1JLVA 4KB3A 5F07A 1U3AA 4EL1A 2R4VA 2EIOA 3DYRA 3ZL5A 1K0AA 5IO2A 4GWRA 1IYHA 4LMVA 2X99A 3IBHA 2CX4A 1QQ2A 3GN3A 3FZ9A 5DJLA 1XWAA 3ZMKA 1FW1A 1GP1A 2O8VB 4V2NA 3ZLPA 1EP7A 1EZKA 5CO3A 1Y6EA 4DEJA 2LV3A 1EEJA 4HI7A 2IMFA 4POMA 2FUG2 2CVBA 1ZMAA 1M7TA 3M3MA 3DD3A 4NHZA 3QPMA 3C1SA 20GSA 3MDKA 4YH2A 4RI6A 3GKXA 2MZCA 2H6XA 3GRXA 1WPIA 3IK7A 4G2EA 1ERUA 3D6IA 3LYPA 5LNKe 3TJKA 5C04A 3EC3A 2IMEA 2ZUPA 4K7OA 3W6GA 5DQSA 4ID0A 4WBJA 6GSSA 2WULA 2YCDA 4BL7B 1EEMA 2CZ2A 2GZPA 4EDZA 3HZ4A 3GSTA 2ES7A 1AQVA 1A23A 3IAM2 3A2WA 4L0WA 2IL3A 2O85A 8GSSA 3DMLA 1X5CA 4K0GA 1GUKA 4GRFA 3A3TA 2DSAA 2XC2A 4Q5NA 1PL1A 1EV9A 5CAXA 3FK8A 4MLYA 2WZ9A 2HXKA 3TKSA 3D22A 3TRPA 3PH9A 2L4QA 1X9MB 1YKAA 2L6DA 1SJIA 3F8UA 4OFNA 4MF7A 4JR6A 6GSVA 1Z3EA 1XW6A 5EPFA 1K0BA 3EU3A 2AHEA 3RPPA 2IFQA 3U6VA 2K8SA 3GKNA 2VUPA 2MBSA 5B7CA 4HUAA 2B1LA 2I4AA 4XCSA 4GSSA 1EWXA 4MMMA 2VCWA 2DJ1A 2H0IA 1QFNA 1V57A 4H86A 3QAWA 3WGXA 2I9HA 1THXA 3SWLA 2CVKA 1ZCPA 1B4PA 3F3RA 1ABAA 4ZL9A 5DBQA 2H0GA 1XVWA 4RQXA 1FHEA 5DDLA 2N5AA 3DVWA 2DIYA 1A8YA 1J0FA 3H4KA 2GGTA 4EKZA 4PQHA 1ST9A 1NSWA 3F6DA 1H4OA 3FHKA 1OC8A 5J9CA 2F8AA 3NIVA 3AY8A 2LNSA 5DQYA 5BMUA 4HDEA 2B7JA 1TJDA 3G7IA 4V1Ag 1GULA 1GSDA 4TR3A 2Z9SA 1YEXA 2L6CA 1AAZA 2YWOA 2NTOA 1XPVA 1YF0A 4QL7A 2OBKA 3IAS2 4E8EA 2NPBA 5KN3A 3ZITA 4TR1B 1QGVA 3LG6A 3V1WA 1X9SB 4PUAA 4MH2A 2A2RA 3HD5A 1FAAA 14GSA 1TRWA 3PINA 1BJXA 2PWJA 5H5QA 3H1NA 5HFKA 1TRVA 5A4VA 2L4CA 3M9KA 4OCEA 3HVSA 2VM2A 3F4TA 3DRNA 1G6WA 3QD9A 1LU4A 1OAZA 3TKPA 2B5EA 2YP6A 2C3NA 3ERGA 4MF5A 1BEDA 1O8WA 18GSA 3FR9A 2M80A 2L5LA 1FG4A 5ECNB 2R3XA 2VCZA 2CA8A 3VWWA 1G7EA 3Q6OA 1A0RP 4XRDA 5IMVA 1OC9B 1CQGA 4L8EA 2ALBA 4KE3A 1VF3A 2LEGA 5ID2B 1B9XC 3QFBC 2H0HA 3DWVA 3J7Yb 5HFIA 4GQFA 1AW9A 2HRNA 2TRCP 2PUKC 3HCZA 2FY6A 1XXUA 3FKFA 2O7KA 1U6TA 4EC0A 2VLUA 1BAYA 1GWCA 3UVTA 6GSYA 4TKYA 2B5YA 3ZVJD 4I2UA 2KUCA 1GSEA 3LEFA 3QAGA 5DAKA 3KP9A 3E9JB 4ZB9A 1LJRA 2WRTA 2EIQA 2LRTA 4PUFC 5KN0A 2JL4A 2YWIA 3KTBA 3TB2A 5DJMA 4NHWA 3TOUA 2CX3A 1PMTA 3KMOA 4BL7A 3ISOA 1XWGA 3ZZXA 5G31A 1RK4A 4G10A 2YZUA 3RAZA 4MZBA 2HQTA 4F03A 3GX8A 5KN2A 3DXBA 3EU4A 4V1Ap 2GSTA 4HQSA 1TKDB 4ECJA 2XPDA 3WT2A 4BPYA 1G0TA 2HRFA 1WJKA 2K9FA 5GZZB 5CNWA 1HQOA 1N2AA 3TRXA 3ERWA 4NWYA 5CRHA 2RIIA 1SYRA 4ECCA 5IMZA 3TJFA 2P0GA 5F06A 5GSSA 4TRXA 2N5FA 3LXTA 2PMTA 4ACSA 4HU9A 2V41A 2LRNA 4BA7A 5INYA 3ZFBA 3KD0A 4IQAA 5EVOA 3BD2A 4IS0A 1JLWA 4G0LA 1B8XA 1YZXA 1M99A 5JWRB 2IJYA 2YJHA 3EWLA 1DE1A 4NV2A 4MZWA 3F6FA 1GH2A 2LJAA 2OA7A 5GAPD 3UAPA 2E2MA 4EO3A 1DUGA 5D73A 1SJZA 2FD3A 3US3A 1GNWA 4HOJA 3EYTA 3CSHA 4AJ8A 4CHSA 7GSSA 5ECMB 2PVOC 2HI7A 2CVDA 3CTFA 4IKHA 1RQMA 2VCVA 4DSSB 1ERWA 1B9YC 2LQOA 1PA3A 10GSA 1YJ6A 4GLTA 1SJ6A 2C3QA 4CDOA 3KJYA 1WMJA 1Q98A 4O92A 4RI7A 22GSA 3HVXA 2AYTA 3ERFA 4MK3A 4KA0A 2PU9C 4I97A 4XIHA 2GS3A 1GSFA 4HZ2A 1PSQA 4N11A 1YKCA 1T3BA 4MH3A 1EGRA 2YNXA 3HVVA 4QQ7A 4PNGA 4XS1A 3QCPA 2CAIA 1YF1A 1O7UA 3LQ7A 4OFTA 3PGTA 4IJIA 3FEUA 1QXHA 3DKSA 4ZBAA 1TK5B 4O7HA 1XWCA 5D9VA 4JR4A 1FOVA 2H75A 4N0VA 1V2AA 2R2JA 3WYWA 2J23A 1B4QA 1T4ZA 4KSMA 4HU7A 4FQUA 2V1MA 2AB6A 1GSSA 4PXOA 1W89A 2DJJA 2LJRA 3TKSC 6GSXA 3ZYWA 4Q5QA 1SENA 2JADA 2JSYA 4V2MA 5ECHB 3HHVA 3JCML 2DMLA 1FVKA 4OO4A 4J56E 4G0KA 1F2EA 3KIJA 5HR3A 3M8NA 1ZL9A 3QMXA 2VAFA 2GT5A 2C80A 1OC9A 1GSQA 2L5OA 2PBJA 5B6NA 2C4JA 5ID2A 1G6YA 1NW2A 2LJKA 2V32A 5IMFA 4LMWA 4I2TA 3F3QA 1BQ7A 2H6YA 5DAKB 5E59A 4K7NA 1ZYQB 1M9AA 3EE2A 3IC8A 1WWJA 1THOA 3SBCA 4TN8A 5H5SA 1XWBA 5HFGA 4GF0A 1GL8A 4I5QA 2IIYA 2C0FA 3ZTLA 1TK0B 3C1RA 3LYKA 3TOTA 3DIEA 4F82A 3MSZA 1MDIA 2K8VA 1SK0A 2FLSA 3GL5A 1MEKA 1R5PA 4WR4A 2REMA 3VURA 4EDYA 2K6VA 5AIXA 3C71A 4GSTA 2G2QA 5J9BA 2GZYA 4PTSA 3HYPA 4XS6A 2C0EA 4EVMA 2AJQB 2YOIA 5JCGA 3IOSA 3VPTA 5B8BA 1TTZA 3L9VA 2HSMB 3H8QA 4MF6A 3HA9A 1YEPA 1Z7PA 1NHOA 4MPGA 3TJJA 2WCIA 3APOA 1GUHA 2GQLA 4F0BA 2DIZA 2VM1A 2GTUA 1LBKA 4P3YB 1MDKA 1T1VA 4KDXA 3MNGA 3N5OA 2X8GA 1S3CA 5COHA 4KUNA 5IMCA 2LS5A 2F9SA 3FW2A 1F3BA 2ON7A 1XOBA 5D96A 4PGTA 5DVBA 1Z9HA 4I8BA 1XWKA 2YV7A 9GSSA 4AJ6A 2P31A 3KMNA 2F8FA 2FWHA 3UJ1A 3ZFLA 4K1FA 4ZBBA 1VRSD 3UOMA 2BTOT 2JSZA 5G5FA 3D0ZA 2V2GA 2YPMA 1ZZYA 1VF2A 2MMNA 2RM5A 4KCEA 2F51A 4ZILA 2HT9A 3QR6A 1PL2A 1Z5YE 2I3YA 2YANA 4WXTA 1H75A 2FNOA 4XHMA 2VCXA 1WRYA 5CRDA 3CBUA 1X5DA 4NPBA 4DSSA 3KCMA 1N8JA 5CYYA 2MMOA 2YN1A 1GSYA 4IP1A 3O6TA 19GSA 1S3AA 2P5QA 3F9UA 2B7KA 4ZB6A 4KX4A 3LGCA 4L5LA 5HQPA 2IPAA 4ECBA 5L71A 3LFLA 2PVQA 3I9V2 3TUEA 2C0GA 4BWSA 4FYBA 3VI5A 2H73A 1YQ1A 1GTAA 2C8UA 2CAQA 2TRXA 1F6MC 3FYGA 2KLXA 3DEXA 4FO5A 4KGIA 2JZTA 1I9DA 1J9BA 4L5OA 3A2XA 5IPHA 2HE3A 3W8SA 3S9FA 4JEDA 3VLNA 4MDCA 5J3RA 3UBKA 4BVXB 5ELAA 4KNDA 3CSIA 3GL3A 5G2ZA 2H6ZA 4L0UA 2EIRA 4EE0A 4GTUA 4MJEA 3GMFA 2HRKB 1QK8A 1AXDA 4F9ZA 2H76A 5HR1A 1U3IA 2FWEA 3GFKA 3H93A 3CMIA 4N0ZA 3IR4A 5ECQB 3RHCA 3U5RE 2H1BA 2CV4A 4TR4A 2DLXA 3GH6A 2VD0A 4POLA 1A2JA 4PQ1A 1XFLA 4WBRD 1QMVA 1SKWB 1WP0A 1XW5A 3VPQA 1F9MA 1PQNA 5IM9A 4GSNA 1FVJA 4E8HA 2VLVA 2H01A 3RHBA 3IV4A 1SL0B 1C72A 2HSYA 2O87A 2OKAA 1EGOA 1JFUA 3CRTA 2B3SA 4KH7A 2WFCA 3HZ8A 2NBSA 1M9BA 3LORA 3CYNA 4YAPA 3RBTA 3L78A 1R7HA 2WS2A 4AGSA 5IQYA 3FR3A 5ECKB 1URMA 2VCQA 3P2AA 3TJGA 4K6XA 2NVLA 5ECPB 4JZQA 2XPEA 3DVXA 1VF1A 2QGVA 2XHFA 4ZIJA 4N10A 5C00A 1M0UA 3GHAA 4PX1A 2CZ3A 2E2GA 1O85A 3UARA 2PGTA 3BCKA 1PD21 2H1DA 11GSA 4KCAA 4Q5FA 2HSMA 3L4NA 1GLPA 1ML6A 5G5EA 3VK9A 5B8AA 4KDYA 2KOKA 2WB9A 2MBTA 5D9TA 3C73A 2X8HA 3IE3A 4TXOA 4IHUA 5KN1A 2A2SA 2AV4A 3TDGA 3GNJA 5F8BA 2LUSA 5ECRB 2JACA 3L0HA 1GTBA 1JHBA 3TKQA 3C7MA 1JZRA 5DCGA 2V6OA 2JU5A 3E3EA 3KH9A 1DSBA 4YAVA 3UVHA 3ZIJA 4YQVA 1O73A 2LTKA 2VL2A 4Q5RA 3P90A 2H1GA 2OE1A 3W8JA 2P5RA 5E4WA 5CREA 2M46A 3BBYA 4ECIA 1M2BA 1O81A 1XIYA 1V58A 3KM6A 3IHQA 1ILOA 1V9WA 4BVYB 2LSTA 2LNTA 3A5WA 1FB6A 4RUVA 1AQXA 2MYGA 2XBQA 2FA8A 4JRRA 5CRGA 4FIWA 4NV5A 4HEA2 4IQ1A 5IOXA 2LKUA 3VFIA 4TOPA 1F3AA 2HLSA 1G7OA 1HYUA 1HNBA 3LXZA 2OJLA 1X9WB 1EOHA 1UC7A 1GRXA 2PERA 4WR5A 3TKRA 1F37A 4LLRA 4OO5A 1PX7A 2HNLA 4Z7XA 1GLQA 4IVFA 5A5KA 3M0FA 3ZMLA 5DALB 4X43A 4D73B 17GSA 2C3TA 2A4VA 1Y25A 1W4VA 3D4MA 5GSTA 2E7PA 3I6AA 1UN2A 3VI7A 1OYJA 1TI3A 1XVQA 3CTGA 3D4TA 3IC4A 1SK1A 1XCCA 2RUFA 4ISDA 5JCWA 4HS1A 1TU7A 1GSUA 1GNEA 2VCTA 3UMAA 1SKSB 1BX9A 3OR5A 4DSRA 1AQWA 3ZREA 3FY7A 4HJ2A 3CRUA 4BVXA 2TIRA 1AIUA 4MCUA 4KDUA 1XZOA 2WJUA 2IWTA 2HRKA 4IJ3A 2JZRA 1USBA 2HYXA 2IN3A 2PPTA 2QSIA 2VLTA 1OE7A 4GXZA 4OD7A 1XBSA 3RPNA 2DJKA 1SL2B 3HJPA 2OADA 1M2DA 2KP1A 4GQCA 2VL9A 1RW1A 1OKTA 3HY2A 3QDNA 1PKWA 1WOUA 3R2QA 4TVEA 1OKDA 5JWOB 2VOCA 3GYKA 1ON4A 3N9JA 3APQA 5ELGA 1UA5A 1K3LA 5G1KA 2IMIA 1WE0A 3GV1A 2YWNA 2I81A 3GA4A 1NM3A 5KEJA 4IP6A 5ENUA 5AIVA 4JU5A 2GLRA 5FT3A 4NMUA 3VWVA 4YQUA 4BWQA 3GSSA 4MPFA 2VIMA 3GH9A 4WF5A 4X0XA 1DBYA 2H72A 4OWYA 3L9UA 1ZOFA 1KEBA 4ULXA 3VWUA 3IA1A 2K18A 3G7YA 3Q19A 2GSQA 5IMDA 2DC5A 1GTUA 2R6KA 3O76A 3F4SA 2L57A 2CQ9A 5J5NA 3DGQA 1HD2A 1SK2A 3TKSE 3UBLA 4F0CA 6GSUA 4LL1B 3D5JA 4G9HA 4HJMA 5IMAA 2F3MA 1ZYEA 2MMAA 1X0RA 1V40A 1TW9A 1TOFA 3ZVJA 1WIKA 1E2YA 1A2MA 3CXGA 3ZIVA 2NDOA 2H19A 4EXJA 1XW9A 13GSA 1A0FA 2YV9A 3IPZA 1A24A 4MJBA 2FA4A 3ME8A 4IBPA 2B1KA 5HR0A 3HDCA 1SL1B 2AAWA 2KP2A 4TXOB 4AJ7A 5IOWA 4USSA 2OBIA 1TXXA 3WD6A 4TXVA 3D21A 2YJ7A 4J2FA 1ERTA 3LWAA 2G0FA 3F63A 4YQMA 2IMDA 1TDIA 2BMXA 4FYUA 1J08A 4HZ4A 4WF4A 3F4RA 3MAKA 3IXRA 4X1UA 1T8EB 3HXSA 3APSA 1ACVA 2E0QA 2GVPA 5IIZA 2MMZA 1KNGA 3WT1A 12GSA 1KBNA 2H70A 1TU8A 3P8WA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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