4NHW | Genus

Total Genus 79

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	219
structure length	213
Chain Sequence	MLTIYGVYRSRASRNYWMAGELGLPFRSVPVVQAHRVADPLAADAPLNTKSPGFLAINPMGLIPAIEDDGLVLTESLANNLYLARKHGGPLAPADIREEGQIGNWTMWAATEVEPHAVKIVLAHTPEGRAEIAACARSLEKAFAVLETHLAERDYVVGDRFTVADLNLAEVFRYTMSQTDLFKRHPQVKAWLARCQSRPAFKAMMEERLKEPE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
source organism	Sinorhizobium meliloti
publication title	Crystal structure of glutathione transferase SMc00097 from Sinorhizobium meliloti, target EFI-507275 rcsb
molecule keywords	Glutathione S-transferase
total genus	79
structure length	213
sequence length	219
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date	2013-11-05

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1050.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	4nhwA02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4nhwA01

5ECMB 1IYIA 3VI7A 3FRCA 3MAKA 1JHBA 3ZIJA 2WZ9A 5EY6A 5IOWA 1G6YA 4ZIJA 4JR6A 2G2QA 3FHKA 4WETA 4EVMA 3SBCA 1RQMA 1NSWA 5ECKB 1SKWB 1OAZA 2HRNA 3QMXA 3RPPA 2PMTA 4GXZA 1BQ7A 1PRXA 3ZVJA 2H8LA 2PERA 3VWUA 1AW9A 4IS0A 5D93A 1M9BA 4NXIA 5ID2A 3U6VA 4MCUA 3VPQA 1YQ1A 5ECOB 4L5LA 3EVIA 5D96A 3QAWA 2KP2A 3KZQA 1HNCA 5HFKA 3HDCA 2V41A 2XPEA 4O32A 1TDIA 4J2FA 3GHAA 2B7KA 3M1GA 4ULXA 1RK4A 5DQSA 1S3DA 1YY7A 3KH7A 3N9JA 3ZZXA 4PNFA 6GSTA 5ENUA 3E9JB 1G6WA 2YV9A 1M99A 3ZTLA 4I97A 4JBBA 3CSIA 5AISA 5IPHA 3WGXA 1A0RP 5DCGA 5AN1A 1YZXA 2MMNA 2N5BA 2FWHA 1GTAA 4HDEA 1SL1B 4XS4A 4WR4A 1EOGA 4G9HA 3GL5A 1TRVA 2LQQA 2B6MA 1Z9HA 4QQ7A 4KX4A 2MMOA 1FO5A 2OADA 2I9HA 3APOA 3BOAA 5FWGA 3TKRA 3KM6A 2FGXA 5EVOA 2YZUA 2CT6A 2FLSA 1BYEA 2LUSA 3TKQA 2VOCA 5G2ZA 2OE1A 4KDUA 1GTUA 3IK9A 4YAVA 2CZ3A 1ZYEA 3MNGA 4HQZA 2DJ2A 2YJHA 3H79A 3HVSA 2IL3A 1EEJA 4HUAA 5D73A 2OE3A 2FA8A 4RQRA 1GSYA 1RW1A 3Q6OA 1TRWA 3TOTA 2QSIA 4USSA 4HZ2A 2ZUPA 4PGTA 3I43A 1PA3A 5G5EA 1GSSA 1FOVA 2HNLA 2JSZA 2DMMA 16GSA 1BAYA 2H01A 1AQXA 2YCDA 5IO0A 3FZAA 1T8EB 1Q4JA 4NV5A 3US3A 1OYJA 4K8MA 3TOUA 2IFQB 3ZMKA 3IXRA 4GSNA 3LSZA 3UJ1A 4GF0A 2M72A 2IMDA 1OC9A 1U6TA 4XS4B 3D4MA 2IMEA 4TR0A 6GSSA 4XTSA 2H6XA 5KEJA 1FB0A 1O6JA 2HZFA 4PURA 1OKTA 1GLQA 1PX6A 1XIYA 1YDKA 5EPFA 3ZIVA 1TW9A 1ERUA 3DIEA 3GSTA 2WCIA 4PNGA 1QMVA 5HR1A 5J9CA 3EU3A 3GTUB 3TJFA 3CTFA 3RHCA 2FY6A 3KD0A 2ZCTA 2E0QA 1AIUA 2VO4A 1XBSA 3L9VA 4K0GA 4AGSA 2GTUA 3KEBA 2IMKA 2VL2A 1WMJA 1EOHA 3BCIA 1C72A 5J41A 5HFGA 6GSWA 3ZREA 1THOA 3D21A 3VFIA 2VCWA 2C3TA 3W6GA 3VI5A 2M80A 2VCQA 2R6KA 1ZYQB 4DVCA 9GSSA 3HY2A 1U88A 3KP8A 3IV4A 2R3XA 1A2JA 4X1UA 1G7EA 1XWGA 1O7UA 1JLVA 1MD3A 2PGTA 3IC8A 3PR8A 2AHEA 2ON5A 3HZ4A 3GKMA 1WPIA 2VUPA 5H5QA 1JLWA 5CREA 4RI7A 1SL0B 4TXOB 1T4YA 2OKAA 4OO4A 3DRNA 4YQMA 1A24A 2IWTA 3A2VA 2FUG2 2RM5A 4PUAA 4N10A 1OC9B 4ZB6A 1OE7A 1WRYA 4HEA2 4TR1B 3CRUA 3GX0A 3L0HA 4WBRD 3LEFA 5E59A 3FEUA 2HSNB 1O8XA 3RDWA 4K9ZA 4ZBBA 1O73A 5C04A 2YZHA 3W8SA 5LNKe 2LNTA 4K7OA 4NHZA 3EMPA 4MJAA 2YPMA 4MZBA 5B8BA 2MBTA 6GSYA 3I9V2 4O92A 2WJUA 4WEYA 1G0TA 2B7JA 3KGKA 2KOKA 3LGCA 3E3EA 2DIZA 2HRAA 1VGLA 2L5OA 1GH2A 4KCEA 4L5OA 1I5GA 5IMCA 4F9ZA 1SK1A 4HI7A 2B5XA 3VWVA 3A2XA 4L8EA 1PKWA 1T3BA 4WF5A 1R4WA 2XPDA 2C8UA 4WXTA 4ZILA 1Z7PA 2FCHA 5DQYA 3ISOA 2IIYA 3GNJA 1A23A 3KCMA 4TKYA 2V1MA 3C73A 5JCUA 4NAXA 3IK7A 1GSDA 4EXJA 2K8SA 4IN0A 4LMVA 1TK5B 4DEJA 4KSMA 5FT3A 1N8JA 3J7Yb 1SD9A 4ZXGA 3Q19A 4K1FA 1X5DA 4J57E 4KW6A 3ZMLA 3DXBA 4PTSA 1QFNA 2QKEA 2VCTA 4V2NA 1TP9A 4ECJA 2LQOA 1K0OA 4HJMA 2YJ7A 1H4OA 5G1KA 4MDCA 2H76A 4IW9A 4IQAA 1AQWA 4BL7A 1DBYA 4XIHA 4K2DA 2JACA 2V6KA 3HVVA 4XHMA 3W8JA 2KUCA 2X64A 3TRXA 2VLTA 3HCZA 4MPGA 2HXKA 3G7YA 3MDKA 4GCIA 1GUMA 4V1Ag 1OE8A 3LORA 3BCKA 4FYBA 5GSTA 2HSYA 5ECRB 1V57A 2YN1A 3H1NA 1R26A 4ML1A 3CRTA 3F63A 4Q5NA 4POLA 2H75A 2H72A 3D6IA 2FNOA 3EYTA 4GSTA 1WIKA 1Z6MA 3ERFA 2HRKB 4PUFC 3EMXA 3EWLA 2PUKC 3DEXA 3QD9A 5GAPD 4QL9A 2MZCA 1EP8A 4N11A 1SJ6A 4E8HA 1EEMA 1OC8A 1VF4A 4ZB8A 3QAVA 1KTEA 2LJKA 3F0IA 2YNXA 2KP1A 4NWYA 3H4KA 2RUFA 4IELA 3GA4A 4BL7B 1GSEA 1LJRA 1USBA 3IC4A 2P31A 2CA8A 3N5OA 2IMFA 2H6ZA 3EINA 3EE2A 4EDYA 4I8BA 5BMUA 1XW6A 3HD5A 2HE3A 1U87A 2DJ1A 2L59A 3IAS2 1O85A 2X8GA 1EGRA 1K3OA 2YWOA 1ST9A 3G7IA 1KBNA 2C0EA 4N0VA 1GULA 1QUWA 5J3RA 1X5EA 1Z7RA 3EURA 4G0LA 5ECSA 1MDJA 5JCWA 2YANA 3QDNA 2B5EA 3ZVJD 3FZ4A 3CTGA 1EP7A 3I6AA 4KNDA 1WP0A 1DE1A 1PN9A 4DSRA 2CX3A 1PD21 4V2LA 4OO5A 4L0WA 1K0MA 5DALA 2AUVA 4V2MA 4ZBDA 2YOIA 1TI3A 2X8CA 4OFMA 4WKWA 3F4RA 1WOUA 1HD2A 4P3YB 2H1BA 2E2MA 1T7PB 4MH2A 4BWSA 1GWCA 3VWWA 4BVYA 3IPZA 2L6DA 1NW2A 3TGZA 2H1GA 1XXUA 1ZOFA 3M9KA 3TJKA 4FYCA 4QL7A 4HJ2A 3TKSC 1XZOA 4GRFA 1F9MA 2BTOT 4E8EA 4YQUA 3IRAA 2IFQA 4GTUA 4MLYA 5EL8A 2H0IA 1GSFA 3ZLPA 4RQXA 3LYPA 3IE3A 2H71A 3FZ9A 3TKPA 3GKNA 2PPTA 2REMA 18GSA 5F0GA 2IJYA 1T1VA 1HQOA 8GSSA 1H75A 2WDUA 2C3NA 4OFNA 3LQ7A 3DVXA 1EGOA 3UVTA 3D0ZA 1EZKA 1V98A 3GTUA 1SU9A 1ILOA 1JZOA 3TDGA 2HFDA 2L57A 1X9WB 5CAXA 2YP6A 1F3AA 3C71A 3UIWA 2XC2A 3ZFBA 1V40A 22GSA 2LEGA 1I9DA 2PBJA 3GSSA 1M2DA 1SK2A 3OR5A 5DALB 4POKA 2GSSA 4G19A 2LV3A 4ZBAA 4K0NA 1BEDA 2N5FA 2LRCA 3C1SA 5IIZA 2ES7A 4MJCA 1QGVA 2NBSA 4GQFA 1GLPA 3HVXA 4ISDA 2C80A 2H0HA 5J5NA 4MPFA 2R4VA 5ECQB 4BVYB 1V9WA 4TVEA 2FHEA 5H5SA 5D9WA 3PINA 2F8AA 4H86A 3A2WA 1F6MC 1ERWA 3L4NA 3C1RA 2QC7A 4IKHA 4O5RA 5FHIA 4TXOA 4NMUA 2L6CA 1YKCA 2RM6A 4OFTA 4ECBA 4AJ7A 3GUSA 1PKZA 2HSMA 3QFAC 5CRGA 1AXDA 1R5AA 4KH7A 2CX4A 1GUKA 2DLXA 2L4QA 1EV9A 1SJZA 4O7HA 4TR1A 1TXXA 1LU4A 3GH9A 2B1LA 5D9TA 2P0GA 2DC5A 2GQKA 2BMXA 4WR5A 1S3CA 5F8BA 5IOXA 3VLNA 1ML6A 3TJJA 1KNGA 3KH9A 1GNEA 2H0GA 4IQ1A 2WULA 3GN3A 1M2AA 5ECLB 3GH6A 1ZGNA 4LA1A 4ML6A 3QPMA 3P90A 4Q5QA 3F4SA 4KB3A 3ME7A 1B4QA 4NPBA 4JE1A 1KEBA 2JADA 4MJBA 5ECIB 4MMMA 3WT2A 1ZCPA 3NZNA 1BG5A 4KF9A 3APQA 5DAKA 3QAGA 5AIXA 4JRRA 2YWMA 3LFLA 2B5YA 1ERTA 2PWJA 3UBKA 3BBYA 3WD6A 3HXSA 4PXOA 1TRSA 2R37A 4N30A 2B1KA 4KAEA 4ZL7A 1CQGA 1R7HA 1SKRB 1J08A 2HSMB 3PPUA 4HOJA 2MYGA 1K0CA 1GTBA 2CAIA 3ZYWA 6GSVA 3GKKA 3WYWA 1LBKA 2I3YA 2AV4A 2TRXA 5D8IA 2RIIA 2O85A 2C4JA 2O7KA 1YEXA 4PQHA 2PN8A 3O3TA 3M8NA 3KTBA 1MDKA 4CDOA 1J9BA 1UVZA 5F07A 2F51A 4TR4A 2IPAA 5DDLA 2BJXA 5CO3A 1K0AA 5HR0A 1XWKA 3TKSA 1F37A 3CSJA 2CVDA 3FZ5A 4EO3A 5ECHB 2GZZA 3GIXA 1A0FA 1A8YA 4MZWA 2VL3A 5KN1A 1XFLA 5B6MA 1HYUA 5DAKB 2IN3A 5GAND 11GSA 1W4VA 1X5CA 2PVOC 4RI6A 5J4UA 2WFCA 1X0RA 1XPVA 2HRKA 2I4AA 3DGQA 4EDZA 2VCXA 5D9XA 3G7JA 5AGYA 3TJGA 2DJ0A 5IMVA 3M9JA 5CRHA 4TRXA 4FYUA 1G7OA 2ON7A 2J23A 4KE3A 3QCPA 1DE2A 2OACA 4KUNA 5DVBA 2D2ZA 4JEDA 3VPTA 2I81A 2H19A 2VM2A 3ZL5A 2WRTA 2X8HA 4BA7A 1N2AA 1FB6A 5DCHA 2JU5A 3KMOA 3HZ8A 5IMZA 4ZL9A 4ID0A 2E2GA 5GZZB 1BJXA 3APSA 4WF4A 3UMAA 2DBCA 2A2SA 5A5KA 6GSUA 6GSXA 3F6DA 3HA9A 2XHFA 2V2GA 4ZL8A 2I1UA 3KTLA 3GX8A 2VLUA 5ECPB 3QOUA 5HQPA 3UOMA 1PL1A 4G0IA 4PQIA 2TRCP 1TU8A 4F0BA 1J0FA 3CSHA 2QGVA 2OBIA 3DKSA 4KGIA 3HJPA 1OKDA 2H73A 1U3IA 5CP1A 4F2IA 2H1DA 4KCAA 2GS3A 3GV1A 3PGTA 3F3RA 2M46A 3FYGA 2IMIA 2K18A 2YV7A 1XW9A 1XWBA 4FH8A 3IAM2 1QQ2A 3WGDA 3VK9A 3P2AA 3F8UA 2K8VA 2H30A 2GGTA 2GSRA 2VL9A 4HZ4A 4KDYA 2PU9C 5A4UA 4MF7A 2ALBA 4LL1B 3RBTA 2RLIA 1K0DA 3R2QA 4EL1A 1YF1A 4TN8A 4OCEA 4IHUA 3PH9A 2LTKA 1TK8B 2LRTA 5ELAA 2GQLA 1A2MA 1XOAA 5F06A 5IO2A 2JZRA 3I69A 4IJIA 2V32A 4ECCA 4ACSA 3A3TA 2EIOA 4MF5A 2AAWA 3AY8A 3L9SA 2UZ8A 2C0GA 1XWCA 3D5JA 4IVFA 4MF6A 5A4WA 3P8WA 2OJLA 3BJ5A 2FWEA 1AUCA 2HZEA 4TR3A 2A4VA 2JZTA 3Q74A 2TIRA 2H74A 5ELGA 4MP4A 4G2EA 3IDVA 2MMAA 2A2RA 1SJIA 14GSA 1GNWA 1B8XA 3WT1A 3DMLA 4GLTA 1FHEA 4HU7A 2VM1A 1VF3A 5JWRB 1HNAA 5HR3A 3M3MA 1VRSD 1WE0A 3FR6A 1SYXA 1ZZYA 2OE0A 1M7TA 3ZRDA 4Z7XA 4PX1A 2P5QA 4Q5FA 1M0UA 3VWXA 1GRXA 3TB2A 4IGJA 1PQNA 1Y25A 3DYRA 2CQ9A 3O6TA 1CQHA 2CVBA 4CHSA 2AYTA 1SL2B 1M2BA 1EWXA 4HS1A 3R3EA 2Z9SA 3SWLA 4IP6A 1F2EA 1Z3EA 5G31A 2GZPA 2OA7A 2LKUA 1TOFA 4GWRA 2WB9A 1Q98A 2KLXA 2ZNMA 2VD1A 1MDIA 1VF2A 2G0FA 2HZEB 5AIVA 3ED3A 1S3AA 1UA5A 12GSA 4JU5A 3C8EA 2P5RA 3CYNA 2GQMA 4F0CA 1SKSB 3J7Yk 1XWAA 5DJMA 2YWIA 2EIRA 3F3QA 2C3QA 1ON4A 17GSA 3FKFA 4ZB9A 2XBIA 5L71A 3ME8A 1WWJA 4AJ8A 4V1Ap 2JZSA 5B8AA 3LYKA 3K8NA 2LSTA 2HSHA 3UARA 3GKXA 4I6XA 2L5LA 3LWAA 2LJAA 1B9XC 3U5RE 5JCGA 2X99A 3TRPA 1AAZA 1MEKA 2J9HA 3IR4A 5JWOB 1XVWA 3EU4A 2FD3A 4MK3A 20GSA 3L78A 4XS1A 1FW1A 5ID2B 2HLSA 3HKRA 2N5AA 3P7XA 3LXTA 3GFKA 2F8FA 4J56E 3CBUA 1FVKA 2C0FA 1SENA 1GUHA 4LMWA 4K6XA 2F9SA 4YAPA 3E0UA 2VIMA 3F4TA 3ERWA 2OBKA 2CV4A 1IYHA 5IMDA 1B48A 1OVNA 4PQ1A 5DBQA 2V6OA 4ECIA 2FWFA 3JCML 4K7IA 4D73A 1PGTA 3UL3A 3UVHA 2GZYA 1M9AA 1YEPA 4IBPA 1GTIA 2H66A 1O8WA 3MSZA 4XCSA 5COHA 2GT6A 2VCVA 1FAAA 4G0KA 4WBJA 1HNBA 2GVPA 5CRWA 1DSBA 1WJKA 5CNWA 1UC7A 2MMZA 4F03A 4BVXA 1ACVA 1YF0A 4I2UA 3RAZA 4NHWA 2DJKA 4ILFA 4XRAA 3A5WA 3UAPA 3TUEA 1VF1A 2DIYA 1Z6NA 5ECNB 1TI1A 4OCFA 1U3AA 4EC0A 7GSSA 4TXVA 5DJLA 3TKSE 4MJEA 4XS6A 1K0NA 3H8QA 2EIQA 1V2AA 4GQCA 1FG4A 2C1YA 1YKAA 5JWQB 4X0XA 3HJMA 3NIVA 3KIJA 2EC4A 4OMVA 3GL3A 4MZCA 2HYXA 5IPGA 1T00A 4AF2A 1TKDB 1T4ZA 10GSA 2GT5A 5IQYA 4MA9A 3LXZA 1PX7A 4MABA 1YJ6A 2NDOA 4OD7A 3WGEA 3Q18A 4YQVA 2MBSA 3RHBA 2R5GA 5D9VA 5A4VA 4AJ6A 1JZDA 4DSSA 3F9UA 4D73B 4EF0A 1UN2A 1XW5A 3ERGA 4BWQA 4EE0A 5H5RA 4LL4B 4RUVA 4IJ3A 3M0FA 5ABRA 5KN3A 3KP9A 1O81A 2C0DA 2XBQA 4LLRA 1K3LA 3UBLA 5E4WA 3IA1A 2GLRA 2KHPA 1XOBA 4BVXB 2DSAA 4POBA 3FW2A 3V1WA 1ZMAA 4EKZA 1ZL9A 1QXHA 1X9SB 2L4CA 1JZRA 2F3MA 2NTOA 3H93A 1NHOA 4TOPA 2DMLA 3S9FA 4NV2A 3KJYA 1GP1A 1F3BA 4KSOA 2LRNA 2K6VA 5LCZA 1SD8A 1Z5YE 2CZ2A 1B4PA 5HFIA 4I5QA 2E7PA 3TCOA 4XRDA 4GSSA 3GYKA 3FK8A 2VD0A 3GRXA 1FVJA 2AB6A 5G1LA 1R5PA 3IOSA 2AJQB 3QFBC 3C7MA 3DWVA 2H6YA 2VLVA 1DUGA 2NVLA 2LJRA 2HT9A 1OC3A 2DJJA 2K9FA 1K3YA 1E2YA 1JZWA 4POMA 1THXA 4DSSB 5KN0A 3L9UA 2RUEA 3O76A 1AC1A 3GURA 1PL2A 3D22A 1GL8A 1PSQA 4MH3A 1MTCA 4JZQA 2WS2A 2HRFA 3CXGA 2R2JA 3FR9A 1MD4A 3FR3A 5CYYA 3ZFLA 2H70A 5G30A 1X9MB 3D4TA 4CW9A 1JFUA 4BPYA 3G9BA 1ERVA 3VURA 4EUYA 1AQVA 2O8VB 1Y6EA 4X43A 3DD3A 1SYRA 4YH2A 2FWGA 3UEMA 2VAFA 2HQTA 4HQSA 5J9BA 5B7CA 2B3SA 3F6FA 5B6NA 3DVWA 5HR2A 1TTZA 3LG6A 3MWHA 1TRUA 3KMNA 1TU7A 3RPNA 2LS5A 5IMAA 1V58A 1QK8A 2GSTA 1GSQA 2LNSA 19GSA 5G5FA 4FO5A 1URMA 2DJ3A 3LJRA 2HI7A 1SK0A 1W89A 1E6BA 4IP1A 3TJBA 1XCCA 3EC3A 5LD0A 3HJOA 4F82A 2VCZA 1PMTA 4TW5A 3HHVA 5INYA 2JL4A 2O89A 5IM9A 5C00A 2CVKA 4I2TA 2NPBA 1NHYA 3HYPA 5IMFA 1A8LA 3IBHA 4HU9A 1XVQA 1A2LA 1TJDA 3FY7A 3CMIA 3NOFA 5KN2A 2YWNA 2JSYA 4KDXA 2GDRA 3QR6A 13GSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4NHWA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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