1U87A

Crystal structure of the 26 kda glutathione s-transferase y7f mutant from schistosoma japonicum complexed with glutathione
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
MSPILGFWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGLEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQAT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystallographic and Thermodynamic Analysis of the Binding of S-Octylglutathione to the Tyr 7 to Phe Mutant of Glutathione S-Transferase from Schistosoma japonicum(,)
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Schistosoma japonicum
molecule keywords Glutathione S-Transferase 26 kDa
total genus 56
structure length 209
sequence length 209
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2004-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1u87A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1u87A01
1TK8B 2YANA 1BG5A 1XWAA 1YEPA 3PINA 3FR6A 4ACSA 5DQSA 1FOVA 1M2BA 1I9DA 3OR5A 1BYEA 2MYGA 2AB6A 2QGVA 5IOXA 2H74A 2D2ZA 3KJYA 2R5GA 2LRNA 2PVOC 5HR3A 4ZBDA 5F0GA 2YWMA 2DLXA 3GL3A 5HFKA 4Z7XA 4YH2A 3FHKA 4YQUA 1SYXA 2I81A 2JU5A 3SWLA 4DEJA 1EV4A 3H8QA 3K8NA 1TRUA 3ZFLA 3J7Yk 1LBKA 5E4WA 4AJ6A 4NMUA 2CVKA 3D21A 4OCEA 5COHA 1B48A 3WT2A 3VLNA 4XS4B 4IJIA 1U87A 5B6MA 5G31A 4MMMA 2H6YA 1O81A 1YQ1A 3WGXA 2HSHA 2PVQA 1M2AA 4RUVA 1S3DA 4XRAA 1V40A 2OBKA 4Q5NA 1A2MA 2YZUA 3GSSA 5CNWA 1JHBA 3L78A 4G2EA 1PD21 1OC9A 3V1WA 4MH3A 3D4TA 3EC3A 3P8WA 1JZOA 2H8LA 3UJ1A 1SD9A 1Z9HA 4V2MA 1QMVA 1GLQA 4KB3A 4KE3A 5BMUA 2YJ7A 4TR3A 1M9BA 4O7HA 2NPBA 2LJKA 2VUPA 4GSSA 2DJ2A 3P2AA 3NZNA 5ECQB 5B8BA 1ZMAA 4POBA 3GN3A 5LCZA 1XWBA 3IDVA 1WP0A 4MLYA 4OMVA 3TKPA 2VD1A 3ME7A 2G0FA 2LJRA 3TKRA 1A23A 2PERA 5AN1A 2WDUA 1V98A 2R4VA 3TRPA 5KN1A 3HKRA 5G2ZA 17GSA 3P90A 1HYUA 4GWRA 2HXKA 2HRFA 4BL7A 4K0NA 3Q18A 3LYKA 2P5RA 1E6BA 1FB0A 2JACA 2LSTA 5CAXA 2GQKA 1Z6MA 1MD3A 3HXSA 1NHYA 3BOAA 2ZUPA 3FW2A 2O8VB 3GURA 4IKHA 1O85A 1PA3A 4FYUA 4PUFC 1VGLA 3CTGA 4KDYA 3GHAA 4J2FA 13GSA 8GSSA 4IGJA 1RQMA 3H4KA 3DGQA 1G6WA 2WCIA 4V2LA 3I9V2 2HNLA 2UZ8A 1EGOA 3C7MA 1H75A 3HVXA 3UEMA 1FG4A 3MWHA 5IMZA 3APSA 2CX4A 1XWCA 4O92A 1PRXA 1GSUA 1T4ZA 5ECLB 1KEBA 3G7JA 1V57A 4GQFA 3KP9A 1GSFA 2AYTA 3GNJA 1RW1A 3VI5A 4KGIA 1TW9A 4K7OA 3TJGA 3ZTLA 1WOUA 4GXZA 2EIRA 3D6IA 1U6TA 3GV1A 3GRXA 3WGEA 1SK0A 1X5CA 4BWQA 1VF2A 4EXJA 2DJJA 5ID2A 4G19A 2HE3A 1VF3A 1YZXA 2PBJA 3ZVJD 2XHFA 2B5XA 4Q5QA 1WPIA 2KLXA 4LA1A 1USBA 2DJKA 2GQLA 2ES7A 2RUEA 1T8EB 4NV2A 5EL8A 2VLVA 5F07A 4FO5A 1GSEA 3ZIJA 5ECMB 2PUKC 1EP8A 1XW9A 2M80A 4RI6A 3ZL5A 1X9SB 11GSA 4GF0A 2H30A 4ZBAA 3IK7A 2GSQA 2V41A 1F2EA 2O87A 3H93A 2CAIA 2H1AA 5A4WA 3EVIA 1VRSD 1LJRA 2DSAA 3CTFA 5DDLA 3C1RA 4ZL9A 2V2GA 5AISA 1GL8A 2OACA 1Z3EA 1T00A 3L0HA 3LXZA 5D9WA 4DSQA 1GTUA 4N10A 4TXVA 1XWKA 2YWNA 2E0QA 4ZBBA 3PPUA 3WGDA 3IXRA 1F6MC 5CO3A 4XS1A 1E2YA 2N5AA 3Q6OA 3DEXA 3HJOA 1QGVA 3E9JB 2F8FA 3Q19A 2X8HA 1K3OA 3IPZA 2PGTA 2F9SA 2FHEA 1GNWA 4BVXB 3LEFA 2YOIA 2WB9A 2H6XA 2IMDA 4ULXA 2H71A 1SKRB 4NAXA 4MPFA 1O7UA 1TRSA 1O8WA 1S3CA 1ZL9A 3TCOA 3TKSA 5FWGA 2OADA 4ZXGA 2N5BA 4I97A 4F82A 3UIWA 1OE8A 1SL0B 4I5QA 1PMTA 1MDKA 2AUVA 4TR1A 1I5GA 1X5EA 3ZRDA 3M9JA 3HZ4A 2JADA 3O6TA 4MABA 1BX9A 1B4QA 4FH8A 4I8BA 1DBYA 3ERGA 3DWVA 5HR1A 1UA5A 2GZYA 1XVWA 3F3QA 3KTBA 2K6VA 1YY7A 2BTOT 4L0WA 1AC1A 2JZTA 4ECCA 2HSNB 4RI7A 2J9HA 1TU7A 3DVWA 3RAZA 3F4RA 1M2DA 1AW9A 6GSUA 2ON5A 3KMNA 4OFMA 2RIIA 2CZ3A 1FAAA 3DRNA 1QUWA 4DSSB 2P31A 2RM6A 2YWIA 1F37A 5CRDA 2MZCA 3EURA 3GX0A 3EE2A 1SKWB 1A0FA 3DXBA 1PX6A 1GTIA 2FA8A 1ERWA 4POLA 2TIRA 2AV4A 2B5YA 4KH7A 5ENUA 2VL3A 4MP4A 2GZZA 4TR0A 3CMIA 4N30A 3EWLA 2DJ0A 2GSTA 4I2TA 1B4PA 5AIVA 2BJXA 2IL3A 4G0LA 3LQ7A 2LV3A 5CRHA 1AXDA 4RQXA 1XOBA 4EDZA 2L4CA 2GDRA 3DVXA 3HVVA 2HRNA 4LL1B 1Z7PA 3MDKA 2L57A 3N9JA 2FA4A 3ZITA 1MEKA 1EGRA 1RK4A 2H66A 3PH9A 3BCKA 6GSTA 4G10A 1UVZA 2LUSA 1W89A 3ZYWA 3I43A 2DBCA 5DCHA 3TKSE 1K3LA 1XVQA 3VWWA 1Z7RA 3EMXA 5ELGA 3MNGA 5ECIB 5GSTA 2R3XA 3GSTA 2L5OA 4K8MA 3HD5A 2H0GA 1HNCA 2VL2C 4TN8A 5CRGA 2LQOA 5EVOA 5GAND 4GQCA 1CQHA 4H86A 3HA9A 2VO4A 4I2UA 2H72A 4PNFA 1MDJA 3C8EA 3IAS2 1EEMA 2GVPA 2LRTA 2C8UA 1OC3A 3UBKA 1AQXA 2L59A 14GSA 2H0IA 3QAGA 2RM5A 1ON4A 2HQTA 4WXTA 4KDXA 3VPTA 4F03A 1AIUA 2HSYA 1JZRA 4AF2A 4K7NA 3W8JA 3RPPA 4KDUA 5C00A 3GIXA 5F8BA 3FZ5A 1FO5A 2GTUA 4MJEA 1GRXA 1ZZYA 2VAFA 1FB6A 4WEYA 2IPAA 1C72A 1XIYA 2C3NA 4GRFA 4NPBA 4GSNA 5D8IA 4MK3A 1VF1A 3U5RE 3UL3A 2HRKA 4L5LA 1U88A 2N5FA 3I69A 2I4AA 4IBPA 3CBUA 3ERFA 3VK9A 2FY6A 2C1YA 1B8XA 1ABAA 5FT3A 3LJRA 1JZDA 3ME8A 2B1LA 4FYCA 2FWGA 2IWTA 5HFIA 4NV5A 4MJAA 3IA1A 5JCWA 2LNTA 1SL1B 3F6FA 2HT9A 2MMOA 1THXA 3LFLA 5ECOB 5ECKB 3I6AA 4PNGA 2XBIA 2WRTA 5ECHB 1GWCA 1N8JA 2C0FA 4MA9A 2HSMB 2IMKA 2F3MA 2YPMA 9GSSA 1B9XC 2MBSA 2B5EA 4E8EA 1PQNA 3IHQA 4I6XA 5IM9A 3KH7A 3D0ZA 1R26A 4MPGA 4HZ4A 4JEDA 3FZ9A 4AJ8A 2O7KA 2VD0A 4XS4A 2GT5A 4MJCA 1DSBA 1LU4A 2H1BA 3GKXA 1H4OA 2GZPA 3F4TA 1EEJA 5D9XA 1FVJA 4BA7A 5DAKB 3GTUB 1SJIA 1A8YA 4HQSA 3QR6A 2IIYA 2H19A 1SK1A 2GSSA 5J9BA 4IN0A 5HQPA 3G7IA 4K1FA 2DJ1A 2DMLA 4X0XA 4HUAA 1XPVA 4EO3A 2G2QA 1GTBA 4CHSA 1YDKA 4YQMA 2QSIA 1WJKA 4WKWA 3TUEA 3LORA 3NOFA 3HYPA 3HDCA 1A8LA 3KP8A 2I3YA 4L5OA 4ZB6A 3AY8A 2MMZA 2REMA 2B7JA 4G0KA 3RDWA 4HOJA 5B7CA 4IVFA 2V32A 1NW2A 3EYTA 5INYA 1TI1A 6GSYA 1AUCA 1J08A 2R2JA 2IFQB 2VLUA 5J41A 3TOUA 4FIWA 1ZCPA 3QAVA 1EP7A 1KTEA 4KSMA 1XW5A 3ZZXA 3EU4A 1F9MA 4OO5A 3GH6A 5IMVA 1Z6NA 5D9TA 5JWRB 3LWAA 4XS6A 5CRWA 3KMOA 2YP6A 4WF4A 2FWHA 3HJPA 4MZBA 5IIZA 1TKDB 1MD4A 2PPTA 1YKCA 2ZCTA 1YF0A 1AAZA 5D93A 2WJUA 3EMPA 4N0ZA 3UOMA 2DIZA 19GSA 2IN3A 3TGZA 4KF9A 2XPEA 1OE7A 1YJ6A 4ZILA 3ZMKA 3L9SA 1FW1A 1ML6A 3KTLA 3LXTA 5IMAA 4WR4A 2FGXA 2HLSA 3DYRA 3JCML 1AQWA 2FCHA 3QFAC 3QMXA 4WF5A 1GULA 4L0UA 3FRCA 3MSZA 2ON7A 5IMFA 2NDOA 2ZNMA 1XW6A 1V58A 1TDIA 6GSWA 4K9ZA 3CSIA 3IOSA 3RBTA 4IP1A 5F06A 4MF7A 3TJBA 2I9HA 4GCIA 1OAZA 1NHOA 2OE1A 5FHIA 1AQVA 1SJ6A 3M0FA 2KOKA 5F05A 6GSXA 3GYKA 4PURA 3F8UA 5C04A 4PQHA 2LKUA 5DALB 4DVCA 2IMFA 4K6XA 2YNXA 1A0RP 1TRVA 1SKSB 2C3QA 3F4SA 3VPQA 1GSSA 3H79A 1UC7A 1XOAA 3M8NA 2YWOA 1FVKA 4CDOA 2C4JA 3TRXA 3UBLA 4QL9A 5GAPD 4MCUA 3ISOA 1A2JA 2YN1A 4TVEA 2YV7A 4IHUA 4XCSA 5J4UA 3UARA 4ML1A 4PX1A 4IP6A 3A2XA 4J57E 3QDNA 1ZYQB 4AGSA 5HR2A 1EV9A 3FYGA 3DKSA 3WYWA 3VWXA 3H1NA 4TOPA 4V2NA 1WIKA 4HQZA 4MF6A 4ZB8A 3FR9A 2H73A 3KZQA 1X9MB 4BVYB 1X9WB 1QQ2A 4O5RA 3KIJA 4KA0A 3F6DA 1ERVA 2J23A 2KUCA 4J56E 1M9AA 2VCQA 4BVXA 1Y25A 2HI7A 2HZEB 4JR4A 2E2GA 1GUHA 1A24A 2DC5A 4POKA 2B7KA 4PTSA 4D73B 1X5DA 1PX7A 2A2SA 1S3AA 1G7EA 1TK5B 2CA8A 3GL5A 2L4QA 3N5OA 4NHWA 1QXHA 2CX3A 3IRAA 3U6VA 3NIVA 1MTCA 4LMWA 5G1KA 1K0OA 4KW6A 4P3YB 1ST9A 5LD0A 1TTZA 3VWVA 3GUSA 2CZ2A 1TJDA 1DUGA 2E2MA 2H76A 2B6MA 5AGYA 2DIYA 1TOFA 2CT6A 3GKMA 5KEJA 2L5LA 1TK0B 4BVYA 5D96A 4ZB9A 5G30A 1XWGA 3FZAA 3TOTA 4LL4B 2NVLA 4JRRA 1QFNA 3EINA 2K18A 2HYXA 3ERWA 1O6JA 3L9UA 5IPHA 2HZEA 1CQGA 3TJFA 1M99A 3TRQA 3E0UA 4GLTA 4OFTA 2LS5A 3ZFBA 3UMAA 4IQ1A 2OBIA 1M0UA 2DMMA 1SENA 2GGTA 3D4MA 1TXXA 3QAWA 12GSA 1OKDA 3F63A 3L9VA 1THOA 2OJLA 4DSSA 3IAM2 2OKAA 3VWUA 1HNAA 1ZYEA 1PKWA 3IC8A 1R4WA 3HZ8A 1K0BA 3LGCA 3P7XA 1GSDA 1X0RA 6GSSA 3QOUA 3M3MA 2FNOA 4F9ZA 1PL1A 5A4VA 2MBTA 2VL9A 2JZSA 1YF1A 2OE0A 4MZCA 3VI7A 1BQ7A 3IBHA 2DJ3A 2EC4A 3GX8A 1JFUA 1ERUA 5ELAA 2K8SA 2PWJA 3W8SA 4F0CA 2R37A 4ID0A 2F8AA 1IYHA 3J7Yb 3WT1A 2E7PA 3DMLA 1M7TA 5DBQA 4ML6A 2OE3A 3D22A 4HU9A 2M72A 2JZRA 4HU7A 4MF5A 5ECRB 1SYRA 1YKAA 3KD0A 3HY2A 5IO0A 1ZGNA 5KN3A 1KNGA 5ECPB 2O85A 2MMAA 1BJXA 3KCMA 4JE1A 2CVDA 4YAVA 3ZIVA 3R3EA 4GSTA 1GNEA 2EIOA 4EC0A 4X43A 3G7YA 1ACVA 3EU3A 3KGKA 4V1Ap 2FUG2 4HS1A 2LRCA 1T4YA 3F0IA 4CW9A 1PKZA 2O89A 2HFDA 4NWYA 3IV4A 2YV9A 4DSRA 2MMNA 2V6OA 1N2AA 3FR3A 2YCDA 1W4VA 4V1Ag 5J3RA 4KCEA 3PR8A 2WZ9A 3DIEA 3GKNA 1WRYA 2VLTA 2LEGA 3UVHA 1O8XA 4OWYA 3TKQA 1V2AA 2X64A 1NSWA 3TJKA 4K0GA 1EOGA 5G1LA 1K0MA 1T3BA 1OYJA 1OC9B 3PGTA 3UAPA 2FWEA 2M46A 4EKZA 3QFBC 2LTKA 2VM2A 2AJQB 1PGTA 2GQMA 4NXIA 4K7IA 2JSZA 1WWJA 3FZ4A 5DVBA 4TKYA 2TRCP 4ECJA 3G9BA 1F3BA 1K0NA 1JZWA 2V6KA 4XIHA 3TKSC 2C80A 1NM3A 18GSA 1EZKA 5J9CA 3UVTA 4HJMA 2IMIA 3RHBA 1T7PB 3GKKA 2H75A 2TRXA 2C0DA 4KNDA 1GUMA 2C0GA 5E59A 4QL7A 4TXOB 4OD7A 2C0EA 3A2VA 2GT6A 5DJMA 5H5QA 3ZVJA 3L4NA 4BL7B 5CYYA 1K0DA 1EWXA 3LYPA 2CVBA 5D9VA 5B6NA 1VF4A 5A4UA 1XXUA 2K9FA 4IELA 3CYNA 1F3AA 1SL2B 2CV4A 1URMA 1SK2A 2HSMA 3CXGA 4LLRA 4X1UA 4EE0A 1TI3A 1T1VA 3GH9A 5CP1A 1HQOA 2WS2A 3FKFA 4Q5FA 1SD8A 4HJ2A 2LQQA 4YQVA 5IOWA 1ZOFA 3TDGA 5JWOB 2KP1A 2PN8A 5D73A 4USSA 2AHEA 4TXOA 2XBQA 4JBBA 2WFCA 3DD3A 1R5AA 5CREA 1G6YA 1V9WA 2QC7A 2YZHA 4LMVA 2NBSA 2VOCA 1Y6EA 1K0AA 4HDEA 4G0IA 5DAKA 3GTUA 3CRUA 3M9KA 2NTOA 1U3IA 2LJAA 3IK9A 4EL1A 1DE2A 5ID2B 3W6GA 4FQUA 4EVMA 1ILOA 4TR4A 4PGTA 1GSQA 2KHPA 3RPNA 4IQAA 7GSSA 4QQ7A 4JU5A 4L8EA 1UN2A 2FWFA 3GMFA 2BMXA 3HVSA 6GSVA 3A3TA 3R2QA 4EF0A 2JL4A 3KXOA 5HFGA 2XPDA 10GSA 3QD9A 2IFQA 4MJBA 5DCGA 4MZWA 1TRWA 4IJ3A 3HJMA 4AJ7A 3O3TA 3BCIA 1BEDA 2VL2A 4WBRD 2VCVA 2HZFA 2C3TA 2A4VA 4OO4A 5KN0A 4N0VA 4IW9A 3KH9A 2IJYA 2VM1A 2AAWA 2P0GA 2PU9C 1G7OA 3A2WA 1IYIA 5J5NA 1DE1A 4MH2A 4POMA 3LSZA 4TW5A 2GS3A 4OCFA 5ABRA 3ZREA 1Z5YE 1QK8A 2KP2A 5EPFA 4PQ1A 3M1GA 1Q4JA 4PUAA 2A2RA 3BD2A 1O73A 4ZIJA 5ECSA 1GUKA 3TJJA 1B9YC 2B3SA 2K8VA 1MDIA 1GLPA 5IQYA 5H5RA 3CRTA 2RLIA 3QPMA 5IMCA 3QCPA 2ALBA 3S9FA 2VCXA 4BWSA 2GLRA 3CSHA 20GSA 1SU9A 3LG6A 4TR1B 1GSYA 5ECNB 1OKTA 1R5PA 2WULA 5GSSA 3VFIA 2CAQA 4HEA2 2GSRA 5G5FA 1XZOA 4OFNA 3US3A 16GSA 2HRAA 5A5KA 4G9HA 4E8HA 3O76A 4PXOA 5JCGA 3BBYA 5IO2A 5DALA 4K2DA 4TRXA 4XRDA 4YAPA 2EIQA 2V1MA 3VURA 4EUYA 1YEXA 4FYBA 5L71A 4GTUA 4PQIA 1PN9A 4NHZA 4F0BA 5KN2A 1KBNA 3IE3A 2QKEA 2CQ9A 3KEBA 3FY7A 3IR4A 2H01A 1Q98A 2LNSA 1ERTA 1U3AA 2X8GA 5IMDA 5DQYA 1XFLA 2Z9SA 5B8AA 4N11A 5DJLA 4JZQA 2RUFA 2WGRA 2I1UA 5JWQB 2FD3A 3APOA 4KSOA 2L6CA 1A2LA 3GA4A 2H6ZA 2YJHA 4ECIA 2PMTA 2B1KA 1XBSA 3ED3A 3CSJA 4HI7A 1XCCA 2H0HA 3MAKA 1J0FA 1WE0A 2P5QA 2R6KA 5IPGA 4IS0A 3KM6A 3RHCA 2H1GA 5LNKe 2JSYA 4ISDA 4D73A 1HD2A 3ZMLA 4XHMA 4XTSA 3GFKA 4HZ2A 4Q5RA 4EDYA 5H5SA 3SBCA 3HCZA 1WMJA 4MDCA 3TB2A 3HHVA 2H1DA 4KAEA 3ZLPA 1HNBA 4KCAA 4RQRA 1OC8A 3Q74A 3BJ5A 5G5EA 4O32A 2OA7A 1TU8A 5GZZB 1GH2A 4WR5A 4KX4A 4ZL7A 1PSQA 3E3EA 3F9UA 1BAYA 3C71A 3D5JA 5AIXA 2L6DA 1TP9A 2VCTA 1OVNA 22GSA 3FEUA 5EY6A 1K0CA 1JLVA 2VCZA 2X99A 1SJZA 4WETA 4ZL8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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