1K0MA

Crystal structure of a soluble monomeric form of clic1 at 1.4 angstroms
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
235
structure length
235
Chain Sequence
PQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGELPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAALNPESNTAGLDIFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLTSPLPEGVDETSAEDEGVSQRKFLDGNELTLADCNLLPKLHIVQVVCKKYRGFTIPEAFRGVHRYLSNAYAREEFASTCPDDEEIELAYEQVAKAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords CHLORIDE INTRACELLULAR CHANNEL PROTEIN 1
publication title Crystal structure of a soluble form of the intracellular chloride ion channel CLIC1 (NCC27) at 1.4-A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal transport
total genus 78
structure length 235
sequence length 235
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13409 GST_N_2 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1k0mA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1k0mA01
5J9BA 2HRKB 1GSSA 3C71A 1XWKA 1R7HA 3O6TA 1ILOA 1PSQA 1WJKA 4ZB8A 3CYNA 1WMJA 10GSA 4ID0A 3IC4A 2F8FA 1AW9A 3J7Yb 4G2EA 2C3QA 5C04A 3BBYA 2B7JA 3TDGA 2YV7A 3IR4A 1TK8B 2J23A 3GA4A 4TW5A 3LGCA 3GNJA 2X8GA 3RAZA 1EP7A 3GX8A 2AJQB 2CZ2A 3F9UA 5CAXA 4MZWA 1QK8A 3DD3A 1JLVA 9GSSA 2XC2A 3TKSC 1GNWA 4KDYA 2KP2A 2HRAA 4KE3A 3IHQA 4KH7A 2C3TA 4OFTA 4V1Ag 1XPVA 2I81A 1EV4A 3KH9A 2CV4A 4K0GA 4HU9A 4ZBAA 2B1LA 1GTUA 2FD3A 4CHSA 4O92A 5ELAA 1T3BA 2ON5A 5AISA 4TXVA 1XW6A 2XHFA 1NHOA 2LRTA 3GKMA 4ZL9A 2MMNA 1GL8A 3HA9A 2H19A 2HXKA 3GTUA 3OR5A 3VPTA 4AJ7A 1URMA 3Q19A 3KEBA 4TOPA 2YJ7A 3FHKA 1KBNA 4KGIA 5IQYA 1VF4A 2BMXA 4RQXA 5G5FA 1VGLA 2E2GA 4GSNA 5GAPD 1RW1A 1XW9A 4BVYA 2I1UA 3DXBA 1GUHA 3GH6A 2M80A 3QAGA 3U5RE 5CREA 4HQSA 5F06A 1K3LA 4F9ZA 4GWRA 2H72A 1V40A 6GSSA 2HSNB 4N0ZA 5KN1A 3Q18A 2WULA 4PTSA 2PVOC 2IFQA 2PGTA 4GTUA 1Z7PA 3UBLA 4EO3A 5ECKB 3EU3A 4JZQA 4HI7A 1FB6A 3MAKA 4L0UA 1NM3A 2F9SA 4HUAA 3P90A 2CVBA 1B48A 2VL2C 3RPPA 2LKUA 1MTCA 4MJBA 4DSQA 2EIOA 5INYA 3VI5A 4ILFA 1OE7A 1EZKA 5D8IA 4TRXA 1RQMA 1KEBA 1Z7RA 5IO0A 1AAZA 1SU9A 2MZCA 4IJ3A 3ZMLA 4X0XA 3PH9A 5D9TA 1SYXA 1GWCA 4XIHA 2FCHA 2Z9SA 5IOXA 3IK9A 20GSA 2F3MA 1EEJA 5CRGA 4GF0A 1WP0A 4OD7A 4PNGA 1A8YA 1O6JA 3EYTA 1VF2A 2VL2A 4NV5A 2V1MA 3HZ4A 5ABRA 3EMPA 3PGTA 3F63A 1SL2B 2ES7A 4EXJA 3C7MA 5D73A 5IIZA 4MA9A 2MMAA 3TJFA 2HQTA 2IIYA 4WKWA 4GSSA 2MBSA 3KIJA 2OBKA 4XS4A 2R2JA 1SJ6A 1FVKA 4F2IA 2C8UA 2GGTA 4BVXB 3QMXA 3KTLA 3GIXA 3PINA 2QKEA 3QAWA 4XRAA 4TN8A 1SKSB 2LSTA 2AV4A 3E3EA 3IV4A 1LJRA 5J5NA 3ZFBA 3GL5A 1HNAA 3H79A 5GAND 2YWNA 1PL2A 4MJAA 3KP8A 5C00A 3FEUA 2VCXA 2DMMA 1PX7A 2GSSA 1H4OA 3ZL5A 5FWGA 1TXXA 2PERA 2IMFA 5FHIA 4WF4A 4BPYA 2M72A 6GSTA 5IMVA 2H8LA 4Q5RA 2FWEA 5FT3A 2FGXA 2WRTA 2B3SA 2BTOT 1XZOA 4JBBA 3GSSA 5LD0A 3QCPA 5JWQB 4YQMA 1OVNA 3VWWA 3LYPA 1X5CA 3EC3A 4WEYA 2NPBA 1K3YA 1YEPA 4ISDA 3D6IA 3ZREA 3TJBA 2K6VA 4BWQA 4WBJA 2YNXA 1O7UA 1TTZA 1WWJA 1M9AA 1MD3A 1GUMA 1GSQA 2PU9C 3E0UA 2V2GA 3FZ9A 5F0GA 4POMA 1B9YC 3VWXA 3ISOA 4CW9A 3LJRA 2AYTA 4F03A 1M9BA 3WGEA 1C72A 3HKRA 5A4UA 1GLPA 2V6KA 2WCIA 3DIEA 2H76A 5EVOA 1EOGA 1G6WA 4QL7A 2H6ZA 5ECPB 5LNKe 1DE1A 1Y6EA 4KSOA 3GH9A 3M3MA 1X9WB 3GHAA 2J9HA 1SJIA 3PR8A 1RK4A 3L9SA 5CRDA 2GVPA 3ZVJA 3FZ4A 1Z6MA 3GN3A 4MMMA 3R2QA 4Q5NA 3L4NA 2PWJA 1SD9A 2LS5A 3FZ5A 3EU4A 5DCHA 1ZMAA 5H5QA 1HNCA 3C8EA 1MDIA 4MZBA 5IM9A 3GUSA 5KEJA 3BD2A 4D73B 2X99A 3QPMA 1XVQA 4NV2A 1BYEA 5IPHA 3IRAA 1E2YA 4MH2A 1R5PA 3VWUA 4K6XA 1CQGA 2X8HA 2PBJA 1PX6A 4ULXA 1E6BA 5AIXA 3M9KA 4I2UA 1TU7A 1ON4A 1F3AA 2GTUA 3WGXA 4IBPA 2HYXA 2K18A 2VUPA 2FWHA 3DVXA 3WGDA 3G7JA 1FVJA 5DCGA 4KNDA 2H01A 4X43A 3IDVA 3TRXA 2PPTA 3APOA 2YANA 2RM6A 3JCML 2C0GA 2VL9A 2GDRA 3KGKA 4J57E 4FQUA 3DWVA 3L9VA 2H1AA 4FIWA 5ID2A 1YJ6A 2H0GA 4KCAA 4IGJA 3BJ5A 5KN2A 4I6XA 2WDUA 22GSA 3ERWA 2B5XA 4GXZA 1PRXA 2GZYA 2JU5A 4XHMA 1TK5B 4DEJA 2FA4A 1XIYA 1X0RA 5D96A 3I43A 3KXOA 2C4JA 2YCDA 2IPAA 3UVTA 3KD0A 1TOFA 5DAKB 1GSFA 3TKRA 1UVZA 5DQYA 3IA1A 2L5LA 1XFLA 5DJLA 3GKNA 4OO5A 4N0VA 1TP9A 4TR1A 5AN1A 5JWOB 1NHYA 3UVHA 2X64A 3WT1A 1GP1A 2ON7A 3QD9A 2F8AA 3WD6A 2PUKC 1F3BA 3F4RA 3TJKA 2HRKA 5F07A 2C0DA 4IHUA 1SK1A 2LJKA 2CA8A 4H86A 5E4WA 3TRPA 2C0FA 1HYUA 1G7EA 2YJHA 4POKA 5J9CA 3P8WA 4HOJA 3O76A 2C80A 3W8JA 5B8BA 2VD0A 1VRSD 3GX0A 3ERFA 2WFCA 2DJ1A 3I69A 4TR0A 2PVQA 7GSSA 3R3EA 3KP9A 5D9VA 4L5LA 1GSYA 4ECJA 2L57A 2R6KA 1JZWA 1AC1A 5B6NA 1O8WA 4XS6A 4N11A 3ZZXA 2GSTA 2XPDA 4HDEA 3LXZA 5DQSA 3ZFLA 16GSA 3GFKA 1THOA 1UN2A 4JU5A 3D4MA 1OC8A 5DALA 3ZLPA 4K9ZA 1JZDA 3KJYA 3A5WA 3LQ7A 3H1NA 3ME7A 5DALB 3FR9A 5JWRB 2C0EA 1LBKA 3M1GA 2I9HA 2N5AA 4NWYA 1PN9A 4WBRD 4EC0A 11GSA 4KB3A 4CDOA 3N9JA 2MMOA 4EF0A 2WZ9A 2MMZA 1V9WA 2CT6A 2JZTA 3MSZA 2JZSA 4KX4A 4PXOA 1T00A 5IMFA 1MDJA 4MABA 4K7IA 1K3OA 1M99A 3GYKA 2VLUA 2PN8A 4G0KA 3HJMA 5GSSA 17GSA 1GTAA 1Q4JA 3CTGA 3G9BA 3RPNA 5CRWA 4IQAA 4AGSA 5A4VA 2XBIA 3CSIA 2H73A 1BAYA 4BWSA 1OKDA 5CP1A 2HRNA 2NVLA 5JCUA 3TOUA 1U87A 3KMOA 4YH2A 2GZPA 4TR4A 2G0FA 4KW6A 2YP6A 2L4CA 3GRXA 2H6XA 4QL9A 3MDKA 2LRNA 2HFDA 3ZYWA 2MYGA 4MPGA 2HRFA 2RIIA 3WYWA 4HJ2A 4I8BA 1BX9A 5IO2A 4OO4A 1IYHA 1TK0B 4OCEA 2VAFA 5KN0A 3SBCA 2LQOA 4ML6A 4IVFA 3U6VA 5DJMA 3D22A 3QFBC 5H5RA 2G2QA 1AQWA 5HR0A 5EL8A 3H4KA 4O5RA 2HZEB 4GSTA 1M2AA 2P5QA 4IN0A 3GSTA 1TRUA 4BA7A 4FYUA 2OJLA 5G31A 3EINA 1GTIA 5G2ZA 3UAPA 2WB9A 2DSAA 1BEDA 5D93A 4FO5A 4MCUA 3CTFA 1BJXA 2DC5A 3APQA 1ERVA 3MNGA 1WPIA 1YZXA 4YAVA 1MDKA 2XPEA 1FAAA 3RBTA 4MZCA 1R26A 3D4TA 1ERWA 3CSHA 1M7TA 4BVXA 1SD8A 2IMKA 2LUSA 3ZIVA 1B8XA 2JSZA 5B8AA 2DJ0A 3LXTA 5J4UA 3HYPA 3UMAA 3TOTA 1U3IA 1B9XC 4GLTA 5AIVA 1X9SB 2E7PA 2GLRA 3A2XA 4KSMA 3CXGA 5ECRB 5CO3A 3VFIA 2M46A 1YY7A 4KCEA 2X8CA 1FO5A 3HVXA 3UEMA 4WR5A 2CZ3A 2DJ3A 2B5YA 1QXHA 4I2TA 2JSYA 3C1RA 2DIYA 1O73A 5ECQB 2LJAA 1MEKA 4MP4A 1EV9A 1HD2A 1EGRA 4IQ1A 2HE3A 3LEFA 2VCVA 1EEMA 3DGQA 4WETA 4GQCA 2VLVA 3CMIA 4POBA 5ECSA 4PUFC 1KTEA 3HDCA 3D5JA 2UZ8A 2OADA 2VM1A 2OBIA 4RI6A 4K7OA 4EDYA 3FR6A 4EUYA 4P3YB 1K0CA 4AJ8A 3KZQA 3IC8A 2VCZA 1X9MB 3F4SA 4V1Ap 3ERGA 1TKDB 4LL4B 3UBKA 4J56E 4K7NA 2DLXA 2OE1A 2HSMB 4BL7B 4USSA 1XBSA 2O7KA 4ZL7A 4NMUA 4OMVA 2DJJA 4Q5FA 3UOMA 3KM6A 2LRCA 3IK7A 5KN3A 4POLA 3W8SA 4XRDA 2WJUA 4RUVA 3M8NA 2V6OA 4ZBBA 3G7YA 3UIWA 1WIKA 1SK2A 18GSA 4MPFA 2BJXA 3APSA 1CQHA 3HHVA 1VF1A 3QR6A 1TJDA 2E2MA 4XCSA 2JL4A 5E59A 2L59A 5HR2A 3BCIA 2C1YA 4ZB6A 1XVWA 3TCOA 4D73A 2R3XA 4JEDA 3MWHA 2YPMA 4LLRA 4DSSB 1O8XA 5G1KA 1SL1B 2VM2A 4IS0A 5COHA 2YWMA 1DBYA 4NHZA 4L0WA 1OC9B 4YQVA 1T1VA 2JZRA 2NTOA 5B7CA 3TGZA 1XXUA 1T7PB 1SL0B 4I5QA 3TB2A 1JZRA 4G0LA 3F6FA 4TXOB 1A0RP 2OKAA 3GV1A 4MK3A 2JADA 1NSWA 2AUVA 2YWOA 1A2LA 2GS3A 5LCZA 4IJIA 3VWVA 2YZUA 4HU7A 3KH7A 2EIRA 2L4QA 4O7HA 2B6MA 2DBCA 3VURA 3TJJA 1ABAA 2B5EA 1AQXA 5J41A 2KP1A 2R5GA 3FY7A 3ZTLA 5DAKA 1O81A 2IMIA 2QGVA 2N5FA 1GSEA 1GLQA 4KA0A 4O32A 1ZGNA 3D21A 5EY6A 2H0IA 3LSZA 5J3RA 1TRSA 4QQ7A 3ED3A 3P2AA 1V98A 4IELA 2FLSA 4X1UA 3QDNA 5F8BA 4G19A 3I9V2 5CYYA 1V2AA 5JCWA 1W89A 4K2DA 2K8VA 2GQKA 5HQPA 5ELGA 3LG6A 1THXA 4TR3A 5ENUA 3IPZA 2CAIA 5ECOB 4WXTA 4G0IA 1ZYQB 2QC7A 4IP1A 3EE2A 2CQ9A 2RUFA 4TKYA 3TJGA 4ECCA 2VD1A 3DKSA 3D0ZA 2QSIA 1TI1A 3P7XA 1PKZA 3ZITA 3HZ8A 3HVSA 3ZMKA 1J0FA 1PKWA 3CRTA 1AQVA 2OA7A 2LJRA 6GSYA 5HR1A 1ST9A 4V2MA 5H5SA 2FWFA 1S3CA 1I5GA 5AGYA 4F0CA 1SENA 1ERTA 5B6MA 1T4YA 5IPGA 3TRQA 1A24A 3UARA 1K0MA 5HFIA 2L5OA 1BQ7A 2H1GA 2HNLA 3IBHA 4MDCA 2RUEA 1F6MC 2YN1A 1ZOFA 2B7KA 5EPFA 1GUKA 1FHEA 2H66A 3A2WA 2CVKA 3L78A 2H30A 4J2FA 3RHCA 2R37A 3IAS2 4EE0A 4ACSA 3M9JA 3TKSE 1EGOA 4EDZA 3GL3A 4KDXA 1HQOA 4MJCA 1TW9A 2MBTA 2F51A 6GSVA 3KTBA 1DSBA 3FW2A 2HI7A 1M2DA 5A4WA 1Q98A 3SWLA 2YWIA 3EWLA 4N10A 1NW2A 2H71A 3K8NA 1OKTA 2NDOA 2IMDA 4LMVA 4JR6A 3HJPA 1FG4A 4WR4A 1Z9HA 2L6CA 4XS1A 3FK8A 2D2ZA 2GT5A 2LTKA 2IL3A 1N2AA 1EWXA 4ML1A 2VO4A 2HZFA 2HLSA 3GKXA 4OFNA 1SKWB 4FYCA 4FH8A 2LQQA 3LFLA 4MF7A 4JR4A 1V57A 2V41A 1XWGA 1U6TA 5ECIB 3I6AA 4KAEA 3TKSA 2DMLA 3GTUB 3Q74A 2REMA 2WS2A 1K0NA 1XWCA 2ZUPA 1Z3EA 5G5EA 3VK9A 1JHBA 3LORA 3NIVA 2VL3A 2H1DA 4PQHA 5ECMB 3LWAA 2GSRA 1U88A 2RM5A 2YZHA 2LV3A 1PD21 3F0IA 1XOBA 3HD5A 4GRFA 1KNGA 4N30A 1XOAA 3HXSA 2H1BA 2R4VA 4BVYB 1V58A 13GSA 4NXIA 3N5OA 14GSA 4OCFA 3W6GA 3DYRA 3BOAA 1UC7A 5A5KA 1K0DA 5DVBA 1PGTA 2O89A 1QUWA 2EC4A 3TKQA 2TRXA 3UL3A 3WT2A 1AXDA 1PMTA 2A2RA 3UJ1A 2IFQB 4NPBA 4GQFA 1WE0A 1YKAA 1YKCA 3A3TA 1SKRB 5HR3A 5CNWA 2HZEA 3F4TA 2FHEA 4DVCA 1B4PA 2VCTA 2ALBA 2YOIA 4LL1B 1EP8A 3VPQA 2OACA 5BMUA 1TRVA 2O85A 5D9XA 5CRHA 3F6DA 1XWBA 1QGVA 5JCGA 3TKPA 3HJOA 1M0UA 1AUCA 3F3QA 4JE1A 4LA1A 4Q5QA 4FYBA 3J7Yk 4PX1A 4AF2A 1R5AA 4IP6A 2IMEA 1M2BA 1UA5A 1OYJA 1USBA 2H74A 3E9JB 1S3AA 3PPUA 4XTSA 1PQNA 4L5OA 1FOVA 2DIZA 1TDIA 2TRCP 2E0QA 3BCKA 2CVDA 1JFUA 3FKFA 1OC3A 3L0HA 3GURA 4GCIA 3FYGA 1DE2A 4KF9A 1XW5A 4ZL8A 1FW1A 2H75A 2DJ2A 4HQZA 1EOHA 2L6DA 5GZZB 1F2EA 4NAXA 3HY2A 3IOSA 4IKHA 2P31A 4RQRA 4XS4B 2FY6A 3DMLA 3AY8A 4MH3A 1A0FA 3ZRDA 1TRWA 4ECBA 1SJZA 1ERUA 4OWYA 2VOCA 2GT6A 2IN3A 4PUAA 3CSJA 1SK0A 1R4WA 2AHEA 3IXRA 4DSRA 4HEA2 4ECIA 4V2LA 3G7IA 1OE8A 1LU4A 1H75A 1A23A 1YEXA 1W4VA 4F0BA 2RLIA 2NBSA 1O85A 1DUGA 4MLYA 1A8LA 1GNEA 2AAWA 4OFMA 4G9HA 1ACVA 1G0TA 2C3NA 4ZIJA 1PL1A 3F8UA 3O3TA 1QFNA 2LNSA 3QOUA 3FZAA 1ZCPA 1YF0A 5GSTA 5G1LA 5IMCA 1JLWA 4ZILA 3C73A 2P5RA 2IJYA 2HSMA 4BL7A 4E8EA 19GSA 12GSA 1X5DA 3ME8A 2HSYA 2KUCA 3QAVA 3TUEA 3EMXA 3CRUA 1YQ1A 1GRXA 3KCMA 2K8SA 3IE3A 5ECNB 2DJKA 3CBUA 1F9MA 4KUNA 6GSWA 1ZL9A 3VI7A 2KOKA 3KMNA 5G30A 4AJ6A 1Z5YE 4EVMA 4PGTA 4ZB9A 1K0AA 4WF5A 8GSSA 2O87A 2PMTA 5DDLA 1HNBA 1AIUA 2KHPA 1T8EB 2VCQA 4YAPA 4K1FA 3DVWA 2JACA 4JRRA 2H6YA 4DSSA 4I97A 4HZ4A 4ZXGA 4YQUA 4KDUA 2B1KA 1I9DA 1K0BA 1JZOA 2TIRA 1K0OA 2HSHA 3ZIJA 5IMZA 2ZNMA 1OC9A 2HT9A 4RI7A 4G10A 3RHBA 3NZNA 4NHWA 2A2SA 1GTBA 1VF3A 4EL1A 3GKKA 2OE3A 4E8HA 3ZVJD 4PQ1A 5F05A 4K8MA 1TU8A 2AB6A 4TXOA 3RDWA 1G7OA 1XCCA 5IMDA 3M0FA 1A2MA 2VLTA 4IW9A 1ZZYA 2I4AA 5D9WA 2I3YA 2GSQA 3IAM2 4LMWA 1J9BA 2GQMA 3DEXA 4HS1A 2OE0A 4ZBDA 2N5BA 1IYIA 1QQ2A 2ZCTA 1FB0A 2O8VB 2FWGA 4HJMA 1GULA 4K0NA 5DBQA 3US3A 3HCZA 3FRCA 1OAZA 2LNTA 4F82A 4TVEA 4L8EA 3S9FA 1WOUA 1J08A 3DRNA 2IWTA 1BG5A 4MF5A 1G6YA 1Y25A 1GH2A 3V1WA 1N8JA 5L71A 4PQIA 2FUG2 5HFGA 5IOWA 2VCWA 5ECLB 5ID2B 2LEGA 1TI3A 1XWAA 2GQLA 5IMAA 4PNFA 2VIMA 4EKZA 4HZ2A 1MD4A 3H93A 1QMVA 3L9UA 3C1SA 5ECHB 1X5EA 3QFAC 2FA8A 3LYKA 1A2JA 2EIQA 1B4QA 2P0GA 2CAQA 2FNOA 2H0HA 4V2NA 1ZYEA 4PURA 2H70A 2CX3A 3NOFA 3F3RA 1T4ZA 3H8QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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