1NHYA

Crystal structure of the gst-like domain of elongation factor 1-gamma from saccharomyces cerevisiae.
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
MSQGTLYANFRIRTWVPRGLVKALKLDVKVVTPDAAAEQFARDFPLKKVPAFVGPKGYKLTEAMAINYYLVKLSQDDKMKTQLLGADDDLNAQAQIIRWQSLANSDLCIQIANTIVPLKGGAPYNKKSVDSAMDAVDKIVDIFENRLKNYTYLATENISLADLVAASIFTRYFESLFGTEWRAQHPAIVRWFNTVRASPFLKDEYKDFKFADKPLSPPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Translation
molecule keywords Elongation factor 1-gamma 1
publication title The Crystal Structure of the Glutathione S-Transferase-like Domain of Elongation Factor 1B{gamma} from Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 59
structure length 219
sequence length 219
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1nhyA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1nhyA01
2GQLA 3IC4A 2L5OA 2L6DA 3UJ1A 1GSYA 3HY2A 2J9HA 5ECOB 2ON7A 2F9SA 5J41A 4NHZA 4NAXA 3M9KA 1HQOA 3APQA 3GSTA 1ACVA 4MJBA 5FHIA 1F2EA 3RHCA 5DCGA 4IS0A 1GH2A 4XRDA 3EC3A 3UBLA 4PQIA 2IN3A 2GSQA 3VWUA 1GULA 2FD3A 3TRXA 3BOAA 1Z6NA 4EVMA 1T00A 4BL7B 3RHBA 3M1GA 2H74A 4TRXA 1OAZA 5GZZB 1Q4JA 1W4VA 5HR2A 1S3CA 3F9UA 2VM1A 2PU9C 2LUSA 2KP1A 2MMAA 1QXHA 3IRAA 1EGRA 4ZL8A 2CVKA 4ZB9A 3KTBA 2C0FA 3MDKA 2X64A 5HFIA 1PX6A 3UOMA 4AJ6A 2H01A 3GKNA 1T4ZA 2H6YA 2OKAA 2V41A 2LRTA 3QR6A 2FCHA 5G1LA 1WMJA 2H8LA 4TN8A 3ZVJD 1M7TA 3VURA 1MTCA 1XVWA 4JBBA 1G6WA 1CQHA 4OFMA 4YAPA 2JSYA 2DSAA 5AIVA 5D9VA 4AGSA 1A2MA 4MDCA 5IMFA 3QFBC 3VPTA 1Z5YE 5GAND 3MAKA 1GSEA 4K8MA 1GUHA 4HZ2A 1ST9A 2B7KA 2FWEA 3CTFA 4L5OA 1U6TA 4LMVA 3GH6A 1VF4A 1HNCA 1VF3A 1VF1A 3H79A 2E0QA 3AY8A 1TDIA 5IOXA 2XPEA 4HU7A 1DUGA 2E2MA 5D8IA 3DD3A 4ZBAA 4ZL9A 3IXRA 20GSA 1K0DA 2K18A 3C1RA 3TB2A 2AHEA 5JCGA 4USSA 1PL2A 2PMTA 1FB0A 1A2LA 5J4UA 3HHVA 3SWLA 1XCCA 2H66A 5ECKB 3TKSA 5LD0A 5FWGA 5B8AA 1DE2A 1XWCA 1QMVA 1PGTA 3W8SA 2C0GA 2VAFA 1GRXA 1PKZA 1X5DA 3QAGA 1PD21 1WP0A 1R5PA 1AC1A 3CXGA 3TJKA 1T3BA 4NWYA 4EL1A 5HFKA 2GT6A 3ZRDA 2QGVA 4GWRA 3PPUA 1KNGA 2IIYA 2YV7A 4KUNA 1EV4A 1O73A 2QC7A 5JCWA 1NHYA 2GDRA 4TXOA 2GSTA 3Q6OA 1K3LA 2A2RA 4ZL7A 1JFUA 3WD6A 3FR6A 3FEUA 2HZFA 3LXTA 3L0HA 3UL3A 4IBPA 5D9TA 1SD8A 4OD7A 2ALBA 3J7Yk 2IMEA 7GSSA 1LBKA 3KD0A 4I5QA 4V2MA 5D96A 2ON5A 9GSSA 5CRWA 4F2IA 1A8YA 3GV1A 2C3QA 3VWWA 2YWOA 4KCEA 4G19A 3O3TA 1WOUA 5B7CA 3FR3A 1UC7A 1WJKA 1PMTA 4KGIA 1AQVA 2HSMB 1Q98A 3UVTA 1FAAA 4I2TA 3BD2A 4J56E 3ZFBA 3HVXA 3Q74A 1EGOA 5CRDA 3D21A 2MZCA 3EMXA 4TR3A 3DIEA 4K2DA 1FHEA 2HRFA 2WCIA 17GSA 2PGTA 4HJMA 4KF9A 3MNGA 3TKPA 1IYIA 4G0KA 2C1YA 4NV2A 4G0IA 4ILFA 4KDUA 1OC8A 1T4YA 4ZB6A 3WGDA 1SYXA 1BEDA 1V9WA 3L9SA 3DMLA 4JEDA 1GTAA 4EE0A 5CREA 4XHMA 3F6DA 3LYPA 1TTZA 1GL8A 4XS1A 3ME7A 2H19A 5ELGA 1RW1A 3IA1A 3RBTA 1N2AA 2VCTA 2DJKA 3IR4A 1W89A 5ECLB 2I81A 1BX9A 5KN0A 4PNFA 1XIYA 1TOFA 3DRNA 1IYHA 4HI7A 1RQMA 3SBCA 2KLXA 1SK1A 5F8BA 2GVPA 5G5EA 2L4CA 2EIQA 1YDKA 2B3SA 1GSUA 3LXZA 2L57A 5FT3A 3BBYA 1K3OA 3FZ4A 1QGVA 2EIOA 2R2JA 4XS6A 4XS4B 4MA9A 2OACA 4N0ZA 2HSMA 10GSA 3APOA 3GHAA 5DALB 3I6AA 3UEMA 5E59A 5EVOA 1U3AA 1GTUA 2DMMA 1XWBA 2VL3A 3KGKA 1A8LA 2H1AA 3IAM2 1O85A 12GSA 1XPVA 14GSA 2HFDA 3A2WA 4E8EA 1E6BA 4RI6A 4FYUA 2PBJA 3EVIA 3QAVA 3U6VA 4KE3A 3CRUA 1GTIA 2RM5A 1GWCA 13GSA 2ZNMA 3LGCA 5DQSA 1TRWA 1ERUA 1JZRA 5CNWA 3UIWA 4F0CA 1USBA 2HNLA 3KH7A 4IQ1A 1EEMA 4ULXA 1AAZA 2VLTA 2DIYA 2LRCA 1OYJA 5J9CA 3GURA 3F6FA 3P7XA 4BVXB 3H4KA 3ISOA 1SJ6A 5ECPB 2IFQB 3LJRA 4HOJA 4JR4A 3RAZA 1SJZA 3ZL5A 2GSSA 3FW2A 2PUKC 3KP9A 5EY6A 5F07A 3ZIJA 1GTBA 2VCWA 1WWJA 2EC4A 1PRXA 1VRSD 3W6GA 1SENA 5GSSA 1YEPA 2GQKA 2C8UA 1MEKA 1F3BA 1ZGNA 4TXVA 1J9BA 3IHQA 2JSZA 5A4UA 3HDCA 4I6XA 2IPAA 3PINA 3WGEA 2YCDA 1YF1A 3CSHA 5AISA 4FIWA 4XS4A 3LQ7A 1FG4A 3DKSA 1HNAA 2AV4A 4BA7A 1UA5A 3N9JA 5DALA 6GSXA 3J7Yb 2YOIA 4MJAA 4MJEA 2CZ3A 2O87A 2H0IA 4QL9A 4RQXA 3L78A 3EWLA 3ZIVA 4GSSA 3UARA 4TOPA 4BVYB 3U5RE 3LG6A 1NW2A 1SK0A 5J5NA 3M3MA 2VL9A 4NMUA 4X43A 2YN1A 4QQ7A 1B8XA 2BTOT 1K0OA 4J2FA 3VI5A 4RQRA 2VUPA 3KMOA 3G7JA 1J0FA 4V2LA 2OE1A 2LQQA 3QMXA 5LNKe 1B4PA 2K8VA 4D73B 2VCQA 5ECHB 3KTLA 2H0GA 3QAWA 4F0BA 5D93A 4TVEA 3KM6A 2F51A 3ZTLA 2DBCA 1ILOA 4P3YB 4EO3A 4JR6A 1VGLA 4BVXA 5E4WA 2GS3A 1YKAA 1G6YA 4PUFC 3VFIA 3BCIA 2IFQA 2H70A 4ZBDA 1Z6MA 1NSWA 5DVBA 1TRVA 5IIZA 1C72A 5ID2B 4H86A 4IP6A 2REMA 2VD1A 2H75A 1OE7A 3IPZA 1EOGA 5AGYA 3UBKA 5IMDA 5IQYA 4MF5A 2QKEA 1U87A 1Y6EA 4F9ZA 2WS2A 2PVOC 2B1KA 3VPQA 4KDXA 2VCZA 1GP1A 1A23A 4HUAA 2XHFA 1TK8B 3DVXA 4CW9A 3O6TA 2VOCA 1SYRA 6GSVA 4TR4A 2Z9SA 2H1DA 2LS5A 4KB3A 1RK4A 3R2QA 4YAVA 2HSNB 4BVYA 3JCML 1PSQA 2FHEA 1FVKA 2X8CA 1TJDA 1FB6A 2JZRA 4N30A 4MF7A 2CVDA 1BYEA 1O6JA 4LLRA 3D5JA 2JADA 2GTUA 3R3EA 2H1BA 5ECSA 1DBYA 4ZIJA 1X9MB 2YWMA 3PH9A 3F4RA 5F06A 4D73A 2WB9A 1O8XA 1WE0A 3V1WA 3WT1A 3GX0A 4O32A 1JZWA 2WDUA 3KJYA 4ACSA 1A2JA 3Q19A 5KN1A 1ABAA 1BG5A 3VWXA 2GSRA 3M9JA 2GQMA 1Z7PA 3HA9A 1AQWA 2IMIA 4KDYA 2E2GA 5ID2A 4EXJA 1O8WA 1BJXA 2RIIA 4I97A 1TU7A 5ENUA 2LTKA 5CO3A 4MCUA 1HYUA 2P0GA 4K6XA 4ML6A 1K0MA 5A5KA 2C4JA 4OFNA 1UN2A 18GSA 1K3YA 1OVNA 2NPBA 2AJQB 4AJ7A 1M2DA 1JZDA 4BL7A 3VWVA 1SJIA 5CRHA 1ON4A 2G0FA 3E3EA 2V6KA 5IM9A 1YEXA 4HU9A 2LV3A 1TI1A 1TK5B 3TKQA 1AQXA 1Z9HA 2P5RA 4MZCA 6GSWA 3TKSE 1TKDB 3EYTA 3GN3A 2DJ3A 3QD9A 1KBNA 2OA7A 2AUVA 2C3NA 4NHWA 2I9HA 5IPGA 6GSTA 3I69A 1GUKA 4EDYA 3NZNA 4MMMA 3OR5A 1XW6A 2LJAA 3PR8A 3GKXA 2VLVA 5H5QA 2GZYA 2JZTA 5BMUA 2D2ZA 3GRXA 4YQMA 1ZCPA 4OCEA 5IMVA 4MP4A 2VL2C 2MBTA 3L4NA 3GYKA 3GFKA 1EP7A 4KH7A 1XWGA 4POLA 2YZUA 4J57E 1G7OA 3TCOA 1OKTA 5KN3A 1GLQA 2DJ1A 2RUFA 1XZOA 4ZBBA 1OE8A 4ZB8A 1A0FA 5B6NA 4E8HA 2OE3A 2C80A 1H4OA 4WBRD 4TR1B 3UVHA 5KN2A 5C00A 4HS1A 1LU4A 2YWNA 3ZITA 1TP9A 5HFGA 4IHUA 5DAKB 3LWAA 4G2EA 4IJIA 1PA3A 4I2UA 1TK0B 2A2SA 4YQVA 2XBIA 2QSIA 5ECMB 1MD4A 3HJOA 2HQTA 1B9XC 2KHPA 4WXTA 4LA1A 4PUAA 5ECNB 1ML6A 3DVWA 2FWHA 4YQUA 2VCVA 5DCHA 1JZOA 2RLIA 1JLWA 2JZSA 1NM3A 1O7UA 2DJ2A 2V6OA 2MBSA 2HRNA 1PL1A 4KNDA 4POMA 3HJPA 3CRTA 2B5EA 3W8JA 2H71A 1Z3EA 2H76A 2KUCA 4MF6A 4K7OA 2WGRA 4ML1A 3GL3A 4PURA 4TKYA 3P8WA 1MDKA 3DEXA 2CX4A 1AUCA 2DIZA 1EEJA 5G31A 5HR1A 1THOA 2RUEA 2WZ9A 1FOVA 3NIVA 6GSUA 4PGTA 1WPIA 3DWVA 3KMNA 2O89A 4POKA 3C7MA 3FR9A 5GSTA 3RPPA 4K7NA 3F0IA 3BCKA 1ERWA 3KCMA 4XTSA 2YV9A 5HR3A 3TJBA 1PN9A 4LL1B 5G30A 2NDOA 2JACA 4EDZA 3FZ5A 4MK3A 4ID0A 4Q5QA 5DAKA 1FVJA 1PKWA 1M2BA 3GX8A 3GA4A 1YQ1A 2HT9A 6GSSA 5COHA 5ABRA 2PVQA 4OO4A 1TXXA 2HXKA 1K0BA 2HRAA 4L8EA 4ZXGA 2R37A 3GUSA 2FA4A 3VK9A 2PWJA 3UAPA 1EV9A 4EC0A 3HZ8A 1HNBA 5B8BA 1HD2A 4Z7XA 2A4VA 4K9ZA 1ZL9A 2O7KA 1T1VA 4WF5A 3QCPA 4O5RA 4MH2A 3ME8A 2BMXA 5IMZA 1PX7A 2N5BA 2C0EA 4WF4A 4KSMA 5JCUA 4OWYA 2TRCP 5INYA 1H75A 1XXUA 3IK7A 3D4MA 1XBSA 2HSYA 4ECBA 2WJUA 5D9WA 3EU3A 1AW9A 2H1GA 2R6KA 1R26A 1S3DA 5G2ZA 1XFLA 2R3XA 5EPFA 4AF2A 3TJJA 2AB6A 5J3RA 3TJGA 5G5FA 1SL1B 4RUVA 4K0GA 3D0ZA 2B1LA 2MMNA 3D4TA 4F03A 5J9BA 1SK2A 5ECQB 5DQYA 1ZMAA 1B4QA 5D73A 1U88A 2F8FA 1N8JA 2L6CA 4N11A 4PQHA 1TI3A 1OC9B 3ZVJA 3GSSA 1I5GA 4EUYA 8GSSA 3QFAC 1WIKA 5H5SA 3HKRA 3KZQA 3IV4A 2CQ9A 1ZYEA 2IL3A 1JLVA 1MD3A 4XCSA 3RDWA 4YH2A 2LNTA 1GUMA 2I4AA 2KP2A 1YY7A 4V1Ag 4Q5NA 2IMKA 1F3AA 4HJ2A 1X5CA 2DJ0A 2CZ2A 4ISDA 3C71A 2HLSA 4IN0A 2K8SA 4DVCA 2F3MA 2HZEB 4BWQA 4NPBA 4KAEA 2LSTA 2MYGA 2V32A 4EF0A 3WGXA 2VIMA 2PERA 1XOAA 2MMOA 4FQUA 4BWSA 4GQCA 2NTOA 4LL4B 3GKKA 1VF2A 3HVVA 1R5AA 4OFTA 4LMWA 3IC8A 1CQGA 2O85A 4HQZA 1R4WA 4DSSB 4ECJA 1G0TA 4G9HA 4OMVA 4TW5A 2H0HA 3FKFA 3TOUA 2H73A 5G1KA 1B48A 1EWXA 2XC2A 1K0NA 4O7HA 2RM6A 3HYPA 2GT5A 5DJMA 3LSZA 5IMAA 1M2AA 5IPHA 1OC9A 3KEBA 4HDEA 3TKSC 3NOFA 2R5GA 2JU5A 5JWRB 4GLTA 1A24A 4WKWA 3KH9A 1WRYA 5DJLA 2CX3A 2DMLA 1V57A 2CV4A 5H5RA 2GZZA 3CSIA 5EL8A 3LYKA 1QFNA 2IMFA 2LJKA 2LJRA 3IBHA 2B7JA 2M46A 4O92A 3QDNA 3GTUB 3N5OA 1NHOA 3KIJA 3A3TA 1PQNA 1F37A 2MMZA 1B9YC 2G2QA 4KSOA 2FGXA 3ERGA 4Q5FA 4FYCA 2E7PA 2FLSA 2IJYA 4OCFA 2HZEA 2YANA 5LCZA 3ERWA 4IQAA 1EOHA 1K0CA 2TRXA 3IAS2 4EKZA 4TXOB 2H6ZA 3HVSA 2LQOA 3EMPA 1SU9A 4IJ3A 1M9BA 5B6MA 3CYNA 3M8NA 2V1MA 3VI7A 2ES7A 4ZILA 2R4VA 4DSSA 6GSYA 1V2AA 1BAYA 4NXIA 2IMDA 4GSNA 3TKRA 5CYYA 3K8NA 4MABA 4JU5A 3FYGA 4F82A 4GQFA 2CA8A 2DLXA 5AN1A 2O8VB 2AAWA 1V40A 2OADA 3IOSA 2M72A 2H30A 2CT6A 1FO5A 2I1UA 2XBQA 3H93A 2M80A 3TJFA 1THXA 1GSQA 1MDIA 5GAPD 4TR0A 4IGJA 2B6MA 2OJLA 5HR0A 1SKWB 4WR4A 5CP1A 1EP8A 4Q5RA 3GTUA 3BJ5A 1F6MC 4KCAA 2PPTA 4PXOA 2VLUA 3FZAA 4G10A 4MLYA 1URMA 11GSA 4POBA 1QQ2A 3A2VA 1T7PB 2YWIA 3IDVA 2L4QA 2L5LA 3LORA 2C0DA 2H6XA 2ZUPA 2DC5A 4PQ1A 5C04A 1SL2B 3ZLPA 3P90A 5D9XA 3IE3A 1GNEA 1UVZA 2WFCA 3ZYWA 2YZHA 2FWGA 1YJ6A 2FA8A 1GLPA 3F3RA 1XW9A 2HI7A 2VCXA 2TIRA 4JRRA 4N0VA 1S3AA 3TRPA 3GKMA 5ECIB 1XWKA 1Z7RA 2GZPA 3CBUA 3EU4A 3DYRA 1AXDA 1OC3A 4BPYA 4MH3A 4WETA 2N5AA 2EIRA 1YZXA 4HQSA 1E2YA 4IELA 1LJRA 4X0XA 3QOUA 1OKDA 3QPMA 3GL5A 3MSZA 3A5WA 3WT2A 3DXBA 4V2NA 4ECCA 5IMCA 4DSQA 2CAQA 4PNGA 1GSSA 5JWOB 2VD0A 3UMAA 4NV5A 1BQ7A 3E9JB 1XOBA 2K6VA 1DSBA 1YKCA 1V58A 2X99A 4K7IA 3EURA 2WULA 1ZZYA 2AYTA 4IKHA 5JWQB 3G7IA 5ECRB 4PX1A 2YNXA 4DEJA 3I43A 4X1UA 3C8EA 3Q18A 3HXSA 1ZYQB 3WYWA 4WR5A 1XW5A 4FH8A 1QK8A 3F3QA 3FZ9A 3H1NA 2B5XA 3KP8A 3ZMLA 1O81A 19GSA 4PTSA 5AIXA 2X8HA 2VL2A 1I9DA 3MWHA 4GTUA 5A4VA 4GF0A 1T8EB 5IOWA 1X9WB 3P2AA 4KW6A 4WBJA 5DBQA 3L9VA 2OBKA 2XPDA 3ZFLA 1YF0A 4JZQA 3G7YA 1XWAA 3ERFA 3HD5A 1TW9A 2CAIA 4G0LA 1XVQA 4TR1A 4MZBA 3FRCA 1GSFA 1TRUA 4HEA2 5CAXA 3PGTA 3O76A 2LRNA 3I9V2 3HJMA 1TRSA 1K0AA 2B5YA 2ZCTA 4OO5A 3E0UA 2HYXA 5IO0A 2K9FA 2HRKB 2NVLA 1X0RA 2N5FA 1X5EA 3CSJA 4L5LA 3C73A 3GMFA 3H8QA 4IW9A 5KEJA 4GSTA 2FNOA 4FYBA 4I8BA 3APSA 2FY6A 2H72A 4XIHA 3EINA 2WRTA 4GXZA 4AJ8A 3TRQA 3ZZXA 3S9FA 4JE1A 1DE1A 3US3A 3L9UA 2FUG2 3C1SA 1SL0B 3FY7A 2GGTA 1TU8A 1M0UA 4MJCA 1F9MA 2LNSA 4IP1A 1ERTA 1KEBA 22GSA 1ERVA 2I3YA 4MPGA 1U3IA 16GSA 2HSHA 3F63A 4GRFA 5F0GA 1R7HA 2KOKA 1V98A 2NBSA 4N10A 2P31A 3FHKA 2PN8A 2VM2A 4RI7A 3EE2A 3KXOA 1G7EA 2C3TA 3F4SA 2OBIA 3TUEA 2JL4A 3G9BA 5L71A 1GNWA 2J23A 3DGQA 3ED3A 4FO5A 3RPNA 3TOTA 3D6IA 3TGZA 3LFLA 4DSRA 3HZ4A 1SKSB 3A2XA 3VLNA 4KA0A 3D22A 2YJ7A 1SD9A 2DJJA 2F8AA 1AIUA 5IO2A 1FW1A 2YPMA 5A4WA 2VO4A 4ECIA 2CVBA 4KX4A 4K0NA 4WEYA 4V1Ap 2YJHA 4L0WA 1QUWA 1JHBA 2HRKA 5ELAA 1MDJA 5F05A 2GLRA 2P5QA 2V2GA 3TDGA 3IK9A 2OE0A 1A0RP 3GNJA 5CRGA 1ZOFA 3LEFA 1M9AA 2IWTA 2X8GA 3CTGA 1SKRB 1GSDA 5HQPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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