4MP4A

Crystal structure of a glutathione transferase family member from acinetobacter baumannii, target efi-501785, apo structure
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
212
structure length
198
Chain Sequence
b'EYFKLYTDSQFLSPYAFTVFVGLHEKQIPFEIAAIDLLTAKVPVLEHNDFALSESSAILEYLEELYPDTAIYPKDIQARARARQIQAWLRSDLVALRTERPTDVIFIQPKSTPLSEEGKKAAEKLFFVAEKLLASDAEFLFGSWSIVDAELALMLQRLIQNGDAVSERLKNYALQQWQRPSVQKWLALRHKAENLYFQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a glutathione transferase family member from Acinetobacter baumannii, Target EFI-501785, apo structure
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase
source organism Acinetobacter baumannii
molecule tags Transferase
total genus 69
structure length 198
sequence length 212
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2013-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4mp4A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mp4A01
3IRAA 2I1UA 1ZMAA 1AC1A 5D9VA 2AV4A 4AGSA 4KW6A 3CTGA 2H1DA 4TR3A 5ECLB 4KCEA 1M0UA 1SU9A 1WIKA 4Z7XA 1EEJA 4HOJA 4BL7A 1AIUA 1XZOA 3TJKA 4O7HA 2EC4A 3H79A 5DALA 4EE0A 2OJLA 4TN8A 4YQVA 2GSQA 1SL2B 4PTSA 2R3XA 3IC8A 2OBIA 4GWRA 2FWFA 2Z9SA 1LJRA 3GIXA 4TR4A 1M2AA 3HJPA 1Z9HA 2LKUA 3DIEA 3FZ4A 2JZTA 3LYPA 4N11A 5ECRB 2LSTA 4LLRA 4KB3A 3GURA 2I9HA 1XW9A 2XBIA 2L4CA 3F6DA 2IN3A 5AGYA 3LXZA 1A8LA 2RM6A 1V2AA 3I43A 1PX6A 2H0IA 1O85A 4HU7A 3LSZA 1AW9A 2DJJA 1OKDA 5HR3A 4POLA 2YZHA 2OA7A 1O6JA 4LMVA 4QL9A 3LGCA 5GAPD 2K8SA 3IR4A 1YEXA 4G2EA 2PBJA 5IM9A 3KH9A 4XTSA 2HZEB 1YEPA 1T1VA 2VOCA 2HSMA 1CQGA 5JCWA 2GDRA 1GNEA 1SK0A 5ID2A 1C72A 3C8EA 3FYGA 4O32A 4WEYA 5B8BA 1M2DA 4ECCA 4HJ2A 1YKCA 3N9JA 4L8EA 5E59A 4GSNA 4KA0A 2MMNA 2HSNB 2X8CA 2HQTA 3I6AA 2H0GA 4ZL8A 2HRNA 1R7HA 2H6YA 2TRCP 3P2AA 5JCGA 4OCEA 4N30A 2J9HA 1PGTA 3BJ5A 2NVLA 1FAAA 1GUMA 2F9SA 3ZFBA 1ZGNA 6GSTA 4IN0A 3APSA 3F4SA 3VWWA 5C00A 3KEBA 3P90A 3M9KA 1XIYA 2DSAA 4KDUA 2C0FA 4CDOA 3TKSA 1GULA 1ZL9A 4G10A 4XS4A 3CYNA 3TJJA 2P5QA 2VCXA 1HNBA 3EC3A 4WR4A 1TOFA 2DJKA 5CRWA 2CV4A 5L71A 17GSA 2GSSA 1K0BA 2GS3A 4DSRA 5A4UA 3UL3A 3UVHA 4RQXA 2H66A 1NM3A 1SK2A 1PKWA 4MDCA 1ON4A 2KP1A 3GH6A 3DEXA 1K0NA 2B7KA 4EDZA 4PQIA 4K0NA 4WR5A 1XWKA 4K7NA 3UVTA 5IQYA 4D73B 3QFBC 3G7JA 1NSWA 5KN3A 2DC5A 1XFLA 5G1LA 3KGKA 4JU5A 4LMWA 2KUCA 2E2MA 1B9XC 1CQHA 4XS6A 2E0QA 5G1KA 1GSSA 2NDOA 4IGJA 4K1FA 4YQUA 3RAZA 1GLPA 5A4WA 1E6BA 5ECMB 2H72A 2WRTA 1JHBA 4HZ4A 1K3LA 1OC9A 1V98A 1UC7A 2PVQA 1XWAA 2FWHA 5D73A 4IP6A 3AY8A 6GSXA 7GSSA 3CSHA 2OACA 1VF2A 1O73A 4HUAA 1W89A 2VCZA 4HEA2 2RIIA 3O76A 3F3QA 2ON5A 1URMA 1XWBA 3KCMA 2DIYA 1M99A 3ERGA 3KP8A 1AXDA 3FZ9A 2P5RA 3KMOA 1ZCPA 4TXOA 1FOVA 2VLVA 4L0WA 1OC3A 5EY6A 1GH2A 4BA7A 2IL3A 3L0HA 3QCPA 1Z5YE 4TR1A 4RI7A 3M8NA 1GUHA 3GUSA 1Y25A 4BL7B 2G2QA 1BAYA 1XWGA 5DALB 1LBKA 1O8WA 3VWXA 4USSA 5A5KA 1T8EB 1YF1A 3DVWA 4MP4A 5HFIA 1TTZA 3WGDA 2KOKA 3F9UA 2L5LA 1TW9A 2N5FA 4EKZA 3HVVA 1Z6MA 3UEMA 3M1GA 2AYTA 4EL1A 4ZXGA 2N5AA 5AIVA 5JWOB 5F8BA 2B6MA 3ZL5A 1VF4A 4EXJA 4TW5A 1VF3A 3F4RA 4L0UA 3HDCA 5J9BA 1YY7A 2XPDA 4K7IA 4AF2A 4JRRA 3G7YA 1GLQA 1DE1A 6GSYA 2L59A 4OMVA 1QFNA 5KEJA 2XC2A 1B4QA 3GTUA 2K18A 1XOBA 2C0DA 3RHCA 10GSA 3NOFA 4WF4A 2WCIA 3L4NA 3TB2A 5DAKA 3G9BA 4OFNA 4NV5A 4KAEA 1GSFA 2GT6A 1RK4A 5ECPB 1HQOA 3SBCA 2UZ8A 5DJLA 1R5AA 2HSMB 2BMXA 1FO5A 4X1UA 4IELA 5FHIA 1WE0A 4YAPA 2DJ0A 1X9WB 4MF5A 5ID2B 2FA4A 4GLTA 3VPTA 5G31A 3DGQA 2YCDA 5BMUA 1KNGA 3C73A 4DEJA 2IPAA 5F05A 5IPGA 4MF6A 3LWAA 3TJBA 5ECHB 5ECQB 3VWVA 2ZCTA 2V41A 5D93A 2X64A 3ZMKA 2B5EA 1G7OA 3VLNA 1PL1A 1ZYEA 4JBBA 2BTOT 3ZYWA 1S3DA 4I2TA 1SYRA 1ERUA 4ZL9A 3RPPA 1FB6A 2JSYA 3R2QA 2YJ7A 4NV2A 1OE8A 2F8FA 1OE7A 5D9WA 2IFQA 1NHOA 3F6FA 2VLTA 3QAWA 2LUSA 3J7Yk 1FG4A 4XS4B 1XOAA 2I81A 1X5EA 3S9FA 1EP8A 2O85A 5FT3A 2B1LA 4F03A 4YQMA 4TOPA 3UARA 5IMVA 3TKPA 4IVFA 2PUKC 4MF7A 1BX9A 4MABA 4IKHA 4JEDA 2H30A 3TKSE 1SL1B 4K7OA 4E8HA 4YH2A 1ST9A 2C3TA 3FEUA 1SJZA 1XPVA 1PRXA 2M80A 2VL3A 2R37A 5G2ZA 2VCVA 2CT6A 1TDIA 4ZB9A 3F4TA 5DQSA 4RI6A 4HQSA 4PUFC 4WKWA 2WJUA 3TKQA 3DVXA 4OO4A 5DJMA 2HRKA 1G6WA 1IYHA 2WZ9A 2WDUA 1QQ2A 1W4VA 1OC9B 3GRXA 2VD1A 4KUNA 1QXHA 1S3AA 5IMDA 1G6YA 2H70A 2M46A 3TRXA 5G5EA 3MWHA 2VCWA 1WMJA 2VAFA 1JLWA 2F8AA 5E4WA 1YQ1A 1EWXA 2VIMA 2O89A 2CX3A 3IAM2 3IAS2 2R5GA 1XVWA 5KN1A 2GTUA 1WPIA 4MK3A 2GT5A 4GQFA 1U88A 3UIWA 3K8NA 5GAND 2FCHA 5B6NA 2C0GA 2F51A 1GSDA 4HI7A 5D96A 1A0FA 3DMLA 4TXOB 4V2LA 4Q5QA 3V1WA 2VM2A 2LQOA 4PQ1A 3D21A 3VURA 2O8VB 1TI1A 3CMIA 2LNTA 2HE3A 3A2XA 2H1GA 4ZBDA 1A0RP 4TR1B 2JZSA 1TJDA 4K2DA 2YP6A 2FA8A 2H0HA 2R2JA 2R4VA 1OC8A 4I2UA 5CAXA 5HFGA 2OE1A 2C3NA 1Z3EA 3PPUA 2YPMA 1GSQA 3C7MA 3ZMLA 2TRXA 3HCZA 4CW9A 2FY6A 4KGIA 4KX4A 3GH9A 5DDLA 3GA4A 5CYYA 1THOA 1K0OA 4CHSA 4POKA 2AB6A 2HYXA 3QMXA 3A5WA 2ZNMA 2LV3A 3EMXA 4NPBA 3H4KA 1GTIA 3GKMA 1T7PB 4PX1A 1EGOA 3IV4A 3WT1A 2X8GA 4IW9A 2EIRA 1X9MB 2M72A 2XHFA 3GTUB 4ZILA 4L5OA 1JZOA 4MLYA 3RPNA 2HFDA 1FVKA 5DCGA 3FR6A 3HXSA 3D22A 3KMNA 2VCQA 3ZIJA 5DAKB 1I5GA 3HVSA 3QFAC 4XHMA 5J4UA 1WOUA 4OFMA 2FD3A 1TK0B 2LQQA 4AJ7A 5INYA 2CX4A 3M3MA 1DUGA 5HQPA 5ECKB 1Y6EA 3LQ7A 1YZXA 3UAPA 5DQYA 4NHZA 3GL3A 1H75A 1UVZA 3TGZA 3KZQA 1J0FA 1BYEA 4G0LA 1X5DA 1BQ7A 2PVOC 2LRNA 4ZB8A 2VL9A 4FYBA 18GSA 2LRCA 3CBUA 2HT9A 5CRHA 2H8LA 2MBSA 5ECNB 3L78A 5A4VA 5IPHA 2MYGA 1SL0B 4ISDA 3HA9A 4EDYA 1A24A 3P7XA 5COHA 2VUPA 2YOIA 4WBRD 3WYWA 4HS1A 2IFQB 1TRUA 3O3TA 1GTUA 1TP9A 3D4TA 5AN1A 4X43A 3VK9A 1M2BA 4O5RA 5ELGA 2HXKA 3DD3A 2RUEA 3VWUA 1SKRB 1YKAA 4ECBA 4ZB6A 1ML6A 5CP1A 4NMUA 1JLVA 4ID0A 4AJ6A 5IIZA 4TVEA 2MMAA 2CAIA 1M7TA 4G0KA 2H74A 4ML6A 5GZZB 2H75A 4FH8A 3APQA 1YJ6A 4K9ZA 3ZVJA 5J9CA 5G30A 4KF9A 1ERTA 2MMOA 5IMAA 1F2EA 1ERWA 1THXA 2QKEA 3DXBA 3C1RA 1PKZA 1KBNA 4OD7A 3UBKA 2DJ1A 3QPMA 3O6TA 1ILOA 4MZWA 2GZYA 2H73A 3A2WA 2GQLA 1SD8A 4BVXA 4G0IA 3TCOA 2HLSA 2I3YA 2OBKA 2XPEA 1XXUA 3TOTA 5IMCA 3L9SA 2YV7A 1G7EA 2H1BA 3IHQA 3H1NA 2JSZA 3WGXA 3IK9A 3D0ZA 3BD2A 2YV9A 3RDWA 4G19A 1XCCA 2HI7A 5IO2A 4NXIA 2HRAA 1KEBA 5IO0A 4JE1A 2B1KA 4Q5RA 2DMLA 4K6XA 3D6IA 3CXGA 1S3CA 1U3IA 4PGTA 2YJHA 4N10A 2JZRA 4FYCA 4MJAA 3U5RE 1HD2A 1JFUA 2A2RA 1ACVA 1N8JA 3I69A 22GSA 4JR6A 1R5PA 5D9XA 3DKSA 4MJBA 4F9ZA 5GSTA 2DJ3A 2N5BA 1BG5A 1RQMA 1X5CA 2YNXA 5ECOB 5DVBA 2H19A 2EIQA 4WBJA 4K0GA 4DSQA 3UMAA 4MMMA 1H4OA 2ON7A 2E2GA 2KHPA 4J57E 4XS1A 2ZUPA 1J9BA 5HR1A 3GKNA 4ZBBA 4GSTA 4IP1A 3F0IA 2AUVA 4HDEA 2CVDA 1XBSA 2DIZA 3GKKA 2B5XA 3KJYA 5CNWA 3CSIA 4MH3A 3Q74A 3FK8A 1G0TA 1ZZYA 1KTEA 1B4PA 3QAGA 3I9V2 4HJMA 3ZVJD 3ZLPA 1GTAA 1TRSA 5ECIB 2H6ZA 2CZ2A 3QAVA 2OE0A 4N0VA 3D4MA 2TIRA 1PQNA 3L9VA 1U6TA 3RBTA 1VRSD 5H5SA 5B7CA 3PINA 3EYTA 2H01A 4DSSA 4XCSA 1V9WA 3PGTA 4OO5A 2L6CA 4LL1B 1T00A 2LEGA 2MBTA 1ZYQB 3J7Yb 4KCAA 3FZ5A 4ZIJA 4F2IA 2OKAA 3QR6A 1PL2A 4EF0A 4XRDA 2YWOA 2FNOA 4MJCA 3EU3A 1WRYA 3F63A 3NIVA 4IBPA 3BCIA 3GN3A 3HZ8A 1TKDB 4I8BA 3FY7A 1EOGA 1K0CA 1R4WA 4OFTA 4QL7A 4BWQA 1J08A 2JU5A 4RUVA 2I4AA 4RQRA 3P8WA 1ABAA 2VL2A 4BWSA 2GVPA 4ACSA 3GX8A 3FHKA 3BBYA 1MDJA 2ALBA 2GSRA 1XW6A 4TR0A 3TKRA 3GSTA 2DBCA 1MEKA 4IJIA 2YZUA 4Q5FA 1R26A 3RHBA 2AJQB 1RW1A 3LEFA 4IQAA 1OVNA 5FWGA 2C3QA 3WGEA 3TRQA 3U6VA 2D2ZA 1F3BA 3CSJA 1SK1A 3W6GA 2LJRA 2VCTA 3GNJA 3HHVA 1GTBA 1X9SB 3QOUA 5J3RA 3GX0A 2GQKA 1GSYA 4Q5NA 2K6VA 4TXVA 3TJFA 4FQUA 3Q18A 3CRUA 1PA3A 5DCHA 1A2MA 2PU9C 1MTCA 4I6XA 1V58A 3Q6OA 4BPYA 4YAVA 3JCML 1EZKA 1O81A 1AQWA 3IOSA 1PN9A 2PGTA 3GKXA 4BVXB 5F06A 5ABRA 2AHEA 3ZREA 3H93A 3DYRA 6GSVA 3KH7A 4NAXA 2QGVA 4K8MA 3APOA 4PXOA 2C4JA 4WF5A 4IHUA 2HZFA 5D9TA 5CO3A 1JZDA 4ULXA 1ZOFA 1UA5A 5ENUA 5KN0A 3C71A 2RUFA 1HNCA 1JZRA 3SWLA 3OR5A 2E7PA 3EINA 3ERFA 2GZPA 4V1Ag 3LXTA 2DJ2A 2REMA 2JL4A 3F3RA 2HRFA 4AJ8A 4J2FA 1QUWA 2IJYA 1F3AA 19GSA 3CTFA 4GQCA 2GZZA 2VL2C 5G5FA 1B48A 4I97A 3PR8A 1PD21 3MDKA 3H8QA 3BOAA 1OAZA 3E0UA 5EPFA 3FKFA 1WWJA 2F3MA 3Q19A 2A4VA 3EU4A 3MSZA 5JCUA 4QQ7A 3FW2A 1NHYA 2C80A 2PN8A 2G0FA 3M0FA 5CRGA 2PPTA 3ZITA 1MD3A 4GTUA 3ME8A 2GLRA 5LD0A 5AISA 3NZNA 1USBA 1HNAA 4POBA 1VF1A 4POMA 4XIHA 4ML1A 2LJKA 4HU9A 5AIXA 3DWVA 3UJ1A 2H6XA 1M9AA 2IWTA 2GSTA 1Z7PA 4ILFA 2OE3A 4PNFA 3TDGA 1K3YA 4DSSB 5IOWA 1TRVA 1TK5B 3M9JA 1SENA 4PUAA 1FHEA 1EV4A 2VO4A 1K0AA 2GGTA 1Q4JA 2J23A 5LCZA 1SYXA 2C8UA 1YDKA 4KH7A 5GSSA 2C1YA 8GSSA 2K9FA 4MPFA 3FZAA 20GSA 4FYUA 2KLXA 1GRXA 5CRDA 1FW1A 2DMMA 4XRAA 5C04A 3HY2A 5B8AA 4G9HA 4EUYA 1GL8A 4V2MA 2L4QA 1K0DA 1GWCA 2YWMA 2CVKA 1XW5A 5F07A 2IMFA 4LL4B 2P0GA 1SJ6A 4WETA 2IIYA 9GSSA 3KTBA 4KNDA 3G7IA 1DSBA 2V6OA 2B3SA 2V2GA 2WS2A 1TK8B 1F9MA 2FWEA 5H5RA 3UOMA 1PX7A 3BCKA 1XWCA 2MZCA 2VLUA 3US3A 4E8EA 2FGXA 2R6KA 4WXTA 3L9UA 3VI5A 1K3OA 1T3BA 2PMTA 4BVYA 4O92A 2HSHA 3ZIVA 4GSSA 2AAWA 2LS5A 3FR3A 5IMFA 1O8XA 2QSIA 4MZCA 3MAKA 6GSUA 2HRKB 5IOXA 3HD5A 1QK8A 2FUG2 5CREA 5H5QA 2X99A 2PWJA 1EV9A 4NWYA 4MZBA 2H76A 1I9DA 3ED3A 3IC4A 1U3AA 3GSSA 16GSA 1E2YA 1QGVA 4GF0A 2IMKA 2CAQA 4PURA 3IE3A 3HZ4A 3HYPA 1IYIA 1TI3A 2JACA 4JZQA 3W8JA 1NW2A 3KTLA 2LRTA 1PSQA 5IMZA 2OADA 3CRTA 3FRCA 1BEDA 2LTKA 3F8UA 1BJXA 1PMTA 2CA8A 3GL5A 5F0GA 1A23A 4EVMA 1GUKA 1GNWA 4EC0A 3TRPA 1B9YC 4J56E 3IXRA 3LG6A 12GSA 1EGRA 2A2SA 1F37A 2CQ9A 2O87A 2WULA 4FO5A 2WGRA 5D8IA 1ERVA 5ECSA 1WP0A 3A2VA 4ECJA 1A8YA 2LJAA 1Z7RA 2L6DA 4JR4A 3KD0A 2FHEA 3ZTLA 1A2LA 3N5OA 1GSEA 4H86A 4IS0A 2BJXA 3HJOA 2IMDA 4ZL7A 2FLSA 3KP9A 3DRNA 3IBHA 14GSA 5JWRB 3GMFA 1T4YA 3E9JB 4MH2A 4DVCA 1AQVA 5HR2A 2VM1A 4MJEA 3TJGA 4KSOA 1GSUA 4F0CA 4TRXA 4OWYA 4KE3A 5EVOA 3ME7A 4HZ2A 3TKSC 1T4ZA 1V57A 1U87A 5EL8A 1SKWB 3EWLA 1UN2A 3VPQA 4ECIA 2NBSA 5B6MA 3HJMA 2PERA 1FB0A 2DLXA 3EURA 3ISOA 1TU8A 4V2NA 2HZEA 1X0RA 1MDIA 3ZFLA 3D5JA 1AAZA 4FIWA 3TOUA 4KDXA 2FWGA 3ZZXA 2EIOA 6GSSA 3WT2A 1XVQA 4I5QA 4PNGA 2HSYA 2YWIA 5DBQA 2V1MA 1SJIA 2LNSA 2B7JA 3EVIA 4IJ3A 1SKSB 3QD9A 2HNLA 2RLIA 1AQXA 2JADA 3TUEA 1QMVA 1OYJA 3GHAA 3IPZA 4MCUA 5ELAA 1N2AA 1K0MA 2X8HA 2O7KA 1M9BA 3KM6A 3EE2A 4L5LA 13GSA 1EOHA 1V40A 5LNKe 1DBYA 4LA1A 2CZ3A 1GP1A 2NTOA 3KXOA 3W8SA 3WD6A 4P3YB 1YF0A 3ZRDA 3HKRA 1TXXA 3A3TA 2YWNA 2XBQA 4NHWA 3UBLA 4EO3A 1MD4A 2B5YA 1Q98A 2IMIA 1MDKA 3MNGA 4X0XA 2V6KA 2P31A 2WB9A 1Z6NA 1VGLA 3GYKA 4GRFA 4IQ1A 3GFKA 4TKYA 4ZBAA 3KIJA 2NPBA 4KSMA 3IK7A 5J5NA 2H1AA 2L5OA 1F6MC 2GQMA 2ES7A 3GV1A 3LORA 2WFCA 4GCIA 3EMPA 4D73A 4PQHA 3E3EA 1EP7A 4KDYA 3PH9A 1TU7A 3C1SA 4MPGA 5HR0A 5HFKA 1FVJA 5J41A 5KN2A 1EEMA 4V1Ap 1B8XA 5JWQB 1WJKA 3VFIA 4F82A 2V32A 2VD0A 2H71A 2YN1A 3IDVA 4HQZA 1HYUA 3LJRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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