5DALA

Crystal structure of human glutathione transferase pi complexed with a metalloid in the presence of glutathione
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
210
structure length
209
Chain Sequence
MPPYTVVYFPVRGRAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIYTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Visualisation of Organoarsenic Human Glutathione Transferase P1-1 Complexes: Metabolism of Arsenic-based Therapeutics
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase P
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 209
sequence length 210
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2015-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5dalA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5dalA01
2O87A 4WBRD 2XPDA 3TCOA 1GTUA 2YWMA 2MMZA 3BCIA 2RLIA 2C0EA 3HJPA 5CAXA 3GKMA 1GUKA 1WWJA 5IM9A 2VCTA 3A2XA 1U6TA 1YEXA 3TJGA 1OYJA 2H6XA 2HQTA 4KDXA 3GX0A 1AXDA 4POMA 3TRQA 4HI7A 5IO2A 2K8VA 2XHFA 2JSYA 1J9BA 1O7UA 4ML1A 3RBTA 1DSBA 4EKZA 2XBIA 3HY2A 4PX1A 4EDYA 1PL1A 1ZCPA 2VCQA 3D6IA 1YY7A 3ZFLA 1ZL9A 2JZRA 1KNGA 2NTOA 2MBTA 3BCKA 2R3XA 5AN1A 4EUYA 4MH3A 1K0BA 2LNSA 2YWIA 3M9JA 1TRUA 2B5YA 3CYNA 5H5RA 5HR3A 5GAND 3CRUA 3L0HA 7GSSA 1XBSA 2K9FA 2YNXA 2MMNA 4EDZA 2NBSA 3CTGA 1A2MA 2H01A 5ID2B 1NHOA 4EO3A 1TDIA 2OA7A 2YN1A 5ID2A 2CVBA 2BTOT 3TKSC 2L59A 3HJOA 4E8HA 3TUEA 4KX4A 2CVKA 1EP8A 3G9BA 4DSQA 5EY6A 3VURA 17GSA 2B7JA 3RHCA 1R26A 5JCWA 1THOA 2H70A 4G0KA 1LU4A 2GTUA 1ABAA 2YWOA 3CTFA 3PINA 1JZDA 5D9XA 4WKWA 2HZFA 3I69A 4NV2A 4O92A 2C3NA 1MDKA 1TOFA 1T4ZA 5GSTA 1MDIA 1YF0A 11GSA 5IMFA 3ERGA 1RW1A 2LJKA 1TK0B 3JCML 1SD8A 3L78A 3H8QA 1K0NA 2HI7A 4AF2A 1Q4JA 5IMVA 2O85A 3OR5A 4NHZA 4G0LA 5D73A 5ENUA 3FZ9A 4IP1A 4HOJA 2LTKA 1A24A 2WB9A 4KF9A 1B9YC 1XWBA 2GS3A 2E2MA 3TKPA 3WGDA 4D73B 4BWSA 4K8MA 4TOPA 3TKQA 3FZAA 3IAS2 3LEFA 1T00A 2MMOA 1GUHA 5CRHA 2CVDA 3ZREA 4PURA 3LORA 3O3TA 3KP8A 3QR6A 3ZVJD 4MA9A 2FNOA 3GKXA 3DIEA 1F37A 2VLTA 3MSZA 5FWGA 2O89A 1GUMA 4F2IA 3TOUA 2H73A 3C7MA 3M0FA 3DKSA 4JBBA 1Q98A 2OACA 1S3DA 3KTBA 3QFBC 2L6CA 1O6JA 4ZL9A 2WRTA 5H5SA 4L8EA 3HVSA 1MDJA 2A2RA 3LJRA 3TJFA 2CA8A 3J7Yb 2PVQA 3IHQA 2VIMA 3ZZXA 4OD7A 2HYXA 3F4SA 1GNEA 4PXOA 1PKZA 3IBHA 3ZMLA 1CQGA 1BX9A 1H4OA 3VWXA 2YZUA 5CRWA 1EV9A 3APOA 6GSYA 2C0GA 2GQMA 2GDRA 4ISDA 4FYUA 3DVWA 2R6KA 4GSNA 4MZCA 4PQ1A 4TRXA 1SJIA 2X8HA 2HSMB 1XVQA 4HQSA 3VK9A 4XCSA 2HRNA 4FQUA 3DMLA 2ES7A 5G1LA 4KUNA 5G1KA 4NMUA 1ZZYA 4USSA 4WR4A 4MJBA 3GV1A 4RQRA 3US3A 3ED3A 1W89A 4P3YB 2CAQA 5DALB 5A4WA 1TRWA 2WDUA 2L5OA 2GVPA 2TRXA 2PU9C 1ERTA 4JR4A 4PTSA 2N5BA 2X8GA 1U3IA 3IXRA 18GSA 2ON5A 3L9SA 1B4PA 2OADA 3BOAA 4I6XA 1WPIA 1XWGA 1V2AA 2FA4A 5CYYA 2LRCA 2VLUA 2HRKB 1SJ6A 3D4TA 2CX3A 3VPTA 3VWWA 2HRKA 3IAM2 3IC8A 3SBCA 2HRFA 5FT3A 1PSQA 1K3OA 3C8EA 4XS4B 3FW2A 4JE1A 1UA5A 1OC8A 2IFQB 3IPZA 1PMTA 3C71A 2IFQA 5G5EA 4RI6A 2AHEA 2PPTA 2GLRA 1ZMAA 2HLSA 1WRYA 2YJHA 1GSQA 4ID0A 2H0HA 3FRCA 4IHUA 4YAPA 5B8AA 4RUVA 4IQ1A 3HYPA 2DIYA 3MAKA 4J2FA 4PNGA 2PVOC 4V2NA 4G2EA 4X0XA 3P7XA 2C0DA 1WJKA 1XPVA 1HNAA 3HVXA 1J0FA 1PGTA 2K8SA 5KEJA 1JFUA 2VD1A 4IJ3A 2OE1A 1X9SB 2HSNB 3GUSA 5DAKB 1TK8B 1EV4A 2X99A 5DAKA 3DD3A 4GF0A 1LJRA 2GSRA 2LQOA 4K2DA 2H1BA 3ERWA 4GRFA 1AQWA 2V41A 4F82A 4EVMA 3TRPA 2C8UA 2QC7A 3ERFA 1O8WA 1QQ2A 5E4WA 1QFNA 1RQMA 4IN0A 4TW5A 3FR9A 3APSA 1EEJA 4FYCA 2IN3A 1Z6MA 2AYTA 1K0CA 1Z9HA 1ZYQB 2BJXA 2KHPA 2WJUA 3D4MA 4I97A 4XRDA 4PNFA 1BQ7A 22GSA 5CRDA 1QK8A 1HNCA 2RIIA 1GTBA 3O6TA 4LMVA 4J56E 2H0GA 4ZXGA 5IOXA 3ME8A 4EL1A 2R37A 2FD3A 1K3YA 6GSWA 5HR0A 1X9WB 5D93A 2KOKA 5A4UA 1B48A 3VFIA 6GSVA 3GN3A 2JZSA 1MEKA 1N2AA 2NPBA 4YH2A 3DYRA 4L0UA 2I81A 2MZCA 4MMMA 4ZB8A 1V9WA 1G6YA 1J08A 1O8XA 4ZL8A 1TK5B 2VM1A 4XIHA 2V6OA 2AB6A 4O5RA 3HVVA 5IPHA 2H71A 1F3AA 1EGRA 4F9ZA 1ERUA 3WD6A 1XIYA 5IIZA 3FK8A 3UJ1A 4V1Ag 3KMOA 1F3BA 4OCEA 4TXOB 2E7PA 2GGTA 3F9UA 4TXOA 1XCCA 4G10A 1FG4A 4MK3A 1IYHA 1AQVA 1M9AA 2BMXA 5JCGA 3CMIA 2HE3A 1Y6EA 2JACA 1T8EB 4MJAA 4ZBBA 1YF1A 3I43A 4IELA 4KW6A 1GSUA 3DWVA 2LJRA 3GURA 2FUG2 5F05A 2M80A 4K7IA 1R4WA 2J9HA 2JSZA 1K0MA 3QPMA 2FY6A 2WULA 1GLPA 2LEGA 1ZYEA 1X0RA 2EIRA 2VL2A 3F0IA 1NSWA 1Z6NA 4G19A 1S3CA 3EWLA 2A4VA 3C1RA 4X43A 6GSTA 2X64A 2I9HA 2B1LA 3FEUA 1R5AA 3EU3A 5ECQB 3KZQA 4WEYA 3UEMA 1BEDA 1RK4A 2IWTA 4ECIA 3GKNA 1X5CA 1U87A 4MCUA 2HT9A 2H74A 3CBUA 4HUAA 3GX8A 3IV4A 5A4VA 1XFLA 1R7HA 4POKA 3KMNA 2DIZA 1GSDA 1EOGA 5IPGA 1TRSA 5INYA 3J7Yk 1VGLA 4DVCA 3FHKA 2KP1A 2XPEA 1JZWA 1A8YA 5B6MA 1NW2A 2E2GA 4N10A 3NOFA 5D9VA 1E6BA 1TI3A 2G2QA 2DJ3A 4ML6A 4O7HA 1YKAA 3EC3A 3GKKA 2B5XA 3HDCA 4Q5RA 16GSA 1HNBA 2I4AA 3IR4A 1PRXA 1TXXA 3EURA 1GLQA 1ILOA 5KN3A 1FB6A 3H1NA 1GNWA 2CZ2A 3LQ7A 5CP1A 2IMIA 4LLRA 4Z7XA 2YV9A 3A5WA 3W8SA 4QL9A 1OKTA 2GT6A 4K9ZA 2LQQA 5GSSA 3MWHA 2R4VA 4MPFA 4Q5QA 1U3AA 3UMAA 3UAPA 3UVHA 3ZYWA 2N5FA 2VLVA 2GSSA 4TR3A 3F4RA 4PUAA 2FLSA 1BYEA 4K6XA 2VCWA 2REMA 1X9MB 2GZPA 4AJ7A 4XRAA 5IQYA 4JRRA 2YP6A 1PL2A 2VCVA 1PKWA 1ERWA 1F2EA 4EE0A 1GSYA 4IQAA 4IKHA 4EF0A 2IMEA 2YPMA 2WS2A 2G0FA 4F03A 2RM6A 3S9FA 4L5OA 4MABA 3KD0A 4MJEA 2P0GA 5G31A 1JZOA 2DBCA 1M2DA 3GH9A 2H0IA 2OBKA 2PMTA 1B4QA 5B7CA 5DJMA 2DLXA 2TRCP 1AC1A 1JLWA 5G5FA 2H6ZA 2LV3A 4DSRA 5ECSA 2VUPA 2H19A 5B6NA 3IK9A 4LA1A 2GZZA 2JADA 3IC4A 3A2VA 1H75A 2CX4A 2OE3A 1G6WA 2H66A 3TKSE 3UIWA 5ECLB 2DC5A 3APQA 2DMMA 4KDUA 2H1AA 3UBKA 3CSIA 4CW9A 4OO5A 5AIXA 3HD5A 4NHWA 2LUSA 3IOSA 4OMVA 1T7PB 3HZ4A 2VL3A 1DE2A 4WBJA 4TXVA 2HSYA 1XWAA 4JZQA 3M8NA 2YZHA 4DSSA 3Q19A 4F0BA 3WYWA 4KGIA 3BJ5A 5LD0A 3LFLA 2L6DA 3ME7A 2LSTA 1FVJA 1VRSD 4NV5A 1M0UA 3H79A 1SKSB 2WGRA 4MDCA 2XBQA 2WCIA 4HS1A 1SL1B 2QKEA 1PA3A 1TI1A 3GA4A 4IGJA 4BVYA 1KEBA 5C04A 5IMAA 2IL3A 3MDKA 1UN2A 2WZ9A 5D9WA 3BBYA 5ECPB 2VM2A 5DDLA 5AIVA 5KN0A 4Q5NA 4I5QA 2V32A 1HD2A 3L4NA 4KA0A 3DRNA 2FWHA 3LSZA 2I1UA 3N9JA 2FWEA 1TU8A 3SWLA 3ZRDA 1K0OA 1EOHA 1O81A 1EEMA 4HEA2 2RM5A 2V2GA 1FB0A 4KSOA 3F6FA 1F9MA 2L5LA 3ZIJA 3F8UA 2R5GA 1KBNA 3UL3A 2RUEA 3KIJA 1NHYA 3HXSA 3KH9A 3GHAA 1V57A 1U88A 5D9TA 1YKCA 1AAZA 3QFAC 2VL9A 4WETA 2IMFA 4PGTA 1USBA 2R2JA 4GSSA 4ECCA 2J23A 1T1VA 3CSHA 1GULA 4OFNA 5JWQB 1DE1A 3H4KA 3KCMA 1XWCA 2HZEA 3UARA 1XZOA 3W6GA 1EZKA 1ACVA 3EINA 4MP4A 3RPPA 5L71A 4KCEA 2AAWA 1XOAA 2DJKA 2FCHA 1C72A 3G7IA 5EL8A 2OE0A 3EYTA 2GSTA 20GSA 1Z7PA 3UVTA 3P8WA 2YCDA 2LNTA 3ZL5A 2F9SA 2OJLA 1XXUA 1NM3A 2ON7A 12GSA 4L0WA 3P2AA 5HQPA 4LMWA 1V40A 3RPNA 1TTZA 5F8BA 3FY7A 4TVEA 2PGTA 2DJ1A 3TKRA 4YQMA 4X1UA 3GFKA 1FW1A 5BMUA 3ZTLA 3LYPA 1A2JA 5EVOA 1S3AA 4FO5A 4OCFA 3GSSA 3F3QA 2YANA 3KEBA 3L9VA 2TIRA 1M99A 1HYUA 2HSHA 4MPGA 1GSFA 2YJ7A 1UVZA 1IYIA 4ECJA 4IW9A 2FWGA 5ECMB 1SYXA 2GQLA 2F8FA 5DJLA 3KXOA 4BL7A 1SL2B 3M1GA 3U6VA 2ALBA 1DUGA 2GZYA 3LYKA 2KUCA 3U5RE 1Y25A 1GL8A 4LL1B 1YZXA 4AGSA 1FOVA 4KCAA 2EIOA 4IP6A 3LG6A 2IIYA 2M72A 1O85A 3RDWA 4E8EA 4JU5A 1PQNA 2HXKA 3C1SA 3NIVA 1WOUA 1TRVA 1M9BA 4NXIA 3C73A 5H5QA 13GSA 4AJ8A 3IDVA 2LJAA 2VO4A 4HQZA 2YOIA 1XWKA 4N30A 5C00A 1GRXA 1VF3A 3R2QA 1K3LA 4MF6A 3HA9A 3D22A 3O76A 2K18A 5J41A 5B8BA 4L5LA 5IMDA 2L4CA 2C1YA 4I2TA 3ZITA 2UZ8A 3TJKA 2AV4A 3AY8A 3BD2A 1W4VA 1DBYA 4G9HA 6GSXA 1KTEA 5HFKA 1VF4A 4POLA 1EWXA 2QGVA 1I9DA 2N5AA 3IE3A 1OC9B 4I8BA 1OC9A 4FYBA 3GSTA 2MBSA 4GWRA 4Q5FA 5IMCA 5COHA 2FA8A 1WIKA 5DCHA 1SENA 2CZ3A 1G0TA 1E2YA 5CO3A 1Z5YE 5DVBA 1X5EA 4ECBA 4PQIA 1JZRA 3D0ZA 1Z7RA 2P5QA 2O7KA 3GL3A 1A0FA 4BVXB 3W8JA 1ML6A 2IJYA 3TGZA 4LL4B 4YAVA 4BVXA 5CREA 1YJ6A 1THXA 3L9UA 4ZBAA 4MZWA 2FGXA 1X5DA 2B6MA 5HR2A 2IPAA 4NAXA 2CT6A 4TKYA 3TJJA 4GQFA 3UOMA 5ECOB 3HZ8A 4TR1B 1R5PA 4MZBA 4TR1A 4BWQA 2L4QA 2F8AA 2JL4A 1M7TA 2H30A 5J3RA 5ECRB 3HHVA 3WGXA 2H1DA 1FVKA 1XVWA 3HJMA 2VD0A 4EC0A 4PQHA 1GTIA 3PPUA 1M2BA 4AJ6A 4GTUA 1GP1A 2OBIA 5AISA 1AQXA 5A5KA 1M2AA 5ECIB 1SK0A 3TJBA 2C4JA 3D5JA 4I2UA 5F06A 3GL5A 3QAWA 1LBKA 5KN2A 1B9XC 1TP9A 3GNJA 2HNLA 1OC3A 1ST9A 4IVFA 1FO5A 1CQHA 5ECKB 4F0CA 5ELAA 1BAYA 2HFDA 2YV7A 2H6YA 3TOTA 1F6MC 2KLXA 1FAAA 1ZOFA 1QGVA 5G30A 3VI5A 2VOCA 3DVXA 2E0QA 3IA1A 4HJMA 5J9CA 5IO0A 3PR8A 4N0VA 19GSA 1OKDA 4CHSA 3ZMKA 3KJYA 4IJIA 4G0IA 4KSMA 5DCGA 3QCPA 1JLVA 4IS0A 3TKSA 5JCUA 3LXTA 4WF5A 3N5OA 3GTUB 4RI7A 4YQUA 1AIUA 3GTUA 1WP0A 4GLTA 4ZBDA 4KDYA 1OE8A 4K0GA 2PN8A 2C80A 4N0ZA 4ZILA 4D73A 4MH2A 4IBPA 4JEDA 3MNGA 4KE3A 2ZCTA 2FHEA 4WR5A 1O73A 3Q6OA 3FYGA 2P31A 4XS6A 3KGKA 1GWCA 1PX7A 3ZVJA 5E59A 3IK7A 4O32A 5IMZA 2CQ9A 2B7KA 1QMVA 4DEJA 2H1GA 3TDGA 1HQOA 4HU7A 1VF1A 4N11A 1XW9A 2B3SA 5AGYA 3LWAA 1GH2A 4EXJA 3FZ4A 4HZ4A 2M46A 2H75A 3GRXA 3QAVA 2ZUPA 1A0RP 2JZTA 4K7OA 2Z9SA 4V1Ap 2CV4A 3PGTA 1I5GA 1WE0A 14GSA 3H93A 2EC4A 3QMXA 4GQCA 3E3EA 3CRTA 3RHBA 3VPQA 2H8LA 5DQSA 3WT1A 1BG5A 1YDKA 1V58A 3I9V2 1B8XA 2L57A 2C0FA 4DSSB 2I3YA 5DBQA 3EMPA 4K0NA 3GYKA 2LS5A 4POBA 4WF4A 3F63A 2V1MA 1MTCA 2MYGA 2D2ZA 4XTSA 3Q18A 1T4YA 2DJ0A 2QSIA 2LRTA 4XHMA 2GQKA 3DEXA 5HFGA 4TR4A 4XS1A 3UBLA 4GSTA 3M3MA 4HJ2A 1T3BA 3P90A 3FR3A 9GSSA 1SU9A 2HSMA 3VLNA 1EP7A 1ERVA 3A3TA 3HCZA 4GXZA 3ZLPA 4BVYB 1GTAA 2X8CA 2AJQB 3QDNA 5ECNB 5LNKe 4ZIJA 5G2ZA 2LKUA 3LGCA 5HFIA 5JWOB 4HDEA 3HKRA 3FKFA 3KP9A 5DALA 1SK2A 4FIWA 3ZIVA 3A2WA 4NWYA 5F0GA 3ISOA 5JWRB 8GSSA 2OKAA 2B5EA 4KB3A 1SKRB 5CNWA 3KH7A 2NVLA 3M9KA 3Q74A 3F4TA 3WGEA 4TR0A 1ZGNA 3TRXA 1OVNA 2PERA 2XC2A 2F51A 2NDOA 4HZ2A 5D96A 3PH9A 3EVIA 4OWYA 2DMLA 4XS4A 3IRAA 4MF7A 5HR1A 1UC7A 4ZB6A 6GSUA 2FWFA 4K7NA 2HZEB 3VWUA 2VAFA 1YEPA 2H72A 4FH8A 3GIXA 4JR6A 3QAGA 4OFMA 3RAZA 3WT2A 3NZNA 4ULXA 3VWVA 4RQXA 1XW6A 1TKDB 4NPBA 5GAPD 2IMKA 1XW5A 2H76A 1BJXA 2HRAA 2CAIA 3EE2A 1GSSA 1MD4A 1TJDA 3KM6A 2C3QA 3E9JB 3E0UA 5ECHB 5GZZB 5LCZA 5J5NA 2JU5A 1VF2A 1G7EA 1K0DA 1N8JA 5KN1A 4KNDA 5IOWA 4V2LA 1OE7A 1AW9A 4ZL7A 4MLYA 3DXBA 4PUFC 4TN8A 2GSQA 5D8IA 2VCZA 10GSA 3CXGA 1TU7A 3LXZA 4HU9A 5CRGA 2PWJA 1K0AA 3D21A 3TB2A 2VCXA 6GSSA 2F3MA 1OAZA 5FHIA 2V6KA 4KH7A 1SKWB 3I6AA 4BA7A 2B1KA 3F3RA 2P5RA 1FHEA 4BL7B 1GSEA 1AUCA 1EGOA 3R3EA 4V2MA 3EMXA 5EPFA 2AUVA 3FZ5A 1PX6A 4ZB9A 4ACSA 2EIQA 3K8NA 5J4UA 4GCIA 2K6VA 4CDOA 1YQ1A 3ZFBA 1XOBA 2LRNA 3VI7A 2DJ2A 2O8VB 5ABRA 3DGQA 2PBJA 1G7OA 1URMA 1A8LA 4QL7A 1TW9A 1QXHA 4MJCA 1JHBA 1V98A 4J57E 1MD3A 1SL0B 4MF5A 1SJZA 2IMDA 3CSJA 2C3TA 3G7JA 4KAEA 2GT5A 3GH6A 2DJJA 1Z3EA 1ON4A 1PD21 5ELGA 1SYRA 1QUWA 4ILFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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