3LFLA

Crystal structure of human glutathione transferase omega 1, delta 155
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
236
structure length
236
Chain Sequence
SARSLGKGSAPPGPVPEGSIRIYSMRFCPFAERTRLVLKAKGIRHEVININLKNKPEWFFKKNPFGLVPVLENSQGQLIYESAITCEYLDEAYPGKKLLPDDPYEKACQKMILELFSKVPSLVGSFIRSQNKEDYAGLKEEFRKEFTKLEVLTNKKTTFFGGNSISMIDYLIWPWFERLEAMKLNECVDHTPKLKLWMAAMKEDPTVSALLTSEKDWQGFLELYLQNSPEACDYGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Novel folding and stability defects cause a deficiency of human glutathione transferase omega 1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase omega-1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 236
sequence length 236
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.20.4.2: Methylarsonate reductase.
pdb deposition date 2010-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3lflA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lflA01
2B5YA 2NDOA 2OACA 2VL3A 1BEDA 1W89A 2P5RA 3CTFA 3IR4A 1EEMA 1X5CA 1OKDA 3QDNA 3IDVA 1B4QA 4AJ6A 3ZL5A 2H70A 2J9HA 5DCHA 2L57A 3N9JA 2LUSA 4KCEA 3FR9A 2CZ2A 5ELGA 1OVNA 3FZ5A 4OWYA 5G2ZA 1Y6EA 5HFKA 3O76A 3U5RE 1Z6NA 2L4QA 1GSQA 2GQKA 3KEBA 4ECJA 2X8HA 2M80A 3DRNA 1PX6A 4TN8A 4QL7A 4BPYA 3LG6A 1JHBA 4FO5A 1EV4A 2DMMA 3TRQA 4MLYA 5DBQA 5ECMB 2PN8A 16GSA 4LL1B 4JU5A 1R5PA 2GGTA 5CNWA 2QC7A 2P0GA 3LXZA 3J7Yk 2C0EA 2V32A 3KP9A 4CW9A 2FNOA 3BJ5A 3KMNA 4JRRA 3HJPA 4HOJA 4FIWA 1FOVA 19GSA 1GTAA 2FWFA 3QAWA 2DJ2A 2V6OA 3TDGA 3WT2A 2C3TA 5G5FA 1U6TA 3VURA 3DKSA 4Q5RA 5ABRA 1AQVA 1G7EA 2H6XA 3ZTLA 1NW2A 3HKRA 1JZOA 4HJMA 4NXIA 4HUAA 2R37A 3HA9A 3D4MA 2V1MA 2R4VA 3FR6A 2X64A 3RHCA 2M46A 1TRUA 5KEJA 2PU9C 3GHAA 4KSOA 2MBTA 4IKHA 2PWJA 3ZVJA 4EUYA 1TK8B 1T1VA 3IC4A 3TKSA 3GMFA 4MPGA 3HZ8A 1CQGA 4IHUA 4EO3A 3DEXA 2BTOT 1S3AA 5DCGA 2AJQB 4POMA 2N5FA 3HCZA 1YJ6A 2YANA 5ECOB 2EIQA 2DIZA 2HLSA 3UAPA 4V2LA 1K0DA 3ZIJA 4XRAA 5HR3A 3Q18A 4H86A 4JZQA 3GSSA 4XS6A 3E0UA 3FR3A 2HQTA 3HD5A 3NZNA 2YWIA 1SYRA 4GQFA 5AIVA 2FCHA 3F0IA 4PURA 3CTGA 1PKZA 2VUPA 2OE0A 1X9WB 3VLNA 2GZYA 4NV5A 4I8BA 2L6CA 2IMFA 1YF0A 1M2DA 1PKWA 2C4JA 1A0FA 5IPHA 2KUCA 3KH9A 4YQVA 2C8UA 5JCGA 2GLRA 3O6TA 2E2GA 1XW5A 3DGQA 2PBJA 4LL4B 4BL7B 1G6WA 2KP1A 1LBKA 2GVPA 3KH7A 1FO5A 2C0FA 2VLTA 3ERWA 1YKCA 4MJEA 2GSQA 2JSZA 4N11A 1OE8A 3UMAA 4G0KA 1THXA 1XVWA 2CVBA 3V1WA 3HXSA 3KCMA 1Z6MA 2B1LA 1OC9B 4OFMA 1SJZA 4TRXA 1OE7A 4MF5A 3FZAA 3F4TA 3DYRA 4EF0A 4NV2A 5G1LA 1K3YA 4K0NA 5D8IA 5D9WA 1PGTA 2VCZA 3TJFA 5FHIA 2RIIA 4RI7A 3EC3A 3C73A 3A3TA 3S9FA 5F06A 4HQSA 5ECQB 3MSZA 3D0ZA 5D9XA 1UVZA 2VL2A 1DBYA 4IS0A 4BL7A 2PERA 1BAYA 4XRDA 5JWQB 1UC7A 4ZB8A 1V2AA 4KGIA 5IPGA 4HU9A 4PQIA 4ZIJA 3IBHA 4V2NA 3UL3A 1OKTA 4KAEA 5D9TA 2IIYA 1U88A 1OC9A 3LFLA 4F0CA 2C0GA 4WETA 3A5WA 4ILFA 1S3CA 3P8WA 1IYIA 4KE3A 1BX9A 3HHVA 1A23A 1ZGNA 3TOUA 5B8BA 3BCIA 4LMWA 4JR6A 3MNGA 2R2JA 5DDLA 3DWVA 1T7PB 1EGRA 1E2YA 2A2RA 7GSSA 2O89A 5J9CA 3MWHA 1HQOA 1U87A 1QMVA 1SD8A 2K8VA 3GKMA 2ES7A 2PVQA 3GKKA 1TP9A 2CVKA 2J23A 2YCDA 4I6XA 2FHEA 2WS2A 1WIKA 3IOSA 3H93A 1EZKA 2MYGA 1JZRA 3CRTA 1FB6A 2GT5A 1M2AA 3ZVJD 1R4WA 4K8MA 4TR3A 2YV9A 1OAZA 5GSTA 4V1Ag 1DE1A 2H30A 2M72A 1HNBA 5CYYA 2MBSA 3G7IA 3ZFBA 3H1NA 5DAKB 3APOA 4MZWA 1BQ7A 3US3A 4XTSA 2OKAA 3SBCA 1K3LA 1U3AA 1IYHA 5H5RA 4HDEA 1QXHA 1W4VA 1K3OA 3ME8A 2LKUA 1VF3A 2DJ1A 1F3BA 4JE1A 3TB2A 1K0OA 1YQ1A 3F63A 1JLWA 2OE3A 2LS5A 3TOTA 3TJBA 4ZB9A 1A0RP 2V41A 3VPQA 4ML1A 2L5LA 2V6KA 4BA7A 1ML6A 3VFIA 2H01A 5ECIB 3D21A 3D5JA 5BMUA 1TKDB 1QFNA 2HE3A 2FWGA 3GKNA 2HRFA 1SKSB 3BBYA 2ALBA 3A2WA 1G7OA 2YNXA 13GSA 3WYWA 4Q5NA 1WPIA 1ZYEA 3L9SA 2H75A 4ECIA 5DQSA 3NOFA 1AQWA 1HD2A 3C1SA 4FYUA 1M99A 2L6DA 4NAXA 5DAKA 2KOKA 1NSWA 2H71A 9GSSA 1I9DA 1GSSA 1GL8A 4GRFA 4AJ7A 3GX0A 2I4AA 2H1BA 3H8QA 3GL3A 2LJKA 4OFTA 1F37A 3GYKA 3P7XA 3TGZA 3ISOA 3D6IA 2WB9A 1BYEA 2REMA 3EINA 4O7HA 1B9YC 1XW9A 3KD0A 5FT3A 2TIRA 4OO5A 2H0GA 3QOUA 4V2MA 1M0UA 1AQXA 1K0AA 1PQNA 1HNCA 1Z7PA 3CSJA 3TKSC 1WJKA 4OD7A 4HZ2A 3F6FA 2F3MA 1ZL9A 5C00A 1Z7RA 3JCML 4F9ZA 2QSIA 4IW9A 1EOHA 1V98A 2YP6A 1AUCA 2CZ3A 1TI3A 4ZBBA 4WBJA 2JL4A 1T00A 2D2ZA 4G9HA 2H1AA 3LGCA 3VWXA 4HQZA 1FAAA 4G0LA 1VF4A 1WWJA 2V2GA 3ZIVA 2B5EA 5FWGA 1NM3A 2GTUA 4K1FA 2I81A 4Q5QA 5LD0A 1FVJA 1HYUA 3IAM2 4G10A 3RAZA 3VI7A 2E0QA 4L5LA 4E8EA 2QKEA 2ZNMA 3LXTA 4F82A 3J7Yb 2O87A 3ME7A 5G30A 3LSZA 4ZL9A 4G2EA 4FH8A 5J41A 3H4KA 2ZUPA 3QPMA 1XOAA 3LYKA 3OR5A 1ERVA 1KEBA 2G0FA 1GP1A 1TW9A 4WF5A 4GXZA 4DVCA 2WFCA 3U6VA 2YV7A 2GT6A 2LJRA 2YWNA 4NPBA 1SK0A 4AF2A 5F07A 2CA8A 3F3QA 5ENUA 4ZBAA 1M2BA 2IMDA 2DJ0A 2JSYA 1MD3A 1I5GA 2E2MA 4MABA 4LLRA 4J2FA 4YQUA 1V40A 20GSA 3IV4A 1XCCA 2X8GA 3BCKA 4XS1A 4EVMA 3KJYA 3IPZA 4XCSA 3W8JA 3QD9A 1EGOA 4DSQA 1O8WA 2LRTA 3HZ4A 2FUG2 5CRWA 1HNAA 2VD0A 3GH9A 2VL2C 1TRSA 1GSFA 4XIHA 4Q5FA 1RQMA 3ZZXA 5ID2B 4MZBA 2GDRA 4HS1A 3L9UA 5A4VA 5ECKB 2TRXA 4ULXA 4KW6A 2YZHA 3GX8A 1R5AA 3NIVA 2B5XA 4FYCA 4TVEA 4OCFA 5IMAA 1B4PA 4AGSA 1B8XA 3IXRA 5HFIA 2K18A 4F2IA 1CQHA 3GN3A 4BVYB 3FK8A 2JU5A 5IO0A 5HQPA 8GSSA 3UJ1A 2WDUA 2HYXA 3DVWA 2H19A 5EL8A 1DE2A 2VL9A 3EVIA 2AB6A 3WD6A 5ECRB 4EXJA 3FKFA 2RM6A 4GSNA 1XIYA 5H5SA 2VCWA 4EC0A 5GAPD 2XHFA 2RUFA 4IP6A 3WGXA 2VCVA 3LQ7A 1X9SB 2L59A 3ZMKA 2LSTA 5ID2A 2GZZA 2A2SA 1Z9HA 2CX4A 3Q19A 1YKAA 2OADA 4EE0A 2H6YA 1EP8A 1FVKA 2P5QA 3L9VA 3M9KA 3G7JA 4TKYA 1JZWA 4GLTA 2H1DA 3DD3A 5HFGA 4BVYA 1YDKA 4K7IA 2H6ZA 2LQOA 4KDYA 4RQXA 1X9MB 4ECBA 2I1UA 4POLA 2HNLA 3HY2A 4NMUA 2OE1A 4DSRA 5ECHB 4HEA2 4N0ZA 4EKZA 4NHZA 3PR8A 2H0HA 4GSSA 2JACA 1FHEA 1AC1A 2LNTA 2RM5A 4MA9A 2PGTA 1T4YA 5IM9A 5J9BA 3GA4A 3IAS2 3TKSE 4WEYA 4MDCA 1GTBA 2XBIA 2DMLA 2R3XA 2B6MA 1TOFA 3GH6A 1PD21 1SJ6A 2HT9A 5A5KA 2YJHA 4ZL8A 1TTZA 1GRXA 1MD4A 2NBSA 2VD1A 2LQQA 4IN0A 1XZOA 3ZFLA 3GSTA 3L78A 3M8NA 4MK3A 2WGRA 3VWWA 1XWBA 4K6XA 1XWGA 2GS3A 5EVOA 4MMMA 5INYA 4ZXGA 2VCXA 4POBA 2HSYA 3D22A 4N30A 1YF1A 4OFNA 3L4NA 4QL9A 4LA1A 2PUKC 1TXXA 3QFAC 1O73A 3MAKA 3KTLA 2JZSA 6GSYA 4IBPA 5AGYA 5JWOB 2MMNA 3F4RA 1GSUA 4O32A 3RBTA 3VWVA 2X8CA 5IMCA 2I3YA 1SL0B 2MMAA 4LMVA 1A2LA 2WCIA 4BVXB 1GNEA 4N0VA 1VF2A 4KDXA 3IE3A 1XPVA 4PX1A 4MF6A 1TI1A 2N5AA 4PTSA 3TJGA 1ERWA 4MCUA 3G7YA 3CMIA 1TRVA 2MMOA 1ERUA 1GUMA 3ZMLA 4WXTA 5ECPB 2GSTA 4G0IA 3VPTA 1GNWA 2VM2A 3Q6OA 3AY8A 3C8EA 3C71A 3WT1A 2AYTA 3P2AA 4WR5A 6GSSA 5C04A 3ZYWA 1KTEA 1DSBA 2RLIA 4DSSB 5CO3A 3K8NA 2LRNA 4L5OA 5KN1A 4ML6A 4BVXA 2HSMB 3TUEA 1XXUA 3PPUA 1OC8A 2DSAA 1V57A 4FQUA 3TJJA 3FZ9A 4GSTA 2VIMA 2DJJA 5JCWA 1XWAA 4MJAA 2HZEB 3VK9A 3ZRDA 5B7CA 5EPFA 5AISA 2O7KA 5J5NA 2B3SA 2B1KA 1A8LA 5IMZA 2NVLA 4EL1A 3L0HA 2YOIA 6GSUA 5J4UA 2ON7A 4ZBDA 3GV1A 3GL5A 1O7UA 3EMPA 3E3EA 4DSSA 3QMXA 1RK4A 3GKXA 4WR4A 3LWAA 1Y25A 3GNJA 4ZILA 2VAFA 2HSMA 4IELA 4PNFA 2IMKA 1XVQA 2DIYA 3M9JA 3VWUA 1OYJA 1MEKA 1ZZYA 3MDKA 2QGVA 2IWTA 4ID0A 5G31A 3F9UA 1T8EB 2GSSA 2EC4A 1ZYQB 1NHYA 5IQYA 3LJRA 1URMA 4ACSA 2HZEA 4RUVA 3CSIA 2FLSA 3KMOA 1SYXA 1J9BA 4HI7A 3KM6A 4YH2A 3DMLA 2VO4A 4L0WA 2IL3A 1O85A 3A2XA 4YAVA 3UEMA 5A4UA 1OC3A 5CRHA 1SD9A 5ECSA 2MZCA 2YN1A 5J3RA 2JZRA 2N5BA 1THOA 4MPFA 2WRTA 1X5EA 4PXOA 2H73A 2PVOC 5B8AA 2GZPA 2ON5A 1Z5YE 1VF1A 2Z9SA 4O92A 2DLXA 17GSA 4L8EA 1N8JA 3D4TA 4G19A 4IJ3A 1YZXA 4XS4B 4PNGA 3N5OA 3FW2A 3H79A 5D96A 2LJAA 1J0FA 5JCUA 1KBNA 2H72A 5CAXA 1JLVA 4POKA 2VM1A 3QR6A 2VCQA 2DBCA 2XPDA 3TKQA 3ZREA 1ILOA 5B6NA 1GSYA 2R6KA 1E6BA 4PQHA 1ERTA 3KIJA 3GUSA 1LU4A 5CRDA 4L0UA 2YWMA 5D9VA 5DALB 2BJXA 2H74A 2LNSA 1YEXA 1FW1A 4TXVA 5KN0A 3CXGA 1H75A 2PPTA 4TOPA 1JZDA 2OJLA 3PINA 3ZLPA 2A4VA 2C1YA 4XS4A 3R2QA 4CHSA 3HVVA 1AIUA 1ON4A 4TXOB 1ACVA 1UA5A 2FA4A 1SKRB 1BJXA 4MJBA 4MP4A 4NHWA 3I9V2 4TR0A 3CBUA 3PH9A 4NWYA 4K7OA 5LNKe 2DJ3A 2CX3A 2FWHA 2ZCTA 6GSXA 1WRYA 2GQMA 4J56E 4WKWA 1BG5A 3F8UA 3FEUA 5CREA 4EDYA 1XW6A 1GLQA 3IC8A 5ECLB 5B6MA 1GUHA 4USSA 4OO4A 5IMFA 5DALA 1QK8A 2OBIA 4IVFA 1NHOA 2K6VA 2UZ8A 2FGXA 3ZITA 1VRSD 2HFDA 1Z3EA 3BOAA 3FRCA 4K2DA 2K9FA 1TK0B 1EOGA 3RPNA 4TR1B 3KZQA 1MDJA 1O8XA 4TXOA 3HVSA 1MTCA 1GUKA 3VI5A 2EIOA 3UARA 3EU4A 3KP8A 10GSA 4BWSA 4YAPA 3IK9A 2HRNA 1M9AA 3WGEA 4RQRA 4J57E 5DVBA 4CDOA 1PL2A 5E4WA 5CP1A 4ECCA 4PUAA 3I43A 4DEJA 2B7JA 2CAQA 1GWCA 4ZB6A 1DUGA 1MDIA 2HXKA 4KNDA 1WMJA 1VGLA 5IOWA 3DXBA 4HZ4A 1K0BA 11GSA 3PGTA 3UVHA 1QQ2A 4KUNA 5G5EA 4XHMA 2DC5A 2GSRA 4BWQA 2LTKA 4TR1A 1RW1A 5IMDA 2XPEA 6GSTA 1WP0A 2YZUA 5IMVA 2B7KA 4KCAA 1TDIA 1QGVA 2AAWA 3EMXA 3ERFA 1A2JA 4KB3A 3ERGA 4KH7A 2O85A 1M7TA 2HRKB 3FZ4A 2H66A 3GTUB 3LYPA 4ISDA 1PA3A 1EP7A 2NTOA 2C3NA 3BD2A 3GRXA 3TCOA 2OA7A 3M3MA 4X1UA 3F3RA 3UVTA 5A4WA 5DJMA 3FYGA 1FG4A 5CRGA 3M1GA 3TJKA 4TR4A 4WBRD 1KNGA 5IO2A 1V58A 1XBSA 22GSA 2R5GA 4MF7A 2VLUA 5ECNB 1G0TA 6GSWA 3APQA 2C80A 2VLVA 4JBBA 3IA1A 2CAIA 4KSMA 2JADA 3GFKA 2WJUA 5JWRB 2CQ9A 3UBLA 3WGDA 2C3QA 1K0NA 4D73B 2F9SA 5IIZA 4KX4A 2HRKA 1LJRA 3GTUA 3M0FA 2IMIA 2X99A 3EWLA 3QFBC 4ZL7A 3TRPA 1GH2A 5L71A 5KN3A 3LORA 2YJ7A 4O5RA 1EEJA 3Q74A 14GSA 4GWRA 1SL1B 4MZCA 5E59A 5GZZB 4E8HA 4GQCA 1C72A 5ELAA 5IOXA 3EYTA 3RDWA 2HRAA 2JZTA 5HR0A 1PX7A 2FD3A 1F3AA 1GSDA 1O81A 3W6GA 2P31A 5GSSA 1PSQA 1B9XC 1ABAA 4F03A 3KXOA 4D73A 1R26A 5F8BA 1MDKA 1XOBA 3QCPA 5LCZA 2TRCP 3IHQA 4TW5A 3KGKA 4K7NA 1TRWA 2CVDA 1ZCPA 3FY7A 1WE0A 6GSVA 1UN2A 4IGJA 1EWXA 3W8SA 2WULA 2YPMA 4V1Ap 3HJOA 1GTIA 1ST9A 5F0GA 1PL1A 3CRUA 4GCIA 4IQ1A 4IP1A 1SU9A 1SL2B 1F2EA 1M9BA 2H76A 3GURA 1T4ZA 1TU7A 4I2TA 2GQLA 2XBQA 4PQ1A 3DIEA 3UBKA 2HSNB 2G2QA 3EURA 5EY6A 2C0DA 4I5QA 3QAVA 4YQMA 5D73A 1X5DA 4AJ8A 4IJIA 2CT6A 5H5QA 1F9MA 4OCEA 4I2UA 1EV9A 2I9HA 3C7MA 4HU7A 1B48A 4MH2A 1G6YA 5G1KA 4X43A 1T3BA 4MH3A 4GTUA 2F8FA 2LRCA 2O8VB 2L5OA 3F4SA 1XWCA 1TJDA 3EE2A 1XWKA 2E7PA 2VOCA 3QAGA 2IFQB 1YY7A 1A24A 1N2AA 2HI7A 5D93A 1FB0A 3E9JB 5AN1A 1X0RA 4KDUA 3R3EA 4OMVA 5COHA 12GSA 1V9WA 2KLXA 4PUFC 4N10A 3GIXA 2FWEA 2BMXA 2F51A 1QUWA 4KA0A 5DQYA 1K0CA 1ZOFA 1ZMAA 2H8LA 4EDZA 1WOUA 3TKRA 2YWOA 2IJYA 2WZ9A 4GF0A 2KP2A 4K0GA 4KF9A 3CYNA 1A8YA 1F6MC 1Q98A 1GTUA 3P90A 1PN9A 1J08A 3TRXA 1PRXA 4PGTA 4I97A 2MMZA 2HSHA 4IQAA 1SK2A 1SKWB 1PMTA 5HR1A 4HJ2A 3FHKA 2H0IA 1Q4JA 4F0BA 3ED3A 1GLPA 2IPAA 2KHPA 3I6AA 1YEPA 2XC2A 3G9BA 3SWLA 1XFLA 2AV4A 4JR4A 3I69A 1K0MA 4JEDA 4K9ZA 2LEGA 3IK7A 2IFQA 2VCTA 4P3YB 1GULA 1USBA 3APSA 5GAND 4FYBA 2RUEA 3C1RA 1SK1A 5AIXA 1TK5B 1A2MA 2LV3A 3HVXA 2K8SA 4Z7XA 3IRAA 4QQ7A 5HR2A 4X0XA 3LEFA 2HZFA 1SJIA 1AAZA 3UOMA 3UIWA 2OBKA 2NPBA 2IMEA 3EU3A 3O3TA 2AHEA 5F05A 1S3DA 2FA8A 1O6JA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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