3QAWA

Crystal structure of a glutathione-s-transferase from antarctic clam laternula elliptica in a complex with glutathione
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
SKPFVYWGSGSPPCWKVLLVLQEKKIDYDEKIISFSKKEHKSEEILELNPRGQVPTFTDGDVVVNESTAICMYLEEKYPKVPLFPSDTTIRAKVYQRMFETSNISTNVMEFVQYKMKNKDSIDQVLLKEKKDKAHVELGHWENYLKQTGGFVATKEFTMADVFFFPMVALIVRQGANLKDSYPNIFKYYNMMMDRPTIVKTMPPHWAESDSPGNLLDLC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Rho-class glutathione S-transferase
publication title The structure of a shellfish specific GST class glutathione S-transferase from antarctic bivalve Laternula elliptica reveals novel active site architecture.
pubmed doi rcsb
source organism Laternula elliptica
molecule tags Transferase
total genus 81
structure length 219
sequence length 219
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2011-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3qawA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3qawA01
5DBQA 2H6YA 4LA1A 2LKUA 4FIWA 4ISDA 5G31A 2OE1A 1QUWA 3RAZA 1Y6EA 1NHYA 1FB6A 1CQHA 4X1UA 4G0LA 4IS0A 2F9SA 4TVEA 4MF6A 4MH2A 3VK9A 3UMAA 1BG5A 4POLA 3HVXA 3US3A 3GUSA 1TTZA 1M9BA 1OAZA 1S3AA 2XBIA 2ZCTA 1GSYA 1TU7A 4HQSA 2BJXA 1GUMA 5FHIA 3E9JB 4GSNA 3WD6A 5G5FA 5DAKA 5JWQB 3WGEA 5B7CA 1Q98A 3GHAA 2WJUA 2R37A 1EOHA 1SL1B 1F6MC 3H4KA 2OBKA 4PX1A 1BX9A 1S3DA 5A4VA 1R4WA 4KE3A 3BOAA 2F8AA 5KN1A 4XRAA 5A4WA 4AGSA 3LEFA 4OD7A 4JR6A 4JE1A 4MZCA 5D93A 1MEKA 4ZBAA 5AIXA 4Q5RA 2C80A 4I8BA 3KH7A 4OMVA 4EKZA 2D2ZA 1GSFA 2VL3A 4TOPA 3TOUA 1XVWA 1USBA 2EC4A 3PGTA 4ZB9A 4OO4A 3VPQA 1V57A 2CAIA 1HNAA 1X5EA 2IMEA 2VO4A 5G1KA 1WMJA 4NMUA 4FO5A 1T1VA 3ZL5A 2CVBA 1MTCA 3D21A 4HOJA 2H76A 2GZPA 1SYRA 4OWYA 1WE0A 1SK1A 4GSTA 4X43A 1B4QA 4GWRA 3P90A 3WGDA 1LU4A 1ERTA 3VI7A 2LQQA 2N5BA 1XW5A 3TKSA 2PWJA 4MF7A 5D9VA 3IBHA 1RK4A 1ML6A 1W4VA 2TRXA 5IIZA 4FQUA 5ECSA 2UZ8A 1IYHA 2JZSA 2L57A 3F4RA 4HZ4A 2HZEA 1R26A 4F9ZA 1VF4A 1KEBA 2LRTA 5HFIA 2NPBA 3GA4A 1T8EB 1TRUA 2CT6A 1A24A 2HYXA 3FZAA 3LGCA 4NV2A 4OFTA 2BTOT 2HI7A 2XBQA 2K18A 3L9UA 2LS5A 5ENUA 3GV1A 3GSTA 1K0DA 4G0KA 3CXGA 2HRFA 1AXDA 3APOA 4G2EA 2YJ7A 4XRDA 2O8VB 2GTUA 5CREA 4PGTA 2DJ3A 3PR8A 3GNJA 3J7Yk 1T00A 4F0CA 1LBKA 1VF2A 2VCVA 5D9XA 4GQFA 1EOGA 4MJCA 1XFLA 3FZ5A 4K1FA 1Z9HA 3LSZA 2C0EA 2AHEA 3ZMLA 1DSBA 1K3YA 2G0FA 3EU4A 1JHBA 4L8EA 1B9YC 3FR9A 2IJYA 3TB2A 3FY7A 5EVOA 3TJFA 3TKSC 4K0NA 1A2LA 4AJ7A 2OADA 5L71A 1Z3EA 4GSSA 2O85A 4NHZA 2OE3A 2R2JA 5IO0A 3TDGA 3HD5A 1R5AA 2WCIA 2GQKA 2RM5A 2LNSA 4CDOA 1ZGNA 2PBJA 3ERFA 3ZFBA 4WETA 1UVZA 4WBRD 5AIVA 3H93A 2L5OA 5A5KA 1GSSA 1GP1A 3F4TA 4O92A 5DJMA 4EDZA 1ST9A 1XPVA 1C72A 2EIRA 2GZYA 1TK5B 2WGRA 4K0GA 3A2VA 5J4UA 1PX7A 3HY2A 1DUGA 4N0ZA 2HRAA 5CRDA 5CO3A 2TIRA 3ZFLA 3C71A 1DE2A 3LQ7A 2YN1A 2YP6A 3KIJA 4EF0A 1QXHA 3M3MA 1H4OA 4BL7A 2ZNMA 3WT2A 1GLPA 5BMUA 1V98A 2H6ZA 2VAFA 22GSA 5CNWA 2DMLA 2N5FA 5GAND 1ERVA 4ZIJA 2VLTA 3R2QA 2GSTA 5ECOB 3L0HA 5GAPD 2H0GA 4XIHA 3CSIA 2C0DA 2KHPA 2HSMB 2OE0A 4V1Ag 1XOBA 2JACA 1YQ1A 1KBNA 4MK3A 2YZHA 2E0QA 2YZUA 3E3EA 1WJKA 5DQYA 1SL2B 1A2MA 3RDWA 5JCGA 4GCIA 1LJRA 3S9FA 1M2AA 2JADA 2F3MA 3GIXA 5IMZA 1F9MA 2FY6A 4I97A 4YAVA 1SD9A 3IAS2 3FK8A 4KCEA 1BQ7A 3L4NA 4MABA 2MBSA 3GH6A 3UJ1A 3CRTA 1OKDA 3HJMA 1G6WA 2X8CA 2HSMA 3L9SA 4MZWA 3HVVA 4KH7A 10GSA 1K0MA 4O7HA 3WT1A 4P3YB 1FO5A 2VCXA 1AW9A 2N5AA 4GXZA 3EU3A 3HXSA 3ISOA 1DE1A 4BWQA 4PQ1A 2L6DA 2R4VA 3FHKA 3RPNA 3DGQA 4ZBBA 1HD2A 4V2MA 4DVCA 3Q74A 2VD0A 1JFUA 1H75A 2C0GA 4KDUA 2O89A 3I43A 1SKSB 4IP1A 2HSYA 2GZZA 3KP8A 3IR4A 3UAPA 4ZB6A 3DRNA 3VWUA 4MJBA 3FZ4A 2TRCP 3G7YA 4KB3A 2GDRA 4G10A 4WEYA 3Q18A 5IMDA 5C04A 3QAWA 3CMIA 2DLXA 3CBUA 3EVIA 4HU9A 4F2IA 4Q5FA 1WIKA 1GRXA 2WULA 4L0WA 3L78A 5D8IA 4K6XA 2YWOA 1O8XA 2KUCA 3MNGA 4MPGA 2L4QA 3HJOA 8GSSA 2H1GA 2K9FA 2PGTA 5AISA 2FNOA 4O5RA 5IQYA 2LRNA 3D4TA 5IOWA 1A23A 3IA1A 3LXTA 3QAGA 1FG4A 3GURA 11GSA 2VL9A 3BBYA 2MMAA 3KCMA 1THXA 4KW6A 2IWTA 2C3TA 2REMA 2VUPA 4AF2A 3F3RA 2R6KA 1FAAA 1U3IA 5IMFA 3LWAA 1XWBA 2VLUA 3QD9A 4JZQA 3Q19A 4LL4B 4IQAA 4PURA 1NSWA 4KDYA 3H8QA 3F4SA 2R3XA 2YNXA 2JSYA 2IFQA 2IIYA 4WR4A 4TKYA 5HR3A 2YWIA 5ABRA 2GT6A 2PVQA 5HFGA 4HI7A 3DWVA 4IJ3A 2F8FA 4POKA 4H86A 1ON4A 2K8VA 1N2AA 2L4CA 12GSA 4O32A 1QMVA 2I9HA 4USSA 5A4UA 2AB6A 2PMTA 3FR6A 3IC8A 3KH9A 3E0UA 4N30A 2VCQA 3UBLA 3C8EA 2VCTA 1SKRB 4MP4A 3GSSA 1GTIA 2CVKA 2OA7A 4EC0A 1OE7A 4ZL9A 3CSJA 2DBCA 1YEXA 2GVPA 3GH9A 3GMFA 2GGTA 5E4WA 1XXUA 3TRPA 4BVYB 5CRHA 1B4PA 3IE3A 1UC7A 3FYGA 5C00A 3D22A 1AAZA 2HFDA 5ECIB 1F2EA 1TW9A 3KJYA 4XHMA 4NAXA 4K7NA 3QMXA 4YH2A 3QOUA 5J9BA 4YAPA 4ECCA 1TJDA 1T4YA 5F06A 1HNCA 3HJPA 2E2GA 1PKZA 4TW5A 4MDCA 4IBPA 1MDIA 3M9JA 5KN0A 3ZVJA 1QK8A 5B6MA 2HZEB 3GL3A 4MPFA 5ECQB 4WKWA 1GNEA 1GNWA 4IP6A 3QAVA 1RQMA 2KLXA 3KP9A 2C3QA 2CZ2A 4OFMA 2MMOA 3GKKA 3DMLA 5KN2A 1GUHA 3GFKA 3L9VA 3IDVA 1YKAA 1SJZA 4KCAA 3TRXA 1R7HA 3KD0A 3EMPA 4BVYA 1MDJA 1JZRA 2AYTA 4J56E 2IMDA 3C73A 2M80A 3TRQA 2B1KA 2MMZA 4PNFA 1GSUA 3GKXA 4HU7A 2H72A 5ECHB 1EGOA 4QQ7A 3ZIVA 2LJRA 4YQMA 3TGZA 5EPFA 1XW6A 2V6OA 5DCGA 3A5WA 1GSQA 2LEGA 1F37A 2IMFA 4NPBA 4GQCA 5DALA 1Q4JA 2A2SA 3IHQA 3PINA 5HQPA 4MCUA 3V1WA 3ERWA 3M0FA 5ELAA 2ZUPA 1B9XC 1NW2A 1DBYA 3TKQA 1BJXA 2WB9A 2KP1A 1SL0B 2J23A 1T3BA 3QFAC 4WXTA 3KGKA 5EL8A 3BCIA 3C1SA 1XWCA 4LMWA 1MD3A 5ECPB 2I3YA 3DEXA 1K0NA 1FVKA 2WDUA 1XW9A 2FCHA 2QSIA 2DC5A 3SBCA 3U6VA 2HE3A 3CTFA 5JWOB 2JZTA 4F03A 2MYGA 4K2DA 2VD1A 2EIQA 2DJKA 3ERGA 5EY6A 1OC9B 2H19A 3DVXA 5HR2A 5J5NA 1K0BA 19GSA 2XPDA 3ME8A 3UEMA 4L0UA 2FD3A 3HA9A 3NIVA 4I5QA 6GSWA 1WOUA 4GF0A 1EP8A 1PSQA 4V1Ap 1E6BA 2LSTA 1X9MB 3A3TA 13GSA 4PNGA 1OVNA 4N11A 1JZOA 5D96A 2CQ9A 1ACVA 1GL8A 1NM3A 2A4VA 2XHFA 4TXOB 3GYKA 4RUVA 4HZ2A 3IV4A 1G7EA 1YJ6A 4LMVA 1YZXA 1GH2A 4K8MA 5LNKe 2B5XA 1FHEA 3D6IA 3VWWA 3MAKA 2A2RA 3KEBA 5IO2A 1YF1A 3FR3A 3IPZA 1I9DA 3RPPA 2YOIA 3C1RA 1OC9A 1M2BA 2C8UA 3FZ9A 2MZCA 2CA8A 3F63A 1PD21 2B1LA 2X64A 1FOVA 5AN1A 3M8NA 1O8WA 5F07A 4BL7B 2NVLA 4ML1A 2PUKC 2OBIA 4FYUA 4IQ1A 2LJKA 5J41A 1IYIA 2X99A 4TXOA 3QCPA 3P2AA 4J2FA 4F0BA 1TDIA 5G5EA 2HNLA 4EUYA 3W8SA 2FLSA 4HS1A 3O6TA 1M99A 2B6MA 2YJHA 4MMMA 4HQZA 2YPMA 1TOFA 3APSA 1JLVA 2MMNA 2QKEA 5IOXA 1YDKA 4IJIA 2V32A 2VL2A 20GSA 4NHWA 1EGRA 5CYYA 4JU5A 4KA0A 2CX4A 3VPTA 5DDLA 2VCWA 3D0ZA 5H5QA 5J9CA 4ZILA 6GSSA 1TXXA 1G6YA 1XIYA 4K9ZA 4NV5A 1QQ2A 2PPTA 3HDCA 3UIWA 1GUKA 3VI5A 2EIOA 5KEJA 1BEDA 4RI6A 3RHCA 4NWYA 3HCZA 1VF1A 3P8WA 2Z9SA 1V2AA 4WF4A 3KMOA 2NBSA 4KUNA 1SD8A 5ECMB 3LJRA 4KSOA 1GTUA 4XS1A 3J7Yb 4D73B 5D9TA 1MDKA 3ZITA 4K7IA 5CAXA 1UN2A 3G9BA 4I2UA 3F6FA 2V2GA 3F0IA 2VOCA 3P7XA 3CSHA 2VIMA 2H73A 2DJ0A 5ID2A 5IPGA 1EV9A 3TJGA 1Z7PA 2LUSA 3ZYWA 5H5SA 1XBSA 1ZZYA 1PA3A 3DD3A 1YEPA 1TI1A 4IN0A 3ZMKA 1OE8A 2OKAA 1BYEA 4EL1A 2YCDA 2HSHA 3ME7A 1PRXA 5ECKB 2JL4A 3G7IA 5E59A 4HEA2 4ID0A 4CW9A 1G7OA 2DJ1A 4D73A 18GSA 4NXIA 1XWAA 2G2QA 1TKDB 1PQNA 1EZKA 3N9JA 2K6VA 4V2NA 3HKRA 1A8YA 1JZWA 3BJ5A 3HZ4A 2VL2C 4G0IA 1UA5A 6GSTA 5COHA 4HJMA 2CVDA 3VURA 1A0FA 1S3CA 4L5LA 2DJ2A 4XS6A 3UVHA 4QL9A 3KZQA 2GLRA 1ZL9A 5ECLB 2ALBA 3QPMA 2LJAA 2H30A 2LNTA 2WS2A 2WFCA 2FA4A 3MDKA 3HVSA 5B8BA 1XCCA 3HZ8A 2GQLA 2DSAA 2B3SA 2HRKA 1RW1A 4KDXA 2YV9A 3O3TA 4Z7XA 5GSTA 2C4JA 1WRYA 4BVXB 4KSMA 1AQXA 3ED3A 4E8EA 3GKMA 5ECRB 1TRSA 3F9UA 2K8SA 3TJJA 2H8LA 1GTAA 1BAYA 2FWFA 2IFQB 5KN3A 2RLIA 3WGXA 5IM9A 4E8HA 3WYWA 1ZOFA 1SK0A 2O7KA 3UBKA 1ERWA 2P0GA 5G1LA 1KNGA 2I81A 1V9WA 2PERA 2V6KA 3IAM2 3JCML 3IK9A 5CRGA 4Q5QA 4RI7A 4EVMA 3BD2A 4IHUA 4TR4A 5AGYA 1I5GA 1GSDA 4BVXA 4K7OA 2IL3A 1M7TA 1WP0A 2O87A 4WBJA 3UARA 4AJ8A 2WRTA 2GQMA 4ECBA 3H79A 1EP7A 1Y25A 9GSSA 3IOSA 4AJ6A 3LORA 4XCSA 4TN8A 3I69A 1SKWB 1PN9A 2IMIA 3HYPA 1VRSD 5DQSA 5JCWA 1X5DA 1KTEA 1ABAA 2P5QA 1V40A 2BMXA 2FWHA 2JSZA 3QR6A 2R5GA 4G19A 2HT9A 2KOKA 3EE2A 5FWGA 3FW2A 4PTSA 2FGXA 1OC8A 4KGIA 1EEJA 4OCEA 4BA7A 1FVJA 1TI3A 3AY8A 2H1DA 4ZL7A 2WZ9A 4PQIA 4RQXA 4TR3A 1M0UA 5HR1A 1K0AA 5HR0A 2E2MA 3KTLA 2CV4A 5IMCA 1T7PB 1WPIA 1HNBA 14GSA 2H1BA 3RHBA 1ZMAA 3ZZXA 1M9AA 1M2DA 1U88A 1ILOA 4DSRA 1MD4A 2NTOA 2H0IA 2FHEA 3Q6OA 3DVWA 3EINA 1TRWA 4ILFA 1EWXA 2OACA 2E7PA 1N8JA 2GS3A 2HRNA 4IELA 5DALB 2L5LA 1TP9A 1K0OA 2OJLA 3TCOA 1SYXA 4PXOA 3LFLA 1A2JA 1T4ZA 1K0CA 4V2LA 3D5JA 1TK8B 1ERUA 3KTBA 4ZL8A 4JBBA 3DKSA 3C7MA 2XC2A 3VFIA 1SU9A 1ZYQB 5JWRB 3A2WA 1PL1A 1TRVA 5IPHA 4ML6A 2AUVA 4YQVA 3TUEA 2P31A 3KMNA 3OR5A 5ELGA 3LXZA 5GSSA 2C1YA 3DXBA 1HYUA 4GRFA 1GSEA 4IVFA 2RUFA 3TKSE 1J08A 3DYRA 5FT3A 3RBTA 1PMTA 2GSSA 4EXJA 2HXKA 3VWVA 5B6NA 3W6GA 3EURA 2M46A 2YWNA 3FRCA 2VCZA 4ZXGA 4POMA 2L59A 3F8UA 3TKRA 3MSZA 1A0RP 1JLWA 4X0XA 3SWLA 1TU8A 1YF0A 5LCZA 4KNDA 4MJAA 2H74A 3KM6A 1SJ6A 2B5EA 3TJBA 3ZVJD 4BWSA 6GSVA 4IKHA 3TJKA 4KX4A 5D9WA 2AAWA 3IRAA 1HQOA 1G0TA 1QGVA 4MJEA 3NZNA 4IGJA 3EC3A 3FEUA 1X9SB 4BPYA 2LTKA 4TRXA 2GSQA 2B7KA 1VGLA 6GSUA 1TK0B 1K3OA 1PL2A 4PQHA 2DIYA 4MZBA 4FYBA 5F05A 4Q5NA 4TR1B 4JRRA 3ZRDA 1XWGA 3ZLPA 2P5RA 2FA8A 1CQGA 1X5CA 3MWHA 4MLYA 1Z6MA 2C0FA 2YANA 1URMA 3LG6A 1XZOA 2L6CA 6GSYA 2J9HA 3CRUA 2LRCA 2X8GA 1ZYEA 3A2XA 2H71A 2MBTA 2LV3A 5HFKA 2IPAA 4HUAA 1X9WB 4CHSA 4ACSA 2ON5A 2CX3A 1B8XA 1YKCA 3IXRA 3ZTLA 2RUEA 1E2YA 4TXVA 2HZFA 2PU9C 3UVTA 3F3QA 2B5YA 4HDEA 3H1NA 1GLQA 1YY7A 4TR1A 2AV4A 2CZ3A 2LQOA 3DIEA 4MH3A 2FWEA 17GSA 3U5RE 3FKFA 4MF5A 4ECJA 2H0HA 4DSQA 3I9V2 2YV7A 3GRXA 3O76A 5J3RA 4YQUA 1XWKA 2V1MA 2IMKA 4L5OA 5LD0A 3IC4A 1A8LA 1VF3A 2ES7A 2DMMA 1WWJA 3EMXA 2F51A 1X0RA 5IMVA 5ID2B 2I4AA 2HLSA 2QGVA 2YWMA 1AUCA 3LYKA 2H6XA 1XVQA 4LL1B 3M1GA 2NDOA 1W89A 4G9HA 2H75A 3CYNA 3EYTA 1J9BA 16GSA 2B7JA 2FWGA 4F82A 3G7JA 3PPUA 4FH8A 5CRWA 1F3BA 2KP2A 4WR5A 2X8HA 4QL7A 2H01A 1PKWA 1EEMA 1FB0A 4ECIA 1OYJA 1Z6NA 1O73A 3N5OA 1PX6A 4JEDA 4EE0A 1Z5YE 2HQTA 5CP1A 2H1AA 3UOMA 1NHOA 1AQVA 4IW9A 5DCHA 3NOFA 2H66A 1O81A 1U3AA 4ULXA 3APQA 4LLRA 4PUFC 4I2TA 4HJ2A 4GLTA 3HHVA 1ZCPA 2C3NA 3PH9A 4ZBDA 5ECNB 2HSNB 4XS4B 2GT5A 2HRKB 4KAEA 3BCKA 1FW1A 4ZB8A 3D4MA 2RM6A 3CTGA 1B48A 4N0VA 3VWXA 7GSSA 3KXOA 5GZZB 4RQRA 4EDYA 5INYA 4OFNA 5G30A 5DJLA 2FUG2 4KF9A 1U6TA 2IN3A 4OO5A 6GSXA 1PGTA 1GTBA 1AQWA 2JZRA 1Z7RA 3IK7A 1AC1A 3ZREA 3QFBC 4DSSB 1THOA 5B8AA 1SJIA 2PN8A 5DVBA 1GULA 2PVOC 3GX8A 4I6XA 1EV4A 4TR0A 3UL3A 2DJJA 4XTSA 5G2ZA 4POBA 4OCFA 5JCUA 2DIZA 3GKNA 3GTUB 3R3EA 1O85A 3F6DA 1R5PA 4XS4A 1GWCA 2I1UA 3GN3A 1QFNA 3TOTA 5IMAA 4MA9A 2AJQB 5F0GA 3EWLA 4J57E 3GL5A 4FYCA 2XPEA 1O6JA 5F8BA 1F3AA 3QDNA 4WF5A 1AIUA 2M72A 3GX0A 2VLVA 1U87A 1SENA 2GSRA 1OKTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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