5DAKB

Crystal structure of human glutathione transferase pi complexed with a metalloid in the absence of glutathione
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
209
structure length
192
Chain Sequence
PPYTVVYFPVRGRAALRMLLADQGQSWKEEVVTQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIYTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Visualisation of Organoarsenic Human Glutathione Transferase P1-1 Complexes: Metabolism of Arsenic-based Therapeutics
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase P
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 192
sequence length 209
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2015-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
B PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5dakB02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5dakB01
3OR5A 2VLVA 1X5EA 1CQHA 3VPQA 1U3IA 2VCVA 4LLRA 17GSA 4O7HA 4KF9A 2H66A 1F3BA 2ON7A 5A5KA 4KUNA 4V1Ag 3N9JA 5IMVA 3RPNA 4ZBAA 5CNWA 4G0KA 3APSA 3A2XA 5G30A 2DC5A 4LMVA 5IPHA 1O73A 3ZIJA 1ON4A 2GQKA 4Z7XA 2YANA 4G19A 2O85A 4MH2A 5D73A 5JWRB 4ILFA 3DKSA 3W8JA 2G2QA 2KP2A 4POMA 3APOA 2B7KA 2OADA 1GNWA 1WPIA 2YZUA 2GSSA 1SJIA 5G5FA 1YKCA 5CRDA 2NTOA 2YWIA 3J7Yk 3IK9A 2L6CA 1GULA 1HYUA 3CBUA 3D5JA 3ZITA 2XBIA 1TDIA 3H93A 2L4QA 5CAXA 1BJXA 3D22A 4I2TA 1EEMA 3IDVA 3Q6OA 2GZPA 1PL2A 3TKSE 3JCML 5F07A 2MMAA 1WIKA 2CX4A 2LNTA 1BEDA 2WJUA 3FKFA 4L8EA 2C0GA 5D9WA 3TJBA 2FWFA 1RK4A 3G7JA 3UJ1A 5KN1A 3EC3A 4J57E 3VWUA 4OCFA 4PGTA 2R4VA 4WF5A 2GVPA 2B1LA 2LS5A 4HU9A 5DAKB 3GX8A 2I4AA 1SJZA 2GGTA 2NDOA 2WGRA 3VWXA 2R37A 3QDNA 2OBIA 5IO0A 3TKSA 3L4NA 3FR6A 1DUGA 3I6AA 1YEPA 1GTAA 3G7IA 1T1VA 3PINA 2YWMA 1VF3A 3DVWA 4ZL8A 4G2EA 1SKWB 2JZTA 3LGCA 2HE3A 5D8IA 3M9KA 2AYTA 3PH9A 2JSYA 3L9VA 1GWCA 3QAGA 3GKKA 2H73A 4KX4A 3TKRA 3G7YA 1XW6A 3C71A 4HU7A 2EIOA 3KXOA 5KN2A 5JWQB 2CZ3A 4WBRD 2XPDA 3DMLA 3L9SA 1X0RA 2WULA 3A3TA 3KP8A 4FYBA 3U6VA 4IHUA 4P3YB 1TU7A 4POBA 5G5EA 2PMTA 3HDCA 4F9ZA 6GSSA 2WFCA 2VCZA 3KZQA 4IP1A 4RI6A 1ZMAA 1EWXA 2OE0A 2AAWA 4TR1A 4DEJA 4KNDA 1F3AA 2YN1A 4FYCA 2TRXA 1FB6A 5IMAA 2ON5A 4MF6A 4DSSB 5A4UA 3F6FA 4IW9A 2MBSA 3KD0A 1FAAA 3EMPA 1S3AA 3M9JA 4WXTA 3HVSA 4EDZA 4MJEA 4XRDA 3NIVA 2MMNA 4IQAA 4OFMA 4TR0A 2C3QA 2H19A 3RHBA 2DJJA 1GRXA 1GUMA 1GSYA 4TN8A 18GSA 5D9VA 3GN3A 2EIRA 3FR9A 1A8LA 2N5FA 4EE0A 2HRNA 2XHFA 1ZZYA 2JZSA 3HD5A 5GAND 3E0UA 6GSWA 4XIHA 2RUEA 3U5RE 1TI1A 3F9UA 2K8VA 3IBHA 2K9FA 4YQMA 1WJKA 4BL7B 5DJMA 1JLWA 1M9AA 5ECOB 2CAQA 1PGTA 1THOA 4BWSA 1MDIA 4D73B 3ERWA 1Z5YE 3LEFA 3D4TA 3S9FA 4MH3A 2EC4A 5HFKA 1O8XA 4TXOB 4GRFA 2FY6A 3P2AA 19GSA 3ZZXA 3RDWA 2DJ0A 1F6MC 1PQNA 5ECIB 3MWHA 1V9WA 2CVBA 2M46A 3FRCA 4KGIA 1YF1A 2MMOA 1DBYA 5IIZA 5B6MA 2CA8A 3RBTA 5AGYA 2E0QA 5DCGA 2PVOC 1LBKA 4V2NA 3DXBA 4NWYA 2H0HA 2H6ZA 3QCPA 2R3XA 1Z3EA 3P8WA 1V58A 1GSEA 1TRVA 1XWKA 2GS3A 4EKZA 4KAEA 2CQ9A 4BWQA 1XOAA 2IWTA 4IP6A 1MD4A 2OKAA 4MF5A 1TW9A 3O76A 1OC3A 3TRQA 2DMLA 5DCHA 3TB2A 2M72A 4ECBA 1R5AA 2VCXA 2OACA 1H75A 3TRPA 4QL9A 5ECRB 2P5RA 22GSA 2XBQA 3LORA 2IMKA 5IMFA 4GXZA 3QFBC 3VK9A 1SD9A 2NPBA 3PR8A 2H74A 1RW1A 1M2BA 3ISOA 4G10A 5FHIA 3EVIA 4MLYA 4RI7A 1ERTA 5GSTA 3VPTA 1AAZA 2REMA 3KP9A 1EP7A 3TKPA 4DSRA 1V98A 3UBKA 1KTEA 2KHPA 4EL1A 4I5QA 4PX1A 2PBJA 2FWGA 5GAPD 4KB3A 3GTUA 2YOIA 4POKA 4O5RA 3CRUA 1B9XC 2EIQA 1PN9A 4K8MA 1JZRA 4X43A 3C73A 4KDUA 2PVQA 3LQ7A 1TRWA 1ERWA 4GCIA 3UEMA 2IIYA 1TI3A 1ZOFA 2QC7A 5ENUA 4JR4A 2LTKA 3KTBA 1A2JA 5ID2A 3WD6A 5IOWA 5IO2A 5C04A 2BTOT 3RHCA 5CRGA 3VLNA 4TR1B 4XHMA 5G1KA 3GUSA 4MCUA 5E59A 4ID0A 4OO5A 3ZVJA 4HEA2 4HOJA 4L5OA 2NVLA 2R6KA 1XZOA 5B8AA 1XOBA 2JSZA 3QOUA 3TKSC 4K2DA 4K1FA 4PUAA 2FD3A 3D4MA 4HJ2A 3DWVA 4F0BA 5CRWA 5CP1A 2C0EA 2HSHA 1NM3A 1K0MA 2VAFA 3HA9A 4WKWA 1Z7PA 4CW9A 1AQXA 3UL3A 2XPEA 2CVKA 2LJKA 2VLTA 1T8EB 2C1YA 3WGDA 5CRHA 2LJAA 5KEJA 2C0FA 2GZZA 4Q5FA 3GL5A 1GTIA 2H1GA 4MPFA 3I9V2 1TK5B 1M2DA 1AXDA 2AUVA 2E2GA 3RPPA 1CQGA 2H6YA 2I9HA 1OKTA 4TR4A 4BPYA 1GSDA 1E6BA 2H8LA 1YEXA 2K18A 2J9HA 3TDGA 3ZL5A 2YJ7A 1G6YA 4J56E 2HRAA 2BJXA 5KN3A 1SL1B 4KSOA 1YQ1A 2HSMA 4WBJA 3GSTA 3LYPA 4PQHA 3HJOA 1EEJA 1XWAA 1K3LA 2P31A 3IOSA 2ES7A 1SL0B 2DJ3A 2WCIA 5JCWA 4AF2A 1Z6NA 4F2IA 1ERUA 4HZ4A 2X8HA 5B8BA 3DRNA 2V6KA 4ZBBA 2LUSA 5HFGA 3L0HA 2D2ZA 1ZGNA 4BVXA 3CSHA 2VUPA 3FY7A 3VURA 3GHAA 4WETA 4BA7A 3HZ8A 1EV4A 1HNCA 4GQCA 5DALB 1TOFA 1XFLA 3EYTA 2HLSA 1ERVA 2IJYA 1XPVA 4F03A 2C3TA 4Q5NA 1LU4A 2C3NA 3TOTA 3VFIA 3APQA 3LXTA 2PU9C 2DLXA 2HRKA 4HJMA 2HQTA 2GSRA 4ZB9A 4H86A 3CTGA 3NZNA 4BVYB 5A4VA 1C72A 5FT3A 1YZXA 1IYIA 1T00A 3BBYA 1PKWA 1T4YA 2JU5A 5C00A 3IAM2 3H8QA 3MAKA 4HQZA 4YAPA 4QL7A 4MDCA 3TJJA 1WE0A 2HYXA 4IN0A 3Q19A 1XCCA 1JFUA 1OKDA 1QUWA 2VL2A 12GSA 10GSA 2HSNB 2H1AA 3KM6A 14GSA 2GLRA 5LNKe 2QSIA 3TJKA 4NAXA 1TJDA 2VIMA 2FUG2 1PKZA 4JU5A 2CV4A 4TKYA 3HJPA 2OE3A 3UAPA 4WEYA 2LRNA 3ZREA 3FK8A 2QGVA 2VLUA 1ZYQB 2OJLA 4XCSA 4N0ZA 3F4RA 5IOXA 4GTUA 3CSJA 3UOMA 4KCAA 4NV2A 1B4PA 2G0FA 4ZBDA 1JHBA 3IE3A 4GWRA 4IGJA 2RLIA 2H75A 2MBTA 3FHKA 1R26A 1G7OA 4MJCA 3QAVA 4I97A 2YJHA 1YJ6A 4EO3A 3DD3A 3ZVJD 3ME8A 4Q5RA 2YNXA 3DIEA 1WOUA 2KLXA 1FB0A 3HVXA 2GT6A 1SYRA 1JLVA 2IFQA 1TP9A 1WP0A 5ECQB 2KUCA 4O32A 4KDXA 1M7TA 3ED3A 5J41A 5G1LA 2L5LA 3M1GA 3KJYA 1K3OA 2IMIA 3R2QA 3H4KA 1YDKA 5CO3A 2IL3A 3TRXA 3SWLA 2LJRA 1J08A 3O3TA 4N10A 3VWVA 3IHQA 2PN8A 3D0ZA 1VGLA 1H4OA 1AUCA 3IV4A 2B1KA 20GSA 1A2LA 4K9ZA 1UA5A 4EVMA 4NHWA 2C80A 5G31A 3TCOA 4PQIA 1XBSA 4HI7A 2HSMB 3GMFA 4ZB6A 3FZ9A 1WWJA 4ZL9A 2LNSA 4USSA 3DYRA 5F8BA 2V1MA 1F9MA 4CHSA 2KOKA 4K0NA 5D93A 4WR5A 1A23A 4IS0A 3VI7A 4GQFA 2GTUA 5IMCA 2H01A 3DVXA 2Z9SA 1PRXA 1QQ2A 1GTBA 1Z6MA 2BMXA 3ZTLA 4KH7A 2P0GA 5E4WA 2LEGA 4MABA 2VM2A 3GL3A 3E9JB 5CYYA 2HZFA 1EGRA 2X8CA 1K0AA 3SBCA 1IYHA 1T3BA 2AHEA 2KP1A 3CYNA 1DE2A 1PL1A 4TXVA 6GSYA 2WB9A 1QFNA 2VL3A 1G0TA 3LXZA 4OFTA 5DBQA 1WMJA 1ZYEA 3CRTA 1U6TA 3F0IA 2ZUPA 1R7HA 5A4WA 7GSSA 3E3EA 1MTCA 4G0LA 5J9BA 4MA9A 2HRKB 1GUHA 2GSTA 2M80A 4HDEA 5HQPA 4YAVA 2CZ2A 1MD3A 2VM1A 5HR2A 1OC9A 1XIYA 1SJ6A 5HFIA 2LV3A 4MPGA 4L0WA 5DVBA 2N5AA 2PUKC 2I81A 4JZQA 4Q5QA 3IRAA 5ECLB 4MZBA 3KTLA 3HHVA 3FZAA 3ZLPA 3QAWA 3N5OA 3C8EA 5IQYA 4E8EA 1O8WA 4MF7A 1JZWA 1SL2B 4O92A 4XS6A 1FVJA 2YWOA 1VF4A 2F8AA 3LG6A 4WR4A 1S3CA 4DVCA 2WRTA 8GSSA 5JWOB 4XTSA 2YCDA 2DJ1A 3C1RA 5D9TA 3F63A 1AIUA 3TUEA 3DGQA 5ECKB 4POLA 3D21A 2MYGA 2DSAA 2JL4A 2A2SA 3Q74A 3KIJA 3CMIA 3CTFA 1QXHA 1RQMA 3AY8A 1X9MB 4KSMA 4WF4A 5DAKA 3KMOA 2MMZA 3KH9A 1ABAA 2HZEA 1HNBA 3IPZA 3GIXA 2X8GA 5DDLA 2FA8A 2C8UA 2TIRA 4IELA 1NW2A 3IK7A 2IFQB 1FHEA 1BYEA 4IQ1A 3P90A 2B5YA 5CREA 3QD9A 2YV9A 3A2VA 2VL2C 1FO5A 5HR3A 2RIIA 2IMEA 3C7MA 1GUKA 4TRXA 3GH6A 2B5XA 4G9HA 4MP4A 1GTUA 1BX9A 4ACSA 2V6OA 1A0FA 1A24A 5JCGA 4LL1B 3ZIVA 3CXGA 4MMMA 2DMMA 2R5GA 2YV7A 5JCUA 1Y6EA 1M9BA 3GKXA 3R3EA 3LYKA 4PQ1A 1F2EA 4ECCA 2NBSA 4K7IA 3UIWA 3CSIA 2B5EA 4MZCA 1X9WB 1K0NA 1MEKA 3IR4A 4FIWA 4EXJA 2L59A 2VCWA 3ZMKA 4IJIA 3UBLA 3GV1A 4CDOA 4HUAA 3F8UA 1B48A 4JRRA 2OA7A 5AIXA 2YPMA 4DSSA 4GSSA 4E8HA 2DJ2A 2LKUA 2L4CA 1PD21 3V1WA 1K0OA 1GSUA 3QPMA 3K8NA 1S3DA 1V57A 4MZWA 4AJ8A 2FHEA 1M2AA 1GNEA 3EURA 3HYPA 1X5DA 1PMTA 1JZOA 3ZFBA 4K7NA 3M0FA 3HVVA 3US3A 4PNGA 3MSZA 2L57A 4K6XA 4RQXA 3EWLA 5H5QA 4K7OA 5B7CA 4PNFA 1XXUA 5DQYA 5ECMB 2H71A 4BL7A 4K0GA 3BCIA 2GDRA 3A5WA 2VD0A 2TRCP 1TU8A 1ST9A 2HSYA 2R2JA 2PWJA 3GYKA 1A2MA 3QR6A 5LCZA 4KDYA 5DQSA 4AJ6A 4D73A 2DIZA 3TJFA 4OWYA 4RQRA 2OBKA 4OCEA 2DJKA 1XWCA 3WYWA 4TXOA 2JADA 1OC9B 1SU9A 1ZCPA 2V32A 4TW5A 2V2GA 4YQVA 3KCMA 3G9BA 1T7PB 3GURA 1EP8A 2B7JA 4I8BA 3VI5A 3I43A 2F9SA 4V1Ap 3ERFA 1V40A 2A2RA 3LFLA 1QGVA 4ZIJA 1AQWA 4ECJA 1YY7A 1SYXA 1HNAA 4LMWA 1FVKA 4MJBA 2HRFA 4FQUA 4ZILA 3GA4A 3HKRA 1J0FA 1PA3A 4JEDA 5J9CA 5ABRA 5IPGA 3WT2A 1XWBA 1QK8A 3TOUA 4XS4A 4PUFC 1TRUA 5EPFA 2V41A 3GTUB 3A2WA 2FCHA 4ZL7A 2H0IA 4KCEA 3HJMA 1XW9A 4OFNA 4OO4A 2FWHA 2K6VA 3BD2A 1XVWA 1EV9A 3P7XA 1V2AA 1M99A 3FW2A 1TXXA 2B6MA 2QKEA 3F4SA 2GZYA 1A0RP 1Y25A 1ZL9A 2PGTA 1NHOA 1KEBA 4ML6A 4J2FA 3I69A 1AW9A 2E2MA 2HZEB 1Q4JA 5ID2B 4TR3A 3ME7A 3C1SA 2L6DA 5HR1A 3KMNA 4XRAA 5H5SA 1E2YA 6GSTA 1VF1A 2LQQA 3ZFLA 2WS2A 1O85A 3ZYWA 3M8NA 3J7Yb 4JE1A 2C4JA 2XC2A 2I1UA 1B4QA 2VCTA 4N0VA 3L78A 3LWAA 2RUFA 4FH8A 2H0GA 1O7UA 1PX6A 1BG5A 3UVTA 3KH7A 2O89A 4NPBA 2AB6A 1X5CA 13GSA 4TOPA 2IN3A 11GSA 4FO5A 2CX3A 3EU4A 1XVQA 4GLTA 2LSTA 1OE7A 5KN0A 4G0IA 1SD8A 1K3YA 3ZMLA 5IMZA 1SK2A 6GSXA 3H1NA 1USBA 2YP6A 3RAZA 1TK0B 3GFKA 5ELGA 4ZB8A 4JR6A 1MDJA 6GSUA 4I6XA 1TRSA 1R5PA 2C0DA 1XW5A 4LA1A 2H1BA 5BMUA 4EC0A 2O8VB 5ELAA 4RUVA 1U87A 2X99A 2IMDA 2IMFA 3GRXA 2YZHA 6GSVA 1AC1A 1JZDA 1N8JA 3KEBA 2H1DA 4X0XA 2A4VA 4OD7A 3ZRDA 3UARA 1SK1A 1YF0A 5ECPB 3GKMA 2HXKA 1U88A 4XS1A 2O87A 4N30A 2X64A 3IA1A 2VCQA 1PSQA 5AISA 4DSQA 1ILOA 4BVXB 1GL8A 3HXSA 4IKHA 3M3MA 2H72A 3TGZA 3VWWA 3HY2A 4IJ3A 4ISDA 1W89A 4N11A 1OC8A 1G7EA 5AIVA 2K8SA 5EVOA 5IM9A 1K0DA 1GH2A 2HT9A 1TKDB 2CT6A 2RM5A 4F0CA 4V2MA 2HFDA 1Q98A 1Z9HA 3EMXA 3IXRA 5J4UA 3ERGA 1EOHA 1OVNA 3FEUA 1KBNA 5H5RA 1A8YA 3QMXA 1B9YC 4NXIA 3H79A 1OYJA 2AV4A 1EZKA 5INYA 3PPUA 4PXOA 3BOAA 2DIYA 5DJLA 2IPAA 2FLSA 3IAS2 1TTZA 3GH9A 4EUYA 1ACVA 2VL9A 3TKQA 2L5OA 4KA0A 4X1UA 1GSFA 1G6WA 2LRTA 5DALA 4XS4B 2VD1A 2PPTA 3F3RA 1OE8A 1J9BA 1HQOA 2YWNA 4ULXA 4NMUA 1PX7A 4KW6A 3D6IA 1X9SB 4QQ7A 3PGTA 1BAYA 4GF0A 4NV5A 1F37A 1THXA 1UN2A 3MDKA 4KE3A 2ZCTA 1O6JA 2O7KA 5GZZB 3LSZA 3GSSA 1NSWA 2DBCA 1VRSD 1HD2A 2VO4A 4NHZA 2FA4A 3W6GA 4IVFA 1AQVA 5ECHB 1UVZA 4BVYA 9GSSA 4L0UA 4PURA 2AJQB 3GKNA 1SKSB 5J3RA 2CAIA 1BQ7A 2H30A 1N2AA 3FYGA 3FZ4A 1SKRB 1VF2A 4EDYA 5ECSA 1MDKA 5FWGA 1OAZA 3UMAA 1M0UA 1Z7RA 3F4TA 3WT1A 1KNGA 5AN1A 4L5LA 2J23A 2CVDA 5D9XA 2ZNMA 4GSTA 4F82A 4FYUA 1W4VA 1FOVA 2PERA 3BCKA 4LL4B 3BJ5A 5B6NA 4PTSA 2F8FA 1QMVA 1I9DA 1K0BA 3UVHA 2I3YA 5F06A 4ZXGA 4YH2A 4OMVA 1NHYA 3HZ4A 1R4WA 3FZ5A 4AJ7A 2WZ9A 3KGKA 2B3SA 1GLQA 2P5QA 2WDUA 2H6XA 1DE1A 1FG4A 5D96A 2UZ8A 2HNLA 3F3QA 4MK3A 2FNOA 2VOCA 3O6TA 16GSA 4TVEA 1K0CA 5ECNB 1UC7A 3FR3A 4IBPA 1SENA 1TK8B 4YQUA 5F05A 4HQSA 1GSSA 1XWGA 3DEXA 1WRYA 3MNGA 2GT5A 5EY6A 3F6DA 2GSQA 2H70A 1FW1A 4MJAA 2OE1A 1U3AA 3GX0A 1DSBA 3IC4A 4HZ2A 3GNJA 2MZCA 4V2LA 5EL8A 3HCZA 1EGOA 1LJRA 1SK0A 4I2UA 2LQOA 2FWEA 1URMA 5J5NA 2FGXA 1T4ZA 3LJRA 2E7PA 1YKAA 1B8XA 5LD0A 3IC8A 2F51A 4GSNA 5F0GA 4EF0A 3QFAC 2GQMA 5COHA 2LRCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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