1GSQA

Three-dimensional structure, catalytic properties and evolution of a sigma class glutathione transferase from squid, a progenitor of the lens-crystallins of cephalopods
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
202
structure length
202
Chain Sequence
PKYTLHYFPLMGRAELCRFVLAAHGEEFTDRVVEMADWPNLKATMYSNAMPVLDIDGTKMSQSMCIARHLAREFGLDGKTSLEKYRVDEITETLQDIFNDVVKIKFAPEAAKEAVQQNYEKSCKRLAPFLEGLLVSNGGGDGFFVGNSMTLADLHCYVALEVPLKHTPELLKDCPKIVALRKRVAECPKIAAYLKKRPVRDF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Three-dimensional structure, catalytic properties, and evolution of a sigma class glutathione transferase from squid, a progenitor of the lens S-crystallins of cephalopods.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTATHIONE S-TRANSFERASE
molecule tags Transferase
source organism Ommastrephes sloani pacificus
total genus 74
structure length 202
sequence length 202
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 1995-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1gsqA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1gsqA01
4BL7A 1O6JA 1EV4A 4KB3A 3EVIA 3TKSA 4TXOA 4ML1A 4XIHA 2QGVA 5H5QA 4BVYB 2FWGA 3ZFLA 1AQXA 3MWHA 4GSTA 4KDYA 2M72A 2O85A 1WE0A 2IMEA 2QC7A 2IMKA 14GSA 1WWJA 4K7OA 1OKDA 4ZL9A 2H74A 4ZILA 2ZNMA 4HJ2A 3EU4A 3KMNA 2H0IA 2WB9A 3WD6A 4PUFC 13GSA 3E9JB 1K0CA 2HXKA 4I8BA 4K9ZA 2HSMA 5AISA 3IC4A 3ERWA 1TKDB 4ZBBA 2IWTA 2M46A 1G0TA 2L5OA 5HR2A 3ZL5A 5IOXA 7GSSA 3VFIA 2NTOA 1PKZA 3F4RA 4X43A 1GSYA 3F3QA 2L6CA 3IV4A 1HYUA 2DMMA 1MD3A 1KNGA 4MH2A 1PX7A 1EZKA 4MZWA 4K8MA 3KZQA 3EMXA 4N0ZA 5LNKe 2KP2A 2GT5A 3EMPA 5D9TA 5ENUA 3J7Yb 5JCUA 2RUEA 3GSTA 3TGZA 1XWBA 2XBIA 1R26A 4OCFA 2MBSA 1PN9A 4MJCA 5IM9A 2GGTA 4MJEA 4N11A 4GWRA 4J56E 2DIYA 5HR0A 2J9HA 4GTUA 3UOMA 1XWKA 3RAZA 3TOTA 3Q19A 3O76A 3G7JA 2LNTA 2H0HA 4TRXA 4Q5NA 1TTZA 5B6NA 2LJAA 3D6IA 5ELAA 4MP4A 3KTLA 3HKRA 1VF4A 1V58A 4IVFA 4MPFA 1SJZA 3SWLA 2OBKA 1G7OA 3IOSA 2D2ZA 4J57E 5DALB 3FK8A 3BBYA 1X5CA 3QPMA 5ID2A 1THOA 2K18A 1TK5B 2HSHA 2AJQB 4HJMA 2VCWA 1X5EA 1XW9A 2WFCA 4HOJA 5DBQA 4EDYA 4MF5A 2V6KA 2HZFA 4XS6A 3VWVA 2MZCA 3DKSA 4NHWA 3V1WA 1K3YA 3DGQA 4JR4A 1VRSD 5D9VA 1Y25A 5CAXA 1YF0A 3IXRA 3QD9A 4XTSA 1WJKA 4N30A 3ZVJA 2YWIA 2H01A 4TR4A 1BQ7A 5CP1A 6GSSA 1M2AA 1TJDA 1QXHA 3GFKA 4MCUA 1MDIA 2JZSA 4EO3A 1K0DA 1SENA 1X5DA 5CNWA 4D73A 1UA5A 5D9WA 2GLRA 3LYPA 4GF0A 2HI7A 1M2DA 2ON5A 1F3BA 1SL1B 2P31A 3H79A 3UL3A 4EC0A 4OWYA 3F0IA 4PNGA 1QMVA 1S3CA 1TW9A 4KAEA 4XRDA 5FT3A 3W8SA 3VI7A 4TKYA 3HD5A 3TRPA 4JBBA 3D22A 3H8QA 4HU9A 2K9FA 4PX1A 3D4TA 5GSSA 5JWOB 5AIVA 2HZEA 4N10A 4FO5A 2VLUA 4ZBDA 4I6XA 4E8EA 2F8FA 4JU5A 3TJKA 3A2XA 1NW2A 1MEKA 1LJRA 1ML6A 1FAAA 2A4VA 4GXZA 3U6VA 5JCGA 4YAPA 5GZZB 3FZ5A 5CRGA 3HZ4A 2P5RA 2H8LA 3DEXA 2CVKA 3GV1A 5AGYA 3VWXA 4ECBA 2LNSA 4OFTA 3KH9A 3ZIVA 1OVNA 1TDIA 3GRXA 3ZITA 2OE1A 1AIUA 3GSSA 4JE1A 5IQYA 3IK9A 2YV7A 5DJLA 3FZ4A 2VCXA 2CV4A 3EYTA 3DRNA 3DVXA 2XBQA 1AW9A 4LL4B 2GS3A 2WRTA 5JWQB 2GSQA 3IAM2 1TRVA 4KDXA 3RPNA 3PGTA 3VPQA 4MA9A 1J08A 4MF7A 1OC9B 5B8AA 1PMTA 3CTGA 1FW1A 3D4MA 4WR4A 1G7EA 3OR5A 1DSBA 3P8WA 2MYGA 4HQZA 1FVJA 3RPPA 3CSHA 5J41A 2L4CA 1OC3A 4BWQA 1ERUA 2JU5A 2QSIA 2YCDA 4P3YB 4BWSA 2DJ1A 2Z9SA 1F3AA 2A2SA 2L5LA 3DD3A 2V32A 4ZB9A 5HFGA 5LD0A 3MNGA 3QAVA 4ILFA 5H5RA 4AJ7A 3GX0A 1IYIA 3FEUA 5FWGA 1O7UA 2H1AA 3HCZA 4F82A 5ECRB 4ZL7A 3F6DA 4Q5RA 1QGVA 1B9YC 22GSA 2LS5A 2R4VA 3US3A 1DE2A 3KP8A 1N2AA 5A4WA 3CMIA 2F3MA 3QOUA 2UZ8A 1ZMAA 1PSQA 2NBSA 4IP1A 2LRTA 1UVZA 3GHAA 6GSWA 1F2EA 3O3TA 1VGLA 1SL0B 2CAIA 4XS4B 2MMAA 2MBTA 3ZVJD 4BL7B 4RI6A 4TXOB 3WGDA 5E4WA 3ZRDA 2XC2A 1A0RP 3QFBC 4OFMA 1JFUA 1M99A 5G5EA 4MMMA 3GIXA 5D8IA 4ZB6A 1GSEA 1DUGA 1A0FA 1GTAA 2DBCA 1R5PA 1R4WA 3Q6OA 4JEDA 4YH2A 1TRUA 1ACVA 2WJUA 2RUFA 4MZCA 1AC1A 3KMOA 1WMJA 2HNLA 5IOWA 2HSMB 2B7KA 4L0UA 3UARA 1FO5A 3KP9A 5LCZA 3VK9A 1FVKA 1XVQA 4CDOA 2C3QA 4I2UA 3KJYA 3P7XA 3DIEA 3BOAA 4KW6A 2VCQA 3D0ZA 5ECMB 1RW1A 3RHCA 3F8UA 2ON7A 3IDVA 1V98A 3RBTA 4V2NA 8GSSA 4KGIA 2AHEA 1TK0B 2C0FA 3APQA 3R3EA 1EEJA 3EU3A 5CREA 3VI5A 5COHA 4F0CA 1WRYA 2FGXA 2X8CA 1AQWA 2VL9A 2YWMA 1PL2A 1PL1A 2JSYA 3GA4A 4TR1A 1USBA 3C73A 1F9MA 1NHOA 3TJBA 3W6GA 3NZNA 1J0FA 4IELA 4GRFA 5G1LA 3L78A 3HY2A 4NMUA 2H75A 2JL4A 3ZLPA 1GLPA 4HUAA 1FHEA 2FY6A 5DJMA 2GZPA 2LRCA 1M9AA 3UAPA 1JZOA 4X0XA 3UBKA 4XHMA 3FHKA 1TP9A 3JCML 4WR5A 4EDZA 2B6MA 1T4YA 1BX9A 1QFNA 5ID2B 2LQQA 2RM6A 1Q98A 4NHZA 1ZYEA 3BJ5A 1ERTA 4POMA 1XZOA 4MF6A 1U87A 1Q4JA 3C1SA 2OA7A 4IBPA 1ABAA 4F9ZA 3DWVA 3WYWA 4USSA 1GSFA 5IIZA 1EOGA 4G0KA 2RLIA 3ME8A 1KBNA 2IMDA 1XFLA 4OO4A 4NV5A 4V1Ap 2YWOA 19GSA 1V9WA 3VPTA 2CX4A 2IIYA 1T3BA 4PGTA 3MAKA 4HU7A 1F6MC 4WXTA 3EURA 5IMFA 2GTUA 3MSZA 4EXJA 5C00A 4PUAA 3IRAA 2R5GA 4ACSA 2I9HA 3I43A 3APOA 1B48A 4WEYA 3VLNA 2LJKA 1OKTA 5ECHB 4IJIA 1G6YA 4V2LA 3TKSE 2LRNA 1XXUA 1LBKA 2CQ9A 4ECIA 5J9CA 5CYYA 4D73B 4WKWA 1U88A 1YEPA 3UVTA 4YAVA 4HS1A 1J9BA 4JR6A 2KP1A 5IMDA 3FRCA 2C0EA 3M9KA 2YJ7A 2DJ2A 1XW5A 2HLSA 5A4VA 2DJJA 4BVXA 1V57A 3IPZA 1SJIA 2HQTA 3PR8A 5G30A 1FOVA 4MDCA 3IR4A 2KHPA 1EEMA 2OJLA 5IMZA 1Z7PA 1ZYQB 4KCAA 2NPBA 3HVVA 4N0VA 3VURA 4K7IA 2XPEA 3LXZA 4KUNA 4F2IA 1Z6MA 1A8LA 1GSSA 2IMFA 2GDRA 3FY7A 1TI1A 2F9SA 4IJ3A 5IMAA 3M3MA 4G9HA 1O85A 1H75A 2WZ9A 2VL3A 4E8HA 4K7NA 2ZCTA 2E2GA 4Q5FA 2JACA 4G10A 3ZTLA 2C0GA 2WULA 2HRKB 3GYKA 2HSNB 4G2EA 1WPIA 3KGKA 2HFDA 1GTUA 3H93A 5J3RA 2ES7A 5A4UA 1O8XA 4CHSA 2E2MA 1S3DA 2DLXA 6GSXA 1GUHA 4DSSA 4TOPA 2JSZA 2V2GA 3HXSA 4FYCA 3P90A 4XS1A 3E0UA 2HRNA 2PVQA 3M1GA 3FZ9A 3IBHA 4DVCA 2CX3A 1GUKA 3I69A 5EY6A 1F37A 3DVWA 4RQXA 3TJFA 5IPGA 3EE2A 5G31A 5EVOA 1TI3A 2V41A 3A3TA 4IQ1A 1PQNA 2BTOT 3C7MA 2GZZA 2X64A 1GSDA 4OCEA 2H1BA 3ERGA 3BCIA 1JLWA 2YV9A 4K2DA 2IPAA 20GSA 1SKRB 2FD3A 1QK8A 3QDNA 4ECJA 4PQ1A 3F6FA 4YQMA 1T4ZA 3J7Yk 3N5OA 2YNXA 2WDUA 4POBA 2EC4A 2B3SA 2VL2C 3ZZXA 4QQ7A 2DSAA 3R2QA 3CRTA 1A2MA 1OE7A 4IKHA 3CYNA 5DDLA 1K3OA 2YJHA 2FA4A 4X1UA 3ED3A 3QCPA 2DJ3A 4GSSA 4GLTA 3IA1A 1QUWA 5G1KA 2X8HA 1XOAA 1N8JA 4ZXGA 1GSQA 2QKEA 3A2VA 2LEGA 1ZGNA 3HYPA 1YKAA 4IN0A 4OO5A 4K0NA 1UN2A 2H71A 2N5BA 1A8YA 5J9BA 2OADA 3HZ8A 1H4OA 11GSA 3WT2A 3LEFA 5D96A 1SKWB 2CT6A 4ZL8A 1T00A 3UMAA 5F07A 3KH7A 3HJPA 5CRDA 2VD0A 5KN0A 4KSMA 5EPFA 2VL2A 1QQ2A 1ERWA 2EIQA 4NPBA 2FWEA 3MDKA 3TKPA 2PU9C 1SU9A 5B7CA 3L4NA 3F4SA 4EL1A 1YDKA 3LQ7A 4IQAA 3CBUA 3RHBA 1E6BA 2LJRA 2VIMA 1HNAA 5L71A 3A5WA 2VCVA 2WCIA 2DJKA 3GX8A 3TKQA 3KIJA 2YP6A 4WF5A 1I9DA 3IHQA 1EGOA 1NM3A 2H66A 4RI7A 3UVHA 1BYEA 1YJ6A 1R5AA 2PUKC 3GUSA 16GSA 2O8VB 3K8NA 2X99A 3FKFA 2OACA 4RQRA 1M7TA 3FR6A 3G9BA 5HR1A 1GH2A 1XCCA 1YQ1A 2OBIA 3GKXA 3CSJA 2YWNA 4ZB8A 2H70A 2GQKA 4F03A 1HNCA 2VUPA 2REMA 4KH7A 1SL2B 2JADA 4I2TA 2LKUA 3ZFBA 2PBJA 5IPHA 2VCTA 1ZOFA 1ON4A 2TIRA 2XHFA 1AUCA 3SBCA 3Q74A 4IS0A 1T1VA 5G2ZA 4ID0A 4TR1B 3N9JA 3C1RA 1VF1A 2OE0A 3QAWA 1KTEA 3KD0A 2CVBA 3WGEA 5DCHA 1S3AA 4TN8A 2FLSA 3BCKA 4OMVA 1ERVA 4O32A 3QR6A 5AIXA 1YZXA 3TCOA 2GSSA 2N5AA 2RIIA 1A24A 2OE3A 2GQMA 18GSA 1C72A 2XPDA 2AUVA 4KNDA 3KM6A 4LMWA 1M0UA 4ZIJA 3CXGA 3GMFA 4RUVA 2B1KA 5KN2A 1OC9A 2X8GA 2IFQA 4MJBA 2IJYA 4CW9A 1T7PB 2GT6A 1BJXA 1ZZYA 3IC8A 2H0GA 2EIOA 4ISDA 3Q18A 5AN1A 5ECPB 1GNEA 2H6ZA 4MJAA 2FNOA 2I1UA 3DMLA 1BG5A 2OKAA 2VLVA 1PGTA 4L8EA 3ZMKA 3IE3A 4ZBAA 1MDJA 4TXVA 3ZYWA 5F05A 1SD8A 2LTKA 2KOKA 4YQVA 5GAND 5B8BA 5DQYA 2DMLA 2PN8A 1BAYA 2IL3A 1HNBA 4HDEA 4BVXB 1A2LA 2GZYA 3EWLA 2J23A 3HA9A 1JLVA 3FR3A 5GAPD 3LXTA 1K0MA 2I81A 2CA8A 5KN3A 5CRHA 3TJGA 4AJ8A 3L9SA 2V1MA 5DAKA 4I5QA 2B5YA 2I4AA 3GH6A 4POKA 1JZRA 4F0BA 2HYXA 3TRQA 4PTSA 1SK0A 2HE3A 5CRWA 1G6WA 4O92A 5CO3A 2I3YA 2PMTA 4GSNA 4LL1B 3C8EA 3FW2A 4DSQA 4PNFA 5ECQB 2CZ3A 2A2RA 5IO2A 4K0GA 5D9XA 2YPMA 1HQOA 2V6OA 1FG4A 5HR3A 2FWHA 4PQHA 3F63A 2K6VA 1TRSA 2C1YA 3TOUA 9GSSA 1SK2A 3APSA 2DC5A 4FIWA 1EGRA 4NV2A 1ST9A 1U3AA 3GTUA 3ME7A 1JZWA 1GSUA 3G7IA 3GN3A 1X0RA 2LQOA 4NXIA 3HVXA 4DSSB 1B4QA 3NIVA 1B4PA 4HEA2 2M80A 1UC7A 4K6XA 2AB6A 3BD2A 2C4JA 2IMIA 2VO4A 1EP7A 1ZL9A 5BMUA 2B5EA 1YKCA 5J5NA 4EE0A 2JZRA 1WOUA 3GL3A 1Z5YE 2RM5A 1O81A 6GSTA 3VWWA 5HFKA 2VM2A 2PGTA 2ZUPA 5JWRB 4GCIA 3TJJA 4NWYA 3LYKA 3HVSA 5F8BA 3RDWA 3CRUA 1EOHA 3GNJA 2BMXA 2R37A 4WBJA 3IAS2 1OE8A 2C8UA 2ALBA 2H72A 5ECKB 4WETA 2N5FA 5ECIB 1XWAA 1GWCA 5D93A 1JHBA 4IP6A 2TRXA 4KSOA 2MMNA 2HZEB 1AXDA 3WT1A 1VF3A 1AAZA 2B7JA 1YY7A 1A2JA 1IYHA 2VD1A 5E59A 2H6YA 5IMCA 1Z7RA 2FHEA 3W8JA 4G0IA 4BVYA 1KEBA 1XIYA 4O5RA 3LFLA 5F0GA 17GSA 2CAQA 1XW6A 2VAFA 2YZUA 2LSTA 1GTBA 2G0FA 4OD7A 4POLA 3HJOA 1LU4A 1A23A 3FYGA 5IO0A 3ZMLA 5DQSA 3CTFA 1TK8B 3DYRA 1OYJA 4V1Ag 3TUEA 4MLYA 4ULXA 1MTCA 3GKMA 4BPYA 2HRFA 5F06A 2EIRA 3AY8A 4TW5A 1Y6EA 1WIKA 3KTBA 2H30A 1O73A 2VOCA 3PPUA 1BEDA 1PD21 1GUMA 4G0LA 3HDCA 1GL8A 2R2JA 4JRRA 4QL9A 1TU8A 1SJ6A 2NDOA 3L0HA 2FUG2 3DXBA 2AAWA 1GLQA 3PINA 1EP8A 5FHIA 2GQLA 1E2YA 1M2BA 3I6AA 5GSTA 4MPGA 1K0OA 1URMA 3TKRA 4QL7A 2O87A 2PPTA 2DIZA 2F8AA 1EV9A 3NOFA 1R7HA 4MZBA 4KE3A 2VLTA 3EC3A 4V2MA 4IW9A 1T8EB 4LMVA 5C04A 1SD9A 2H76A 1GRXA 3H4KA 3ISOA 3GKKA 1HD2A 4JZQA 3U5RE 4O7HA 1CQGA 1DBYA 2YZHA 4DSRA 3VWUA 1DE1A 3GL5A 2O89A 2C3NA 3QMXA 2LV3A 3D21A 2YOIA 3F9UA 5DALA 1V40A 10GSA 1TOFA 2H1GA 2WGRA 4MH3A 4AF2A 5J4UA 4FYUA 2VCZA 2YN1A 3GURA 2GVPA 1X9WB 2HT9A 2G2QA 5INYA 3O6TA 4L5OA 1K0AA 2H1DA 2HRKA 4MK3A 1AQVA 2YANA 6GSUA 3F3RA 1PX6A 2L4QA 4LLRA 1X9MB 3QFAC 2KLXA 3PH9A 1PRXA 1GNWA 3D5JA 6GSYA 4J2FA 2NVLA 3GKNA 4TR0A 3E3EA 4Q5QA 1SYXA 2JZTA 4WF4A 1XWCA 5EL8A 2R6KA 4PURA 1SK1A 2MMZA 4KF9A 4MABA 1K0NA 4PXOA 4GQCA 4NAXA 1NSWA 4ML6A 4TR3A 3GH9A 4FQUA 1SKSB 1CQHA 2R3XA 5KEJA 2IFQB 1NHYA 3FZAA 3UIWA 4EF0A 2PWJA 5DCGA 2PVOC 1XOBA 1W89A 2CVDA 1K0BA 2H6XA 4LA1A 4HZ4A 1XBSA 1I5GA 2P0GA 1RK4A 1MD4A 3QAGA 3KEBA 2AYTA 2BJXA 4HQSA 2AV4A 1FB6A 3LGCA 2GSRA 3ERFA 2B1LA 2MMOA 3LWAA 5G5FA 1TU7A 2KUCA 2GSTA 2PERA 4Z7XA 2FCHA 3LORA 4I97A 4OFNA 4EVMA 4FYBA 3C71A 1GTIA 5DVBA 1JZDA 4IGJA 4KX4A 4K1FA 2H19A 4KCEA 4EKZA 3KXOA 1GULA 2L6DA 1PKWA 3FR9A 5ECOB 1ZCPA 2WS2A 3ZREA 1Z6NA 4WBRD 2F51A 4H86A 3A2WA 4HZ2A 1OC8A 1EWXA 2FA8A 5KN1A 1XPVA 5IMVA 5DAKB 4BA7A 1B9XC 5ECNB 3G7YA 2O7KA 1TXXA 4KDUA 4DEJA 3UJ1A 2C80A 2HRAA 3P2AA 4FH8A 5A5KA 2P5QA 5D73A 1OAZA 1YEXA 3LG6A 1THXA 2VM1A 3IK7A 1U3IA 1GP1A 4GQFA 1M9BA 5ABRA 4L5LA 2B5XA 4XCSA 4AJ6A 1B8XA 1O8WA 3M9JA 2E0QA 4TVEA 4IHUA 3HHVA 1Z3EA 5ECLB 12GSA 5HFIA 3UBLA 2H73A 2IN3A 4HI7A 2TRCP 3TRXA 1V2AA 4PQIA 3ZIJA 1K3LA 1PA3A 3GTUB 4L0WA 5HQPA 2C0DA 1VF2A 3TKSC 1ILOA 1U6TA 1FB0A 1W4VA 3HJMA 5JCWA 4ECCA 3KCMA 3TDGA 1MDKA 2K8VA 3WGXA 2E7PA 2HSYA 3LJRA 4AGSA 1RQMA 1WP0A 1XWGA 3H1NA 2DJ0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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