1C72A

Tyr115, gln165 and trp209 contribute to the 1,2-epoxy-3-(p-nitrophenoxy)propane conjugating activities of glutathione s-transferase cgstm1-1
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
VVTLGYWDIRGLAHAIRLLLEYTETPYQERRYKAGPAPDFDPSDWTNEKEKLGLDFPNLPYLIDGDVKLTQSNAILRYIARKHNMCGETEVEKQRVDVLENHLMDLRMAFARLCYSPDFEKLKPAYLELLPGKLRQLSRFLGSRSWFVGDKLTFVDFLAYDVLDQQRMFVPDCPELQGNLSQFLQRFEALEKISAYMRSGRFMKAPIFWYTALWNNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Tyr115, gln165 and trp209 contribute to the 1, 2-epoxy-3-(p-nitrophenoxy)propane-conjugating activity of glutathione S-transferase cGSTM1-1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (GLUTATHIONE S-TRANSFERASE)
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
total genus 71
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2000-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1c72A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1c72A01
4TN8A 5HR1A 4DSRA 5H5SA 4EUYA 3O3TA 5ECHB 4KH7A 4HEA2 3O6TA 2R5GA 4IVFA 1LU4A 1OC9B 3U6VA 3ME7A 3ZFLA 3NZNA 4N11A 2DJ1A 1MDKA 3DYRA 1QXHA 4AJ8A 4EDYA 1TRSA 3D4MA 2GQMA 2V6OA 2KLXA 2MBSA 1V2AA 3H4KA 1O81A 5EPFA 4KNDA 4IELA 1X9WB 4MZBA 1V9WA 4FYBA 3APOA 4TR4A 3Q19A 3M3MA 2H1GA 1EGRA 1SKRB 4ZL7A 4MPFA 3L4NA 3DMLA 5D9VA 3IK9A 2DLXA 2PPTA 2HT9A 1GSQA 5JCUA 3HZ4A 4OMVA 1XWGA 4HS1A 1F2EA 1ST9A 3FKFA 3FW2A 3P8WA 3VPQA 1ERUA 1ILOA 1M2DA 2LJRA 5GSSA 5F07A 2LNTA 2V2GA 1BX9A 1M9AA 2EC4A 4DSQA 2VOCA 1SL1B 1UN2A 5B6MA 5IPHA 1XW6A 1WRYA 4LA1A 2X8GA 4WF4A 1A2MA 4ZB9A 1R26A 2LNSA 3UARA 2C8UA 5B7CA 4QQ7A 5LD0A 4JE1A 1WPIA 4MJCA 1T1VA 1EOGA 2GSRA 4XS4B 4V1Ag 4JR6A 3KD0A 1TJDA 3RHCA 2LRCA 1O85A 2R3XA 2H66A 4EO3A 1YEPA 3CXGA 2OE3A 2B6MA 2E2GA 4JR4A 7GSSA 2MZCA 5CNWA 4KGIA 1TRVA 5CAXA 2E0QA 1A24A 1TI1A 1I9DA 1B9XC 1N8JA 2FGXA 4J56E 2H1AA 4HQZA 2NTOA 4MDCA 1W4VA 2C0FA 4MZCA 5J9CA 3GA4A 6GSWA 3TKRA 5ABRA 3CSIA 1PX6A 2YPMA 2YOIA 4KF9A 4TW5A 1K3OA 4TR1A 4IKHA 4L5LA 4BPYA 3HD5A 1G7EA 1X5DA 4K0NA 3FR3A 3DVWA 3ZL5A 3FR9A 1VGLA 2LTKA 3I43A 4GTUA 1MDIA 1SKSB 2GZZA 6GSSA 3UL3A 3ME8A 1M2BA 4ZL8A 5INYA 18GSA 1B8XA 1JZOA 2MMOA 4ULXA 1GUKA 4PNFA 2WZ9A 2GT5A 1YKAA 1ZGNA 2HSNB 3EYTA 3PINA 4GQCA 3L9SA 4G0LA 3HJOA 1MTCA 2HQTA 4WBRD 2C4JA 2ZNMA 4MF6A 3D6IA 2GQLA 1J08A 3RPNA 4RUVA 1N2AA 1GTBA 4ZXGA 4ML6A 2B1KA 1FW1A 4FIWA 2VCTA 5KN2A 2VD1A 3F4TA 3H79A 3F6DA 1BAYA 3IE3A 3K8NA 4Z7XA 2H0GA 1DE1A 1G7OA 1OC3A 1H4OA 2J23A 4TOPA 3I69A 2WCIA 2VAFA 4USSA 2ZCTA 1FO5A 3CMIA 5CO3A 4KDXA 2GSTA 1YZXA 1RK4A 1M9BA 1R4WA 2C80A 3R3EA 5AISA 2FA4A 4IHUA 1A0RP 4PURA 3FR6A 3HVXA 3VWVA 3HZ8A 4F0CA 5KN0A 1WOUA 2LSTA 1A2LA 2P5QA 2LJKA 1GUMA 3LXZA 3FHKA 2HLSA 1ZZYA 1XFLA 1U3IA 2PUKC 3F8UA 3GTUA 1WP0A 4TR1B 1EP8A 4O7HA 1GTAA 2OE0A 4HJMA 3QD9A 4ZBAA 3F9UA 3TUEA 3KTBA 1XWCA 4WR4A 3M0FA 4NXIA 3HKRA 2AUVA 4NAXA 1YDKA 4PQ1A 5DALA 2GGTA 2IMEA 1O8XA 4BA7A 2PVQA 3VURA 4E8EA 5G5FA 2H71A 2KUCA 4XS6A 1A0FA 3QFBC 5HR2A 4IP1A 2ES7A 4CW9A 3N5OA 2H0HA 3PGTA 2AAWA 1VF3A 4H86A 2P0GA 2CZ3A 1F37A 3S9FA 1K0DA 3VFIA 2OBKA 3KZQA 1F9MA 5DAKB 2C1YA 1HNBA 3PR8A 4OD7A 4F03A 1SYXA 1DUGA 1CQGA 3FZ4A 1K0BA 2YV7A 1ABAA 4NHZA 1Q98A 3HYPA 2GDRA 1G6WA 1BG5A 4J2FA 2IL3A 2WS2A 3C7MA 3DIEA 3GL5A 4JU5A 3C73A 3L9UA 1Z5YE 5IM9A 2EIOA 2DBCA 2JZTA 4GSSA 3BCKA 1FB6A 3DXBA 2IMIA 3CSHA 2H6ZA 1K0NA 3A2WA 5AIXA 4NV5A 4V2LA 4PQIA 4N30A 3EMXA 2HSMA 1VRSD 1DE2A 3SBCA 3UJ1A 3WGXA 4I97A 3QOUA 1OE7A 3GTUB 3LG6A 4MA9A 2PERA 4MJAA 1T8EB 3DVXA 2N5FA 4WBJA 2M72A 4KSMA 3E3EA 5H5RA 1YF0A 2IMKA 1B9YC 1J9BA 3MWHA 3HY2A 4N0ZA 1AQXA 5DQYA 5E4WA 1OC9A 1RQMA 4YAPA 2PWJA 5DALB 3P7XA 5EL8A 2DIYA 1ERTA 3FZAA 3TGZA 2C3NA 3GUSA 5CREA 5G30A 4EKZA 3TKSE 3LSZA 3TOTA 3VI5A 2F51A 4POKA 2F9SA 3TJBA 1USBA 4KAEA 1AQWA 9GSSA 5ECSA 4JRRA 3EU4A 1SL2B 2YP6A 1PKWA 3F63A 1NSWA 4MJEA 4G19A 1V40A 3IV4A 2JZSA 3TKPA 2TRXA 3I6AA 3QAGA 2H30A 2HRFA 2O85A 5IOWA 2CVDA 1XOAA 2C3TA 3M1GA 3KGKA 3ZIVA 3IPZA 1BYEA 4Q5RA 4KDUA 5ELAA 4K2DA 1OKDA 5H5QA 1KTEA 2B5YA 1XW5A 2VCZA 3ZRDA 1YKCA 3TJFA 4MPGA 5E59A 1I5GA 5JCGA 4IJIA 2F3MA 16GSA 2HSMB 1FVJA 1GNEA 2XHFA 5EY6A 1JLVA 3HVVA 1PKZA 2L5OA 3Q74A 3KXOA 3LYKA 5C00A 1R5PA 2RLIA 5DVBA 4QL9A 4AJ6A 3ZYWA 3D5JA 1XVQA 5F0GA 1SK2A 3WGDA 3H93A 3LYPA 1QUWA 5DJMA 2DJJA 3Q6OA 3LQ7A 5D9WA 1OVNA 2CZ2A 4V1Ap 3W6GA 2GS3A 1JHBA 2WB9A 4QL7A 4RQRA 1PGTA 2N5AA 3IDVA 1O8WA 5FHIA 4KA0A 4RI6A 5KEJA 2I1UA 1O7UA 2GT6A 4OFNA 3SWLA 2L6DA 4CDOA 4MP4A 3GKMA 4Q5QA 2VCWA 4OO5A 1THXA 4FH8A 2H6XA 4K6XA 1TOFA 4XRAA 3EURA 2WULA 3DKSA 4YQVA 2WGRA 1V98A 1K3LA 3FRCA 2H1DA 3LFLA 4ILFA 2GLRA 1GL8A 2CAQA 4GRFA 4ISDA 3FK8A 1IYHA 4J57E 4KSOA 2AYTA 5J5NA 3KTLA 5HR0A 1A23A 2Z9SA 4KUNA 1HQOA 1G6YA 1GSUA 2C3QA 2DMMA 2L59A 1TK0B 1F3AA 5IOXA 2B5EA 4K9ZA 3QCPA 4PXOA 3KEBA 1ZYEA 4K0GA 4WKWA 3W8SA 2TRCP 2O89A 1U6TA 3TRXA 2DIZA 1XWAA 1VF2A 4HUAA 1AAZA 1TW9A 1OKTA 5EVOA 1SU9A 3GSSA 1XBSA 3BD2A 3TJGA 4G9HA 4HI7A 3GV1A 1CQHA 1QGVA 5AN1A 2FWHA 2IMDA 3GYKA 2FNOA 3APQA 4V2NA 2GQKA 2MBTA 1GTUA 3IHQA 3TKSA 3ZFBA 2H1BA 5IQYA 4L0UA 2IMFA 4PX1A 2H73A 1M0UA 3CRUA 4KCEA 2HNLA 2CX3A 2FLSA 1GULA 3FZ9A 3GKXA 4YAVA 2LRTA 4IQAA 3VWWA 3ZREA 4PNGA 3KMOA 1H75A 3DEXA 4I6XA 1GUHA 3QFAC 1FHEA 14GSA 2FWEA 1S3CA 1LJRA 1SJZA 1TU8A 2YANA 3O76A 5ECRB 2VCVA 4I2UA 3QR6A 1XWKA 2X99A 4NPBA 2V41A 1X0RA 2HSYA 3HJPA 3HVSA 4X1UA 1PMTA 3TDGA 2YJ7A 4FQUA 2XPEA 1YY7A 2VIMA 3VWXA 2ON5A 2REMA 2A2RA 1WMJA 2L4QA 2RUFA 2VL3A 2VM2A 1M99A 4KCAA 4OFMA 2MYGA 2QGVA 3CTGA 1MD4A 2YZUA 2DSAA 2GZYA 2ALBA 1AXDA 4TVEA 2O7KA 3GL3A 2IWTA 4X43A 1UVZA 1F3BA 3ZIJA 1GH2A 4LL1B 3LGCA 2LKUA 3CBUA 2JACA 3C1SA 4ZL9A 4HU9A 4BVXA 4MZWA 2QC7A 3E9JB 5A5KA 5JWQB 5DAKA 2A2SA 2RM6A 2E2MA 2K6VA 1B48A 5B8AA 3ZVJA 2VL2C 2YCDA 3TCOA 2V32A 4DVCA 2OKAA 1PRXA 2B1LA 2YNXA 4NMUA 5DCHA 3M9KA 6GSTA 4TR3A 3HCZA 2IIYA 3Q18A 1VF1A 2VO4A 2F8FA 2H6YA 5J9BA 5JWRB 4IN0A 1QFNA 3KH7A 5IMDA 5ECKB 1UC7A 2HFDA 1A2JA 4I2TA 2CA8A 2I9HA 2MMNA 2MMZA 1AC1A 2TIRA 2CQ9A 3HXSA 1Z6MA 2R2JA 4TXVA 4K1FA 22GSA 2K9FA 1PL1A 2QKEA 3EE2A 2KP1A 2VCQA 1F6MC 3FEUA 1E2YA 3DWVA 1Y6EA 3EINA 2X64A 4GF0A 3ZZXA 5HQPA 5DQSA 3ERGA 3MSZA 2P5RA 4ID0A 1YQ1A 5L71A 1GLQA 3A2VA 1U88A 5AIVA 2O8VB 1TU7A 3F6FA 3MAKA 3F4SA 1EEJA 3EVIA 1HNAA 4XHMA 1K0CA 1NW2A 2DJ3A 1K0AA 1ACVA 2CVKA 3A3TA 1HD2A 1YEXA 3UOMA 4EDZA 3LXTA 1XOBA 2MMAA 1V58A 3GKKA 2YZHA 4GQFA 1NHYA 4L0WA 4GCIA 1V57A 3ZLPA 4G10A 4KB3A 2AB6A 4BVXB 5IMCA 4EF0A 19GSA 3EWLA 2JSYA 1TXXA 2LQQA 4CHSA 3NOFA 4KX4A 2CV4A 3DD3A 3VI7A 1JZWA 4TXOA 3TOUA 2B7KA 1T4YA 3PPUA 4K7NA 4YQMA 4MLYA 3IOSA 2EIQA 1G0TA 2FHEA 1XIYA 4MCUA 4GSTA 1X5CA 1U87A 2HRKA 4GSNA 1GP1A 1B4PA 3GH9A 3P2AA 4LMVA 2JZRA 3C8EA 3ZITA 3KJYA 3QAVA 1NHOA 5A4WA 2GVPA 2WRTA 1Z3EA 1TK5B 3CRTA 1SD9A 4XRDA 1T00A 1ON4A 4LLRA 4IGJA 3GHAA 3UBLA 3VLNA 1WJKA 1GSYA 5HR3A 1XW9A 5D9TA 2OADA 4JBBA 1E6BA 2OA7A 3ERFA 4AF2A 3UAPA 1S3AA 3E0UA 1TRWA 1HYUA 3IR4A 4EE0A 1K0MA 2BJXA 3KH9A 1SKWB 1GSFA 4WF5A 2LQOA 3GFKA 4HZ2A 8GSSA 5D8IA 3RDWA 5CRHA 4PGTA 2YWMA 1ML6A 3KIJA 5D73A 4EXJA 3GNJA 2VUPA 3U5RE 3RPPA 1SENA 2LV3A 2VM1A 2H8LA 5F06A 3TRQA 2YJHA 3TRPA 2JU5A 3H8QA 1PSQA 5ECLB 4MMMA 1TI3A 1TTZA 4HQSA 3M9JA 4POBA 4AGSA 4GXZA 2A4VA 2JADA 5G2ZA 1EGOA 1VF4A 2RM5A 5F05A 2HYXA 3GH6A 4GLTA 1R7HA 1X5EA 4MF7A 4TXOB 4KDYA 4BVYB 1GSDA 5ECNB 4OO4A 4ZILA 3UEMA 4JZQA 4K7OA 4RQXA 3KM6A 1MEKA 2OACA 1MDJA 2HRKB 5IMVA 3FYGA 3L0HA 1X9SB 5HFIA 4O5RA 2FA8A 2KP2A 2GTUA 3CSJA 3TJJA 3H1NA 4YQUA 5HFKA 4MF5A 2H76A 1ZYQB 1X9MB 2I81A 2AHEA 5J41A 2X8HA 1T3BA 5DBQA 5IMZA 3IAM2 2C0EA 4IS0A 2KHPA 4OCEA 2V1MA 1Q4JA 1TDIA 4XTSA 4HOJA 1U3AA 1GSSA 1SD8A 2H01A 2V6KA 3N9JA 5DCGA 1GWCA 3KP8A 2IFQA 4X0XA 3HA9A 1ZL9A 3UVHA 2XPDA 2B5XA 3F3QA 2GSSA 1SK1A 3AY8A 1SYRA 4ZBBA 3QMXA 2LEGA 1A8LA 4IQ1A 2P31A 1WE0A 2I3YA 2H74A 3GX8A 5ECQB 3BCIA 5LNKe 4NHWA 2UZ8A 2PGTA 1ZMAA 1FVKA 1OAZA 2FCHA 1SL0B 4NV2A 3EU3A 5IPGA 3ZVJD 2VCXA 3D22A 1WWJA 1JZDA 1MD3A 4WETA 3ZMLA 3CTFA 3F0IA 2CVBA 1KEBA 2BMXA 6GSXA 10GSA 4EVMA 1DBYA 1AUCA 5GAND 2VL2A 2H72A 1FOVA 3A5WA 2C0GA 4O32A 5GAPD 1BJXA 1GRXA 2D2ZA 2M80A 5ECMB 4MK3A 1ZCPA 1K0OA 3IAS2 5BMUA 5COHA 1ZOFA 4F9ZA 4F0BA 2LJAA 5A4VA 5C04A 3F3RA 2VLUA 3TKQA 4JEDA 3GN3A 2H19A 2AV4A 3KCMA 17GSA 4AJ7A 4DEJA 1FAAA 4DSSA 5IIZA 1AQVA 5GSTA 2IFQB 4PUAA 2F8AA 3V1WA 1QQ2A 2G0FA 2YWNA 3KMNA 1TKDB 2J9HA 3W8JA 1Z6NA 2GSQA 4BL7A 4OCFA 3HHVA 5ID2B 5CP1A 5LCZA 3WGEA 3FZ5A 4D73A 4EC0A 4ECCA 4OFTA 3VWUA 4Q5FA 2CAIA 2PBJA 3MNGA 2PMTA 3D4TA 2ON7A 3WT2A 3C1RA 1K3YA 4E8HA 4L8EA 2QSIA 4EL1A 3IXRA 1PD21 5FT3A 3PH9A 1AW9A 2H70A 2I4AA 4HU7A 2K8VA 1Z9HA 6GSUA 3A2XA 5HFGA 4P3YB 4FO5A 2CT6A 2HE3A 2XBIA 2OBIA 4WEYA 3LEFA 4ECIA 2XBQA 5IO0A 4RI7A 4LL4B 3G7YA 5B6NA 2L4CA 3KP9A 2H75A 2JL4A 3LORA 2NDOA 1LBKA 3GURA 5ECPB 3UIWA 5ELGA 3VPTA 2E7PA 3ED3A 4F2IA 4L5OA 1AIUA 4ML1A 1XPVA 2HZFA 2WDUA 3ISOA 2YWOA 3IC4A 6GSYA 5CRGA 4PQHA 4WR5A 1ERVA 3HDCA 1WIKA 1EP7A 2EIRA 1EZKA 1A8YA 2HI7A 5ENUA 2O87A 1FB0A 3DRNA 1IYIA 4HJ2A 4IJ3A 2JSZA 3M8NA 2GZPA 3IRAA 1C72A 4DSSB 2R37A 3P90A 11GSA 4IW9A 3LWAA 4TRXA 5G31A 3APSA 3L9VA 1O73A 4BL7B 4KE3A 5CRWA 1T4ZA 4PUFC 20GSA 3MDKA 4D73B 4MJBA 4ZB8A 3G9BA 5KN1A 3QDNA 1EWXA 5F8BA 4MABA 4XCSA 2B3SA 1HNCA 2LS5A 5AGYA 3UBKA 2NVLA 2C0DA 2K8SA 3I9V2 5DJLA 4K8MA 3GSTA 2RIIA 2X8CA 4ZB6A 2DJ2A 4FYUA 3GIXA 2N5BA 5IO2A 3TKSC 4O92A 1UA5A 2L5LA 2L6CA 1PX7A 3BBYA 4V2MA 1DSBA 1XZOA 3ERWA 5ECOB 1GTIA 2IN3A 1QK8A 5DDLA 2FUG2 2OJLA 1R5AA 5GZZB 2LUSA 3BOAA 1B4QA 4XS1A 5FWGA 1JFUA 2IPAA 4NWYA 4BWSA 3GKNA 5D96A 3NIVA 2WJUA 2VLTA 1T7PB 3ZMKA 2WFCA 1KBNA 1EEMA 4HZ4A 4BVYA 4WXTA 3J7Yb 4ACSA 1RW1A 1EV9A 2LRNA 4TR0A 3EMPA 2ZUPA 12GSA 1THOA 4G0IA 3WYWA 4POMA 1XXUA 3IA1A 3CYNA 6GSVA 2H0IA 4YH2A 3TJKA 1W89A 2KOKA 4MH2A 2NPBA 5A4UA 1NM3A 1M7TA 1FG4A 2VLVA 4HDEA 1J0FA 3EC3A 4K7IA 4N10A 3D21A 2VD0A 2B7JA 2HZEA 1OE8A 2FWFA 2IJYA 1EOHA 2RUEA 4ECBA 1URMA 3RBTA 2FD3A 1KNGA 3G7JA 2XC2A 1YF1A 4XIHA 3C71A 2K18A 1XWBA 1Z7RA 5J3RA 3G7IA 2AJQB 5JWOB 3JCML 1SJIA 3L78A 1TK8B 3J7Yk 1BQ7A 2PN8A 3GX0A 2YN1A 13GSA 4GWRA 3R2QA 2M46A 5G5EA 3RHBA 4G0KA 2HRAA 2PU9C 1XVWA 2HSHA 1QMVA 1SK0A 3HJMA 1S3DA 3BJ5A 4OWYA 1JZRA 2NBSA 1SJ6A 2DJ0A 3F4RA 1O6JA 5G1KA 1OYJA 5D93A 4KW6A 1M2AA 3GRXA 4BWQA 4MH3A 3IK7A 2HXKA 3IBHA 3GMFA 4LMWA 5IMAA 4ZBDA 5G1LA 2CX4A 2OE1A 1XCCA 5JCWA 4PTSA 1Z7PA 2HRNA 3UMAA 3QPMA 1YJ6A 4F82A 1PL2A 3LJRA 4FYCA 3VK9A 1GLPA 4ZIJA 4I8BA 1ERWA 4I5QA 3DGQA 1JLWA 5D9XA 3OR5A 3US3A 2DJKA 4TKYA 2YWIA 2R6KA 5CYYA 2DMLA 2BTOT 2FWGA 1GNWA 5CRDA 3FY7A 3TB2A 3D0ZA 2PVOC 2HZEB 2VL9A 1PA3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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