3VI7A

Human hematopoietic prostaglandin d synthase inhibitor complex structures
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
198
structure length
198
Chain Sequence
PNYKLTYFNMRGRAEIIRYIFAYLDIQYEDHRIEQADWPEIKSTLPFGKIPILEVDGLTLHQSLAIARYLTKNTDLAGNTEMEQCHVDAIVDTLDDFMSCFPWAEKKQDVKEQMFNELLTYNAPHLMQDLDTYLGGREWLIGMSVTWADFYWEICSTTLLVFKPDLLDNHPRLVTLRKKVQAIPAVANWIKRRPQTKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase/isomerase inhibitor
molecule keywords Hematopoietic prostaglandin D synthase
publication title Human hematopoietic prostaglandin D synthase inhibitor complex structures
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 198
sequence length 198
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2011-09-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3vi7A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3vi7A01
3NOFA 3ZTLA 2HZEA 3ERGA 5IO0A 1YJ6A 2IN3A 1UN2A 5JCGA 3EU4A 1PL2A 5IMFA 5IPHA 4POLA 2C80A 2LQOA 4GQCA 1OC8A 3CRTA 3GX8A 4OO4A 4TW5A 2NTOA 3HJPA 3FR6A 2H1GA 3BOAA 2IL3A 4BWSA 2MYGA 5KEJA 2C0EA 1O8WA 2I1UA 2VUPA 3GKNA 4KNDA 2LRTA 3E3EA 2NPBA 3CMIA 3ZL5A 3PGTA 1XZOA 2WRTA 1BEDA 4NXIA 1G6YA 1XPVA 4J56E 4IELA 2V32A 2YJHA 4TRXA 3ZZXA 2WJUA 4IN0A 2QKEA 1A0RP 2AAWA 3W8JA 2LRNA 4HJMA 3LQ7A 3IDVA 2PWJA 3DVXA 2C0GA 1OC3A 4PX1A 1J08A 2QC7A 2CX3A 3D5JA 3GKKA 4F0CA 5IOXA 3O76A 4D73A 3IR4A 4KF9A 3GTUA 3TOTA 5A4VA 4GQFA 4EDZA 4G10A 4F82A 2JZRA 4Z7XA 3F4SA 1GNEA 5IMDA 1DE1A 1EGRA 6GSYA 4NV2A 1UA5A 4NHWA 2H0IA 1T7PB 20GSA 1EWXA 1W89A 2MBSA 2C3NA 2L6DA 3LSZA 4ECJA 3TKPA 2ALBA 2FA4A 4PNFA 5EL8A 3W6GA 2YN1A 1EP7A 1EV9A 3KEBA 3D22A 1X5DA 4YAPA 4ID0A 5ECHB 3Q19A 3KM6A 4K7NA 1MDIA 4MJAA 3OR5A 3HVVA 4ZL8A 2LTKA 3MDKA 5DJMA 1XIYA 3G7YA 1XOAA 2FWHA 3VWXA 1GSDA 1VRSD 4TXVA 2XHFA 2C4JA 5E59A 1SKSB 5ECRB 3TRXA 1K3YA 3CSJA 3ZIVA 1XWGA 4MF5A 3KH9A 3GH6A 5LNKe 2REMA 3KGKA 5J9BA 5GSTA 1HNBA 3GURA 3L78A 3U6VA 1DUGA 1MDKA 1CQGA 5D93A 2VAFA 5F05A 5D9XA 2R37A 3GFKA 3SBCA 4PQ1A 2LJAA 4ULXA 5ECOB 2LSTA 5IOWA 1TTZA 4WF5A 4LLRA 5HR0A 5DCGA 2YCDA 4GF0A 3ZFBA 4WKWA 1PKWA 1WPIA 5IQYA 3RHBA 3F4RA 1FG4A 1Z9HA 2O8VB 3KMOA 1XW5A 2IWTA 3WGEA 1XWAA 4HQZA 3HA9A 2VO4A 5BMUA 2VCZA 1PSQA 1XWKA 2HRKB 2C0DA 3QDNA 4OO5A 1GWCA 5HQPA 1G7OA 4P3YB 3KJYA 5AIXA 4TR1B 3NIVA 4KSMA 5H5QA 1HYUA 4GSTA 1T3BA 4EE0A 1M2DA 3ZIJA 1EEJA 2DMMA 17GSA 3FRCA 5ECKB 3D4TA 3C1SA 3HYPA 2F9SA 1BX9A 3L9UA 3KP8A 1U88A 4K0NA 5F06A 4PUFC 5FT3A 1TP9A 1U3AA 4X0XA 2GSQA 2HSHA 4HZ2A 4PQIA 2JL4A 4ZILA 4GLTA 4KDUA 4MF6A 5KN1A 5ID2B 2YWIA 1T8EB 2MMAA 4MA9A 2GQMA 2WFCA 3EURA 3HY2A 3ISOA 3TOUA 3W8SA 3M0FA 2H0HA 2DJJA 3GMFA 1MDJA 2B1LA 2HZFA 4TR4A 3IC4A 3EMXA 2DIZA 1XW6A 2L5LA 5CRHA 1OC9A 5FHIA 9GSSA 1JLWA 1IYIA 4QL7A 4IW9A 4TXOA 2PVQA 2MMZA 1SJ6A 5IMCA 4I2UA 2VD1A 1PKZA 3VWVA 5CREA 2YWOA 1QFNA 1F2EA 3UVHA 3FHKA 4FO5A 3CSHA 4YH2A 5DDLA 2ZCTA 5AISA 5EY6A 3H79A 2YOIA 1TK8B 3QMXA 4N0ZA 1V57A 5IIZA 1W4VA 2R2JA 3G7JA 5IMZA 2YV9A 2H71A 1OE8A 3KTBA 3HJMA 1B8XA 4EUYA 4NPBA 4KX4A 1V2AA 4WXTA 3C8EA 4EKZA 2EIOA 2LQQA 1M0UA 6GSWA 1M7TA 2YNXA 1PD21 3ME7A 5KN3A 4PUAA 2B5EA 5ECMB 1T1VA 4EO3A 1Z7PA 1OYJA 2ON5A 2OBIA 3M3MA 1XCCA 2GZPA 1GTAA 1XW9A 3TB2A 2PGTA 5ABRA 4NV5A 2LS5A 1MTCA 2CZ3A 2NDOA 1X9WB 1K0BA 1BQ7A 1E2YA 5G30A 12GSA 2FUG2 3A2XA 5H5RA 5ENUA 1SJZA 3EWLA 2WZ9A 2CA8A 1QUWA 4WR4A 1YEXA 2MZCA 4MDCA 2J23A 1K0DA 4RUVA 2V6OA 3WYWA 3FZAA 4G19A 2VLVA 5KN0A 4RQXA 1RQMA 4L8EA 2H74A 2ZUPA 1G0TA 4WBRD 3LYPA 5J9CA 3DKSA 4WR5A 2V6KA 2HLSA 5ECIB 1XBSA 5DALB 4ACSA 2FLSA 2P0GA 1HD2A 4FIWA 5H5SA 3H93A 5IMAA 2DJ0A 1OKTA 2XPDA 2F3MA 1X0RA 5JWQB 2OE1A 5CNWA 3BCIA 2F8FA 3HKRA 3A3TA 3FW2A 2JACA 2A2RA 1PN9A 2IFQB 2IIYA 2VL9A 2GLRA 3FKFA 2VCTA 3TKQA 2BTOT 1R5AA 4TOPA 1SJIA 2H1BA 2YZUA 6GSSA 2IMFA 3QAVA 2R4VA 2PN8A 5J41A 1TU8A 1Z7RA 2HQTA 2I3YA 2IMEA 4KCEA 2OE0A 3TJFA 5FWGA 3SWLA 2H70A 5D9WA 5ELGA 3F0IA 1ERVA 1DBYA 1DE2A 1NSWA 3TJJA 1Y6EA 1T4YA 4HI7A 3QD9A 1GUMA 3GL5A 2RM5A 4YQMA 2V2GA 4L0WA 11GSA 2GT6A 3VFIA 4GSNA 4RI6A 3A5WA 1LBKA 1SK1A 1QK8A 1NHYA 3PR8A 1GULA 3A2VA 3DVWA 4TKYA 1Q4JA 2L57A 2B3SA 4ZB6A 1TU7A 2J9HA 1Y25A 1AQVA 2H6ZA 3VWUA 4V1Ag 3L0HA 4EC0A 3D21A 2HRKA 4Q5FA 1FOVA 3GHAA 1M2BA 3HZ4A 5GZZB 3HCZA 2E0QA 1K3OA 4MJEA 4MPFA 3VPQA 1A24A 2LUSA 4TR1A 2CZ2A 1PRXA 3G9BA 4HU9A 4KW6A 1EOHA 2XPEA 2A4VA 3ED3A 2GSTA 1S3DA 2E7PA 3GIXA 2L4CA 1RW1A 1YDKA 4FH8A 2X8GA 4PQHA 1WP0A 3C1RA 2H19A 5ID2A 1TKDB 2CT6A 3RHCA 4K6XA 4V1Ap 2HRNA 2GGTA 1TK0B 5J5NA 4O92A 1Z3EA 1J0FA 3H1NA 2H30A 1QMVA 2K8VA 3Q74A 1YKCA 1U3IA 4I5QA 3L9SA 4EF0A 2B5XA 1B4QA 3G7IA 4MF7A 2FGXA 3E0UA 3F4TA 1FO5A 2P5QA 3ZYWA 3FR9A 4OCEA 2KUCA 4KSOA 4MABA 4XIHA 3LXTA 3F3RA 5ECLB 3PINA 3RPPA 3DD3A 4USSA 1SL1B 3DIEA 2LEGA 1A2MA 4YQVA 1F6MC 2DJKA 1F9MA 3PPUA 4WF4A 3ZMLA 2PVOC 2GQKA 2K6VA 2TIRA 1HNCA 4DSRA 5E4WA 2YP6A 2HNLA 2M72A 3F6DA 4KB3A 5CO3A 4EVMA 4ECBA 3RBTA 2HSMA 3QR6A 1GSYA 3BD2A 1QQ2A 1M99A 4K1FA 4EXJA 4KH7A 3HHVA 1S3AA 1WJKA 2ZNMA 2OACA 1TOFA 1XOBA 2C0FA 3PH9A 4WEYA 5IMVA 1O85A 4N0VA 1JZOA 1FW1A 4Q5NA 5LD0A 5AIVA 5JCUA 1O8XA 5G2ZA 2ON7A 1ERWA 2AJQB 4IP1A 3DEXA 4HS1A 1HQOA 4KGIA 4ZBAA 5B7CA 3WGDA 5G1KA 5DVBA 3TJGA 3LG6A 3F3QA 5ECNB 2GDRA 4RQRA 3AY8A 2X64A 3JCML 1TI3A 2M80A 1SKRB 4H86A 2IMDA 4XS1A 1SD9A 1YKAA 1WE0A 5AGYA 3A2WA 1GLPA 1U6TA 1GL8A 4EL1A 2DSAA 1EOGA 2JADA 4NWYA 6GSXA 2VCXA 2FWGA 2N5AA 2GZYA 4LL4B 2X8CA 1OVNA 4AJ6A 4J2FA 3UARA 4IQ1A 1GNWA 3ZRDA 3LFLA 3DRNA 18GSA 2OADA 3HVSA 3UMAA 5DALA 2AHEA 4K8MA 4MJCA 3U5RE 4OFNA 3MSZA 3L9VA 5INYA 1XWCA 4AJ7A 2P5RA 2RUFA 4QL9A 2GTUA 3DXBA 1ERUA 2O89A 2EIRA 4AGSA 2CQ9A 5ECSA 2IJYA 1KTEA 1ZL9A 1TRSA 3K8NA 4CW9A 2YWNA 3KZQA 4IHUA 2IFQA 5DBQA 4XTSA 1Q98A 1V40A 2EC4A 4IVFA 2HRFA 1Z6MA 2MBTA 5EPFA 5F07A 2JZSA 1RK4A 2I9HA 2B6MA 3EYTA 4YQUA 3EE2A 2XBIA 3EU3A 3KP9A 1U87A 2DBCA 2H1AA 3V1WA 5CRWA 1ILOA 19GSA 1A8YA 2FWFA 4XHMA 1THOA 4IBPA 3IPZA 1K0NA 2AYTA 3KXOA 2AB6A 3ERFA 5D9TA 4HEA2 2DLXA 3IK9A 2HE3A 5HR3A 1NW2A 3GN3A 1N2AA 3IRAA 1BG5A 3FEUA 2M46A 2A2SA 5D9VA 2VLTA 2VL2A 5ELAA 1FHEA 5KN2A 4ZL7A 4MPGA 3I69A 3CSIA 4MK3A 1GUKA 1UVZA 3ZLPA 2PPTA 1SU9A 4OWYA 2GQLA 4KAEA 1XVQA 1GSQA 4G0LA 4DVCA 1XXUA 4BVXB 3H8QA 1X5CA 2P31A 5CRGA 2HSNB 3QPMA 2O7KA 5DCHA 1TRUA 4JE1A 1BAYA 4F9ZA 1LU4A 2GZZA 1GTBA 2VOCA 2AUVA 2NBSA 5DJLA 1IYHA 2I4AA 4F0BA 1O81A 3WGXA 1M2AA 3EVIA 4HJ2A 3FR3A 2E2MA 4E8EA 5B6MA 8GSSA 4FQUA 2YZHA 1XWBA 1SYRA 2R5GA 5ECQB 1H75A 5G31A 4IGJA 3LXZA 2OBKA 5CRDA 1B9YC 1XFLA 1GSSA 5GSSA 2DJ3A 4DSSB 1GSFA 4CHSA 1K0CA 1VF4A 1FVJA 1NM3A 2RUEA 1AUCA 3HJOA 3DYRA 5J3RA 4XCSA 1NHOA 1A2JA 5G5FA 1SENA 2JZTA 2F51A 2K8SA 3KIJA 3N9JA 4GCIA 3ZVJA 2YJ7A 4N11A 1YZXA 2OE3A 2CVBA 2R6KA 2OKAA 1VGLA 4XRAA 2VL2C 5A4UA 2C1YA 4BVYB 3IBHA 1TRVA 3ERWA 1Z5YE 2CAQA 3UEMA 5A5KA 4LL1B 1PX7A 3GUSA 3CYNA 3APOA 2N5FA 4XS6A 1N8JA 3CRUA 1PQNA 5F0GA 4PNGA 1B48A 1ZOFA 1O73A 2EIQA 4Q5QA 7GSSA 1T00A 3UBKA 4MLYA 3QFAC 3WT1A 4XS4B 2FCHA 1AXDA 2C3QA 1JZWA 4E8HA 1O6JA 2VM2A 3UJ1A 3WT2A 2KP2A 1URMA 1ERTA 1JZRA 2LJKA 2RIIA 1ABAA 2FHEA 3IOSA 3Q18A 2YV7A 5DAKB 4ZXGA 5CAXA 1A8LA 5EVOA 3CBUA 3E9JB 3LJRA 2JSYA 3GA4A 1QGVA 5G1LA 1GRXA 2LV3A 2UZ8A 2B7JA 3HZ8A 3LWAA 4ML1A 1I9DA 4CDOA 2XBQA 4DEJA 3QAWA 1TI1A 1WOUA 5HFKA 1WWJA 4NMUA 1ZYEA 5L71A 4FYCA 4G0KA 5A4WA 5D96A 4ECIA 3FZ4A 2VCWA 2HXKA 4O7HA 5IPGA 2WB9A 1AIUA 2L59A 1X5EA 4ZBBA 22GSA 3TJKA 1AC1A 3F9UA 4WBJA 4PGTA 4KDYA 1GTUA 2H66A 4QQ7A 3LYKA 1GP1A 4L0UA 4BL7B 1TW9A 2D2ZA 3UIWA 2DMLA 4JR6A 5CP1A 3TCOA 1B4PA 2H6YA 4OFTA 1TJDA 2IMIA 1BJXA 4POBA 1R26A 4L5LA 3N5OA 3LGCA 2TRCP 3FYGA 3DMLA 1KBNA 2QGVA 3QAGA 5DQSA 3C71A 13GSA 3ME8A 2E2GA 1CQHA 4I6XA 1VF1A 2C8UA 2KOKA 1ZYQB 2FWEA 2DC5A 1UC7A 4JBBA 5JWRB 4RI7A 4MCUA 4MP4A 4TR3A 2IMKA 2H8LA 2MMNA 1FVKA 3GRXA 1M9AA 4HZ4A 4DSQA 4IS0A 4GSSA 1PX6A 4O5RA 1ZGNA 3IC8A 1ST9A 1TRWA 2AV4A 3IAS2 4OD7A 3TKSA 3J7Yb 1A2LA 3EC3A 2DIYA 1ZMAA 1PGTA 1V9WA 5DQYA 3GYKA 1AAZA 1JFUA 4IKHA 4OMVA 1K0AA 2LNTA 1THXA 1AQXA 1F3AA 4JRRA 2WGRA 1KEBA 5D8IA 3P2AA 5LCZA 3ZFLA 3IK7A 4MMMA 4HU7A 1J9BA 1YY7A 3EMPA 1FAAA 2WDUA 4GWRA 1GSUA 5HFGA 3VI7A 3M9KA 5HR2A 5AN1A 1F3BA 2TRXA 1GH2A 2FNOA 1ACVA 3IHQA 1SKWB 3IE3A 4FYBA 1AW9A 4K7OA 1A0FA 1GTIA 4ILFA 4L5OA 2LNSA 3CTFA 1EEMA 3KMNA 1YQ1A 4BWQA 1VF2A 1G7EA 4J57E 4BVXA 3UBLA 4I97A 4EDYA 4F03A 2LJRA 4LMWA 2GVPA 3J7Yk 5JWOB 2QSIA 3EINA 3P8WA 1JZDA 4Q5RA 3BBYA 2HSYA 4JEDA 3MAKA 2LRCA 4OCFA 5D73A 2RLIA 5B6NA 2CV4A 2X99A 4AJ8A 5IO2A 2RM6A 3RAZA 2L6CA 2B5YA 4ISDA 3TKSC 3F6FA 3BJ5A 3ZREA 3VPTA 3HVXA 3IA1A 3DWVA 2O85A 2H72A 1V58A 2LKUA 4KCAA 1EZKA 2CX4A 3M1GA 3FZ5A 4DSSA 3TKRA 1MD4A 1C72A 4LMVA 4MZCA 1OE7A 4V2NA 2FY6A 1SL0B 3TKSE 5F8BA 2Z9SA 2O87A 3UL3A 4ZBDA 3F8UA 4ZL9A 2NVLA 1Z6NA 5G5EA 2DJ2A 1VF3A 2VLUA 1WRYA 1X9MB 2HZEB 2L5OA 3LORA 2C3TA 10GSA 3FK8A 4JZQA 3TGZA 3GL3A 1V98A 1H4OA 4BVYA 3TDGA 3MNGA 1O7UA 1K0MA 1M9BA 3VI5A 1B9XC 2WS2A 4KDXA 3R3EA 3TRQA 1DSBA 3VURA 4V2LA 1ZCPA 4I8BA 4GTUA 1USBA 4TN8A 4N10A 4HUAA 4K2DA 3APSA 2MMOA 6GSVA 4XS4A 1ON4A 4BA7A 6GSUA 3UOMA 2ES7A 5GAPD 4KE3A 1YEPA 1E6BA 1TK5B 5C00A 4G9HA 2IPAA 3APQA 3KH7A 2CVKA 5DAKA 2WULA 1JLVA 14GSA 2V41A 3D0ZA 3P7XA 2FA8A 3C73A 3ZVJD 3RDWA 4X1UA 3IV4A 1AQWA 3CTGA 3QCPA 4GXZA 4PTSA 3C7MA 2H0GA 2BMXA 2JSZA 2G2QA 2XC2A 3M9JA 4G2EA 3VLNA 4AF2A 2VCVA 4G0IA 5IM9A 2I81A 1GSEA 1SK2A 3O3TA 2KLXA 4D73B 4OFMA 1WIKA 3GTUB 2H75A 3GV1A 3F63A 4K7IA 3KTLA 2PUKC 3GKMA 2H76A 4KUNA 3GSTA 4K0GA 16GSA 4I2TA 4BL7A 4MH2A 4IJIA 4ZB9A 1OKDA 1FB0A 1R5PA 2VL3A 3IAM2 2X8HA 3VK9A 2GT5A 3UVTA 1PMTA 2H01A 5C04A 2CAIA 3FY7A 4ECCA 1FB6A 4POKA 2HSMB 1I5GA 3QOUA 3DGQA 3WD6A 3MWHA 1LJRA 2VM1A 1F37A 2B1KA 2KHPA 1JHBA 3IXRA 3O6TA 1R7HA 4JR4A 4ZIJA 1GUHA 2HT9A 3M8NA 3CXGA 2L4QA 2YWMA 4MZBA 2WCIA 2F8AA 2K18A 3H4KA 2PU9C 3TRPA 2GS3A 1X9SB 2DJ1A 5COHA 2B7KA 2HYXA 5ECPB 4ML6A 2VCQA 2N5BA 3UAPA 1MEKA 2GSRA 1YF0A 3I6AA 1EGOA 1K0OA 4PXOA 3HXSA 1TXXA 1GLQA 4K9ZA 4IJ3A 3US3A 3KCMA 1EP8A 2HI7A 3I9V2 3VWWA 1S3CA 3I43A 1EV4A 4FYUA 4TR0A 4GRFA 1SL2B 6GSTA 5CYYA 4POMA 1SYXA 2BJXA 1BYEA 4IQAA 1PL1A 1G6WA 3S9FA 3NZNA 2FD3A 2H1DA 1YF1A 5JCWA 2VD0A 5J4UA 1SK0A 5B8BA 2OJLA 3GH9A 3HDCA 4JU5A 4HDEA 3FZ9A 5GAND 2JU5A 4HQSA 5HFIA 4XRDA 4HOJA 3GSSA 1K3LA 4NAXA 2K9FA 4V2MA 3RPNA 1T4ZA 4X43A 3D6IA 2HRAA 3ZMKA 1ML6A 1QXHA 4ZB8A 3GNJA 5HR1A 2OA7A 4N30A 3ZITA 2H73A 1A23A 3Q6OA 3TJBA 3TUEA 4F2IA 4IP6A 2PMTA 3R2QA 2YANA 1HNAA 3GX0A 2YPMA 4NHZA 3HD5A 2G0FA 2CVDA 1R4WA 2VIMA 4O32A 1MD3A 2PBJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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