3NIVA

The crystal structure of glutathione s-transferase from legionella pneumophila
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
210
structure length
191
Chain Sequence
ILYDYFRSTACYRVRIALNLKKIAYEKIEVHLLVPSLDINGQILSQSMAIIDYLEEIHPEMPLLPKDPFMKATLKSMALIVACDMHPLNNLRVLNRLKEQFNANEEQVLEWYHHWLKTGFDAFEEKLGALERDKPVCFGSEVGLADVCLIPQVYNAHRFHFDMASYPIINEINEYCLTLPAFHDAAPEAIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1
publication title The crystal structure of Glutathione S-transferase from Legionella pneumophila
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase
total genus 59
structure length 191
sequence length 210
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.2.1.2: Maleylacetoacetate isomerase.
pdb deposition date 2010-06-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3nivA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3nivA01
3TKQA 2B7JA 5KN0A 3EINA 1TRSA 1SJ6A 4PNGA 1JLVA 4F0BA 4N0VA 1T00A 3D21A 1EGOA 2WGRA 2L5LA 1W4VA 2GVPA 1YY7A 3GL3A 1IYIA 1WWJA 1YF0A 4N0ZA 3IA1A 2EC4A 3FZ9A 1M99A 2YP6A 2VUPA 1B9XC 4F03A 1BG5A 1NW2A 2I3YA 3QDNA 3NOFA 2XHFA 3GSTA 5LNKe 5IPGA 1NM3A 5D9XA 3CBUA 2VCQA 3Q6OA 4MJAA 4IS0A 2XPEA 4E8HA 1HQOA 4FYCA 2AB6A 2B5EA 4ML1A 5D73A 4BPYA 2IMDA 2PVOC 5ABRA 5DJLA 4KW6A 3HVXA 3QAWA 4MJEA 1A2MA 1F9MA 2OA7A 4K7NA 4MA9A 2HZFA 1SK1A 4L0WA 3HJOA 2YPMA 1NHYA 5J5NA 1WMJA 4RI6A 3TRQA 3BBYA 2OACA 2LEGA 4F9ZA 1K3OA 2RLIA 1OYJA 2OJLA 3ZIVA 5JWQB 4POMA 4NHWA 1QQ2A 1HYUA 1CQGA 4AF2A 4MMMA 1XZOA 2HRFA 1AAZA 2LUSA 2HRNA 2L59A 2F51A 1PA3A 4MF6A 4XS6A 4LMVA 4ZBBA 9GSSA 2EIOA 3ZYWA 1OKDA 5IMVA 4XS4B 1ERVA 1ZGNA 4AJ8A 1OE7A 2L6CA 4HI7A 2QC7A 1GNWA 3QD9A 5F0GA 3VLNA 12GSA 2H66A 1G0TA 4HUAA 1WPIA 3IRAA 2VM1A 4OWYA 2IL3A 4BVXA 5GAPD 1AUCA 3E3EA 3O76A 1UC7A 2NDOA 3M1GA 2DSAA 1GTUA 3WT2A 1QFNA 2KP2A 3KGKA 3CTFA 4NAXA 19GSA 2VCZA 4MZCA 3FZ4A 3VK9A 1I5GA 2CVKA 1T1VA 4JR6A 2BJXA 2HSYA 1PL1A 1XW9A 1YJ6A 3HKRA 1ZOFA 5ECMB 2DMMA 4JZQA 2A2RA 2CA8A 3FRCA 1EP7A 4ZILA 3L4NA 3ME8A 2CQ9A 1ZYQB 3KP9A 5KN1A 1BYEA 4PXOA 4MCUA 2PVQA 4BVYA 3FHKA 4HOJA 1Z6NA 4O7HA 3ZFBA 5ECIB 3RPNA 1H4OA 2HSMB 2MMZA 1OC3A 1GTIA 1SL2B 4G19A 1YDKA 4L5LA 3H79A 4MF7A 3GYKA 3G7JA 2VM2A 5JCUA 5CRDA 4FIWA 1A0FA 4MPGA 3UBLA 3M9JA 1WIKA 3TKSA 3FR3A 3IC8A 1K0MA 2B6MA 2DC5A 4WR5A 5CRWA 4ZXGA 5HR0A 6GSUA 4OCEA 1M2DA 5ECPB 4KE3A 2LNTA 2I9HA 2EIRA 3F3RA 4WEYA 4ZB9A 1ZCPA 1GUHA 1GULA 2GZYA 2C3NA 3H1NA 1XIYA 1EWXA 1BEDA 5HFIA 17GSA 3ZIJA 2RM6A 3EC3A 1U3AA 3ERFA 3IR4A 4WR4A 4WBJA 3N9JA 4HZ2A 2OBKA 4MLYA 5IM9A 2C8UA 4XIHA 2CZ3A 5ECQB 2C0EA 1OC9B 1R26A 4I2UA 3TOUA 5IQYA 1B8XA 1PN9A 1GSUA 1TJDA 2WB9A 2I81A 2FWEA 3DRNA 3HZ8A 2RIIA 2JZSA 4AJ6A 2YWNA 2AHEA 1AQWA 2HZEB 1GUMA 2FGXA 3FZ5A 1OE8A 4CW9A 3BD2A 4NV5A 1A24A 2MYGA 1LBKA 5IOWA 3PH9A 5J41A 3GTUB 3KH7A 1JZRA 2TRXA 1ZYEA 2WJUA 4CHSA 3D4TA 4XRDA 4TR0A 3CSIA 4KDXA 1EEMA 2GZZA 3OR5A 2ON5A 3A5WA 1YEPA 1DBYA 3W8SA 2CAQA 1OVNA 1GP1A 2B5XA 3P7XA 1KNGA 1ZZYA 3VWUA 3TKSE 3W8JA 2CAIA 3KEBA 1SK0A 3C7MA 1AW9A 2VCXA 1FVJA 2B1LA 2FHEA 1K0OA 1PGTA 1YF1A 1BAYA 2H75A 1SD9A 2H0HA 3GKKA 2LKUA 4BWSA 3ZRDA 5B7CA 2WRTA 1O7UA 4G10A 3MDKA 1K3LA 3GHAA 4YAVA 1PQNA 5DAKB 1PSQA 5CYYA 1JZOA 4KF9A 2H19A 5C00A 3IC4A 4ZL7A 2LRTA 2G2QA 5AISA 3ZVJD 1GSEA 3N5OA 3ERGA 2NPBA 4K0NA 1G7OA 2BTOT 3IBHA 5H5SA 2LQOA 1Z5YE 3TB2A 3RAZA 4JEDA 4IJIA 4NXIA 3HY2A 1YKAA 2KOKA 1USBA 3P2AA 5D9WA 3HHVA 5CP1A 3LSZA 1QGVA 1W89A 2DIZA 4LMWA 6GSXA 3QMXA 2L57A 2H1BA 1VGLA 1DSBA 4AJ7A 1K0DA 2R3XA 3PGTA 1X9MB 2P5QA 2TRCP 2PERA 4RI7A 3F0IA 3C1RA 5ECLB 2DBCA 4GQFA 6GSTA 2FA8A 3WGDA 5J9BA 3QFAC 1B4QA 1GSDA 5G5FA 2LQQA 5KEJA 4TOPA 1TU7A 1FB0A 2N5AA 3JCML 2YN1A 4PQIA 1XPVA 1BX9A 3TKPA 2C3QA 5CREA 1FW1A 2CX3A 1WP0A 5DALB 3VI7A 3A2WA 4GSSA 5EL8A 3SBCA 1HNBA 5ID2A 2ZCTA 1M7TA 5HFKA 1O8XA 4V2NA 1JZWA 2NBSA 3ISOA 1EZKA 2X8CA 3L78A 3KCMA 2R37A 13GSA 1GTAA 2YCDA 2LJRA 3G9BA 2A4VA 3UL3A 4OO4A 5DCHA 3GH6A 1TK0B 3ERWA 4D73B 1JFUA 1MD3A 2LTKA 1BJXA 1XW5A 4KNDA 1TU8A 2YWIA 4TR1A 4KSOA 2H01A 4GTUA 2PMTA 2GZPA 1VF4A 4PNFA 4Q5NA 3UOMA 6GSWA 4IHUA 2DJKA 2PWJA 3HDCA 3F6FA 1RK4A 5L71A 2ALBA 5COHA 4EF0A 4NWYA 4JR4A 3M3MA 5A4VA 3TKRA 1AQVA 3FR9A 4LL1B 3KM6A 3S9FA 2AUVA 2REMA 1Z3EA 2FY6A 1TI3A 4DSSB 4G0LA 3EU3A 4X0XA 2GT5A 2HRKA 2GT6A 2O7KA 1QMVA 1PKZA 1EV4A 4EL1A 4YQMA 3EWLA 2HFDA 3GKXA 3KTLA 1TKDB 1V98A 2GDRA 2H30A 2MBTA 16GSA 1T7PB 2FWHA 5GSSA 5HR1A 1PMTA 1J9BA 1GUKA 3QR6A 4I97A 5FHIA 2L5OA 2DJJA 3D0ZA 1MDKA 3EMXA 1AC1A 1SK2A 4GRFA 2VO4A 1TRVA 4PX1A 3CMIA 5JWOB 2LRCA 4HU7A 1Z6MA 3UVHA 1A23A 4IELA 3GFKA 3ZZXA 5AN1A 4G0IA 1SU9A 4IVFA 2GSTA 5J9CA 3APSA 1JHBA 1K0AA 3TRPA 4EO3A 1XCCA 4ZBAA 2GQMA 5ECKB 1BQ7A 1AQXA 4Q5RA 4RUVA 4J2FA 3WT1A 2R4VA 3CRUA 4HZ4A 1G7EA 2B5YA 3MWHA 5HR3A 2FLSA 4V1Ag 4HDEA 2FWFA 4WKWA 2P0GA 4MH2A 1ML6A 1PX7A 4KX4A 1MEKA 4EDZA 3IK7A 4JU5A 2IJYA 4QL9A 4TVEA 3ZREA 4XRAA 2O87A 2CVBA 3D4MA 2H73A 2AV4A 3IAS2 2HNLA 2X99A 3D22A 2JSZA 4KDYA 1U3IA 2ZUPA 3TJBA 4FYUA 2VOCA 4JBBA 1FAAA 5HQPA 4MABA 2MMOA 5IO0A 1QXHA 2GSSA 4MJCA 1X5EA 3A2VA 3F8UA 5A5KA 2C1YA 5GZZB 2QSIA 3IK9A 4ILFA 5G2ZA 2VAFA 3VPQA 1SKSB 4IQ1A 4HEA2 3GIXA 1OKTA 4GQCA 1DUGA 3K8NA 1K0NA 4DSQA 2CV4A 1VRSD 4GF0A 2M72A 1SYRA 2QGVA 2H1AA 2E0QA 1A8LA 2IFQA 2GQKA 2R2JA 3P8WA 2V2GA 4TR4A 2GGTA 1B9YC 1XOAA 3UAPA 4OMVA 4YAPA 1WJKA 3CYNA 4BL7B 5CNWA 4K8MA 2FWGA 2QKEA 1F3AA 1XXUA 3MSZA 3F9UA 5CAXA 4IJ3A 1QK8A 4KGIA 3WGXA 3DVWA 4BA7A 3C1SA 3GSSA 1B48A 5AIVA 1PD21 4XS4A 5F06A 4Q5QA 1WOUA 3ED3A 3HJPA 1R4WA 1O73A 2C0GA 4ULXA 2MMNA 1RQMA 4EVMA 2N5FA 4IKHA 3I6AA 1FG4A 1TRUA 2M80A 3DYRA 1EV9A 3EMPA 1X5CA 2P31A 1MDJA 2H72A 4XHMA 2N5BA 4WBRD 1SJZA 5ECHB 3FK8A 2PN8A 4YH2A 1XBSA 3DGQA 1FB6A 3UMAA 4IW9A 3WD6A 3J7Yk 2YANA 2VL2A 2PPTA 2VD0A 5DQYA 4TKYA 4YQUA 3RBTA 1ZMAA 2LRNA 3NIVA 2YZHA 4EE0A 2V1MA 4FQUA 3LORA 1GLPA 22GSA 2HSMA 3L9VA 2GSRA 4L8EA 2C3TA 3PR8A 4ISDA 2JSYA 3MAKA 3KMNA 1GRXA 2YV9A 2F8FA 4ECCA 2E2MA 2GLRA 3D6IA 4OFNA 1X9SB 3QAVA 1TI1A 1UN2A 3P90A 2BMXA 2M46A 5JCGA 1F3BA 4POKA 1VF1A 1FVKA 6GSSA 1O85A 2KP1A 3EURA 2DJ0A 2H1GA 2C0DA 5E4WA 2VCWA 4OO5A 4DVCA 3HXSA 2C4JA 4MJBA 2HSNB 3LFLA 1S3DA 2VCVA 3CTGA 4ZB6A 1SL1B 1MTCA 4HS1A 4N11A 3FYGA 1Y25A 1GSFA 5INYA 4PGTA 2YV7A 4MF5A 1HNCA 2CVDA 5ECSA 2FNOA 5EY6A 5G5EA 5ECOB 6GSYA 2PGTA 3FR6A 1YZXA 1Y6EA 3KD0A 2G0FA 4LL4B 3G7YA 5D8IA 2GTUA 4YQVA 3TOTA 1OC9A 3U5RE 1XW6A 4TXOB 1MD4A 2WDUA 1YQ1A 1K0CA 5FT3A 3PPUA 1UVZA 1M2AA 4LLRA 2LNSA 4H86A 4TRXA 1F6MC 1URMA 2HZEA 3W6GA 2MMAA 5F07A 3QPMA 4TW5A 1ERUA 3GTUA 1XWGA 4JRRA 2L4QA 2VLUA 4POBA 2WULA 3UVTA 3QFBC 1V40A 1EP8A 4IQAA 5DDLA 3DKSA 2JU5A 3CRTA 1DE1A 1SJIA 2X8HA 4IN0A 5DBQA 2L4CA 4J57E 4NPBA 2AAWA 1WRYA 3ZITA 2FCHA 1V2AA 4ZBDA 3GMFA 3TJGA 5AIXA 1R7HA 2WCIA 2RUFA 4K7IA 4TN8A 1S3CA 3HZ4A 2IWTA 2LJAA 2I1UA 2ON7A 1A0RP 1T8EB 1G6WA 2JZTA 2VL3A 2IPAA 3HA9A 4X43A 5IIZA 5LCZA 3CXGA 3L9UA 4RQRA 2DJ2A 3MNGA 3US3A 11GSA 3RHBA 3GX8A 4POLA 2DJ3A 4N10A 5ENUA 1TDIA 1ERWA 5CRHA 4GSNA 1SYXA 2LSTA 3BCKA 2VL9A 5J3RA 5J4UA 4K7OA 3Q18A 3FW2A 3LXZA 2CT6A 3KZQA 5DAKA 2MBSA 3TKSC 1I9DA 3Q74A 1J0FA 4MPFA 5G31A 5CRGA 2K6VA 2HRKB 1HNAA 2FA4A 4ID0A 2CX4A 2YNXA 1PRXA 5JCWA 3L0HA 5CO3A 5HR2A 4ECIA 3DXBA 5ECRB 4OCFA 4GSTA 1HD2A 1GH2A 2VLVA 2HRAA 4HQSA 4WF4A 3BOAA 2OKAA 5IMCA 4Z7XA 3BJ5A 3QOUA 4PURA 4ML6A 5D9TA 4NMUA 1XFLA 1T3BA 20GSA 2B1KA 1V9WA 3E9JB 2C80A 3ZLPA 2HI7A 2RM5A 2AYTA 2YWOA 2H6ZA 2HSHA 1T4ZA 3DVXA 1SD8A 3GX0A 4K9ZA 1R5PA 4MK3A 1GNEA 1K0BA 10GSA 1M0UA 4QL7A 3C71A 5B8AA 3RHCA 4USSA 4MH3A 3F4TA 3FZAA 5DJMA 2H1DA 5DALA 3VI5A 3GUSA 1X5DA 3R3EA 1EOGA 4ECBA 5GAND 1FO5A 3V1WA 4K6XA 1ZL9A 2O85A 2JACA 4P3YB 5LD0A 4F2IA 4EKZA 1YEXA 1QUWA 2VD1A 4L0UA 3GURA 4LA1A 4L5OA 4D73A 3A2XA 4I6XA 4X1UA 4IBPA 3UEMA 4WF5A 4BVXB 2YOIA 1XOBA 1SL0B 3LQ7A 2YZUA 3BCIA 1Q98A 2PU9C 3O3TA 4PQHA 4IGJA 2DMLA 5ELAA 5KN3A 3CSJA 2KLXA 2EIQA 5IO2A 4F0CA 4HQZA 4F82A 1XWKA 2YJ7A 3GL5A 4I5QA 3HJMA 2IFQB 1M9AA 4BVYB 4XCSA 4DSSA 4O92A 2HE3A 3LJRA 5F05A 3E0UA 1X9WB 2WS2A 4K0GA 2H8LA 2DIYA 3UJ1A 3QCPA 5D96A 3RPPA 3FY7A 3TDGA 4KAEA 1U87A 2E7PA 1S3AA 4TR3A 1TK5B 1LJRA 1GWCA 1M2BA 1N8JA 4PQ1A 1JZDA 2IMEA 3LYKA 5GSTA 1TK8B 4HJMA 3LXTA 2JL4A 2HYXA 4EXJA 3GH9A 2CZ2A 3IE3A 1V58A 1F2EA 2IMKA 2KUCA 3O6TA 4EC0A 6GSVA 1T4YA 2XBIA 3FKFA 3KJYA 4NHZA 1U6TA 2F8AA 3H8QA 2NTOA 1WE0A 2JZRA 2A2SA 2R5GA 1B4PA 1CQHA 1KEBA 3IV4A 3FEUA 1MDIA 1THXA 2K8SA 4KB3A 1X0RA 2D2ZA 2O89A 2IMFA 3ZMKA 4J56E 3DIEA 2HT9A 3ME7A 2FUG2 4CDOA 1UA5A 1PKWA 2UZ8A 8GSSA 2JADA 3LG6A 5AGYA 3APQA 4KH7A 2LV3A 3KP8A 3EVIA 4NV2A 5BMUA 4K2DA 4WETA 1XWCA 5FWGA 2RUEA 3L9SA 3TCOA 4DEJA 1H75A 5DCGA 5A4UA 3UIWA 14GSA 3C73A 2V6KA 3IXRA 4ZL9A 2C0FA 4ACSA 5ECNB 2ZNMA 2E2GA 2TIRA 3EYTA 1SKWB 1O81A 1XVQA 1M9BA 1N2AA 2B7KA 3LGCA 3VWWA 3LWAA 1YKCA 2XC2A 2WFCA 1E6BA 4V2LA 4MP4A 5F8BA 3ZTLA 3C8EA 3M9KA 2YJHA 1IYHA 2PUKC 2NVLA 3DEXA 1F37A 1O8WA 1Z7PA 1GL8A 2H0IA 1PL2A 4G0KA 4PUAA 1FHEA 5DQSA 2GQLA 3ZL5A 1C72A 1AXDA 3RDWA 4E8EA 5IPHA 3QAGA 5EVOA 3WYWA 1TP9A 1Z7RA 3KMOA 2AJQB 3NZNA 2OE1A 4N30A 2X64A 3U6VA 2H6YA 1GSSA 2XBQA 3F4RA 4BL7A 1XWAA 2R6KA 3F4SA 3M8NA 1LU4A 5G1LA 3ZVJA 3APOA 4FH8A 3IAM2 1OC8A 4V1Ap 4ZIJA 2WZ9A 3ZMLA 2VLTA 3F6DA 1ILOA 2DLXA 2B3SA 3Q19A 3TJKA 2IIYA 2OE3A 2OADA 5DVBA 1KBNA 1TRWA 5D9VA 4EUYA 3GN3A 7GSSA 3IDVA 1DE2A 1VF3A 1EEJA 4GLTA 5B6NA 3H93A 4O5RA 4WXTA 4DSRA 2IN3A 2K18A 3KTBA 3TJFA 4GXZA 5KN2A 1ERTA 3HCZA 1AIUA 1TOFA 3WGEA 1RW1A 1A2JA 4XS1A 3F3QA 4BWQA 3F63A 5IMFA 3M0FA 1Q4JA 3SWLA 5D93A 5A4WA 4KDUA 1EGRA 1O6JA 3GKMA 3VURA 3GV1A 3VFIA 3EE2A 1VF2A 2LS5A 4PTSA 2DJ1A 3TRXA 1E2YA 2V6OA 1FOVA 3UBKA 4K1FA 1GSYA 2HXKA 4OFMA 2ES7A 3DWVA 3KXOA 3G7IA 3DD3A 2H0GA 3VWVA 3HVVA 5ELGA 3D5JA 1ABAA 5IMAA 1R5AA 3GNJA 3GRXA 5ID2B 3KH9A 2L6DA 2K9FA 4G2EA 4V2MA 4HU9A 1A8YA 2GSQA 2OBIA 4JE1A 4I2TA 1U88A 5G30A 4RQXA 1V57A 2V41A 3HVSA 1K3YA 3LEFA 4OFTA 4ZB8A 1A2LA 1NHOA 5IOXA 5EPFA 3I43A 4XTSA 2HLSA 3VPTA 1GTBA 2MZCA 4TXVA 1J08A 3J7Yb 4TR1B 2FD3A 2IMIA 3TUEA 3R2QA 1PX6A 1THOA 3A3TA 2F9SA 4ZL8A 4PUFC 3GKNA 2PBJA 4ECJA 1NSWA 3GA4A 5IMDA 3CSHA 2H76A 5G1KA 4O32A 4MDCA 18GSA 2Z9SA 4IP1A 1GSQA 2V32A 3KIJA 5JWRB 4G9HA 5IMZA 2GS3A 4TXOA 3LYPA 4MZBA 1ST9A 2F3MA 4KUNA 3IOSA 3ZFLA 2J9HA 3VWXA 2HQTA 2H74A 4MZWA 4IP6A 2LJKA 2H70A 1ON4A 3H4KA 5B6MA 4FO5A 5H5RA 1KTEA 1SENA 1EOHA 2VIMA 1XWBA 2X8GA 1TW9A 3IPZA 3HYPA 4KSMA 2J23A 2XPDA 2O8VB 1G6YA 2K8VA 4KA0A 5C04A 4QQ7A 5HFGA 5H5QA 1XVWA 1SKRB 1JLWA 4KCAA 3IHQA 2VL2C 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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