5D73A

Structure of wuchereria bancrofti pi-class glutathione s-transferase
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
207
structure length
207
Chain Sequence
SYKLTYFPIRGLAEPIRLVLVDQGIKFTDDRINASDWPSMKSHFHFGQLPCLYDGDHQIVQSGAILRHLARKHNLNGGNELETTHIDMFCEGVRDLHTKYTKMIYQAYDTEKDSYIKDILPVELAKFEKLLATRDDGKNFILGEKISYVDFVLFEELDIHQILDPHCLDKFPLLKAYHQRMEDRPGLKEYCKQRNRAKIPVNGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glutathione S-transferase
publication title STRUCTURE OF WUCHERERIA BANCROFTI PI-CLASS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE
rcsb
source organism Wuchereria bancrofti
molecule tags Transferase
total genus 73
structure length 207
sequence length 207
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5d73A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5d73A01
16GSA 12GSA 1K0AA 3KXOA 2IWTA 5DCHA 2K6VA 2H73A 5KN2A 1A2JA 5DDLA 4LLRA 2B5EA 1UA5A 4E8EA 1H4OA 5CYYA 2H6YA 5D9XA 5CRHA 2KUCA 6GSVA 4N0VA 2XC2A 2B1KA 1PX6A 5ECMB 1QGVA 4FYCA 4EKZA 1V57A 4TR1B 4JE1A 3FY7A 2K18A 1PGTA 3PH9A 1SYRA 4O5RA 1MDIA 1XOAA 3APOA 5HFIA 4NHZA 2C0DA 5H5RA 5C04A 2DMMA 4ZILA 1ZL9A 2JZSA 3HZ4A 2C4JA 4POMA 3P8WA 1BEDA 1QXHA 1ERUA 3IAM2 5DQSA 3GSTA 4WR4A 4CHSA 4PXOA 1EV4A 4ZXGA 4X43A 1JFUA 4GSNA 3ZRDA 4WR5A 4YH2A 3ZMKA 2R5GA 1K0MA 2FWHA 1T1VA 1OC3A 4FQUA 4OCEA 5AISA 5DAKB 3GN3A 1T00A 4MCUA 4V2LA 3D6IA 3LSZA 2HQTA 2IIYA 3F0IA 3LQ7A 6GSUA 2H30A 2L4CA 2ZCTA 1VGLA 1VF1A 3F6FA 3RPNA 2HRNA 2YN1A 3H1NA 4TKYA 3ZIJA 2F8AA 2CT6A 3TRPA 3CYNA 3UMAA 1DE1A 3FR3A 4LMWA 3ZZXA 2YANA 4KCAA 2H0IA 5IQYA 3HXSA 2JSYA 1SJIA 5JCUA 3IK9A 4I97A 5C00A 1T8EB 4OO5A 2AJQB 3DIEA 1T4YA 2R6KA 5JCWA 2H1BA 1U3IA 2L5OA 5IPHA 3FYGA 2WRTA 1OKTA 1R26A 4MK3A 3D4MA 2ON7A 5F06A 4EDZA 5INYA 1LBKA 3U5RE 3GH6A 4K2DA 2MMZA 4MF7A 3F9UA 2N5BA 3L0HA 3WGXA 1H75A 3E9JB 2AUVA 1T7PB 2GSQA 4KCEA 3IV4A 2HT9A 2WCIA 5KEJA 1SENA 1GSFA 1J9BA 4PQIA 1KNGA 1WPIA 4L0WA 4QL9A 1EWXA 2ZNMA 3ZLPA 3L78A 1WMJA 3EWLA 3CSHA 3ERWA 1SU9A 4GXZA 2DIZA 4K7IA 3QD9A 1YKAA 1X5CA 1VF2A 1GRXA 4PUAA 3M3MA 2LQOA 4EC0A 3F4RA 3TCOA 3HY2A 1Z6NA 1XW5A 5IMVA 1JLWA 2P5QA 1WWJA 2HRFA 1VF4A 5ENUA 1O7UA 2JZTA 3IBHA 4ECJA 2H72A 13GSA 3UBLA 3TB2A 1GSEA 4PTSA 4QQ7A 3KM6A 2EC4A 2WFCA 2YV9A 4MDCA 4I5QA 5ECLB 2N5AA 2MMOA 1JLVA 4MZCA 3DEXA 2DC5A 4WXTA 1S3CA 2MBSA 4AJ6A 2L5LA 2ES7A 1XWKA 2CZ3A 2VCQA 4K8MA 3TKPA 2L4QA 3W8SA 4MPFA 2VAFA 2E7PA 1AUCA 1M9BA 2B5XA 4DVCA 3G7YA 2H6ZA 5DALB 1YJ6A 5ECSA 3CRTA 2CVKA 3QAWA 3I9V2 2YWNA 2H0GA 1M2DA 1JZWA 2RLIA 3GH9A 1M2BA 4ZBDA 3KH7A 1R5AA 1JZDA 4YQMA 3VURA 17GSA 2JZRA 2FLSA 2M80A 1NHOA 5B6NA 4E8HA 4HDEA 3FKFA 1GULA 3BBYA 1ZCPA 3TOTA 1GWCA 1O81A 2RM5A 2MMNA 1GUMA 3I69A 2M72A 5HFKA 2NDOA 1EOHA 3GX8A 4IGJA 14GSA 4MJAA 2LRNA 2H71A 1X9SB 1F3BA 2RM6A 4GWRA 3IHQA 3SBCA 4IS0A 1B9XC 1PSQA 1V9WA 5G1LA 3W8JA 4IELA 3KH9A 1Z6MA 2GZPA 1XWAA 4TR0A 5JWQB 3GYKA 4G0LA 2NBSA 2YNXA 4ML6A 4MZBA 2I81A 3IA1A 3KTBA 4HQZA 4MMMA 2O87A 1GSQA 3IPZA 1TU8A 2PVOC 1OAZA 4IJ3A 1WOUA 4I2UA 4Z7XA 4LMVA 3WT1A 3IXRA 2YP6A 1TJDA 3F4TA 4ZB6A 4BVXB 4FH8A 4GCIA 5LCZA 4OFMA 4BVYB 3TKSE 5IO0A 2BTOT 1CQGA 4O32A 2KP2A 4J2FA 4L5LA 1KTEA 2A2RA 4ISDA 1O8XA 1GP1A 2IL3A 2JADA 2AYTA 3OR5A 2V2GA 2JSZA 3KEBA 2VCZA 3HCZA 2B1LA 2VUPA 2TRCP 2LJRA 4KA0A 2IMEA 2GDRA 4G0KA 1Y6EA 3VI5A 3DVWA 2B6MA 1OC9B 5F07A 4TR3A 4DSQA 4J57E 1B48A 3RDWA 1W89A 2IPAA 5A4WA 4ZL7A 4XS4B 2GSRA 3UVHA 1RW1A 4MF5A 2OADA 1XW9A 2IJYA 22GSA 1ZMAA 1TXXA 1B8XA 1GTAA 4D73B 1TK0B 3S9FA 2K8SA 3US3A 3TGZA 3BCIA 2LS5A 2VCWA 1A24A 2H0HA 3F63A 1ERVA 2HSMA 3QAGA 3EYTA 2V1MA 2PMTA 1HNCA 5ID2B 3QCPA 5ECHB 4G10A 3LYKA 3IAS2 3Q19A 1FB6A 5IM9A 2IMKA 1ILOA 3KIJA 5KN0A 2YOIA 4JU5A 3GKKA 4EVMA 1Z3EA 5G30A 5CREA 3KJYA 1THXA 2QSIA 1R5PA 4ZL8A 2BMXA 2IMDA 1A8YA 2NVLA 4BA7A 5GSSA 1YF0A 2X8HA 1FOVA 1YF1A 1AQWA 3GNJA 3PPUA 4KSMA 5H5QA 4LL4B 4MPGA 3QAVA 1I9DA 3FZAA 3IK7A 1THOA 5DVBA 3FEUA 4MA9A 4O7HA 2G2QA 3GFKA 2J23A 4OD7A 4GRFA 3WD6A 1K0DA 2UZ8A 3V1WA 2DJ0A 3RHBA 4TR1A 4HOJA 4PUFC 1TU7A 2EIQA 1GTBA 3VWUA 1BG5A 4EXJA 3O6TA 5AGYA 1SKRB 3TKSC 3WGDA 2PBJA 1ZYEA 1G0TA 1QMVA 3C8EA 3M9JA 3FHKA 3PINA 1AXDA 2LKUA 4NMUA 5D9WA 4TVEA 4WF4A 2I1UA 4PGTA 2K8VA 4HJMA 2V32A 2NPBA 3TJBA 20GSA 4ZBBA 4EDYA 1R4WA 2OE3A 1OYJA 4IBPA 3FZ4A 2HSHA 5CRWA 5FWGA 5JCGA 3M9KA 4PNGA 2P0GA 1SL0B 2VL2C 1TP9A 1BX9A 5DAKA 2N5FA 1K0NA 4PQHA 5IO2A 2TIRA 1OC8A 2C0GA 4IVFA 2FCHA 4GLTA 1SKWB 1QFNA 3GUSA 4F2IA 2D2ZA 3CTFA 3G7IA 1B4PA 4FYUA 1Q98A 3M8NA 4POBA 1ST9A 4WETA 3KP8A 3VFIA 6GSXA 5ECKB 1SK0A 4RQRA 4ZB8A 1V58A 3CTGA 4F0BA 5IOXA 2HZFA 3KZQA 1G7OA 2IFQB 3UL3A 2CX4A 2GSTA 1F3AA 3EMXA 3TRXA 4KE3A 1M0UA 1QQ2A 2KHPA 1ZGNA 1MEKA 2YZUA 1XXUA 4QL7A 4K9ZA 3LXTA 1XCCA 1GSYA 1TK5B 2OJLA 4H86A 4RI7A 1U88A 2V6KA 1IYHA 4F82A 2H1GA 1GNWA 3GRXA 2WDUA 3LFLA 2CVDA 5H5SA 1HYUA 4ZBAA 1EGRA 4N30A 1HD2A 2LQQA 3ZREA 4N11A 4FYBA 4V1Ap 3TKSA 4F9ZA 5EPFA 5IMCA 1R7HA 3C73A 3EMPA 1XVQA 3BCKA 3TJFA 4ECIA 4PURA 3HHVA 5ECQB 1SD8A 1A2MA 1ZZYA 2A4VA 1F6MC 3GMFA 1MD4A 5ELGA 1B9YC 4WBJA 2CVBA 1YDKA 1GLPA 4TN8A 2B3SA 2GQMA 1SL2B 4K1FA 3L9UA 1FG4A 3DYRA 2YWIA 3QMXA 3CSIA 1EOGA 4I2TA 3H4KA 4NPBA 3HZ8A 5B8AA 3UAPA 2EIOA 2VL2A 2C8UA 1BYEA 1GLQA 3EURA 5DBQA 3VK9A 2HZEB 3A2WA 5F05A 2DJ1A 2DLXA 1MDKA 5ECNB 1XOBA 4POLA 4IHUA 4XS6A 3DRNA 1AAZA 1UN2A 3ED3A 5IMZA 3LYPA 2CQ9A 5EY6A 2VLVA 4V1Ag 2KP1A 5DALA 3LEFA 4I6XA 3EU3A 2C3TA 2IMIA 2GS3A 3DKSA 2HFDA 5D93A 5DQYA 3LORA 3HD5A 2YJHA 4PNFA 2R3XA 2WZ9A 5AIXA 2H6XA 2F3MA 4MLYA 2HRKB 3AY8A 2A2SA 2AHEA 4KX4A 2DJKA 1V40A 3M1GA 4KGIA 3A2VA 4ECCA 2E2GA 2YPMA 4MABA 3DXBA 1HNBA 4X0XA 3IC4A 2IN3A 4JRRA 2AV4A 2E2MA 3ZIVA 1TDIA 4NV5A 2C3NA 5HR0A 2H75A 5DJLA 3TKRA 1IYIA 3KTLA 3FR9A 1O6JA 2KOKA 3HA9A 3H93A 1FHEA 3ME7A 3IOSA 5JWRB 2VLUA 1F37A 2MBTA 2VOCA 1M7TA 1FB0A 4DSRA 1PL1A 4KUNA 4L0UA 1QUWA 2YZHA 1M99A 4TXOB 1TK8B 5HFGA 2F9SA 1E6BA 2H76A 1FVJA 5CAXA 4KAEA 4MZWA 1PKWA 1TOFA 1JZRA 2HE3A 1XBSA 3ZVJA 1V2AA 19GSA 2VCXA 4HUAA 2DBCA 3KMNA 3ERGA 3LG6A 2O7KA 1U6TA 4BVXA 1TTZA 3P90A 3J7Yk 4MH2A 3H79A 2HNLA 4BVYA 5B8BA 2CZ2A 4RI6A 1M2AA 4K7NA 3A5WA 4WBRD 5J41A 3QPMA 4XIHA 3Q74A 5HQPA 1ACVA 2H66A 3IRAA 6GSYA 3GL3A 2VL9A 2L6DA 4NHWA 2XBQA 2GTUA 4ZB9A 2R2JA 1PA3A 2GZZA 4Q5NA 1YKCA 4HU9A 1OC9A 4IQ1A 3UBKA 3JCML 2FNOA 3L9VA 4XS4A 1RQMA 4GQCA 1TI3A 2HRAA 3UEMA 3EINA 2HI7A 4POKA 3C1RA 3HYPA 3VWXA 2LJAA 4D73A 4NV2A 3DWVA 3KP9A 1VRSD 2M46A 4HI7A 4YAPA 2FD3A 3NZNA 2FY6A 3VPTA 3WGEA 3CXGA 5IIZA 3CSJA 2PU9C 5IMFA 2FHEA 3ZITA 2J9HA 5ID2A 4ECBA 2LEGA 1LJRA 5ECOB 1TW9A 1X5DA 2REMA 4JR6A 5A4VA 2XPEA 3GV1A 1X9MB 3D4TA 3N9JA 5J5NA 4KDUA 3SWLA 2GT5A 4FIWA 4KDXA 1YEXA 5CNWA 2E0QA 5KN1A 5G2ZA 2FWFA 1F2EA 6GSWA 1SJ6A 3BOAA 18GSA 2XPDA 3TJJA 3ZYWA 1A0RP 1GSDA 10GSA 4EL1A 1SJZA 1XIYA 5IPGA 2R4VA 1Z5YE 3GSSA 5F8BA 3ME8A 4JZQA 3A2XA 1J0FA 5G1KA 1NW2A 3H8QA 2CAQA 1S3DA 4ILFA 5J4UA 3KGKA 2MZCA 4I8BA 2PVQA 2I3YA 5LD0A 4BL7B 1I5GA 1EP8A 4NXIA 2JACA 2CAIA 5LNKe 4KDYA 1OKDA 4MJBA 5D96A 2I9HA 4USSA 1K3YA 2XBIA 2YWMA 2VIMA 4KW6A 2F51A 3MDKA 4ZL9A 2H70A 2X99A 4NWYA 9GSSA 2DJJA 2HSYA 1WJKA 2GGTA 5KN3A 4MJEA 2CA8A 1PRXA 1BAYA 2FUG2 2JL4A 1XPVA 2JU5A 4PQ1A 3A3TA 4IKHA 2VL3A 3PR8A 1A0FA 2K9FA 4ML1A 4GF0A 3P7XA 1OE8A 1PL2A 3Q18A 5HR2A 1U3AA 1EEMA 4KNDA 4K0NA 4WKWA 3FR6A 4V2NA 1XVWA 5D9VA 5ECRB 3RBTA 6GSSA 2C0EA 5DJMA 4DSSB 5ECPB 2QC7A 1TRWA 4RQXA 2YCDA 3FZ5A 5A4UA 2RUFA 1PKZA 4L5OA 4EO3A 1MDJA 2HLSA 4N10A 3M0FA 4K0GA 3I43A 2OBKA 5E59A 4IQAA 3EC3A 1ML6A 2IFQA 4BWQA 1VF3A 5E4WA 1T4ZA 3KMOA 1O8WA 1NHYA 4G2EA 2L59A 2VM2A 5HR3A 3GTUB 2DJ3A 3DD3A 2H1AA 2AAWA 3QFBC 2VO4A 2FGXA 4TR4A 3UOMA 4EE0A 4HJ2A 3RPPA 4PX1A 2GQLA 4HU7A 1O73A 1EP7A 3IE3A 3KD0A 2RIIA 4EF0A 5GZZB 3CBUA 2HYXA 2WJUA 4OMVA 1DUGA 1AQVA 4V2MA 3ZFBA 4KSOA 1T3BA 5CRDA 1G6YA 2PERA 1KEBA 2LNSA 1U87A 3HVXA 4XS1A 3GKXA 1RK4A 1Z7PA 3UVTA 2V6OA 5IMAA 4P3YB 3U6VA 1KBNA 2LTKA 2LV3A 3CRUA 4GQFA 4TXVA 4RUVA 4AGSA 3Q6OA 3VPQA 2WULA 4YQVA 5CP1A 2PGTA 3F4SA 3HVSA 1XW6A 2L6CA 1Y25A 4G19A 4F03A 1Q4JA 4CDOA 4AJ7A 3GHAA 4Q5QA 3K8NA 4KB3A 1AQXA 2C80A 3TUEA 3MNGA 1N2AA 3EE2A 1XWCA 1YZXA 2XHFA 2WGRA 3QDNA 2HZEA 5G5FA 2OKAA 5GAPD 2FA8A 3MAKA 3KCMA 5L71A 1O85A 1EZKA 1NSWA 1MD3A 3ZFLA 1SK2A 2C0FA 2LNTA 7GSSA 1G7EA 2L57A 2VD0A 5EVOA 1GTIA 2QGVA 3F3RA 3TKQA 3UIWA 3WYWA 1WE0A 3GIXA 3RHCA 2CV4A 2HRKA 3TRQA 4KH7A 4BPYA 3RAZA 4JBBA 3VWVA 4IW9A 4ZIJA 4IP1A 5D8IA 4NAXA 2BJXA 2X8CA 2MYGA 4XHMA 1TKDB 3TDGA 1DE2A 3APQA 3ERFA 4XRDA 2LRTA 3E3EA 4K7OA 1WIKA 2NTOA 1WRYA 3D5JA 2PN8A 1QK8A 4TXOA 2O8VB 3HDCA 2GVPA 1FO5A 3HJOA 4MJCA 2GLRA 3VI7A 3DMLA 3F3QA 4XCSA 1F9MA 1EEJA 4J56E 2P31A 1C72A 3HKRA 1FAAA 2PPTA 3IDVA 4IP6A 2B7JA 5FHIA 3IC8A 5J9CA 1GUHA 3QOUA 1B4QA 3F8UA 2OBIA 2H8LA 3C7MA 2C3QA 1K0CA 2YJ7A 3MWHA 1N8JA 5AN1A 1E2YA 4X1UA 4HEA2 2DIYA 3FZ9A 2F8FA 3GKMA 1XWGA 1YEPA 5B7CA 2QKEA 2H1DA 1AW9A 4JEDA 3G7JA 3C71A 1TRVA 2DJ2A 2VM1A 2VD1A 3HJMA 4ID0A 2LSTA 3TOUA 1X0RA 1YY7A 4LL1B 3E0UA 1X9WB 1PD21 5G5EA 4Q5RA 5J3RA 3WT2A 2P5RA 4TW5A 5J9BA 11GSA 3P2AA 2KLXA 3GURA 3VWWA 2R37A 3DVXA 2ALBA 3HJPA 6GSTA 1Z9HA 4AJ8A 1G6WA 3L4NA 4WEYA 3TJKA 1SD9A 2H19A 4HQSA 3FRCA 3VLNA 1AC1A 3GKNA 2DSAA 2TRXA 2V41A 1OE7A 3BD2A 2YV7A 4BWSA 3MSZA 1K0OA 1X5EA 1K0BA 1A8LA 4OWYA 1PQNA 1JZOA 3ZL5A 1GH2A 4HZ2A 3TJGA 5B6MA 5JWOB 1V98A 3R2QA 3DGQA 1EV9A 5F0GA 3W6GA 1CQHA 3GL5A 3D21A 3GX0A 1A23A 4CW9A 2RUEA 3QFAC 3LWAA 5EL8A 4XTSA 4YAVA 2GZYA 1TI1A 2OE0A 3BJ5A 1HNAA 2VCTA 2O85A 1Z7RA 4OFTA 4MH3A 5D73A 2YWOA 2OE1A 4GTUA 2VCVA 1URMA 2MMAA 4GSTA 4MP4A 3ZMLA 1W4VA 5CRGA 2LUSA 2ZUPA 2IMFA 3FW2A 4G9HA 1TRUA 2WB9A 1GUKA 1GNEA 5ECIB 1BJXA 2Z9SA 2GQKA 1DBYA 1K3LA 4BL7A 2HSNB 3LJRA 4OCFA 5IOWA 2LRCA 4TRXA 8GSSA 2DMLA 3O3TA 4JR4A 3APSA 2GT6A 1SKSB 1GTUA 1WP0A 2LJKA 2GSSA 4L8EA 3L9SA 3LXZA 3O76A 4YQUA 2WS2A 3QR6A 5COHA 5A5KA 2VLTA 2H01A 1BQ7A 4WF5A 5D9TA 4HZ4A 1J08A 1A2LA 1TRSA 4ACSA 5CO3A 4HS1A 3I6AA 4O92A 3HVVA 1FW1A 3PGTA 3EU4A 2PUKC 4G0IA 3GA4A 3R3EA 2X8GA 5ELAA 2OA7A 3J7Yb 1XFLA 5G31A 1JHBA 3UARA 3D0ZA 3NOFA 4XRAA 4DSSA 4AF2A 4IJIA 4N0ZA 2FWEA 2B5YA 2B7KA 4OO4A 1PN9A 4GSSA 3UJ1A 2ON5A 1HQOA 1XWBA 2PWJA 2HXKA 1S3AA 4KF9A 1AIUA 1USBA 3C1SA 5DCGA 1M9AA 1OVNA 2C1YA 1GL8A 1ABAA 1YQ1A 3GTUA 5FT3A 1GSUA 1UVZA 4TOPA 3LGCA 3FK8A 3F6DA 1MTCA 3ZTLA 5AIVA 1SL1B 4OFNA 1ON4A 1LU4A 3NIVA 1UC7A 2I4AA 1ZOFA 1FVKA 1SK1A 5IMDA 1EGOA 2O89A 2H74A 1ERTA 2X64A 1XZOA 1PMTA 2HSMB 2FWGA 4Q5FA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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