5D9V | Genus

Total Genus 67

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	67
sequence length	211
structure length	210
Chain Sequence	MGVEVCVKAAVGHPDTLGDPFSQRVLLTLEEKKVPYEMKLIDVQNKPDWFLKISPEGKVPVFNGGDGKWIPDSDVITQVIEEKYPTPSLVTPPEYASVGSKIFSCFTTFLKSKDPNDGSEKALLTELQALEEHLKAHGPFINGQNISAADLSLAPKLYHLQVALEHFKGWKIPEDLTNVHAYTEALFSRESFIKTKAAKEHLIAGWAPKV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	Dehydroascorbate reductase
publication title	Structural understanding of the recycling of oxidized ascorbate by dehydroascorbate reductase (OsDHAR) from Oryza sativa L. japonica pubmed doi rcsb
source organism	Oryza sativa subsp. japonica
molecule tags	Plant protein
total genus	67
structure length	210
sequence length	211
ec nomenclature	ec 1.8.5.1: Glutathione dehydrogenase (ascorbate).
pdb deposition date	2015-08-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13410	GST_C_2	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A	PF13417	GST_N_3	Glutathione S-transferase, N-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1050.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	5d9vA02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	5d9vA01

1M2BA 3RAZA 4DSSB 3ZVJA 1DUGA 1K0MA 4GSSA 2JSZA 4OO5A 2H74A 4V2MA 1E2YA 4F0CA 2GTUA 1ST9A 2BMXA 2C0FA 1R5PA 2VL9A 4FQUA 2H6ZA 5B6NA 5DQYA 4GCIA 10GSA 1FVJA 1TI1A 1ZCPA 2MMOA 3KTLA 2CVDA 3GKMA 5GAPD 4MJCA 1OVNA 5D73A 3DD3A 4CDOA 3KEBA 3APQA 1ERVA 3KXOA 4IP6A 2K8SA 4V1Ap 3IK7A 4F82A 4CW9A 2HSNB 2QGVA 3L9VA 4POLA 2YPMA 2BJXA 4WF4A 4F03A 1OKTA 7GSSA 2GQLA 4K7IA 4KCEA 2LSTA 3QCPA 2GSTA 2BTOT 1SJIA 1XCCA 2FWGA 1PD21 4EF0A 3HXSA 3ZYWA 5F0GA 1JZWA 4MDCA 1NSWA 2LJAA 5GZZB 2K9FA 2KUCA 2PMTA 1Y25A 2YZHA 3CYNA 2LQOA 5AISA 2R37A 3ME7A 2JL4A 5CO3A 4F9ZA 3N5OA 1BX9A 3EU4A 2IMIA 4RUVA 3CSHA 4XRDA 4XIHA 4WXTA 1YEPA 2DC5A 5HR2A 4G0IA 1GWCA 3FZAA 1WWJA 1WOUA 3VURA 2GS3A 1SD8A 3TRQA 3TOTA 5CREA 4ZBBA 2LUSA 2VCZA 1VRSD 1B9YC 3A3TA 5GSTA 1SK1A 3GRXA 6GSVA 4L5LA 3FR3A 2M46A 4ACSA 2LV3A 2H1DA 2WZ9A 2FGXA 2JSYA 2CAIA 3IC8A 1H75A 4JR6A 3FRCA 4K6XA 3GA4A 1K0DA 2VM1A 3ZMKA 2OADA 3WD6A 1JZDA 2HRNA 1ERTA 4BA7A 2PVQA 4AGSA 4EDYA 2AJQB 3KGKA 2O8VB 4TXOB 4WR5A 3VK9A 1ZYEA 3UOMA 1OE8A 3ME8A 5J41A 3RBTA 4MH2A 1GSDA 4MJAA 4OFNA 2VM2A 2GZZA 4EC0A 2FY6A 3ZLPA 1KBNA 5JCUA 2YJHA 3FY7A 4MA9A 1TK8B 4I2TA 4NHZA 5DJLA 4JE1A 3ZL5A 4BVYA 3LFLA 4O92A 2H0GA 4PNFA 4WKWA 2WDUA 1GTIA 3NIVA 4I8BA 4I5QA 5ECSA 4HU7A 4WF5A 2I1UA 3TDGA 3F3QA 8GSSA 2LJKA 2V6OA 5A4UA 2OE1A 2N5AA 1V2AA 2R3XA 1GSFA 1VF4A 4L0UA 2CZ3A 2YWMA 3TCOA 2FWEA 1DSBA 4LMVA 4F0BA 2GT5A 22GSA 1A0FA 2L59A 1GSUA 1UN2A 3GSTA 3H4KA 4Q5QA 5KN0A 4HOJA 3D4MA 3M1GA 1M0UA 2RUFA 1FOVA 5L71A 4HUAA 3WGDA 4TR0A 4EUYA 1B8XA 1SYXA 1T4ZA 1X9WB 4TOPA 2NTOA 4FYBA 4WEYA 4KA0A 4OWYA 1ON4A 3BCIA 3K8NA 1R4WA 3ZMLA 4USSA 4ISDA 1Z9HA 3EYTA 1GSSA 5CRGA 1AXDA 1OC9B 2IPAA 2YV7A 2AB6A 3EU3A 3L9SA 2FNOA 2KP2A 1ML6A 1PGTA 2FA8A 2H1GA 3FR9A 4OO4A 1EGOA 12GSA 2F8FA 1VGLA 2WCIA 1T3BA 4IBPA 3GKKA 3UMAA 3L9UA 3H93A 4X43A 4HQZA 3VWXA 1UC7A 2MMAA 3KD0A 1EZKA 3UL3A 3BBYA 5AGYA 1I5GA 1OE7A 1GP1A 1TU7A 4DSSA 3VI7A 5J5NA 4H86A 4PQ1A 3VPTA 1GTBA 2CQ9A 1JZOA 4POMA 4ZXGA 2C0GA 2FLSA 4IELA 1ZOFA 1MD4A 3GX8A 2DJ0A 3UBKA 3GH6A 4IW9A 4EDZA 3GV1A 4IP1A 5ECIB 14GSA 2H6YA 2DSAA 4MZBA 3RPNA 2PPTA 5AN1A 1AW9A 5D9WA 2YN1A 5INYA 4LLRA 1ZYQB 3D22A 1WP0A 1IYHA 3DWVA 2KHPA 2GGTA 3Q6OA 1SK0A 2L57A 3F63A 1ZMAA 3EC3A 2O85A 2VL3A 1PQNA 4PQHA 4BL7B 2PGTA 5C00A 1X5CA 1K0BA 16GSA 5JWQB 2HT9A 3QDNA 2OACA 2YWIA 3VLNA 3VPQA 1A8YA 2O7KA 4IJ3A 4ULXA 3GL5A 5AIXA 3FYGA 1K0CA 1EP8A 5DAKA 4NPBA 3ERGA 1TRVA 2X99A 4Q5NA 2KP1A 4TR1A 2VLUA 5C04A 2GQKA 4ML6A 1BQ7A 2O89A 4TR3A 1SKRB 3CTGA 1PKZA 4BWQA 2E2MA 4IKHA 3IC4A 2HSYA 1XFLA 1JFUA 2MBSA 2B5XA 3LXTA 13GSA 1A2JA 3EMXA 3IHQA 3A2XA 4MK3A 1FO5A 4HZ4A 1QUWA 4OCFA 3HJPA 1HNCA 3ZTLA 3PGTA 2REMA 2X8CA 2R6KA 4MCUA 2VCTA 3TJGA 2PVOC 3HY2A 2YJ7A 5KN2A 2B1KA 5EVOA 5ENUA 2FD3A 5ECLB 1SL0B 2K6VA 2GSQA 3TUEA 1G6YA 5COHA 5IM9A 4KDYA 1HQOA 2X64A 5IMZA 2NPBA 5CP1A 3TKPA 2D2ZA 1G0TA 5ID2B 4IJIA 1X5EA 4ZB6A 2Z9SA 2EIRA 4KE3A 2HRKB 3GTUB 1F3BA 2MMZA 4GWRA 1THXA 4Q5FA 3QOUA 2F3MA 2HZEB 2CVKA 1EOHA 1GNWA 1M7TA 4KB3A 2CZ2A 3M9KA 1SU9A 3KIJA 3TRXA 2LS5A 1RW1A 5LNKe 1FG4A 2C3TA 1WJKA 3GKXA 4GQCA 4FYCA 4NHWA 2HFDA 2WS2A 2ZUPA 3UJ1A 2VD1A 1GL8A 3C7MA 3GSSA 4V1Ag 1OAZA 3WGXA 4QL9A 4GTUA 1PL2A 4K2DA 2E0QA 1TU8A 2XHFA 1LJRA 3SWLA 2WB9A 5IMCA 4XS4B 3GNJA 2GVPA 3EURA 1THOA 1TRSA 1ERWA 1J0FA 4JZQA 1GULA 2EIQA 1RK4A 5DBQA 4O7HA 3GMFA 2RIIA 2TRCP 4KDXA 3GX0A 5ECRB 3DGQA 3UAPA 5ABRA 2GT6A 4K0GA 5EPFA 1PSQA 4Z7XA 2HNLA 1V40A 1O7UA 3F0IA 3W8JA 4DEJA 4TN8A 3CRUA 3RPPA 1GUHA 1TK0B 1KTEA 3G7JA 2LEGA 1VF3A 1O85A 2L6DA 5B7CA 1XW9A 2EIOA 2B5EA 1EOGA 2C3QA 3QR6A 3BJ5A 2MBTA 5IQYA 4NXIA 1RQMA 2HLSA 5H5QA 4G0LA 1N2AA 4KF9A 4L5OA 3PH9A 3P8WA 4N11A 5J9BA 1EGRA 1GSQA 1SYRA 2DIZA 1OC9A 4QQ7A 4POKA 2DJJA 3I43A 17GSA 2H76A 5F8BA 1AAZA 2A2RA 4CHSA 1TKDB 1T00A 4NAXA 1XIYA 3F4TA 4HZ2A 1ZZYA 3Q19A 2B6MA 3FR6A 1T4YA 2HYXA 2AAWA 4L8EA 3WYWA 3FW2A 2LQQA 2C0EA 2B3SA 3D6IA 3WGEA 3TGZA 2P0GA 1K3LA 1XWKA 3KMNA 1QFNA 1BJXA 5AIVA 1O8XA 3IDVA 3Q74A 2FHEA 2TIRA 3R3EA 1PX7A 3G9BA 2C3NA 3UBLA 1GH2A 3ZREA 4IHUA 1MDJA 5G5EA 3W8SA 4FYUA 4IS0A 3TRPA 4MJEA 2KLXA 5IOXA 3WT1A 3EINA 1TDIA 1BG5A 1GLQA 2DIYA 5DJMA 4HJ2A 3IRAA 1XVWA 1FB0A 2LKUA 4KW6A 4V2NA 1UA5A 3VI5A 2NBSA 4HDEA 4NMUA 2AHEA 1SENA 5HR1A 1OKDA 4KSMA 5IPHA 4KX4A 5DCGA 2H0IA 5G1LA 5DALB 2R2JA 2NVLA 1BYEA 1O81A 2DBCA 1LBKA 4LL4B 3L0HA 4BL7A 4AJ8A 3I9V2 1MDIA 3GN3A 4F2IA 3O76A 3FHKA 1C72A 1OC8A 1YDKA 3C71A 2L4QA 4NWYA 2RUEA 4JRRA 3LQ7A 3DVWA 4X0XA 3HKRA 2IFQB 2P5QA 1SL1B 4HU9A 2H19A 3KCMA 1U3AA 5IOWA 1GSEA 4MJBA 3C73A 1AC1A 1USBA 1ZL9A 5H5SA 4MF6A 3KH7A 11GSA 4EL1A 3LSZA 5G5FA 1UVZA 2L5LA 4G2EA 1TP9A 2PWJA 4XS6A 4LA1A 4ID0A 4IQ1A 4ZL8A 4K1FA 3LXZA 3P90A 3HVXA 5B8BA 3TKRA 3DVXA 3KJYA 5ECPB 1XZOA 1Z6MA 2VLVA 2ZCTA 1EV9A 2G0FA 3KTBA 4LMWA 2H70A 2H66A 3RHBA 3EWLA 1QGVA 1K3OA 4PQIA 1EP7A 4HEA2 1CQHA 4MLYA 1SK2A 4KDUA 1O73A 3HDCA 5E4WA 1AQVA 1TK5B 1B48A 4ZL9A 4TVEA 4YQUA 4GQFA 3OR5A 4KCAA 3TJKA 3BOAA 2JZRA 4J57E 2OA7A 1HNAA 5KEJA 2B7JA 1GUKA 1FHEA 2HI7A 1EEMA 3CMIA 2V6KA 1EWXA 2YP6A 4KAEA 1H4OA 4GXZA 2PBJA 3F4SA 4GF0A 4K8MA 1S3AA 1EV4A 3VWVA 5ID2A 2HE3A 4XTSA 4GSTA 4XHMA 4PTSA 5DQSA 1FVKA 3KZQA 3QFAC 2VCXA 3IPZA 4RQRA 3GTUA 4G0KA 3US3A 3D0ZA 2JADA 1XWGA 3HJOA 4DSQA 5B8AA 3CSIA 3IV4A 1U88A 1XVQA 3JCML 4K7OA 4WBJA 3NOFA 1ERUA 3QAVA 1PKWA 1U3IA 1ACVA 3RDWA 1MD3A 2IMFA 3KP9A 1GLPA 1TJDA 4K7NA 1B4PA 2ON5A 4ZBAA 3F9UA 2WRTA 1S3CA 1QXHA 2E2GA 4Q5RA 2AYTA 4ECJA 1JLWA 2RLIA 4D73B 4OFMA 4MP4A 4MZCA 4XS4A 1GTAA 3F8UA 5ELGA 5HFKA 2FA4A 2GLRA 5DVBA 5F05A 4BVYB 5HFGA 5FHIA 2OKAA 3EE2A 5IMFA 2DLXA 1AQXA 2H1AA 1M9AA 2RM6A 2MYGA 1PMTA 1M9BA 1E6BA 4I6XA 3LGCA 4E8EA 5CRDA 2LTKA 1NHOA 2H73A 4XS1A 1EEJA 4JBBA 1YY7A 3GKNA 1YJ6A 2XC2A 3APOA 3M0FA 5F06A 3UARA 1WIKA 5JCWA 5J9CA 1K0OA 4YQMA 1K0NA 3FZ9A 1M99A 5A4WA 2R5GA 5F07A 3DYRA 3F3RA 6GSTA 3Q18A 2YZUA 3ZRDA 4AJ7A 2A4VA 19GSA 4IQAA 3UIWA 3ZIVA 4MMMA 2CAQA 2V1MA 3IAS2 2C8UA 2IIYA 2JACA 5IO0A 3E3EA 1LU4A 3QFBC 3VWWA 4KH7A 2OE0A 5G31A 2C4JA 4P3YB 2XPDA 2G2QA 3J7Yb 1TW9A 1XOBA 1DE1A 1U87A 3ZIJA 2GZYA 3HZ4A 2GQMA 1YQ1A 1XW6A 2CT6A 4NV5A 1G6WA 1Y6EA 3PINA 3TJBA 4IN0A 5FWGA 4KUNA 5JCGA 3AY8A 5LCZA 1O6JA 4PX1A 3DRNA 4TXOA 1TOFA 1PN9A 3IK9A 3D21A 3GH9A 2GZPA 4N30A 2VAFA 1Q98A 6GSXA 5GSSA 4O32A 5IMDA 2B1LA 5D9TA 3IOSA 1DBYA 3G7YA 2FWHA 1DE2A 3EVIA 2AV4A 2ZNMA 1FW1A 2J9HA 2JZTA 1X9MB 2XBIA 3IA1A 5CRHA 3ZVJD 2A2SA 2VO4A 1AIUA 3KH9A 3O3TA 1A8LA 2O87A 2VUPA 5G30A 4PUFC 4EVMA 2KOKA 1GRXA 5D9XA 2VCQA 5IMVA 2FUG2 2AUVA 4RI7A 5DCHA 2HSHA 1F6MC 5DALA 3MWHA 1NHYA 4HI7A 1XW5A 2CX3A 2X8HA 4ZBDA 1ZGNA 3QD9A 1S3DA 1XBSA 1HNBA 3QAGA 5CAXA 3HVSA 4ECCA 1X5DA 5H5RA 2IMDA 2H0HA 2OBIA 2WJUA 1YKCA 5DDLA 1R7HA 3C1SA 3ED3A 1AQWA 3ZZXA 2H30A 2I81A 2IFQA 1WMJA 4GLTA 5JWRB 2LRTA 2IMKA 3CRTA 3GIXA 1K0AA 4WETA 5J3RA 3CBUA 2VL2C 3TJJA 3PPUA 2YWNA 2RM5A 4BVXB 1XXUA 1CQGA 2K18A 1Z7PA 1SKWB 4KGIA 1K3YA 3LORA 5KN1A 2VCVA 2I3YA 3DEXA 1WE0A 2YOIA 2NDOA 2GSRA 1J9BA 4KNDA 1XWAA 2IN3A 2QC7A 5JWOB 1SL2B 2VCWA 3TKSC 4N0VA 1YF1A 2CV4A 3QAWA 3FK8A 5DAKB 1AUCA 1PX6A 4TR4A 4TR1B 3A2WA 3M8NA 4ILFA 3LWAA 2WFCA 1GUMA 4WBRD 2H01A 4J2FA 1TRWA 4WR4A 5HFIA 1XPVA 3FKFA 1URMA 3G7IA 3H1NA 1MEKA 2DMMA 4OD7A 3UVTA 1HYUA 1VF2A 4HQSA 2HRFA 1V98A 4MF5A 2UZ8A 3ZITA 3ERWA 3IE3A 4OCEA 2ON7A 3RHCA 2LNTA 5D8IA 2J23A 2QKEA 3TB2A 5BMUA 3M3MA 4PUAA 4KSOA 4YAVA 5ECQB 6GSWA 4EKZA 6GSYA 3LEFA 2HSMB 3R2QA 4LL1B 4N0ZA 1XOAA 4GSNA 4TW5A 1V58A 2HRAA 1XWBA 4L0WA 4XCSA 3DMLA 3L4NA 3GFKA 1HD2A 1NM3A 4EO3A 2F9SA 3MAKA 4FO5A 4ECBA 4TXVA 1YEXA 3LYKA 4OMVA 2H71A 3HCZA 1IYIA 1R26A 4IGJA 1MDKA 3A2VA 2GSSA 3W6GA 2YANA 4FIWA 3I69A 4D73A 2L6CA 3C1RA 1BAYA 4TRXA 2H72A 1ILOA 3HYPA 5D93A 1Q4JA 5B6MA 5HQPA 3GYKA 5IMAA 3DIEA 2V2GA 5ELAA 3WT2A 1WRYA 3A5WA 2C0DA 3FEUA 2MMNA 2H8LA 3IXRA 3SBCA 1A2MA 2K8VA 1QK8A 3TOUA 4BWSA 2DJKA 3PR8A 2GDRA 1A24A 3LG6A 3QMXA 4X1UA 2I4AA 2CVBA 3EMPA 4JR4A 1XWCA 3BD2A 4G10A 3IAM2 4ZIJA 3VWUA 4N10A 1KEBA 1GTUA 4AF2A 9GSSA 1PRXA 1Z7RA 1Z6NA 4AJ6A 3ERFA 2LJRA 3GL3A 4PNGA 4YQVA 2DJ1A 4NV2A 1SJ6A 4MF7A 1FAAA 2CX4A 3TKSE 5FT3A 4HJMA 3CSJA 1YZXA 2N5FA 1TXXA 3E0UA 2F51A 3GUSA 5HR3A 5G1KA 1GNEA 2FWFA 1T1VA 2H6XA 1G7OA 4K0NA 2WGRA 1A23A 3HJMA 5D96A 20GSA 4I97A 5A5KA 5E59A 1R5AA 2XBQA 2C80A 1ABAA 1U6TA 3FZ4A 1T7PB 4I2UA 4JU5A 2FCHA 4E8HA 4MH3A 5CNWA 1F9MA 4POBA 4QL7A 2M72A 1A0RP 4EXJA 5EL8A 2YCDA 3IR4A 2OJLA 3KP8A 1M2DA 1SD9A 3D5JA 5IO2A 3P7XA 2WULA 3HHVA 2HQTA 4V2LA 4ML1A 4TKYA 2PN8A 3IBHA 1V9WA 1X9SB 2VIMA 5IPGA 3MDKA 5A4VA 1KNGA 1OC3A 2DMLA 2HRKA 2PU9C 4MPFA 3FZ5A 3HVVA 5GAND 2F8AA 2HZEA 2JU5A 2R4VA 1B9XC 3ZFBA 2P5RA 4MZWA 1YKAA 4GRFA 3LJRA 2IMEA 2B7KA 2YV9A 3I6AA 3F4RA 4G9HA 2X8GA 2C1YA 3S9FA 2HZFA 2OE3A 1OYJA 2DJ3A 3GURA 1JZRA 3L78A 5CRWA 18GSA 2IWTA 2PERA 2PUKC 5EY6A 1G7EA 5D9VA 4MPGA 4ZB9A 4MABA 1PL1A 1I9DA 3MNGA 2ALBA 3TKQA 1W89A 1VF1A 5IIZA 2VLTA 2L5OA 1JLVA 2V41A 3UEMA 3H79A 1V57A 3N9JA 1A2LA 6GSUA 3LYPA 4JEDA 4BVXA 4O5RA 1SKSB 2I9HA 2YNXA 3KMOA 3HA9A 1F37A 3D4TA 5ECOB 1O8WA 1YF0A 4HS1A 2LRNA 4BPYA 2IJYA 2E7PA 5ECNB 1GSYA 4ZB8A 1Z5YE 2OBKA 3HZ8A 3J7Yk 2CA8A 1T8EB 4J56E 3KM6A 4ZL7A 3O6TA 1F3AA 2VD0A 2L4CA 3NZNA 3V1WA 5LD0A 3UVHA 6GSSA 4FH8A 1WPIA 4XRAA 3CXGA 1PA3A 2EC4A 2VL2A 1J08A 2YWOA 1QMVA 1X0RA 3GHAA 5G2ZA 3ZFLA 1SJZA 1TRUA 2TRXA 1W4VA 3ISOA 2N5BA 1M2AA 3BCKA 1Z3EA 2HXKA 3CTFA 5ECHB 3DKSA 2IL3A 1B4QA 5KN3A 3APSA 1BEDA 2P31A 5ECKB 2LNSA 4PURA 5HR0A 3MSZA 4YAPA 5J4UA 5ECMB 2QSIA 4IVFA 1N8JA 3TKSA 3TJFA 4PGTA 4EE0A 4PXOA 2M80A 2MZCA 3HD5A 4YH2A 2VOCA 4ZILA 1NW2A 4ECIA 2ES7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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5D9VA

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sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations