2GDRA

Crystal structure of a bacterial glutathione transferase
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
202
structure length
202
Chain Sequence
MKLYYSPGACSLSPHIALREAGLNFELVQVDLASKKTASGQDYLEVNPAGYVPCLQLDDGRTLTEGPAIVQYVADQVPGKQLAPANGSFERYHLQQWLNFISSELHKSFSPLFNPASSDEWKNAVRQSLNTRLGQVARQLEHAPYLLGDQLSVADIYLFVVLGWSAYVNIDLSPWPSLQAFQGRVGGREAVQSALRAEGLIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords glutathione S-transferase
publication title Structures of Ternary Complexes of BphK, a Bacterial Glutathione S-Transferase That Reductively Dechlorinates Polychlorinated Biphenyl Metabolites.
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia xenovorans
molecule tags Transferase
total genus 66
structure length 202
sequence length 202
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2006-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2gdrA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2gdrA01
1F9MA 1Z7PA 4K8MA 3ZIVA 4E8HA 5H5RA 1FVJA 4GWRA 5AISA 2CA8A 3GMFA 5JCGA 4BPYA 2HLSA 4G19A 2HRAA 3GX0A 2FA4A 3LWAA 4YQVA 2DBCA 1ON4A 2IL3A 1K0BA 2V6KA 2GTUA 2NVLA 3IC4A 2V32A 4N10A 22GSA 1EWXA 1FOVA 2XBIA 3ED3A 1SYXA 5IOXA 4OO5A 3FR9A 3M8NA 3F6DA 5HQPA 3EU4A 2H1DA 4GSSA 2RLIA 2C0FA 2DIZA 2F8FA 3OR5A 4NMUA 4MA9A 2IMIA 2R3XA 3FY7A 3TKSC 5G30A 4TR4A 2NBSA 2H74A 3S9FA 2XC2A 4F0BA 4G0KA 2OBKA 2HI7A 1WJKA 1PKZA 2C3TA 2MMZA 4BVXA 4CW9A 2VLVA 2PVOC 4F03A 2B5YA 5CP1A 2MBSA 2H19A 4GCIA 2J23A 4KNDA 4KDUA 3KP9A 1HNBA 4OFTA 4OCEA 2NDOA 5G2ZA 2DJ3A 2HFDA 3UOMA 1ZGNA 4G2EA 1PGTA 4HU7A 2GQLA 2DIYA 1OC9A 4MDCA 4EC0A 4IELA 3CSHA 4MZCA 4IP6A 2H1BA 1X9SB 2LNSA 3ZRDA 3DRNA 2JSZA 2F51A 5B6NA 3F8UA 4X0XA 1TTZA 1PQNA 2VCXA 2VL3A 1YF0A 1VF4A 2M80A 1UC7A 1A8LA 1HD2A 2BMXA 2FWFA 3FYGA 1TI3A 1EGRA 2ZCTA 4GSTA 2OJLA 2OADA 2GSRA 2FNOA 3W6GA 2YV7A 3IK9A 2AAWA 3ZITA 1PN9A 3GYKA 3Q74A 1ZMAA 4EUYA 2AV4A 6GSTA 4FO5A 2JSYA 3GTUA 4I8BA 4O92A 3G7IA 2OBIA 3IPZA 3CSIA 1B48A 5AIXA 3EMXA 5FWGA 3DMLA 4HUAA 1PKWA 3G9BA 2C0GA 4X43A 3N5OA 1GL8A 1JZWA 4LMWA 1YF1A 2TIRA 3Q18A 1GULA 4N11A 2H6XA 4XIHA 1THOA 3ERWA 4HEA2 1U6TA 2FHEA 3D4MA 3EC3A 4HZ2A 2C80A 1ZYQB 1EZKA 1X5EA 4EDZA 4N0VA 4IN0A 4KAEA 2GS3A 3P7XA 3ZZXA 3ISOA 1QQ2A 4ILFA 2GDRA 1QMVA 4EXJA 18GSA 2H73A 2H76A 1MDJA 1V40A 4N30A 4V2MA 1TRWA 3BOAA 2DJ1A 1GH2A 2CZ2A 3QAVA 3GH6A 4GSNA 1GTBA 4EL1A 4OFMA 2C4JA 1CQHA 1GSDA 4AJ6A 1A0RP 4XS4A 3VFIA 4NHZA 2CVKA 5B8BA 3VURA 3LG6A 3KXOA 4USSA 1FB6A 3E0UA 5ID2B 1BJXA 4WETA 2HT9A 2CT6A 4XS6A 2F8AA 3F3RA 1GUHA 3DVXA 2CQ9A 1BAYA 3BBYA 1Z5YE 2GSTA 2H0HA 3QFBC 4KDYA 1V9WA 3QR6A 2IMFA 1QUWA 3R2QA 2HRKA 1GLQA 3VWXA 3TOTA 1WPIA 2HSNB 2IN3A 3F4SA 3GNJA 2WB9A 3I69A 2P5QA 2HXKA 3LSZA 3ZLPA 1TKDB 3ZFBA 4WBJA 4LL1B 4ECBA 2VIMA 4IHUA 5CYYA 1AW9A 2B3SA 1SJ6A 1EEMA 3PH9A 4JRRA 5ENUA 2LEGA 1J08A 3SWLA 4PURA 4Z7XA 1UVZA 1AIUA 1G6YA 2XBQA 5J3RA 3UBKA 3C1SA 2CVDA 4HDEA 1TRUA 3ZVJD 3PR8A 1K0MA 2K8SA 2KOKA 6GSVA 2L5OA 1BX9A 3TB2A 3J7Yk 2H66A 2CZ3A 5LD0A 5HFIA 3UARA 3QCPA 2H0GA 2P31A 1U88A 3NOFA 2HZEB 1K0AA 3F4RA 4LMVA 3KIJA 3A2WA 1S3CA 1WE0A 2MYGA 2BJXA 4WR5A 3HY2A 5DVBA 3EINA 4ECIA 1FAAA 3RPNA 3Q6OA 5AGYA 1U87A 5DCHA 3WT1A 5E4WA 2KLXA 3LXTA 5JWOB 2PU9C 4GQCA 1A0FA 5GSSA 5BMUA 1OKTA 5CRWA 2DC5A 4JR6A 4E8EA 2GSQA 1DBYA 5LNKe 2O7KA 2KP1A 4MCUA 2GZZA 4NPBA 4MPFA 6GSYA 4DSSA 5DDLA 1XXUA 5G5FA 4ZL8A 1BG5A 1TDIA 3F0IA 2E0QA 4MJBA 4ISDA 4L5OA 1MDKA 1Q98A 1DE1A 3DVWA 3E3EA 1M99A 2L5LA 1I9DA 4ZBAA 5J4UA 3GURA 4DVCA 3HYPA 2HE3A 2E2MA 3QAGA 2DJ2A 3R3EA 4KUNA 19GSA 1X0RA 4PTSA 4HZ4A 1FG4A 2EIQA 5F05A 2B5XA 5HFKA 4N0ZA 1WWJA 4EO3A 1GSFA 9GSSA 1K0CA 2VL9A 3UL3A 4BWSA 3MNGA 4ACSA 1XOAA 2YN1A 3L0HA 1A23A 4PQ1A 1ST9A 6GSSA 4JU5A 3J7Yb 2XPEA 1A2JA 5IMZA 4WXTA 4EE0A 1Z9HA 1F2EA 3WGDA 1R7HA 1NM3A 3KJYA 4TXOA 2LS5A 1YQ1A 2MMAA 4Q5RA 3IHQA 2VO4A 2IPAA 2Z9SA 3KEBA 2V6OA 1K3OA 2DJKA 3K8NA 1ZOFA 5L71A 2LRCA 2MZCA 4JE1A 3FZ9A 2NPBA 2PVQA 2FLSA 3HXSA 4EF0A 1TJDA 3V1WA 1X5CA 5GZZB 1THXA 3L78A 3KM6A 2WFCA 4MP4A 3HVSA 3ZREA 3TUEA 5ELGA 4I2TA 4I2UA 3TJKA 2IWTA 2DLXA 1AXDA 2LKUA 4TN8A 3L9VA 3HD5A 5IMCA 4O7HA 3IAM2 6GSWA 3KH7A 4YQUA 3US3A 2A2SA 4TR1B 4WF5A 2OE1A 4BVXB 1IYHA 3IE3A 5H5SA 4HQSA 4PNGA 1PD21 3D22A 1K3YA 2D2ZA 5G5EA 2YPMA 1OE7A 3EWLA 1FO5A 5A5KA 4OMVA 4KB3A 3IXRA 1AQXA 3DWVA 4JBBA 1X5DA 4POBA 1YEXA 3DD3A 1KNGA 1M2DA 2GT5A 1XW6A 5ECKB 1LJRA 2MBTA 2MMOA 3C1RA 1Z6MA 1EV9A 2P0GA 5IPHA 4FQUA 3KZQA 1VF1A 1T1VA 5KEJA 5CO3A 5IM9A 3UVHA 3F9UA 3GL3A 5ECLB 3E9JB 4WF4A 2R2JA 1USBA 3AY8A 1O85A 5FT3A 1EGOA 4LA1A 4PUAA 1G0TA 3DGQA 1NW2A 3GX8A 4ZB9A 4CDOA 1V2AA 1TW9A 1TRVA 5IOWA 5ECIB 2YZHA 2JZSA 3QD9A 3TKRA 3EU3A 3GTUB 3TJBA 4GXZA 2LQOA 3D5JA 2V41A 2L6DA 1RK4A 4YQMA 1S3AA 1TRSA 2RIIA 7GSSA 3GIXA 1V58A 2C8UA 2R5GA 5ECNB 2KHPA 5DALB 3C7MA 5G1LA 4WKWA 1SKSB 5B8AA 1XWKA 1N8JA 1ML6A 3F6FA 4JR4A 5EL8A 3ZMLA 1R5PA 3NZNA 5F0GA 4TR3A 3QPMA 4WR4A 1ERTA 3ME7A 1Z6NA 3DEXA 2H8LA 5DJLA 1JZDA 3Q19A 3DXBA 3LGCA 3TCOA 1NSWA 4TKYA 1GP1A 5D9TA 5ECOB 4F0CA 20GSA 2F3MA 1MEKA 1B4PA 4ZBBA 1UN2A 2FY6A 3GFKA 3GHAA 1SJZA 1U3AA 2A2RA 2K18A 4J57E 4V2LA 5D96A 4RI6A 5D9XA 2YP6A 2VLTA 4K7IA 3HKRA 2CVBA 1X9WB 5GAND 14GSA 4XS4B 2MMNA 1PA3A 2VM1A 4NAXA 3CTFA 2WDUA 4IJ3A 1R4WA 2KUCA 1T4YA 1HNCA 1ERUA 2VCVA 4Q5NA 1CQGA 3KD0A 2GLRA 4PXOA 4KF9A 1T3BA 2H71A 1EOGA 2DSAA 2J9HA 1FVKA 1A2MA 2GZYA 5COHA 5DQSA 3UBLA 3FHKA 1AQWA 3H93A 1BQ7A 3KCMA 4K6XA 3IBHA 2ON5A 6GSUA 2WGRA 4V1Ag 2PWJA 3P90A 5H5QA 3MAKA 3KH9A 2TRXA 2IMEA 3LORA 1XVWA 3HJPA 4NV5A 4QL7A 1PMTA 1SK1A 1ZYEA 5B7CA 3P2AA 3H1NA 3FZAA 2CAQA 3ZL5A 4F9ZA 1SENA 2LSTA 3LJRA 1F3BA 2B7JA 2JL4A 3TJGA 2DJ0A 4DEJA 3VWWA 3LYPA 3TGZA 4DSQA 2X8GA 1IYIA 1U3IA 4ECCA 1TOFA 2V1MA 3C71A 1FB0A 3M3MA 5GAPD 3RHBA 4ZXGA 3EMPA 1O6JA 1URMA 4ZL9A 1HNAA 5JWQB 3GUSA 3HCZA 2YZUA 2CX4A 1J0FA 5DAKB 3UEMA 5IQYA 1SYRA 5ELAA 4RQRA 3D21A 1A24A 3LQ7A 3WT2A 3ZMKA 2TRCP 3BCKA 1F37A 2GVPA 2H70A 1O81A 4AJ8A 4D73B 4RQXA 3IDVA 1GWCA 3GKKA 4AF2A 2X8CA 3D6IA 2GZPA 1QGVA 5D9VA 2GQKA 2IJYA 4K0GA 2NTOA 1ILOA 11GSA 4P3YB 4MJCA 12GSA 2EC4A 2HRFA 4MJAA 2OACA 4TVEA 1XW9A 2WULA 3VWUA 4IP1A 4BVYB 2HSMB 2QKEA 4K1FA 2VCWA 4IW9A 2PERA 2L4CA 4ZL7A 1KTEA 1PX7A 4GLTA 4IQ1A 4JEDA 2VCQA 1GSYA 1W89A 3RBTA 5E59A 3IV4A 4IGJA 2L6CA 3UVTA 3L4NA 1TU7A 4G10A 3C73A 4F82A 4PQIA 2YWIA 5IPGA 2PUKC 1SL2B 3F63A 2CX3A 1AC1A 4PQHA 2FWEA 4FIWA 2YWNA 1T7PB 2L57A 2VLUA 4WEYA 1PRXA 4BWQA 2FWGA 1QFNA 3A2XA 2X99A 2I4AA 1R26A 2EIRA 2IFQA 1YKCA 3IK7A 2O8VB 8GSSA 2YWOA 4MMMA 1K0DA 3F4TA 4FH8A 3U6VA 4AGSA 1EP8A 1WMJA 3UJ1A 5HR0A 5AN1A 2ALBA 1SKWB 1EEJA 3JCML 5CRHA 4GQFA 3CRTA 2HYXA 3MSZA 2G0FA 10GSA 3LFLA 3ME8A 3A3TA 4O5RA 3W8SA 2PBJA 3HZ8A 3FK8A 1MD3A 4TOPA 1GRXA 2I9HA 1AUCA 4PX1A 2PPTA 2YJ7A 2ON7A 3GSSA 4QQ7A 4ZB8A 1B9XC 4OD7A 2B7KA 1F3AA 3TJJA 2YV9A 2I81A 1PL2A 4IQAA 2R37A 4MZWA 3N9JA 2AHEA 2HZEA 3P8WA 3GKXA 5IMDA 5CREA 2IMKA 2WRTA 4OFNA 4TXVA 4MF7A 3FRCA 3APQA 5J9BA 1AQVA 1Y25A 2ZNMA 4KSOA 1GUMA 1V57A 3A2VA 4PGTA 1KEBA 1AAZA 2O87A 5J5NA 3HDCA 5ECRB 3LEFA 3VLNA 4YAPA 1DE2A 4FYCA 2R4VA 2LTKA 3GRXA 4KGIA 4MF5A 4IBPA 4OCFA 2HQTA 2M72A 2EIOA 4MABA 3GKMA 4LLRA 2FCHA 2OE3A 1S3DA 5HR3A 6GSXA 5CRGA 3GL5A 1K0NA 3IOSA 1PSQA 3DYRA 3H79A 5EPFA 2L4QA 5A4UA 4MZBA 3L9SA 1EOHA 3W8JA 5G31A 3TKQA 3QFAC 4HU9A 2IMDA 1SD9A 1XBSA 4K0NA 2CAIA 1M2BA 4KCEA 2WZ9A 5DQYA 4BL7A 3RPPA 3ZIJA 2I1UA 4KCAA 2VD0A 2VL2A 5A4VA 3FEUA 3FR3A 2N5AA 2V2GA 4J2FA 2YJHA 4YH2A 4V1Ap 1Y6EA 2R6KA 2YWMA 4NV2A 5ABRA 5F07A 3DKSA 4K2DA 3O76A 3DIEA 5JCUA 3BJ5A 3TRXA 3GA4A 5J9CA 4V2NA 5IIZA 4Q5FA 3APSA 2FUG2 1LBKA 2GQMA 1OC9B 1ABAA 2M46A 3KTLA 1GNWA 1XCCA 3FR6A 1YY7A 4POLA 3RAZA 3TKSE 2VM2A 3KMOA 2QGVA 2AYTA 1Z7RA 1J9BA 5F8BA 4ID0A 3EYTA 4MK3A 3ZFLA 4I5QA 2PN8A 2HSYA 5IMVA 3EURA 3TRQA 1PX6A 4DSRA 3WGXA 1YJ6A 5DBQA 2H1GA 2HNLA 2WCIA 3QOUA 5C04A 1T4ZA 3LYKA 2LJAA 2I3YA 4POMA 2C3NA 2LRTA 4F2IA 5IO0A 3VPQA 5IMAA 3LXZA 2LQQA 4POKA 4TR1A 2VCTA 3WD6A 4MF6A 4XRDA 2B5EA 4MJEA 3ZTLA 1G7OA 3UIWA 3TDGA 3HVVA 3EVIA 2F9SA 3CXGA 4L5LA 4HI7A 4CHSA 4KE3A 1XZOA 1SU9A 5IO2A 5ECHB 4ZILA 1FW1A 3MWHA 4TW5A 1YZXA 2WJUA 4KSMA 4AJ7A 17GSA 3HJMA 2DJJA 3TOUA 2YANA 1OAZA 2A4VA 1RW1A 4GTUA 4ZB6A 3ZYWA 4RUVA 1TI1A 1M2AA 5CAXA 3QAWA 4ZBDA 1O8XA 3FKFA 3H8QA 2UZ8A 5ECMB 1XOBA 1DUGA 4EDYA 4YAVA 4XTSA 3IRAA 1JLVA 2ES7A 4XS1A 4H86A 4IJIA 3CSJA 5B6MA 1OYJA 3GSTA 2C0DA 4XHMA 1YEPA 2O85A 3HA9A 3M0FA 2RUEA 2BTOT 5GSTA 1VGLA 2GGTA 3I43A 16GSA 1H75A 5DALA 1OE8A 2VD1A 1K3LA 4KH7A 2B1KA 5EVOA 2AUVA 1TXXA 4WBRD 2B1LA 1OC3A 3IC8A 1HQOA 1EV4A 3KP8A 1Q4JA 1SJIA 1GTAA 1WRYA 3CBUA 5D73A 1QXHA 4X1UA 5HR2A 3TJFA 3F3QA 2OKAA 2JACA 2HRKB 5D93A 4EKZA 2H72A 4MPGA 1TK5B 3WYWA 3PPUA 1BEDA 1B8XA 3GN3A 2FD3A 1T00A 3A5WA 1V98A 1ZL9A 3CYNA 5CNWA 3C8EA 2HZFA 4KX4A 4IS0A 3IR4A 1NHYA 2C0EA 1XFLA 4EVMA 2H6ZA 1M9AA 4IVFA 1JZRA 2GSSA 4I97A 2C3QA 5INYA 3TKSA 4OWYA 3PGTA 1XWAA 3RDWA 4MH3A 5DCGA 2WS2A 1B4QA 4MLYA 3HHVA 1K0OA 1E2YA 3CRUA 4HJ2A 2X64A 3GH9A 2HSHA 3QMXA 2RM6A 2PGTA 2IIYA 5HR1A 1GTIA 2KP2A 3I9V2 1XPVA 1RQMA 2DMMA 3HVXA 4NXIA 1Z3EA 1T8EB 1G7EA 2H75A 2G2QA 3TRPA 5C00A 2H30A 2LV3A 4FYBA 13GSA 3BCIA 3VI5A 1MDIA 5KN2A 2AB6A 2XPDA 3MDKA 4K7OA 3VK9A 2B6MA 1SKRB 2CV4A 5KN3A 3TKPA 2IFQB 4PUFC 3ZVJA 1X9MB 1A8YA 4ML1A 4OO4A 2XHFA 3O6TA 3VPTA 2GT6A 1MTCA 5LCZA 1M7TA 3NIVA 3KTBA 2X8HA 3RHCA 4XRAA 5DJMA 2H6YA 1XVQA 1SK0A 1M0UA 3KGKA 4DSSB 4ZIJA 1SL1B 2L59A 5EY6A 2JADA 4HS1A 1OVNA 3SBCA 3D4TA 1G6WA 2YNXA 4J56E 3H4KA 2O89A 2OA7A 3CTGA 2LRNA 5ID2A 2K9FA 4HQZA 3UMAA 3ERFA 3O3TA 2VL2C 2JZTA 2N5BA 1TK0B 3HZ4A 4TR0A 2PMTA 1ERWA 2RUFA 3I6AA 2K6VA 3PINA 1FHEA 4L0UA 4RI7A 3CMIA 5IMFA 2H01A 1GSEA 1VF3A 3WGEA 4ULXA 1XW5A 5DAKA 1TU8A 1NHOA 5ECQB 3G7JA 5G1KA 1N2AA 2RM5A 1GSQA 1GLPA 1GSSA 4D73A 3FZ5A 3FW2A 1ZZYA 1H4OA 1WOUA 2QSIA 2HRNA 2LJKA 1DSBA 5JWRB 2P5RA 5CRDA 4FYUA 5JCWA 2REMA 5D8IA 1JZOA 4MH2A 1A2LA 4HOJA 4NWYA 4BVYA 2HSMA 4QL9A 2H0IA 4G9HA 3L9UA 4TXOB 2JZRA 2LJRA 3FZ4A 1ERVA 2OE0A 1XWCA 1O73A 2ZUPA 3KMNA 2VUPA 1WIKA 3EE2A 5FHIA 1XWBA 4LL4B 3GKNA 2YCDA 4K9ZA 1SK2A 4G0IA 5KN1A 2AJQB 3M1GA 3VWVA 4L0WA 4G0LA 4KW6A 4O32A 5AIVA 3VI7A 2VCZA 1YDKA 2E7PA 1VRSD 1GSUA 3BD2A 2QC7A 1SD8A 5F06A 4XCSA 1TK8B 3HJOA 2FGXA 5ECSA 3UAPA 4GRFA 1SL0B 1B9YC 2K8VA 4BL7B 4KA0A 1OC8A 4Q5QA 1GTUA 3D0ZA 2VOCA 5ECPB 1W4VA 3APOA 2H1AA 3QDNA 5J41A 1JFUA 2JU5A 5D9WA 1TP9A 1KBNA 1WP0A 4GF0A 4KDXA 2E2GA 4ECJA 3M9JA 3IA1A 5HFGA 3U5RE 3ERGA 1XWGA 1ACVA 1O7UA 1R5AA 2YOIA 4PNFA 1MD4A 1O8WA 2C1YA 1LU4A 4ML6A 1BYEA 4K7NA 3IAS2 5A4WA 1C72A 4BA7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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