4IVFA

Crystal structure of glutathione transferase homolog from lodderomyces elongisporus, target efi-501753, with two gsh per subunit
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
221
structure length
221
Chain Sequence
LKPIKLYTAPTPNGYKISIFLEVLGLDYEVQKFDLSKNETKEDWFVKLNPNGRIPTINDPNFKGVDGGLVLSQTGAILQYLADTYDKEHKFSYPAGTAEYYKTLEYLIFQVAENGPIQGQANHFVFAAKEKVPYGINRYITDTKRIYGVFEDILSRNKANDSKYLVGDRYTVADFALLGWAYRLSRLEIDINQWPLLGKWYDSLLKLPAVQKGFEVPPKNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Lodderomyces elongisporus
publication title Crystal structure of glutathione transferase homolog from Lodderomyces elongisporus, target EFI-501753, with two GSH per subunit
rcsb
molecule keywords Putative uncharacterized protein
total genus 81
structure length 221
sequence length 221
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4ivfA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ivfA01
2DIZA 4XRDA 4WR5A 2RM5A 2L6CA 2C3TA 1RW1A 5FWGA 1Y6EA 4IP1A 4IHUA 2FA4A 2GZPA 2I3YA 4N30A 3IPZA 1M9AA 1J0FA 1YQ1A 2HT9A 4NWYA 4TW5A 5DCGA 4GQFA 1THOA 5DJLA 3UMAA 4ZBDA 3UL3A 3VURA 3WT2A 4DSQA 2EC4A 4N10A 2H1AA 18GSA 2IJYA 5IMZA 5G1LA 1O81A 2IFQA 1MTCA 3P90A 4HJ2A 4GF0A 4XS1A 3TRXA 4TR0A 1NSWA 7GSSA 2IMDA 3EE2A 4JBBA 1MEKA 3A5WA 3VWXA 5KN3A 4NPBA 1SK1A 2FNOA 2C3QA 4I5QA 4BL7B 1BAYA 2H1BA 5CRHA 3M1GA 3M9KA 4O32A 4TVEA 4PUAA 3UOMA 3ZMKA 1WJKA 3GKXA 1XOAA 3FZ4A 1V9WA 3P7XA 5CP1A 4NAXA 3CMIA 3KTLA 4HOJA 3QFBC 1PQNA 4V2MA 1F3BA 4FYBA 1HNAA 3W6GA 2YP6A 1TJDA 2CAQA 2HRKA 2WDUA 3HY2A 4BVYB 3G7JA 2N5FA 3WYWA 4HUAA 3MDKA 4KX4A 5DQYA 3DMLA 3UEMA 2VM2A 4JRRA 1YKCA 8GSSA 4OCFA 3VI7A 1JLWA 2L5LA 2JZSA 2HYXA 2RIIA 2LQOA 3L9VA 4GSSA 2PWJA 4Z7XA 1YY7A 2P5QA 2TRXA 2OE3A 5A5KA 1QK8A 4KDYA 3FW2A 5J4UA 4O92A 5ECPB 1GP1A 2PN8A 3F9UA 2HZFA 5G5FA 3DVXA 1K0NA 1MD4A 4MH3A 2JU5A 3FZAA 5B8BA 4DEJA 4G0KA 3BD2A 1MDKA 2PU9C 2HI7A 2L57A 2E0QA 1Z9HA 4IP6A 3HKRA 4TR1B 1LBKA 4ECCA 5GAPD 16GSA 1A2MA 1F37A 1EV9A 1C72A 3GX8A 1DSBA 5ID2B 2XBQA 4N11A 4YAPA 3GA4A 3KTBA 1Z6MA 2M80A 4WF5A 3G7IA 3A2VA 3Q19A 5ECKB 4MJEA 1OKDA 4HU9A 4MZCA 5HR2A 1GSFA 2VL2A 1JHBA 3D6IA 2V32A 3APSA 5HR1A 1Q4JA 5DDLA 4ECJA 5A4UA 2P0GA 5JWQB 3TJBA 3R3EA 2VM1A 1H4OA 2VCXA 3A2WA 3ERGA 1SK0A 5IMFA 2L59A 2R3XA 3GSTA 2I1UA 1QGVA 3ZIJA 2R4VA 3GKNA 4GSNA 2H75A 5IPHA 1X9MB 2NPBA 3TKSE 1ON4A 3VWVA 1XWCA 3O76A 2VCVA 2YWOA 4ZL9A 1FAAA 3HXSA 5HFGA 4XS4B 2IMIA 3R2QA 4OMVA 5F06A 2C1YA 2OKAA 3IXRA 2MBSA 1RQMA 5H5QA 2E2MA 4IJ3A 1GTBA 3MWHA 2YZUA 6GSUA 4TR3A 1SJZA 4F0CA 5CAXA 4XIHA 2WZ9A 1ERWA 1USBA 3QR6A 5IOXA 2PVOC 4K8MA 1AQXA 3APQA 3L4NA 1KTEA 5G2ZA 5BMUA 4GRFA 3QAVA 1YJ6A 1Z7RA 1W89A 1YF1A 4JE1A 3VWWA 5KN2A 4KE3A 4L8EA 1AUCA 4NXIA 4RI7A 3C1RA 4V1Ag 2I9HA 4ZIJA 4ZXGA 3TRPA 1EP8A 2C3NA 4PGTA 5B6MA 2K6VA 2OJLA 2VAFA 1HYUA 1HD2A 1YZXA 2GLRA 2QKEA 2K8VA 4JZQA 4K0NA 3F3RA 3RPNA 3UVTA 3IK9A 4O7HA 2VCWA 3LEFA 1FOVA 3LXTA 5IMDA 3HVVA 1PSQA 1FVKA 1TTZA 4EO3A 4WETA 3ZL5A 4PQIA 4YQVA 2FHEA 4OFNA 1TRWA 5ECRB 2IPAA 2FGXA 2H19A 5AISA 3KMNA 1O6JA 1O85A 3GMFA 3DVWA 4ZBBA 1GUKA 4V1Ap 4WR4A 3C73A 3GL3A 1X5DA 1PN9A 1O8WA 4MLYA 3QFAC 3GYKA 1XZOA 3RHCA 1HQOA 2R6KA 5A4WA 4I8BA 2RUFA 2WGRA 1TI3A 3M9JA 3VWUA 1EEMA 2WB9A 4OO4A 5ECNB 1JZDA 3HJPA 5AIVA 1SD9A 1WE0A 1GSQA 2MZCA 3IOSA 3CYNA 3QCPA 2GQKA 3DEXA 2AUVA 1XW5A 2HZEA 4MA9A 2N5BA 1E2YA 13GSA 2WULA 5J5NA 1GWCA 4Q5RA 3EMPA 1XCCA 3IE3A 3FKFA 1Y25A 4AJ7A 2JL4A 1JLVA 2JZRA 2H66A 1XWAA 2NBSA 1GTAA 4EC0A 3ZVJA 1GL8A 3I9V2 2YPMA 5KN1A 3GX0A 3DYRA 2O7KA 1ZMAA 3ZIVA 2MYGA 3UJ1A 4PNGA 1WOUA 3GH9A 3BCIA 4TXOB 1S3DA 3GL5A 4HZ2A 1U88A 4MZBA 2HNLA 2F9SA 3WGEA 2GQLA 3EVIA 12GSA 3PGTA 2LQQA 4LLRA 5ECHB 1B9XC 3M8NA 5DCHA 1VF2A 1EGRA 3LJRA 1FHEA 3GUSA 1EP7A 1ERTA 2C8UA 1AAZA 1R5PA 3VPTA 2IWTA 4F03A 3N9JA 1IYHA 4LA1A 5F8BA 3E9JB 1G7OA 4IJIA 2V6KA 2JSZA 3TCOA 5IMVA 4MF7A 5JCWA 2LV3A 6GSSA 4XTSA 4K6XA 4TR4A 3F0IA 1U3IA 1GSSA 5DAKB 3QD9A 4KNDA 1OKTA 2H72A 1KNGA 2EIOA 4ML1A 4RQRA 4TRXA 5COHA 2PGTA 1PD21 5DBQA 1EOHA 4PQHA 3VFIA 3BJ5A 5LCZA 3FY7A 2DJKA 1J9BA 1B4PA 2B1LA 5D9WA 1SK2A 1ZYQB 2L4CA 4IW9A 4KAEA 3ZITA 14GSA 1A8YA 5ELAA 2P31A 4ZL8A 2JZTA 3Q6OA 1T00A 1SJ6A 2NVLA 3I6AA 4KUNA 2DJ2A 2YN1A 1XOBA 3FEUA 5D96A 3KJYA 3F4SA 3KXOA 3FYGA 4FQUA 4HI7A 3GFKA 5A4VA 2B3SA 2OE0A 1ST9A 3E3EA 4GXZA 4OFMA 4IQAA 1ACVA 2CVBA 1AQWA 3LQ7A 1AIUA 3E0UA 1SENA 2P5RA 1PKZA 2F8FA 4PUFC 2LSTA 4I2TA 1UN2A 2B5EA 1W4VA 3FRCA 3IHQA 2HRAA 2IMFA 2GZZA 1UA5A 5AGYA 4KSOA 1OC3A 1M2AA 4AF2A 5ENUA 1GUMA 3GSSA 1CQGA 3WGDA 5DALA 3TDGA 1FG4A 2MMOA 4IQ1A 1TXXA 5JCUA 1ZZYA 5CRGA 3ZRDA 2XPDA 4FH8A 4NMUA 1U6TA 2WRTA 5LNKe 5ELGA 1O7UA 2GDRA 1T8EB 3NZNA 5HFIA 1XWKA 4TKYA 4DSSA 3F63A 3C7MA 4ZB8A 5H5RA 2AJQB 1URMA 3HHVA 3KGKA 1TOFA 3D4MA 2J23A 4MH2A 2OADA 2E7PA 3A3TA 3KIJA 2DC5A 5KN0A 5IMAA 1T4YA 3GURA 1BJXA 2PBJA 2GSRA 2RM6A 4EDZA 5J41A 1K0DA 3CBUA 1RK4A 1GLPA 4POKA 4TOPA 4D73B 5G31A 3HZ4A 4CHSA 3DXBA 1SYRA 5IPGA 5E59A 3AY8A 1SL2B 4H86A 1AW9A 1ILOA 5EPFA 4E8EA 1Z5YE 5D73A 3GKKA 2YOIA 4ZL7A 1VF3A 3TB2A 2WCIA 2FD3A 3IK7A 3FHKA 2CVKA 3NIVA 1GSEA 1XIYA 3QOUA 3EMXA 2YNXA 3DRNA 3GTUA 1PGTA 4QQ7A 1V98A 1M99A 1ZL9A 2H8LA 1TW9A 1M9BA 5LD0A 2H74A 4KA0A 3JCML 5EY6A 1I5GA 4JR6A 2H76A 2BJXA 1M0UA 5F07A 2GZYA 3UBLA 2LJAA 4GSTA 2YZHA 1JZRA 2C0FA 4ULXA 4OFTA 4F2IA 9GSSA 3TJKA 1Z7PA 1BEDA 2IN3A 1WMJA 2C4JA 3PR8A 3KEBA 4PNFA 2H01A 5B8AA 1OYJA 1PMTA 1U87A 1BG5A 1EEJA 2IFQB 2PMTA 2HE3A 3G7YA 2XPEA 3GN3A 3A2XA 2OA7A 2FLSA 3CXGA 3TOUA 1MDJA 1TK8B 2CT6A 1ERUA 1ML6A 2DJJA 5D9XA 3F3QA 4BWQA 2HRFA 4ZB9A 4RI6A 2JSYA 3W8JA 5DVBA 3CRTA 1G6WA 2X8HA 5CYYA 2R5GA 1GLQA 3W8SA 1TP9A 2BMXA 4FO5A 5DJMA 1UC7A 3BOAA 4L0UA 4K9ZA 2M72A 2YANA 3TKPA 2TRCP 4POBA 3UARA 2KLXA 2NDOA 4DSSB 3L0HA 4MMMA 2FUG2 4KSMA 1LJRA 3LGCA 3IAS2 5ECMB 4MJAA 1SKSB 1K0OA 4YQMA 2HRKB 4EVMA 1PL2A 4KCAA 1BX9A 3O3TA 1ZYEA 2VLVA 2YJHA 1EZKA 17GSA 5B7CA 4GWRA 1V58A 4QL9A 2CZ3A 2F3MA 4EXJA 3QAWA 5E4WA 3RAZA 2X8CA 2DIYA 4K7NA 2JACA 5IMCA 3ZMLA 3ERFA 3LXZA 4G19A 4IBPA 2NTOA 5HFKA 1O73A 2O8VB 3OR5A 2B7JA 3HVXA 1LU4A 1QMVA 4FYCA 5JCGA 1TI1A 1WIKA 4ECBA 5D9TA 3EURA 1F3AA 1K3OA 3S9FA 2CVDA 3IBHA 1V40A 4MJCA 1F6MC 1KEBA 3HA9A 2GTUA 3TUEA 4K1FA 1X9WB 1K0BA 3KH7A 3GTUB 2H0HA 4V2LA 2PUKC 4GLTA 5ECOB 4MDCA 1AC1A 2HSMA 4L0WA 3FR9A 4EDYA 22GSA 20GSA 2TIRA 3RDWA 2HSNB 4DVCA 4K2DA 4G0IA 1JZWA 4HU7A 2OE1A 4HS1A 4HDEA 1G0TA 2C0DA 4G0LA 1A2LA 3M0FA 3RBTA 2YJ7A 1DUGA 1GH2A 2O85A 4X0XA 3F6DA 5J9BA 3EINA 1WPIA 2HSHA 2GT6A 1DBYA 4XRAA 1QFNA 2MBTA 4EKZA 1SD8A 2GSSA 1FB0A 2A2SA 3J7Yb 1XXUA 1R5AA 4V2NA 2H71A 1J08A 3QAGA 3I69A 3GKMA 4EF0A 1XVQA 5C04A 2BTOT 2GQMA 10GSA 3FZ5A 3UVHA 5ECQB 1IYIA 2XHFA 2J9HA 4PURA 5B6NA 2B5YA 3DWVA 1XW9A 3ZVJD 1VRSD 4IN0A 3CSIA 1M2BA 1X9SB 4WKWA 1SKWB 2KP1A 3ZREA 2V2GA 4PTSA 2VUPA 1OVNA 4KDUA 4E8HA 1A23A 3DGQA 4WBRD 4WEYA 3P2AA 2ES7A 3H1NA 3F6FA 2EIRA 2X8GA 1GRXA 1NM3A 2DMLA 1FW1A 2KUCA 3LG6A 3US3A 5ECSA 1Q98A 2DBCA 2D2ZA 1NHOA 2Z9SA 4LMVA 1A0FA 1PX6A 3IRAA 1VF4A 4GCIA 4HJMA 4F82A 5HQPA 1T7PB 2HXKA 3IAM2 3ZTLA 1EV4A 2H6ZA 4EL1A 5J9CA 1TRSA 4J2FA 4ZILA 2IMKA 1I9DA 4BL7A 4PX1A 1F9MA 5F05A 1Z6NA 3IC4A 4KGIA 2FY6A 5CRWA 4DSRA 3GNJA 1OAZA 3TKSA 1K3YA 3CRUA 5CREA 2G2QA 4I2UA 4NV5A 1FVJA 1TK5B 3ED3A 3I43A 2VD1A 4XS6A 3C1SA 2KOKA 4I6XA 1K3LA 5G30A 1QXHA 5G5EA 5F0GA 4POMA 3QMXA 3UIWA 1YEPA 2GSTA 1ERVA 1B4QA 2ALBA 1DE2A 3RHBA 4AJ8A 4NHWA 2R37A 3Q18A 1WP0A 4TN8A 3ZFLA 5HR0A 2M46A 3D5JA 2IMEA 2LTKA 3TKRA 4USSA 1K0MA 3ZFBA 4G9HA 4JEDA 3UAPA 4F0BA 2A4VA 5D93A 2HFDA 4F9ZA 3NOFA 2B1KA 4MCUA 1AQVA 4CW9A 2RLIA 2CX3A 5IOWA 2VCZA 3K8NA 5IO2A 1VGLA 3H4KA 3ZZXA 1M7TA 4POLA 2LRNA 1XVWA 2HZEB 1N2AA 4L5LA 2K18A 2X99A 3Q74A 3HVSA 1YEXA 4TR1A 1PL1A 1JFUA 3FZ9A 2VCTA 2XC2A 1F2EA 1GSYA 4YQUA 2LKUA 4JU5A 5ID2A 5GSTA 1TRVA 3F4RA 1XFLA 2LRCA 1A24A 4KDXA 1EWXA 4GQCA 1B8XA 3WD6A 2GT5A 4BA7A 3IA1A 4YAVA 3VLNA 1VF1A 3IC8A 3QPMA 5FHIA 4MF6A 4ISDA 3C8EA 4J57E 3U6VA 1OE7A 1TKDB 2V41A 3GV1A 3TJJA 1FB6A 1OE8A 2WFCA 2H1GA 3TKQA 2AYTA 3QDNA 1NHYA 3VI5A 3ME8A 1JZOA 1H75A 4KW6A 2F51A 2R2JA 5J3RA 1OC9A 3H8QA 1SL0B 3HYPA 4WF4A 1UVZA 1GULA 2LJRA 6GSYA 2H0GA 1A0RP 2WS2A 4XS4A 5AN1A 2LJKA 3H79A 4N0VA 4ML6A 2H73A 2B7KA 4J56E 2XBIA 4OCEA 5AIXA 2UZ8A 2AHEA 2ZNMA 4K7OA 1V57A 4P3YB 4G2EA 4N0ZA 4BWSA 4Q5FA 1GUHA 19GSA 5H5SA 2VO4A 1M2DA 1EOGA 2DLXA 4IKHA 3LORA 1B9YC 4IS0A 2VOCA 1K0CA 1G6YA 1GTUA 3FR3A 11GSA 2PVQA 3CSJA 4MPGA 3G9BA 2JADA 3UBKA 5GSSA 3KH9A 5INYA 2LS5A 2YCDA 1GSDA 4RQXA 6GSXA 3FR6A 3M3MA 1X5EA 3KD0A 6GSVA 4O5RA 2VLUA 3SWLA 4MZWA 1GSUA 3CSHA 2DMMA 2FWEA 3PPUA 3J7Yk 1WWJA 2PPTA 2LEGA 3BBYA 3RPPA 3TKSC 5D8IA 4MF5A 1PKWA 1SYXA 3LYPA 3KM6A 4K0GA 3ERWA 3N5OA 2I81A 4KF9A 2QC7A 2G0FA 4FYUA 1R4WA 4X43A 2HSYA 2L6DA 2H6YA 3HZ8A 1YDKA 2VD0A 1GNEA 3HD5A 2A2RA 2MMNA 5IQYA 2V1MA 1HNBA 5G1KA 2AV4A 3EC3A 5ECLB 1XWGA 2C0GA 3DIEA 4KH7A 1ZGNA 2CX4A 3EWLA 3L9UA 3ME7A 4ECIA 2GVPA 3BCKA 2KP2A 2VIMA 3PH9A 4LMWA 3APOA 5DALB 4EE0A 2WJUA 4XHMA 3EU4A 4MK3A 5IO0A 1FO5A 5EVOA 2ZUPA 4HZ4A 2YWNA 1OC9B 1WRYA 2DJ3A 4KCEA 3VK9A 4EUYA 3LFLA 1ABAA 6GSWA 1A8LA 3KZQA 4ACSA 3TJFA 4LL1B 4KB3A 4Q5NA 2IL3A 1MD3A 3ISOA 5CRDA 3F8UA 4HQZA 5ECIB 2FA8A 4CDOA 2AB6A 4HEA2 1YF0A 2GS3A 2FWFA 3HCZA 2GGTA 2YWMA 4BVXA 1THXA 2GSQA 1X0RA 1ZCPA 5KEJA 2FCHA 2VLTA 3SBCA 4JR4A 2LNTA 4WBJA 1TDIA 3LYKA 2HRNA 1GTIA 5D9VA 4IELA 2VL9A 2YWIA 5CNWA 5JWRB 2DJ1A 3IV4A 1DE1A 2H0IA 2VCQA 1S3CA 2H70A 5FT3A 4ILFA 3D4TA 5EL8A 2E2GA 3GH6A 4TXOA 3MSZA 1R26A 1N8JA 4PXOA 3V1WA 4BPYA 1QUWA 1HNCA 1E6BA 5IM9A 1V2AA 2QGVA 4OWYA 1Z3EA 1PRXA 4NHZA 1TU8A 2O89A 2YV7A 4ID0A 4IGJA 3HDCA 1XW6A 4RUVA 1T4ZA 2V6OA 4QL7A 2CQ9A 2FWHA 2B5XA 3D21A 1B48A 4WXTA 2H30A 2CV4A 4HQSA 4AGSA 1ZOFA 5GZZB 1K0AA 2YV9A 2RUEA 2LUSA 2VL3A 1YKAA 1EGOA 5DAKA 1T1VA 5L71A 2ON5A 3KP8A 3L9SA 3P8WA 2N5AA 3WGXA 2OBKA 4GTUA 3C71A 3PINA 2F8AA 1XWBA 3ZLPA 3TRQA 4PQ1A 4MABA 1TK0B 4K7IA 4L5OA 5ABRA 1TU7A 2O87A 4AJ6A 2ON7A 3WT1A 1T3BA 2MMAA 1U3AA 1SU9A 4MJBA 1BQ7A 1AXDA 4X1UA 2C80A 2FWGA 4G10A 4MP4A 5HR3A 1SJIA 5IIZA 1R7HA 5CO3A 3ZYWA 1GNWA 3EU3A 3KCMA 3DKSA 3IDVA 3EYTA 3DD3A 1X5CA 3H93A 5DQSA 2DSAA 4BVXB 3GIXA 4LL4B 1A2JA 2B6MA 2LRTA 2AAWA 2QSIA 3O6TA 3D0ZA 2H1DA 4ZBAA 2MMZA 3CTFA 5GAND 2K8SA 2VL2C 4TXVA 1O8XA 3HJOA 3IR4A 3TGZA 3FK8A 2PERA 5C00A 3L78A 1PA3A 2IIYA 2EIQA 2DJ0A 6GSTA 4MPFA 2REMA 4Q5QA 4IVFA 2HQTA 5JWOB 4NV2A 1TRUA 2C0EA 3TJGA 4XCSA 4FIWA 1CQHA 2KHPA 2HSMB 2CZ2A 3TOTA 4I97A 3F4TA 2H6XA 1MDIA 3KMOA 2L4QA 4YH2A 1PX7A 3CTGA 3VPQA 4BVYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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