3MDKA

Structure of stringent starvation protein a (sspa) from pseudomonas putida
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
200
structure length
200
Chain Sequence
RLACYSDPADHYSHRVRLVLAEKGVSVQLIDVDPAHLPRKLAEVNPYGSVPTLVDRDLALYESTVVMEYLEERYPHPPLMPVYPVARGNSRLLMHRIQRDWCALADTVLDPRSSEAARTEARKALRESLTGVSPLFSEFACFMSDEQSLVDCCLLPILWRLPVLGIELPRQAKPLLDYMERQFAREPFQASLSSVEREMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Stringent starvation protein A
publication title Structure of stringent starvation protein A (sspA) from Pseudomonas putida
rcsb
source organism Pseudomonas putida
molecule tags Transcriptional regulator
total genus 64
structure length 200
sequence length 200
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3mdkA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3mdkA01
3IDVA 1V9WA 1NHOA 4FYUA 1HD2A 1PSQA 3DMLA 1RW1A 3VI7A 2XPDA 4MCUA 3GMFA 4KCAA 2O8VB 5IMDA 2YV7A 5DDLA 4WETA 3KTBA 3KH7A 1A2LA 2LQOA 2REMA 4LL4B 1PX6A 1YEPA 2ZUPA 3TOUA 2OBKA 3CRTA 4V1Ap 1JHBA 5IMVA 3K8NA 1GSFA 3VWUA 3DRNA 2CVDA 5ID2B 1U3IA 2VAFA 5B7CA 2HE3A 1FO5A 4I2UA 3O6TA 1H75A 2HSMA 2WDUA 2IPAA 1PKZA 5FT3A 3G7IA 3G9BA 4ZILA 1FW1A 4MZBA 1YDKA 1S3DA 5D9VA 3F9UA 2DJ3A 4ECJA 3CSIA 2HSHA 5B8BA 2VOCA 5ECPB 3ZIVA 1HYUA 2PBJA 2OE0A 1K0AA 3ZLPA 4ZIJA 3SWLA 3R2QA 5IMCA 3E3EA 1LBKA 1U6TA 4EXJA 2HXKA 2VO4A 2JSZA 1TRVA 2KOKA 2DMLA 4HOJA 1QMVA 4TR4A 3TJJA 4E8HA 3FK8A 2L6CA 5E4WA 3ZTLA 3HJMA 1V58A 2MBSA 4ECBA 2H6XA 4PXOA 3WYWA 4HDEA 4D73B 4KDYA 1V40A 1MDKA 1FVJA 2KLXA 4HJMA 3C1RA 3N5OA 4NHWA 5COHA 2FWHA 4J57E 4PNGA 5AIXA 4ECIA 4I5QA 4LMWA 3QPMA 5F0GA 1YJ6A 3TRXA 1BEDA 4NMUA 3D21A 4BA7A 2I81A 2HNLA 5G5FA 1E6BA 3GSSA 1OKTA 1GUKA 3EVIA 4K7NA 2HZFA 4HQSA 1BJXA 2H76A 2LNSA 4PTSA 5CNWA 4MPFA 1SL1B 1Y6EA 2E7PA 1SU9A 4WF5A 4CW9A 1JZDA 1R7HA 4HI7A 1YZXA 1K3LA 2VM2A 1SKWB 2KHPA 5B6NA 3F3RA 19GSA 1XBSA 2X8GA 2X8CA 3KXOA 1S3AA 2YV9A 4ZBAA 1SYRA 4EDYA 3ZITA 4TOPA 5KN2A 1T8EB 2BTOT 1HQOA 4MJBA 3VPQA 2HSNB 3CRUA 4KDXA 4TXVA 2NBSA 1B4PA 1R26A 1G6WA 4USSA 4WR5A 1URMA 2GQKA 1YY7A 4Q5RA 2LRNA 4KGIA 2JADA 2ES7A 2O89A 2WGRA 4IGJA 1UC7A 1WMJA 4HS1A 3AY8A 3GRXA 3HXSA 1K0NA 2WFCA 4K0GA 4O7HA 3VFIA 4RI7A 2B6MA 3KJYA 1X5CA 2VCXA 5DALB 1JZWA 4XCSA 3LGCA 1R4WA 3W6GA 1XCCA 1EP7A 2J9HA 4L5LA 2OE1A 2RM5A 2XHFA 3EYTA 3GL5A 2X8HA 5IOWA 2OJLA 2R37A 3E0UA 3IK7A 4GWRA 2F8FA 4IJ3A 1BYEA 3NIVA 17GSA 2PN8A 2VD0A 4LA1A 5DAKB 4P3YB 4BVXB 1ERVA 1XWGA 2RM6A 1Z9HA 2A4VA 4Q5QA 2P0GA 4QL9A 3LJRA 5GZZB 3HVVA 3O3TA 3C7MA 3TKRA 2LNTA 3RBTA 5HQPA 3NOFA 3QFBC 2NPBA 2K8VA 3KCMA 1WPIA 3A2VA 4DVCA 3IK9A 1ST9A 2HRAA 6GSWA 4V1Ag 1AQWA 3LSZA 4EO3A 2C3TA 2FNOA 2IMDA 1QGVA 2PWJA 4I97A 5J9BA 3MSZA 1VF4A 4NXIA 3MWHA 3MAKA 4JRRA 2H1BA 1M9BA 3UJ1A 1MD3A 2HQTA 3GKMA 1EV4A 4HJ2A 2IFQB 5FHIA 1WE0A 4F9ZA 4ZL7A 1GWCA 1XPVA 4XIHA 3UARA 1PX7A 4WKWA 4ML6A 2XBIA 5EL8A 2C0EA 1PQNA 2WS2A 1ACVA 3D0ZA 4QQ7A 3UOMA 3KP9A 4TR1B 2MBTA 4TRXA 2GSSA 3L4NA 1PGTA 1G6YA 1K3OA 4K6XA 3I9V2 2LRCA 3P7XA 1SD8A 3GA4A 3ERGA 2C8UA 4TN8A 4ILFA 2CVKA 1MDJA 3FKFA 3P90A 2B5XA 1PMTA 4KW6A 1GSEA 2LKUA 3V1WA 2N5AA 4YQUA 1SJZA 2B5EA 4WBJA 1SL0B 1EGOA 3H1NA 1WRYA 3KMNA 1AXDA 1KBNA 3I69A 3QAGA 5A5KA 2Z9SA 1RQMA 2TIRA 2F51A 2IL3A 1F3BA 4AJ8A 1TK5B 1AAZA 3Q18A 4K8MA 1QXHA 2L57A 3VPTA 1AUCA 3KZQA 1NHYA 1ZCPA 1B4QA 2JACA 1XVQA 2O7KA 4F0BA 1AIUA 3EINA 1DSBA 2L4QA 1K0MA 3GKXA 2VL2C 4G0KA 4ZB8A 4D73A 5E59A 2R6KA 4IS0A 16GSA 2L5LA 1SKSB 4MJAA 3FRCA 3O76A 3ED3A 1OC3A 5D96A 4ZL8A 2I1UA 2GGTA 3FEUA 2IN3A 1GUMA 2DIZA 4NHZA 2TRXA 5JWQB 5BMUA 1EP8A 4FIWA 3D5JA 1UN2A 5LD0A 3D6IA 5ECMB 2FWGA 5ECQB 2O87A 4OFMA 4WF4A 2H74A 4LL1B 1PRXA 1B9YC 3RPNA 3TOTA 2C0GA 1V2AA 3ZFLA 1K0CA 1TDIA 2OKAA 2JSYA 1W89A 2CVBA 2IWTA 5CRDA 1GP1A 2QC7A 5F07A 3A5WA 5B8AA 2FGXA 1T7PB 1M2BA 5IO2A 4GSNA 3WGEA 1ML6A 2HRNA 5DCHA 1WJKA 4AJ7A 3W8SA 2MMAA 2HZEB 1XOBA 1TXXA 2WCIA 1CQGA 3R3EA 4KB3A 4NV5A 3CMIA 2CZ2A 4G0IA 5ECLB 1XXUA 6GSVA 3ZFBA 3KEBA 4NWYA 3GTUB 3GSTA 3H8QA 2RUEA 12GSA 4TW5A 3HJOA 3F4TA 2CX4A 4X43A 3HA9A 1NM3A 2C0DA 2H66A 4MABA 4OMVA 1TI1A 4FH8A 1W4VA 1DE2A 4PQ1A 5DAKA 4L0UA 1A24A 2FA8A 4BVXA 4WEYA 3WT2A 4V2MA 2AJQB 3M1GA 3EC3A 4IW9A 1FOVA 2IMKA 5ELGA 22GSA 3ZIJA 4EDZA 3OR5A 3MNGA 1TK8B 3IA1A 3C8EA 2XC2A 1ON4A 3U6VA 2QKEA 1WWJA 5ECRB 1IYIA 2GQMA 2CV4A 4KCEA 2GS3A 2GVPA 4OFTA 5IMZA 2DJJA 1IYHA 1GSSA 4PNFA 5H5RA 4JEDA 2VL9A 2BJXA 2IIYA 5DJLA 5ECHB 3L0HA 1TRUA 2PVOC 3ERWA 3F8UA 3F0IA 1U3AA 3VWXA 2IFQA 1NW2A 4J2FA 4GCIA 2WULA 3VI5A 1GTAA 4O92A 2GT5A 2H1DA 1OVNA 1B9XC 3APSA 3GN3A 4IHUA 2H0IA 5LCZA 3G7JA 2MMZA 3CSJA 3KM6A 3J7Yk 4TR1A 4KX4A 4G0LA 3M3MA 2QSIA 2YZHA 3CXGA 2OADA 4FQUA 2R2JA 5D9XA 1HNAA 5EVOA 3FZ4A 3G7YA 4GSSA 4K7IA 1G0TA 3TJBA 3C73A 1UA5A 2LV3A 2B1KA 2HLSA 2HSYA 2QGVA 3C71A 3CBUA 4YQMA 3APOA 2RLIA 6GSYA 2JU5A 3DEXA 4F0CA 5EPFA 10GSA 1JFUA 2AHEA 5JCUA 1O6JA 1GTUA 4JR4A 3M8NA 4HUAA 3QD9A 4MA9A 5CREA 5DQSA 1O8XA 4WR4A 4DSSB 4XS4B 1XFLA 3VWWA 2M72A 2DIYA 1DBYA 3ZYWA 1A8YA 2H75A 5ENUA 2WB9A 4FYCA 2H0HA 1F37A 4RQXA 2N5FA 4PX1A 3ZMKA 2JZRA 1KTEA 2B3SA 4OWYA 3L9UA 4IKHA 1NSWA 3DKSA 1FB0A 2H6YA 4TXOB 5F05A 5J5NA 4H86A 1YEXA 2C3QA 3TKSA 3EE2A 6GSUA 4JU5A 5CAXA 4GQFA 4NV2A 1Z6MA 2L59A 2K8SA 5CRHA 1WIKA 2GZPA 1M0UA 1TOFA 3F4RA 4OCEA 3LFLA 3UVHA 5F06A 18GSA 1OC8A 5KN0A 2OA7A 3E9JB 2X99A 1O81A 4L0WA 3GKNA 3TKQA 2NVLA 4V2LA 2CZ3A 2OACA 1YKCA 3J7Yb 2YJHA 2V6OA 4N10A 3UL3A 4ZB6A 1C72A 2HZEA 3HCZA 2VL3A 3DVWA 2C4JA 1GSQA 3IOSA 5DJMA 2YWIA 1K0OA 3LXTA 4HZ4A 4G10A 1ERUA 3LQ7A 3IR4A 1FB6A 2C0FA 3GTUA 1EZKA 2P31A 1J0FA 5EY6A 3BCKA 4MZCA 3LG6A 2ON5A 2DJ2A 1GSDA 1TKDB 1VF1A 1M99A 2L4CA 1YF1A 5GAND 3Q74A 5HFIA 3TKSE 3DYRA 2HFDA 3GURA 1RK4A 5HFGA 2N5BA 1VF2A 2L6DA 3EMXA 4I6XA 3DXBA 1ZMAA 2VIMA 1OYJA 3VURA 2H30A 5CO3A 2AV4A 2WRTA 3FZ5A 2G0FA 2ZCTA 5IM9A 4NPBA 2PERA 3HVSA 2DMMA 14GSA 2FCHA 1XWBA 4ACSA 4RQRA 1GUHA 1GULA 4GF0A 4Z7XA 2FHEA 3GX8A 3ZREA 4E8EA 1A2JA 2VCTA 1DUGA 3Q6OA 3U5RE 1GRXA 6GSXA 1N8JA 3ZRDA 5ABRA 1N2AA 5HR1A 1YKAA 4DEJA 20GSA 3LORA 3ZVJA 1QK8A 3KGKA 1EEMA 3PGTA 2AUVA 4F03A 2V2GA 3TJGA 3TRQA 3TJFA 2VCVA 1I5GA 1TRWA 3US3A 2VUPA 2VLVA 5A4VA 3FW2A 3IAS2 1S3CA 3L78A 1A0RP 3A2XA 1OAZA 4K1FA 4LLRA 3KTLA 1Y25A 5AN1A 2MZCA 3CTFA 4MH2A 3LYPA 2RUFA 4J56E 3IPZA 3GUSA 5B6MA 1X9SB 4ZBBA 1OE8A 4MZWA 1TP9A 4YH2A 3APQA 3LYKA 1I9DA 3EU4A 5AISA 3VLNA 1XVWA 1EOHA 5L71A 3I6AA 3Q19A 3EURA 2I4AA 3PINA 4ID0A 1X0RA 2EIQA 1ZYQB 1M9AA 4MH3A 4HQZA 1XOAA 3HY2A 4EUYA 2P5QA 2C1YA 4IVFA 1H4OA 1GNEA 4OCFA 2DBCA 3BD2A 1JLVA 4DSSA 2R5GA 1Z7PA 1MEKA 4XS4A 1B48A 2GZZA 5ELAA 3HDCA 4GRFA 1FG4A 2VLUA 4TKYA 3N9JA 2LEGA 4XS1A 3RPPA 2M46A 5IO0A 4N30A 4I8BA 2B5YA 4HZ2A 5AGYA 3HYPA 2HRKB 3RDWA 2XPEA 1X5EA 1EWXA 5CRGA 3HJPA 5F8BA 2O85A 4OO5A 4OFNA 2GT6A 3TDGA 3RHCA 1M2DA 3QR6A 2GLRA 1PL1A 1LU4A 2JL4A 4TXOA 3JCML 3UMAA 1BX9A 4PUAA 1PD21 5G30A 5G2ZA 4POMA 4XHMA 4MJEA 5DVBA 5FWGA 2K18A 3KMOA 5KN1A 3LWAA 1SENA 1TI3A 3D22A 2H1AA 3F4SA 3WGDA 4BPYA 5D93A 5DQYA 2C80A 5GSSA 2PVQA 1GL8A 5ECNB 3KIJA 4YAVA 1YF0A 1ZL9A 3GYKA 1USBA 2KUCA 4O5RA 3GH9A 4NAXA 1V57A 1PL2A 5C04A 2CT6A 3GKKA 4GTUA 2DJKA 1HNBA 3I43A 3IRAA 3F3QA 2R3XA 5D9TA 4MF6A 2FY6A 4L8EA 2GQLA 3FR3A 2CX3A 4MLYA 2H8LA 3BCIA 4KNDA 1YQ1A 5J9CA 2IMIA 3TGZA 5DBQA 4TR0A 1TRSA 4K2DA 1JZOA 8GSSA 1ZOFA 4KSMA 1XW6A 1QFNA 2B1LA 4DSRA 4GQCA 3FYGA 1V98A 2KP2A 2YP6A 1A2MA 2XBQA 1GLPA 1GLQA 2C3NA 4MK3A 4IBPA 11GSA 2K9FA 4HU9A 1Z7RA 1TW9A 3CYNA 3ME7A 1EGRA 5IMAA 3NZNA 5GAPD 2AYTA 3ERFA 2LJKA 4G9HA 4EVMA 3PPUA 2L5OA 1GSUA 3QFAC 1Z5YE 4POKA 2UZ8A 2MMOA 4BWQA 4GLTA 2ALBA 1Z3EA 5IOXA 3A2WA 2CA8A 2FWFA 3IE3A 3ZMLA 3ZL5A 2GSQA 1PKWA 2EIRA 4G19A 4YAPA 1K3YA 2YWOA 2OBIA 4MP4A 3KD0A 5INYA 4O32A 4AJ6A 4Q5FA 1K0DA 3TKSC 5D9WA 3WT1A 3TRPA 4ZB9A 4EF0A 3H79A 4TVEA 5IMFA 4PQHA 2I9HA 2DSAA 3EWLA 1THXA 1X5DA 1TJDA 1SK1A 3DGQA 4XRDA 2G2QA 5HR2A 4Q5NA 3QAWA 9GSSA 3KP8A 3P2AA 1DE1A 4POLA 2LS5A 2KP1A 2VCZA 3PH9A 4KE3A 3UBLA 1U87A 1TU7A 3UBKA 1TTZA 2LJAA 2YZUA 6GSSA 1SJIA 2F9SA 1KEBA 1VGLA 2RIIA 4KF9A 2GSTA 5IPHA 3QCPA 2DC5A 1LJRA 2FUG2 4RUVA 3CSHA 1XW5A 5IIZA 1GTIA 5CP1A 2HYXA 2LSTA 5JWRB 5A4UA 3FHKA 2ZNMA 1GNWA 1SJ6A 3HD5A 2YWMA 2HI7A 4KA0A 2FD3A 4FO5A 2NTOA 1F9MA 3D4TA 4BL7A 3F6DA 2BMXA 4ULXA 2V6KA 4JZQA 2PGTA 1KNGA 5G1KA 1R5AA 2PMTA 3UEMA 4PGTA 3IAM2 5ECKB 1SD9A 3GL3A 3HVXA 5DCGA 5H5QA 4MF5A 3GH6A 4N11A 4BVYA 1SKRB 2B7KA 1E2YA 3DIEA 5GSTA 1ZGNA 3BBYA 3ZVJD 5G1LA 4DSQA 1R5PA 2HRKA 1OC9B 1T3BA 2PPTA 2H01A 2K6VA 5IQYA 1Q98A 1TU8A 3F6FA 1QQ2A 4F82A 3M0FA 3D4MA 4IQ1A 3SBCA 2YOIA 3W8JA 3HKRA 5HR3A 1M2AA 2JZSA 3FY7A 4MPGA 2VCWA 4FYBA 2NDOA 1G7OA 1FHEA 2LJRA 1EEJA 4F2IA 3CTGA 2YWNA 3F63A 2WZ9A 4I2TA 3HZ8A 5J41A 2IMFA 4JE1A 3L9VA 3WGXA 2MYGA 4X1UA 3EMPA 1AC1A 4IP1A 2V32A 1PN9A 4YQVA 2M80A 3LXZA 4KUNA 4CDOA 4GXZA 3LEFA 3P8WA 2WJUA 1FAAA 3VWVA 1MTCA 1MDIA 3RAZA 1O85A 5ECSA 4ZXGA 1FVKA 2AB6A 2GZYA 5D73A 1K0BA 2CQ9A 2DJ0A 2GDRA 3GV1A 2H71A 5LNKe 3HZ4A 3MDKA 2OE3A 3ME8A 3QOUA 4G2EA 4V2NA 3A3TA 4EE0A 4WXTA 1EV9A 5G31A 1MD4A 5J4UA 1J08A 1Q4JA 3UVTA 3GX0A 2LUSA 2DLXA 4AGSA 2HSMB 3IC8A 3DD3A 5HFKA 3DWVA 3FZAA 3FR6A 5D8IA 1SL2B 4OD7A 5J3RA 1T1VA 3EU3A 2R4VA 1OE7A 1GSYA 5KN3A 1AW9A 1F6MC 1EOGA 4N0ZA 4PURA 1SYXA 2A2RA 2PUKC 3GHAA 2HRFA 5CYYA 2ON7A 4IQAA 1SK2A 1O8WA 4HEA2 1OKDA 4IELA 4ZBDA 2YJ7A 4L5OA 3IHQA 3RHBA 3WD6A 2H6ZA 1X9MB 2J23A 5ID2A 2E0QA 1SK0A 4OO4A 1CQHA 1THOA 3GNJA 5IPGA 5KEJA 2VLTA 3IXRA 3H4KA 4MJCA 4XS6A 3BOAA 5AIVA 1GTBA 5H5SA 2VD1A 1JLWA 1XWAA 2E2GA 1TK0B 5JWOB 5ECIB 3TUEA 1WP0A 2LQQA 3FZ9A 1XWCA 1PA3A 3S9FA 4CHSA 1A23A 4WBRD 3IC4A 4KDUA 3M9KA 4MMMA 5CRWA 2B7JA 5G5EA 4K9ZA 2E2MA 1BAYA 1B8XA 2EC4A 1XZOA 2LTKA 4K0NA 3QMXA 2D2ZA 1T4ZA 2IMEA 1A8LA 2FLSA 3PR8A 2A2SA 13GSA 2VM1A 2EIOA 2H73A 1VRSD 3ISOA 3FR9A 1U88A 2P5RA 4N0VA 5JCGA 4BL7B 1XW9A 1ZZYA 4ML1A 3QDNA 1X9WB 2MMNA 3L9SA 4BWSA 1Z6NA 3UAPA 4XRAA 1F3AA 3GFKA 1BQ7A 7GSSA 1J9BA 4RI6A 4BVYB 2H72A 5A4WA 3TB2A 1O7UA 4EC0A 1T00A 4IJIA 2YCDA 1AQVA 3M9JA 3C1SA 6GSTA 5HR0A 4MF7A 2FWEA 4JR6A 5C00A 2YNXA 1ZYEA 4HU7A 3TJKA 5JCWA 4JBBA 4EKZA 2VCQA 3DVXA 2FA4A 1HNCA 1BG5A 2JZTA 1F2EA 3H93A 3HHVA 4ZL9A 1XWKA 3ZZXA 4MDCA 2F8AA 1XIYA 2H1GA 3BJ5A 1GH2A 3VK9A 3TKPA 4LMVA 2H0GA 4ECCA 2V41A 4IN0A 1VF3A 2TRCP 3IV4A 2AAWA 2YN1A 4KSOA 1M7TA 2H19A 3IBHA 1ABAA 2GSRA 1ERWA 4EL1A 4AF2A 2YANA 2H70A 4PQIA 4KH7A 1UVZA 2LRTA 4K7OA 4PUFC 2IJYA 2YPMA 1OC9A 2CAIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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