3MDKA

Structure of stringent starvation protein a (sspa) from pseudomonas putida
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
200
structure length
200
Chain Sequence
RLACYSDPADHYSHRVRLVLAEKGVSVQLIDVDPAHLPRKLAEVNPYGSVPTLVDRDLALYESTVVMEYLEERYPHPPLMPVYPVARGNSRLLMHRIQRDWCALADTVLDPRSSEAARTEARKALRESLTGVSPLFSEFACFMSDEQSLVDCCLLPILWRLPVLGIELPRQAKPLLDYMERQFAREPFQASLSSVEREMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transcriptional regulator
source organism Pseudomonas putida
publication title Structure of stringent starvation protein A (sspA) from Pseudomonas putida
rcsb
molecule keywords Stringent starvation protein A
total genus 64
structure length 200
sequence length 200
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3mdkA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3mdkA01
4WKWA 2DJKA 2V2GA 5E4WA 2VD0A 3HCZA 1JZDA 4NV2A 3ZL5A 1LJRA 4IKHA 1I5GA 2PVOC 2YZUA 3EYTA 3TOTA 3IAS2 3A3TA 3IOSA 1XWBA 3ZFBA 4KNDA 5E59A 4TVEA 3KJYA 4ZB6A 1K3OA 2VIMA 5IMFA 5A4UA 4TR1A 5ABRA 4D73A 1OC9B 1OYJA 2H76A 3TB2A 1LBKA 3HZ4A 1A2JA 3GSTA 4MDCA 2RM5A 3A2WA 2YPMA 4DSRA 4N11A 4HI7A 4PUAA 3GNJA 1PL1A 1OKTA 1AXDA 5GAND 5INYA 3J7Yk 3KMOA 1TI1A 4MF5A 5CNWA 4RI7A 3KH7A 2VUPA 4V2NA 5IM9A 5DQYA 5ECPB 3VI5A 1A8YA 2OACA 5JCUA 2MZCA 2A2SA 2LJRA 2KLXA 2HRAA 3IK7A 2JZSA 3ERWA 3EU4A 2HLSA 3GKKA 3LYKA 1B9YC 2O7KA 1EOHA 2CVBA 2AHEA 4WEYA 4MA9A 4K0GA 4ZBAA 2LKUA 3MNGA 4FYCA 4H86A 5IO2A 2FHEA 3FKFA 2AUVA 2HYXA 5ECQB 1GUMA 4BVYA 3O76A 4TRXA 3TJJA 4KSMA 1TU8A 3RHBA 1M9BA 1AW9A 2OA7A 5JCGA 1AQVA 3TJKA 1MDKA 2C0EA 1OE8A 1GTBA 4X0XA 1Z7PA 7GSSA 2LUSA 1O8WA 4DEJA 2C4JA 2BTOT 1GSFA 1XOAA 2MMOA 3F6DA 3UOMA 1WIKA 3QAGA 5EVOA 1XWAA 2OKAA 3CYNA 1M9AA 2GT5A 3QAWA 1AQWA 2BMXA 5D93A 1EEMA 3FEUA 1EGOA 2WZ9A 2OBIA 2DJ3A 2JSYA 1GULA 4KAEA 3CRUA 3KMNA 1TK0B 4BWSA 4J56E 5ECRB 3PGTA 2H74A 1YZXA 2DIZA 5HR3A 4KCAA 3QFBC 3QMXA 3L9SA 2WB9A 3EVIA 3HJMA 4ID0A 4KGIA 2VL3A 1XOBA 2EIOA 4G0LA 5AIVA 4GSTA 3MWHA 4XRDA 2WS2A 2P5RA 2NPBA 3LG6A 1T3BA 3KTLA 1O73A 5D73A 5G5FA 3D6IA 5KN1A 1XWCA 1PSQA 1NHOA 3IK9A 2CQ9A 5A4VA 1WPIA 2L57A 3DMLA 4KF9A 1LU4A 2E7PA 4KDXA 4BPYA 5IMAA 2L6CA 4F82A 1G7EA 4RQXA 2HZFA 1T4ZA 1PRXA 3D5JA 1B4QA 2FCHA 5LD0A 2LQQA 3GKMA 3LJRA 4I6XA 1H4OA 1DUGA 1TTZA 2DJ2A 3APOA 1VRSD 4NAXA 4K6XA 5L71A 2AV4A 3UMAA 2VCTA 3GTUA 3P8WA 3FZ4A 4BWQA 2H19A 1G6WA 2JZTA 2OADA 2DJJA 1OC8A 2A4VA 1ST9A 2C3TA 2VCVA 1R7HA 3NIVA 4GLTA 3BOAA 2C0GA 3O3TA 2CVKA 2YANA 2PUKC 2YJHA 1F3BA 3ISOA 3GX8A 5CREA 4NV5A 2HRKA 4MABA 1I9DA 3ZREA 1SU9A 5IMDA 1YQ1A 4EDYA 1E2YA 1SKWB 5D9WA 4NXIA 4J57E 5IOXA 2MBTA 1A2LA 3CRTA 3G7YA 1PGTA 2RUFA 1T4YA 1EV4A 1ERWA 2H73A 4Q5NA 2DMMA 1PX7A 3HXSA 1GRXA 4HZ2A 1FAAA 2HFDA 3QFAC 3IRAA 3GHAA 3GH9A 3LYPA 2X64A 1OAZA 5JWOB 4FO5A 3CMIA 5FHIA 4GRFA 1UN2A 4KCEA 1K3LA 4BVXA 3HJPA 3RDWA 1PD21 5IQYA 1UC7A 2CX4A 4PQIA 2LEGA 3IBHA 4KX4A 4CW9A 3VWUA 4ZBBA 4V1Ap 3H1NA 3HA9A 3L9UA 2MBSA 4EDZA 4JU5A 2VCQA 3KCMA 5IOWA 3TKSA 1OKDA 3GV1A 4EO3A 4GWRA 2X8GA 1AUCA 1ERUA 1EP7A 4ISDA 4XRAA 1FG4A 1YEXA 2GQMA 5DJMA 4ML6A 2MMAA 4TR0A 1PMTA 1A0RP 3A2VA 3EC3A 4LL1B 1TRUA 4ZXGA 4LLRA 1O85A 2HZEA 2OE0A 2V32A 2KUCA 3LSZA 5HFGA 4HUAA 3KD0A 1XPVA 4PNFA 4OO5A 2VL2A 2X8CA 4EXJA 1PA3A 4TXVA 4PQ1A 4HQSA 5J9CA 2IMKA 4KSOA 1YY7A 3G9BA 2GSTA 2K8VA 5ID2B 4GSSA 2AJQB 5F07A 4ULXA 4MK3A 1Z5YE 2XBQA 6GSUA 4K7OA 4EC0A 5B7CA 1ZYQB 2GT6A 1EV9A 3A5WA 3LGCA 2C1YA 2AAWA 5DBQA 2H01A 2GSRA 1B48A 3HZ8A 9GSSA 4BA7A 3GKNA 3C1SA 4DVCA 4FYUA 1GWCA 3VURA 2YWMA 2B5YA 2WDUA 3KP9A 1M7TA 3TRPA 17GSA 3EE2A 2TRCP 1X5DA 2HRNA 5ECIB 3MDKA 5H5QA 4GXZA 1ABAA 3CSIA 2MMNA 2N5FA 3UL3A 1VF2A 2HSMB 3C71A 4HU9A 4O7HA 1GTUA 3W8SA 3ZMLA 1K0CA 1YEPA 3TJFA 2OE3A 2AB6A 2OJLA 2YOIA 4Q5QA 4PGTA 2GGTA 4MH2A 2R37A 4N10A 3ZFLA 2MYGA 2EIQA 2H1GA 2IPAA 1HD2A 1BJXA 4L5LA 2PN8A 4MJEA 1FHEA 1M99A 1S3DA 4PURA 3KIJA 4TXOA 4F0BA 5HR2A 4ZL8A 3L78A 5ECHB 2KHPA 3BCIA 3P2AA 4NHWA 3H93A 2HSHA 4IP6A 3FY7A 2LRCA 3M0FA 16GSA 1TXXA 1ZOFA 2QC7A 4TR4A 4QL7A 2M80A 3CTFA 3F3QA 3ZRDA 4GCIA 1X9MB 2PVQA 5CAXA 1XCCA 6GSSA 4IBPA 4PNGA 4MPGA 2I4AA 1GUKA 1OVNA 3RHCA 11GSA 4Q5FA 1XW9A 2PU9C 1MTCA 2X99A 3F4RA 3PH9A 4HJ2A 4WF5A 4IELA 3GMFA 4ZILA 4K7IA 4K7NA 2VCZA 2B1KA 2HRFA 2GZPA 2H30A 1PN9A 4ECIA 1EZKA 2VCWA 5BMUA 4OWYA 2YN1A 3QD9A 2C0FA 3PR8A 3P90A 3J7Yb 4HS1A 2IMFA 1FOVA 1BG5A 3HJOA 1XWKA 3KZQA 1PL2A 1YKAA 4ACSA 4EF0A 4OD7A 1KEBA 5DAKB 5G31A 3CBUA 1Q4JA 4XS4B 1F6MC 3DRNA 4ZIJA 2CAIA 3VI7A 4KW6A 2VM2A 2I3YA 1AC1A 4TW5A 5EL8A 3D22A 1TJDA 2P31A 1O8XA 2H75A 1OC3A 2O87A 4N30A 4Z7XA 6GSWA 1K0AA 1XZOA 1XWGA 4K1FA 2ZCTA 5DALB 3ED3A 1Y6EA 1YDKA 4ZL9A 3M8NA 3PINA 1Z6MA 3Q74A 3ERFA 5KN3A 4FQUA 1XW6A 3R3EA 3H4KA 1S3AA 1F2EA 3AY8A 5IO0A 1B4PA 3BJ5A 5F05A 1QXHA 1V2AA 4O32A 5IMCA 5JWQB 1EP8A 4BL7A 2I81A 4JZQA 1V57A 4O5RA 2DMLA 3MSZA 3I69A 2VM1A 5J41A 1QQ2A 2GZYA 4KUNA 2DBCA 1SD9A 3KP8A 3GURA 5LCZA 3ZZXA 3F9UA 4HU7A 2WRTA 1GNWA 3ZLPA 1THOA 5DJLA 1X9SB 1EGRA 4MP4A 1O7UA 2JADA 3TOUA 3DIEA 2HE3A 5GSTA 3Q6OA 2A2RA 4TR1B 4D73B 4KDYA 3ME8A 2C3QA 1G6YA 3KEBA 2HSNB 3FRCA 4OO4A 4V1Ag 4I2UA 2RLIA 5C00A 5CRWA 3EURA 2JU5A 4NMUA 2GQLA 12GSA 2K9FA 3RAZA 1VGLA 2EIRA 3TKSC 5A4WA 3TUEA 5GAPD 2FUG2 2G2QA 2WCIA 5G1KA 1K0BA 1SJIA 1EEJA 1T1VA 2B6MA 2XC2A 5DDLA 3L4NA 2IMEA 2VLTA 2LRNA 1O6JA 1XIYA 1X5CA 4IVFA 1HNCA 4GQCA 5F8BA 3FR9A 4DSSB 1HNBA 1TRVA 2L4QA 2RIIA 3DD3A 5G2ZA 2GSQA 3S9FA 3GX0A 4BVYB 2H0IA 1GLQA 2VL2C 3HVSA 4E8EA 5AISA 5EPFA 1A0FA 5FT3A 2Z9SA 3FR6A 1MDJA 3DEXA 4IQAA 4N0VA 5JCWA 2REMA 1EOGA 3ZMKA 5AGYA 1ERVA 4K2DA 3CSJA 3DGQA 3DYRA 3W8JA 3M3MA 4G10A 1QFNA 2KOKA 3D4MA 3LORA 3NOFA 5IMVA 4J2FA 4MF6A 2NBSA 5G5EA 3BBYA 1YJ6A 4LA1A 2IL3A 2WFCA 4HZ4A 1JLVA 3TRQA 1UA5A 1QMVA 4IGJA 5B8AA 3M9KA 2LNSA 2EC4A 4LMWA 2H6ZA 5IIZA 1UVZA 5AIXA 5C04A 1QGVA 5GZZB 4L5OA 2DC5A 1YF1A 5ECMB 5HFKA 1Z6NA 4X1UA 1FVKA 2B7KA 3VLNA 5B8BA 4ZB9A 6GSVA 3FR3A 2C80A 2GTUA 1KNGA 3DXBA 4I2TA 4KB3A 1BYEA 1G7OA 2ON7A 3UVHA 3GRXA 2L5LA 3FZAA 1SL1B 3EMXA 4MCUA 1H75A 3C7MA 1M2DA 1GL8A 2YV9A 2K6VA 4PQHA 2ZNMA 1ERTA 3VPTA 1SK2A 5IMZA 1W89A 3GA4A 3DKSA 1JHBA 3N9JA 3RPNA 4K8MA 2IFQA 3GL3A 3F6FA 1W4VA 3IR4A 3WD6A 10GSA 3JCML 3D4TA 4RQRA 2IMIA 4AJ6A 3P7XA 3EMPA 4MJCA 1RW1A 5DVBA 3IA1A 3GTUB 4LMVA 2WULA 5EY6A 3DVXA 1PQNA 3ZVJA 3WGXA 2JACA 5D8IA 4PUFC 4NHZA 1J9BA 4XS6A 3HKRA 2CA8A 3M1GA 1TU7A 4IW9A 1E6BA 4JRRA 4MZCA 1PX6A 1KTEA 4MJAA 3GN3A 1PKWA 1USBA 2VOCA 1HNAA 18GSA 1WJKA 2FWFA 2HRKB 4OCFA 1T7PB 1K3YA 5DCHA 1ZZYA 3APQA 1N8JA 2LNTA 4YQMA 4WETA 1XXUA 1MEKA 2YNXA 2M46A 1VF1A 4ZB8A 4IS0A 2KP2A 3WGEA 1TK8B 3NZNA 2N5BA 3QPMA 1F9MA 2HNLA 3G7IA 4FIWA 4NPBA 2XPDA 3GUSA 1FW1A 4IHUA 4KE3A 4IJ3A 5HR0A 1WRYA 1JZWA 2G0FA 4WBRD 4EUYA 2F8AA 1BEDA 5F0GA 3HDCA 4YQVA 4XCSA 2PPTA 5A5KA 3EINA 3HVVA 2V6KA 3LFLA 2I9HA 2B7JA 1GNEA 4AJ8A 3ZIVA 1OC9A 2E0QA 1J08A 2IJYA 1A24A 1IYHA 3QAVA 2C8UA 3OR5A 1JFUA 3UEMA 1SKRB 4KH7A 1XW5A 5B6MA 2HZEB 3N5OA 2GLRA 1N2AA 3UVTA 1AQXA 4ILFA 1NW2A 4G0KA 4ZBDA 2DJ0A 3CXGA 1WE0A 1G0TA 3DWVA 2V41A 2AYTA 3UBKA 3IXRA 3TKQA 4AF2A 3TKSE 2K18A 2J23A 4JR4A 1M2AA 3IV4A 2L59A 5ECNB 1MD3A 2YCDA 4OCEA 1Q98A 1U87A 3F8UA 3ZITA 2FWHA 20GSA 1TRWA 5DALA 1FB0A 4OMVA 5ECSA 2OE1A 1GP1A 1TDIA 2B5XA 3QOUA 5D9TA 2ZUPA 1TK5B 2TRXA 4AJ7A 1ZMAA 1Y25A 4OFMA 4GTUA 1NHYA 1SL0B 4POBA 2RM6A 1RK4A 5CP1A 1R26A 4XIHA 3VWVA 5CO3A 1NSWA 3LXTA 3I9V2 3U6VA 1JZOA 3QDNA 3HYPA 1SK0A 4G0IA 4KA0A 2DSAA 4O92A 5GSSA 2VLVA 1A2MA 5H5SA 2YP6A 4HQZA 2GZZA 3VWWA 3ZYWA 1TP9A 3TRXA 2P5QA 4RI6A 1WMJA 1BAYA 4I97A 2R4VA 4F03A 1XVQA 1V40A 5H5RA 3SWLA 1GSYA 4F2IA 5HR1A 2WGRA 2CX3A 3GKXA 3HVXA 3U5RE 1ML6A 2ALBA 3C1RA 2CZ3A 3QCPA 2FGXA 5COHA 5IPGA 1R5AA 4TXOB 2H71A 4ML1A 2VCXA 4L8EA 3GYKA 2L6DA 2LTKA 5ECLB 3E3EA 1XBSA 2CV4A 1Z9HA 2LJAA 1C72A 4KDUA 2WJUA 2FA4A 1IYIA 2PWJA 3HY2A 3VPQA 4NWYA 2B1LA 4EKZA 3IE3A 3ERGA 1FVJA 2HT9A 4CDOA 1GTIA 14GSA 2ON5A 3KH9A 3KGKA 2LQOA 1V98A 3VFIA 3H8QA 1WP0A 4DSSA 2F9SA 4EVMA 2HXKA 5CRGA 2IN3A 3F3RA 2H1DA 3I43A 4POLA 4IJIA 5HQPA 2XBIA 5ELAA 3IC4A 4OFNA 3Q19A 2J9HA 4F9ZA 1AIUA 3BCKA 2UZ8A 2LS5A 4V2MA 1SK1A 2H70A 3GH6A 2LSTA 4MZWA 3W6GA 3TDGA 5G30A 3E9JB 3UAPA 4F0CA 3G7JA 1AAZA 3LEFA 5J3RA 1GUHA 1DE1A 3RBTA 1GLPA 2R6KA 1O81A 1CQGA 3IAM2 5J4UA 2B5EA 2YZHA 3DVWA 1GSQA 3WT2A 5AN1A 3UJ1A 4WR4A 4X43A 3IC8A 3HHVA 4TOPA 2JL4A 3UARA 2FD3A 2YWIA 4DSQA 5ELGA 2JZRA 2OBKA 4L0WA 1M0UA 2YWNA 2LV3A 3TCOA 3FYGA 4JBBA 4HOJA 3FHKA 3L0HA 1B8XA 2FLSA 1ACVA 5F06A 3TKRA 5CYYA 3BD2A 2VLUA 3H79A 1V9WA 1T8EB 3FK8A 1X0RA 1SJ6A 2FWGA 3GSSA 5D9VA 1FO5A 1F3AA 2YV7A 3PPUA 1TI3A 4USSA 3RPPA 1FB6A 3WYWA 5B6NA 2CZ2A 4XS1A 1GSUA 3FW2A 4BL7B 2NTOA 3F4SA 4AGSA 3UIWA 4RUVA 4K9ZA 2FA8A 2PBJA 2H72A 3E0UA 4FH8A 3ME7A 3O6TA 2YJ7A 1ZGNA 4ECJA 4PXOA 5DCGA 2NDOA 4OFTA 2DLXA 3TGZA 1X5EA 2VD1A 3QR6A 2QKEA 3EWLA 5KEJA 2QGVA 4YAVA 13GSA 4ECBA 3FZ9A 4WBJA 2CVDA 3LXZA 2H1BA 2JSZA 2F51A 3CSHA 22GSA 3R2QA 4ECCA 2IIYA 3IDVA 2B3SA 4XHMA 2HQTA 1HQOA 3C8EA 4TN8A 5D96A 3ZIJA 1S3CA 4HJMA 2C3NA 5JWRB 1WWJA 8GSSA 4GF0A 3TJGA 1SJZA 4WR5A 4I8BA 1YKCA 2H6YA 2R2JA 5KN2A 3TKPA 1X9WB 2H8LA 4IN0A 2NVLA 3V1WA 2IMDA 6GSTA 1VF3A 4XTSA 3GL5A 3F63A 6GSYA 5ID2A 4MH3A 2H0HA 4HDEA 3MAKA 1ZL9A 2E2GA 2GQKA 1M2BA 3D0ZA 2H6XA 4Q5RA 1SKSB 4WF4A 4TR3A 4GSNA 2VAFA 2PERA 1TKDB 1URMA 1JZRA 1SYXA 2IWTA 5CRDA 3CTGA 1MD4A 2FY6A 4EL1A 2XPEA 3TJBA 3APSA 2X8HA 4HEA2 3C73A 1T00A 1A8LA 1JLWA 1GSEA 1EWXA 1YF0A 4JEDA 5HFIA 1ON4A 1BQ7A 1SD8A 3KXOA 1B9XC 4PX1A 2BJXA 4QQ7A 4G9HA 5DQSA 1ZCPA 4POKA 4POMA 4MPFA 5ENUA 2N5AA 1KBNA 2H0GA 2HSMA 5FWGA 2HSYA 2K8SA 1TOFA 4GQFA 4N0ZA 4MZBA 4YH2A 3GFKA 5G1LA 3LQ7A 1GSSA 1OE7A 1GH2A 5J5NA 1THXA 2KP1A 1U88A 6GSXA 2LJKA 1XFLA 4WXTA 1A23A 1TW9A 1K0OA 2DJ1A 4QL9A 2DIYA 3A2XA 2H1AA 2GS3A 1ZYEA 2GVPA 4E8HA 4MMMA 1TRSA 2O85A 2GDRA 3KTBA 4L0UA 3ZVJD 2M72A 1Z7RA 1K0DA 3FZ5A 1K0MA 1U3IA 3K8NA 1VF4A 3HD5A 1XVWA 4JE1A 2VO4A 1QK8A 4LL4B 1HYUA 2O8VB 1SENA 4G19A 3WT1A 1BX9A 2FNOA 1DSBA 4EE0A 2H66A 1Z3EA 2IFQB 4MLYA 2I1UA 2CAQA 4BVXB 5IPHA 5D9XA 4MF7A 4YQUA 1GTAA 2FWEA 4CHSA 4PTSA 2RUEA 1U6TA 5CRHA 4IQ1A 5LNKe 1J0FA 5ECKB 1DE2A 3SBCA 4YAPA 5KN0A 1K0NA 2VL9A 5ECOB 1V58A 4IP1A 4G2EA 2YWOA 2F8FA 2ES7A 2O89A 3WGDA 2MMZA 3VK9A 3F0IA 1PKZA 3UBLA 1SYRA 1QUWA 4TKYA 4FYBA 3KM6A 2GSSA 4JR6A 3GIXA 5J9BA 1U3AA 3F4TA 3EU3A 5DAKA 3D21A 2CT6A 4XS4A 2R3XA 2L4CA 3LWAA 1R5PA 2V1MA 2V6OA 2XHFA 2D2ZA 3I6AA 2F3MA 3L9VA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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