3PGTA

Crystal structure of hgstp1-1[i104] complexed with the gsh conjugate of (+)-anti-bpde
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
210
structure length
210
Chain Sequence
MPPYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIYTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure and function of residue 104 and water molecules in the xenobiotic substrate-binding site in human glutathione S-transferase P1-1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (GLUTATHIONE S-TRANSFERASE)
total genus 83
structure length 210
sequence length 210
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 1999-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3pgtA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3pgtA01
1U87A 4HDEA 3LYPA 3BJ5A 2VCVA 2DJKA 4FQUA 2HE3A 3H79A 2X8GA 5D9WA 5ID2A 3WT1A 1RK4A 1WWJA 1EOGA 4TR3A 4GSTA 3O76A 1PL2A 2X99A 1T7PB 3CBUA 2HXKA 1VGLA 1DE1A 4NPBA 3ZVJA 2P0GA 2WFCA 1TK0B 1ERUA 1TU8A 1GUKA 3GYKA 1SKRB 2IIYA 1GTUA 1G7OA 3KIJA 1OC3A 2FUG2 2WS2A 2LEGA 4MF6A 3R3EA 2DJ3A 1YEXA 3EE2A 2PWJA 4N11A 5ECHB 1RW1A 3H93A 5CRGA 5J5NA 1V57A 3GH6A 3IBHA 3HYPA 2EIOA 1GTIA 3C73A 1X9SB 5ECIB 22GSA 3M0FA 3BCIA 2CV4A 4DSSA 2GZZA 2CZ2A 4XRAA 1S3AA 4EL1A 5FWGA 2AUVA 3ERFA 4ECBA 3TGZA 1F3BA 1N8JA 2QC7A 4KCAA 1G6WA 2G0FA 1R7HA 2NDOA 2F51A 2K18A 4RQRA 4E8HA 5IO2A 1OC9B 2QGVA 2FA4A 1ON4A 2YNXA 4LL4B 4GSSA 2H0HA 3PGTA 4HZ2A 1FVKA 5EVOA 1DUGA 1B4QA 3DVWA 2GGTA 1J9BA 4K7OA 4GRFA 3GA4A 2AHEA 2REMA 3C8EA 2RUFA 1YQ1A 2WB9A 4ML1A 2BMXA 3HJMA 5GSTA 3TRQA 3D22A 2TRXA 4CDOA 4EC0A 4HI7A 1XBSA 1B48A 3D5JA 3FHKA 3N9JA 4YAPA 2R5GA 5IQYA 2C3TA 1U6TA 4KDUA 1OE8A 1GSEA 2H1BA 1U3AA 2YWIA 2MMNA 5CYYA 2IFQB 1YKCA 4DSRA 4EDYA 1FHEA 1SJZA 2GQLA 1F9MA 1QK8A 11GSA 2LNTA 2B5EA 1XVQA 4ZB8A 3CMIA 1LJRA 2E2GA 4PNGA 4G0IA 3GIXA 5HQPA 1ERWA 1THOA 1GUHA 1ERTA 2OACA 1HNAA 3ZMKA 3HD5A 5E4WA 2MYGA 5IOWA 4MF7A 3KTLA 1PSQA 2I3YA 2PVOC 2V6OA 4O7HA 1CQHA 1NHYA 3QFBC 3KZQA 2IMIA 3RBTA 3EINA 4TR0A 5DAKB 3LG6A 1SD9A 2YWMA 5J4UA 3KCMA 3KP9A 2CZ3A 4MF5A 5ELAA 2IJYA 1U88A 3U6VA 1X5EA 2B7KA 5DJMA 2FHEA 3F4SA 3GHAA 5IMFA 1F37A 1TTZA 3JCML 3F4RA 3W6GA 2X8HA 3LXTA 2FNOA 4X0XA 2B6MA 1PMTA 2HSMA 2H72A 1GWCA 1GSSA 2F8FA 4ZB6A 1M7TA 2ON5A 3OR5A 4MH3A 3O6TA 4X43A 1G7EA 1K0CA 1FB6A 4IQ1A 4MPGA 3GL3A 4POLA 1T1VA 1AC1A 4F2IA 1NW2A 4IHUA 3PPUA 3VPQA 3CYNA 3Q74A 1G0TA 2LRTA 3G7YA 2RM5A 1Z7PA 1ZYQB 1R5AA 1TI3A 1TU7A 4IELA 3A2XA 4AJ6A 2PGTA 4PUAA 1EWXA 5HR0A 4POMA 1SJIA 4F82A 3UJ1A 4KH7A 1F3AA 1UN2A 1GLPA 3UBKA 1M2DA 2B1KA 1U3IA 3MSZA 2YP6A 3MAKA 3UARA 4YQMA 3PH9A 4JE1A 3M9KA 4PUFC 4L5OA 5LNKe 4MZBA 1GSQA 1MDJA 2NBSA 4MLYA 4V2LA 3TKSA 4MZCA 4BWSA 3J7Yk 4XS1A 5IMZA 1UC7A 2YJHA 2C3NA 2IMFA 2FA8A 3TRXA 2RM6A 4NAXA 1ZGNA 2VCWA 3FZ9A 4OFTA 4BVYB 5ECMB 2JSZA 5ECSA 4HS1A 4MJEA 5E59A 5ECLB 4FYBA 4PXOA 3C1SA 1GRXA 2PPTA 4CHSA 3KH9A 3ERWA 3TJGA 5B7CA 5H5SA 18GSA 3LXZA 1TW9A 2XPEA 1LBKA 3HZ4A 3EWLA 4TKYA 2NPBA 2HQTA 5F05A 4F03A 3BCKA 2C8UA 3TDGA 3SWLA 5B6NA 4IQAA 2V32A 5G1LA 3F8UA 2YV9A 5F07A 4ZB9A 2YPMA 5A4UA 2OBKA 2FY6A 3GSSA 2YJ7A 1GNEA 2C0DA 3AY8A 3IPZA 4O32A 5DALB 2K9FA 3TOUA 1SK2A 3MDKA 3US3A 1Z9HA 1ZYEA 4PTSA 4TW5A 1JLVA 4KUNA 4ILFA 2XBQA 4MCUA 5IOXA 4YAVA 1QQ2A 1TRSA 5IPGA 3TJKA 2OE0A 4JEDA 4L5LA 3ZITA 4TR4A 4HEA2 2PUKC 1IYIA 3SBCA 4ZBDA 4BPYA 2GTUA 2XC2A 5D96A 2L4CA 3F63A 3A2WA 5D9TA 1PGTA 2JZRA 1GLQA 3IOSA 2WZ9A 2AB6A 3RAZA 3GTUA 5EL8A 3A5WA 1AXDA 4KGIA 1FVJA 1X9MB 4K0NA 1OC9A 1WPIA 1G6YA 5CREA 2ZNMA 5CRDA 1UVZA 6GSYA 1AQXA 2OE1A 4JU5A 4MZWA 2E7PA 5G30A 3TOTA 1RQMA 2C3QA 1KTEA 5B8BA 4GXZA 5HR1A 2N5BA 3UMAA 1VF2A 1LU4A 2FLSA 3HVVA 2TIRA 4KDXA 2QSIA 2O89A 17GSA 5IMCA 2MMAA 13GSA 4K9ZA 4EE0A 3C7MA 1O85A 2DMMA 5G2ZA 2PMTA 4IJIA 3VWXA 2LJAA 3RDWA 1HYUA 3BD2A 2EIQA 4XHMA 2YWOA 3TJFA 1SL2B 1EEMA 1E2YA 3I6AA 5ELGA 1EEJA 1F6MC 4HUAA 1XWGA 4LA1A 1WMJA 1PA3A 12GSA 2IFQA 2MMZA 2VOCA 2GZPA 2UZ8A 3HJOA 2R2JA 3UAPA 5A4VA 2GDRA 4IKHA 2VLTA 5FHIA 5AISA 3QDNA 4PNFA 1WP0A 2L5OA 1TI1A 2PU9C 4TRXA 1S3DA 1C72A 5C04A 2H8LA 2IWTA 4I2UA 2AV4A 2I9HA 4N0VA 1V2AA 2V1MA 3WGDA 4RQXA 3DMLA 3GUSA 5F8BA 4BVXB 1FB0A 1WRYA 1W89A 1PKWA 3IA1A 4V2NA 2H6ZA 1O7UA 3ZZXA 4USSA 4K7IA 3HXSA 2Z9SA 1ZMAA 1A2JA 4HU9A 3O3TA 1EZKA 3GX8A 1OVNA 2M80A 2LJKA 3F3RA 3KMOA 3ZLPA 5LCZA 2H01A 1SYRA 2B1LA 2B3SA 5AIVA 4YH2A 3TJJA 4AJ8A 5DAKA 4QQ7A 1XWKA 5CRHA 5GZZB 6GSVA 1ERVA 2B5YA 4GSNA 1FOVA 4TXOB 1TK5B 1ILOA 3P7XA 3CTFA 3GURA 4GLTA 3TKSC 2H73A 4AF2A 2H1GA 5HR3A 10GSA 2LRCA 1NHOA 5G31A 1Q98A 4NHZA 2JU5A 1GULA 3A2VA 1JZDA 4TN8A 1JHBA 1ML6A 1K0NA 1O81A 3ZYWA 4J2FA 1B4PA 6GSSA 1YDKA 1EV4A 4KCEA 1M99A 2M46A 3I43A 4N0ZA 3GKNA 1HQOA 2O85A 5J9BA 2DIYA 3DXBA 4WF4A 1TKDB 3GFKA 1EOHA 4WBJA 2H0IA 1XIYA 1XFLA 2N5FA 3EU3A 2LS5A 2LQQA 4L8EA 3FR6A 3NOFA 4NXIA 1YKAA 3CTGA 5KN2A 1BYEA 3DGQA 2DIZA 2G2QA 2C0GA 1M2AA 5DDLA 1J0FA 3IV4A 4WKWA 4BL7B 1OKDA 3Q18A 4GCIA 1WJKA 3L9SA 3UIWA 2YANA 4IN0A 1H75A 4MMMA 2AAWA 3ZIVA 3L9VA 8GSSA 2KUCA 2CX4A 2K8SA 5G1KA 4IP1A 2H6YA 2VLUA 4FH8A 3PR8A 5CP1A 3CSHA 3VWUA 2PERA 3ZFBA 1EGOA 3FR3A 2V41A 3ZTLA 3L4NA 4TVEA 1T00A 2KHPA 1ZZYA 4MA9A 1SU9A 2NVLA 1GSYA 2P31A 1FO5A 4H86A 1R4WA 2IL3A 1V40A 3WD6A 3ZL5A 2LUSA 1FG4A 1GNWA 2OA7A 5AGYA 5D73A 3VI7A 3HY2A 4L0UA 3NIVA 2H0GA 2HSNB 4K0GA 1A2LA 2O7KA 3W8SA 4ECIA 5HFKA 3LJRA 1XZOA 2EC4A 2LSTA 2GSTA 5F0GA 4ZL7A 3H8QA 5DQSA 3DWVA 5DALA 4KSOA 4ZBAA 2OBIA 3KJYA 2BTOT 1PX6A 4L0WA 3ME8A 1K0BA 1UA5A 3UBLA 3TB2A 3IAM2 1K0DA 3BOAA 5F06A 3VK9A 4KNDA 3FYGA 4X1UA 3QAGA 4OFMA 1K3OA 16GSA 4IS0A 3CXGA 3W8JA 2KLXA 4EXJA 1QMVA 3D0ZA 1YF1A 4MDCA 4WXTA 1YEPA 1Y25A 5ECNB 3IHQA 3Q6OA 5DCHA 1VF4A 5DJLA 1AUCA 3D6IA 1V9WA 1XPVA 4DVCA 2PN8A 1GL8A 5BMUA 2HRKA 3PINA 4QL7A 4LLRA 1MEKA 3KEBA 2GSQA 2CX3A 2R6KA 2YZUA 3FY7A 1HD2A 1M9AA 3GKXA 2O87A 2LTKA 1GSDA 3UL3A 4D73B 4OCFA 2FGXA 5IMDA 5IM9A 5EPFA 1W4VA 1T4YA 2CVKA 2J9HA 5AN1A 2O8VB 2WJUA 4JZQA 3L9UA 1A2MA 2WDUA 3GSTA 1V58A 2VAFA 4HQZA 4XS4B 5B6MA 3M3MA 5INYA 4TOPA 4KW6A 1BG5A 2H1DA 3VPTA 3M8NA 3L78A 3IK9A 3VFIA 3QAWA 4GF0A 4WBRD 2VCTA 2RUEA 2C0FA 1MD4A 1GUMA 3TRPA 2LJRA 2KP1A 1XCCA 5DQYA 1Z6MA 1THXA 1B8XA 3LORA 1BAYA 4AJ7A 1JFUA 1YY7A 4IP6A 1MTCA 1TXXA 2GT5A 4OO5A 4WR4A 4WF5A 1ZL9A 2AYTA 4KA0A 4LMWA 2CQ9A 2LNSA 2OJLA 1XWAA 2NTOA 4BVXA 3APQA 1PQNA 3GMFA 1TP9A 2VCXA 4NMUA 1PL1A 2CVDA 4IW9A 5JCGA 4HJ2A 3TKRA 1MDIA 3N5OA 4ISDA 1T3BA 5H5RA 2IMEA 3EU4A 1JZOA 2FWFA 4IJ3A 4FIWA 1TDIA 5D9XA 2B5XA 3CSIA 4TXOA 1GTBA 2DJ1A 1K3YA 3TKSE 4Q5NA 2H70A 4ECCA 3FZ4A 6GSXA 5HFGA 1FAAA 2FD3A 3F9UA 1O8WA 1XVWA 6GSUA 3FKFA 2IN3A 5KN3A 3QAVA 3BBYA 2GT6A 4EUYA 4JBBA 2DJ2A 2F9SA 2VCZA 4ECJA 4YQVA 2DJ0A 3DYRA 2OKAA 2VIMA 4OD7A 1A8LA 3IDVA 2ALBA 3RPNA 5HFIA 5KEJA 3HVXA 1ZOFA 1JLWA 2LKUA 1K0AA 2K6VA 1PD21 2FWEA 1O8XA 1X5CA 2QKEA 3LFLA 2FWHA 1WE0A 3FZAA 4MK3A 5EY6A 3EMXA 4JRRA 1XW9A 1SKWB 1A23A 3KTBA 3APOA 3ISOA 5JCUA 5J3RA 1SD8A 1AQVA 2H1AA 5DCGA 1O6JA 1PRXA 3QCPA 1GSFA 4ML6A 1MD3A 1URMA 2C0EA 1JZWA 4BL7A 4K6XA 2PBJA 2ZCTA 3FW2A 2VCQA 3ERGA 4ACSA 2HLSA 2VD0A 5JWRB 4POKA 4ZILA 2MZCA 3E0UA 2HSHA 4MH2A 2VL2A 4OFNA 3F0IA 2JADA 3HCZA 2HZEB 2IMDA 4WR5A 1F2EA 1SENA 1I5GA 3LEFA 3I69A 2L4QA 1AW9A 5IPHA 5C00A 3UEMA 4J56E 4BA7A 3WGXA 14GSA 2VL3A 4EF0A 2H19A 2C4JA 1QFNA 1YF0A 4MJAA 3U5RE 2JACA 2XPDA 3DD3A 3GH9A 4XRDA 2YZHA 4RI6A 2V6KA 3E3EA 4K7NA 4Q5QA 3HZ8A 2GVPA 5GSSA 3H4KA 1X9WB 1Z5YE 5JCWA 4ZIJA 2H66A 3ZVJD 4KF9A 2B7JA 3VWVA 3LGCA 1ACVA 1WIKA 1KNGA 3CSJA 4ID0A 5D8IA 5ECRB 2GSRA 2L6CA 5H5QA 3UOMA 4TR1B 2LV3A 2HRNA 2YOIA 4DEJA 4BWQA 4MABA 1VRSD 2F8AA 4N10A 4PURA 2RLIA 3L0HA 4OCEA 4FYCA 3LWAA 2XBIA 3D4TA 2GLRA 3GTUB 2GQKA 1CQGA 1SKSB 4I8BA 3K8NA 3QOUA 1XXUA 4I2TA 9GSSA 3I9V2 4IBPA 3WT2A 5B8AA 1YJ6A 4IVFA 4E8EA 4YQUA 5ECOB 4NHWA 3C1RA 2VD1A 4NWYA 1Z7RA 2TRCP 1X5DA 1OKTA 2DJJA 1TK8B 1OC8A 2WGRA 4KB3A 5FT3A 1ST9A 4HOJA 4HZ4A 2MBTA 1M2BA 5IIZA 5GAPD 3ZIJA 5GAND 2IMKA 2LRNA 3J7Yb 2JSYA 3DRNA 4GTUA 4ULXA 3KMNA 1B9XC 3C71A 3MNGA 4OWYA 5J9CA 4K2DA 1A0RP 1VF1A 3GV1A 2HNLA 5L71A 1BX9A 3F6FA 4KE3A 4F0CA 3HJPA 3R2QA 1TOFA 3EC3A 4V1Ag 4D73A 2DBCA 2R3XA 4G9HA 2LQOA 3EVIA 2HT9A 3P8WA 19GSA 1SL1B 5ABRA 4I6XA 3MWHA 3E9JB 2E2MA 2YCDA 4EO3A 4XS4A 3D4MA 4GQFA 3GKKA 3ZFLA 4BVYA 1AAZA 7GSSA 1A8YA 1Y6EA 4Q5RA 2WULA 1SK0A 1QXHA 1MDKA 3IE3A 4FYUA 1SL0B 4TXVA 4Q5FA 4RUVA 1QGVA 4V2MA 4MJCA 1X0RA 5ID2B 2AJQB 4G19A 1XWBA 5A4WA 1A0FA 1AIUA 5CNWA 5ENUA 2D2ZA 2HYXA 5G5FA 5IO0A 3FRCA 5D93A 1Z6NA 4G10A 4Z7XA 2VUPA 1XW6A 1T8EB 1OYJA 1Q4JA 2KP2A 5DVBA 4G2EA 4FO5A 1XW5A 3DEXA 2H75A 4HQSA 3VURA 2X64A 3APSA 4ZL9A 4ZL8A 4POBA 3CRUA 4J57E 1TRVA 3FZ5A 3FEUA 1KEBA 3DVXA 3P2AA 2VM1A 3KH7A 5LD0A 4DSSB 3KGKA 4WETA 3EMPA 3GL5A 3EURA 2E0QA 2HRFA 1GTAA 1BEDA 1TRUA 2VM2A 1SJ6A 2VO4A 3ED3A 3V1WA 1NM3A 2VL2C 3IK7A 3KXOA 3HKRA 1SK1A 3IXRA 5JWOB 2MBSA 3TKPA 1NSWA 2OE3A 3IC4A 1SYXA 3TKQA 4EDZA 2FCHA 3GRXA 3HHVA 4JR6A 4PX1A 4EVMA 4NV2A 4XTSA 3ZREA 4PQIA 2CT6A 3GKMA 3G7IA 5J41A 1BJXA 2H76A 4OO4A 3G9BA 2ES7A 1JZRA 4MPFA 2F3MA 3WYWA 3KM6A 3QPMA 2WRTA 4P3YB 2L59A 3IC8A 5ECPB 1R5PA 5ECKB 4AGSA 3FR9A 5IMAA 1S3CA 3ZMLA 3WGEA 3F4TA 4KDYA 3ZRDA 1EP7A 4I5QA 1PN9A 2PVQA 3KD0A 4XIHA 3LYKA 2CAIA 3DKSA 4XCSA 3UVHA 2YN1A 1PX7A 4N30A 2M72A 2GSSA 1USBA 3VI5A 4IGJA 1K0OA 1M9BA 4I97A 4XS6A 3RHCA 1O73A 2P5RA 3Q19A 5COHA 1GH2A 1Z3EA 2RIIA 2A4VA 2OADA 3G7JA 3TCOA 1BQ7A 2BJXA 2WCIA 2I1UA 2HZEA 2P5QA 1ZCPA 4DSQA 1VF3A 2JZSA 5KN1A 2MMOA 6GSWA 1EV9A 1XOBA 5IMVA 3QD9A 1EP8A 2H6XA 4KSMA 3IRAA 1N2AA 3H1NA 1J08A 6GSTA 2YWNA 4QL9A 4LMVA 3UVTA 3F6DA 2XHFA 3NZNA 3LSZA 2FWGA 3M9JA 4K8MA 4O92A 1KBNA 3GN3A 4ZBBA 3LQ7A 1FW1A 1OE7A 1A24A 20GSA 4V1Ap 3RPPA 1EGRA 1WOUA 2JZTA 4G0LA 2CAQA 2DC5A 4MJBA 5ECQB 4ZXGA 3KP8A 4EKZA 4RI7A 4F0BA 2I4AA 2HSMB 1DSBA 4LL1B 1T4ZA 1OAZA 3QFAC 5HR2A 4HJMA 3GNJA 4PQ1A 2CVBA 2HSYA 2C1YA 1M0UA 2HI7A 4PQHA 3TJBA 2GS3A 4HU7A 4TR1A 1IYHA 2JL4A 2K8VA 1HNCA 4GWRA 3A3TA 3DIEA 4OMVA 1DBYA 1K3LA 1GP1A 3EYTA 5CRWA 2HRAA 1E6BA 1ABAA 1H4OA 1HNBA 2V2GA 4K1FA 5AIXA 3IR4A 5D9VA 2J23A 2I81A 2EIRA 2HZFA 2N5AA 4KAEA 3QMXA 1AQWA 4NV5A 3HA9A 2HFDA 2R4VA 2IPAA 5DBQA 2HRKB 3VWWA 3F3QA 3CRTA 4G0KA 2DMLA 4GQCA 2L6DA 1XWCA 3HDCA 2YV7A 2H30A 2H71A 1GSUA 2L5LA 4F9ZA 2VLVA 3QR6A 4MP4A 1TJDA 5A5KA 3S9FA 5CO3A 3TUEA 2DSAA 2ZUPA 4KX4A 3HVSA 4PGTA 3GX0A 1XOAA 4JR4A 1K0MA 1I9DA 1QUWA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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