2ON5A

Structure of nagst-2
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
206
structure length
206
Chain Sequence
MVHYKLTYFAGRGLAEPIRQIFALAGQKYEDVRYTFQEWPKHKDEMPFGQIPVLEEDGKQLAQSFAIARYLSRKFGFAGKTPFEEALVDSVADQYKDYINEIRPYLRVVAGVDQGDPEKLFKELLLPAREKFFGFMKKFLEKSKSGYLVGDSVTYADLCLAEHTSGIAAKFPSIYDGFPEIKAHAEKVRSIPALKKWIETRPETKF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Na Glutathione S-transferase 2
publication title X-ray structures of Na-GST-1 and Na-GST-2 two glutathione s-transferase from the human hookworm Necator americanus
pubmed doi rcsb
source organism Necator americanus
molecule tags Transferase
total genus 77
structure length 206
sequence length 206
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2on5A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2on5A01
1M9BA 2VCWA 4ZL7A 1PSQA 1AQVA 5G31A 1EGOA 1GUMA 1O8WA 2C8UA 4QL9A 4OFTA 1YF1A 1BYEA 1ZGNA 2IMDA 2P0GA 3ZL5A 3HDCA 3LJRA 1E2YA 2YV7A 2YNXA 1MTCA 4AJ7A 1T7PB 3DRNA 1LJRA 1YEPA 2F9SA 1V57A 1MDJA 1T4YA 5A4VA 1XOAA 16GSA 2PPTA 4HJMA 4K7IA 5IMAA 2HSHA 2H66A 4V2LA 3HVVA 2C4JA 1W89A 3IOSA 1XZOA 3LG6A 2L4QA 4TR1B 2GDRA 1X9SB 2HZEA 4G10A 2WGRA 1X0RA 2YZHA 5DDLA 3FEUA 3QPMA 1K3OA 2IMKA 4KDUA 2ON7A 3D21A 2IFQB 1SL1B 3K8NA 3DGQA 4KW6A 2VL2A 2BMXA 2EIRA 5IPGA 2DSAA 1GL8A 3GN3A 2R4VA 2H71A 2OE3A 1M99A 4LMWA 2K18A 1HYUA 3DEXA 1WOUA 3A2WA 1MD4A 1KNGA 4IJIA 1FB0A 5ECRB 4PNFA 5ABRA 1YEXA 4EF0A 4G0KA 1XWAA 4WEYA 4IS0A 5G2ZA 1ERWA 3P2AA 4HOJA 1EZKA 2YANA 4N30A 5H5RA 4BL7B 2H1GA 3ZVJD 2DJKA 4O92A 3GYKA 1PGTA 1TRUA 4IW9A 4OCEA 3CYNA 4FYCA 4FQUA 1ZL9A 5AGYA 4TR0A 1XCCA 2V1MA 3M8NA 4TXVA 4QL7A 5ECIB 6GSWA 1ERVA 3WGDA 3LSZA 2XBIA 5CAXA 1BX9A 1VF2A 4K7NA 4ZB8A 3TJFA 1K0NA 1Z3EA 1I9DA 1G6WA 1WWJA 5ID2B 2R2JA 3L9UA 2VIMA 4O32A 4USSA 5E4WA 1GSQA 5J5NA 3G7IA 2L5LA 3F6FA 5HR0A 3ME7A 2NBSA 4YQUA 1K0DA 1RW1A 3GIXA 3RDWA 3QCPA 5AISA 3D22A 3IPZA 2GSQA 2M80A 2RUFA 2G0FA 5LD0A 1OYJA 4XRDA 3UVTA 2F8AA 3MSZA 1Z6NA 3E0UA 3EYTA 3NZNA 2IWTA 4JR4A 3A2XA 3GMFA 5JWQB 2H6ZA 4HU7A 2GZYA 3KP9A 5ECNB 2FHEA 3E9JB 4PGTA 4KB3A 4ZBDA 1TTZA 4NMUA 4JBBA 1HD2A 4X1UA 3US3A 4MPGA 3A2VA 2MMOA 1SU9A 4TXOB 5ECPB 2H1BA 2M46A 4K9ZA 3ZMKA 4LA1A 2NTOA 1T1VA 3UEMA 5FWGA 1G7OA 20GSA 3D5JA 2JZRA 4K0GA 3HJPA 5KN3A 3U6VA 2QSIA 4LL4B 2H30A 4NV2A 7GSSA 2AB6A 2WDUA 4PUAA 2DC5A 1EOHA 4N0ZA 3O3TA 2YZUA 5HR2A 3TRXA 2TIRA 3D0ZA 5F8BA 3GNJA 4ML1A 2TRCP 1TRSA 2H74A 5ENUA 3Q6OA 4MJCA 2DJ0A 5F07A 2B6MA 1C72A 4HZ2A 3TKQA 4BVYA 4F03A 3TKSC 4WBJA 4GSNA 1KTEA 4Q5NA 5IMVA 5EY6A 1SK2A 1PD21 2IFQA 3GRXA 1TKDB 1R5AA 3ZVJA 5HFIA 1QXHA 4H86A 4Q5RA 4F82A 1BG5A 1NHYA 1VGLA 1G6YA 3TRPA 3D4TA 4MA9A 4GXZA 1O85A 2HRNA 4OWYA 2TRXA 1R26A 2IL3A 4OO5A 5DCGA 3KP8A 4NHWA 4IGJA 3KEBA 3BOAA 2OJLA 5L71A 1V9WA 3QAVA 1ZYEA 3EINA 2RIIA 2UZ8A 4K1FA 13GSA 2L5OA 3F3RA 5D8IA 3FR6A 2I3YA 1Z7PA 5D96A 2B5YA 4BL7A 1M0UA 5F05A 2I81A 2B5XA 4I8BA 4MZWA 4KDXA 4WF5A 4PQHA 2G2QA 2PU9C 2C0EA 2E2MA 1X9MB 5IPHA 3GUSA 4GLTA 2HSYA 4RQRA 3M0FA 3VWUA 2B1LA 2L6CA 2VUPA 1GLPA 1FO5A 1A0RP 4IQAA 2FA4A 3G7YA 3GFKA 5FHIA 1JLVA 2CA8A 3HY2A 1CQHA 4GCIA 1FAAA 1FG4A 2ALBA 4GF0A 2J9HA 2MMZA 5KEJA 3E3EA 4YQVA 4DSRA 2HNLA 5ID2A 3VK9A 2OACA 3CSJA 3MAKA 1FVKA 3TJGA 1MDKA 2IMFA 5GAND 3VFIA 5G1KA 1YZXA 3ERFA 4GQCA 1PL1A 1OKDA 2A2SA 2V41A 3DIEA 5D73A 1AIUA 1TI3A 1QQ2A 1ZCPA 5D93A 3UAPA 2NPBA 4WBRD 1KBNA 4TRXA 3N9JA 2IMIA 3UVHA 1SD9A 1Z9HA 3KD0A 3RHBA 4OFMA 4KGIA 5IQYA 2VL2C 4TXOA 2H01A 4DSSB 2I1UA 3FZ5A 1TP9A 2OA7A 3Q19A 2CAQA 1JZOA 2AJQB 2CZ3A 3TKSA 2N5FA 3VI5A 2IIYA 2FWFA 4N10A 1B4PA 2QGVA 2X8HA 1CQGA 1F9MA 3MDKA 3LYKA 1JZRA 3CXGA 4MJAA 4HQSA 5DAKB 3EE2A 3FZ4A 4EXJA 3R3EA 2RM5A 2HFDA 3IDVA 3TRQA 4TN8A 3F4SA 3M1GA 4BPYA 1XIYA 4ZBBA 4K2DA 1YQ1A 2YV9A 2XPEA 2FY6A 3VLNA 4RQXA 4KA0A 2VL9A 1ML6A 3TDGA 1UC7A 3C1RA 1IYIA 1RK4A 2GTUA 1WMJA 3VURA 2H72A 4TOPA 4P3YB 4XHMA 1EV9A 5JCUA 2H19A 3HHVA 5INYA 1Z5YE 3PINA 3SBCA 1A23A 3CTGA 2LSTA 3FR3A 2PVOC 4EDYA 2OADA 1TW9A 4N0VA 4MJBA 1AQWA 4TR3A 4N11A 3V1WA 4G9HA 4IHUA 2MBSA 1EOGA 4EC0A 2CZ2A 5H5QA 4HDEA 2H70A 3TJJA 2WCIA 6GSVA 5A4UA 2GSSA 2L6DA 1TU7A 3L78A 3F3QA 1OE8A 4POLA 3LFLA 2H8LA 4Q5FA 2HLSA 1K0AA 2B1KA 4KCEA 2VCVA 1GRXA 4WKWA 2L59A 2H73A 4I6XA 4WETA 2LUSA 8GSSA 3MWHA 3ISOA 2VM2A 4JR6A 4WXTA 5ELGA 5F06A 2NDOA 2GSRA 18GSA 4K6XA 2E2GA 1X5EA 2H0GA 2KP2A 5HFGA 4XS6A 1WJKA 2P5QA 2LQQA 1SL2B 3MNGA 4OD7A 3CBUA 2DJJA 1PKZA 1PX7A 4J56E 4K7OA 4WF4A 4TVEA 1Y25A 5G30A 3H1NA 1XXUA 2VM1A 3HCZA 1T3BA 2CX3A 4L8EA 4POMA 3NIVA 5IM9A 1AUCA 1U88A 2IJYA 4AF2A 1J08A 1OC3A 2I4AA 2MMAA 3KXOA 5GSSA 3L4NA 1GTBA 3C8EA 1S3CA 3F9UA 5J9BA 4MJEA 3KTLA 3UIWA 4GQFA 2GQLA 3FY7A 3GURA 3KGKA 2BJXA 5DBQA 2CQ9A 3FYGA 4DSSA 3D4MA 1V40A 3EURA 4PURA 1SKWB 2LJKA 1YDKA 3EC3A 2J23A 2PUKC 5DALB 3TGZA 1DSBA 2HSMB 5IOWA 4CW9A 2GGTA 2HE3A 4IELA 5DAKA 2K8SA 1PMTA 4MPFA 4LMVA 3QR6A 4O5RA 3CSHA 4G0LA 1SYRA 6GSUA 3LQ7A 5LCZA 3TUEA 3ERGA 1ABAA 3RBTA 3TB2A 1K0MA 2YPMA 2YP6A 2KP1A 4XS4B 2C80A 4K0NA 2FD3A 3WT2A 1B8XA 1SKRB 4HJ2A 2FLSA 1Z7RA 1T4ZA 3EU3A 4JU5A 2GQKA 4POKA 4OFNA 1G0TA 5IO0A 2EC4A 3IE3A 3EWLA 4HS1A 3L9SA 3HVXA 2FUG2 2IN3A 5D9TA 4DVCA 4HU9A 4IBPA 1VRSD 3LXZA 1OC8A 5D9XA 4E8HA 4HQZA 2LNSA 1EWXA 5DVBA 4I2TA 2C0DA 5GAPD 2KLXA 3QDNA 5D9WA 1WRYA 1SJIA 5B8BA 2GT5A 4EKZA 2JSZA 1YY7A 3GKNA 1F3BA 2A4VA 1ZYQB 1XW5A 2C3TA 6GSYA 3JCML 2PGTA 3FZAA 2YWMA 1KEBA 2DJ2A 3FHKA 3DWVA 4Z7XA 2R37A 1JZDA 1ZMAA 3ERWA 2CV4A 4ZBAA 2JSYA 3RHCA 3ZREA 3QAWA 1O8XA 1NM3A 1NHOA 1K3YA 2HRKB 1SK1A 3IAS2 1BJXA 4BWSA 2DIYA 4NAXA 3IAM2 2IMEA 1R5PA 3W6GA 1A2LA 1B4QA 2VCZA 4IP1A 1OVNA 4TR1A 3F4RA 3TJKA 4GTUA 2GZPA 1PL2A 1U3IA 1WP0A 2C3QA 1GTAA 3M3MA 1BEDA 3H4KA 3FR9A 2JACA 3CSIA 1K0OA 1U87A 4EDZA 5ECOB 1I5GA 3IBHA 3UOMA 4L0UA 1QFNA 1TK0B 2CVBA 4DEJA 2OBKA 4AJ6A 1NSWA 2A2RA 4AGSA 5JWOB 1YKAA 2HRAA 1LBKA 1A8LA 2YJHA 4BVXB 3APOA 3F0IA 1GWCA 1O6JA 1MD3A 1QMVA 5JCWA 4IP6A 1X5DA 5AN1A 3LXTA 2JZSA 2LJAA 1GSDA 4KDYA 5DJMA 10GSA 1XWGA 2KUCA 4IJ3A 1GSUA 1Q98A 4V1Ag 2K6VA 1XFLA 2VLTA 3GKXA 4JE1A 2YJ7A 4G2EA 6GSXA 3IK7A 1JFUA 1OKTA 4XIHA 2FGXA 4BWQA 4BA7A 4GSTA 1B9XC 4HUAA 2VD1A 5DALA 4EVMA 2JU5A 2LS5A 3C71A 3GKMA 3VPQA 3HJOA 3KMNA 1PQNA 4V2MA 1UVZA 1V2AA 5DCHA 2C1YA 5ECMB 4FIWA 5G5FA 2V6KA 2JL4A 4HZ4A 3KIJA 1O7UA 2FWHA 3APSA 2H6XA 2LRCA 4XS4A 3F63A 4KH7A 3FKFA 1XW9A 4FO5A 5ECQB 3FK8A 2KHPA 4ZIJA 2AAWA 3PPUA 5A4WA 3I6AA 4MZBA 1AW9A 2HXKA 1XVWA 3R2QA 2ZCTA 5ECHB 4L5LA 1QGVA 1GULA 4XRAA 2LQOA 2MZCA 3AY8A 1A2JA 3EMXA 4ZL9A 5COHA 4IVFA 4LL1B 3DXBA 1ZZYA 1SD8A 3W8JA 2B5EA 3WGEA 5EL8A 1GTUA 3GKKA 2F3MA 2P31A 4PTSA 1THOA 4ZILA 3GL5A 1K0CA 4O7HA 4KSMA 2K8VA 1T00A 2RM6A 1TU8A 2H0IA 4KX4A 2VD0A 2XPDA 3FRCA 5E59A 2OBIA 3RAZA 3CRUA 5AIXA 3WGXA 5IMCA 2EIQA 3M9JA 2AYTA 2CVKA 2E0QA 4JRRA 1E6BA 1M9AA 3J7Yk 3KJYA 3CMIA 3VPTA 3RPPA 2FA8A 3I43A 2L4CA 3J7Yb 3ZYWA 2HRKA 4KAEA 2CAIA 1XWBA 3W8SA 1OC9B 3A3TA 9GSSA 2LRTA 1TOFA 4FH8A 3DYRA 3IC4A 6GSTA 3GV1A 3GTUB 3TCOA 2VL3A 1W4VA 3FW2A 5D9VA 2PWJA 2LV3A 3F8UA 1URMA 3RPNA 1XWKA 1JZWA 3QMXA 1Q4JA 2GLRA 1VF4A 2ZUPA 4L0WA 1B9YC 1GSSA 4XCSA 3O6TA 1HNAA 1S3DA 4XTSA 1H75A 3DMLA 2Z9SA 3TKSE 1B48A 2LKUA 4BVXA 4MLYA 3GA4A 4ILFA 4ML6A 3LWAA 3QD9A 4MP4A 1TXXA 1SJ6A 4RUVA 2PBJA 4MF7A 4ECJA 2FCHA 3GX8A 2YN1A 1QUWA 3KCMA 2RUEA 3I69A 2BTOT 1DUGA 1V58A 2OE0A 1XBSA 4MZCA 4V1Ap 3P7XA 1F37A 2FNOA 3IA1A 3IK9A 2GVPA 2LTKA 1FB6A 2HZFA 2R3XA 1TK5B 2H1DA 2I9HA 5ECLB 3I9V2 3G9BA 5EVOA 3HZ4A 3BBYA 4ULXA 1EEJA 2GSTA 4TR4A 1A2MA 4I97A 1A24A 4POBA 4IKHA 1ST9A 1GSEA 5CRGA 3QAGA 1OAZA 4IN0A 2B7KA 1ZOFA 2O7KA 1TK8B 4RI7A 3H8QA 4EUYA 2X8GA 4KF9A 1M7TA 4OO4A 3UL3A 4CHSA 4ZL8A 4V2NA 2O87A 3GHAA 1Y6EA 3KTBA 3KH9A 1K3LA 2YCDA 3TJBA 1XPVA 2C0FA 1ERTA 1UA5A 2YWNA 1NW2A 5KN2A 3BD2A 1USBA 5CREA 4BVYB 2VO4A 2HQTA 11GSA 1GUHA 5HR3A 4KCAA 4MH3A 3QFAC 2PERA 12GSA 2O85A 1SJZA 5J3RA 4ECBA 1U6TA 4YQMA 4NV5A 2XC2A 5C00A 2WB9A 3F4TA 2KOKA 3GH6A 1IYHA 3IV4A 4DSQA 2ZNMA 2LRNA 2RLIA 5G5EA 3TKPA 2QC7A 4ZB9A 3HYPA 3Q74A 3P8WA 4E8EA 2X8CA 3IC8A 4PX1A 2VCQA 4HI7A 3TOTA 2VCXA 3A5WA 2DJ3A 2AV4A 1YJ6A 2B3SA 5B7CA 4G0IA 1THXA 3UMAA 4F2IA 1UN2A 4PUFC 5HR1A 4KE3A 4KNDA 2CVDA 4F0BA 3GSSA 4ZXGA 3HJMA 1OC9A 2NVLA 4ZB6A 3ZTLA 2LNTA 4GWRA 4XS1A 2WS2A 3TKRA 3GTUA 5J4UA 1FW1A 3GH9A 4GSSA 5EPFA 2X64A 5IOXA 1GUKA 5DJLA 1MEKA 1DBYA 4FYUA 3IHQA 3ZIJA 1TI1A 2P5RA 1HNBA 2FWGA 2JZTA 1N8JA 4PQIA 3DVXA 2YWOA 3BJ5A 2E7PA 2F51A 3UBLA 3VI7A 1FHEA 3ZFBA 4NWYA 1WPIA 2HRFA 1DE2A 1O73A 2AHEA 1F3AA 4F0CA 2N5BA 3VWXA 1EEMA 1GTIA 3TOUA 2H1AA 4KUNA 5CRWA 1EP8A 1J9BA 4I2UA 3FZ9A 3UJ1A 1V98A 1BQ7A 1OE7A 3HA9A 3WD6A 1AQXA 3DVWA 5ECSA 1M2DA 5J41A 2YWIA 2PVQA 1AAZA 1PA3A 2WJUA 5IMFA 4NHZA 1XOBA 2VAFA 3PGTA 2F8FA 1LU4A 2OKAA 4FYBA 4MDCA 4PNGA 3NOFA 5IO2A 2QKEA 3KMOA 5J9CA 5ELAA 1MDIA 1GNWA 5JCGA 14GSA 3KZQA 2IPAA 3U5RE 2VOCA 4HEA2 4D73B 3SWLA 1EV4A 3O76A 3C7MA 1SK0A 22GSA 3HKRA 5BMUA 5B6NA 3L0HA 5B6MA 3CTFA 3BCKA 1QK8A 3WT1A 1SENA 3D6IA 4PQ1A 2REMA 1GNEA 4G19A 2MMNA 1H4OA 3IXRA 2VLVA 4GRFA 3HZ8A 4X43A 2DMLA 2PN8A 1YKCA 4EE0A 2PMTA 2DLXA 5JWRB 1BAYA 1TRWA 3DD3A 3GX0A 5KN1A 4OCFA 2GQMA 1M2BA 4ACSA 2R5GA 1TRVA 2JADA 2H75A 3ZLPA 4J2FA 5A5KA 5CYYA 4JZQA 4MF5A 5GZZB 2WFCA 5ECKB 4L5OA 3P90A 2WRTA 1ACVA 2WULA 2OE1A 2O8VB 3ZRDA 4X0XA 1TJDA 1HQOA 2GZZA 4MF6A 5DQYA 2DMMA 5CP1A 4TKYA 3LYPA 2M72A 4I5QA 5KN0A 1G7EA 4QQ7A 3GSTA 1PN9A 4MABA 3LORA 2R6KA 3PR8A 2LEGA 5IMDA 1F2EA 4PXOA 3BCIA 3HXSA 2HSMA 2H0HA 1U3AA 2DJ1A 1EGRA 1ON4A 5F0GA 5CO3A 1TDIA 3EVIA 17GSA 3HVSA 2V6OA 1PRXA 1YF0A 1VF1A 2YOIA 2V2GA 1ERUA 4J57E 3WYWA 4Q5QA 3M9KA 2D2ZA 4MH2A 2X99A 1O81A 4YAPA 1S3AA 4JEDA 4WR5A 1GSYA 4ID0A 1VF3A 2HYXA 2C3NA 1AC1A 3EMPA 3IR4A 4KSOA 19GSA 4WR4A 1N2AA 2FWEA 1X5CA 2WZ9A 3DKSA 2HSNB 3GL3A 4MK3A 2HZEB 3LGCA 4YAVA 1A0FA 2GS3A 2VLUA 2XBQA 1HNCA 2GT6A 3S9FA 4MMMA 4AJ8A 3ZZXA 1DE1A 2XHFA 5CNWA 3H93A 3PH9A 4EL1A 4F9ZA 4OMVA 5DQSA 1R7HA 1R4WA 2ON5A 4ISDA 3VWWA 1SKSB 1SYXA 1J0FA 2EIOA 1JHBA 2CX4A 3APQA 3OR5A 4LLRA 1WIKA 1FOVA 5HQPA 3CRTA 1F6MC 5AIVA 3N5OA 1JLWA 3IRAA 4YH2A 1T8EB 4TW5A 1SL0B 1GH2A 3G7JA 4D73A 5C04A 3QOUA 1RQMA 5B8AA 2V32A 1AXDA 3UARA 2L57A 3KH7A 3HD5A 6GSSA 3Q18A 1A8YA 1X9WB 2MYGA 4CDOA 4NXIA 2H76A 1GSFA 3VWVA 5LNKe 1ILOA 1M2AA 3KM6A 2LJRA 2VCTA 4ECIA 2ES7A 2O89A 3LEFA 5GSTA 3UBKA 2N5AA 2H6YA 1PKWA 3ZMLA 2HI7A 4EO3A 1Z6MA 4MCUA 2HT9A 4NPBA 1XWCA 3QFBC 1GLQA 1WE0A 3EU4A 5CRHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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