3CRU | Genus

Total Genus 68

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	68
sequence length	214
structure length	214
Chain Sequence	MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGCEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
molecule keywords	Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme
publication title	Using affinity chromatography to engineer and characterize pH-dependent protein switches. pubmed doi rcsb
source organism	Schistosoma japonicum
total genus	68
structure length	214
sequence length	214
ec nomenclature	ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date	2008-04-07

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02798	GST_N	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A	PF14497	GST_C_3	Glutathione S-transferase, C-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1050.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	3cruA02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3cruA01

2DJJA 3O6TA 4POLA 4KDYA 2IWTA 4EC0A 2HZEA 4QL9A 3WD6A 3UEMA 2HNLA 4YQUA 2PU9C 1F37A 3D6IA 1YF0A 1GRXA 2V1MA 2LNSA 3ZIJA 4PX1A 2AHEA 2VLUA 4OFNA 3WYWA 1T7PB 3IXRA 3CMIA 1S3CA 4ILFA 4POKA 1XW5A 3G7IA 2GVPA 4H86A 4I5QA 1PN9A 1Z5YE 1PKZA 5KN3A 3ISOA 4HJMA 3HZ8A 5ECKB 2FWEA 5DBQA 3FKFA 2CQ9A 2O87A 3FZ5A 3HA9A 3LG6A 5B7CA 1SJ6A 1XPVA 1AQWA 3PR8A 3KZQA 1HNCA 1PX7A 4DSSA 4V1Ap 2VUPA 5IMDA 3TUEA 2RM5A 1O81A 4KE3A 2PPTA 1A2MA 3GRXA 4ISDA 3VWXA 3QAWA 3GKXA 2FGXA 2IPAA 3LORA 3IBHA 4MH3A 2AV4A 3L9UA 5B6NA 2IL3A 2HSHA 3MNGA 3KP9A 3KIJA 3VWVA 4LMVA 5IOXA 5KEJA 1N8JA 4HOJA 5DALA 1XW9A 3VPQA 4PUAA 3QPMA 3GL5A 1EP8A 2VCQA 2H70A 1HYUA 4PGTA 4G2EA 2IMIA 1GTBA 3HJMA 2HQTA 6GSTA 2DJ1A 1JLWA 2ES7A 2YP6A 1PKWA 4ZB6A 1Z6MA 2CAQA 1K0DA 4ULXA 5ENUA 3DEXA 2VD1A 2GT5A 4F82A 3RAZA 1PQNA 5JCWA 2HXKA 2V32A 1YQ1A 1VRSD 2VLVA 4NXIA 1DUGA 2OJLA 3EYTA 4PTSA 3IRAA 5AISA 1TRUA 5F8BA 3ZTLA 1K0MA 1WJKA 3ZREA 3ERGA 1GUMA 1GLQA 1EGRA 3IE3A 1GH2A 5CP1A 1FO5A 1K0AA 2IFQA 5D96A 1EV4A 2KHPA 3GV1A 1TK8B 5F06A 4POMA 3APQA 3F0IA 1ZL9A 1U87A 4ZB8A 2H30A 4TKYA 1GSQA 3DRNA 3A5WA 5ECMB 2R3XA 4JRRA 2ALBA 3W8JA 1C72A 4YAVA 2JL4A 5IQYA 3E9JB 4WEYA 1BJXA 3FR9A 3LWAA 2LQQA 3L0HA 1MD3A 5G2ZA 1LBKA 2YWOA 9GSSA 5D8IA 2HLSA 2MBTA 3U6VA 1UN2A 2KP1A 4WKWA 1ABAA 2XPEA 5IMZA 5LD0A 4EXJA 4GQCA 5JWQB 4ZBDA 4RI7A 5D73A 3KMOA 3M3MA 2M72A 1FB0A 1URMA 4XCSA 3P90A 3GH6A 4K7OA 1OC8A 3HVXA 2LNTA 4HEA2 2DLXA 2L5LA 4K2DA 4ZBBA 1XFLA 2YJHA 2C3TA 2DIYA 2GGTA 1Z6NA 3H79A 5E59A 1R5PA 4FYCA 4HJ2A 1I5GA 4CDOA 4IN0A 1GSFA 4HZ4A 3DGQA 3QAVA 3TB2A 2JACA 2H66A 4LMWA 8GSSA 5INYA 2EIQA 1O8XA 1PRXA 5IIZA 2H6YA 1TRVA 2LUSA 1V58A 2VD0A 1JHBA 1K0BA 2A4VA 5LNKe 3M9KA 2XPDA 3IR4A 4NHWA 4PXOA 3UBLA 3UIWA 2JZRA 2P0GA 2N5AA 2XBQA 4HU7A 3C7MA 4ECJA 2VCWA 1R4WA 4MLYA 1VGLA 3IC4A 4XS4A 1ZYQB 5IMFA 6GSUA 3TJGA 1LJRA 2FY6A 4EUYA 4ZIJA 4PQHA 3FW2A 2EC4A 1OE8A 1GTUA 2H1BA 3QD9A 2P31A 1NW2A 3TKPA 2FHEA 1O6JA 1O85A 1ON4A 2E2MA 2C1YA 3LGCA 2QGVA 2HSYA 1EV9A 2HRAA 4BWQA 3Q19A 3CYNA 2YZUA 3TKSE 2DJKA 1OYJA 1XOAA 1OKDA 3CSJA 3QMXA 4TXVA 2KUCA 2XBIA 1XIYA 5HR0A 1B4PA 1F3BA 1T1VA 3L78A 4DSQA 1SKWB 2E0QA 2FWFA 11GSA 1XCCA 3UBKA 1QMVA 1KNGA 3UOMA 1V9WA 2LV3A 2H72A 13GSA 4GSSA 4I97A 2PBJA 4PQIA 14GSA 2P5RA 2YV7A 4KX4A 4Q5FA 1QUWA 2FNOA 3LXTA 2CX4A 1ERVA 2NDOA 2FWGA 5DJMA 1SYXA 1SL2B 3VLNA 4IQAA 2D2ZA 2PMTA 4L0WA 2MZCA 3KTBA 3QAGA 2AUVA 3PINA 2GTUA 5B8AA 4MF5A 2H6ZA 1A8LA 5B8BA 5H5SA 3BJ5A 4NV5A 1B48A 3FHKA 3MDKA 5ECRB 5ABRA 2GZYA 2V6KA 4X0XA 5G31A 5ECQB 4V2LA 3KH7A 3F9UA 1UA5A 5DQYA 3VWWA 1T00A 3GKKA 4K0GA 2CVDA 3EE2A 1EEJA 2YANA 4MZCA 4BL7B 2H73A 2X8GA 1YF1A 3TRXA 3HDCA 3M1GA 5J5NA 1XOBA 5IO0A 3LSZA 2VL9A 3FZAA 3LJRA 1WPIA 1WWJA 3HYPA 4BVXB 1EZKA 5EVOA 3UARA 17GSA 4X1UA 5HFIA 5CAXA 1MD4A 1G7EA 2UZ8A 2OADA 3ZFLA 3WGXA 1WRYA 3GL3A 5A5KA 1FVJA 4MJEA 5LCZA 3GKNA 5ECOB 1NHYA 4EVMA 4HU9A 1FW1A 1XWBA 2YJ7A 4ML6A 4PQ1A 1DE2A 3EC3A 2GQMA 3HZ4A 1B4QA 1FOVA 4RQXA 3ZMLA 2HYXA 3DVWA 3VWUA 2X8HA 3ME8A 2B7KA 3R3EA 4KB3A 3KXOA 4IJIA 1FAAA 4NAXA 2FLSA 3DVXA 4E8HA 3I6AA 5IMVA 3VI5A 1X9MB 4GXZA 3C1SA 3KEBA 2VLTA 4F0BA 1EP7A 4JR6A 2L5OA 1K3YA 2QC7A 1GP1A 2LRNA 1TXXA 1HNAA 4OCFA 4N0VA 4AGSA 4V2MA 3L4NA 3C71A 2HZFA 4MABA 2CA8A 5JWRB 2B7JA 1ZYEA 3ZZXA 1GSDA 3KTLA 3FEUA 4WXTA 3NOFA 3L9VA 5JCUA 4K9ZA 4O32A 1Z3EA 2C0EA 4HUAA 1SKSB 2HI7A 4KAEA 4WF5A 3KMNA 3HVVA 4GSTA 3F6FA 3NIVA 3QDNA 3ZLPA 3PH9A 1I9DA 1GUHA 4LA1A 4WR5A 3ZL5A 1GNWA 5ECNB 2WJUA 4JEDA 1VF1A 1T4YA 2FUG2 3C73A 3HHVA 4WBJA 2R4VA 1OE7A 3TDGA 1M9BA 3QFBC 1XVWA 5CYYA 4XRAA 1BQ7A 2WFCA 1NSWA 4JBBA 2X64A 2OE1A 4YH2A 3UVTA 4WF4A 4EDYA 1M9AA 2WS2A 2LRCA 2E7PA 4O5RA 3Q18A 4MJCA 3DWVA 4FO5A 1X5DA 3WT1A 4GQFA 4XIHA 3TJKA 16GSA 3I43A 2OA7A 1B9XC 3U5RE 4K0NA 1AIUA 1K3OA 5HFGA 2FWHA 1LU4A 2C3QA 2JZTA 5CO3A 3EWLA 2FCHA 4HI7A 5HQPA 2PN8A 1EOGA 2HRFA 2YOIA 3L9SA 2YCDA 1TRWA 1SD8A 2AJQB 1HNBA 4G19A 4O7HA 2HFDA 2IMFA 3KM6A 2PUKC 2K8SA 1ZZYA 1V57A 3RHBA 2R6KA 1TK0B 2JADA 3A2VA 3TKSC 3TRQA 3HXSA 1BAYA 1Y6EA 3LYPA 3FR6A 2H1GA 3ERFA 5GAND 1NHOA 2E2GA 1DE1A 2I81A 1XWCA 3D4TA 4LL1B 5D93A 4MK3A 1PGTA 1OC3A 2CT6A 2L4QA 2LKUA 1KEBA 2G2QA 1RQMA 2V6OA 2J23A 4TR1B 4NV2A 3HJOA 1SU9A 5H5QA 2VOCA 1GSSA 4DVCA 2NVLA 3C1RA 2X99A 3VK9A 2R5GA 1MDKA 1A24A 1KBNA 2I3YA 2X8CA 3TOUA 4KDUA 1ZMAA 3PGTA 4EDZA 4ZB9A 4OO5A 4PNGA 4XS1A 3FZ9A 5ECHB 1USBA 3IAS2 2WCIA 5ECSA 1M7TA 1T8EB 1ACVA 4V1Ag 2VO4A 4YQMA 4EKZA 1EOHA 2H8LA 3NZNA 4HQZA 2IMKA 3CSIA 1GTIA 2V2GA 1K0OA 5ID2A 3GUSA 3HJPA 3CSHA 1SL0B 2CZ3A 2B5XA 2CVBA 3ZFBA 4YAPA 2B3SA 3DMLA 2WULA 3V1WA 4AJ7A 2H1DA 5FWGA 3GURA 1B9YC 1QK8A 3I9V2 5ECLB 4IJ3A 5G5EA 5CRWA 4GLTA 3KH9A 1E2YA 3WGEA 5J4UA 5A4UA 3QR6A 3S9FA 1TU8A 4MDCA 4BL7A 1X9SB 1DBYA 1A2LA 3F4SA 1YEPA 5E4WA 1F3AA 3F6DA 4JE1A 3D21A 5IMAA 4P3YB 1SJIA 1GWCA 5AIVA 1AW9A 2HT9A 3GNJA 2C0FA 4GSNA 2A2SA 2TRCP 4ZL7A 2LQOA 2K6VA 4AJ8A 1XVQA 2CX3A 3TGZA 4BVXA 4XTSA 1X9WB 2DIZA 3M0FA 4IELA 4Q5QA 2OE0A 4KNDA 4AJ6A 4BVYB 2WDUA 1XZOA 2B5EA 3UVHA 2VM1A 3E3EA 1A0FA 1TJDA 3I69A 4XRDA 4EL1A 2H71A 3AY8A 5IOWA 1G7OA 1IYIA 1QQ2A 2GQLA 4OO4A 1M99A 1F9MA 3QFAC 2C3NA 3TJJA 2RUEA 5D9XA 2L4CA 2ON5A 5F05A 2PVQA 3N9JA 4Q5RA 5IPGA 5ELAA 2BJXA 1CQGA 3H93A 2YWNA 4LL4B 1XBSA 2AYTA 3D5JA 4NHZA 3WT2A 1PA3A 1F2EA 2HSMB 1YDKA 2LJAA 1ZGNA 1TRSA 2FA4A 1ZOFA 1SL1B 2MBSA 4ZBAA 1TTZA 3US3A 1M0UA 5IO2A 4BPYA 1GSUA 3VFIA 5JWOB 1GLPA 3G7JA 1K0CA 1Q98A 4MJAA 2RIIA 5DAKB 2J9HA 2CVKA 2VCVA 1YZXA 4GCIA 1XWAA 2GSQA 4L5OA 2F51A 2MMZA 1S3AA 5ID2B 2H74A 19GSA 3GX0A 5AIXA 2GSTA 2JU5A 4PUFC 5D9VA 3D22A 1JZWA 4QQ7A 4OCEA 4IW9A 3ZRDA 1U3IA 1OKTA 3BCKA 1MEKA 5CRGA 4G0KA 3UJ1A 1G6WA 4I6XA 3IOSA 5EL8A 2C80A 2NBSA 5CNWA 3TKRA 4KSOA 1X5CA 1FB6A 2F9SA 1R5AA 2RLIA 3P7XA 3EVIA 1AQVA 4TOPA 1MDIA 5ELGA 2TIRA 1ML6A 2H76A 2Z9SA 12GSA 2CZ2A 3LXZA 2XHFA 3CTGA 2VCTA 3DD3A 1YEXA 2VAFA 4MZBA 1JZRA 7GSSA 2GZZA 1UC7A 2WZ9A 2M80A 3GHAA 3FK8A 3QOUA 4K7IA 3M9JA 2IJYA 3F4TA 4TN8A 5DDLA 1TDIA 2O8VB 3MSZA 3TKQA 1RW1A 4KUNA 2H6XA 4MZWA 5D9WA 2JZSA 1QGVA 4IP6A 4GTUA 3KJYA 3IPZA 1RK4A 1A0RP 1U6TA 4IP1A 2VL3A 2N5FA 2VL2C 2MMNA 2WRTA 2WB9A 5KN2A 4ECCA 4MA9A 3C8EA 2O7KA 4BWSA 1AUCA 2CAIA 3RHCA 1WOUA 1G6YA 3VI7A 3O76A 1ERUA 5G1KA 4MJBA 2L59A 3R2QA 4PNFA 1S3DA 1VF4A 3KD0A 2H19A 3EMPA 2PERA 2BMXA 3ZYWA 1AQXA 4O92A 1JZDA 5CRDA 1K0NA 1VF2A 4XHMA 2I1UA 3LEFA 1AAZA 5B6MA 3QCPA 2HRKB 3TJBA 4TXOB 5BMUA 4GF0A 2V41A 2IIYA 4ACSA 2KLXA 4MP4A 3BOAA 4D73A 4MMMA 3A2WA 4N30A 3A3TA 4I2UA 1PX6A 3O3TA 2ON7A 5HFKA 3MWHA 3DKSA 1SYRA 4K1FA 1GTAA 2L57A 3DIEA 5J9CA 1B8XA 3GN3A 2MMOA 1JLVA 1SENA 4X43A 1WE0A 1TU7A 4TR3A 4TR4A 3LYKA 5KN1A 4RI6A 3SWLA 2KOKA 4KCEA 4TR1A 4DSRA 2LS5A 4ID0A 1HQOA 3W8SA 4WBRD 4BA7A 4L5LA 4E8EA 3ZITA 4AF2A 1WMJA 1TW9A 1WP0A 4MH2A 1GL8A 3FR3A 4MF6A 4G9HA 3DYRA 2JSYA 3EURA 2K8VA 3PPUA 4KW6A 1SKRB 22GSA 3CBUA 2QSIA 2LSTA 1W89A 4IBPA 1U88A 1V40A 1SD9A 4RQRA 4N11A 3M8NA 4ZL9A 5FHIA 3E0UA 1QXHA 3H1NA 2DMMA 4KGIA 1G0TA 2YV9A 2MMAA 3BCIA 4L8EA 3GIXA 3CRTA 4I2TA 3GTUB 5DVBA 2OKAA 3CXGA 5KN0A 2C8UA 4QL7A 1AC1A 3IHQA 6GSXA 3IK9A 5J41A 1TK5B 5IPHA 3UAPA 1BEDA 3HKRA 5JCGA 3JCML 5CRHA 1F6MC 1R7HA 4ECIA 1SK2A 1N2AA 2RUFA 4YQVA 1BX9A 3TKSA 1ERTA 2GDRA 4HS1A 4IS0A 3RBTA 1ZCPA 1H4OA 1KTEA 2ZCTA 3Q74A 2HRNA 3RPNA 1A8YA 1MTCA 4JZQA 1YKCA 1TKDB 3EU4A 2DMLA 3GFKA 4BVYA 3GSSA 2DC5A 3VURA 6GSSA 2K9FA 5D9TA 1R26A 3IDVA 2VCZA 1GULA 1XW6A 2G0FA 4IHUA 2I4AA 2NTOA 1SK0A 1EWXA 4OFMA 3F3RA 1BG5A 3IAM2 2DBCA 4KDXA 5GSTA 4D73B 2R37A 1M2DA 4J57E 3FZ4A 3APSA 1GUKA 1PSQA 2B1LA 2HSNB 1GNEA 3D0ZA 2DJ3A 2HZEB 3BBYA 1QFNA 2JSZA 1J08A 3ZVJD 4EE0A 4NPBA 2OBKA 3IK7A 1MDJA 1J9BA 4HZ2A 2HSMA 1V98A 1WIKA 1GSYA 2DJ2A 4OMVA 3J7Yk 2AAWA 1T3BA 2ZNMA 3HVSA 2PGTA 2GZPA 1YKAA 2IN3A 2HE3A 2RM6A 3DXBA 3F63A 3VPTA 5GSSA 2F3MA 5DCHA 5DCGA 2YPMA 4USSA 1J0FA 4KSMA 4N10A 4XS6A 2AB6A 5DAKA 5IM9A 1W4VA 4LLRA 1AXDA 2BTOT 2XC2A 3UMAA 2GLRA 4HDEA 3RDWA 1ERWA 3HCZA 4ZILA 4DSSB 5ECPB 1E6BA 1O8WA 1T4ZA 3CTFA 1YJ6A 2MYGA 3P2AA 5CREA 3LQ7A 18GSA 2IMEA 4Z7XA 2ZUPA 3FYGA 4ZL8A 2VM2A 1CQHA 5EPFA 2YWMA 1YY7A 3HD5A 3ZIVA 4MF7A 3KP8A 2WGRA 4KF9A 5DALB 2GS3A 4TW5A 1DSBA 2H0HA 3RPPA 3GYKA 2F8AA 2IMDA 5H5RA 5G5FA 2LJRA 1X0RA 2H0GA 5HR2A 1PL2A 1U3AA 3EMXA 4WR4A 2B1KA 4OD7A 4MCUA 4G0LA 1TOFA 2GSRA 2VIMA 3EU3A 1A23A 4ZXGA 1TP9A 4NWYA 4OWYA 1XWKA 4TR0A 6GSVA 4KA0A 1X5EA 5C04A 2I9HA 2P5QA 5F0GA 2IFQB 3OR5A 2C0GA 4F03A 5G1LA 1FHEA 3GKMA 3ZMKA 4MPGA 1OAZA 1O73A 2LEGA 5EY6A 1EGOA 2YN1A 3F4RA 4EF0A 2REMA 3GA4A 2OBIA 3EINA 2B5YA 3KCMA 1BYEA 4RUVA 2GSSA 4CHSA 5DJLA 3TJFA 5J3RA 3IC8A 1M2AA 4FYUA 5A4VA 3HY2A 1JFUA 3F8UA 3LFLA 3FY7A 4K7NA 3D4MA 3WGDA 5DQSA 4ECBA 3MAKA 1FG4A 4HQSA 2HRKA 3GMFA 2PVOC 5FT3A 4FIWA 4TXOA 1K3LA 4FYBA 1VF3A 2N5BA 3K8NA 4F2IA 5AGYA 4IQ1A 10GSA 1Z7RA 2C4JA 2YWIA 1OC9A 1A2JA 2H0IA 4KCAA 5L71A 4K8MA 3SBCA 3ZVJA 1OVNA 4J56E 3KGKA 2FA8A 2H1AA 2H01A 3BD2A 4CW9A 5A4WA 3ERWA 1ILOA 2DJ0A 4MPFA 1Z9HA 4IVFA 4K6XA 3TOTA 3H4KA 4NMUA 2OE3A 3W6GA 2LJKA 1UVZA 2F8FA 4POBA 2YNXA 1Q4JA 4TRXA 2NPBA 2O85A 4F9ZA 1THXA 6GSWA 5IMCA 2H75A 1SK1A 2VCXA 3G7YA 1HD2A 3APOA 2L6DA 2FD3A 2QKEA 3J7Yb 3G9BA 1XXUA 4Q5NA 2B6MA 2GT6A 3IA1A 5G30A 4EO3A 2VL2A 2C0DA 2LRTA 4IKHA 4I8BA 4XS4B 1GSEA 4FH8A 3A2XA 3TRPA 5GAPD 1PMTA 1EEMA 4FQUA 5ECIB 5HR1A 1H75A 5C00A 3F3QA 3GTUA 4G0IA 3Q6OA 4GRFA 1TI3A 2GQKA 2K18A 4IGJA 4PURA 5COHA 3N5OA 4L0UA 2O89A 2M46A 1V2AA 6GSYA 4WETA 1THOA 3GH9A 1XWGA 1M2BA 3H8QA 1Y25A 3FRCA 4GWRA 3TCOA 2PWJA 5F07A 4N0ZA 3ED3A 4OFTA 2EIOA 3GX8A 2YZHA 3CRUA 4DEJA 4JR4A 3P8WA 2EIRA 1JZOA 2A2RA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3CRUA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations