1F3BA

Crystal structure of mgsta1-1 in complex with glutathione conjugate of benzo[a]pyrene epoxide
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
222
structure length
221
Chain Sequence
AGKPVLHYFNARGRMECIRWLLAAAGVEFEEKFIQSPEDLEKLKKDGNLMFDQVPMVEIDGMKLAQTRAILNYIATKYDLYGKDMKERALIDMYSEGILDLTEMIGQLVLPPDQREAKTALAKDRTKNRYLPAFEKVLKSHGQDYLVGNRLTRVDIHLLEVLLYVEEFDASLLTPFPLLKAFKSRISSLPNVKKFLQPGSQRKPPMDAKQIQEARKAFKIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Residue R216 and catalytic efficiency of a murine class alpha glutathione S-transferase toward benzo[a]pyrene 7(R),8(S)-diol 9(S), 10(R)-epoxide.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
molecule keywords GLUTATHIONE S-TRANSFERASE YA CHAIN
total genus 81
structure length 221
sequence length 222
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2000-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1f3bA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1f3bA01
3RPNA 2LNSA 1UA5A 3FR6A 4EE0A 2TIRA 1HNBA 1SD9A 2HRAA 1PQNA 4I8BA 3UMAA 4GWRA 4RQRA 3TKSA 3GNJA 2QC7A 4NAXA 1TK5B 3G7JA 2R6KA 3D4MA 2HRFA 4WXTA 2VCQA 4G10A 3CRTA 1Z3EA 2PU9C 4KSMA 3TDGA 1RK4A 3HKRA 1QGVA 3IDVA 4FO5A 3UJ1A 2VCXA 5C04A 2VCTA 5A4WA 4NPBA 1YKCA 1PL2A 1WRYA 2H75A 4EF0A 2H74A 4EL1A 2H0IA 1A8LA 4BVYB 4TVEA 2V2GA 2DBCA 2YPMA 1TDIA 3ZRDA 4XCSA 1VF1A 1HYUA 1M99A 2EIOA 3M1GA 4CHSA 4ZL7A 2HSHA 4ZB6A 5CREA 1GSDA 1K0CA 2L4CA 4MA9A 3KTLA 4ECCA 2F9SA 4F82A 4YAVA 4V2MA 1TTZA 2GSTA 2CQ9A 3P7XA 5EVOA 1A24A 2MBTA 5DQSA 3LSZA 1MDIA 4AJ7A 1XW9A 4BVYA 3LXZA 1CQGA 3C7MA 4H86A 4WF5A 3QDNA 1T00A 1Y6EA 4TOPA 5IMCA 2GLRA 1GULA 4GCIA 1R7HA 5E59A 2C0GA 3L9VA 2MMAA 3IBHA 4DSSB 4GQFA 4EDYA 4X1UA 4TRXA 1NM3A 1CQHA 2P5RA 1ERWA 1GLPA 1DE1A 2O7KA 4K0NA 5AISA 2WFCA 1BJXA 2DSAA 1A2MA 1A0FA 5IMZA 3IXRA 3CSIA 5HFKA 2C0FA 4KX4A 1WOUA 1G6WA 1X9SB 1K0MA 1SKSB 4DEJA 4KB3A 2LNTA 3UBKA 1X9WB 1YZXA 2N5BA 2H6YA 1XOAA 2OE3A 2C1YA 5IMAA 5ELAA 4MF6A 2YZUA 1IYHA 4DSRA 1SYRA 4IHUA 2H1DA 1V98A 4L0UA 2HQTA 3MAKA 4PUAA 3DGQA 2WCIA 6GSTA 3R2QA 1OAZA 3US3A 3S9FA 1ML6A 3GMFA 3QR6A 4KH7A 4XS1A 5HR0A 4POLA 2IIYA 5DDLA 3E3EA 4YQVA 2VM2A 4G9HA 4O5RA 1GTUA 1BAYA 1JHBA 2FGXA 4F0CA 2FA4A 2RUEA 3ZMKA 1NHYA 4N0VA 2QGVA 2PERA 4L8EA 2P5QA 1M2DA 1TI1A 3DIEA 1T1VA 2GSRA 2LUSA 3UOMA 3ZITA 3ZIVA 2YNXA 4N11A 3UVHA 1PD21 2HRKB 4IJIA 1URMA 3WT1A 5A4VA 3TCOA 1U6TA 2VLUA 3GRXA 1K3OA 2I81A 2IMEA 1MD3A 3BJ5A 3ZYWA 1PRXA 2H01A 3VWWA 2JL4A 6GSUA 5J5NA 1SENA 2HSMB 4ZB8A 3HZ8A 3A3TA 4NXIA 4WR4A 3ZVJA 2FNOA 3H8QA 5ECOB 4Q5QA 1Z6MA 4MJEA 3LQ7A 1VF3A 3PR8A 3W8SA 2R3XA 2F51A 2M46A 2HYXA 5KN0A 2RUFA 2HRKA 2X99A 1GL8A 3GKXA 5IPGA 5ECQB 5CRWA 1GUMA 3TKRA 2GQLA 2F8FA 4OCFA 3I43A 2JSZA 3DWVA 2C8UA 2ES7A 2IJYA 2AB6A 3F3QA 2CVKA 3EYTA 1UN2A 19GSA 1MD4A 1EOHA 5G2ZA 3I69A 1AUCA 3I6AA 4TN8A 4P3YB 3V1WA 4RQXA 3FZ5A 1X5CA 13GSA 4G0KA 4ZBDA 3TJFA 2HZEA 1T8EB 4E8HA 3GL5A 3EMXA 9GSSA 4PX1A 1SL0B 1M0UA 3A2WA 5IPHA 1ON4A 4MF7A 3HA9A 4K7IA 2GVPA 4I5QA 4AF2A 1TRSA 4K8MA 4G19A 5EL8A 4KDXA 1Q4JA 5EY6A 3C1RA 4NV5A 1B9XC 1RQMA 1K3LA 4MZBA 3PINA 5B6MA 5CAXA 2H1BA 18GSA 2IWTA 1O8WA 1J9BA 3VWVA 5ABRA 3HCZA 3R3EA 4BWSA 2YANA 1WPIA 2HSYA 2OA7A 3K8NA 1AIUA 1GRXA 3ZFBA 4YQUA 3UL3A 2OADA 2YV9A 1SD8A 2C0EA 2NBSA 4QQ7A 3VLNA 5G30A 4WBJA 3UAPA 2I3YA 1AQVA 2KLXA 2XPDA 2V6OA 1WE0A 2YWIA 1AQXA 1XFLA 2JACA 4TR3A 3FR9A 2LKUA 3M9KA 3L78A 4EVMA 2J9HA 4POBA 1HNCA 6GSWA 3RBTA 3IPZA 1AAZA 2CA8A 3VK9A 1HD2A 3IA1A 3Q6OA 3D0ZA 2FWGA 2DJ1A 1EOGA 5D96A 3VFIA 3WD6A 2VCZA 2VD1A 1J08A 2JZRA 2ZCTA 2CZ2A 2WULA 2JADA 2B5EA 3LXTA 5H5RA 3GH9A 3HVXA 3N5OA 4BVXB 3NIVA 2NTOA 2MBSA 4YAPA 3EVIA 2CX4A 3IK7A 3GHAA 2DJ3A 4XHMA 4HZ4A 2KP1A 1F3BA 2OBIA 5JWQB 5G5FA 3IOSA 3QMXA 5B6NA 3ZIJA 3KXOA 3L9SA 3HXSA 2JSYA 4USSA 3H93A 5JWOB 2I1UA 5HR2A 5F05A 4ECJA 2DMMA 3TOTA 4MDCA 5IMFA 4GSTA 1R4WA 1XXUA 4RI6A 2B1KA 3UEMA 3LYPA 2WB9A 3FKFA 1J0FA 2YWNA 4PNFA 1KTEA 3ZMLA 3TGZA 1XOBA 5F07A 3J7Yk 3ED3A 1F3AA 4J2FA 2R2JA 4IVFA 3RDWA 3TOUA 1FOVA 4EDZA 1YEXA 1ZZYA 2WGRA 1O73A 2MYGA 1X0RA 1QXHA 4TKYA 1R26A 2XPEA 2E2MA 2M80A 1F2EA 6GSSA 2H19A 1Z7PA 5GZZB 8GSSA 1SK2A 4KGIA 1OC9B 5DBQA 3IAM2 4EXJA 3TJGA 2HSNB 2RLIA 4ECIA 2FWFA 2CT6A 5DALB 2MMNA 2AAWA 2HI7A 4K9ZA 3I9V2 5DJLA 2K8VA 2VLTA 1ILOA 5JCUA 2VCWA 1S3CA 1SU9A 1KBNA 1R5AA 2GZPA 1B9YC 3NOFA 1AQWA 1THOA 3QAWA 2H0HA 1XBSA 1S3DA 20GSA 3QFAC 5C00A 3HY2A 1K0NA 4PGTA 1PSQA 1O7UA 2FUG2 2FCHA 3FK8A 3RHCA 1YEPA 4PTSA 2GZZA 1V2AA 1ERTA 2FHEA 2A2RA 2V32A 4L0WA 4EC0A 1OC9A 1SL2B 5F0GA 1ST9A 4OFMA 3IC8A 2MMOA 4BPYA 4KCEA 5CNWA 2XC2A 5KN2A 3BOAA 1M7TA 2H66A 4ULXA 1M2AA 5EPFA 2PN8A 2AUVA 4ZB9A 5G1KA 1WP0A 4EO3A 1TRVA 4XTSA 4ZILA 3GKKA 22GSA 2KOKA 1H75A 2R37A 3KH9A 1JZWA 3LGCA 3DVWA 2GZYA 2OBKA 1TU7A 2GSSA 4MJAA 3UIWA 1XWBA 2L6DA 2E2GA 1UC7A 1TI3A 1Y25A 3CSHA 2C3QA 3UVTA 5DAKB 5AIVA 4TR0A 4X43A 2Z9SA 1EP7A 2M72A 4XIHA 3LJRA 3KM6A 11GSA 2GGTA 2XBQA 4GTUA 1LJRA 1AXDA 2P0GA 4K1FA 6GSXA 1PX6A 3WYWA 3W8JA 2R4VA 3CRUA 1PGTA 2OE0A 4NWYA 3FYGA 2FY6A 1VF4A 1HQOA 2FWEA 2AV4A 1E6BA 1ERVA 2B1LA 1JZRA 1M9BA 2YZHA 3RAZA 4BL7B 2LRCA 2X8HA 3WGDA 2K18A 3TJKA 3D4TA 2DJKA 3HZ4A 2V1MA 4I2TA 1QUWA 3VPQA 1MDKA 5IMDA 1Z6NA 4IJ3A 1YF1A 2AJQB 1A2LA 5DAKA 2H0GA 4ZL8A 3KGKA 4DSSA 4MPGA 3H4KA 2B5YA 2MZCA 4D73B 4FYBA 4MJBA 3G7IA 2ZNMA 3FZ9A 1K0DA 1GP1A 3GFKA 5ECLB 5D8IA 4OFNA 4MP4A 2IMKA 1XCCA 1FVJA 4XRDA 3IRAA 1XIYA 5CP1A 2L5LA 2H71A 3HHVA 3GSSA 2IMIA 3W6GA 3LORA 1VGLA 2YP6A 3G7YA 3AY8A 4HJMA 1OE7A 2IMFA 5B8BA 4MLYA 2ON5A 5D9TA 5JCGA 1OKTA 1TW9A 1K0OA 5AIXA 1EWXA 3ERWA 2KP2A 5B7CA 2DJ0A 1TJDA 3N9JA 2I9HA 1UVZA 1YDKA 2L5OA 1T4ZA 1F6MC 4MK3A 3EINA 3HYPA 3DD3A 2XHFA 3F9UA 4TR1B 2O85A 3C71A 2HE3A 4K2DA 3C1SA 4MJCA 2HRNA 2V6KA 1A2JA 2XBIA 4POMA 5DJMA 3EU4A 1W4VA 1KNGA 4GRFA 4O7HA 1OC8A 5D9WA 3VWXA 1E2YA 3GA4A 2QKEA 1F9MA 3DEXA 5KEJA 4F2IA 1DUGA 4KDUA 4XS6A 2E0QA 1GSYA 3M3MA 5LNKe 1HNAA 2C4JA 1U3AA 2DJJA 2TRCP 3F0IA 3FZ4A 3GYKA 2G0FA 5J9BA 1ZL9A 2C0DA 2IFQB 4MZWA 4TR1A 1QQ2A 3VI5A 3EURA 1YJ6A 3GURA 2HSMA 3MDKA 2VL9A 2CVBA 2O89A 4AGSA 4ISDA 1USBA 1TOFA 4PQ1A 1B8XA 4V2NA 4BWQA 2DIYA 5ECRB 3L4NA 2WJUA 4YH2A 3Q74A 3JCML 4JR6A 1ERUA 1EGRA 2F3MA 4G2EA 2EC4A 4AJ6A 4PURA 4K7NA 5J41A 3FHKA 2CVDA 4MZCA 2VOCA 4JEDA 1X5EA 1QMVA 2TRXA 3LEFA 2ZUPA 1VF2A 5FHIA 2IFQA 4KDYA 1SJZA 1I9DA 1LU4A 2B5XA 3TUEA 3GTUB 3HVSA 3UARA 2I4AA 2PWJA 3FY7A 2H76A 5ECSA 2BTOT 1EV4A 2EIQA 2G2QA 2LQQA 2BMXA 5IOXA 1FB6A 2RM6A 4GF0A 2KUCA 3DMLA 1GTIA 3IHQA 5ECNB 2ALBA 4JRRA 5ELGA 3BBYA 4ML1A 1FW1A 5DVBA 2H73A 3VWUA 2NDOA 2FA8A 3BCIA 3WT2A 2GT5A 2HLSA 4CDOA 1GTBA 4KNDA 3LYKA 3A2VA 4ECBA 4PQIA 2VIMA 3PH9A 5B8AA 5IMVA 3BD2A 3BCKA 3MWHA 1OYJA 1GWCA 3GKMA 3WGXA 1V58A 2GTUA 3GTUA 4HZ2A 2RM5A 3GN3A 2FLSA 4L5OA 4JE1A 3Q18A 1KEBA 3H1NA 1GLQA 5CRDA 4ZBBA 2PBJA 4I2UA 3CMIA 1TK0B 3DYRA 4LMVA 2VUPA 1G0TA 3IE3A 1JFUA 1G7OA 3HDCA 1X9MB 3KCMA 5LCZA 4GXZA 3ZTLA 5DQYA 3GKNA 4JU5A 4ZXGA 4HQZA 4FQUA 3KD0A 5GAND 4IQ1A 3EU3A 3P90A 2PUKC 2H1AA 4TXOB 5G5EA 2B6MA 2CAQA 3WGEA 1THXA 2KHPA 2R5GA 2C3TA 5CYYA 1C72A 5D9VA 1M2BA 5E4WA 1N8JA 1WIKA 3SWLA 3QPMA 4GLTA 1ACVA 4PXOA 4V2LA 1RW1A 1GSUA 3GL3A 2DC5A 1LBKA 2K8SA 4LL4B 1XW5A 3P2AA 2IMDA 1QK8A 3QD9A 2GT6A 2YCDA 2VL3A 3O6TA 4KA0A 1TXXA 2LSTA 2C80A 4HOJA 2NVLA 5HR3A 4BVXA 3F3RA 3TRXA 2YOIA 2N5AA 3CTGA 1GSQA 1EP8A 1GUKA 4HQSA 5A5KA 3RHBA 1O8XA 1MTCA 2PVQA 1NHOA 1ZMAA 3O3TA 4NHZA 3HD5A 4MH3A 4FYUA 2YV7A 2YJHA 1JLWA 2CZ3A 4Q5FA 12GSA 3E9JB 3L0HA 5CRGA 5IO2A 1F37A 4IBPA 3DRNA 5DCGA 4OCEA 2VL2A 1SL1B 2LS5A 2PVOC 3TB2A 3FRCA 1H4OA 2AYTA 4I97A 1YY7A 4K7OA 2DIZA 2OKAA 2BJXA 4IGJA 1ZYQB 3EWLA 3M8NA 2V41A 3LFLA 3GIXA 4LA1A 4IELA 5GSTA 4FYCA 4ACSA 4KSOA 1SJIA 2GS3A 1GUHA 5F06A 2HFDA 1DE2A 2YWOA 1GSFA 4Q5NA 2VL2C 3U6VA 3GSTA 2QSIA 2PGTA 1W89A 2O87A 5G1LA 4HDEA 2NPBA 1SJ6A 2PPTA 3KTBA 1ZOFA 2DJ2A 3E0UA 4BA7A 1XWKA 3F6DA 2LJRA 1O6JA 1QFNA 5DCHA 1O81A 1WMJA 4F03A 14GSA 1OC3A 2H1GA 5ENUA 5L71A 1G7EA 3F6FA 4LLRA 4TR4A 2LTKA 3TKSC 4QL7A 3M0FA 1M9AA 5FWGA 2H8LA 3QAVA 2OJLA 5HQPA 5IQYA 2H70A 10GSA 3QOUA 1NW2A 5DALA 1TRWA 3D6IA 4Q5RA 2HZFA 5KN3A 4LL1B 1FB0A 3EMPA 1GTAA 2B3SA 3ZZXA 4OWYA 3IR4A 4NHWA 1GSSA 2IL3A 1PN9A 2D2ZA 3VPTA 3GV1A 16GSA 5ECKB 1XZOA 1YF0A 3F4SA 1SK1A 3APQA 1Q98A 2H6XA 3HJMA 4KW6A 1I5GA 7GSSA 1JZDA 5IM9A 4O92A 1TKDB 3TKQA 5BMUA 4HJ2A 1XVWA 2HXKA 1PKZA 1PA3A 3A2XA 5JCWA 2OE1A 5H5SA 3TJBA 5J3RA 3D5JA 1XWGA 2VM1A 5HR1A 3KMNA 5INYA 1DBYA 2CX3A 2K6VA 1U3IA 2J23A 4KCAA 4GSNA 1ZYEA 2L6CA 5J9CA 1U87A 5CO3A 4PQHA 4FIWA 3KIJA 1BQ7A 1JZOA 3ME7A 4POKA 2L59A 4J56E 1V40A 2K9FA 3ZREA 3PGTA 3ZVJD 3APSA 4MMMA 3H79A 1A23A 4GSSA 3Q19A 1PMTA 2CV4A 1OE8A 2H6ZA 1BG5A 3O76A 2PMTA 2VO4A 2WZ9A 1WJKA 1U88A 3TKSE 1YKAA 3KP9A 4XRAA 4F9ZA 3ZLPA 2JZTA 1GNEA 3NZNA 1SYXA 3GX8A 3L9UA 3KEBA 1X5DA 6GSVA 3FZAA 1GNWA 1TU8A 3D21A 4IP1A 1FG4A 3CBUA 4HS1A 3M9JA 1BX9A 1YQ1A 3TRQA 1FAAA 5D73A 4DSQA 5D93A 4HEA2 5G31A 3ZL5A 4BL7A 4FH8A 3LG6A 3IV4A 2E7PA 4HU7A 5HFGA 4L5LA 2GSQA 5KN1A 1ABAA 2LQOA 4WF4A 1XPVA 1B48A 2ON7A 2X8GA 4WR5A 2LRNA 1EV9A 2P31A 4D73A 2A2SA 4HUAA 3GX0A 3SBCA 6GSYA 4CW9A 2DMLA 4ILFA 3KP8A 4MABA 3GUSA 3QAGA 1FVKA 4KE3A 3G9BA 3LWAA 1MDJA 2GQMA 4JR4A 2L57A 2H30A 5ECIB 4MF5A 2LJKA 4RUVA 2AHEA 1T4YA 2VCVA 3ERGA 1EEJA 1B4QA 5IOWA 3EC3A 5COHA 3D22A 1FO5A 5ID2B 1SKWB 2WDUA 1WWJA 5IO0A 1TRUA 3FW2A 4K6XA 5JWRB 4V1Ag 2HZEB 1O85A 4XS4B 2VD0A 3FEUA 1T3BA 4IS0A 4KAEA 3F4RA 2LV3A 1K3YA 3VI7A 4G0IA 5ECPB 1V9WA 2JZSA 3MNGA 1VRSD 4OO4A 5HFIA 4IN0A 3VURA 1BEDA 1ZCPA 4RI7A 4E8EA 3CYNA 2RIIA 3UBLA 3DXBA 3QFBC 3KJYA 4WBRD 4WETA 4O32A 1PL1A 2LEGA 1TP9A 2YN1A 2N5FA 4JZQA 4MH2A 4QL9A 2YWMA 2LRTA 4EKZA 5ID2A 2OACA 1JLVA 4AJ8A 5ECMB 1IYIA 4XS4A 3IC4A 1SK0A 5D9XA 3F63A 1XWCA 4ML6A 3APOA 1Z9HA 3ISOA 1T7PB 3IAS2 1TK8B 2MMZA 1OVNA 2YJ7A 1B4PA 2LJAA 2GDRA 3FR3A 4IW9A 1S3AA 3EE2A 1EZKA 17GSA 2WS2A 5J4UA 4NMUA 4LMWA 4ZBAA 1MEKA 1BYEA 2FWHA 1AC1A 1GSEA 2JU5A 3QCPA 4WKWA 3KZQA 4MCUA 5LD0A 4IKHA 4JBBA 1NSWA 3F4TA 3ERFA 4TW5A 4HU9A 1AW9A 2X8CA 4OFTA 3HVVA 5AN1A 4K0GA 4DVCA 3TJJA 2DLXA 4NV2A 4N10A 4G0LA 1XWAA 3C73A 1K0AA 1PX7A 2HNLA 3OR5A 4I6XA 3A5WA 2X64A 3TKPA 1EEMA 4KF9A 1FHEA 2WRTA 2B7JA 4IQAA 5H5QA 4F0BA 3F8UA 3J7Yb 3HJPA 1N2AA 5GSSA 1DSBA 1R5PA 2C3NA 1V57A 3TRPA 1G6YA 3GH6A 2REMA 4HI7A 4YQMA 4TXVA 4ZL9A 1A8YA 1XW6A 1XVQA 2CAIA 3ME8A 4Z7XA 3PPUA 4OD7A 3DKSA 3U5RE 4ID0A 2VAFA 3DVXA 4GQCA 1K0BA 4EUYA 4OO5A 2HT9A 4ZIJA 3CSJA 1Z7RA 3P8WA 5AGYA 2L4QA 1OKDA 4KUNA 1PKWA 4IP6A 5GAPD 3C8EA 1GH2A 1EGOA 5F8BA 2VLVA 4WEYA 2IPAA 1Z5YE 5IIZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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