4MDCA

Crystal structure of glutathione s-transferase from sinorhizobium meliloti 1021, nysgrc target 021389
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
SMPTLYHHPMSPASRFVRLILSEYGYQTELSEEQPWENRRDFLTLNPAGTLPVYVDDSMRALCGATIISEYLDETSGIMKRDRRLLAEDPFQRAEIRRLTEWFLQKMEADVTRPLVRERIFKLQMTPDQGGGAPDSKILRTSRSNIRQHMKYLSWLAGSRPWLAGDRISYGDLAAAAAISVLDYLGEIDWSDAPTAKEWYQRLKSRPSFRPLLAERVRGVTPVSHYADLDF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Putative glutathione S-transferase
publication title Crystal structure of glutathione S-transferase from Sinorhizobium meliloti 1021
rcsb
source organism Sinorhizobium meliloti
molecule tags Transferase
total genus 83
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2013-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4mdcA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mdcA01
1K0CA 4KA0A 1BX9A 2YWNA 4EDYA 4MPGA 3VWUA 1A23A 3CXGA 5B8BA 1R5AA 4GCIA 3KGKA 1SYXA 5DQSA 2CZ3A 1SL0B 3HVXA 2XPDA 2FLSA 3HHVA 4EF0A 3VURA 3IR4A 5IMZA 2ON5A 2XC2A 1U6TA 3KZQA 2IMFA 3L78A 5FT3A 4TN8A 1ZL9A 18GSA 3FY7A 4PXOA 2IIYA 1YDKA 3F6FA 2RM5A 5D9TA 1Z6MA 1MEKA 4EUYA 2VL2C 1G0TA 5LNKe 3M8NA 1SKSB 3PGTA 3F4RA 2RM6A 3KP9A 3W8JA 3N9JA 4E8EA 3UMAA 2H01A 1UN2A 5GSSA 3R3EA 1ZMAA 4K7NA 5LD0A 3VK9A 1TDIA 1PN9A 4POBA 3P7XA 4F2IA 3TJFA 2H6ZA 3L4NA 4L5LA 2J9HA 5KN3A 5DCGA 1SD8A 3MDKA 5F05A 2KP1A 3LYKA 4IHUA 4ULXA 1SD9A 4POKA 3QR6A 1XCCA 1NSWA 4FH8A 3TRXA 3DWVA 3HYPA 5E59A 3EYTA 2GQLA 2CV4A 2DMMA 3TKRA 2PVOC 1S3CA 1EV4A 2PBJA 1QGVA 1GSEA 1VF2A 4PGTA 2I4AA 2MMNA 1E6BA 2HI7A 4ZBAA 2VD0A 1F9MA 2B5XA 1J0FA 3L9SA 1YKCA 2I81A 1EGRA 4PX1A 4NHZA 4NHWA 5A5KA 4JR4A 2JZSA 1KEBA 1U3AA 5J9BA 4KAEA 1Z9HA 4BWQA 4CW9A 3M1GA 4IJIA 2B1LA 2K18A 3ZVJA 2PGTA 4PUFC 1YJ6A 4MA9A 2DJJA 2K8SA 3IRAA 3TDGA 6GSUA 5J4UA 1WOUA 3TKSC 1A2LA 1V58A 1PGTA 2L6CA 5IMDA 1TRSA 2FA4A 1GSUA 3SWLA 2MBTA 4ZB8A 4OCEA 1SJIA 3IE3A 3MNGA 2YP6A 3WT1A 3KXOA 4HQSA 1GTIA 2V6OA 1OYJA 1BYEA 2UZ8A 2YV9A 1GSYA 3ZFLA 5B7CA 4N10A 2X64A 3VWWA 1K3YA 4QL9A 5DBQA 4TXOA 4BPYA 3ZIJA 1XWCA 5G1KA 5IIZA 2V1MA 2H30A 2OE1A 5A4WA 3EMPA 4HQZA 1HNCA 1V2AA 1GUHA 2H71A 3KCMA 4G2EA 3GFKA 2FWFA 1QUWA 2PMTA 1XWBA 2C80A 5ECMB 3C71A 2VCZA 4KGIA 2V32A 1LBKA 7GSSA 4X43A 1M2DA 1YF0A 3A2WA 2LV3A 4MJEA 3ZREA 1KTEA 4ML1A 3TKQA 2WDUA 1M2AA 2LSTA 4ILFA 2VCXA 5G2ZA 3TUEA 2HRKB 4I2TA 3TB2A 3LJRA 5IM9A 4KX4A 3HVSA 4DVCA 1QMVA 4TRXA 4EXJA 1SYRA 1O7UA 2A4VA 3UAPA 5CYYA 4MF6A 2LKUA 2C4JA 2MMZA 1OKTA 3E0UA 3GHAA 4ACSA 4HJ2A 4I5QA 1FAAA 3C1SA 1PA3A 1GTAA 1GP1A 2YWOA 5JWOB 1AIUA 4LLRA 4IQ1A 4CHSA 2C3NA 3D4TA 5GSTA 1G6WA 2YNXA 2GVPA 4OO4A 1K0OA 2H0GA 3QFBC 1XXUA 1SK2A 1MTCA 1T3BA 3O6TA 4MH2A 2F9SA 4MABA 5GAPD 2VCVA 4FYCA 2O85A 2VCQA 1R26A 2GQMA 5GAND 3PH9A 2C0DA 3KD0A 3FEUA 2AV4A 2H0HA 5JCGA 3FK8A 1SJ6A 2DSAA 4KDYA 4NV5A 4OFTA 3FYGA 1ZYEA 1C72A 4HS1A 3ZZXA 2IJYA 1TRUA 1Z7PA 2VO4A 1DE2A 2H66A 4BA7A 1N8JA 2IWTA 4X0XA 1U87A 4AGSA 1GSSA 2CQ9A 2E2MA 5G1LA 2PU9C 5KN2A 3F63A 5G31A 5D93A 4K8MA 5CP1A 5IMFA 5DCHA 1UA5A 3Q18A 3VFIA 2LRTA 2GSTA 1BQ7A 2F8AA 9GSSA 5ECPB 2DJKA 4MP4A 2GT5A 4Z7XA 2FD3A 3VPQA 3ISOA 3GN3A 1ZCPA 3FHKA 5HFKA 2YCDA 3GA4A 1A8LA 3GL3A 5FWGA 3LWAA 2WS2A 2FUG2 3TOTA 4EVMA 3ERWA 2IMIA 2ZUPA 3OR5A 1Z5YE 2I3YA 5INYA 2H1DA 6GSXA 1SENA 2H6YA 4WETA 2RIIA 4K9ZA 3EU3A 1FB0A 1R5PA 1TJDA 3RAZA 3L9VA 2VM2A 3HZ8A 5J41A 5DDLA 2OACA 3FR3A 3QDNA 13GSA 2FWHA 3CSHA 3ERGA 2IFQA 1XZOA 2R3XA 1URMA 4NV2A 5JWQB 1EEMA 4OD7A 4GRFA 5DAKA 1K3OA 1UVZA 4HZ2A 4K2DA 3L9UA 2N5AA 3LFLA 3ERFA 3ZMKA 1PKWA 4MJBA 1E2YA 1Q98A 5IQYA 2B5EA 3GTUB 2GGTA 3KTBA 4DEJA 1B9XC 1EWXA 2IMDA 1J08A 3HXSA 4ZBDA 1TRVA 2X8CA 2B6MA 4FQUA 2V2GA 2PWJA 1PMTA 3WGEA 4I2UA 3IOSA 4ECCA 3GKXA 1TK0B 1U88A 3W6GA 2BJXA 4PQHA 1G7OA 3LQ7A 2H1AA 1TI1A 3D22A 3KP8A 5HQPA 4KB3A 1TKDB 2PVQA 4YQMA 5D9VA 3MWHA 2F51A 4ZBBA 5IO2A 2VLVA 11GSA 1VF3A 3C1RA 1RQMA 4G0KA 2VAFA 1VF1A 4QL7A 4ZB6A 2HXKA 1GUMA 4I8BA 1G7EA 3IC8A 4GSSA 1QFNA 3LYPA 3UARA 2L59A 1VRSD 3UVHA 3HZ4A 1F37A 5G30A 4OFMA 2H19A 2HT9A 1LJRA 4HEA2 5J5NA 4ID0A 2C0EA 1JLVA 2DJ1A 3F9UA 3FZ5A 3I6AA 2HSYA 1XW6A 2H73A 1DE1A 3GIXA 1JHBA 1O73A 1HD2A 2H74A 3NIVA 4YH2A 2FY6A 4DSSA 2HSMA 3W8SA 2EIQA 5ID2A 4MDCA 2TRXA 5D73A 4PNFA 1TU8A 3IXRA 1NHYA 5CRWA 5B6NA 4JEDA 5A4UA 3KIJA 3LORA 2B1KA 3EWLA 3IBHA 1X5EA 1R7HA 1AQXA 1JLWA 2GS3A 3H8QA 4Q5QA 1LU4A 3KEBA 2GT6A 1UC7A 4TKYA 1K0DA 1BEDA 5ECKB 1GUKA 4NAXA 2PN8A 3KTLA 3G7YA 3G7IA 3E9JB 3WYWA 4PQ1A 1B4QA 4WBJA 4YAPA 3BJ5A 1YKAA 4WF4A 2YZHA 5BMUA 1Z3EA 2L4QA 1ZZYA 3GL5A 2OE3A 1RK4A 2NTOA 3Q19A 2CVBA 3CSIA 2YZUA 1K0NA 3WGDA 1TK8B 4ISDA 5ECQB 1XPVA 2MBSA 3UJ1A 4HI7A 1XVWA 2GTUA 2HRAA 4NWYA 3J7Yb 4XRAA 3ZFBA 4WR4A 3PR8A 1DBYA 4KF9A 20GSA 4G10A 2YJHA 3HA9A 2QKEA 3U6VA 2X8GA 1M99A 1AXDA 2DC5A 1JZWA 4OO5A 3F0IA 3IAM2 1S3AA 4MH3A 4BL7A 1FVJA 2HE3A 2VOCA 1RW1A 4JE1A 5IPGA 3D5JA 10GSA 3ZIVA 2GZPA 2H1BA 3H79A 2D2ZA 1WWJA 3UIWA 2DJ3A 1NM3A 4F03A 5CRGA 4MZCA 4IN0A 1TXXA 2VL2A 4MLYA 2L6DA 2ALBA 5ECHB 1J9BA 2WB9A 4MPFA 2GSRA 2H1GA 3IV4A 2CAQA 2YJ7A 4YQVA 1O85A 3KH9A 2FWGA 1MD3A 3DVWA 4K7IA 5ECSA 4O7HA 1K0AA 3APSA 1EEJA 1IYIA 1EOHA 5EVOA 1XVQA 5DAKB 3F8UA 1S3DA 1GULA 2H76A 2O89A 3VWVA 2P0GA 4F0CA 4OMVA 3GNJA 1GLPA 4J2FA 1GSFA 4XS4A 4D73B 2VM1A 2JL4A 1SKWB 5G5EA 2B7KA 2R6KA 3NZNA 5JCWA 4ZL8A 4CDOA 4XCSA 1HQOA 4TW5A 4G9HA 1M7TA 5HR3A 2LJRA 4BVXA 2P5QA 4WR5A 4KCEA 2VL3A 2AJQB 1VF4A 2NPBA 4GXZA 1OAZA 3FZ9A 1M0UA 2H0IA 3UVTA 2LTKA 1YZXA 4G0LA 3F4TA 1GH2A 3HY2A 1T00A 3RDWA 4USSA 2KLXA 5EY6A 3QFAC 4L0WA 1TTZA 1FW1A 1Q4JA 2HZEA 4X1UA 3G7JA 1QXHA 1HNAA 3DVXA 1BG5A 4MJCA 4KDUA 3ED3A 2WGRA 5D8IA 4POLA 2IPAA 3HDCA 1GNEA 3ZITA 3TKSA 3LGCA 1K0MA 1USBA 4YAVA 4FIWA 3GX8A 4TR1A 4FO5A 3FZAA 4PTSA 5AISA 4NMUA 1N2AA 2FWEA 2AAWA 3H4KA 4MMMA 3Q6OA 4KCAA 1XBSA 4N30A 1YEXA 1F3AA 1T7PB 4ECIA 1HYUA 2HRFA 3M0FA 2REMA 5DJLA 3QAGA 4DSSB 1X9MB 3LEFA 2HSMB 4TR3A 2GLRA 1WP0A 1W4VA 3QOUA 1GSDA 3FR9A 2LS5A 1YQ1A 1M9BA 2DLXA 1PKZA 5JCUA 2NDOA 3KM6A 4IQAA 1EP7A 4IP1A 3APOA 1FOVA 1X0RA 5HR2A 4LA1A 3BBYA 3VPTA 4PURA 5H5QA 3TGZA 1XWAA 4HUAA 5A4VA 1AQVA 4F82A 1ILOA 2FHEA 2PERA 2DIZA 2YN1A 4LL4B 1GSQA 3FR6A 1A2MA 1KBNA 2FA8A 2VLUA 2YANA 1EP8A 2XBQA 1QK8A 5CRHA 3CBUA 3D6IA 2I1UA 2J23A 1EV9A 2PUKC 5B6MA 5G5FA 3IK9A 2FCHA 4AF2A 2HLSA 3CTGA 1PD21 3MAKA 2B5YA 5KN1A 1AAZA 1YEPA 3FKFA 5ECLB 2GZYA 4MZBA 5AIXA 2E7PA 1TOFA 5C04A 4ZL9A 2M46A 3ME8A 2VCWA 3GKMA 5AGYA 1V40A 4P3YB 3US3A 5CAXA 2OBIA 1X9SB 2L5OA 3UL3A 1H75A 2C3TA 5EL8A 1CQHA 4MCUA 4NPBA 4Q5FA 3G9BA 2JSZA 2JACA 3D21A 4HZ4A 1GTBA 1T4ZA 3QPMA 4TR0A 1MD4A 3O3TA 1XWKA 1SKRB 2HSHA 5B8AA 1ERVA 5DALA 5DVBA 2RUEA 1PSQA 4RQXA 4BVYA 3F4SA 1B48A 1PRXA 6GSVA 3IDVA 4V2NA 1ON4A 4YQUA 3GRXA 3CTFA 2CZ2A 2KHPA 2HQTA 3QAVA 3F6DA 1WPIA 2BMXA 3HD5A 3EMXA 3VWXA 4E8HA 3HCZA 4J57E 4PQIA 2FNOA 3U5RE 1MDJA 3GKKA 1OC8A 3TJJA 4OCFA 2OE0A 1B8XA 2HSNB 3HVVA 2XHFA 4RUVA 3L0HA 4TXOB 5D9XA 3ZMLA 2CAIA 2NVLA 1JZOA 3KH7A 1ZYQB 2VL9A 2HZFA 2E2GA 4F0BA 4MF5A 2QSIA 5J3RA 4O92A 4LMVA 2RLIA 1Y6EA 3WD6A 5D96A 4IVFA 2MZCA 3DYRA 3BCKA 4OFNA 5J9CA 2JSYA 4N11A 4JBBA 5AIVA 4EC0A 8GSSA 2L57A 1PX7A 2CX4A 3DD3A 4RI7A 19GSA 2HZEB 3HJOA 2EC4A 4G0IA 1OC3A 2HRKA 1T4YA 1OE8A 1EZKA 2H6XA 4MZWA 3RPNA 3CSJA 1PL2A 1SL2B 4KDXA 2R5GA 1GNWA 1PL1A 2DIYA 2AUVA 4EKZA 2MYGA 2AB6A 16GSA 2H72A 5ECIB 3P8WA 2O7KA 3CMIA 2A2RA 4RI6A 2ZCTA 4GSNA 4TR1B 2TIRA 3RBTA 14GSA 1PQNA 4PNGA 3ZRDA 1I9DA 1I5GA 2EIRA 1A2JA 2WULA 5KEJA 4TXVA 3H1NA 4XTSA 1IYHA 1AC1A 1JFUA 3F3RA 1R4WA 5F06A 4IP6A 4OWYA 2C1YA 2LNSA 2O87A 5F07A 2H75A 2MMAA 4KW6A 1PX6A 1JZDA 2WZ9A 1EOGA 4V1Ap 4V1Ag 2OJLA 4GLTA 2DMLA 5IOWA 4MJAA 3GH6A 1QQ2A 2OADA 1AQWA 2LQOA 3TKSE 3GSSA 3LG6A 5H5SA 4O5RA 2HNLA 3E3EA 2LUSA 3AY8A 2LRNA 3TOUA 3GH9A 5ELGA 4IJ3A 1FHEA 5ENUA 2IN3A 2A2SA 5D9WA 1TK5B 5ECNB 4Q5RA 3IA1A 5ABRA 2VCTA 2ON7A 2LNTA 4XS1A 3N5OA 1A0RP 2HRNA 1TP9A 1V98A 1Z6NA 4K0GA 3K8NA 2F3MA 1K3LA 2V6KA 1DSBA 1TW9A 3Q74A 4KNDA 1SU9A 4AJ7A 1KNGA 2NBSA 4K6XA 1GL8A 2VUPA 4ZIJA 3I69A 5CO3A 5KN0A 4FYUA 4IKHA 2RUFA 1FVKA 2H8LA 1ML6A 3J7Yk 2JZRA 2JZTA 1OC9A 2I9HA 3M9JA 1NHOA 4HU9A 3WT2A 3GURA 2YV7A 1M9AA 1SK1A 5JWRB 1THXA 1XOAA 4HJMA 1WJKA 3FZ4A 4RQRA 2XPEA 2G0FA 3GYKA 2GZZA 1OVNA 3MSZA 17GSA 2YWIA 3IHQA 4GWRA 4EL1A 4V2MA 4XS6A 4TVEA 5LCZA 2IFQB 3DRNA 2MMOA 1ACVA 5DALB 3GSTA 4XHMA 1WRYA 5ELAA 2P5RA 2L5LA 6GSTA 4BVYB 3VLNA 3UBKA 4WEYA 5ECRB 2DJ2A 5HFIA 3DMLA 3GTUA 3TRPA 2IMKA 4L8EA 3CRTA 4GQCA 2IL3A 2X8HA 3F3QA 4HDEA 3A3TA 1WE0A 2N5BA 4PUAA 4LMWA 2B3SA 4IELA 1XIYA 1GTUA 2ZNMA 3M3MA 2Z9SA 1DUGA 2G2QA 2HFDA 3ZVJD 3S9FA 1EGOA 4WF5A 5DJMA 3HJPA 2C3QA 4ZILA 4KH7A 1AW9A 5IO0A 3LSZA 5EPFA 1AUCA 1O6JA 3UOMA 2M72A 3UEMA 1YY7A 3M9KA 3ZYWA 2FGXA 4ZXGA 4QQ7A 4N0VA 1O81A 4NXIA 3GX0A 1O8WA 4I6XA 4ZB9A 3V1WA 4Q5NA 4I97A 3IC4A 1XWGA 4BWSA 2VD1A 1WMJA 3PINA 2WJUA 1Y25A 2LJKA 1WIKA 4IGJA 5CRDA 3UBLA 4XIHA 3C73A 2K6VA 3KJYA 3C7MA 1Z7RA 4WXTA 3CRUA 3ME7A 1BJXA 3HKRA 2KOKA 4EDZA 4JRRA 1SK0A 4WBRD 4L5OA 1FB6A 2LJAA 2WRTA 2GSSA 3FW2A 5E4WA 1SJZA 6GSYA 4LL1B 3NOFA 2K9FA 2XBIA 1X9WB 1YF1A 5IOXA 1SL1B 3LXZA 3DXBA 2R2JA 5IMCA 5ID2B 6GSWA 4G19A 1M2BA 1ERTA 3R2QA 2LQQA 3TJBA 5C00A 5IPHA 4GQFA 2TRCP 3APQA 3P90A 4FYBA 4ECJA 1H4OA 4AJ6A 1GWCA 5ECOB 3C8EA 1HNBA 1U3IA 22GSA 1JZRA 5HR1A 3VI7A 2DBCA 2E0QA 2AHEA 2OA7A 3ZL5A 5IMAA 2H70A 2OKAA 3GV1A 4F9ZA 3GKNA 2CVKA 4TR4A 3IPZA 4JZQA 2EIOA 1A8YA 2L4CA 3EE2A 1F3BA 3RPPA 1THOA 4KUNA 4POMA 3BD2A 5HFGA 2ES7A 2CVDA 2R4VA 3KMNA 2JU5A 3WGXA 4J56E 4JU5A 1FO5A 4KSMA 2GDRA 1W89A 4L0UA 3IAS2 1CQGA 3EU4A 3A2VA 3A2XA 4EE0A 3TJGA 5H5RA 3GMFA 2IMEA 4EO3A 4MF7A 3BOAA 2K8VA 1MDKA 3TJKA 4BL7B 4WKWA 2P31A 6GSSA 2CA8A 2VLTA 2M80A 3VI5A 3TKPA 4N0ZA 5DQYA 1XW5A 1OC9B 1OKDA 2LRCA 5GZZB 1VGLA 3RHCA 3ZLPA 5FHIA 3IK7A 3EURA 2JADA 2WFCA 4TOPA 4GTUA 1GRXA 2X99A 1ABAA 2DJ0A 1TI3A 5COHA 3ZTLA 5L71A 1ERWA 1ZOFA 2YWMA 4DSQA 1XFLA 3EVIA 1T1VA 3LXTA 3EINA 3JCML 4ZL7A 1X5DA 5F0GA 1B9YC 2PPTA 3SBCA 3RHBA 1G6YA 2YPMA 2KP2A 4AJ8A 3QD9A 1O8XA 3FRCA 1ST9A 1XOBA 3HJMA 5CNWA 4IBPA 2C0GA 5CREA 4D73A 3I43A 4XS4B 2N5FA 4KSOA 3D0ZA 3QCPA 4K7OA 1A0FA 1ERUA 1MDIA 2KUCA 3P2AA 3DGQA 2CT6A 3TRQA 4K0NA 2AYTA 3DKSA 1A24A 3I9V2 1GLQA 4MK3A 4BVXB 3QAWA 2V41A 5IMVA 1K0BA 3GUSA 1X5CA 3CYNA 2F8FA 4DSRA 1XW9A 2BTOT 4HU7A 1BAYA 2CX3A 3BCIA 4XRDA 1T8EB 1OE7A 1B4PA 1FG4A 2O8VB 2LEGA 5F8BA 3H93A 3O76A 4KE3A 2QGVA 2YOIA 3A5WA 1NW2A 1V9WA 2QC7A 4GF0A 2C8UA 3DEXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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