3CRTA

Structural characterization of an engineered allosteric protein
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGCEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Schistosoma japonicum
publication title Using affinity chromatography to engineer and characterize pH-dependent protein switches.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme
total genus 70
structure length 214
sequence length 214
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2008-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3crtA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3crtA01
5IIZA 1XZOA 2GGTA 1QMVA 4IP6A 4K1FA 3TKPA 2WB9A 4KDXA 2H71A 4HU7A 3M0FA 4Q5FA 1XVWA 3FRCA 4F82A 5ABRA 1WPIA 3SWLA 2D2ZA 1GLQA 1UC7A 2MMOA 4KA0A 4MA9A 1GSQA 3KP8A 5ECSA 4N0VA 2C8UA 2E2GA 2L5LA 2GVPA 4KUNA 3EURA 5DAKA 4KSMA 1SD9A 1EEMA 3TRXA 3VURA 1SKWB 2C0GA 3TKSE 1XBSA 2GDRA 1GL8A 1T7PB 1AQXA 1KBNA 4NMUA 5GAPD 5DCHA 3QFAC 2NVLA 2VLUA 2QGVA 3ZTLA 3O3TA 5ECQB 4PUFC 4QL9A 4XS6A 5F8BA 5DBQA 5IPGA 6GSXA 3TKQA 1Z6NA 5GZZB 3WT2A 1YF1A 2HYXA 4MABA 3DGQA 2DSAA 1G6YA 4OD7A 2I4AA 1PL1A 2CVDA 2RM5A 2CAQA 5DJLA 2H30A 1DBYA 1SJ6A 4TR3A 1X5DA 1OC9A 3E3EA 4ZB8A 1S3CA 3P2AA 3WT1A 2G0FA 2H0GA 2V6OA 2K8SA 1BYEA 5D73A 2LTKA 3ZVJD 1K0AA 3GN3A 2GSTA 2PU9C 4TR4A 3RBTA 2GSRA 1ZOFA 1SJIA 3QCPA 4PQ1A 2P0GA 5ECMB 4EL1A 2H76A 2ZCTA 4TR1B 2L57A 2VAFA 4G2EA 2JU5A 2NTOA 1E6BA 4YH2A 3FY7A 3UL3A 3LORA 2HLSA 4ZB6A 1TDIA 4V2NA 1U3IA 4DSQA 5KN1A 1B8XA 2H6XA 4CHSA 1G0TA 2PMTA 2K18A 3ZZXA 4BWQA 2CA8A 1ZYQB 4I6XA 1XFLA 4I2UA 1XW5A 1SL2B 1B9XC 1LBKA 4BL7B 1QFNA 2BTOT 2HE3A 4HS1A 3UVHA 5IOWA 3KXOA 2R4VA 2JADA 1AAZA 3FZ4A 4MH2A 3F3RA 1THOA 1FVKA 5G31A 1EEJA 1AW9A 2KP1A 2IMDA 3W8SA 2VCVA 4HUAA 3D4TA 4K6XA 4XCSA 2IJYA 4X1UA 1ZGNA 1TI1A 2GZPA 2HRKA 4IBPA 2HRNA 2I81A 3H93A 3APQA 3WYWA 3DWVA 3IK7A 3FZAA 3HJOA 4EXJA 2KP2A 2RIIA 3DRNA 2KHPA 4IW9A 4QL7A 3TJGA 4F9ZA 3VWUA 4L0UA 4YQVA 2C1YA 1F3BA 2H73A 4O5RA 1AXDA 4BWSA 4FH8A 4ID0A 4AGSA 2EC4A 3H8QA 1R5PA 2I3YA 1T4ZA 3GH9A 5KN3A 4OFMA 1GSFA 3F3QA 3L4NA 3N5OA 4AF2A 2X8CA 2R6KA 4V1Ap 2OE0A 5ECRB 16GSA 3DIEA 4KX4A 1EOHA 3KP9A 2GT5A 4IQAA 22GSA 2M72A 1ML6A 3I69A 4ZB9A 5ID2B 4Q5RA 2A2SA 2GQKA 4KH7A 4K2DA 3GFKA 4KCEA 1SYRA 3ERWA 1M2DA 2FWEA 5GSSA 3QD9A 2L5OA 2J9HA 3HJMA 5ECHB 3HDCA 3LXTA 1FAAA 2LS5A 3A5WA 3IR4A 1SU9A 2C0FA 4POKA 2N5BA 2O8VB 5EVOA 1Q4JA 3H4KA 1Z5YE 5ENUA 1M2BA 1JHBA 1TRVA 1JFUA 1WP0A 4ZL8A 1QXHA 5HR3A 4EUYA 4KW6A 3CSIA 4PXOA 2YWNA 3QAWA 5ECNB 4WEYA 1QQ2A 1Y25A 3VPQA 4BL7A 3UIWA 3BCIA 2PUKC 2K8VA 2JSZA 2H6YA 1X0RA 5F07A 2H0IA 2TRXA 2NDOA 1TK0B 3D21A 5C04A 1O81A 4LMVA 3U6VA 4L5OA 5JCGA 2HT9A 4Q5NA 3F8UA 3IK9A 1O73A 1N2AA 5L71A 4GCIA 2WRTA 3KMNA 3CTFA 3TKRA 2H72A 5J41A 1U3AA 3FK8A 5D93A 2VL2C 1FHEA 4X0XA 2H1DA 2CZ2A 1I9DA 2NPBA 4POLA 3N9JA 5G30A 2B5YA 2IN3A 1U87A 3ZVJA 4AJ8A 1TK5B 1XXUA 1E2YA 3ERGA 3TOUA 3IPZA 4YQUA 4K7OA 3DXBA 4F0CA 3F4SA 5F06A 1F2EA 2K6VA 2DJ1A 3TGZA 4MZWA 4Q5QA 4MJBA 3A2WA 5ID2A 1GTAA 3ED3A 2E2MA 4KNDA 3RHBA 5LNKe 1RQMA 4ZILA 4LLRA 5G5FA 3DVWA 4MCUA 2P31A 1X9MB 4EVMA 5INYA 2WCIA 4FIWA 5D8IA 2XC2A 4ECCA 2AUVA 1USBA 3UEMA 3I43A 2V6KA 2PWJA 2YWOA 4GSNA 1GTUA 2M80A 3BBYA 4G0IA 2H8LA 1A0FA 3D4MA 3GL5A 1GH2A 1AUCA 1O7UA 1M7TA 1YKAA 1A2LA 3O6TA 3W8JA 4G19A 2OBIA 5CRGA 1TKDB 2IMFA 3IAS2 1FB0A 13GSA 4XS1A 4MZBA 3MWHA 2FUG2 3ZITA 2RLIA 2HXKA 5HFIA 3WGEA 3G7JA 2VCZA 3GSTA 3APOA 4ML1A 2JL4A 1ZCPA 5LD0A 2PGTA 1DE2A 4LL1B 3ZMKA 1PX7A 2L6DA 1UA5A 1GSDA 1BJXA 1GULA 1WWJA 5IO0A 3KJYA 2O7KA 5IMAA 3WD6A 3ZL5A 2GSSA 1GNWA 4PTSA 6GSYA 4IKHA 4MDCA 5IPHA 2IFQA 3P7XA 4JZQA 3FHKA 4NPBA 3D6IA 5IMDA 2WS2A 4HI7A 4N10A 1ACVA 2V1MA 4L8EA 2PERA 3ZFLA 2L59A 2DJKA 3GV1A 2J23A 4TW5A 3TRQA 3CMIA 2GS3A 1BEDA 3UAPA 3HVXA 1PD21 1K0BA 1SL1B 2HSNB 1X9SB 2MBTA 3BOAA 1O6JA 1LJRA 1M9BA 5KEJA 4GSSA 1ON4A 3M1GA 5HFGA 1O85A 3UVTA 1GUMA 1K3YA 2OE1A 4K8MA 2LUSA 1TRUA 1BG5A 4FYUA 5JWOB 1YJ6A 2DJ0A 3IRAA 5KN0A 1MDIA 4JRRA 2ES7A 4GWRA 2FGXA 3QAVA 2G2QA 1SK2A 2K9FA 2LNTA 1EV9A 4V2MA 1V2AA 4KDUA 1K3OA 3IAM2 1VF3A 2XHFA 4IELA 2TRCP 2CZ3A 2VCXA 3FR3A 4USSA 4PUAA 1AQWA 2I9HA 4ZBBA 2R37A 5GAND 1XPVA 1TRWA 4XIHA 1LU4A 3ISOA 1XWAA 1SK0A 5IM9A 1T8EB 1M9AA 5FT3A 4CW9A 5D9XA 2VO4A 2PN8A 4WBRD 3ZLPA 2VM2A 3GHAA 1NHOA 4TVEA 2HQTA 2IWTA 2JACA 1CQHA 14GSA 5HR2A 1V57A 3F4TA 6GSVA 4D73B 1N8JA 1TTZA 3GMFA 4XS4B 2JZSA 5CO3A 3VI7A 1Y6EA 1M99A 3H1NA 3AY8A 2AHEA 2O85A 3E0UA 1V40A 3RDWA 2IIYA 3L9UA 3EU3A 4DSSB 1FG4A 1EP7A 3DKSA 12GSA 2UZ8A 3R2QA 2H74A 4EC0A 1G7EA 3MNGA 5AISA 1OKDA 3CSHA 4WR5A 2HRAA 1TRSA 4P3YB 2CX4A 3K8NA 5J5NA 2LRNA 1OC3A 2YV9A 4ULXA 4JE1A 4X43A 2H70A 5H5SA 4IGJA 2WGRA 3HA9A 2HZEB 2VL3A 3VI5A 1XCCA 3QMXA 1R5AA 3GX8A 5G1KA 2RUFA 4BVYB 4BVXB 1WMJA 4L0WA 4FQUA 3PH9A 3A2XA 4J56E 2PBJA 1H4OA 4ECBA 1VRSD 1PMTA 3EINA 4IJ3A 5DVBA 1J0FA 5A5KA 3A2VA 3F9UA 1Q98A 2WZ9A 3EWLA 2DLXA 4HZ4A 3QAGA 5B7CA 2WDUA 2AJQB 5D9WA 3RHCA 1W4VA 2AAWA 3QDNA 3HD5A 4ZXGA 4F0BA 3C7MA 2F3MA 2QC7A 4EE0A 2F8FA 1B4PA 2VLVA 2GTUA 2OKAA 2IMEA 2XBIA 9GSSA 3KMOA 4IQ1A 1EV4A 3IE3A 4EO3A 5KN2A 4FO5A 1ERUA 2ZNMA 2FNOA 5EPFA 2VCTA 4JR6A 4TN8A 1XWKA 3BCKA 2YWMA 4MZCA 2DC5A 4K7IA 4OMVA 3TRPA 3GX0A 1EGOA 2R2JA 1V98A 3LYKA 4F03A 4FYBA 4Z7XA 1F3AA 3US3A 4XRDA 2CVBA 4N30A 3L9VA 3TB2A 3ZIJA 1U6TA 3EC3A 3VWWA 1SK1A 1OAZA 1EOGA 4D73A 4KF9A 1X5CA 4FYCA 3VPTA 4MH3A 3LFLA 4XS4A 4XHMA 3TOTA 5A4UA 1YQ1A 4NXIA 2VM1A 2VL9A 4GTUA 4J57E 8GSSA 4TR1A 4K0NA 4DSSA 4RUVA 3IDVA 1Z3EA 1TU8A 2A2RA 1PA3A 4PQIA 2E7PA 2C3NA 1PKZA 3HHVA 4TXVA 4OO4A 1PQNA 4AJ6A 2HFDA 3GIXA 3Q19A 1M2AA 1JZDA 1Z7PA 2QSIA 4KE3A 4K9ZA 3ZMLA 5ELGA 3QFBC 1TU7A 4ILFA 4RQRA 4OFTA 2HZEA 1T1VA 3GKMA 4DEJA 3Q18A 1ZYEA 3C73A 1G7OA 1TP9A 1ERWA 1YZXA 5EY6A 3FYGA 4BVXA 2Z9SA 1J08A 3NIVA 3GYKA 4F2IA 1IYHA 4IS0A 1K0NA 5AGYA 5A4VA 2I1UA 1A2MA 1K0CA 2IL3A 3ZYWA 3HYPA 3HXSA 3CBUA 5JCWA 3WGXA 1ZMAA 2DIYA 1ST9A 3IBHA 1NM3A 1TXXA 1MD3A 4ECIA 1A8LA 4PNFA 4I5QA 4NHWA 1B9YC 2OA7A 4OFNA 3C71A 2B1KA 5HQPA 1XWCA 2DIZA 2B7KA 4O92A 4MK3A 3FZ9A 2IMKA 3VWVA 2YANA 2V41A 2AV4A 1OVNA 3DVXA 2H01A 2WJUA 4EKZA 1PKWA 1A8YA 2V2GA 3DEXA 2FD3A 3GA4A 4G9HA 4KSOA 2B7JA 1X9WB 1WJKA 3LQ7A 1XWGA 4KGIA 5BMUA 3APSA 1FO5A 3D0ZA 4E8EA 4PGTA 3TDGA 4LMWA 3F6DA 2P5RA 3R3EA 4HDEA 4JEDA 5HFKA 1BAYA 1TOFA 4PX1A 1PGTA 2XPDA 3IXRA 5H5RA 1QGVA 1QK8A 2VD1A 4PURA 1O8XA 5J9BA 5HR0A 2YCDA 3C8EA 3LXZA 1F9MA 3CYNA 5ECOB 2C3TA 4YAPA 1WRYA 2QKEA 4V2LA 3L9SA 1A23A 5IMZA 2GQLA 1GWCA 3L78A 2L4CA 3M9JA 2YPMA 2B1LA 3VLNA 2EIRA 3G7IA 3RPNA 3UMAA 1YY7A 2LQQA 2FWGA 2FA8A 1DUGA 1ERVA 3HKRA 3I9V2 4TKYA 2YV7A 1RK4A 3QOUA 2WULA 1AIUA 2ON5A 2HSMB 5IO2A 4DVCA 1KEBA 4EDZA 4ZL9A 5ELAA 1XIYA 1R26A 5G5EA 4TRXA 1WIKA 4DSRA 3GTUB 1R7HA 4V1Ag 4IJIA 3RPPA 2LRTA 2GSQA 2YOIA 1U88A 2ZUPA 1VF1A 2YZUA 3FZ5A 18GSA 1KTEA 1TI3A 1A24A 2HNLA 3GSSA 2X8HA 5IQYA 1BQ7A 5LCZA 5IMCA 1A0RP 2MMAA 1UN2A 3U5RE 3UBLA 4ECJA 4ACSA 4NWYA 5DQYA 2DBCA 3E9JB 1Z6MA 3MDKA 1ABAA 1MEKA 5ECLB 4ISDA 2ALBA 4TXOB 2OADA 4MF6A 4IVFA 4ZBDA 5CAXA 2H1GA 5CP1A 1F6MC 2FCHA 2MYGA 4HJ2A 5AN1A 5ECIB 3VWXA 3I6AA 3HVVA 3TJBA 19GSA 2DMMA 1ZL9A 3IV4A 3O76A 4WBJA 5DALB 1X5EA 2LQOA 3KH9A 1GNEA 3EVIA 2CQ9A 4JU5A 3ME8A 3DYRA 5G1LA 2VOCA 2H1AA 2GZYA 4NV2A 3GKNA 4ZBAA 4ML6A 2LEGA 3IA1A 1XOAA 5F05A 6GSTA 5AIXA 4HQZA 4MPFA 1SKSB 5DQSA 3LJRA 3IOSA 4IHUA 3PR8A 3ZFBA 2B3SA 3W6GA 2HRKB 3FR6A 2C0DA 3QR6A 4POBA 5B6MA 2HSHA 2FHEA 3M8NA 1C72A 4GLTA 4MJCA 3IC8A 3MAKA 3TKSC 5COHA 3GRXA 2CVKA 3HVSA 4YQMA 4WF4A 2VIMA 4BPYA 1JLVA 2L6CA 3GKXA 3JCML 1GSUA 3GURA 4G0KA 4KCAA 3WGDA 3LG6A 4G10A 1AC1A 5IMFA 3DMLA 1OC8A 3DD3A 5FWGA 2HSMA 4RI7A 1T4YA 4EF0A 4POMA 3LWAA 4MJEA 2F9SA 5B6NA 1SENA 2X99A 4WR4A 2B6MA 2XBQA 1K3LA 3NOFA 2JZTA 3H79A 3GTUA 1FOVA 5CNWA 2DJ3A 4I2TA 1T3BA 1GUKA 1NHYA 4L5LA 1K0OA 1Z9HA 2VCWA 1G6WA 1XWBA 4XTSA 5FHIA 2H66A 2FLSA 4MMMA 4JR4A 5CRWA 3PINA 1NW2A 4GSTA 3P8WA 11GSA 4BA7A 1NSWA 2CAIA 4EDYA 3C1RA 2R5GA 4G0LA 4MF5A 3LEFA 3KTBA 5G2ZA 3TJJA 3FKFA 4TXOA 1GTBA 1OKTA 4RI6A 2VLTA 17GSA 2LV3A 1O8WA 5DJMA 2V32A 4KDYA 2H1BA 3OR5A 2AB6A 4HOJA 1R4WA 2PVOC 2N5FA 1DSBA 2LNSA 2LJAA 3CTGA 3HJPA 3ZRDA 5DALA 1GSYA 1JZWA 4J2FA 4KAEA 4RQXA 3KM6A 1JZRA 1MD4A 3CXGA 4I8BA 2VL2A 1YEPA 1UVZA 2CX3A 2FY6A 2KLXA 4XRAA 4E8HA 3Q6OA 2LKUA 1B48A 5J4UA 1Z7RA 2AYTA 1CQGA 2DJJA 3P90A 3TUEA 6GSUA 1HNCA 2KUCA 3HY2A 2C4JA 1TW9A 2OJLA 2DMLA 2F8AA 2O87A 4IP1A 3EU4A 1SKRB 1PSQA 3RAZA 4O32A 4K0GA 1I5GA 4MPGA 1YKCA 4WXTA 3FW2A 4GQCA 1SJZA 6GSWA 3HZ8A 5CRDA 2C0EA 1OYJA 2E0QA 5B8BA 1URMA 1H75A 5JWQB 3TJKA 1MDJA 4TOPA 3KIJA 2HI7A 2H19A 2RM6A 1GSEA 4TR0A 1DE1A 3M9KA 1K0MA 1XOBA 6GSSA 2GQMA 4WETA 4GRFA 5H5QA 3SBCA 3TCOA 1TJDA 4GQFA 1FB6A 2B5XA 1HNBA 5B8AA 3CRUA 2FA4A 4ZL7A 1MDKA 2C3QA 3EMPA 3QPMA 3ZIVA 2MMZA 3Q74A 1IYIA 3ERFA 2REMA 2WFCA 1JLWA 1M0UA 1QUWA 5IOXA 2F51A 20GSA 4IN0A 1HD2A 4WKWA 5HR1A 4QQ7A 3KEBA 5J9CA 3UBKA 3GNJA 3MSZA 1T00A 2GT6A 2OACA 4PQHA 1GRXA 4MJAA 4OO5A 5A4WA 3BJ5A 1TK8B 4MF7A 3GUSA 4OWYA 3F63A 2YWIA 4N0ZA 1PL2A 1SL0B 1RW1A 1BX9A 1PX6A 2OBKA 4JBBA 1YEXA 2H6ZA 3G9BA 4HJMA 1ILOA 3CSJA 4BVYA 2X64A 2YJHA 3VFIA 3HZ4A 4OCEA 1HQOA 1GUHA 2IPAA 3D22A 3KGKA 5ECKB 2YN1A 2MZCA 5GSTA 2MMNA 3V1WA 3S9FA 4PNGA 1GLPA 2HSYA 2CT6A 5D96A 1S3AA 3NZNA 3F4RA 3UJ1A 1W89A 1OE8A 1FVJA 4MLYA 2NBSA 3KZQA 10GSA 5CRHA 3EYTA 3KD0A 1VF4A 2HRFA 4O7HA 2GLRA 1J9BA 1VGLA 3C1SA 4NV5A 1XVQA 2EIOA 2FWFA 2JSYA 1THXA 2VUPA 3UARA 2YZHA 4ZIJA 1S3DA 2IFQB 1A2JA 2VCQA 3L0HA 4GXZA 1EWXA 1WE0A 5EL8A 3G7YA 4MP4A 1HYUA 4N11A 3UOMA 7GSSA 2DJ2A 3KCMA 4I97A 3J7Yk 5J3RA 2B5EA 2PVQA 1YF0A 1FW1A 3VK9A 1F37A 1VF2A 3A3TA 5CYYA 1EGRA 2JZRA 1SYXA 1GSSA 3F0IA 4KB3A 3M3MA 3TKSA 4H86A 1JZOA 1B4QA 5DAKB 5ECPB 3LYPA 4LA1A 4YAVA 3KTLA 2XPEA 4NAXA 2GZZA 3FR9A 2A4VA 5D9TA 2TIRA 2HZFA 4AJ7A 2YNXA 2X8GA 1XW6A 4CDOA 2LJRA 1PN9A 2YP6A 5C00A 1YDKA 2MBSA 5E59A 2IMIA 2RUEA 2LRCA 3ME7A 2YJ7A 3J7Yb 2PPTA 1V58A 3FEUA 3IHQA 1GP1A 2CV4A 1MTCA 1ERTA 2LJKA 3GKKA 2C80A 1EZKA 4HQSA 3KH7A 3ZREA 2O89A 5AIVA 4GF0A 2N5AA 5JWRB 5CREA 5E4WA 5JCUA 4OCFA 4NHZA 3IC4A 3BD2A 1V9WA 1OC9B 3D5JA 3LSZA 4K7NA 2ON7A 4WF5A 2EIQA 1K0DA 1SD8A 3PGTA 2P5QA 1ZZYA 1WOUA 4HEA2 1AQVA 5DCGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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