3CRTA

Structural characterization of an engineered allosteric protein
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGCEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme
publication title Using affinity chromatography to engineer and characterize pH-dependent protein switches.
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma japonicum
molecule tags Transferase
total genus 70
structure length 214
sequence length 214
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2008-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3crtA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3crtA01
2JL4A 4HJMA 2PBJA 2VCZA 4MF6A 2AJQB 4KA0A 2B1LA 2P5RA 3E0UA 5COHA 2O89A 4MH2A 3P90A 2LUSA 2AV4A 5B6MA 1MDJA 3GURA 1Z6MA 3CSIA 2OACA 3CTGA 3KGKA 1X5DA 2V1MA 1GLPA 3WGEA 4GTUA 1S3CA 1AUCA 3US3A 3HKRA 1M2BA 1ZCPA 4GQFA 4PXOA 3G9BA 2CZ3A 4WETA 2WDUA 1XIYA 1YZXA 2CX3A 3UL3A 1OVNA 2FWFA 1N8JA 3NIVA 3TKPA 3C1SA 2P5QA 5DQSA 10GSA 1NW2A 4ECIA 1J9BA 5ECOB 4EL1A 1GSUA 3L9UA 3JCML 3HCZA 2O85A 4AJ7A 5ID2B 1H4OA 2VD0A 3FR6A 1XOAA 1ST9A 1B4PA 2H6ZA 2QSIA 4MP4A 3QAWA 5IO2A 2CVDA 1K3YA 4POLA 4WXTA 4V1Ag 2JZSA 2M72A 4N0VA 3FYGA 2R6KA 4CHSA 2CT6A 2YWOA 4O5RA 2YNXA 2ZNMA 3C7MA 3IXRA 1TI3A 4AJ6A 3KH7A 2WGRA 3LGCA 2H1BA 1WJKA 4WBRD 5G31A 3TOUA 1ERTA 2OADA 3ZIVA 4I6XA 2YV9A 1TW9A 4L5LA 1MD4A 1WWJA 2HRKB 3UEMA 2VM1A 4TR1A 2ZUPA 1XW9A 3N5OA 3IK7A 4F0BA 1GUHA 1PA3A 1ABAA 2VL2A 2ZCTA 4MA9A 2F51A 3G7YA 2XPEA 5HR1A 1WPIA 3LFLA 2A4VA 4WEYA 4XRAA 1SK0A 3OR5A 4V1Ap 2HZEB 3HVVA 2AB6A 3GKXA 4XTSA 5IM9A 3TJBA 1Z3EA 3ME8A 2JADA 1ZGNA 2LEGA 5F06A 2VCQA 1X5EA 2H71A 2QC7A 1T3BA 4ZL9A 2FD3A 4GSTA 2KOKA 1I9DA 1QMVA 2DJ3A 14GSA 3ZVJA 5JCUA 2AHEA 1A8YA 2B3SA 2CQ9A 3HD5A 3RHBA 1XZOA 2EIRA 2CVKA 1GP1A 2HLSA 5EL8A 2YANA 4F2IA 2GT5A 4G2EA 3W8JA 5AN1A 19GSA 1Z9HA 3QDNA 3MWHA 4Q5RA 3CXGA 5IOXA 1GSEA 1DE2A 1ERWA 1U87A 4ULXA 1OE7A 3U5RE 1USBA 5IMAA 5JWOB 3GUSA 1T4ZA 3VI7A 5G2ZA 2JZRA 2ES7A 4MH3A 1VF1A 3QOUA 3BD2A 2L4QA 2X8CA 3EU4A 3J7Yb 2L57A 3TRXA 5ECKB 2XC2A 4Q5QA 2AAWA 4FQUA 2C0EA 1KNGA 2K8VA 5CRDA 1UA5A 3IOSA 3O6TA 2E2MA 3EMPA 4ZB9A 2TRCP 5F8BA 3O3TA 4Q5NA 2NBSA 1IYIA 4NPBA 2VL2C 2P31A 2HZFA 3D4TA 3LWAA 4G0LA 3D4MA 2R4VA 12GSA 18GSA 1YF0A 4QL9A 1G7OA 3U6VA 1XVQA 5KN3A 4MMMA 1HD2A 2GTUA 1X9SB 5IMVA 3H1NA 3LYPA 1JHBA 4MZWA 4HOJA 4FO5A 4PNGA 2CAIA 2H0HA 3VPQA 3TB2A 3WT1A 4EUYA 1B4QA 1R7HA 4I5QA 4AF2A 2JACA 1PSQA 5J4UA 2H1AA 4MPGA 4K9ZA 5ENUA 4TR1B 3LG6A 1VF3A 3L9SA 1TI1A 4RUVA 4DSQA 4LL1B 3TJFA 2VCTA 5B8AA 3Q6OA 2DJ0A 1SJIA 1NSWA 2C3TA 2VCXA 3VWUA 4JEDA 2Z9SA 1FG4A 4K1FA 4GLTA 1XOBA 1ZL9A 3IRAA 1GTAA 1MD3A 2LKUA 2X8GA 5AISA 3C71A 3D0ZA 5HR0A 3TKRA 3KM6A 3I9V2 4QL7A 3A2WA 3HVSA 3Q19A 4XCSA 4ECBA 4OFNA 1GSDA 3RHCA 2OKAA 2X8HA 1EOHA 3BCKA 2B1KA 1GTBA 1XW5A 4ZB6A 1OC3A 5INYA 4XIHA 5B7CA 4AJ8A 2HRFA 4I2TA 5JCWA 4HU9A 2LTKA 2O87A 1WIKA 4GF0A 3ZLPA 1PX6A 3AY8A 4ZL7A 1FVJA 2G0FA 1WE0A 1EOGA 2WRTA 5KN2A 4WR4A 3LSZA 2LS5A 3Q18A 2K18A 2GZPA 1TRVA 3EMXA 1BEDA 2BJXA 3TCOA 1QK8A 1U6TA 5G5FA 3VI5A 3IBHA 4EE0A 2DC5A 4POKA 4KGIA 5J41A 3CSHA 3APOA 1SL1B 4MJAA 2LNSA 2I3YA 2NTOA 1YQ1A 3ZFLA 4LL4B 1GSQA 4FIWA 5HR3A 1V9WA 4IVFA 4HU7A 2EIQA 2VUPA 3MDKA 5H5SA 1A2LA 2NPBA 2AUVA 6GSUA 2LV3A 3WGXA 3ZZXA 2H0IA 3CBUA 2B6MA 1R4WA 3ED3A 3TOTA 1K3LA 1ILOA 5H5RA 1XWCA 2RUEA 3ZFBA 2YPMA 2C80A 4ILFA 4KNDA 1SJZA 3GV1A 4LMVA 1HQOA 3CYNA 4IBPA 5L71A 2O8VB 2KLXA 3GA4A 5ECPB 13GSA 1WP0A 2JSYA 4MZBA 3UMAA 2WS2A 1H75A 1ZZYA 3HY2A 5ECNB 4USSA 2GQKA 2PGTA 3ZYWA 1SU9A 6GSSA 2NVLA 3BBYA 3D22A 2HRNA 2I81A 5DVBA 3IR4A 3GSSA 3GMFA 1GL8A 4FYCA 1VF4A 1SL0B 4J2FA 4HQSA 2FY6A 3DKSA 2B5EA 4EKZA 3GL3A 3FZ4A 5JWQB 3NZNA 1OYJA 3A5WA 2EIOA 2GGTA 1SJ6A 2YJHA 3TGZA 4HJ2A 1U3IA 3F3RA 1NM3A 3LYKA 2MYGA 3P8WA 3P2AA 2GQLA 4XS4A 4JR4A 1G6WA 2OBKA 4O32A 4ML1A 3M0FA 5HQPA 4HUAA 1F9MA 2HXKA 4TOPA 1QFNA 1TRWA 4F9ZA 5G5EA 2FLSA 3E9JB 4KW6A 6GSYA 3ZIJA 3IAS2 4L5OA 3TUEA 1M2DA 4WR5A 2H30A 1TRUA 1YEXA 1LU4A 4IN0A 2NDOA 3GX8A 1ZMAA 1EWXA 2ON7A 3UJ1A 3HHVA 3QAGA 4IHUA 2PERA 4ECCA 1HNBA 2FNOA 4BVYA 5D9WA 2DLXA 2B5XA 4BWQA 1PRXA 4HEA2 3NOFA 4YAPA 2JSZA 1K0BA 2GQMA 2FWHA 2HI7A 2XPDA 3D5JA 2I4AA 4L8EA 4ZXGA 3DRNA 2YCDA 2PN8A 4WKWA 5CYYA 4JRRA 4IJIA 3KCMA 3IPZA 4DSSA 4TVEA 3F6FA 2MMNA 4HS1A 5AGYA 3H93A 2IJYA 1M99A 3SBCA 3VPTA 1S3AA 4PQ1A 4N10A 1G6YA 3I6AA 1W89A 4EO3A 2VIMA 3TDGA 3IV4A 2H1DA 4EDYA 4V2MA 1A24A 3M8NA 2OE3A 4GXZA 1SYRA 3H4KA 2K8SA 5IO0A 3HJPA 2YV7A 4IGJA 2FWGA 1HNCA 3ISOA 2TRXA 1DSBA 3R3EA 4H86A 4KAEA 3VLNA 3LXTA 4PX1A 1YY7A 3GYKA 3HVXA 4TW5A 4BL7A 3VWVA 1TKDB 2GSSA 4EXJA 5G1KA 3GKMA 3P7XA 1NHOA 3QFBC 5A5KA 3C1RA 3K8NA 4KCAA 1LBKA 4ZBAA 4MPFA 5G1LA 5CNWA 1TXXA 4YH2A 4F82A 4NHZA 2HE3A 5GSSA 3M9KA 5J9BA 3VFIA 1OKTA 2DMMA 3CRTA 1GSFA 3GTUB 1OAZA 1W4VA 3UVTA 5ECSA 1PKWA 16GSA 3ERGA 5KN1A 2C1YA 2RM5A 1SKRB 1WRYA 1GNWA 3FR3A 4JU5A 3TKSA 4TRXA 2GT6A 3TKSE 5GAND 2IFQA 1EV4A 2GLRA 1X9WB 3PINA 2VD1A 3TJGA 5EPFA 2H66A 5CO3A 3HZ4A 2A2SA 4BPYA 5DCHA 1O8XA 3FHKA 3FY7A 4ZILA 3A3TA 4XS4B 2V6OA 3RPPA 2E2GA 3QMXA 2DJJA 1ERVA 1GUKA 2CV4A 1JZDA 3M1GA 1RW1A 1F37A 4LLRA 4OO4A 3D21A 4I8BA 3F3QA 3UOMA 1HYUA 5CRGA 4MABA 2VCVA 3D6IA 2QGVA 2H8LA 1A2JA 1PL1A 5KN0A 1XPVA 4BVYB 3UBKA 3VWXA 4HZ4A 1A2MA 5HFIA 3QAVA 4KB3A 3KEBA 2IMEA 1SKSB 5ECMB 2M46A 3G7JA 1GTUA 2F8FA 1FO5A 1V57A 4OCEA 1B9YC 4DSSB 2GS3A 1ACVA 5IMZA 3EYTA 2FUG2 1ON4A 3LORA 3F4RA 2LRTA 1G7EA 2E7PA 1GLQA 4F03A 1ZYQB 4IP6A 3ZVJD 4TXVA 1THXA 1X5CA 3MAKA 1Y25A 2IWTA 3F6DA 5DAKA 1IYHA 1AC1A 2D2ZA 1XW6A 2PMTA 4ISDA 3ZMKA 4RI6A 1XCCA 2GVPA 1JZRA 4G9HA 3A2VA 1XBSA 3QCPA 2WB9A 5DBQA 4PNFA 4KSOA 1TRSA 4MZCA 2VLTA 3TKSC 1PKZA 4JZQA 3N9JA 1PN9A 1UC7A 4BL7B 2YWIA 3GHAA 5LCZA 1QUWA 1SD9A 1J08A 2WJUA 1PX7A 2VM2A 2C3QA 2L5LA 4MJBA 3ZTLA 3UBLA 2GZZA 6GSTA 4G19A 3FK8A 4MK3A 3WGDA 4KH7A 4K7OA 2YJ7A 5D9VA 3F63A 4MF7A 2GSQA 3DGQA 4IELA 2C8UA 4I97A 3HDCA 4J57E 4PUFC 1X0RA 1OKDA 2C3NA 3CTFA 1V2AA 1B48A 5H5QA 1FB6A 4MJCA 1TK5B 3FZAA 2CAQA 1XWKA 2FA4A 4ACSA 4Q5FA 3S9FA 1M7TA 4X1UA 3PGTA 2WULA 4HI7A 1AAZA 2IFQB 2LNTA 2N5AA 2VL9A 4OCFA 3CSJA 2OE1A 5JCGA 4KE3A 1BQ7A 2LRNA 2H1GA 1K0DA 3IK9A 2DMLA 5F0GA 1V40A 5IIZA 3RPNA 2OJLA 5DQYA 5EY6A 1FW1A 4NXIA 2MMOA 2K9FA 4K7NA 5J5NA 2K6VA 3GN3A 1FVKA 3O76A 4NHWA 3ZITA 1AW9A 5A4UA 4BA7A 5DJMA 3PR8A 1Q98A 3GNJA 4CW9A 2PPTA 1DBYA 4L0UA 1TTZA 2N5BA 1ERUA 2XBQA 4PUAA 5IMFA 4N11A 1PL2A 5IPHA 3H79A 4NV5A 4K0GA 3KMOA 3HZ8A 4QQ7A 1T8EB 1EV9A 3FRCA 2N5FA 1SYXA 3F0IA 2X99A 1AXDA 5IMDA 5HFGA 2JZTA 2CA8A 6GSXA 1T4YA 3V1WA 2FA8A 3F4SA 2CVBA 2DSAA 4HZ2A 1SK1A 11GSA 2KP1A 1R26A 4OWYA 2MMZA 2O7KA 4MF5A 3CMIA 4KDYA 5HR2A 4OO5A 5G30A 2PVOC 2IPAA 2HNLA 3F4TA 4JBBA 3TRQA 1K0AA 5DAKB 1DE1A 3GL5A 3KIJA 1XVWA 4PURA 2KUCA 2PWJA 5B8BA 2E0QA 1BYEA 1YF1A 4TR3A 2FGXA 3LQ7A 1BG5A 4RQXA 4ZBBA 5AIXA 2R37A 4RQRA 4K0NA 4YQVA 4ML6A 5B6NA 2F9SA 3LEFA 1O8WA 1TJDA 3ZREA 1C72A 3FW2A 4PGTA 4ZBDA 4MJEA 4YAVA 3CRUA 2CX4A 1SKWB 3HYPA 3GSTA 2YZUA 3FZ9A 2F8AA 2J23A 2HFDA 2WCIA 2V6KA 4DSRA 4AGSA 4K2DA 1U3AA 1NHYA 1SD8A 3VK9A 2FCHA 1K0OA 2G2QA 4LMWA 3APSA 3FZ5A 1EEMA 2LRCA 5F07A 1HNAA 5J3RA 3W6GA 1ML6A 7GSSA 5C00A 4IJ3A 1KEBA 4XHMA 5CRHA 2KHPA 1GUMA 2IN3A 3DVXA 1JFUA 1T00A 2IL3A 2RM6A 3GX0A 17GSA 4TR4A 3EE2A 3TKQA 4DVCA 1LJRA 1S3DA 2FWEA 3C8EA 4N0ZA 5ECIB 5FHIA 1Z6NA 6GSVA 2RLIA 5D73A 1EP7A 4K8MA 5ECQB 4WF5A 4OFMA 4KX4A 5A4WA 5DALA 2L6DA 1GULA 4E8HA 4G10A 1U88A 5C04A 3I43A 4YQUA 1O81A 2HSNB 2RIIA 4MDCA 2B7KA 3F8UA 2C0GA 1JZOA 6GSWA 4TXOA 3WYWA 2I9HA 2PUKC 2LJKA 4KCEA 1TDIA 1J0FA 4G0IA 2KP2A 2L6CA 4IQAA 3KMNA 1M0UA 3GH6A 1K0MA 1KBNA 4ZIJA 2H6XA 2WZ9A 3BCIA 3EURA 4PQIA 2LJRA 3G7IA 1FB0A 3ME7A 9GSSA 3TJKA 1G0TA 3IC4A 4KUNA 4BWSA 5ECLB 4NV2A 1Q4JA 1BX9A 1TU7A 3IDVA 1F3BA 3GIXA 3IAM2 4ZL8A 1VRSD 3M3MA 5CREA 5GSTA 1THOA 2YP6A 5KEJA 2WFCA 1TU8A 2OA7A 3VURA 4ECJA 3HXSA 5BMUA 2V41A 5LD0A 2EC4A 2DJ2A 5EVOA 5E59A 1DUGA 2DJKA 1BJXA 1XWGA 3DD3A 2VLUA 4GSNA 4F0CA 5F05A 4KF9A 1MDKA 1MTCA 3BOAA 4K6XA 3DYRA 3IA1A 3M9JA 2LSTA 2V32A 1SL2B 4V2NA 3ZRDA 1M9BA 2HQTA 4P3YB 4NAXA 4WBJA 1K3OA 4L0WA 4IP1A 4K7IA 5CRWA 4XS6A 5GZZB 2C0FA 4O7HA 4IKHA 1R5PA 1A8LA 3WD6A 3MSZA 3QD9A 3DXBA 1GSYA 2L5OA 2MBTA 4E8EA 2MBSA 3KTBA 1QGVA 3A2XA 2H6YA 3RDWA 2IMIA 1BAYA 5HFKA 4FH8A 3J7Yk 1A0FA 3KP8A 2B7JA 2R2JA 2H75A 5D9XA 3DEXA 5IQYA 5GAPD 1M9AA 3GRXA 1EEJA 5DALB 5A4VA 5AIVA 2A2RA 1B9XC 4EDZA 2REMA 4EF0A 2VLVA 1OC9A 3IHQA 3HJOA 4TN8A 2OE0A 3UIWA 3L78A 3IC8A 2H0GA 1WOUA 2XHFA 4TXOB 1ZYEA 2PU9C 2VO4A 1JLWA 1WMJA 1PQNA 2H76A 2FHEA 1O6JA 3PPUA 2HT9A 1OC8A 22GSA 1YJ6A 1T1VA 2H73A 1TOFA 3SWLA 1AQWA 5IOWA 2H19A 4ID0A 2P0GA 4JR6A 1V98A 2LJAA 1AQVA 4CDOA 1QXHA 5E4WA 2ON5A 4IW9A 2AYTA 1GTIA 2DJ1A 3LXZA 2VOCA 3APQA 2IMKA 3EU3A 3FEUA 3GFKA 2GSTA 4GCIA 1O7UA 1Y6EA 2BMXA 5ECRB 4FYBA 1VF2A 5FWGA 4OD7A 3RBTA 1EP8A 1GH2A 1URMA 1MDIA 2VL3A 4N30A 4GWRA 3WT2A 2V2GA 4GSSA 2M80A 2MZCA 4MCUA 2GDRA 1EGRA 3EVIA 4O92A 2BTOT 3IE3A 3LJRA 3HA9A 1QQ2A 4GQCA 1E2YA 5D8IA 5CP1A 5J9CA 1EGOA 2HSMA 3KH9A 1GNEA 2F3MA 3GKNA 5DJLA 1JLVA 8GSSA 4OMVA 1Z7RA 3PH9A 1YDKA 2GZYA 2L59A 2LQOA 2VCWA 2HSYA 4YQMA 1FOVA 2B5YA 1TP9A 5FT3A 2H72A 1UN2A 5ELAA 4D73A 2DIYA 4BVXA 3RAZA 3C73A 4FYUA 2HSHA 4PTSA 3W8SA 2L4CA 4RI7A 2ALBA 3DWVA 5LNKe 2YOIA 1AIUA 3QR6A 4DEJA 2C0DA 1XFLA 2VAFA 2OBIA 4HQZA 2JU5A 2QKEA 2RUFA 1R5AA 3QPMA 5IPGA 1MEKA 2YWNA 4MLYA 1AQXA 5DCGA 3MNGA 3EWLA 1XWAA 3R2QA 3KP9A 1YKAA 3UVHA 3I69A 2UZ8A 1Z7PA 1K0NA 2IMFA 1OE8A 2XBIA 4HDEA 3TRPA 1O73A 1E6BA 1OC9B 1RQMA 3FR9A 1GWCA 3HJMA 4NMUA 5D96A 1YEPA 4X43A 3EINA 1A0RP 1Z5YE 5ID2A 1F2EA 3E3EA 1ZOFA 3L0HA 2X64A 4KDXA 1XWBA 2DBCA 5JWRB 3ZL5A 4G0KA 2YZHA 3H8QA 1SK2A 2GSRA 4J56E 2IMDA 1YKCA 1PD21 2MMAA 4Z7XA 4GRFA 3KXOA 3UAPA 2H70A 3KZQA 4LA1A 4I2UA 3QFAC 1F3AA 5ELGA 3L4NA 3KD0A 3Q74A 3L9VA 2LQQA 3ERFA 5ABRA 2YWMA 3ERWA 4EC0A 1T7PB 1F6MC 3TJJA 5ECHB 4POMA 1JZWA 2R3XA 1I5GA 4NWYA 1K0CA 5D93A 2HRAA 1FHEA 2H01A 4XRDA 3DMLA 1O85A 2HRKA 4KDUA 1M2AA 3BJ5A 4TKYA 4OFTA 3GKKA 1CQHA 1XXUA 5IMCA 1GRXA 1EZKA 4KSMA 4X0XA 4JE1A 3GTUA 2I1UA 1X9MB 2IIYA 4POBA 1V58A 3DIEA 4IS0A 2HSMB 3EC3A 1PMTA 1B8XA 2HZEA 1VGLA 3VWWA 3ZMLA 5CAXA 3FKFA 4ZB8A 1UVZA 2DIZA 2HYXA 3F9UA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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