4BVYA

Crystal structure of the aimp3-mrs n-terminal domain complex
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
211
structure length
211
Chain Sequence
MRLFVSDGVPGCLPVLAAAGRARGRAEVLISTVGPQDCVVPFLTRPKVPVLQLDSGNYLFSTSAICRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEATELQPALSAALYYLVVQGKKGEDVLGSVRRALTHIDHSLSRQNCPFLAGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELSALHSWFQTLSTQEPCQRAAQTVLKQQGVLALRPYLQKQPQPSPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords METHIONINE--TRNA LIGASE, CYTOPLASMIC
publication title Crystal Structure of the Aimp3-Mrs N-Terminal Domain Complex
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Ligase/translation
total genus 59
structure length 211
sequence length 211
ec nomenclature ec 6.1.1.10: Methionine--tRNA ligase.
pdb deposition date 2013-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF18485 GST_N_5 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4bvyA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4bvyA01
4AJ7A 1UN2A 4H86A 2HSNB 4Z7XA 3WT2A 5DQSA 1PD21 1PX7A 4X0XA 1ZYQB 1R26A 1PSQA 1W89A 1T00A 2VM2A 3E3EA 5GSTA 1HQOA 2XBIA 1PKZA 1JZRA 4KNDA 3LORA 5F07A 4BVXA 3P2AA 1S3AA 5ELAA 2DJ1A 2VL2A 1UVZA 3MNGA 2WFCA 4ZILA 1MD3A 4K6XA 3EMPA 4MJAA 1TTZA 4QQ7A 5BMUA 4D73B 1K0OA 1SJZA 3LQ7A 2I4AA 2HSHA 1FG4A 1YY7A 4G2EA 3TJFA 3GRXA 2B3SA 2C0GA 5G1KA 4XRDA 2IWTA 1TK0B 2JSYA 2E7PA 8GSSA 5IPHA 5AIVA 4G0IA 4EKZA 4XS6A 2BMXA 1IYIA 4L0WA 3RHCA 2K9FA 2X8CA 3QCPA 2FGXA 5CRGA 1S3DA 1Z6NA 4MMMA 3W6GA 1VGLA 3KM6A 1YQ1A 3A2VA 3UMAA 2HYXA 4AJ6A 2B6MA 5IMFA 2O85A 3D0ZA 1X9MB 2H72A 1B9YC 4IKHA 2H70A 2FA4A 2VO4A 3ED3A 2C0EA 3DMLA 2GDRA 4MLYA 4WETA 2P0GA 1O7UA 4MP4A 4MF5A 1MDKA 4KUNA 2HT9A 1W4VA 4OMVA 2XC2A 2KOKA 1TI1A 3IV4A 5HQPA 2HFDA 4V1Ag 4PNGA 1PGTA 2FWFA 1JFUA 4LL4B 2LUSA 3D21A 4JRRA 2H76A 2NDOA 1KTEA 2NBSA 3Q19A 4PX1A 1TI3A 2WRTA 3J7Yb 3KXOA 3P90A 1OE8A 2C8UA 2O7KA 1ZYEA 1R5AA 3L4NA 2K6VA 5E4WA 1GL8A 2CVBA 4GXZA 4MF7A 2IFQB 2AB6A 1M9BA 2YCDA 1O8XA 5KN2A 1TRUA 4BPYA 2VCTA 2VCQA 2H19A 4LMVA 4ZB9A 2GQLA 1VF4A 4IELA 2L59A 3A5WA 3LEFA 2YZHA 2UZ8A 5IMDA 5COHA 2JZRA 2AUVA 3HA9A 1XBSA 2L57A 1U88A 4K0NA 3MDKA 4GTUA 13GSA 3F0IA 2VLUA 1F6MC 1F3BA 2H30A 2GGTA 5CO3A 1A2JA 3ZMKA 4IW9A 4TR3A 5GSSA 1BJXA 4N11A 5LD0A 2FA8A 1DSBA 3H4KA 1M2BA 3ZITA 1HNCA 2HRFA 3C1RA 4ZBBA 3WYWA 1TRVA 2FWEA 3TOUA 2FNOA 4TR1A 3WGDA 4RQRA 2DJJA 5A5KA 4TW5A 5HFGA 2C3TA 2C3NA 5A4UA 2LQOA 1SK2A 1TP9A 2V32A 3DVWA 1A8LA 3TKQA 2V1MA 3HJMA 3HZ4A 1U3IA 1T1VA 4MCUA 2PU9C 3FR6A 3KP8A 2LTKA 4XS4B 1QQ2A 3ZL5A 3L78A 3L9UA 1U6TA 1OAZA 2CZ2A 2O89A 1A2MA 3CSJA 1G6WA 1QGVA 6GSVA 3LYKA 1FVKA 3D5JA 2HSMA 2IJYA 2VM1A 1IYHA 1F3AA 2GSSA 2LJRA 1AIUA 1TXXA 4HZ4A 5GAND 5DJMA 1XWBA 2VUPA 2HZFA 3HDCA 4XRAA 1GSSA 3E9JB 1ZL9A 1XWCA 5ECHB 5D9VA 3BJ5A 3GSSA 4OWYA 1OE7A 1ZGNA 3KTLA 3IAS2 4MZBA 4HJ2A 4BA7A 1PMTA 3JCML 3U5RE 3GKMA 1X9SB 3Q6OA 4QL9A 2CA8A 1B4QA 4K2DA 4WBJA 3KEBA 1JLVA 3KP9A 3HJOA 2YV7A 2C4JA 2QSIA 4YQVA 2OBIA 2M80A 1GSQA 1OVNA 3M9JA 2I1UA 1XW5A 1EEJA 2YWOA 4MH3A 4BVYB 5DDLA 3KJYA 1GUMA 3GNJA 1VF2A 2YJ7A 4Q5NA 5FWGA 2H6YA 4ZL8A 3F6DA 3H8QA 3HVVA 1EGOA 1F37A 1I5GA 2GZZA 2DJ3A 2L6CA 4D73A 6GSYA 3GV1A 4KA0A 2X8GA 4IVFA 4ECIA 4HJMA 2HI7A 2KP1A 4JR4A 1OC8A 3R3EA 2I9HA 5EL8A 3QFBC 3C1SA 5DAKB 1M2DA 4J56E 1XIYA 4WXTA 1XCCA 2JZSA 1GUHA 2L5OA 1M0UA 4PQIA 4NXIA 1YZXA 1FOVA 4IP1A 4NMUA 3TRPA 3GL5A 4GSNA 2HLSA 3WD6A 2VAFA 4NV5A 2IN3A 4FQUA 1GTAA 4KSMA 3C71A 1O8WA 3HD5A 2LEGA 4EUYA 4MZWA 3TOTA 3WT1A 2AAWA 1A24A 3DGQA 3RPNA 3FZ5A 1FB6A 2VL3A 3APQA 4BL7B 3LGCA 1SENA 3KIJA 3F4TA 3GUSA 1H4OA 5JWQB 3EWLA 4K8MA 3Q18A 2YWIA 3GN3A 2XPDA 3GL3A 1SD8A 1K0BA 1T3BA 5B8BA 1MEKA 1HYUA 2GVPA 4Q5QA 2C0FA 4OCEA 3W8SA 2MMOA 2F8FA 2MMAA 2H66A 2B7KA 1X5CA 2H0HA 2IFQA 3I9V2 5AN1A 5HR3A 5DVBA 1YF1A 3ZMLA 5H5RA 1A0RP 4WR5A 4I8BA 4PUAA 1FVJA 2KP2A 2KLXA 4F9ZA 3ZIVA 4JR6A 5KEJA 4WKWA 1OKTA 3IDVA 5E59A 4XCSA 2OE0A 3IOSA 1ST9A 2BTOT 5HFKA 3F3QA 4PGTA 1JHBA 4TXOB 4JBBA 3HXSA 3QD9A 6GSXA 3CSHA 5AGYA 5F06A 2N5AA 1GSUA 2IMEA 4KCEA 1PX6A 4KF9A 1USBA 1TKDB 4PTSA 5D93A 2H0GA 1XXUA 5A4VA 4WF4A 1J9BA 5CRDA 2VD1A 1B9XC 3P8WA 1K0DA 1YEXA 3IHQA 4N10A 2R3XA 2NTOA 1B8XA 4CHSA 3I69A 5D73A 3CMIA 2WJUA 3LWAA 1GSEA 2H71A 4OO5A 1B4PA 1VF3A 1ZMAA 5AISA 3NOFA 2CAIA 5CREA 5ELGA 1CQGA 4G0LA 4KDUA 1WJKA 2RLIA 3Q74A 2E0QA 1YF0A 1S3CA 2ZNMA 3BD2A 3J7Yk 1SL2B 1PL2A 3FKFA 1DE1A 3KD0A 1V58A 1TRSA 5B6MA 4FYBA 3G7YA 1UC7A 5LNKe 3CYNA 4FYCA 4KX4A 1K0AA 3VWWA 1AUCA 5EVOA 3SBCA 2H8LA 1EP8A 2QKEA 2IL3A 16GSA 3KMNA 5J41A 3GKNA 2H01A 1GSDA 2OADA 3RBTA 4WEYA 2REMA 4POMA 4EL1A 1YKAA 3ZYWA 4F2IA 3QPMA 3EU4A 5ECQB 2RUEA 4I6XA 1G7EA 2VLVA 1R4WA 4YAPA 2GSRA 3VPQA 5IMCA 2DMMA 4RI7A 5HR2A 1KNGA 4DSSB 1GTBA 1J0FA 2K8SA 2AV4A 1THOA 1V9WA 2L6DA 1AXDA 4K7NA 1T8EB 3DRNA 2CX3A 2LNTA 4CW9A 5J5NA 3GFKA 3RPPA 4ML6A 5IMVA 3KMOA 2PN8A 1A0FA 1XW9A 1Y6EA 3HKRA 2TIRA 1GWCA 1Z9HA 2VCXA 1EP7A 5LCZA 4GQCA 1LU4A 3ZVJD 2DLXA 3H93A 3IR4A 3IRAA 1TU7A 3FZ9A 2HZEB 3GH9A 3D22A 3QFAC 3LXZA 5IIZA 1ERVA 1M9AA 1GTUA 2WDUA 2R2JA 2R5GA 5IPGA 4GCIA 3KZQA 1HNAA 1TK8B 5DAKA 2H6ZA 1B48A 4L8EA 4AGSA 3BCKA 3HZ8A 4JZQA 5JWRB 3NZNA 14GSA 3TKRA 3QMXA 2L4CA 2B5EA 2PUKC 4GLTA 2GQKA 2G0FA 4MDCA 4Q5FA 4GWRA 1BX9A 4YAVA 3RDWA 5HR1A 3RAZA 5IMAA 3KCMA 2E2GA 4OFMA 3APSA 3I43A 3VLNA 4LMWA 3GMFA 2HRKB 5B6NA 1CQHA 3DEXA 1E6BA 4BL7A 5IOWA 3D6IA 3AY8A 4JEDA 2H6XA 3UAPA 3DD3A 3IXRA 4L5LA 1WPIA 3ERWA 1OC9B 4G9HA 2X64A 4AJ8A 1H75A 1N8JA 4OFTA 1WOUA 1TRWA 3H1NA 3I6AA 1AQWA 5ID2B 1MTCA 3N5OA 2YOIA 2Z9SA 5L71A 1LJRA 3N9JA 2CVDA 1R7HA 3FEUA 2HRNA 5FHIA 1OKDA 3V1WA 2IMFA 4WR4A 1RW1A 4MA9A 1GP1A 3FK8A 1PKWA 1MDIA 4OCFA 1O6JA 1DBYA 5D96A 4TKYA 3GURA 2WZ9A 2LJAA 2OJLA 2RM6A 3M9KA 3TB2A 5J9BA 1Z5YE 3GSTA 5ECSA 4XHMA 4L0UA 4G10A 4X1UA 2QC7A 1URMA 12GSA 3F8UA 3F6FA 3G7JA 3LSZA 3APOA 4ECBA 4TXOA 4HU9A 1EWXA 3LG6A 2N5BA 4ZL7A 1T4YA 2LSTA 2YNXA 2YJHA 4K1FA 1WIKA 3KH9A 3CBUA 1XVQA 3GA4A 5DALB 1XFLA 2XBQA 5F05A 4KW6A 1V98A 1T4ZA 3L0HA 4I97A 3GHAA 2DSAA 4LLRA 4OD7A 5J9CA 1KBNA 2HRAA 1EV9A 2H73A 3TKPA 4HU7A 5INYA 5FT3A 4I5QA 4DVCA 1BEDA 4HOJA 2K18A 2BJXA 3GTUB 3GIXA 3BOAA 2GQMA 4J57E 4FYUA 4TXVA 2FLSA 2GLRA 1WP0A 1XPVA 4V1Ap 2EIRA 6GSSA 3UBKA 2CAQA 4MABA 2EIOA 2B1LA 2IMKA 3H79A 2AYTA 5J4UA 2WCIA 2QGVA 2OA7A 3MWHA 1XVWA 4MJBA 2R6KA 5B7CA 2C80A 3WGXA 3D4MA 2RUFA 1WRYA 4V2NA 3FZ4A 1Z3EA 1TU8A 5G5FA 2O8VB 2GZPA 1QUWA 1BYEA 1SK1A 2ES7A 1GNEA 1JZWA 4PNFA 2FCHA 4RQXA 1G7OA 5ECPB 5KN3A 1GULA 5C00A 3PPUA 2VCZA 4E8HA 1SK0A 4XS1A 1GSYA 2GZYA 4POBA 3FRCA 1XWKA 3FR9A 5G30A 4GSTA 4DEJA 5JCWA 1ACVA 1FAAA 3CRTA 19GSA 4DSSA 2VL9A 1Q98A 5KN0A 4JU5A 2I3YA 3EURA 3ZIJA 2CZ3A 2LJKA 4I2UA 1XZOA 1M2AA 1A2LA 5IOXA 4HQZA 1V2AA 2P5QA 1PRXA 4GF0A 1GLQA 1K0MA 2VLTA 3MSZA 2ZUPA 3ZRDA 4N0VA 3KTBA 4YQMA 2HZEA 2PGTA 1AQVA 2HXKA 3HVSA 3R2QA 1ZZYA 3ZTLA 3ME8A 6GSUA 3IC4A 3UBLA 1BG5A 2ZCTA 3F3RA 2GS3A 4TVEA 4J2FA 3F4SA 4PXOA 5ECMB 1N2AA 2PVOC 3IK9A 1PL1A 1OYJA 3TGZA 4TN8A 2P31A 2C3QA 2H0IA 4ILFA 2AHEA 4KSOA 1Z7PA 4USSA 3W8JA 4MPFA 1XOBA 3BCIA 5ECNB 4JE1A 5KN1A 3IAM2 4HS1A 4AF2A 6GSTA 2PBJA 2GSTA 4IJIA 2KHPA 2IPAA 2HRKA 3VFIA 4IS0A 1THXA 4HUAA 3EU3A 2VOCA 1SL1B 2HSYA 4TOPA 4FH8A 5DJLA 2YPMA 4RI6A 2OKAA 4OO4A 3L9SA 5ECRB 1X9WB 4NHWA 3UARA 1PQNA 2DBCA 3FW2A 2RIIA 2GTUA 4RUVA 1SYRA 2NPBA 2HE3A 1OC9A 4YQUA 3A3TA 3DWVA 1GSFA 1G0TA 1TOFA 2CVKA 1SKSB 2ON5A 1FW1A 3VWUA 3G9BA 2H74A 4MK3A 2FY6A 2G2QA 5ID2A 4EDZA 3PR8A 1QFNA 2V41A 3HCZA 4KCAA 4TR0A 2HNLA 5JCGA 2HQTA 2LRCA 3OR5A 1I9DA 1TW9A 1AW9A 4N0ZA 2LKUA 4V2MA 3EVIA 1A8YA 4XS4A 1TJDA 3ERGA 4HEA2 3UVHA 3DVXA 3DKSA 1G6YA 2DIYA 2FWHA 3TKSC 4MJEA 1X5DA 5D9WA 17GSA 4WBRD 1EZKA 5IO0A 1NM3A 5AIXA 1ABAA 1F2EA 3VK9A 3FR3A 5JCUA 3IK7A 2C0DA 1ML6A 3CSIA 2NVLA 1YEPA 5IQYA 3UEMA 1T7PB 1DUGA 3EINA 1SKWB 1PN9A 3ISOA 2AJQB 5DCGA 2D2ZA 2IIYA 5IO2A 2GT5A 2WGRA 5DALA 4I2TA 2KUCA 4ML1A 2YP6A 4FO5A 4LA1A 2LQQA 4ACSA 3LFLA 1QXHA 4IN0A 2LV3A 4BWQA 2A4VA 3ME7A 2J9HA 4MZCA 3G7IA 5EY6A 1YJ6A 1BQ7A 4X43A 2DMLA 4ZBAA 1EOGA 2OBKA 3M1GA 1ON4A 1ZOFA 5DCHA 2ALBA 3GTUA 1MD4A 4BVYA 1Z6MA 4E8EA 2DC5A 1BAYA 1AAZA 2DIZA 1XWAA 5B8AA 4FIWA 1GNWA 2XHFA 6GSWA 2EIQA 4F03A 2F9SA 3O6TA 1HD2A 4NWYA 3IA1A 2VCWA 3IE3A 1OC3A 1X0RA 2YN1A 1ERUA 4POKA 3HVXA 3F63A 3QAWA 1U3AA 2XPEA 4O7HA 3EYTA 3TKSE 2M72A 1GLPA 2WULA 4KDYA 4GQFA 1O73A 3O76A 1NW2A 5HR0A 2OE1A 1VRSD 5D9XA 3DIEA 4CDOA 1WE0A 3ZFLA 2YZUA 3FHKA 3HHVA 4EXJA 4HQSA 3HYPA 3TUEA 3LJRA 4MJCA 2PPTA 3VURA 3BBYA 3IPZA 2TRCP 2MBSA 1AC1A 4G19A 5H5QA 2L4QA 3FYGA 5ECIB 5JWOB 1XOAA 4IQAA 1ERWA 2FD3A 5G2ZA 4HZ2A 1JZOA 3UIWA 4DSQA 3C7MA 1E2YA 3M0FA 3GKKA 3CTGA 1FHEA 2H1AA 3P7XA 2JACA 2YWMA 2CT6A 2N5FA 5DBQA 1NHYA 5F0GA 5CRWA 1Y25A 2YANA 5EPFA 4HI7A 3TJJA 3CRUA 2J23A 4MPGA 4NAXA 5CYYA 1GH2A 2OACA 2CV4A 1GRXA 3M3MA 5IMZA 1O85A 3GX0A 2VIMA 3TJBA 3TRXA 4LL1B 4O5RA 4TR4A 4L5OA 4IQ1A 1FO5A 4EE0A 2PMTA 1VF1A 4POLA 3PGTA 3L9VA 3EE2A 2I81A 1Z7RA 4BVXB 1C72A 4EC0A 2CX4A 3SWLA 3UVTA 4GSSA 1MDJA 1NSWA 2A2SA 1QMVA 1K3OA 1ILOA 2IMIA 3UJ1A 4EF0A 5HFIA 2B5YA 4N30A 3O3TA 4ZB8A 1J08A 1SJ6A 2V2GA 7GSSA 3FZAA 4MF6A 2WB9A 9GSSA 2H75A 2GT6A 5D9TA 4F0BA 1V57A 3ZREA 4KGIA 5G5EA 2VL2C 1R5PA 3C8EA 2DJ2A 1TDIA 3ZFBA 4F0CA 4KH7A 5ECKB 2EC4A 3GKXA 2LRNA 5ECLB 2PERA 4P3YB 5IM9A 2MZCA 1K0NA 2DJKA 3ZLPA 2MBTA 4NHZA 2B1KA 3QAGA 1JLWA 1SJIA 4ZL9A 2H1DA 1A23A 3ZZXA 1DE2A 3QOUA 2L5LA 1RK4A 1TK5B 5J3RA 3TKSA 1F9MA 1YDKA 4PURA 2JSZA 4ZBDA 2DJ0A 2V6OA 4KDXA 4WF5A 1XWGA 1EV4A 2B5XA 4NV2A 1SL0B 22GSA 4ID0A 1M7TA 4EO3A 4IGJA 4KE3A 2JU5A 2YWNA 3CXGA 3DXBA 4ULXA 4ZIJA 2JADA 2RM5A 4IBPA 3EMXA 3PH9A 5CP1A 3QAVA 2B7JA 1AQXA 1EEMA 4O32A 3KGKA 4V2LA 3CTFA 3IC8A 2O87A 3EC3A 2A2RA 4XTSA 2LS5A 5ABRA 2GSQA 4G0KA 5A4WA 1QK8A 2IMDA 2X8HA 3LXTA 4BWSA 1YKCA 3DYRA 1SKRB 4TRXA 3US3A 4K7OA 5GZZB 4PUFC 2V6KA 3U6VA 2FWGA 3A2WA 2VD0A 18GSA 4QL7A 3GH6A 3VWXA 3TDGA 3HY2A 2PWJA 1U87A 3E0UA 1K0CA 2F51A 3WGEA 1SU9A 4NPBA 2E2MA 3UL3A 3ERFA 1EOHA 1SD9A 2CQ9A 3F9UA 2YV9A 2JZTA 2FUG2 1KEBA 3C73A 4EVMA 1RQMA 5CRHA 4ZXGA 2H1BA 3M8NA 4OFNA 5G1LA 1EGRA 1M99A 1JZDA 2F3MA 1ZCPA 2FHEA 4ECJA 3NIVA 2MMNA 4XIHA 2R4VA 3TJGA 4TR1B 1GTIA 3TCOA 1XW6A 2JL4A 1Q4JA 3LYPA 2P5RA 3QDNA 4PQHA 3FY7A 5H5SA 2M46A 5C04A 1O81A 3TRQA 3PINA 2PVQA 1HNBA 10GSA 3F4RA 3ZVJA 2MYGA 2TRXA 5GAPD 3HJPA 3D4TA 2K8VA 1LBKA 1K3YA 2WS2A 1NHOA 2X99A 4MH2A 3KH7A 4IJ3A 4O92A 5ENUA 4GRFA 4ECCA 2C1YA 4IHUA 2H1GA 1WWJA 20GSA 2F8AA 4EDYA 4KAEA 1WMJA 4HDEA 3K8NA 5DQYA 5ECOB 3GX8A 1K3LA 2ON7A 2LRTA 2HSMB 3A2XA 3IBHA 4DSRA 4YH2A 4F82A 2LNSA 1V40A 3VI7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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