3IR4A

1.2 angstrom crystal structure of the glutaredoxin 2 (grxb) from salmonella typhimurium in complex with glutathione
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
SNAMKLYIYDHCPFCVKARMIFGLKNIPVELNVLQNDDEATPTRMIGQKMVPILQKDDSRYLPESMDIVHYVDNLDGKPLLTGKRNPAIEEWLRKVNGYVNQLLLPRFAKSAFDEFSTPAARQYFIRKKEASSGSFDNHLAHSAGLIKKIGDDLRLLDKLIVQPNAVNGELSEDDIHLFPLLRNLTLVAGIHWPTKVADYRDNMAKQTQINLLSSMAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glutaredoxin 2
publication title 1.2 Angstrom Crystal Structure of the Glutaredoxin 2 (grxB) from Salmonella typhimurium in complex with Glutathione.
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule tags Oxidoreductase
total genus 79
structure length 218
sequence length 218
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04399 Glutaredoxin2_C Glutaredoxin 2, C terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3ir4A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ir4A01
1OC8A 1TI3A 4IGJA 2ZCTA 4JE1A 2X64A 1AQXA 4CW9A 1EV9A 2LJKA 5F06A 4X0XA 1OVNA 4RUVA 1AW9A 3A2VA 3I9V2 5AISA 2VCQA 3EE2A 1OE7A 4HS1A 4XS6A 1G0TA 1EV4A 3UJ1A 1QUWA 1TRSA 1U3IA 3F8UA 4KB3A 5KN2A 5DQYA 3DKSA 2LRCA 2ZUPA 4BA7A 4HQSA 1VRSD 2LS5A 4IVFA 5J9BA 2FWGA 2GGTA 2YP6A 5B6NA 3J7Yk 4NHZA 2B7KA 3TRPA 2LEGA 4USSA 1GWCA 2H1AA 3GTUB 3GX0A 3D4MA 2E0QA 5IMZA 4P3YB 3GNJA 4K7IA 2VLTA 4PTSA 2PVQA 5B8AA 3BJ5A 1GTIA 4KCEA 1GNWA 2M80A 2HSNB 1OC3A 5IMFA 4MABA 1TK5B 20GSA 1M2BA 4TOPA 3Q6OA 1WIKA 1Z6NA 2I3YA 1G6WA 3M9JA 2DC5A 3EWLA 4ZBBA 1SK2A 3ISOA 2AJQB 3BOAA 1TW9A 4KGIA 1GRXA 4MH2A 1XXUA 4TW5A 2I81A 4EXJA 5CAXA 4V2LA 3TKSA 4MZCA 9GSSA 4O5RA 1USBA 3LSZA 3GH6A 5HFKA 1K3YA 17GSA 2RUFA 4EKZA 1WJKA 2LJRA 1GULA 1R7HA 2V6OA 3K8NA 3GYKA 4PUAA 2IPAA 3FZ9A 4G0IA 2EC4A 3GURA 2QSIA 3ZFBA 3CTGA 5F0GA 3NOFA 1XWCA 2WS2A 4MF7A 2JZSA 1K0BA 1SL0B 2LRNA 3O76A 1OKDA 1MD3A 3EU4A 4LLRA 3ME8A 4KCAA 3VWVA 5GAND 2AYTA 2WULA 4OO4A 3C7MA 1A0FA 2H72A 4KE3A 2R6KA 4E8HA 1U88A 3P2AA 3BD2A 19GSA 4G10A 1YDKA 2QC7A 2EIRA 2H76A 1HYUA 3TUEA 4N0ZA 5CYYA 1PA3A 1M9AA 3LQ7A 2K6VA 4LL4B 3VWXA 1SD9A 1LU4A 2PPTA 2WGRA 3US3A 4DSRA 4HZ4A 3EMXA 4PQ1A 1FVKA 3TGZA 4RQXA 2B1LA 2GSRA 2JZTA 1KBNA 2E2MA 2IFQB 3KP9A 5CNWA 1JZOA 3WD6A 3IV4A 1O8WA 3LYKA 4ISDA 3TDGA 4MF5A 2L4CA 1Y25A 2XPDA 10GSA 5DVBA 2ZNMA 2L5LA 4FYCA 4NMUA 1QXHA 1E2YA 2HZFA 5JCGA 14GSA 4BVXA 4IJ3A 2C8UA 2FA8A 1YZXA 3KD0A 3FZAA 5FHIA 1A8LA 3CRTA 3H1NA 3QD9A 5A5KA 4IP1A 4JU5A 4DVCA 2YWOA 2H71A 3UVTA 2PU9C 3ZITA 2X99A 2HRFA 5IPHA 3N5OA 4ULXA 1WOUA 4E8EA 1UN2A 2KOKA 1M2DA 2B5EA 5ECKB 1FB6A 2GZPA 1ABAA 2XHFA 3LORA 1QQ2A 1I9DA 3IHQA 1SL2B 3VWWA 2I4AA 1SKWB 1U87A 1AAZA 2VCXA 2R4VA 2B6MA 1TU8A 3RHCA 5D9TA 1W89A 3G9BA 3IE3A 3WGDA 3U5RE 2VD1A 1XWBA 3TRXA 2OJLA 1DE1A 2MBSA 3F63A 4KDXA 4WBJA 2B7JA 2WCIA 1LJRA 4EDZA 2YWMA 2WJUA 4FQUA 5JCWA 2E7PA 2GSQA 1N2AA 5LD0A 3CMIA 4J2FA 1ST9A 3TB2A 3UVHA 3GSSA 3DYRA 4WXTA 2R5GA 2DJ2A 1SYXA 2N5FA 3VFIA 5CO3A 5GSTA 2JACA 2H73A 2FWHA 2GVPA 5J9CA 4GLTA 1O6JA 3F6FA 1FW1A 3LWAA 3ZREA 5JWOB 4I6XA 4YQVA 3VI7A 1ZZYA 1EZKA 3APQA 3IOSA 4DSSB 2P31A 1RK4A 3C1SA 2E2GA 5G1KA 3F4TA 4ZL7A 3BCIA 3MWHA 4WBRD 4PXOA 2GT6A 2OBKA 3IPZA 4KF9A 4NV2A 4XIHA 2K18A 2HT9A 2WRTA 1T7PB 1K3OA 3ZMKA 4HQZA 4RI6A 1PL1A 2LKUA 1TOFA 1GLPA 3CSIA 4EVMA 2H1DA 1A23A 4IELA 2PERA 1XOAA 3OR5A 1M2AA 2FNOA 3CTFA 3TKSC 1YEXA 4BVXB 1MDIA 3CSHA 5D73A 7GSSA 4JR6A 3A3TA 1R5AA 3W8JA 5D8IA 3L9UA 1DUGA 2K8VA 3H79A 1I5GA 1SJIA 2WDUA 5IOWA 3HJOA 2VM1A 2VO4A 4KA0A 3WT2A 2RUEA 3EU3A 2P5QA 1R4WA 3TOTA 3MDKA 4BWQA 3D6IA 1SJZA 1G6YA 2HYXA 1ZMAA 4KDYA 1GNEA 1KNGA 1XIYA 3KCMA 5CRWA 4WR4A 5ELAA 3KTLA 1FG4A 2B1KA 2LQQA 4GSTA 1K0CA 1PKZA 3KZQA 4OD7A 4K7NA 2IWTA 2MYGA 3TKQA 4GXZA 3ZMLA 5DCHA 5HQPA 2X8CA 2B5XA 2OE3A 3A2XA 2HXKA 4OCFA 4NXIA 5H5SA 2DJ0A 1SKSB 2CAIA 3F9UA 2AHEA 1XPVA 4WKWA 2H0HA 3HJMA 5FWGA 1V9WA 2YANA 5DCGA 4F9ZA 4L0UA 1WPIA 2YJHA 2M72A 2C3NA 2V2GA 4JBBA 4MLYA 4JR4A 4LMVA 5HFIA 1T3BA 1VF1A 1F3AA 3HY2A 1YF1A 2V6KA 1SENA 5CRHA 4ILFA 2ON5A 2YCDA 2GQLA 1PSQA 16GSA 4OO5A 1X9SB 5ECHB 4V1Ap 2C4JA 4PGTA 1GSYA 1ZYQB 3HJPA 4HUAA 1ZOFA 3FZ5A 1K0AA 3TCOA 4WR5A 4AGSA 1ERTA 1OKTA 3L0HA 1GLQA 3C1RA 4GQFA 3IAS2 1V2AA 3TOUA 1K0DA 4Q5RA 1TJDA 1T1VA 3RAZA 4PURA 1AIUA 1X9WB 5HR2A 1EGRA 2PVOC 2V32A 1V98A 3JCML 2R3XA 3GKKA 2AAWA 2EIOA 1ERUA 1X5DA 3G7IA 1G7EA 1XCCA 4KNDA 5G5FA 3FY7A 5KN1A 3PPUA 1XFLA 5J5NA 3GA4A 5ECIB 4GRFA 3QAVA 3R2QA 1O81A 2PUKC 2FWFA 3KXOA 2OKAA 1N8JA 2N5AA 2IN3A 3I43A 3UBKA 4YAVA 2L59A 1WMJA 3ZL5A 3GN3A 3HZ8A 4KDUA 1PN9A 4Z7XA 2ALBA 2FWEA 3CRUA 2MMZA 3DMLA 4MZWA 1EWXA 3O3TA 1QGVA 3NZNA 3F3RA 1YF0A 3GSTA 4ECCA 1PX7A 1SD8A 1TXXA 12GSA 2J9HA 5DALA 1JZRA 3E0UA 3V1WA 1YJ6A 4D73A 2KLXA 2TIRA 1SK0A 1A2MA 4WEYA 4MJCA 4YQMA 5G2ZA 2IIYA 1ERWA 1HNBA 4ZB9A 4G0KA 6GSTA 1VGLA 4ECJA 3ZTLA 1A2JA 1ERVA 4IP6A 2G2QA 5HR3A 4JRRA 4QL9A 2H66A 4ZL8A 2YWIA 1TKDB 2CT6A 4O92A 3IXRA 4WF5A 4IBPA 4YAPA 3C8EA 2R2JA 2VLVA 3IC8A 3M8NA 3KM6A 4DEJA 6GSXA 1XWKA 2VUPA 2FUG2 2YOIA 3UEMA 1VF4A 3CSJA 1MTCA 5F05A 4OFMA 1O73A 4DSSA 1B8XA 1T4YA 3FYGA 3GV1A 4K0NA 4AF2A 2V1MA 1W4VA 1BJXA 1SJ6A 1GTUA 4GWRA 3QAWA 5ECNB 4XTSA 1T4ZA 4IQAA 3VURA 1XVWA 1X9MB 4FO5A 1K0OA 1F3BA 5DAKA 2DJJA 4NWYA 4NPBA 2OA7A 2B3SA 5IPGA 1B4PA 3S9FA 1NW2A 3U6VA 2K8SA 5J4UA 4BPYA 5GAPD 1ACVA 2H30A 5JCUA 3GKNA 1AQVA 4HJ2A 1LBKA 2KP2A 2QKEA 2IJYA 3LJRA 1YKCA 1GTAA 3CXGA 4ZB8A 5ABRA 2H1GA 5ECPB 4PNFA 5ECOB 4ML1A 2PBJA 2YPMA 4IKHA 4IS0A 3P8WA 2XC2A 3DEXA 3ME7A 5ENUA 2FGXA 3F6DA 3GKXA 2GQMA 5E59A 4POBA 3BBYA 4HU7A 3IDVA 3RHBA 1XZOA 2OBIA 4MJAA 1OC9A 4ZBDA 3I6AA 1Z3EA 2MMNA 3ERWA 4K0GA 3D0ZA 3UAPA 1M0UA 2LNTA 1XWGA 2ON7A 4ECBA 1ZL9A 3O6TA 3DVWA 2A2SA 2CA8A 2DBCA 5HR1A 2FY6A 2UZ8A 2HE3A 1TRVA 1OE8A 5GZZB 3KTBA 1O7UA 1IYHA 1GSUA 4ZBAA 3TJGA 3KH9A 4KUNA 2CV4A 2C0DA 3F3QA 5ELGA 5DBQA 3TKPA 2YWNA 2A2RA 5EL8A 2YZHA 2BJXA 2C3TA 1SKRB 2DIYA 4XCSA 1F2EA 5DALB 1MDKA 2C0GA 1X5EA 3UOMA 1HNCA 4BL7A 4D73B 4K1FA 3ZIJA 2GS3A 1GUHA 1Z5YE 1MD4A 2FD3A 3KP8A 3GIXA 3N9JA 3M1GA 4TR0A 3FR6A 5AIXA 2MMAA 3LXZA 4GQCA 3LYPA 3W8SA 2KP1A 1GSSA 2VLUA 5CRDA 4I2UA 3DVXA 3GL5A 2B5YA 2VAFA 4POLA 3H93A 2NPBA 2FLSA 4KSMA 2YN1A 4G0LA 6GSWA 1O85A 1EGOA 2GTUA 1AXDA 1TDIA 4J57E 4ACSA 3GKMA 5ECSA 1BG5A 1XWAA 1GSEA 2O85A 2X8HA 5L71A 5C00A 3D22A 3IR4A 4MJEA 4I97A 5A4VA 4XHMA 3TJKA 4HDEA 2P5RA 3FW2A 6GSVA 5ECLB 2C0EA 2VL3A 4ZIJA 1EOHA 3DGQA 1EOGA 1ML6A 4MJBA 4YH2A 2RM5A 5DAKB 2JADA 2IMKA 2H6YA 4FIWA 4FYUA 5LCZA 2H70A 3EYTA 3FEUA 3GMFA 2HRKA 3MSZA 4BVYA 3IK7A 3QCPA 4MP4A 5F07A 5BMUA 5IM9A 1K0MA 4PNGA 2WFCA 4MZBA 3VPQA 1TRUA 2A4VA 2M46A 1M99A 1VF3A 1JLVA 3M9KA 2DMMA 1T8EB 1TK8B 2HZEA 1HNAA 2HLSA 2L5OA 4KX4A 4FYBA 1UC7A 1FOVA 1JFUA 3RDWA 2LUSA 1BAYA 6GSYA 1FAAA 3VI5A 4WF4A 4IQ1A 2XPEA 1OC9B 1YKAA 1GUMA 3DD3A 5IMVA 3G7JA 1F37A 1PRXA 4V1Ag 1ZYEA 2V41A 3GRXA 3APOA 2CVDA 2KHPA 5A4UA 1S3CA 1H75A 4NAXA 5D9WA 1GP1A 1NSWA 2GT5A 2VIMA 3HYPA 5COHA 3KJYA 4ZILA 4TXOA 1EP8A 4Q5NA 1AQWA 2CQ9A 4OFNA 4HJMA 1G7OA 5G5EA 4TVEA 1PGTA 1Z6MA 2VOCA 4BL7B 1JHBA 3LXTA 2GLRA 2F8FA 1QMVA 3WT1A 3L9SA 6GSUA 4HU9A 1V40A 1YY7A 1ZCPA 3A2WA 4N0VA 1PMTA 4OMVA 1BX9A 1UVZA 1B9YC 5H5QA 4EF0A 1RW1A 3IC4A 1HQOA 2VCZA 2VL2A 2REMA 4F0BA 1F6MC 3QAGA 1MDJA 1A8YA 2MZCA 3VLNA 3Q18A 3KIJA 4NHWA 4CDOA 18GSA 2D2ZA 2NVLA 2I9HA 1CQHA 1UA5A 2LQOA 4MF6A 2O87A 3TKRA 4POKA 5G1LA 4X1UA 4N30A 2H6ZA 5B6MA 3GUSA 2Z9SA 3WGXA 4HOJA 2H6XA 4HZ2A 2KUCA 2BTOT 4F0CA 3FZ4A 2F3MA 3FR3A 2TRCP 1E6BA 2LTKA 3GHAA 2WB9A 4AJ7A 1GSFA 5B7CA 1PX6A 4I5QA 5IIZA 3P7XA 2L6DA 2VD0A 2J23A 3DRNA 1H4OA 2F9SA 4K7OA 2HI7A 2H74A 3QDNA 3HXSA 2HRKB 1R5PA 1THOA 1URMA 4BVYB 4MH3A 4POMA 4ZL9A 4XS4A 3RPPA 2HQTA 4MPFA 3ZLPA 2DIZA 3CYNA 1DE2A 1PQNA 2JL4A 5INYA 2GZZA 2C0FA 3I69A 2JSYA 1SU9A 2PWJA 3IRAA 3F4SA 2HZEB 2BMXA 3QOUA 3E9JB 3PGTA 3EURA 4XRAA 2MMOA 5IMDA 2JU5A 2O89A 3L4NA 4JEDA 4JZQA 1EEJA 4G9HA 5ECQB 3TJBA 3HVVA 2DMLA 1KTEA 2L4QA 1B9XC 3G7YA 1Y6EA 4LL1B 4QL7A 3Q74A 2OE1A 1KEBA 2DJKA 2JSZA 4F03A 4LMWA 1EP7A 2HRNA 4O32A 1J9BA 3NIVA 2C1YA 1XBSA 4EE0A 4TXOB 5EY6A 4KW6A 2HSHA 3D5JA 4IW9A 2LSTA 1DBYA 3F4RA 5LNKe 5D93A 2P0GA 1U3AA 1K3LA 1YQ1A 2JZRA 3LG6A 3ZZXA 3SBCA 3IBHA 4LA1A 1QK8A 3LGCA 3R3EA 4L5OA 4OCEA 1F9MA 4GCIA 1FO5A 2CVKA 3ZVJA 4I2TA 1GTBA 1BEDA 3HVSA 3H8QA 1OYJA 5A4WA 4TN8A 4V2NA 4MMMA 4F2IA 4MA9A 4QQ7A 1Z7PA 2H75A 1A0RP 1MEKA 1WE0A 2VCVA 4YQUA 1V58A 5J3RA 2H19A 4K9ZA 3ED3A 2CZ2A 4TR1A 4HI7A 1X0RA 5HR0A 1JLWA 3MAKA 3SWLA 3IAM2 1S3AA 5AN1A 3EC3A 4H86A 5IMCA 1BQ7A 4EUYA 4N11A 1X5CA 2TRXA 3DWVA 2R37A 1WP0A 4RQRA 3TRQA 1CQGA 2FHEA 2IMEA 3FK8A 3M3MA 3LFLA 4RI7A 2DJ3A 4KAEA 2YV9A 5GSSA 3AY8A 5ECRB 2OE0A 1ON4A 4WETA 3MNGA 2K9FA 3ERGA 3FHKA 2H01A 1R26A 4L0WA 4F82A 2DJ1A 5AIVA 2ES7A 4OFTA 2VL9A 4FH8A 1DSBA 2F51A 4XS4B 4HEA2 1TRWA 3ZVJD 2NDOA 1ZGNA 4PQIA 3HCZA 1GSQA 3ZFLA 3D4TA 2CX4A 3HDCA 3L9VA 3ZRDA 2VCWA 1TTZA 1FHEA 5KEJA 3UL3A 5DQSA 1M9BA 3VWUA 5ID2A 5ECMB 5DJLA 4K2DA 2VL2C 2GQKA 2EIQA 1T00A 4XRDA 4PQHA 4G19A 1S3DA 5B8BA 5JWQB 4K8MA 2LV3A 2YJ7A 1U6TA 1GSDA 3UIWA 4MCUA 1GL8A 2HSMA 3A5WA 3GL3A 1V57A 3BCKA 2RIIA 1XW9A 2YNXA 3ERFA 2LNSA 11GSA 4CHSA 2L57A 13GSA 3QR6A 1IYIA 4IN0A 1AUCA 4TKYA 4EO3A 2IMIA 5FT3A 4PUFC 1EEMA 2HSYA 2FA4A 4GTUA 5IMAA 1JZWA 3H4KA 3TKSE 1A2LA 5HFGA 5G30A 1WWJA 4TR3A 1BYEA 3VK9A 4ECIA 2RLIA 2GSSA 5F8BA 1FVJA 2DLXA 1J08A 4X43A 1A24A 3E3EA 1Z9HA 1FB0A 3DIEA 2GDRA 3FRCA 3TJFA 3F0IA 3QFAC 2MBTA 2RM6A 3HVXA 3TJJA 4TR1B 2CVBA 2IMFA 4O7HA 3UMAA 3P90A 3KH7A 1J0FA 4L8EA 2YV7A 3GH9A 1TU7A 1XOBA 4GSNA 2G0FA 4XS1A 2IL3A 3GX8A 1THXA 3WGEA 3QFBC 3PR8A 1HD2A 5EPFA 4MPGA 2PN8A 3M0FA 4GSSA 5EVOA 1GH2A 4KSOA 3KGKA 3W6GA 3KMNA 4Q5FA 2CZ3A 1RQMA 5CREA 4L5LA 2IMDA 4TXVA 1B48A 4V2MA 2HNLA 1NHYA 3CBUA 1Q4JA 2H1BA 3D21A 4K6XA 5C04A 3C73A 4DSQA 5AGYA 1M7TA 4N10A 3HKRA 1C72A 5DJMA 2GZYA 2OACA 3HD5A 1YEPA 4EL1A 6GSSA 5IO0A 1XW6A 4EC0A 1GUKA 1AC1A 2X8GA 4IHUA 2NTOA 1O8XA 1Z7RA 3IK9A 3QPMA 4I8BA 3GTUA 2N5BA 1SL1B 1NHOA 4G2EA 2AUVA 3IA1A 2QGVA 4ZB6A 3VPTA 1TP9A 1XVQA 2XBQA 2L6CA 3C71A 2NBSA 1TK0B 1TI1A 5ID2B 3LEFA 4MK3A 2I1UA 1SK1A 2F8AA 5E4WA 5IOXA 3ZYWA 3FKFA 2HFDA 3DXBA 3FR9A 3L78A 5IO2A 2GSTA 5G31A 1K0NA 2C3QA 4J56E 3GFKA 2YZUA 5DDLA 5JWRB 2HSMB 2PMTA 3EINA 3UARA 5H5RA 1PD21 4BWSA 4NV5A 5D96A 3UBLA 1WRYA 4Q5QA 1SYRA 5KN3A 2LRTA 3HA9A 4EDYA 2DSAA 5KN0A 1B4QA 1VF2A 3KMOA 3HHVA 3APSA 2AB6A 2O7KA 1OAZA 4TR4A 4ID0A 3WYWA 2H8LA 2PGTA 3EMPA 4TRXA 3Q19A 3RBTA 2CX3A 1PKWA 5J41A 4MDCA 4GF0A 3ZIVA 2HRAA 2LJAA 4ZXGA 3RPNA 5IQYA 4OWYA 8GSSA 5D9XA 1JZDA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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