2OADA

Structure of glutathione-s-transferase c169a mutant
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
PPYTIVYFPVRGRCEAMRMLLADQGQSWKEEVVTIDTWMQGLLKPTCLYGQLPKFEDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNQREAAQMDMVNDGVEDLRGKYVTLIYTNYENGKNDYVKALPGHLKPFETLLSQNQGGKAFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGALDNFPLLSAYVARLSARPKIKAFLSSPEHVNRPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Kinetic Analyses of Glutathione S-Transferase Mutations
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase P 1
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
total genus 77
structure length 209
sequence length 209
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2006-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2oadA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2oadA01
2IJYA 4I5QA 1B9YC 3ZVJD 4F0CA 1AAZA 1XPVA 1M99A 4POKA 5D96A 4V2NA 4PTSA 1FVJA 2HRFA 1MDIA 2VM2A 2HYXA 2YV7A 2VAFA 2C0DA 1YDKA 2X64A 1X9WB 2PERA 5LD0A 5E4WA 3D6IA 2IMFA 5C00A 2KLXA 4QL7A 2CX4A 3RPNA 1V40A 4HZ4A 4HJ2A 3CTGA 3PGTA 4PUAA 2R4VA 4ZL7A 4ZB8A 1M9AA 5IOXA 1TK0B 4PNFA 4BVYB 4ZL9A 2X99A 1Z3EA 1GSQA 2FA4A 3FY7A 5EVOA 5ECPB 4G0IA 3Q19A 3HCZA 3CSIA 2YWOA 4FYCA 3HY2A 4N0VA 2LTKA 4XHMA 1T8EB 4MF7A 1O8XA 2HZEB 1PL1A 2GQKA 3GNJA 5CRHA 3KMNA 4FH8A 3M1GA 2K18A 1WE0A 4HQSA 2G2QA 6GSXA 3LYKA 3VLNA 3IC4A 4KW6A 5CREA 1IYHA 5DVBA 4TN8A 4KA0A 1XIYA 4O92A 2Z9SA 5G5EA 2WB9A 4JBBA 3E9JB 3M9KA 3MNGA 1XVWA 2E7PA 1EGOA 3ERGA 1USBA 4PX1A 2A2RA 1PMTA 4MZCA 1GTAA 4G2EA 1ACVA 2HI7A 2MMOA 1ZGNA 4E8EA 3H8QA 3RHBA 1GH2A 1OAZA 3EU4A 2JL4A 1LU4A 3KEBA 4HU7A 4N10A 5ABRA 2FUG2 1B4PA 1UC7A 3GTUB 4AGSA 3FR3A 3EMPA 20GSA 1PKZA 4J2FA 5HR3A 1C72A 1HYUA 3FZAA 1SENA 4OD7A 2GZPA 8GSSA 3D5JA 3VURA 2VCVA 4I2TA 4GCIA 3I9V2 3UEMA 1BYEA 3HJPA 4L5OA 3HXSA 1F37A 2ES7A 5DJLA 4IQAA 1Z9HA 4MCUA 3L9VA 2WJUA 5AISA 1M2DA 2GVPA 2MBTA 4MZBA 3U6VA 2LJAA 4AJ7A 3I43A 4IGJA 4PXOA 2X8GA 2FA8A 2ON7A 5GAPD 7GSSA 3H1NA 1EOGA 1TRUA 4MA9A 1PSQA 1NSWA 3F3RA 1AXDA 3IPZA 2VL2C 4IP1A 2YZUA 1GUKA 1M2BA 2RUFA 4XS4A 3TRXA 4XCSA 4K0GA 1PN9A 3GIXA 4OWYA 2JADA 3BD2A 4NV2A 3VPTA 4V1Ap 2DIYA 3DWVA 4O5RA 1GNWA 3WGDA 4HU9A 1B9XC 3F3QA 3HA9A 5CRWA 1VRSD 2H01A 1HNAA 3VI5A 1OKTA 1T4YA 5G5FA 5JWRB 2M72A 3EMXA 2ZNMA 1X5CA 2XC2A 3A2VA 3QAGA 3DXBA 3TKQA 4WF4A 1ILOA 1W4VA 1PRXA 3KCMA 3TJJA 1M0UA 3F63A 2LEGA 4RI6A 5ECSA 4XRDA 6GSUA 2PBJA 2GT5A 1WP0A 4YQVA 4WF5A 2HRNA 2JZSA 1K3LA 3DEXA 2ON5A 4G0LA 2YWNA 1TP9A 3ZIJA 2YV9A 1JZRA 2RUEA 2LJKA 3FW2A 5EPFA 3F9UA 5DALA 2E0QA 1F3AA 1K0DA 1PQNA 1SJIA 4XS4B 2VO4A 3DGQA 1F2EA 14GSA 1X9MB 4K9ZA 4F9ZA 3GL5A 4GF0A 3P7XA 4USSA 1F9MA 4ECIA 2GQLA 1WIKA 4F2IA 4Z7XA 1YKAA 5A4UA 1E2YA 4WXTA 1I9DA 1DE1A 1V98A 2OBIA 1U87A 2PU9C 1MDJA 2HQTA 5JCWA 2L57A 2PWJA 3TJFA 2WULA 2H1BA 4KH7A 1AQVA 3IHQA 4HUAA 4ZBDA 1M9BA 2YWIA 5CRGA 1NHOA 1Z7RA 5DAKA 1EP7A 5B6NA 3ZYWA 1Q4JA 1YEXA 4I8BA 1RQMA 2EIRA 1VF4A 1OC9B 4HI7A 3GH6A 3HD5A 3DMLA 3CRUA 1GSEA 1O7UA 2GTUA 3TB2A 4RQRA 1PX7A 2NPBA 1NM3A 1Q98A 1V57A 1WOUA 3KZQA 16GSA 3FYGA 4ZL8A 1N8JA 4LA1A 2H73A 2OE3A 1LBKA 2DMLA 4IW9A 2CA8A 2VD0A 4TXOB 2IIYA 1AQXA 2R6KA 1GLQA 1TU8A 1TI3A 4OMVA 1XWCA 1SKWB 1OYJA 2E2GA 4RI7A 1DUGA 2L6DA 1URMA 1CQHA 3O76A 4ULXA 4JZQA 4L8EA 2I9HA 4TW5A 3QR6A 1O73A 5HFKA 2AAWA 5ECQB 2V6KA 3G7YA 2C0EA 1XOAA 1TRVA 1A2MA 1OKDA 4XS6A 2B5YA 5G1LA 1S3CA 2C3TA 1FHEA 3Q74A 3QFAC 5HFGA 4GSSA 2B5EA 2IL3A 6GSWA 3GKKA 4IJIA 4EXJA 2I4AA 2H66A 1GWCA 4NHZA 5GSSA 3ZIVA 4K1FA 4RUVA 1MD3A 2YCDA 3F4TA 4J57E 3GX0A 2CVBA 1U3IA 5FHIA 5FT3A 4ML1A 4BWSA 2TIRA 2VUPA 2DJKA 1XWBA 5IMFA 4V2LA 1O85A 2MYGA 5J9BA 4X43A 3FZ4A 4BVYA 3L0HA 1K0CA 2NDOA 2MMAA 4L0UA 4LLRA 4IVFA 4F82A 5B6MA 17GSA 1A8LA 2DJJA 5HR2A 3LXTA 2ALBA 4QQ7A 2PVOC 1EOHA 4ZILA 1ML6A 3DKSA 2C0GA 1R7HA 1MEKA 3RBTA 1R5PA 2HZEA 2FY6A 1GSFA 3APOA 1XXUA 4HDEA 2YWMA 1V9WA 2I81A 4MK3A 4ZBAA 3ED3A 4FYUA 3I6AA 5JWOB 2H76A 4ECBA 2AHEA 4G10A 3ERWA 4NHWA 4IP6A 5D9VA 3J7Yk 4HZ2A 2H1AA 2JU5A 5F05A 1OE7A 3RDWA 5L71A 1SL2B 1HNBA 1JZWA 2NVLA 5C04A 5DQSA 3QOUA 4YH2A 4K7OA 1EWXA 2CZ3A 3QFBC 1AC1A 3MSZA 2QGVA 1AQWA 3UAPA 4IELA 4KDYA 1J08A 2FWEA 2XPDA 4DSQA 1ERVA 1G6WA 3L9UA 2CQ9A 3A2WA 4N11A 3D4MA 2M46A 3H4KA 5B8BA 2D2ZA 4GSNA 2N5AA 2LS5A 2LV3A 5G2ZA 2R5GA 3GTUA 2F8FA 3HJOA 3GL3A 3LORA 2HE3A 1TK8B 1J9BA 6GSTA 6GSYA 3VWXA 1VF2A 4MLYA 3EE2A 4V2MA 2VLUA 4GQFA 2WZ9A 3UJ1A 5BMUA 4MJAA 2AUVA 2DBCA 3QAVA 19GSA 3UVHA 2PPTA 1K0OA 1JLVA 3P90A 4PNGA 4D73B 2H6YA 4I2UA 3A5WA 4JE1A 2OA7A 1WRYA 2VCXA 2CVDA 2K8SA 3EURA 1B48A 1VGLA 2HSHA 2ZUPA 2K8VA 1GULA 3F6DA 5IMCA 1OC8A 2B3SA 4NWYA 2CT6A 4KNDA 4K6XA 1A0RP 2BMXA 3IE3A 3KMOA 1S3AA 1UN2A 4AJ8A 3A2XA 3RPPA 1BG5A 3M9JA 1XWAA 3PR8A 3GKNA 5H5QA 1QFNA 1UA5A 3GUSA 2DJ2A 4KGIA 4K2DA 4MH2A 4ML6A 1ZL9A 2I1UA 3CSHA 1SK1A 3KP8A 3PH9A 5KN0A 3UBKA 5DQYA 2VOCA 2P5QA 1KBNA 1GL8A 4L0WA 4WKWA 3VFIA 2VLVA 2OBKA 1ST9A 4AJ6A 2OADA 4ZBBA 5AIXA 2KP2A 1TKDB 4X0XA 1MDKA 2AJQB 2R3XA 4MDCA 1WWJA 2TRCP 2GQMA 2LNSA 1YKCA 1IYIA 3TJKA 4EKZA 4J56E 2AV4A 2XPEA 3R3EA 1U3AA 2C8UA 2HSMB 1R5AA 3G7JA 3M0FA 2LRNA 1F3BA 4BL7B 1FG4A 4G19A 2V2GA 4KE3A 1ERUA 3UBLA 2R37A 4X1UA 2DMMA 3FZ5A 1PD21 3HYPA 4BVXB 2X8CA 3HZ8A 2VCQA 3F6FA 2H8LA 3M3MA 2PGTA 4BWQA 3LG6A 4KSOA 3UIWA 2RIIA 2LRCA 1EEJA 2IMEA 3CRTA 4HEA2 1AUCA 1V58A 2FLSA 1OVNA 1A2JA 1TRWA 3ZFBA 2M80A 1VF1A 3VWVA 1GP1A 1SU9A 2PN8A 4ECJA 3EVIA 5CO3A 1N2AA 3IR4A 4MF5A 1E6BA 4MPGA 2KP1A 3C7MA 2HSYA 1MD4A 3GURA 5IMZA 2EIQA 4WEYA 4DVCA 2IFQB 3MDKA 1X5EA 3FHKA 2OE0A 2MMNA 3TCOA 4L5LA 5JCGA 3CMIA 3ZITA 1R4WA 2QSIA 1ZMAA 2KUCA 1SL1B 5CAXA 2VCTA 3GSTA 4PUFC 3W8SA 5IMAA 1J0FA 2XHFA 4TVEA 3FZ9A 3WT2A 2HRKB 3GN3A 1G0TA 1O6JA 3IV4A 3UVTA 1BX9A 2EIOA 2R2JA 3F8UA 3DD3A 2JZRA 2IMDA 2LNTA 2WDUA 1TK5B 5ECKB 2WGRA 3ZMKA 4KCEA 1SYXA 1OC9A 3IDVA 2RM5A 1XWGA 2DC5A 2P31A 1FB6A 3TDGA 4MH3A 1TDIA 5A5KA 3TKSC 2L4QA 4IHUA 2AB6A 4K8MA 2P0GA 3IA1A 1ZCPA 4NXIA 3GMFA 3US3A 1XVQA 2GT6A 4OCFA 2YN1A 3D21A 1JZOA 3QPMA 4CHSA 5EY6A 2GZZA 3HVVA 4TXOA 2V6OA 3VWUA 2H0IA 2O87A 4WBRD 3ZZXA 3KP9A 3S9FA 2CVKA 2F9SA 2X8HA 5ECRB 4KX4A 5DJMA 4JRRA 3C8EA 1JLWA 1PX6A 1Z7PA 5IO0A 3ZFLA 2LQOA 4KB3A 2HT9A 1OC3A 11GSA 2H19A 1Y25A 4G9HA 3LGCA 4FIWA 2IN3A 1SL0B 1K0AA 3KJYA 1TJDA 2DIZA 1PA3A 1V2AA 1LJRA 4OFNA 4HOJA 3Q18A 4IKHA 1FAAA 5DCGA 2B5XA 1T4ZA 4OO4A 3TKPA 5D73A 5IO2A 1W89A 3ERFA 4ID0A 4FQUA 2LUSA 1WMJA 1SKRB 3UARA 3LQ7A 2V1MA 3KD0A 5D9WA 5CP1A 1I5GA 1BAYA 1VF3A 3LSZA 5ECOB 1SKSB 3U5RE 1G6YA 3F4RA 2JSYA 3IBHA 4GRFA 1BJXA 1RK4A 2B6MA 5J9CA 4XS1A 4EUYA 2VM1A 4JR6A 1F6MC 4BA7A 1ERWA 4POBA 4XTSA 3LXZA 5D93A 3V1WA 3FR6A 2IMKA 1K3YA 4IN0A 1T1VA 2WFCA 1KTEA 3D22A 1G7OA 3WD6A 4GSTA 3VK9A 3APSA 5HFIA 5D9TA 5ECNB 2MMZA 2H1DA 2YOIA 4PQ1A 3F4SA 3MWHA 1SJZA 3IRAA 3GFKA 1EEMA 5ECHB 2BJXA 2HRAA 4TKYA 3IK7A 3W8JA 1K0BA 4GQCA 2V32A 3GKMA 4FO5A 1YQ1A 3I69A 1K3OA 1HD2A 4RQXA 3WGXA 6GSSA 2B1KA 1ZYEA 2QC7A 2CAIA 2VIMA 1EV9A 5AGYA 1X9SB 4MMMA 3LYPA 2QKEA 1GTIA 1EGRA 1MTCA 2REMA 2O85A 1TXXA 2F8AA 3HVXA 3ZTLA 5A4WA 1GTUA 4WR4A 1ZZYA 3J7Yb 1XFLA 4H86A 4NAXA 2OKAA 4QL9A 10GSA 2B7JA 2LSTA 3BOAA 4WBJA 12GSA 1U88A 4ISDA 2GZYA 2F51A 2HFDA 2LKUA 3IAS2 2DSAA 3MAKA 4KSMA 2VCWA 1AW9A 2FNOA 3SWLA 2C3NA 1A2LA 2B7KA 4GLTA 3EWLA 4NMUA 4EVMA 3SBCA 3N9JA 3FRCA 3HJMA 1DE2A 5F07A 3BCKA 4OCEA 4BPYA 1YF0A 5IMVA 3UOMA 2WRTA 4D73A 1CQGA 2KOKA 3EU3A 5A4VA 1GSUA 2FGXA 4N30A 5ID2B 3GYKA 5JCUA 3EYTA 1QK8A 1TI1A 4OO5A 1K0MA 3ZLPA 4DSSA 4NPBA 2O8VB 3DVWA 4WR5A 18GSA 3QCPA 3LJRA 1GSSA 1XCCA 3RHCA 1GUHA 4O32A 2N5BA 2P5RA 3HZ4A 3GKXA 2VL2A 2FWGA 4TR4A 5IIZA 5IMDA 5IQYA 1A0FA 2VD1A 3FKFA 3CBUA 2WCIA 2H72A 1WJKA 1QQ2A 3KH7A 1S3DA 4KCAA 5COHA 5F0GA 4ACSA 3GH9A 3CYNA 2IPAA 1XWKA 3N5OA 3UMAA 4K7IA 2C3QA 4PQIA 6GSVA 2L5OA 5G1KA 3KXOA 3TOTA 5F06A 5GAND 1EZKA 2PUKC 1YF1A 2YJ7A 2NTOA 2LRTA 1XW9A 4HQZA 2HSMA 3WT1A 3C71A 4O7HA 4BL7A 5CNWA 4CW9A 5LNKe 3PPUA 4I97A 2AYTA 2EC4A 1T3BA 4LL4B 3W6GA 4BVXA 5ELAA 2GS3A 2H1GA 2BTOT 3VWWA 2GLRA 4DSSB 3PINA 4JU5A 2GGTA 3TKSA 2E2MA 2DJ1A 1K0NA 2NBSA 4FYBA 1JHBA 1B4QA 2LQQA 3HVSA 1DBYA 3DVXA 5B7CA 1GNEA 4XRAA 4ZB9A 3LFLA 3QAWA 2JZTA 2H30A 1QGVA 2GSRA 4F0BA 1B8XA 2GDRA 4NV5A 2L6CA 4DSRA 1PGTA 4JR4A 1GRXA 3CSJA 1X5DA 2FWHA 4YQMA 4EF0A 2IFQA 4GXZA 1PKWA 1KEBA 1UVZA 4AF2A 4Q5QA 2YP6A 2OE1A 2A4VA 1HQOA 3TKSE 2RM6A 4MP4A 3G7IA 5IOWA 1NW2A 1FO5A 5H5RA 3O3TA 4JEDA 3E0UA 3TJBA 4PQHA 2HLSA 2XBIA 2L5LA 2HRKA 4KDUA 3HHVA 4YAVA 4LMWA 4OFTA 4TOPA 2JACA 4K7NA 2LJRA 2O89A 3HKRA 3G9BA 3KM6A 1H75A 3LWAA 5HQPA 3APQA 5AN1A 4ILFA 1EP8A 5J3RA 3JCML 4LMVA 3VI7A 1T00A 4EO3A 5GZZB 2PMTA 2FWFA 4TR0A 3LEFA 1M2AA 3ISOA 9GSSA 2H0HA 4E8HA 4TR1A 1SD9A 4ZIJA 5IPHA 4I6XA 5DCHA 2KHPA 5HR1A 4MF6A 5J4UA 5D9XA 2C80A 5G30A 3IK9A 2DJ0A 1SD8A 1TOFA 5ECIB 2CZ2A 1EV4A 1FW1A 3IXRA 4YQUA 1QMVA 1FVKA 1GLPA 2WS2A 1THOA 4Q5FA 3EINA 2ZCTA 2H70A 3OR5A 5KN1A 5JWQB 1GSDA 2H6ZA 1ON4A 5FWGA 2H0GA 4GWRA 1U6TA 5HR0A 2DJ3A 1SYRA 1DSBA 3L4NA 3L9SA 2CX3A 1ZYQB 1X0RA 4TR3A 2N5FA 3H79A 4EE0A 1HNCA 5DBQA 1TW9A 4KDXA 1OE8A 4PGTA 5CRDA 1TTZA 3D0ZA 3IOSA 2H6XA 3FR9A 3KIJA 3IC8A 3GX8A 4IBPA 4MZWA 3TUEA 5LCZA 5KN2A 4TR1B 2GSTA 2UZ8A 1FOVA 4HS1A 1Z6NA 3CXGA 3TGZA 2IWTA 4V1Ag 2HNLA 4KAEA 5F8BA 2YANA 4Q5NA 3AY8A 1Z5YE 2J23A 3GRXA 3CTFA 1SK0A 2A2SA 1WPIA 3KTBA 2YZHA 1ERTA 4LL1B 1SK2A 3KTLA 4YAPA 3EC3A 4WETA 4MPFA 4HJMA 3TRPA 3QMXA 1QXHA 3BBYA 1YJ6A 1A8YA 2XBQA 5EL8A 3D4TA 2RLIA 1YEPA 4XIHA 5B8AA 1JZDA 1ABAA 2CV4A 3QD9A 5ENUA 1XW6A 4DEJA 2VCZA 3ME8A 1XBSA 5KN3A 3GSSA 5INYA 4POMA 1H4OA 5J41A 2JSZA 1YY7A 3NOFA 2C0FA 4N0ZA 5DDLA 2CAQA 4K0NA 4EDZA 4MJBA 3VPQA 3C1SA 2I3YA 3H93A 2H74A 3P8WA 1Z6MA 4PURA 1M7TA 1XOBA 4CDOA 1GUMA 2TRXA 3C73A 5IPGA 4ECCA 1SJ6A 3E3EA 1O8WA 2MZCA 3ZL5A 4F03A 3WGEA 1A23A 4KF9A 1TRSA 3Q6OA 2MBSA 3L78A 3TJGA 4G0KA 3DIEA 4KUNA 1PL2A 5DALB 2K6VA 2HSNB 2L4CA 3UL3A 3GHAA 3TKRA 2YPMA 2VL3A 3BJ5A 3GV1A 2DLXA 4OFMA 3NIVA 3HDCA 4POLA 1THXA 4EDYA 2O7KA 5ID2A 2GSQA 2HXKA 2J9HA 1O81A 2VLTA 3QDNA 5ELGA 1AIUA 1A24A 2C1YA 4MABA 3C1RA 2FHEA 1GSYA 1NHYA 4GTUA 1GTBA 1TU7A 3P2AA 5J5NA 1G7EA 3RAZA 2OACA 2HZFA 3DRNA 1XW5A 1KNGA 2FD3A 3R2QA 3ZVJA 1QUWA 1BEDA 5DAKB 2OJLA 1RW1A 4EL1A 5GSTA 4ZB6A 5ECMB 3DYRA 4IQ1A 5D8IA 2K9FA 2C4JA 3M8NA 4IS0A 4TXVA 4MJEA 2PVQA 5AIVA 3KH9A 3O6TA 5G31A 1YZXA 5H5SA 3F0IA 3ME7A 3TRQA 1XZOA 1JFUA 2V41A 5CYYA 5ECLB 4EC0A 1BQ7A 2GSSA 1Y6EA 3IAM2 4MJCA 13GSA 3ZMLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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