2X64A

Glutathione-s-transferase from xylella fastidiosa
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
206
structure length
206
Chain Sequence
HMKLYIMPGACSLADHILLRWSGSSFDLQFLDHQSMKAPEYLALNPSGAVPALQVGDWVLTQNAAILNYITDIAPAERGLSGDGSLKARAEINRWIAFSNSDVHPMYWALFGGTAYLQDPQMIARSQDNARQKLRVLYQRADAHLKHHNWLANGQRSGADAYLYVTLRWAKKVGVDLSSLDALSAFFERMEADPGVQAALQAEGLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Xylella fastidiosa
publication title Structural and Biophysical Characterization of the Recombinant Glutathione-S-Transferase from Xylella
rcsb
molecule keywords GLUTATHIONE-S-TRANSFERASE
total genus 76
structure length 206
sequence length 206
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2x64A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x64A01
4IKHA 4BWQA 2IJYA 1TI3A 3DVXA 3KTLA 4ML1A 3GL3A 4N30A 5GAND 4G9HA 4XTSA 3RHBA 3G7IA 5J9BA 2JZRA 4I2UA 4TRXA 5G1KA 3IXRA 2E2GA 3QCPA 3EMXA 4HEA2 1NHYA 3FR9A 5IQYA 4ECCA 2AJQB 2VOCA 4HUAA 5ECIB 3K8NA 3GFKA 4GF0A 3F6DA 2J9HA 3BJ5A 1XWBA 4Z7XA 3CTFA 2LRCA 2KHPA 1LJRA 1YKCA 3M9JA 2MBSA 1GSUA 5FT3A 2YZUA 4TW5A 1TK5B 2R4VA 4TR1B 4OO5A 3FZ9A 1GSSA 1IYIA 1XZOA 1T8EB 1OKDA 2K18A 1TK8B 2GZZA 1EEJA 1WRYA 4F03A 3KM6A 5IO2A 1X9WB 3HD5A 3VWUA 2VLVA 2C0DA 2M80A 1X5EA 5CYYA 2QGVA 3HZ8A 3Q74A 2VM2A 5DCGA 2K8SA 2AB6A 2NPBA 3GKKA 4NV5A 1T4ZA 2GSQA 4N11A 1I5GA 4XRAA 3LG6A 4BWSA 3TUEA 1K0MA 3GH6A 2LJRA 1AC1A 2VM1A 3CBUA 2MMAA 4V2MA 1WJKA 4MJAA 3KP8A 2DJ2A 1AW9A 2AAWA 4L5OA 2JSYA 1YJ6A 3IC4A 3MNGA 5G31A 2B7KA 4FYBA 2HYXA 5IOXA 1PRXA 4FYCA 5G1LA 2BMXA 4K0GA 1B48A 5D9WA 5CREA 2VO4A 4IP1A 5G5FA 1F9MA 3ZMKA 3IE3A 2L5LA 1F3AA 6GSTA 1GTUA 2B1KA 3C71A 4EE0A 2YWIA 2C8UA 5JWOB 1B4PA 1PSQA 1T00A 3FZ4A 1XPVA 2N5BA 3TRPA 4ZB8A 2NDOA 3BCIA 1GUHA 5LD0A 3E0UA 1PD21 1TU8A 2F51A 4ZL9A 3NIVA 2BJXA 1NHOA 3N9JA 2FUG2 2K6VA 3PR8A 3C1SA 2DIZA 2DSAA 3P7XA 4K6XA 4GQCA 1Z5YE 2LQQA 2HSMA 5HR1A 5DQYA 2GS3A 1XWAA 5IOWA 2C3NA 5INYA 4CW9A 3RPPA 1GNWA 5CRHA 5IPHA 1K0NA 1U3AA 4RI7A 1VF2A 2YV9A 3F8UA 3WYWA 2H0IA 3PGTA 12GSA 2K9FA 5D73A 2O7KA 3RAZA 1TKDB 1GUKA 1YDKA 2R6KA 4ZBBA 4HJ2A 1WIKA 1A8YA 5ECOB 3TRXA 2N5AA 1KEBA 2GT6A 3L4NA 5F07A 1O8WA 3DD3A 3M8NA 3LYPA 1G7EA 2P5RA 3DEXA 3ERWA 4USSA 5D9VA 4D73B 2VCWA 1CQGA 5DAKB 2HFDA 3QD9A 2DJ0A 4MLYA 1OAZA 4KUNA 4EL1A 1OE8A 5J41A 4PX1A 2AUVA 3L9VA 4ZB9A 3FR3A 2CZ3A 2CX3A 5G5EA 1A24A 1FB6A 1VRSD 4XHMA 3A3TA 3KJYA 5ID2A 3E9JB 2HZEA 2AV4A 1JLWA 3TKSA 1DE1A 3O76A 2VLUA 1KTEA 5GSTA 3ZTLA 5J3RA 3GA4A 3PH9A 4XS4A 2K8VA 1EWXA 2RM5A 2IPAA 2J23A 4I6XA 5CP1A 3TGZA 1RQMA 4FIWA 2ALBA 5DALA 3HDCA 4ACSA 2LJKA 2PVQA 2DMMA 4QL7A 3F6FA 5HFIA 4ECBA 1YQ1A 3WGXA 1XOAA 2GSRA 2I81A 2M72A 3TKQA 5IMAA 3FK8A 5E59A 5CAXA 3G7JA 1FHEA 2P31A 4JE1A 4Q5QA 1WWJA 2MMNA 4JR6A 4IP6A 1MTCA 5DJLA 5GAPD 1AXDA 3H79A 5D9XA 1TOFA 3I9V2 3DYRA 5C00A 4HDEA 3QDNA 2H70A 1K0OA 4GWRA 4OFTA 2HQTA 3EVIA 4HQSA 2OE3A 1GSQA 1ZYEA 2RM6A 2RUEA 5AIXA 4ML6A 3A2XA 1V58A 4G19A 3D4MA 1A0RP 4YQVA 2EIOA 3NOFA 3QFBC 3ZIJA 5DJMA 4BVYA 1LBKA 2LUSA 2F3MA 2TRCP 2YCDA 3GUSA 2F9SA 1MDJA 1Y25A 4NHZA 5ECNB 5D96A 5IMZA 1EZKA 4MF7A 7GSSA 1AIUA 3IA1A 5JCGA 4XIHA 2DJ3A 2O8VB 5DBQA 3VWXA 2ZNMA 2FWHA 5COHA 3APOA 5D8IA 1JZRA 2AHEA 3P8WA 4YAPA 2MMOA 2QC7A 2YPMA 3UVHA 1FB0A 16GSA 2H19A 2C3TA 19GSA 18GSA 3TJKA 4KSMA 1R7HA 2EIQA 2HRKA 3ZVJA 3ISOA 5ECQB 1A23A 1YKAA 4EDZA 2H6YA 5EY6A 1Z3EA 17GSA 2CV4A 4GSTA 2IWTA 3IR4A 2YWNA 4EUYA 1TK0B 1O8XA 2HT9A 3UMAA 5F0GA 1X0RA 1TU7A 4YAVA 1O7UA 3E3EA 4L0WA 3RPNA 1OC8A 3KH9A 3ME7A 4GTUA 2XPEA 1G6YA 1GRXA 3U6VA 1A2JA 4J56E 3UVTA 4ULXA 2GQKA 1U87A 3ZRDA 4F0BA 3UJ1A 3C73A 4RQRA 1ILOA 1XWCA 5DCHA 1B9XC 4KF9A 4OO4A 4WKWA 2VD1A 1J08A 2I1UA 2HXKA 3VPQA 9GSSA 3H4KA 1M2AA 2DJKA 2JADA 4HQZA 2GDRA 1EP7A 5JCWA 1KBNA 1PKWA 5ECLB 3GSTA 3BCKA 3DWVA 11GSA 1HNAA 2L5OA 4WR4A 1XW6A 2KLXA 1PX6A 3UBLA 1EGRA 3P2AA 1GUMA 4MMMA 1BQ7A 4MK3A 4KCEA 2WS2A 1HQOA 1WPIA 2X99A 5AIVA 3HXSA 1ZMAA 4WEYA 1ZGNA 4PUFC 2PBJA 5H5SA 3SBCA 4BA7A 2PN8A 1SK2A 3GSSA 2LS5A 3CTGA 3FZAA 4ZL8A 2HSYA 2LNTA 1XBSA 2JACA 2IMFA 4NV2A 1J0FA 5ID2B 2H1BA 3GTUA 3GX0A 2HZEB 4TVEA 2VIMA 1W4VA 5B7CA 3TJJA 2GTUA 2MZCA 1R4WA 4X1UA 1DBYA 4QL9A 2FWFA 2WB9A 1B4QA 3DKSA 1M99A 1OVNA 2GT5A 4XS4B 4KGIA 3DMLA 14GSA 2C4JA 2GGTA 2OBIA 2L6CA 4HJMA 2GZYA 1JZDA 5F05A 4HZ4A 1E6BA 3HVSA 5HFKA 4CDOA 1UN2A 3ZVJD 1UC7A 3HKRA 3D22A 2KOKA 1F3BA 5ECKB 3LSZA 5IIZA 5DVBA 3GKNA 1M7TA 4XCSA 5ECPB 3EMPA 5GSSA 2IN3A 3EINA 3CYNA 5G30A 4L5LA 1U3IA 1V98A 3HHVA 2H0HA 3Q19A 2H6ZA 4OFMA 4V1Ag 3L9SA 1TRWA 2G2QA 1URMA 3IBHA 1EEMA 1XFLA 4TR3A 1O6JA 4NAXA 2HZFA 1NM3A 2E2MA 2LNSA 1OC9B 3ZL5A 3KMNA 4OCFA 2QSIA 1QXHA 4GRFA 1KNGA 5JWRB 4FYUA 4G10A 3FRCA 3LJRA 2EIRA 4NMUA 1T1VA 1SJIA 4N0ZA 4MP4A 4PNFA 4PXOA 4BVYB 3H1NA 2PPTA 2FNOA 3KD0A 2PGTA 1ERVA 1ZOFA 3D0ZA 2V6OA 1T3BA 1ACVA 3HCZA 4G0LA 1GNEA 1WE0A 2NVLA 1OC3A 1O73A 4OWYA 4IVFA 3ZYWA 5A4VA 2LV3A 6GSYA 2LKUA 1USBA 1Q98A 3O6TA 2H1GA 4TR4A 1A2MA 2R37A 2JZSA 4AGSA 3M0FA 2HNLA 4AJ7A 1FG4A 2B5EA 1GH2A 1K0BA 2HRKB 3TKSE 3KZQA 3QPMA 3TKRA 4BPYA 3L0HA 2CVDA 4L8EA 2GZPA 4MJEA 4WR5A 3A2WA 1A8LA 4GXZA 5C04A 5HQPA 1T7PB 1XW5A 1YZXA 2FWEA 3I69A 4MDCA 4HI7A 2IMKA 4IW9A 1B8XA 2C0GA 1XOBA 4WF4A 4MPGA 1V9WA 5AN1A 1SKSB 3PPUA 4ZBDA 5B6MA 2LSTA 3GX8A 3QOUA 3DXBA 3L9UA 2C0EA 1PX7A 3J7Yb 4PTSA 4KCAA 4IQAA 1QK8A 4X0XA 1PMTA 4KH7A 2H6XA 4K7IA 2GSSA 2H66A 4IGJA 3UBKA 4MJBA 4G0KA 4KDUA 4MABA 3M3MA 3LXZA 4K2DA 2FCHA 4RUVA 3GNJA 5IPGA 2GQMA 3D4TA 2IMEA 2A2RA 1U6TA 3TB2A 2CVKA 3W8JA 2GQLA 6GSXA 2IFQA 4LL1B 1ABAA 2PU9C 1GSYA 1R5AA 3TOTA 1J9BA 4K9ZA 4IQ1A 4LMWA 1YY7A 1TRVA 2OE0A 4QQ7A 2MMZA 3BOAA 2GVPA 3M9KA 1Z7PA 2H0GA 1AQVA 4KB3A 3UL3A 2QKEA 2B1LA 2B3SA 3U5RE 3UARA 1V57A 1UA5A 2YP6A 2E7PA 1AQWA 3GTUB 4MH2A 4MZWA 1Z9HA 3TRQA 4HOJA 5DQSA 1A0FA 2VCZA 5ENUA 2HRFA 1HNBA 2ZCTA 3UEMA 5IMFA 2F8FA 2LRTA 1AUCA 4WF5A 1OE7A 3UAPA 2KUCA 2YWOA 1WP0A 2B7JA 3V1WA 1DSBA 3TJBA 1O85A 3F0IA 3DRNA 3VK9A 3F3QA 3LGCA 4IJ3A 1JLVA 4AJ6A 4I2TA 1QUWA 5JCUA 4N10A 2ES7A 4TOPA 2PWJA 2B5YA 1Z6MA 2H1AA 2MBTA 1OC9A 3TOUA 1VF1A 2DMLA 4OFNA 3IDVA 5AGYA 1MDIA 3TJGA 2V2GA 3EU4A 3EC3A 1TXXA 3GH9A 1R5PA 3MAKA 1FO5A 3VLNA 4KDXA 5ECRB 2H75A 1XVQA 3HJMA 1JHBA 2N5FA 1ZZYA 3FHKA 1GSEA 3S9FA 1TJDA 3PINA 4PGTA 3D5JA 4G0IA 3C7MA 2V6KA 5IMCA 1EGOA 4ILFA 1EOHA 2TIRA 2RUFA 3KCMA 2FD3A 2P5QA 2H30A 1SD9A 3IHQA 2WFCA 3TDGA 6GSVA 3FYGA 3APSA 3BBYA 3CSIA 4O5RA 3FZ5A 2VUPA 2H8LA 3APQA 1ERTA 2VL2C 1G6WA 4POLA 3QAWA 5DDLA 3F4SA 4O7HA 1FOVA 2EC4A 4KDYA 2C80A 5F8BA 4XS6A 5GZZB 1VF4A 3QFAC 1QQ2A 4XS1A 1X9MB 1BJXA 3ZMLA 1C72A 3H8QA 1JZOA 4GSNA 4FQUA 3MDKA 2YV7A 1OKTA 2LEGA 2OBKA 1M2DA 3ED3A 4YQUA 4POKA 1QGVA 3GN3A 3G9BA 1M9AA 3R2QA 4ZL7A 3GV1A 2LTKA 3F9UA 2ON5A 4ZIJA 3FY7A 4G2EA 2YWMA 5A4WA 2H73A 3ZFBA 2HRNA 2JU5A 2FHEA 2B6MA 2XPDA 4V2NA 4POMA 1TTZA 1PA3A 4PUAA 3HA9A 1ERUA 5HR3A 3LYKA 5B8BA 6GSSA 5FWGA 3L78A 3IK9A 4MPFA 2UZ8A 5BMUA 4KAEA 1PGTA 4BVXA 4E8EA 4K1FA 1M2BA 3ZLPA 4JRRA 5LNKe 5ELAA 4ZBAA 2VD0A 1Y6EA 3WGDA 3GURA 4HS1A 1R26A 2DIYA 3EURA 2LRNA 2FLSA 3G7YA 2FGXA 3GYKA 4EO3A 1BEDA 3W6GA 1S3CA 2KP2A 1XWGA 2IFQB 3J7Yk 4X43A 4YH2A 2HRAA 1I9DA 1H75A 1PL1A 2VAFA 4K8MA 2WGRA 1PQNA 2X8CA 5IO0A 4GSSA 1K0CA 1TRUA 1EP8A 5KN1A 3F3RA 4JZQA 4DEJA 4AF2A 1GTBA 3LORA 3HJOA 3GIXA 1N2AA 5AISA 5KN2A 2VCQA 3IC8A 2RLIA 1M0UA 3HVVA 1K3LA 2XBIA 2D2ZA 1XVWA 2GLRA 4MF6A 1ERWA 4ECIA 1T4YA 5CNWA 5H5QA 5EPFA 1JFUA 3FEUA 5EL8A 2CAQA 2O87A 4OD7A 10GSA 2WZ9A 3I6AA 2H74A 2DC5A 1THOA 2H01A 5L71A 2PMTA 3VPTA 3OR5A 2ZUPA 1TI1A 2B5XA 3QR6A 4JEDA 4J57E 8GSSA 5CRDA 3ME8A 4NHWA 2VL9A 4JR4A 1F2EA 4Q5NA 2JZTA 3VWVA 1SL1B 2V41A 3CMIA 3CRTA 4ZB6A 3WGEA 2VL3A 2C3QA 4MH3A 3IK7A 3ERFA 4BL7B 4N0VA 1VGLA 5CO3A 1HYUA 2X64A 2YZHA 4ISDA 2CZ2A 2H72A 4DSQA 2A2SA 5ECHB 3KH7A 1GWCA 2IMDA 3N5OA 3CSHA 4KE3A 5HR0A 1SKRB 1HD2A 1WOUA 5KEJA 3BD2A 3IOSA 2FA4A 1TDIA 3VI7A 1A2LA 3C8EA 22GSA 3QAGA 4K7OA 1FW1A 1OYJA 4H86A 3UIWA 3US3A 4Q5FA 1FVKA 2A4VA 3DVWA 3KXOA 4L0UA 4WBRD 3ZREA 4F2IA 1PKZA 1SU9A 2LJAA 4JBBA 1SJZA 3KEBA 5IMVA 1SYXA 2VLTA 3R3EA 4JU5A 2FA8A 4FH8A 3D21A 5ELGA 4TXOA 4K7NA 5A4UA 1MEKA 3C1RA 1GTAA 1XW9A 4LLRA 1EOGA 1TP9A 4TXVA 3WD6A 4DSRA 1BG5A 3ZFLA 4MCUA 4TR0A 13GSA 4I8BA 4V1Ap 1H4OA 3JCML 3GKXA 2HSNB 1X5CA 2XHFA 4PNGA 3SWLA 1ST9A 1YEPA 2HI7A 2OADA 4RI6A 4MJCA 3UOMA 1GLQA 4IS0A 1SJ6A 4O32A 3A5WA 4ECJA 3TJFA 2JL4A 4GQFA 3LEFA 1XWKA 1SENA 3NZNA 1NSWA 3VWWA 4DVCA 3ZITA 3F63A 4F9ZA 5IM9A 1F6MC 5ABRA 2ON7A 1G7OA 3VFIA 1GP1A 4P3YB 3DIEA 5J9CA 1ZL9A 1SK1A 4DSSA 1XXUA 2M46A 1N8JA 3LXTA 4EXJA 3VI5A 3VURA 4LA1A 3ZZXA 1K3OA 2BTOT 2PUKC 2O89A 4TN8A 3O3TA 1CQHA 5CRGA 1GSDA 4OMVA 5LCZA 4ZILA 4BVXB 5EVOA 4I97A 2OKAA 3WT2A 1GL8A 1MD4A 1Q4JA 1MD3A 2HLSA 3F4TA 1ML6A 3ERGA 4LMVA 3Q6OA 4NPBA 2FY6A 2WJUA 3RBTA 1UVZA 2RIIA 4MA9A 1BX9A 2YJHA 20GSA 3CSJA 4ZXGA 1ZYQB 1S3DA 2YANA 1WMJA 3GKMA 3TKSC 4PQIA 4NWYA 2WRTA 3A2VA 3HY2A 2TRXA 5CRWA 3M1GA 5DALB 2L4QA 1DUGA 4FO5A 2P0GA 2F8AA 5G2ZA 1X5DA 4LL4B 4GLTA 4F0CA 1DE2A 2OE1A 4IN0A 3WT1A 4MZCA 1O81A 3QAVA 1K0AA 2V32A 1S3AA 3FKFA 5FHIA 5J4UA 1YEXA 4WETA 4EF0A 3TKPA 1U88A 5KN3A 1THXA 3HYPA 4PQ1A 5HR2A 2H1DA 6GSUA 2NBSA 1W89A 2C1YA 1GULA 4MZBA 4I5QA 2CT6A 4F82A 3CXGA 4TR1A 2L6DA 1E2YA 3IAS2 2L4CA 1MDKA 1VF3A 2X8HA 4HU7A 2HE3A 5F06A 2CA8A 2R2JA 2CAIA 1TRSA 4PURA 4WBJA 4HU9A 5ECMB 3IRAA 4MF5A 1ON4A 2I3YA 1BYEA 4BL7A 1SKWB 3LWAA 2H76A 2C0FA 5B6NA 5H5RA 1IYHA 3GMFA 3MWHA 2L57A 3EE2A 3EYTA 2MYGA 2KP1A 1GLPA 2O85A 2OACA 1ZCPA 1EV9A 1SYRA 3KGKA 4KX4A 3RHCA 2G0FA 2CVBA 3F4RA 4OCEA 5HFGA 2VCVA 3ZIVA 5E4WA 4KSOA 1LU4A 1V2AA 3W8SA 4EC0A 4WXTA 1F37A 4ID0A 2VCXA 2YN1A 1SD8A 2WULA 4EKZA 3KP9A 2YNXA 4CHSA 2FWGA 3GHAA 3GL5A 2VCTA 4POBA 5D93A 3TCOA 2WCIA 1X9SB 2CX4A 1QFNA 1PN9A 3HVXA 4IELA 2CQ9A 3EWLA 3FW2A 2PERA 1G0TA 5JWQB 3HZ4A 3LFLA 3MSZA 1XCCA 2VL2A 4YQMA 2LQOA 2NTOA 2DLXA 1K3YA 2R3XA 3H93A 1SL0B 4E8HA 5IMDA 1JZWA 4XRDA 4TKYA 4RQXA 2I9HA 6GSWA 1FVJA 3DGQA 5D9TA 5KN0A 5B8AA 4TXOB 2OA7A 4J2FA 2DBCA 3AY8A 3Q18A 1RK4A 5A5KA 4IHUA 4HZ2A 2IL3A 1Z7RA 3HJPA 1NW2A 2E0QA 2XC2A 1YF1A 4V2LA 1V40A 1B9YC 5ECSA 4KA0A 4EDYA 2V1MA 4GCIA 3QMXA 2PVOC 3IPZA 2HSMB 1SL2B 3RDWA 1QMVA 2OJLA 3I43A 2I4AA 1EV4A 1M9BA 1K0DA 2REMA 2IMIA 2XBQA 1GSFA 1TW9A 2YJ7A 3KIJA 2IIYA 3FR6A 4IJIA 4O92A 1YF0A 4KNDA 3CRUA 3LQ7A 5J5NA 4D73A 3EU3A 3IAM2 5DAKA 2AYTA 2JSZA 1AAZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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