1PKZA

Crystal structure of human glutathione transferase (gst) a1-1
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
214
structure length
213
Chain Sequence
AEKPKLHYFNARGRMESTRWLLAAAGVEFEEKFIKSAEDLDKLRNDGYLMFQQVPMVEIDGMKLVQTRAILNYIASKYNLYGKDIKERALIDMYIEGIADLGEMILLLPVPPEEKDAKLALIKEKIKNRYFPAFEKVLKSHGQDYLVGNKLSRADIHLVELLYYVEELDSSLISSFPLLKALKTRISNLPTVKKFLQPGSPRKPPMDEKSLEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title New crystal structures of human glutathione transferase A1-1 shed light on glutathione binding and the conformation of the C-terminal helix.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords Glutathione S-transferase A1
total genus 80
structure length 213
sequence length 214
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2003-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1pkzA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1pkzA01
3HCZA 3VI5A 3LQ7A 1VRSD 3DRNA 1A2JA 2RUFA 4IHUA 1AQWA 2DJ2A 4J56E 4FO5A 3CRTA 4YAVA 4AGSA 1EP8A 1PQNA 4PTSA 4G19A 3H4KA 4V2MA 2EIQA 1NW2A 4YH2A 3F4RA 1WJKA 3NZNA 3TCOA 2AAWA 1Z6NA 2GDRA 4XHMA 4NWYA 3E0UA 1Q4JA 3GH6A 4KDYA 2B1KA 3HY2A 3TJFA 1GSUA 1ZL9A 1MEKA 3D21A 2NBSA 2TRCP 4KA0A 4POKA 1T7PB 2MBTA 1AW9A 4JRRA 1OYJA 2H1BA 1JHBA 3EVIA 6GSTA 3EMXA 3LXZA 4NXIA 4DEJA 4OO5A 5FHIA 4IS0A 3G7IA 5KN0A 4F03A 4KF9A 5AGYA 2O89A 4L5OA 4IBPA 3QD9A 1MDIA 1KTEA 1F6MC 3ZIVA 2RM5A 1CQGA 3U5RE 3P8WA 2LS5A 3EMPA 5F07A 4ECCA 2H71A 2VUPA 4XTSA 4Q5FA 4NV2A 3IOSA 2GZPA 5COHA 5DCHA 1OC3A 1ZCPA 2GSSA 1Y25A 1O81A 4MZCA 4PQIA 3EURA 4X43A 4KNDA 2CQ9A 1ERTA 3H8QA 1PX7A 3QAGA 1SL1B 4GXZA 5CYYA 4AJ6A 4XS6A 1EWXA 4JR6A 5HFIA 2LRTA 2LQQA 10GSA 1NHYA 2AUVA 5IMFA 4ZL7A 5IMDA 2V2GA 4PUFC 2PVQA 4X0XA 5B6NA 4EL1A 3GL3A 1CQHA 2GQLA 1N2AA 3VURA 1UVZA 2CX4A 2PBJA 1WE0A 4DSRA 4NHZA 3D22A 1OAZA 2YWOA 1JZWA 3C8EA 3IE3A 2V6KA 1W89A 4K8MA 2CAQA 1GULA 3IK9A 4TR1A 2PU9C 4OCFA 4ZB9A 3TUEA 4JZQA 3IRAA 12GSA 5CAXA 5JWOB 4PUAA 2IFQB 3VWUA 3TKSC 1O73A 1X5CA 2A4VA 3NOFA 2HSYA 1SENA 3ERFA 3UMAA 3SWLA 4ZBDA 3KJYA 4F0BA 2L4QA 4BPYA 1GTBA 3FRCA 2CA8A 2IMDA 3UOMA 2VCQA 1JLWA 3M9KA 1GL8A 4PQHA 3GRXA 3I9V2 4KSOA 4ZL8A 3QAWA 1YKCA 4K7OA 1YEXA 4TR1B 2E2GA 19GSA 1TI1A 1YJ6A 1X5EA 1GP1A 1PX6A 3CXGA 3DKSA 3CRUA 3RHBA 1V2AA 4MJCA 4G0LA 4I8BA 6GSWA 1NSWA 1TI3A 1OC9A 1EZKA 5C04A 5J9CA 4ID0A 3GNJA 2YZHA 2LTKA 4NMUA 1OE7A 4BL7B 1AXDA 4IQAA 1ST9A 5DVBA 1H75A 2M46A 5D93A 1WMJA 4GQFA 1LU4A 3BCKA 4HEA2 2MMZA 2H1AA 3QOUA 3DVXA 2CZ3A 4QL7A 2MMNA 2JACA 2DJKA 1N8JA 3KTBA 1YZXA 5J41A 2IIYA 3ZYWA 1K3LA 1AQVA 3HJOA 2DIYA 2YOIA 2AYTA 1F2EA 1F3AA 2HSNB 1ON4A 2A2SA 3A3TA 1KEBA 3BJ5A 2CVKA 4KCAA 3A2XA 3EINA 3MDKA 3MNGA 2HRAA 3SBCA 2FLSA 2BTOT 2DIZA 2C80A 3S9FA 2VCVA 2I3YA 1GSSA 3VFIA 2VOCA 3CYNA 1OVNA 2IL3A 4WKWA 1GSDA 2VCZA 1M2BA 3LGCA 2GQKA 4Z7XA 3FZ4A 3ZVJD 3CSHA 22GSA 1FHEA 1U88A 6GSVA 1JZOA 13GSA 2FNOA 2V6OA 2YNXA 2XPEA 2RUEA 2VLTA 4P3YB 1A24A 3RDWA 2GGTA 3FZ5A 5D9WA 3VLNA 2HSHA 2KOKA 3CSJA 2JU5A 1JZRA 1BQ7A 18GSA 4MJBA 1S3AA 4HZ2A 5IO2A 5IOWA 2WJUA 3CTFA 2R37A 1XWKA 4ULXA 3LXTA 2FWEA 3GSSA 4HI7A 2N5FA 1M2DA 4ECBA 3KEBA 1K0OA 7GSSA 3UBKA 3GV1A 4RQXA 2YJHA 2M80A 4OO4A 1YF0A 4KGIA 3WGDA 2HRNA 2VCWA 4Q5NA 4YAPA 3VK9A 1AC1A 1J9BA 3ZL5A 1R5PA 2RLIA 1XWBA 4X1UA 3LSZA 2XC2A 2OE0A 4ZB6A 2G2QA 5CRWA 2B6MA 2VAFA 2PUKC 4MH3A 2CVBA 2TIRA 2VL3A 2K6VA 2N5AA 4ML1A 4ISDA 3F3QA 1ZMAA 1THXA 5ECOB 4YQMA 1FO5A 4ILFA 1THOA 1HQOA 6GSYA 1M7TA 2C0GA 3ZIJA 4FQUA 1GUHA 4BVXB 1ZYQB 1FOVA 1OKDA 2IJYA 2R2JA 1R7HA 4MDCA 3FR6A 4TN8A 1Z7RA 1C72A 3ZMKA 1O7UA 2EIRA 3HKRA 4HZ4A 2VM2A 3GA4A 2QGVA 1JLVA 3Q19A 3AY8A 3TKPA 3KMNA 1EV9A 1A2MA 3HXSA 2NVLA 2IWTA 1EOHA 2J9HA 2KUCA 3PR8A 5E4WA 3D6IA 2EC4A 2HFDA 3TDGA 5DALB 3ZMLA 1Z3EA 3N9JA 3APSA 4USSA 1PKZA 5CNWA 2KP2A 2X8HA 4DSQA 5FWGA 5AN1A 5HR1A 2GT6A 2VO4A 3KD0A 5B6MA 1QXHA 3A2VA 3QCPA 3GMFA 5CREA 3KTLA 3LEFA 3FYGA 2I1UA 5B8BA 5KN1A 3WD6A 5ELGA 4G0KA 1FB6A 3TKRA 1TRVA 2R3XA 3I6AA 1U3AA 5KN3A 2H1DA 2PVOC 3F63A 3KP8A 3C73A 4NPBA 1SKSB 1MDJA 1A0RP 3DVWA 3HD5A 1U3IA 3ZZXA 2FD3A 2LJKA 1BG5A 4MJEA 5HR0A 2QSIA 1K0MA 1M0UA 3EC3A 4BL7A 4MZBA 4PURA 3KMOA 1FG4A 4I97A 2C0FA 5KN2A 4TVEA 1SU9A 1G6WA 2ZNMA 3HYPA 3ZRDA 5G2ZA 2LRNA 1K0AA 4AJ7A 4FYCA 1T00A 3TGZA 5H5QA 5DBQA 4G2EA 1XW6A 2LRCA 1A23A 1BJXA 2FA4A 4MPFA 4FYBA 3TJJA 3FR9A 4KE3A 2CV4A 4KX4A 2JZSA 5CP1A 1OKTA 3DXBA 2HNLA 3BBYA 4J57E 4TXOB 1B9XC 3ERWA 1EEJA 2VIMA 1EGRA 1NM3A 3JCML 1AQXA 2L4CA 3IC4A 1EOGA 1XVWA 1SKWB 3LYPA 1G7OA 4I6XA 4JEDA 1Z7PA 3TOUA 1SK2A 2C8UA 2HSMA 4BWSA 3V1WA 1Y6EA 1T1VA 4OD7A 4ZILA 4EE0A 1SJZA 4TXOA 3PPUA 3IHQA 2H75A 3HVXA 4LMWA 1KNGA 1K3YA 4IJIA 3GX0A 3FW2A 1U6TA 4ECIA 5JCGA 6GSXA 1TK0B 4BVYA 3QAVA 1I5GA 4LL4B 2C0DA 5G1LA 2HSMB 2IMIA 4EVMA 4BWQA 4Q5QA 5DJMA 1VGLA 1JFUA 1ERUA 2R4VA 5H5RA 3H93A 2J23A 1J0FA 3IAM2 11GSA 5EY6A 3GH9A 1XWCA 3GTUA 1HNBA 1WIKA 4TRXA 3ZLPA 14GSA 3MWHA 2AJQB 1GLPA 4HJMA 3HJPA 4WBRD 3VPTA 3F6DA 1QMVA 4XRAA 4HQZA 4WEYA 3RPNA 1PL2A 4EC0A 3ZTLA 3C7MA 1MDKA 3GL5A 4CW9A 1GSFA 3E3EA 4K0GA 1GRXA 5DDLA 5EL8A 2H0HA 1WP0A 1S3CA 5CO3A 1WPIA 5J9BA 2H76A 2GZZA 1B8XA 3GTUB 3I69A 4HU9A 3Q6OA 1O6JA 3IR4A 1O8WA 5GAPD 1GNEA 5BMUA 3DGQA 1URMA 5DAKA 3ERGA 2O8VB 2B1LA 1GLQA 5L71A 3Q18A 5ABRA 4KCEA 4KDUA 2RIIA 4L5LA 4WF5A 2LKUA 2HYXA 1V98A 4F0CA 3DWVA 1ILOA 5CRHA 3FZAA 5DQSA 3LWAA 4EF0A 2H74A 3LYKA 4V1Ap 3UVHA 3FHKA 3H1NA 5AIXA 2IFQA 3N5OA 3TJBA 3TKSA 5DAKB 5IMAA 2VL2C 4HJ2A 1GUKA 1PSQA 4POLA 2H72A 5JCWA 2R5GA 3PGTA 2V32A 4HQSA 4LL1B 3LORA 1SK0A 3D4TA 4N0VA 3TJKA 2VL2A 2H73A 3KZQA 1YQ1A 1W4VA 2DMMA 2E0QA 2QKEA 1SL2B 4IELA 3FK8A 1TU8A 3C1SA 5DALA 2VL9A 2BJXA 3P2AA 3NIVA 3F8UA 3APOA 4PXOA 3CTGA 2VD0A 1WRYA 4KUNA 1H4OA 3HDCA 1HYUA 5IMVA 2FHEA 2GQMA 1PGTA 4HDEA 2H0IA 1RQMA 5EPFA 2IN3A 1VF4A 4HUAA 4XRDA 3KP9A 5ID2B 4GCIA 1A0FA 2HZEA 4V2LA 1G6YA 1SL0B 4DSSA 3IC8A 5IOXA 1TU7A 1GSYA 2MBSA 4D73B 1IYHA 1ERVA 2JSZA 5GSTA 2OE3A 1BX9A 2H6ZA 4V2NA 1B48A 1XFLA 2H66A 2F8FA 3RPPA 2GVPA 5ECMB 3ME7A 3IDVA 2UZ8A 4ZB8A 4G10A 3HZ4A 3UEMA 2ALBA 5ID2A 1UA5A 2FWFA 4PNFA 2L5LA 4F2IA 3UVTA 2YN1A 20GSA 3GN3A 2OACA 4ECJA 2O85A 1FVKA 2YV9A 2L6CA 2OE1A 4IN0A 4EKZA 3GUSA 3F9UA 3D5JA 1DSBA 3IPZA 2X8GA 5HR3A 3DYRA 1ZOFA 3HJMA 4L0WA 2AB6A 5HR2A 5HFKA 5ECPB 1X9SB 3VWWA 3BOAA 4MJAA 3QR6A 1XXUA 4OFTA 1T3BA 2YANA 1GH2A 1ACVA 4IP6A 2GT5A 4H86A 1K0BA 4JU5A 5G5EA 5AISA 5D9XA 3QFAC 4YQVA 3KCMA 1LBKA 1XCCA 4MF6A 3FY7A 3QFBC 3O76A 2C3QA 1ZGNA 5GSSA 2VCXA 5D9VA 3TB2A 1BEDA 2AHEA 3L9VA 1UC7A 3MAKA 4KH7A 2DJ1A 2YWNA 2OBIA 3GKXA 4TR3A 2YP6A 1R4WA 1BYEA 1TOFA 5LNKe 1GSEA 1K3OA 2IMEA 2JZRA 4MP4A 2OBKA 4CHSA 4K0NA 1GNWA 1K0NA 1TW9A 2FGXA 3BCIA 2DJ0A 3KIJA 2GS3A 4K7IA 1ERWA 2BMXA 3QDNA 3FKFA 1TRSA 4MK3A 4N11A 1R5AA 3FR3A 1GTUA 3ME8A 3GHAA 3F4SA 4F9ZA 1JZDA 4KB3A 3HHVA 3TOTA 5JWRB 3U6VA 1F3BA 4GSTA 2NDOA 5HQPA 1XW5A 2KHPA 2F51A 2DBCA 4ZBBA 3TKQA 1PKWA 3HVSA 2GTUA 3UJ1A 2D2ZA 2X64A 5H5SA 5IMCA 4RI7A 3QPMA 4EXJA 1V9WA 1B9YC 2WZ9A 3PH9A 1QQ2A 1LJRA 2KLXA 1TJDA 4LLRA 3ZREA 4XS4A 4RUVA 1A8YA 2V41A 1YDKA 2MMOA 3LG6A 3US3A 3CBUA 3F6FA 1HNCA 4PX1A 3A5WA 4FIWA 3HVVA 1XOAA 4L8EA 3LFLA 4V1Ag 3TRXA 2H8LA 1TK8B 4MMMA 1OC9B 4QL9A 1M9BA 3D0ZA 3O3TA 3KH7A 1XWAA 2N5BA 4POMA 1PN9A 2L57A 5A5KA 4J2FA 3F0IA 1OE8A 2PPTA 1T4YA 3J7Yk 2YWIA 2B7KA 1TRWA 1X5DA 1AIUA 5LCZA 1TRUA 2C3TA 5JWQB 4ZL9A 3RAZA 2ZUPA 2WB9A 2V1MA 5J5NA 3GYKA 1HNAA 1XZOA 1X9MB 3FEUA 1ZZYA 3EWLA 2WCIA 1QFNA 2L6DA 1K0DA 4EDYA 2LEGA 2CAIA 1SYRA 1K0CA 4TXVA 3EYTA 2I81A 4LA1A 4DSSB 1SJ6A 3VPQA 1RK4A 1FAAA 4TOPA 2P5RA 3WYWA 2C1YA 5F8BA 2NTOA 3W8JA 5IPHA 2P31A 4AJ8A 4I5QA 2LJRA 1AUCA 3TRPA 4TKYA 2IMFA 4EDZA 2R6KA 4OCEA 3IAS2 4N0ZA 2ES7A 4KAEA 2OA7A 2CVDA 3TJGA 2CT6A 4G0IA 1QUWA 1ZYEA 1V58A 1Q98A 4WBJA 2FY6A 5A4VA 4NHWA 3EE2A 2PERA 3O6TA 3L9SA 2JSYA 2K8VA 2EIOA 2PMTA 3M9JA 2LNTA 1TKDB 4MLYA 5IO0A 2DJ3A 2E2MA 2XBQA 6GSUA 5LD0A 3GKKA 4IP1A 2G0FA 3VI7A 3IV4A 3M1GA 2B7JA 5B8AA 4POBA 3QMXA 2LSTA 3P7XA 4GTUA 2DJJA 5G31A 3CMIA 2FWHA 5ECRB 4PNGA 1XBSA 1Z5YE 3TKSE 3GX8A 5JCUA 2K9FA 1J08A 4E8EA 3WT1A 4PGTA 1DE1A 2DSAA 2YV7A 1SYXA 1I9DA 4LMVA 4O32A 4RQRA 1GWCA 1O8XA 2MYGA 1R26A 2LV3A 4TR4A 5ENUA 5FT3A 4IVFA 1FVJA 4JBBA 5A4WA 5A4UA 1DE2A 1G7EA 5KEJA 2VM1A 2H01A 5CRDA 4Q5RA 1Z9HA 3DMLA 1GTAA 2L59A 4ACSA 1G0TA 2NPBA 3DD3A 3VWXA 2VCTA 2OADA 1EP7A 3C71A 1BAYA 2WRTA 3OR5A 1TXXA 1XIYA 2X99A 3UBLA 2F9SA 4GQCA 2VLUA 4MPGA 5G30A 3DIEA 2GSQA 4L0UA 4K1FA 1F9MA 3W8SA 4XS4B 2HE3A 1QGVA 3ZFBA 5GAND 5F05A 4XS1A 3RHCA 4O7HA 2WULA 1B4PA 2ZCTA 2B5YA 2XBIA 2MMAA 3P90A 3R3EA 3GIXA 4IQ1A 5CRGA 3W6GA 2WGRA 5IIZA 4ZXGA 3KXOA 4FYUA 5ECKB 2YJ7A 3UIWA 2B3SA 2H1GA 4O92A 5INYA 2OJLA 3KH9A 2HLSA 3KGKA 4TR0A 1SD8A 4K9ZA 5B7CA 4MF7A 2K8SA 2GSRA 1XVQA 4EUYA 4OFMA 2MZCA 1ABAA 2GZYA 2LJAA 1EEMA 2FA8A 5J3RA 1XOBA 4MABA 1T4ZA 1O85A 4GLTA 1M2AA 5ECIB 2F3MA 4O5RA 5C00A 4GWRA 2DC5A 2PGTA 2F8AA 5EVOA 1PL1A 1M9AA 4K6XA 2AV4A 1FB0A 5D9TA 3GKNA 4N30A 6GSSA 1EGOA 3A2WA 3RBTA 5IPGA 2CX3A 1V57A 2GLRA 3M3MA 1XWGA 4PQ1A 5F0GA 3E9JB 1ML6A 2H30A 2HRKA 1XPVA 2LNSA 16GSA 4GSSA 3ZVJA 1M99A 2P5QA 2WDUA 2KP1A 2O7KA 1TDIA 3UARA 1GSQA 3M0FA 1YY7A 4MCUA 1GTIA 4CDOA 1FW1A 1E6BA 3GKMA 3VWVA 3EU4A 5IQYA 3G7YA 2JADA 4OMVA 1KBNA 9GSSA 2FWGA 4KDXA 4NAXA 4BA7A 1EV4A 4RI6A 2B5EA 2DMLA 4HS1A 4KW6A 1MD4A 8GSSA 4K7NA 3F4TA 2I4AA 2K18A 5HFGA 4QQ7A 3IA1A 5IMZA 4WR4A 2YWMA 1UN2A 3IK7A 2E7PA 2HT9A 1AAZA 2H19A 4ZBAA 1V40A 4F82A 3EU3A 4YQUA 1TP9A 1YEPA 3IBHA 4IJ3A 2O87A 1RW1A 4MZWA 2LUSA 2WFCA 5ECNB 1VF1A 3ZFLA 2X8CA 4AF2A 4ML6A 4GF0A 3F3RA 1WWJA 2HZFA 2JL4A 2PWJA 3M8NA 4BVYB 3ZITA 1S3DA 1B4QA 1PMTA 1VF3A 1F37A 5G5FA 3GURA 4MF5A 4MH2A 2XHFA 1E2YA 4HU7A 4ZIJA 1SJIA 2IPAA 3BD2A 5DQYA 1USBA 5ECSA 4XIHA 4WR5A 3L4NA 5J4UA 3L9UA 3IXRA 2H6XA 3L0HA 2ON5A 5D96A 4DVCA 4WETA 1QK8A 2HXKA 3K8NA 1Z6MA 2VD1A 4N10A 2RM6A 5F06A 2FUG2 2I9HA 17GSA 2C4JA 3KM6A 4JR4A 2TRXA 4MA9A 1MD3A 3WGXA 3L78A 2FCHA 1TK5B 4GRFA 5E59A 2YZUA 2GSTA 1NHOA 1OC8A 4TW5A 5ECQB 3HZ8A 2M72A 2YPMA 4BVXA 1PD21 4NV5A 2IMKA 1VF2A 3HA9A 3WGEA 5ECHB 1TTZA 3C1RA 2PN8A 3J7Yb 1YKAA 3FZ9A 4K2DA 1YF1A 2Z9SA 2REMA 4HOJA 2H6YA 3TRQA 1PRXA 2L5OA 2OKAA 3GSTA 1A2LA 5ELAA 5DCGA 1HD2A 1SD9A 2WS2A 5AIVA 3MSZA 1MTCA 2HI7A 4I2UA 2H0GA 4D73A 2HRFA 3PINA 3ED3A 4FH8A 4I2TA 5GZZB 2HQTA 1X0RA 5D8IA 1A8LA 2A2RA 4IW9A 4E8HA 4IKHA 2H70A 2YCDA 2XPDA 3CSIA 3I43A 4EO3A 2VLVA 3WT2A 1SKRB 3UAPA 2ON7A 2C0EA 1T8EB 3R2QA 1DBYA 4OFNA 5D73A 4GSNA 4XCSA 4KSMA 4OWYA 3G9BA 4JE1A 3UL3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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